Search

Tuberculosis (TB) in wildlife challenges epidemiological surveillance and disease control. An outbreak of TB was detected in a free-ranging wild boar population of a Natural Park in Catalonia (Spain) and the outbreak investigation was conducted in the area. During the study period (2015-2020), 278 wild boars were analysed by gross pathology, histopathology, mycobacterial culture and DVR-spoligotyping. In addition, all cattle (49) and goat (47) herds of the area were tested with tuberculin skin test. TB compatible lesions were detected in 21 wild boars, and Mycobacterium caprae was isolated in 17 of them with two different spoligotypes: SB0415 (13) and SB1908 (4). Only two goat herds showed TB positive animals that were subsequently slaughtered. M. caprae with the spoligotypes SB0416 and SB0415 were isolated from these animals. To investigate the phylogenetic relationships and the transmission chain of the outbreak, nine strains isolated from six wild boars and three goats of the study area were analysed by whole genome sequencing (WGS) followed by single nucleotide polymorphism (SNP) analysis by maximum likelihood and median-joining network inference methods. Results indicated that infected wild boars maintained M. caprae strains circulation in their own population and have likely transmitted the infection to goats, thus acting as TB reservoirs, compromising the success of livestock TB eradication campaigns and posing a risk for public health. The results also highlighted the usefulness of WGS followed by SNP analysis in providing relevant epidemiological information when detailed contact data are missing.

En els últims anys, veiem com més varietat de dispositius que utilitzem en el nostre dia a dia, són connectats a la xarxa per tal d'obtenir alguna utilitat d'aquesta. Aquest TFG pretén mostrar un exemple pràctic d'utilització del anomenat "Internet de les coses", on s'enginyarà un mètode de baix cost per poder connectar a la xarxa sistemes electrònics. Com a exemple, es dissenyarà i s'implementarà físicament un sistema d'adquisició i control de dades per a un hivernacle. El prototip dissenyat, constarà dels components, dispositius i algorismes, que permeten fer treballar un sistema electrònic clàssic, format per dispositius com un PIC, un LCD i una sèrie d'actuadors, amb una pàgina web com a eina de monitoratge i control de dades. Mitjançant un sistema Raspduino (una Arduino i una Raspberri) que utilitzarem com a servidor de la pàgina web i sistema de transmissió de dades, aquest sistema podrà fer dues accions típiques del "Internet de les coses", enviar dades al núvol i rebre dades del núvol, tot enfocat a una aplicació pràctica, un hivernacle intel·ligent.

Dopaminergic neurotransmission SPECT studies with 123I-labelled radioligands can help in the diagnosis of neurological and psychiatric disorders such as Parkinson¿s disease and schizophrenia. Nowadays, interpretation of SPECT images is based mainly on visual assessment by experienced observers. However, a quantitative evaluation of the images is recommended in current clinical guidelines. Quantitative information can help diagnose the disease at the early pre-clinical stages, follow its progression and assess the effects of treatment strategies. SPECT images are affected by a number of effects that are inherent in the image formation: attenuation and scattering of photons, system response and partial volume effect. These effects degrade the contrast and resolution of the images and, as a consequence, the real activity distribution of the radiotracer is distorted. Whilst the photon emission of 123I is dominated by a low-energy line of 159 keV, it also emits several high-energy lines. When 123I-labelled radioligands are used, a non-negligible fraction of high-energy photons undergoes backscattering in the detector and the gantry and reaches the detector within the energy window. In this work, a complete methodology for the compensation of all the degrading effects involved in dopaminergic neurotransmission SPECT imaging with 123I is presented. The proposed method uses Monte Carlo simulation to estimate the scattered photons detected in the projections. For this purpose, the SimSET Monte Carlo code was modified so as to adapt it to the more complex simulation of high-energy photons emitted by 123I. Once validated, the modified SimSET code was used to simulate 123I SPECT studies of an anthropomorphic striatal phantom using different imaging systems. The projections obtained showed that scatter is strongly dependent on the imaging system and comprises at least 40% of the detected photons. Applying the new methodology demonstrated that absolute quantification can be achie, Postprint (published version)

El treball que a continuació es presenta és un TFG en modalitat de Pràcticum, realitzat a l’empresa Cromsa Construcción y medioambiente S.A.U. (Cromsa) entre el 4 de març i el 31 de juliol. Primerament es descriu l’empresa i el seu funcionament intern, així com les tasques desenvolupades en la gestió dels encàrrecs. Seguidament es realitza una explicació de la participació a l’empresa durant el Pràcticum, emmarcada en els departaments d’Oficina tècnica i estudis i del de Producció. En una segona part, es realitza una anàlisi de 4 dels encàrrecs en els que s’ha intervingut durant les pràctiques. S’han analitzat 3 projectes de rehabilitació i 1 de reurbanització de carrers. Finalment s’exposen les conclusions extretes relatives a aquests encàrrecs i als diferents agents que intervenen en el sector de la construcció.

Certes malalties neurològiques estan associades amb problemes en els sistemes de neurotransmissió. Una aproximació a l'estudi d'aquests sistemes és la tomografia d'emissió SPECT (Single Photon Emission Computed Tomography) com a tècnica no-invasiva que proporciona imatges funcionals representatives de l'activitat neuronal. Aquesta tècnica permet la visualització i l'anàlisi de diferents òrgans i teixits dins l'àmbit de la Medicina Nuclear. Malgrat que la inspecció visual de la imatge a vegades és suficient per establir el diagnòstic, la quantificació dels paràmetres de la imatge reconstruida poden millorar la fiabilitat i exactitud del diagnòstic precoç de la malaltia. En particular, la quantificació d'estudis de neurotransmissors de dopamina pot ajudar a detectar els estadis inicials de malalties com el Parkinson. Així mateix, la quantificació permet un seguiment més acurat de l'evolució de la malaltia i una evaluació dels efectes de la terapèutica aplicada. La quantificació es veu afectada pels efectes degradants de la imatge com són el soroll estadístic, la resposta del sistema col.limador/detector i l'efecte de dispersió i/o atenuació dels fotons en la seva interacció amb la matèria. Alguns d'aquests efectes poden ser corregits mitjançant l'ús d'algoritmes de reconstrucció iteratius. L'objectiu d'aquesta tesi és aconseguir una quantificació tant absoluta com relativa dels valors numèrics de la imatge reconstruida de manera que reprodueixin la distribució d'activitat real del pacient en el moment de l'adquisició de l'estudi de SPECT. Per aconseguir-ho s'han desenvolupat diferents codis i algoritmes per millorar els mètodes de reconstrucció existents i validar-ne els seus resultats. La validació i millora dels algoritmes s'ha basat en l'ús de tècniques de simulació Monte Carlo. S'han analitzat els diferents codis Monte Carlo disponibles en l'àmbit de la Medicina Nuclear i s'ha escollit SimSET. La interpretació dels resultats, Many forms of brain diseases are associated with problems in the neurotransmission systems. One approach to the assessment of such systems is the use of Single Photon Emission Computed Tomography (SPECT) brain imaging. Neurotransmission SPECT has become an important tool in neuroimaging and is today regarded as a useful method in both clinical and basic research. SPECT is able to non-invasively visualize and analyze different organs and tissues functions or properties in Nuclear Medicine. Although visual inspection is often sufficient to assess neurotransmission imaging, quantification might improve the diagnostic accuracy of SPECT studies of the dopaminergic system. In particular, quantification of neurotransmission SPECT studies in Parkinson Disease could help us to diagnose this illness in the early pre-clinical stages. One of the main research topics in SPECT is to achieve early diagnosis, indeed preclinical diagnosis in neurodegenerative illnesses. In this field detailed analysis of shapes and values of the region of interest (ROIs) of the image is important, thus quantification is needed. Moreover, quantification allows a follow-up of the progression of disease and to assess the effects of potential neuroprotective treatment strategies. Therefore, the aim of this thesis is to achieve quantification of both the absolute activity values and the relative values of the reconstructed SPECT images. Quantification is affected by the degradation of the image introduced by statistical noise, attenuation, collimator/detector response and scattering effects. Some of these degradations may be corrected by using iterative reconstruction algorithms, which thus enable a more reliable quantification. The importance of correcting degradations in reconstruction algorithms to improve quantification accuracy of brain SPECT studies has been proved. Monte Carlo simulations are the --gold standard' for testing reconstruction algorithms in Nuclear Medicine., Postprint (published version)