Kim, M S, Moore, P H, Zee, F, Fitch, M MM, Steiger, D L, Manshardt, R M, Paull, R E, Drew, R A, Sekioka, T, and Ming, R
Genetic relationships among Carica papaya cultivars, breeding lines, unimproved germplasm, and related species were established using amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers. Seventy-one papaya accessions and related species were analyzed with nine EcoRI–MseI primer combinations. A total of 186 informative AFLP markers was generated and analyzed. Cluster analysis suggested limited genetic variation in papaya, with an average genetic similarity among 63 papaya accessions of 0.880. Genetic diversity among cultivars derived from the same or similar gene pools was smaller, such as Hawaiian Solo hermaphrodite cultivars and Australian dioecious cultivars with genetic similarity at 0.921 and 0.912, respectively. The results indicated that self-pollinated hermaphrodite cultivars were as variable as open-pollinated dioecious cultivars. Genetic diversity between C. papaya and six other Carica species was also evaluated. Carica papaya shared the least genetic similarity with these species, with an average genetic similarity of 0.432; the average genetic similarity among the six other species was 0.729. The results from AFLP markers provided detailed estimates of the genetic variation within and among papaya cultivars, and supported the notion that C. papaya diverged from the rest of Carica species early in the evolution of this genus.Key words: DNA fingerprinting, germplasm, genetic relationship, molecular phylogeny, polymorphism.Les relations génétiques au sein du Carica papaya (entre cultivars, lignées en sélection, ressources génétiques non-améliorées) et avec des espèces voisines ont été examinées à l'aide du polymorphisme de longueur des fragments amplifiés (AFLP). Soixante et onze accessions de la papaye ou d'espèces voisines ont été analysées à l'aide de neuf combinaisons d'amorces EcoRI-MseI. Au total, 186 marqueurs informatifs ont été produits et analysés. Une analyse de groupement a suggéré qu'il existe peu de variation génétique chez la papaye, l'indice moyen de similitude génétique étant de 0,880 parmi 63 accessions de la papaye. La diversité génétique entre cultivars dérivés d'un germoplasme identique ou semblable était plus faible encore. Par exemple, les cultivars hermaphrodites 'Hawaiian Solo' et les cultivars dioïques australiens présentaient des indices de similitude génétique de 0,921 et 0,912, respectivement. Les résultats indiquent que les cultivars hermaphrodites à autofécondation sont aussi variables que les cultivars dioïques à fécondation croisée. La diversité génétique entre le C. papaya et six autres espèces du genre Carica a également été évaluée. Le C. papaya était l'espèce la moins semblable aux autres, montrant un indice de similitude génétique de 0,432, tandis que l'indice moyen parmi les autres espèces était plutôt de 0,729. Les résultats obtenus avec les marqueurs AFLP permettent d'estimer avec précision la variation génétique parmi les cultivars de papaye et viennent appuyer l'hypothèse selon laquelle le C. papaya aurait divergé des autres espèces du genre Carica relativement tôt au cours de l'évolution.Mots clés : empreintes génétiques, germoplasme, relations génétiques, phylogénie moléculaire, polymorphisme.[Traduit par la Rédaction] [ABSTRACT FROM AUTHOR]