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1. El podcast como recurso educativo en la docencia de Anestesia Veterinaria

Author

García Sanz, Virginia, Aguado Domínguez, Delia, Arenillas Baquero, Mario, Bustamante Domínguez, Rocío, Canfrán Arrabé, Susana, Clarambo Nassarre, María, De la Mota López-Contreras, Marta, García Sanz, Virginia, Aguado Domínguez, Delia, Arenillas Baquero, Mario, Bustamante Domínguez, Rocío, Canfrán Arrabé, Susana, Clarambo Nassarre, María, and De la Mota López-Contreras, Marta

Published
2024

2. Comparative effects of open-lung positive end-expiratory pressure (PEEP) and fixed PEEP on respiratory system compliance in the isoflurane anaesthetised healthy dog

Author

García Sanz, Virginia, Aguado Domínguez, Delia, Álvarez Gómez De Segura, Ignacio, Canfrán Arrabe, Susana, García Sanz, Virginia, Aguado Domínguez, Delia, Álvarez Gómez De Segura, Ignacio, and Canfrán Arrabe, Susana

Abstract

This study was performed to assess the effects of open-lung positive end-expiratory pressure (OL-PEEP) following stepwise recruitment manoeuvre (RM) and those of a fixed PEEP of 5 cm H2O without previous RM on respiratory system compliance (Crs) and selected cardiovascular variables in healthy dogs under general anaesthesia. Forty-five healthy client-owned dogs undergoing surgery were anaesthetised and mechanically ventilated (tidal volume, VT = 10–12 mL/kg; PEEP = 0 cm H2O) for 1 min (baseline) and randomly allocated into zero positive end-expiratory pressure (ZEEP), PEEP (5 cm H2O) and OL-PEEP treatment groups. In the OL-PEEP group, a stepwise RM was performed and the individual OL-PEEP was subsequently applied. The Crs, heart rate (HR) and non-invasive mean arterial pressure (NIMAP) were registered at baseline and then every 10 min during 60 min. In the ZEEP group, Crs decreased from baseline. In the PEEP group, Crs was not different from either baseline or ZEEP group values. In the OL-PEEP group, Crs was higher than both baseline and ZEEP group values at all time points as well as of those in the PEEP group during at least 20 min after RM. There were no differences for HR and NIMAP between groups. A clinically relevant hypotension following RM was observed in 40% of dogs. Therefore, an individually set OL-PEEP following stepwise RM improved Crs in anaesthetised healthy dogs, although transient but clinically relevant hypotension was observed during RM in some dogs. Fixed PEEP of 5 cm H2O without previous RM did not improve Crs, although it prevented it from decreasing., Universidad Complutense de Madrid, Depto. de Medicina y Cirugía Animal, Fac. de Veterinaria, TRUE, pub

Published
2024

3. Suplementos de CaD en mujeres postmenopáusicas con osteoporosis. Revisión sistemática

Author

Vera Sanz, Virginia, Romero Marco, Patricia, Universidad de Valladolid. Facultad de Ciencias de la Salud de Soria, Vera Sanz, Virginia, Romero Marco, Patricia, and Universidad de Valladolid. Facultad de Ciencias de la Salud de Soria

Abstract

INTRODUCCIÓN. En pleno siglo XXI, la osteoporosis es una enfermedad sistémica, considerada como la “epidemia silenciosa” vinculada al envejecimiento. Existen múltiples factores que influyen en su desarrollo, por lo que la prevención y los screenings anuales de la salud ósea, son herramientas fundamentales. La principal consecuencia de la osteoporosis son las fracturas óseas, precedidas en su mayoría por caídas. En la actualidad coexisten varios tratamientos, entre ellos los suplementos de calcio y vitamina D. OBJETIVO. Describir el efecto de la suplementación de calcio y vitamina D en mujeres postmenopáusicas con osteoporosis. METODOLOGÍA. Revisión sistemática de artículos localizados en las bases de datos: CINHAL, Pubmed, Biblioteca Crochane y Dialnet; publicados en los últimos 10 años. Se seleccionaron una serie de DeCS y MeSH para la estrategia de búsqueda, unidos mediante los operadores booleanos “AND” y “OR”. Se recuperaron 6 investigaciones, de las que se revisaron sus referencias bibliográficas y se obtuvieron 4 más, sumando un total de 10 publicaciones, de las que se valoró su calidad según CASPe, cumpliendo el 70% de los criterios propuestos. RESULTADOS. El aporte de suplementos de calcio y vitamina D para la osteoporosis ha demostrado una disminución en el riesgo de fracturas totales y de cadera. Además, los marcadores óseos se han reducido, aumentándose con ello la densidad mineral ósea, especialmente en la columna vertebral y en el cuello del fémur. CONCLUSIONES. Los hallazgos con respecto a esta suplementación han demostrado beneficios en la salud ósea. Generalmente las dosis máximas han sido iguales o inferiores a 1.200 mg/día de calcio y 800 UI/día de vitamina D, aunque se necesita más investigación para determinar las posologías óptimas. Es altamente recomendable que los profesionales enfermeros realicen intervenciones para prevenir o reducir las complicaciones de la osteoporosis en la población de riesgo., Grado en Enfermería

Published
2023

4. CLASES PRÁCTICAS EN LA ESPECIALIDAD DE CUIDADO DE ANIMALES DEL DIPLOMA FORMATIVO UNIVERSITARIO LICEO: CREACIÓN, USO Y EVALUACIÓN DE MATERIALES COGNITIVAMENTE ACCESIBLES PARA JÓVENES CON DISCAPACIDAD INTELECTUAL

Author

Encinas Cerezo, María Teresa, De Pablo Moreno, Juan Andrés, Morón Elorza, Pablo, González Gómez, Fernando, Arija Martín, Ignacio, Gilabert Santos, Juan Antonio, Marín García, María Del Pilar, San Andrés Larrea, María Dolores De, Díaz Díaz Chirón, María Teresa, Re, Michela Tatiana, Escudero Portugués, Rosa María, Rubio Langre, Sonia, Pineda González, Stefania, García Sanz, Virginia, González De Chávarri Echániz, Elisabeth, Rodríguez Artalejo, Antonio, De Las Heras Molina, Ana, Díez Martín, Amalia, Rebolé Garrigós, Almudena, Viveros Montoro, Agustín, Laviano Medina, Hernán Darío, Nieto González, David, Sánchez Alonso, Alberto, Águeda Gómez, Alejandra de, Ortega Moreno, Carlos, Galván Patas, Carmen, Fernández de Lis Galván, Gonzalo, Encinas Cerezo, María Teresa, De Pablo Moreno, Juan Andrés, Morón Elorza, Pablo, González Gómez, Fernando, Arija Martín, Ignacio, Gilabert Santos, Juan Antonio, Marín García, María Del Pilar, San Andrés Larrea, María Dolores De, Díaz Díaz Chirón, María Teresa, Re, Michela Tatiana, Escudero Portugués, Rosa María, Rubio Langre, Sonia, Pineda González, Stefania, García Sanz, Virginia, González De Chávarri Echániz, Elisabeth, Rodríguez Artalejo, Antonio, De Las Heras Molina, Ana, Díez Martín, Amalia, Rebolé Garrigós, Almudena, Viveros Montoro, Agustín, Laviano Medina, Hernán Darío, Nieto González, David, Sánchez Alonso, Alberto, Águeda Gómez, Alejandra de, Ortega Moreno, Carlos, Galván Patas, Carmen, and Fernández de Lis Galván, Gonzalo

Abstract

Memoria final del Proyecto Innova-Docencia nº 164, titulado "Elaboración y desarrollo de materiales accesibles para la formación de jóvenes con discapacidad intelectual en la Atención y Cuidado de Animales, mediante la intervención en el Proyecto Liceo". Contiene información sobre la creación de materiales y de un repositorio de los mismos disponibles en la Facultad de Veterinaria de la Universidad Complutense de Madrid y sobre la difusión realizada de los resultados obtenidos. También contiene información sobre la sensibilización sobre discapacidad intelectual realizada en la comunidad educativa complutense y en entornos laborales relacionados con el cuidado de animales y sobre la información recibida por los componentes del equipo para poder realizar esta actividad docente con jóvenes con discapacidad intelectual.

Published
2023

5. Conocer y transmitir el conocimiento sobre la Historia de las mujeres II. De las aulas de Máster y Grado a las clases escolares y a los Institutos

Author

González Heras, Natalia, Franco Rubio, Gloria, León Sanz, Virginia, Martínez Vega, María Elisa, Carabias Álvaro, Mónica, Jiménez Pablo, Esther, Muñoz García, Gemma María, Cebrerio Ares, Francisco, Jiménez Patiño, Emilia, González Muñoz, Karla Rebeca, Quiles Albero, David, López Marturet, Adriana, Ávila Martínez, Mª Teresa, García Corral, Paula, González Heras, Natalia, Franco Rubio, Gloria, León Sanz, Virginia, Martínez Vega, María Elisa, Carabias Álvaro, Mónica, Jiménez Pablo, Esther, Muñoz García, Gemma María, Cebrerio Ares, Francisco, Jiménez Patiño, Emilia, González Muñoz, Karla Rebeca, Quiles Albero, David, López Marturet, Adriana, Ávila Martínez, Mª Teresa, and García Corral, Paula

Abstract

Proyecto Aprendizaje-Servicio. Se plantea desde una doble perspectiva: 1) El aprendizaje de la Hª. de las mujeres por los estudiantes de Grado y Máster 2) Ofrecer una actividad en colegios e institutos que enseñe la Historia de las mujeres.

Published
2023

6. Compassionate Communities: Community intervention for the prevention of complicated grief. Model implemented by Madrid Salud

Author

Carrascosa Pujalte, Elisa, Valero Herranz, Elena, Adán Pérez, Esther, Garrido Sanz, Virginia, Trujillo Mejía, Ximena, Plaza Bedmar, Gonzalo, Casla Puig, Ana, Adame Ortíz, Ana, Lorenzo González, Rosalía, Carrascosa Pujalte, Elisa, Valero Herranz, Elena, Adán Pérez, Esther, Garrido Sanz, Virginia, Trujillo Mejía, Ximena, Plaza Bedmar, Gonzalo, Casla Puig, Ana, Adame Ortíz, Ana, and Lorenzo González, Rosalía

Abstract

Objective: The main objective of the Compassionate Communities project in the city of Madrid is to strengthen people’s ability to face and accompany grief situations through a community perspective. Methodology: Design of two intervention axes: sensitization and training of the population and professionals, and development of group spaces aimed at preventing complicated grief. Result: A diagnosis of the city of Madrid has been carried out. Sixty trainings have been carried out for Madrid Salud staff and 32 for professionals and community organizations. There have been 327 sensitizations about the end of life and bereavement (5,873 people). Contact was established with 283 public resources and 158 private resources throughout the year. Finally, a total of 15 Group Spaces for Grieving Support have been carried out. Conclusions: The compassionate communities model of the city of Madrid has managed to strengthen the capacities of the citizens of Madrid for collective care through the different awareness-raising activities and to impact on the professional strengthening and sensitivity of health professionals in relation to the key concepts of the project, thus generating a compassionate community., Objetivo: Fortalecer la capacidad de las personas para afrontar y acompañar las situaciones de duelo desde el modelo de Comunidades Compasivas a través de una perspectiva comunitaria. Metodología: Diseño de dos ejes de intervención: sensibilización y formación a la población y profesionales, y desarrollo de espacios grupales dirigidos a prevenir el duelo complicado. Resultado: Se ha realizado un diagnóstico de la ciudad de Madrid. Se han realizado 60 formaciones dirigidas al personal de Madrid Salud y 32 a profesionales entidades del entorno comunitario. Se han realizado 327 sensibilizaciones en torno al final de la vida y el duelo (5.873 personas). Se ha establecido contacto con 283 recursos públicos y 158 recursos privados a lo largo del año. Por último, se han llevado a cabo un total de 15 Espacios Grupales de Acompañamiento al Duelo. Conclusiones: El modelo de comunidades compasivas de la ciudad de Madrid ha conseguido fortalecer las capacidades de la ciudadanía de Madrid para el cuidado colectivo a través de las diferentes actividades de sensibilización e impactar en el fortalecimiento profesional y sensibilidad de los profesionales de la salud en relación con los conceptos clave del proyecto, generando así una comunidad compasiva.

Published
2023

7. Conocer y transmitir el conocimiento sobre la historia de las mujeres. Del aula de grado a las clases de secundaria y bachillerato

Author

González Heras, Natalia, Franco Rubio, Gloria Ángeles, León Sanz, Virginia, Martínez Vega, María Elisa, Carabias Álvaro, Mónica, Cebreiro Ares, Francisco, López Marturet, Adriana, Jiménez Patiño, Emilia, González Heras, Natalia, Franco Rubio, Gloria Ángeles, León Sanz, Virginia, Martínez Vega, María Elisa, Carabias Álvaro, Mónica, Cebreiro Ares, Francisco, López Marturet, Adriana, and Jiménez Patiño, Emilia

Abstract

Proyecto dentro de la metodología Aprendizaje-Servicio. Se plantea desde una doble perspectiva: 1) El aprendizaje de la Hª. de las mujeres por los estudiantes de Grado 2) Ofrecer una actividad en institutos que enseñe la Historia de las mujeres.

Published
2022

8. Efectos del reclutamiento alveolar y la presión positiva al final de la espiración óptima sobre la distensibilidad del sistema respiratorio y la oxigenación arterial en perros durante la anestesia general

Author

García Sanz, Virginia, Álvarez Gómez de Segura, Ignacio, Canfrán Arrabé, Susana, Aguado Domínguez, Delia, García Sanz, Virginia, Álvarez Gómez de Segura, Ignacio, Canfrán Arrabé, Susana, and Aguado Domínguez, Delia

Abstract

Las maniobras de reclutamiento alveolar (MRA), seguidas del empleo de presión positiva al final de la espiración (PEEP), pueden utilizarse para prevenir o tratar las atelectasias pulmonares durante la anestesia general. En medicina humana se recomienda individualizar el valor de PEEP y aplicar la PEEP óptima en cada paciente después de la MRA. En personas sanas, la realización de MRA seguidas del empleo de PEEP mejora la distensibilidad del sistema respiratorio (Dsr) y la oxigenación arterial intraoperatoria y podría mejorar la oxigenación arterial postoperatoria. En perros sanos, la realización de MRA seguidas de una PEEP fija (no individualizada al paciente) de 4o 5 cmH2O mejora la Dsr y la oxigenación arterial intraoperatoria, pero no se ha evaluado el efecto de las MRA seguidas de PEEP óptima (individualizada al paciente) sobre la Dsr durante la anestesia y la oxigenación arterial postoperatoria. Además, se desconocen los factores que afectan ala PEEP óptima y la Dsr después de una MRA. Esta Tesis Doctoral incluyó tres ensayos clínicos con tres objetivos diferentes. En el ensayo clínico 1, se evaluó el efecto de una MRA progresiva, seguida de PEEP óptima, sobre la Dsr y se comparó con el de la ventilación mecánica sin PEEP o con una PEEP fija de 5 cmH2O sin MRA previa. En el ensayo clínico 2, se evaluó el efecto de la posición y la condición corporal del paciente sobre el valor de PEEP óptima y la Dsr después de una MRA progresiva. En el ensayo clínico 3,se evaluó el efecto de una MRA progresiva, seguida de PEEP óptima, sobre la oxigenación arterial postoperatoria temprana y se comparó con el de la ventilación espontánea y la ventilación mecánica sin PEEP...

Published
2022

9. Efectos del reclutamiento alveolar y la presión positiva al final de la espiración óptima sobre la distensibilidad del sistema respiratorio y la oxigenación arterial en perros durante la anestesia general

Author

Álvarez Gómez de Segura, Ignacio, Canfrán Arrabé, Susana, Aguado Domínguez, Delia, García Sanz, Virginia, Álvarez Gómez de Segura, Ignacio, Canfrán Arrabé, Susana, Aguado Domínguez, Delia, and García Sanz, Virginia

Abstract

Las maniobras de reclutamiento alveolar (MRA), seguidas del empleo de presión positiva al final de la espiración (PEEP), pueden utilizarse para prevenir o tratar las atelectasias pulmonares durante la anestesia general. En medicina humana se recomienda individualizar el valor de PEEP y aplicar la PEEP óptima en cada paciente después de la MRA. En personas sanas, la realización de MRA seguidas del empleo de PEEP mejora la distensibilidad del sistema respiratorio (Dsr) y la oxigenación arterial intraoperatoria y podría mejorar la oxigenación arterial postoperatoria. En perros sanos, la realización de MRA seguidas de una PEEP fija (no individualizada al paciente) de 4o 5 cmH2O mejora la Dsr y la oxigenación arterial intraoperatoria, pero no se ha evaluado el efecto de las MRA seguidas de PEEP óptima (individualizada al paciente) sobre la Dsr durante la anestesia y la oxigenación arterial postoperatoria. Además, se desconocen los factores que afectan ala PEEP óptima y la Dsr después de una MRA. Esta Tesis Doctoral incluyó tres ensayos clínicos con tres objetivos diferentes. En el ensayo clínico 1, se evaluó el efecto de una MRA progresiva, seguida de PEEP óptima, sobre la Dsr y se comparó con el de la ventilación mecánica sin PEEP o con una PEEP fija de 5 cmH2O sin MRA previa. En el ensayo clínico 2, se evaluó el efecto de la posición y la condición corporal del paciente sobre el valor de PEEP óptima y la Dsr después de una MRA progresiva. En el ensayo clínico 3,se evaluó el efecto de una MRA progresiva, seguida de PEEP óptima, sobre la oxigenación arterial postoperatoria temprana y se comparó con el de la ventilación espontánea y la ventilación mecánica sin PEEP..., Alveolar recruitment manoeuvres (ARMs), followed by the application of positive end-expiratory pressure (PEEP), can be used to prevent or treat lung atelectasis during general anaesthesia. In human medicine, the individualization of PEEP and the application of optimal PEEP after ARM in each patient are recommended. In healthy people, ARMs followed by the use of PEEP improve respiratory system compliance (Crs) and intraoperative arterial oxygenation and could also improve postoperative arterial oxygenation. In healthy dogs, ARMs followed by a fixed PEEP (not individualized to patient) of 4 or 5 cmH2O improve Crs and intraoperative arterial oxygenation, but the effect of ARMs followed by optimal PEEP (individualized to patient) on Crs during anaesthesia and postoperative arterial oxygenation has not been assessed. Besides, factors affecting the optimal PEEP and Crs following ARM in this species are unknown.This thesis included three clinical studies and objectives. In clinical study 1, the aim was to assess the effect of a stepwise ARM, followed by optimal PEEP, on Crs and to compare it to those of controlled mechanical ventilation without PEEP or with a fixed PEEP of 5 cmH2O without previous ARM. In clinical study 2, the aim was to assess the effect of patient’s recumbency and body condition score on optimal PEEP value and Crs following stepwise ARM. In clinical study 3, the objective was to assess the effect of a stepwise ARM, followed by optimal PEEP, on early postoperative arterial oxygenation and to compare it to those of spontaneous ventilation and controlled mechanical ventilation without PEEP...

Published
2022

10. Conocer y transmitir el conocimiento sobre la historia de las mujeres. Del aula de grado a las clases de secundaria y bachillerato

Author

González Heras, Natalia, Franco Rubio, Gloria Ángeles, León Sanz, Virginia, Martínez Vega, María Elisa, Carabias Álvaro, Mónica, Cebreiro Ares, Francisco, López Marturet, Adriana, Jiménez Patiño, Emilia, González Heras, Natalia, Franco Rubio, Gloria Ángeles, León Sanz, Virginia, Martínez Vega, María Elisa, Carabias Álvaro, Mónica, Cebreiro Ares, Francisco, López Marturet, Adriana, and Jiménez Patiño, Emilia

Abstract

Proyecto dentro de la metodología Aprendizaje-Servicio. Se plantea desde una doble perspectiva: 1) El aprendizaje de la Hª. de las mujeres por los estudiantes de Grado 2) Ofrecer una actividad en institutos que enseñe la Historia de las mujeres.

Published
2022

11. Efectos del reclutamiento alveolar y la presión positiva al final de la espiración óptima sobre la distensibilidad del sistema respiratorio y la oxigenación arterial en perros durante la anestesia general

Author

Álvarez Gómez de Segura, Ignacio, Canfrán Arrabé, Susana, Aguado Domínguez, Delia, García Sanz, Virginia, Álvarez Gómez de Segura, Ignacio, Canfrán Arrabé, Susana, Aguado Domínguez, Delia, and García Sanz, Virginia

Abstract

Las maniobras de reclutamiento alveolar (MRA), seguidas del empleo de presión positiva al final de la espiración (PEEP), pueden utilizarse para prevenir o tratar las atelectasias pulmonares durante la anestesia general. En medicina humana se recomienda individualizar el valor de PEEP y aplicar la PEEP óptima en cada paciente después de la MRA. En personas sanas, la realización de MRA seguidas del empleo de PEEP mejora la distensibilidad del sistema respiratorio (Dsr) y la oxigenación arterial intraoperatoria y podría mejorar la oxigenación arterial postoperatoria. En perros sanos, la realización de MRA seguidas de una PEEP fija (no individualizada al paciente) de 4o 5 cmH2O mejora la Dsr y la oxigenación arterial intraoperatoria, pero no se ha evaluado el efecto de las MRA seguidas de PEEP óptima (individualizada al paciente) sobre la Dsr durante la anestesia y la oxigenación arterial postoperatoria. Además, se desconocen los factores que afectan ala PEEP óptima y la Dsr después de una MRA. Esta Tesis Doctoral incluyó tres ensayos clínicos con tres objetivos diferentes. En el ensayo clínico 1, se evaluó el efecto de una MRA progresiva, seguida de PEEP óptima, sobre la Dsr y se comparó con el de la ventilación mecánica sin PEEP o con una PEEP fija de 5 cmH2O sin MRA previa. En el ensayo clínico 2, se evaluó el efecto de la posición y la condición corporal del paciente sobre el valor de PEEP óptima y la Dsr después de una MRA progresiva. En el ensayo clínico 3,se evaluó el efecto de una MRA progresiva, seguida de PEEP óptima, sobre la oxigenación arterial postoperatoria temprana y se comparó con el de la ventilación espontánea y la ventilación mecánica sin PEEP..., Alveolar recruitment manoeuvres (ARMs), followed by the application of positive end-expiratory pressure (PEEP), can be used to prevent or treat lung atelectasis during general anaesthesia. In human medicine, the individualization of PEEP and the application of optimal PEEP after ARM in each patient are recommended. In healthy people, ARMs followed by the use of PEEP improve respiratory system compliance (Crs) and intraoperative arterial oxygenation and could also improve postoperative arterial oxygenation. In healthy dogs, ARMs followed by a fixed PEEP (not individualized to patient) of 4 or 5 cmH2O improve Crs and intraoperative arterial oxygenation, but the effect of ARMs followed by optimal PEEP (individualized to patient) on Crs during anaesthesia and postoperative arterial oxygenation has not been assessed. Besides, factors affecting the optimal PEEP and Crs following ARM in this species are unknown.This thesis included three clinical studies and objectives. In clinical study 1, the aim was to assess the effect of a stepwise ARM, followed by optimal PEEP, on Crs and to compare it to those of controlled mechanical ventilation without PEEP or with a fixed PEEP of 5 cmH2O without previous ARM. In clinical study 2, the aim was to assess the effect of patient’s recumbency and body condition score on optimal PEEP value and Crs following stepwise ARM. In clinical study 3, the objective was to assess the effect of a stepwise ARM, followed by optimal PEEP, on early postoperative arterial oxygenation and to compare it to those of spontaneous ventilation and controlled mechanical ventilation without PEEP...

Published
2022

12. Efficacy of the Parasympathetic Tone Activity monitor to assess nociception in healthy dogs anaesthetized with propofol and sevoflurane

Author

González-Blanco, Paula, Aguado Domínguez, Delia, Bustamante Domínguez, Rocío, García Sanz, Virginia, Álvarez Gómez De Segura, Ignacio, González-Blanco, Paula, Aguado Domínguez, Delia, Bustamante Domínguez, Rocío, García Sanz, Virginia, and Álvarez Gómez De Segura, Ignacio

Abstract

Authors' contributions DA: study design, data management and interpretation, statistical analysis and manuscript preparation. RB: data management and interpretation, and manuscript preparation. VGS: data management and interpretation, statistical analysis and manuscript preparation. PGB: data management and interpretation, and manuscript preparation. IAGS: study design, data interpretation and manuscript preparation., Objective: To compare a Parasympathetic Tone Activity (PTA) monitor with cardiovascular changes in invasive mean arterial pressure (IMAP) and heart rate (HR) when evaluating the response to nociceptive stimuli in anaesthetized dogs. Study design: Prospective experimental study. Animals: A group of nine (seven male and two female) adult Beagle dogs weighing 13.4 ± 1.5 kg (mean ± standard deviation). Methods: Anaesthesia was induced with propofol and maintained with sevoflurane in oxygen. Electrical stimuli of different nociceptive intensities were applied for 30 seconds. Stimuli were classified in each patient according to the response obtained (relevant change ≥ 20%) as low (no response), medium (PTA only) or high (PTA and IMAP/HR). Immediate and averaged values of PTA, IMAP and HR were recorded every second from 60 seconds before to 120 seconds after application of the nociceptive stimulus. Time to nociceptive response and peak response were evaluated with analysis of variance and t test. Results: Immediate PTA baseline values did not differ significantly before application of the low, medium and high stimuli (73 ± 15, p = 0.966). Immediate PTA response was observed with the medium stimulus at 33 ± 7 seconds with a maximum decrease of 57 ± 13% at 69 ± 5 seconds. With the high stimulus, the immediate PTA response was of a similar magnitude to the medium stimulus with a response at 28 ± 7 seconds (p = 0.221) and a maximum decrease of 68 ± 15% (p = 0.115) at 72 ± 7 seconds (p = 0.436). The cardiovascular change occurred (22 ± 8 seconds) prior to the immediate PTA response (p = 0.032). Conclusions and clinical relevance: The PTA monitor detected nociceptive stimuli at lower intensities than those eliciting cardiovascular changes. However, nociceptive stimuli of higher intensities provoked cardiovascular changes that occurred before a PTA response was observed., Depto. de Medicina y Cirugía Animal, Fac. de Veterinaria, TRUE, pub

Published
2020

13. Effect of recumbency and body condition score on open-lung positive end-expiratory pressure and respiratory system compliance following a stepwise lung recruitment manoeuvre in healthy dogs during general anaesthesia

Author

García Sanz, Virginia, Canfrán Arrabe, Susana, Álvarez Gómez De Segura, Ignacio, Aguado Domínguez, Delia, García Sanz, Virginia, Canfrán Arrabe, Susana, Álvarez Gómez De Segura, Ignacio, and Aguado Domínguez, Delia

Abstract

The aim was to assess the effects of recumbency and body condition score (BCS) on open-lung positive end-expiratory pressure (OL-PEEP) and quasistatic respiratory system compliance (Crs) following stepwise lung recruitment manoeuvre (RM) in healthy dogs under general anaesthesia. Thirty-four dogs were anaesthetised and mechanically ventilated (tidal volume of 10 mL/kg) without PEEP for 1 min (baseline). A stepwise RM was then performed and the individual OL-PEEP was subsequently applied. The Crs was registered at baseline and every 10-min for 50 min after RM. Dogs were classified into either dorsal or lateral recumbency groups, and as normal (score 4–5/9) or high (≥6/9) BCS groups. The OL-PEEP was higher in lateral than in dorsal recumbency (P = .002), but differences were not observed between normal and high BCS (P = .865). The Crs was increased from baseline at all time points after RM in all groups. The Crs did not differ between dorsally and laterally recumbent dogs at any time point. However, the baseline Crs was significantly lower in dogs with a high BCS than in those with a normal BCS (P < .001); therefore, the absolute change from baseline was considered when comparing Crs after the RM and it was similar in both BCS groups. In conclusion, in anaesthetised healthy dogs the OL-PEEP following RM was lower when dogs were positioned in dorsal than in lateral recumbency. The Crs after RM remained unchanged regardless of the dogs' recumbency. A stepwise RM followed by OL-PEEP could compensate for the potential negative impact of moderately increased BCS on Crs., Universidad Complutense de Madrid (CT27/16-CT28/16), Depto. de Medicina y Cirugía Animal, Fac. de Veterinaria, TRUE, pub

Published
2020

14. Gamificación en Anestesiología Clínica Veterinaria: Ampliación

Author

Aguado Domínguez, Delia, Álvarez Gómez de Segura, Ignacio, Cediel Algovia, Rafael, Canfrán Arrabé, Susana, Arenillas Baquero, Mario, López Ramis, Víctor, Bustamante Domínguez, Rocio, García Sanz, Virginia, Grijota Chousa, Óscar José, Gámez Maidanskaia, Ekaterina, Romero Marco, Patricia, García Gómez, Andrea, González Lendínez, Andrea, Aguado Domínguez, Delia, Álvarez Gómez de Segura, Ignacio, Cediel Algovia, Rafael, Canfrán Arrabé, Susana, Arenillas Baquero, Mario, López Ramis, Víctor, Bustamante Domínguez, Rocio, García Sanz, Virginia, Grijota Chousa, Óscar José, Gámez Maidanskaia, Ekaterina, Romero Marco, Patricia, García Gómez, Andrea, and González Lendínez, Andrea

Abstract

Desarrollo de un juego de mesa que permitan el aprendizaje de conceptos teóricos relacionados con la anestesia en un entorno de gamificación.

Published
2020

15. Gamificación en Anestesiología Clínica Veterinaria: Ampliación

Author

Aguado Domínguez, Delia, Álvarez Gómez de Segura, Ignacio, Cediel Algovia, Rafael, Canfrán Arrabé, Susana, Arenillas Baquero, Mario, López Ramis, Víctor, Bustamante Domínguez, Rocio, García Sanz, Virginia, Grijota Chousa, Óscar José, Gámez Maidanskaia, Ekaterina, Romero Marco, Patricia, García Gómez, Andrea, González Lendínez, Andrea, Aguado Domínguez, Delia, Álvarez Gómez de Segura, Ignacio, Cediel Algovia, Rafael, Canfrán Arrabé, Susana, Arenillas Baquero, Mario, López Ramis, Víctor, Bustamante Domínguez, Rocio, García Sanz, Virginia, Grijota Chousa, Óscar José, Gámez Maidanskaia, Ekaterina, Romero Marco, Patricia, García Gómez, Andrea, and González Lendínez, Andrea

Abstract

Desarrollo de un juego de mesa que permitan el aprendizaje de conceptos teóricos relacionados con la anestesia en un entorno de gamificación.

Published
2020

16. Gamificación en anestesiología clínica veterinaria

Author

Canfrán Arrabé, Susana, Álvarez Gómez de Segura, Ignacio, Cediel Algovia, Rafael, Aguado Domínguez, Delia, Bustamante Domínguez, Rocío, García Sanz, Virginia, García Gómez, Andrea, Grijota Chousa, Óscar José, Morcuende Rodríguez, África, Canfrán Arrabé, Susana, Álvarez Gómez de Segura, Ignacio, Cediel Algovia, Rafael, Aguado Domínguez, Delia, Bustamante Domínguez, Rocío, García Sanz, Virginia, García Gómez, Andrea, Grijota Chousa, Óscar José, and Morcuende Rodríguez, África

Abstract

En el presente proyecto se propuso el desarrollo de un juego de mesa que permitiese el aprendizaje de conceptos teóricos relacionados con la anestesia en un entorno de gamificación. La gamificación se define como el empleo de mecánicas de juego en entornos y aplicaciones no lúdicas con el fin de potenciar la motivación, la concentración y el esfuerzo. Con ello se pretendía complementar la docencia teórica de la asignatura de Cirugía General y Anestesia de cuarto curso de Grado en Veterinaria. Este recurso y la metodología planteada han pretendido facilitar y mejorar el aprendizaje de diversos conceptos de anestesiología clínica en el ámbito de la docencia del Grado en Veterinaria. Con ello, se pretendía mejorar la adquisición de una serie de competencias necesarias para los graduados en Veterinaria, de cara a poder desempeñar adecuadamente su actividad práctica clínica.

Published
2019

17. Gamificación en anestesiología clínica veterinaria

Author

Canfrán Arrabé, Susana, Álvarez Gómez de Segura, Ignacio, Cediel Algovia, Rafael, Aguado Domínguez, Delia, Bustamante Domínguez, Rocío, García Sanz, Virginia, García Gómez, Andrea, Grijota Chousa, Óscar José, Morcuende Rodríguez, África, Canfrán Arrabé, Susana, Álvarez Gómez de Segura, Ignacio, Cediel Algovia, Rafael, Aguado Domínguez, Delia, Bustamante Domínguez, Rocío, García Sanz, Virginia, García Gómez, Andrea, Grijota Chousa, Óscar José, and Morcuende Rodríguez, África

Abstract

En el presente proyecto se propuso el desarrollo de un juego de mesa que permitiese el aprendizaje de conceptos teóricos relacionados con la anestesia en un entorno de gamificación. La gamificación se define como el empleo de mecánicas de juego en entornos y aplicaciones no lúdicas con el fin de potenciar la motivación, la concentración y el esfuerzo. Con ello se pretendía complementar la docencia teórica de la asignatura de Cirugía General y Anestesia de cuarto curso de Grado en Veterinaria. Este recurso y la metodología planteada han pretendido facilitar y mejorar el aprendizaje de diversos conceptos de anestesiología clínica en el ámbito de la docencia del Grado en Veterinaria. Con ello, se pretendía mejorar la adquisición de una serie de competencias necesarias para los graduados en Veterinaria, de cara a poder desempeñar adecuadamente su actividad práctica clínica., The aim of the present project was the development of a board game that allows the learning of theoretical concepts related to anaesthesia in a gamification environment. Gamification is defined as the application of typical elements of game playing to other not playful areas aiming to potentatiate motivation, concentration and effort. Our purpose was to complement lectures of subject titled Cirugía General y Anestesia of fourth course of Veterinary Degree. This resource and the proposed methodology aimed to facilitate and improve learning process.

Published
2019

18. Milano e Napoli nel primo Settecento. Alcune considerazioni sul governo asburgico (1711-1733)

Author

Leon Sanz Virginia, Cremonini, Cinzia, Cremonini Cinzia (ORCID:0000-0002-1739-841X), Leon Sanz Virginia, Cremonini, Cinzia, and Cremonini Cinzia (ORCID:0000-0002-1739-841X)

Abstract

La politica degli Asburgo detentori del titolo imperiale applicata ai due territori di Milano e Napoli all'inizio del Settecento: riflessioni sulle posizioni storiografiche e sui risultati applicati al governo del territorio tra cesure e permanenze

Published
2019

19. Desarrollo de vídeos doodle como apoyo a la docencia en anestesiología veterinaria

Author

Aguado Domínguez, Delia, Álvarez Gómez de Segura, Ignacio, Cediel Algovia, Rafael, Canfrán Arrabé, Susana, Bustamante Domínguez, Rocío, García Sanz, Virginia, Romana Muñoz, Sara, Aguado Domínguez, Delia, Álvarez Gómez de Segura, Ignacio, Cediel Algovia, Rafael, Canfrán Arrabé, Susana, Bustamante Domínguez, Rocío, García Sanz, Virginia, and Romana Muñoz, Sara

Published
2018

20. Desarrollo de vídeos doodle como apoyo a la docencia en anestesiología veterinaria

Author

Aguado Domínguez, Delia, Álvarez Gómez de Segura, Ignacio, Cediel Algovia, Rafael, Canfrán Arrabé, Susana, Bustamante Domínguez, Rocío, García Sanz, Virginia, Romana Muñoz, Sara, Aguado Domínguez, Delia, Álvarez Gómez de Segura, Ignacio, Cediel Algovia, Rafael, Canfrán Arrabé, Susana, Bustamante Domínguez, Rocío, García Sanz, Virginia, and Romana Muñoz, Sara

Published
2018

21. Can the intake of antiparasitic secondary metabolites explain the low prevalence of hemoparasites among wild Psittaciformes?

Author

European Commission, Cemave Sanidad Animal, Ministerio de Economía y Competitividad (España), German Research Foundation, Sociedade de Pesquisa em Vida Selvagem e Educação Ambiental (Brasil), Fondo Nacional de Desarrollo Científico y Tecnológico (Chile), Fundação Neotropica do Brasil, Instituto Venezolano de Investigaciones Científicas, Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (Argentina), Katala Foundation, Ministry of Science and Higher Education (Poland), Conservation des Espèces et Populations Animales (France), Fondation Nature et Découvertes, Massey University, Zoological Society for the Conservation of Species and Populations (Germany), Department of Conservation (New Zealand), Landcare Research, Motuihe Island Trust, Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (México), World Parrot Trust, Masello, Juan F., Martínez, Javier, Calderón, Luciano, Wink, Michael, Quillfeldt, Petra, Sanz, Virginia, Theuerkauf, Jörn, Ortiz-Catedral, Luis, Berkunsky, Igor, Brunton, Dianne, Díaz-Luque, José A., Hauber, Mark E., Ojeda, Valeria, Barnaud, Antoine, Casalins, Laura, Jackson, Bethany, Mijares, Alfredo, Rosales, Romel, Seixas, Gláucia, Serafini, Patricia, Silva-Iturriza, Adriana, Sipinski, Elenise, Vásquez, Rodrigo A., Widmann, Peter, Widmann, Indira, Merino, Santiago, European Commission, Cemave Sanidad Animal, Ministerio de Economía y Competitividad (España), German Research Foundation, Sociedade de Pesquisa em Vida Selvagem e Educação Ambiental (Brasil), Fondo Nacional de Desarrollo Científico y Tecnológico (Chile), Fundação Neotropica do Brasil, Instituto Venezolano de Investigaciones Científicas, Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (Argentina), Katala Foundation, Ministry of Science and Higher Education (Poland), Conservation des Espèces et Populations Animales (France), Fondation Nature et Découvertes, Massey University, Zoological Society for the Conservation of Species and Populations (Germany), Department of Conservation (New Zealand), Landcare Research, Motuihe Island Trust, Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (México), World Parrot Trust, Masello, Juan F., Martínez, Javier, Calderón, Luciano, Wink, Michael, Quillfeldt, Petra, Sanz, Virginia, Theuerkauf, Jörn, Ortiz-Catedral, Luis, Berkunsky, Igor, Brunton, Dianne, Díaz-Luque, José A., Hauber, Mark E., Ojeda, Valeria, Barnaud, Antoine, Casalins, Laura, Jackson, Bethany, Mijares, Alfredo, Rosales, Romel, Seixas, Gláucia, Serafini, Patricia, Silva-Iturriza, Adriana, Sipinski, Elenise, Vásquez, Rodrigo A., Widmann, Peter, Widmann, Indira, and Merino, Santiago

Abstract

[Background] Parasites can exert selection pressure on their hosts through effects on survival, on reproductive success, on sexually selected ornament, with important ecological and evolutionary consequences, such as changes in population viability. Consequently, hemoparasites have become the focus of recent avian studies. Infection varies significantly among taxa. Various factors might explain the differences in infection among taxa, including habitat, climate, host density, the presence of vectors, life history and immune defence. Feeding behaviour can also be relevant both through increased exposure to vectors and consumption of secondary metabolites with preventative or therapeutic effects that can reduce parasite load. However, the latter has been little investigated. Psittaciformes (parrots and cockatoos) are a good model to investigate these topics, as they are known to use biological control against ectoparasites and to feed on toxic food. We investigated the presence of avian malaria parasites (Plasmodium), intracellular haemosporidians (Haemoproteus, Leucocytozoon), unicellular flagellate protozoans (Trypanosoma) and microfilariae in 19 Psittaciformes species from a range of habitats in the Indo-Malayan, Australasian and Neotropical regions. We gathered additional data on hemoparasites in wild Psittaciformes from the literature. We considered factors that may control the presence of hemoparasites in the Psittaciformes, compiling information on diet, habitat, and climate. Furthermore, we investigated the role of diet in providing antiparasitic secondary metabolites that could be used as self-medication to reduce parasite load., [Results] We found hemoparasites in only two of 19 species sampled. Among them, all species that consume at least one food item known for its secondary metabolites with antimalarial, trypanocidal or general antiparasitic properties, were free from hemoparasites. In contrast, the infected parrots do not consume food items with antimalarial or even general antiparasitic properties. We found that the two infected species in this study consumed omnivorous diets. When we combined our data with data from studies previously investigating blood parasites in wild parrots, the positive relationship between omnivorous diets and hemoparasite infestation was confirmed. Individuals from open habitats were less infected than those from forests., [Conclusions] The consumption of food items known for their secondary metabolites with antimalarial, trypanocidal or general antiparasitic properties, as well as the higher proportion of infected species among omnivorous parrots, could explain the low prevalence of hemoparasites reported in many vertebrates.

Published
2018

23. A communal catalogue reveals Earth's multiscale microbial diversity

Author

Thompson, Luke R., Sanders, Jon G., McDonald, Daniel, Amir, Amnon, Ladau, Joshua, Locey, Kenneth J., Prill, Robert J., Tripathi, Anupriya, Gibbons, Sean M., Ackermann, Gail, Navas-Molina, Jose A., Janssen, Stefan, Kopylova, Evguenia, Vazquez-Baeza, Yoshiki, Gonzalez, Antonio, Morton, James T., Mirarab, Siavash, Xu, Zhenjiang Zech, Jiang, Lingjing, Haroon, Mohamed F., Kanbar, Jad, Zhu, Qiyun, Song, Se Jin, Kosciolek, Tomasz, Bokulich, Nicholas A., Lefler, Joshua, Brislawn, Colin J., Humphrey, Gregory, Owens, Sarah M., Hampton-Marcell, Jarrad, Berg-Lyons, Donna, McKenzie, Valerie, Fierer, Noah, Fuhrman, Jed A., Clauset, Aaron, Stevens, Rick L., Shade, Ashley, Pollard, Katherine S., Goodwin, Kelly D., Jansson, Janet K., Gilbert, Jack A., Knight, Rob, Rivera, Jose L. Agosto, Al-Moosawi, Lisa, Alverdy, John, Amato, Katherine R., Andras, Jason, Angenent, Largus T., Antonopoulos, Dionysios A., Apprill, Amy, Armitage, David, Ballantine, Kate, Barta, Jiri, Baum, Julia K., Berry, Allison, Bhatnagar, Ashish, Bhatnagar, Monica, Biddle, Jennifer F., Bittner, Lucie, Boldgiv, Bazartseren, Bottos, Eric M., Boyer, Donal M., Braun, Josephine, Brazelton, William, Brearley, Francis Q., Campbell, Alexandra H., Caporaso, J. Gregory, Cardona, Cesar, Carroll, JoLynn, Cary, S. Craig, Casper, Brenda B., Charles, Trevor C., Chu, Haiyan, Claar, Danielle C., Clark, Robert G., Clayton, Jonathan B., Clemente, Jose C., Cochran, Alyssa, Coleman, Maureen L., Collins, Gavin, Colwell, Rita R., Contreras, Monica, Crary, Benjamin B., Creer, Simon, Cristol, Daniel A., Crump, Byron C., Cui, Duoying, Daly, Sarah E., Davalos, Liliana, Dawson, Russell D., Defazio, Jennifer, Delsuc, Frederic, Dionisi, Hebe M., Dominguez-Bello, Maria Gloria, Dowell, Robin, Dubinsky, Eric A., Dunn, Peter O., Ercolini, Danilo, Espinoza, Robert E., Ezenwa, Vanessa, Fenner, Nathalie, Findlay, Helen S., Fleming, Irma D., Fogliano, Vincenzo, Forsman, Anna, Freeman, Chris, Friedman, Elliot S., Galindo, Giancarlo, Garcia, Liza, Alexandra Garcia-Amado, Maria, Garshelis, David, Gasser, Robin B., Gerdts, Gunnar, Gibson, Molly K., Gifford, Isaac, Gill, Ryan T., Giray, Tugrul, Gittel, Antje, Golyshin, Peter, Gong, Donglai, Grossart, Hans-Peter, Guyton, Kristina, Haig, Sarah-Jane, Hale, Vanessa, Hall, Ross Stephen, Hallam, Steven J., Handley, Kim M., Hasan, Nur A., Haydon, Shane R., Hickman, Jonathan E., Hidalgo, Glida, Hofmockel, Kirsten S., Hooker, Jeff, Hulth, Stefan, Hultman, Jenni, Hyde, Embriette, Ibanez-Alamo, Juan Diego, Jastrow, Julie D., Jex, Aaron R., Johnson, L. Scott, Johnston, Eric R., Joseph, Stephen, Jurburg, Stephanie D., Jurelevicius, Diogo, Karlsson, Anders, Karlsson, Roger, Kauppinen, Seth, Kellogg, Colleen T. E., Kennedy, Suzanne J., Kerkhof, Lee J., King, Gary M., Kling, George W., Koehler, Anson V., Krezalek, Monika, Kueneman, Jordan G., Lamendella, Regina, Landon, Emily M., Lane-deGraaf, Kelly, LaRoche, Julie, Larsen, Peter, Laverock, Bonnie, Lax, Simon, Lentino, Miguel, Levin, Iris I., Liancourt, Pierre, Liang, Wenju, Linz, Alexandra M., Lipson, David A., Liu, Yongqin, Lladser, Manuel E., Lozada, Mariana, Spirito, Catherine M., MacCormack, Walter P., MacRae-Crerar, Aurora, Magris, Magda, Martin-Platero, Antonio M., Martin-Vivaldi, Manuel, Margarita Martinez, L., Martinez-Bueno, Manuel, Marzinelli, Ezequiel M., Mason, Olivia U., Mayer, Gregory D., McDevitt-Irwin, Jamie M., McDonald, James E., McGuire, Krista L., McMahon, Katherine D., McMinds, Ryan, Medina, Monica, Mendelson, Joseph R., III, Metcalf, Jessica L., Meyer, Folker, Michelangeli, Fabian, Miller, Kim, Mills, David A., Minich, Jeremiah, Mocali, Stefano, Moitinho-Silva, Lucas, Moore, Anni, Morgan-Kiss, Rachael M., Munroe, Paul, Myrold, David, Neufeld, Josh D., Ni, Yingying, Nicol, Graeme W., Nielsen, Shaun, Nissimov, Jozef I., Niu, Kefeng, Nolan, Matthew J., Noyce, Karen, O'Brien, Sarah L., Okamoto, Noriko, Orlando, Ludovic, Castellano, Yadira Ortiz, Osuolale, Olayinka, Oswald, Wyatt, Parnell, Jacob, Peralta-Sanchez, Juan M., Petraitis, Peter, Pfister, Catherine, Pilon-Smits, Elizabeth, Piombino, Paola, Pointing, Stephen B., Pollock, F. Joseph, Potter, Caitlin, Prithiviraj, Bharath, Quince, Christopher, Rani, Asha, Ranjan, Ravi, Rao, Subramanya, Rees, Andrew P., Richardson, Miles, Riebesell, Ulf, Robinson, Carol, Rockne, Karl J., Rodriguezl, Selena Marie, Rohwer, Forest, Roundstone, Wayne, Safran, Rebecca J., Sangwan, Naseer, Sanz, Virginia, Schrenk, Matthew, Schrenzel, Mark D., Scott, Nicole M., Seger, Rita L., Seguin-Orlando, Andaine, Seldin, Lucy, Seyler, Lauren M., Shakhsheer, Baddr, Sheets, Gabriela M., Shen, Congcong, Shi, Yu, Shin, Hakdong, Shogan, Benjamin D., Shutler, Dave, Siegel, Jeffrey, Simmons, Steve, Sjoling, Sara, Smith, Daniel P., Soler, Juan J., Sperling, Martin, Steinberg, Peter D., Stephens, Brent, Stevens, Melita A., Taghavi, Safiyh, Tai, Vera, Tait, Karen, Tan, Chia L., Tas, Neslihan, Taylor, D. Lee, Thomas, Torsten, Timling, Ina, Turner, Benjamin L., Urich, Tim, Ursell, Luke K., van der Lelie, Daniel, Van Treuren, William, van Zwieten, Lukas, Vargas-Robles, Daniela, Thurber, Rebecca Vega, Vitaglione, Paola, Walker, Donald A., Walters, William A., Wang, Shi, Wang, Tao, Weaver, Tom, Webster, Nicole S., Wehrle, Beck, Weisenhorn, Pamela, Weiss, Sophie, Werner, Jeffrey J., West, Kristin, Whitehead, Andrew, Whitehead, Susan R., Whittingham, Linda A., Willerslev, Eske, Williams, Allison E., Wood, Stephen A., Woodhams, Douglas C., Yang, Yeqin, Zaneveld, Jesse, Zarraonaindia, Iratxe, Zhang, Qikun, Zhao, Hongxia, Thompson, Luke R., Sanders, Jon G., McDonald, Daniel, Amir, Amnon, Ladau, Joshua, Locey, Kenneth J., Prill, Robert J., Tripathi, Anupriya, Gibbons, Sean M., Ackermann, Gail, Navas-Molina, Jose A., Janssen, Stefan, Kopylova, Evguenia, Vazquez-Baeza, Yoshiki, Gonzalez, Antonio, Morton, James T., Mirarab, Siavash, Xu, Zhenjiang Zech, Jiang, Lingjing, Haroon, Mohamed F., Kanbar, Jad, Zhu, Qiyun, Song, Se Jin, Kosciolek, Tomasz, Bokulich, Nicholas A., Lefler, Joshua, Brislawn, Colin J., Humphrey, Gregory, Owens, Sarah M., Hampton-Marcell, Jarrad, Berg-Lyons, Donna, McKenzie, Valerie, Fierer, Noah, Fuhrman, Jed A., Clauset, Aaron, Stevens, Rick L., Shade, Ashley, Pollard, Katherine S., Goodwin, Kelly D., Jansson, Janet K., Gilbert, Jack A., Knight, Rob, Rivera, Jose L. Agosto, Al-Moosawi, Lisa, Alverdy, John, Amato, Katherine R., Andras, Jason, Angenent, Largus T., Antonopoulos, Dionysios A., Apprill, Amy, Armitage, David, Ballantine, Kate, Barta, Jiri, Baum, Julia K., Berry, Allison, Bhatnagar, Ashish, Bhatnagar, Monica, Biddle, Jennifer F., Bittner, Lucie, Boldgiv, Bazartseren, Bottos, Eric M., Boyer, Donal M., Braun, Josephine, Brazelton, William, Brearley, Francis Q., Campbell, Alexandra H., Caporaso, J. Gregory, Cardona, Cesar, Carroll, JoLynn, Cary, S. Craig, Casper, Brenda B., Charles, Trevor C., Chu, Haiyan, Claar, Danielle C., Clark, Robert G., Clayton, Jonathan B., Clemente, Jose C., Cochran, Alyssa, Coleman, Maureen L., Collins, Gavin, Colwell, Rita R., Contreras, Monica, Crary, Benjamin B., Creer, Simon, Cristol, Daniel A., Crump, Byron C., Cui, Duoying, Daly, Sarah E., Davalos, Liliana, Dawson, Russell D., Defazio, Jennifer, Delsuc, Frederic, Dionisi, Hebe M., Dominguez-Bello, Maria Gloria, Dowell, Robin, Dubinsky, Eric A., Dunn, Peter O., Ercolini, Danilo, Espinoza, Robert E., Ezenwa, Vanessa, Fenner, Nathalie, Findlay, Helen S., Fleming, Irma D., Fogliano, Vincenzo, Forsman, Anna, Freeman, Chris, Friedman, Elliot S., Galindo, Giancarlo, Garcia, Liza, Alexandra Garcia-Amado, Maria, Garshelis, David, Gasser, Robin B., Gerdts, Gunnar, Gibson, Molly K., Gifford, Isaac, Gill, Ryan T., Giray, Tugrul, Gittel, Antje, Golyshin, Peter, Gong, Donglai, Grossart, Hans-Peter, Guyton, Kristina, Haig, Sarah-Jane, Hale, Vanessa, Hall, Ross Stephen, Hallam, Steven J., Handley, Kim M., Hasan, Nur A., Haydon, Shane R., Hickman, Jonathan E., Hidalgo, Glida, Hofmockel, Kirsten S., Hooker, Jeff, Hulth, Stefan, Hultman, Jenni, Hyde, Embriette, Ibanez-Alamo, Juan Diego, Jastrow, Julie D., Jex, Aaron R., Johnson, L. Scott, Johnston, Eric R., Joseph, Stephen, Jurburg, Stephanie D., Jurelevicius, Diogo, Karlsson, Anders, Karlsson, Roger, Kauppinen, Seth, Kellogg, Colleen T. E., Kennedy, Suzanne J., Kerkhof, Lee J., King, Gary M., Kling, George W., Koehler, Anson V., Krezalek, Monika, Kueneman, Jordan G., Lamendella, Regina, Landon, Emily M., Lane-deGraaf, Kelly, LaRoche, Julie, Larsen, Peter, Laverock, Bonnie, Lax, Simon, Lentino, Miguel, Levin, Iris I., Liancourt, Pierre, Liang, Wenju, Linz, Alexandra M., Lipson, David A., Liu, Yongqin, Lladser, Manuel E., Lozada, Mariana, Spirito, Catherine M., MacCormack, Walter P., MacRae-Crerar, Aurora, Magris, Magda, Martin-Platero, Antonio M., Martin-Vivaldi, Manuel, Margarita Martinez, L., Martinez-Bueno, Manuel, Marzinelli, Ezequiel M., Mason, Olivia U., Mayer, Gregory D., McDevitt-Irwin, Jamie M., McDonald, James E., McGuire, Krista L., McMahon, Katherine D., McMinds, Ryan, Medina, Monica, Mendelson, Joseph R., III, Metcalf, Jessica L., Meyer, Folker, Michelangeli, Fabian, Miller, Kim, Mills, David A., Minich, Jeremiah, Mocali, Stefano, Moitinho-Silva, Lucas, Moore, Anni, Morgan-Kiss, Rachael M., Munroe, Paul, Myrold, David, Neufeld, Josh D., Ni, Yingying, Nicol, Graeme W., Nielsen, Shaun, Nissimov, Jozef I., Niu, Kefeng, Nolan, Matthew J., Noyce, Karen, O'Brien, Sarah L., Okamoto, Noriko, Orlando, Ludovic, Castellano, Yadira Ortiz, Osuolale, Olayinka, Oswald, Wyatt, Parnell, Jacob, Peralta-Sanchez, Juan M., Petraitis, Peter, Pfister, Catherine, Pilon-Smits, Elizabeth, Piombino, Paola, Pointing, Stephen B., Pollock, F. Joseph, Potter, Caitlin, Prithiviraj, Bharath, Quince, Christopher, Rani, Asha, Ranjan, Ravi, Rao, Subramanya, Rees, Andrew P., Richardson, Miles, Riebesell, Ulf, Robinson, Carol, Rockne, Karl J., Rodriguezl, Selena Marie, Rohwer, Forest, Roundstone, Wayne, Safran, Rebecca J., Sangwan, Naseer, Sanz, Virginia, Schrenk, Matthew, Schrenzel, Mark D., Scott, Nicole M., Seger, Rita L., Seguin-Orlando, Andaine, Seldin, Lucy, Seyler, Lauren M., Shakhsheer, Baddr, Sheets, Gabriela M., Shen, Congcong, Shi, Yu, Shin, Hakdong, Shogan, Benjamin D., Shutler, Dave, Siegel, Jeffrey, Simmons, Steve, Sjoling, Sara, Smith, Daniel P., Soler, Juan J., Sperling, Martin, Steinberg, Peter D., Stephens, Brent, Stevens, Melita A., Taghavi, Safiyh, Tai, Vera, Tait, Karen, Tan, Chia L., Tas, Neslihan, Taylor, D. Lee, Thomas, Torsten, Timling, Ina, Turner, Benjamin L., Urich, Tim, Ursell, Luke K., van der Lelie, Daniel, Van Treuren, William, van Zwieten, Lukas, Vargas-Robles, Daniela, Thurber, Rebecca Vega, Vitaglione, Paola, Walker, Donald A., Walters, William A., Wang, Shi, Wang, Tao, Weaver, Tom, Webster, Nicole S., Wehrle, Beck, Weisenhorn, Pamela, Weiss, Sophie, Werner, Jeffrey J., West, Kristin, Whitehead, Andrew, Whitehead, Susan R., Whittingham, Linda A., Willerslev, Eske, Williams, Allison E., Wood, Stephen A., Woodhams, Douglas C., Yang, Yeqin, Zaneveld, Jesse, Zarraonaindia, Iratxe, Zhang, Qikun, and Zhao, Hongxia

Abstract

Our growing awareness of the microbial world's importance and diversity contrasts starkly with our limited understanding of its fundamental structure. Despite recent advances in DNA sequencing, a lack of standardized protocols and common analytical frameworks impedes comparisons among studies, hindering the development of global inferences about microbial life on Earth. Here we present a meta-analysis of microbial community samples collected by hundreds of researchers for the Earth Microbiome Project. Coordinated protocols and new analytical methods, particularly the use of exact sequences instead of clustered operational taxonomic units, enable bacterial and archaeal ribosomal RNA gene sequences to be followed across multiple studies and allow us to explore patterns of diversity at an unprecedented scale. The result is both a reference database giving global context to DNA sequence data and a framework for incorporating data from future studies, fostering increasingly complete characterization of Earth's microbial diversity.

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2017
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26. A communal catalogue reveals Earth’s multiscale microbial diversity

Author

Thompson, Luke R., Sanders, Jon G., McDonald, Daniel, Amir, Amnon, Ladau, Joshua, Locey, Kenneth J., Prill, Robert J., Tripathi, Anupriya, Gibbons, Sean M., Ackermann, Gail, Navas-Molina, Jose A., Janssen, Stefan, Kopylova, Evguenia, Vázquez-Baeza, Yoshiki, González, Antonio, Morton, James T., Mirarab, Siavash, Zech Xu, Zhenjiang, Jiang, Lingjing, Haroon, Mohamed F., Kanbar, Jad, Zhu, Qiyun, Jin Song, Se, Kosciolek, Tomasz, Bokulich, Nicholas A., Lefler, Joshua, Brislawn, Colin J., Humphrey, Gregory, Owens, Sarah M., Hampton-Marcell, Jarrad, Berg-Lyons, Donna, McKenzie, Valerie, Fierer, Noah, Fuhrman, Jed A., Clauset, Aaron, Stevens, Rick L., Shade, Ashley, Pollard, Katherine S., Goodwin, Kelly D., Jansson, Janet K., Gilbert, Jack A., Knight, Rob, Rivera, Jose L. Agosto, Al-Moosawi, Lisa, Alverdy, John, Amato, Katherine R., Andras, Jason, Angenent, Largus T., Antonopoulos, Dionysios A., Apprill, Amy, Armitage, David, Ballantine, Kate, Bárta, Jirˇí, Baum, Julia K., Berry, Allison, Bhatnagar, Ashish, Bhatnagar, Monica, Biddle, Jennifer F., Bittner, Lucie, Boldgiv, Bazartseren, Bottos, Eric, Boyer, Donal M., Braun, Josephine, Brazelton, William, Brearley, Francis Q., Campbell, Alexandra H., Caporaso, J. Gregory, Cardona, Cesar, Carroll, JoLynn, Cary, S. Craig, Casper, Brenda B., Charles, Trevor C., Chu, Haiyan, Claar, Danielle C., Clark, Robert G., Clayton, Jonathan B., Clemente, Jose C., Cochran, Alyssa, Coleman, Maureen L., Collins, Gavin, Colwell, Rita R., Contreras, Mónica, Crary, Benjamin B., Creer, Simon, Cristol, Daniel A., Crump, Byron C., Cui, Duoying, Daly, Sarah E., Davalos, Liliana, Dawson, Russell D., Defazio, Jennifer, Delsuc, Frédéric, Dionisi, Hebe M., Dominguez-Bello, Maria Gloria, Dowell, Robin, Dubinsky, Eric A., Dunn, Peter O., Ercolini, Danilo, Espinoza, Robert E., Ezenwa, Vanessa, Fenner, Nathalie, Findlay, Helen S., Fleming, Irma D., Fogliano, Vincenzo, Forsman, Anna, Freeman, Chris, Friedman, Elliot S., Galindo, Giancarlo, Garcia, Liza, Garcia-Amado, Maria Alexandra, Garshelis, David, Gasser, Robin B., Gerdts, Gunnar, Gibson, Molly K., Gifford, Isaac, Gill, Ryan T., Giray, Tugrul, Gittel, Antje, Golyshin, Peter, Gong, Donglai, Grossart, Hans-Peter, Guyton, Kristina, Haig, Sarah-Jane, Hale, Vanessa, Hall, Ross Stephen, Hallam, Steven J., Handley, Kim M., Hasan, Nur A., Haydon, Shane R., Hickman, Jonathan E., Hidalgo, Glida, Hofmockel, Kirsten S., Hooker, Jeff, Hulth, Stefan, Hultman, Jenni, Hyde, Embriette, Ibáñez-Álamo, Juan Diego, Jastrow, Julie D., Jex, Aaron R., Johnson, L. Scott, Johnston, Eric R., Joseph, Stephen, Jurburg, Stephanie D., Jurelevicius, Diogo, Karlsson, Anders, Karlsson, Roger, Kauppinen, Seth, Kellogg, Colleen T. E., Kennedy, Suzanne J., Kerkhof, Lee J., King, Gary M., Kling, George W., Koehler, Anson V., Krezalek, Monika, Kueneman, Jordan, Lamendella, Regina, Landon, Emily M., Lane-deGraaf, Kelly, LaRoche, Julie, Larsen, Peter, Laverock, Bonnie, Lax, Simon, Lentino, Miguel, Levin, Iris I., Liancourt, Pierre, Liang, Wenju, Linz, Alexandra M., Lipson, David A., Liu, Yongqin, Lladser, Manuel E., Lozada, Mariana, Spirito, Catherine M., MacCormack, Walter P., MacRae-Crerar, Aurora, Magris, Magda, Martín-Platero, Antonio M., Martín-Vivaldi, Manuel, Martínez, L. Margarita, Martínez-Bueno, Manuel, Marzinelli, Ezequiel M., Mason, Olivia U., Mayer, Gregory D., McDevitt-Irwin, Jamie M., McDonald, James E., McGuire, Krista L., McMahon, Katherine D., McMinds, Ryan, Medina, Mónica, Mendelson, Joseph R., Metcalf, Jessica L., Meyer, Folker, Michelangeli, Fabian, Miller, Kim, Mills, David A., Minich, Jeremiah, Mocali, Stefano, Moitinho-Silva, Lucas, Moore, Anni, Morgan-Kiss, Rachael M., Munroe, Paul, Myrold, David, Neufeld, Josh D., Ni, Yingying, Nicol, Graeme W., Nielsen, Shaun, Nissimov, Jozef I., Niu, Kefeng, Nolan, Matthew J., Noyce, Karen, O’Brien, Sarah L., Okamoto, Noriko, Orlando, Ludovic, Castellano, Yadira Ortiz, Osuolale, Olayinka, Oswald, Wyatt, Parnell, Jacob, Peralta-Sánchez, Juan M., Petraitis, Peter, Pfister, Catherine, Pilon-Smits, Elizabeth, Piombino, Paola, Pointing, Stephen B., Pollock, F. Joseph, Potter, Caitlin, Prithiviraj, Bharath, Quince, Christopher, Rani, Asha, Ranjan, Ravi, Rao, Subramanya, Rees, Andrew P., Richardson, Miles, Riebesell, Ulf, Robinson, Carol, Rockne, Karl J., Rodriguezl, Selena Marie, Rohwer, Forest, Roundstone, Wayne, Safran, Rebecca J., Sangwan, Naseer, Sanz, Virginia, Schrenk, Matthew, Schrenzel, Mark D., Scott, Nicole M., Seger, Rita L., Seguin-Orlando, Andaine, Seldin, Lucy, Seyler, Lauren M., Shakhsheer, Baddr, Sheets, Gabriela M., Shen, Congcong, Shi, Yu, Shin, Hakdong, Shogan, Benjamin D., Shutler, Dave, Siegel, Jeffrey, Simmons, Steve, Sjöling, Sara, Smith, Daniel P., Soler, Juan J., Sperling, Martin, Steinberg, Peter D., Stephens, Brent, Stevens, Melita A., Taghavi, Safiyh, Tai, Vera, Tait, Karen, Tan, Chia L., Tas¸, Neslihan, Taylor, D. Lee, Thomas, Torsten, Timling, Ina, Turner, Benjamin L., Urich, Tim, Ursell, Luke K., van der Lelie, Daniel, Van Treuren, William, van Zwieten, Lukas, Vargas-Robles, Daniela, Thurber, Rebecca Vega, Vitaglione, Paola, Walker, Donald A., Walters, William A., Wang, Shi, Wang, Tao, Weaver, Tom, Webster, Nicole S., Wehrle, Beck, Weisenhorn, Pamela, Weiss, Sophie, Werner, Jeffrey J., West, Kristin, Whitehead, Andrew, Whitehead, Susan R., Whittingham, Linda A., Willerslev, Eske, Williams, Allison E., Wood, Stephen A., Woodhams, Douglas C., Yang, Yeqin, Zaneveld, Jesse, Zarraonaindia, Iratxe, Zhang, Qikun, Zhao, Hongxia, Thompson, Luke R., Sanders, Jon G., McDonald, Daniel, Amir, Amnon, Ladau, Joshua, Locey, Kenneth J., Prill, Robert J., Tripathi, Anupriya, Gibbons, Sean M., Ackermann, Gail, Navas-Molina, Jose A., Janssen, Stefan, Kopylova, Evguenia, Vázquez-Baeza, Yoshiki, González, Antonio, Morton, James T., Mirarab, Siavash, Zech Xu, Zhenjiang, Jiang, Lingjing, Haroon, Mohamed F., Kanbar, Jad, Zhu, Qiyun, Jin Song, Se, Kosciolek, Tomasz, Bokulich, Nicholas A., Lefler, Joshua, Brislawn, Colin J., Humphrey, Gregory, Owens, Sarah M., Hampton-Marcell, Jarrad, Berg-Lyons, Donna, McKenzie, Valerie, Fierer, Noah, Fuhrman, Jed A., Clauset, Aaron, Stevens, Rick L., Shade, Ashley, Pollard, Katherine S., Goodwin, Kelly D., Jansson, Janet K., Gilbert, Jack A., Knight, Rob, Rivera, Jose L. Agosto, Al-Moosawi, Lisa, Alverdy, John, Amato, Katherine R., Andras, Jason, Angenent, Largus T., Antonopoulos, Dionysios A., Apprill, Amy, Armitage, David, Ballantine, Kate, Bárta, Jirˇí, Baum, Julia K., Berry, Allison, Bhatnagar, Ashish, Bhatnagar, Monica, Biddle, Jennifer F., Bittner, Lucie, Boldgiv, Bazartseren, Bottos, Eric, Boyer, Donal M., Braun, Josephine, Brazelton, William, Brearley, Francis Q., Campbell, Alexandra H., Caporaso, J. Gregory, Cardona, Cesar, Carroll, JoLynn, Cary, S. Craig, Casper, Brenda B., Charles, Trevor C., Chu, Haiyan, Claar, Danielle C., Clark, Robert G., Clayton, Jonathan B., Clemente, Jose C., Cochran, Alyssa, Coleman, Maureen L., Collins, Gavin, Colwell, Rita R., Contreras, Mónica, Crary, Benjamin B., Creer, Simon, Cristol, Daniel A., Crump, Byron C., Cui, Duoying, Daly, Sarah E., Davalos, Liliana, Dawson, Russell D., Defazio, Jennifer, Delsuc, Frédéric, Dionisi, Hebe M., Dominguez-Bello, Maria Gloria, Dowell, Robin, Dubinsky, Eric A., Dunn, Peter O., Ercolini, Danilo, Espinoza, Robert E., Ezenwa, Vanessa, Fenner, Nathalie, Findlay, Helen S., Fleming, Irma D., Fogliano, Vincenzo, Forsman, Anna, Freeman, Chris, Friedman, Elliot S., Galindo, Giancarlo, Garcia, Liza, Garcia-Amado, Maria Alexandra, Garshelis, David, Gasser, Robin B., Gerdts, Gunnar, Gibson, Molly K., Gifford, Isaac, Gill, Ryan T., Giray, Tugrul, Gittel, Antje, Golyshin, Peter, Gong, Donglai, Grossart, Hans-Peter, Guyton, Kristina, Haig, Sarah-Jane, Hale, Vanessa, Hall, Ross Stephen, Hallam, Steven J., Handley, Kim M., Hasan, Nur A., Haydon, Shane R., Hickman, Jonathan E., Hidalgo, Glida, Hofmockel, Kirsten S., Hooker, Jeff, Hulth, Stefan, Hultman, Jenni, Hyde, Embriette, Ibáñez-Álamo, Juan Diego, Jastrow, Julie D., Jex, Aaron R., Johnson, L. Scott, Johnston, Eric R., Joseph, Stephen, Jurburg, Stephanie D., Jurelevicius, Diogo, Karlsson, Anders, Karlsson, Roger, Kauppinen, Seth, Kellogg, Colleen T. E., Kennedy, Suzanne J., Kerkhof, Lee J., King, Gary M., Kling, George W., Koehler, Anson V., Krezalek, Monika, Kueneman, Jordan, Lamendella, Regina, Landon, Emily M., Lane-deGraaf, Kelly, LaRoche, Julie, Larsen, Peter, Laverock, Bonnie, Lax, Simon, Lentino, Miguel, Levin, Iris I., Liancourt, Pierre, Liang, Wenju, Linz, Alexandra M., Lipson, David A., Liu, Yongqin, Lladser, Manuel E., Lozada, Mariana, Spirito, Catherine M., MacCormack, Walter P., MacRae-Crerar, Aurora, Magris, Magda, Martín-Platero, Antonio M., Martín-Vivaldi, Manuel, Martínez, L. Margarita, Martínez-Bueno, Manuel, Marzinelli, Ezequiel M., Mason, Olivia U., Mayer, Gregory D., McDevitt-Irwin, Jamie M., McDonald, James E., McGuire, Krista L., McMahon, Katherine D., McMinds, Ryan, Medina, Mónica, Mendelson, Joseph R., Metcalf, Jessica L., Meyer, Folker, Michelangeli, Fabian, Miller, Kim, Mills, David A., Minich, Jeremiah, Mocali, Stefano, Moitinho-Silva, Lucas, Moore, Anni, Morgan-Kiss, Rachael M., Munroe, Paul, Myrold, David, Neufeld, Josh D., Ni, Yingying, Nicol, Graeme W., Nielsen, Shaun, Nissimov, Jozef I., Niu, Kefeng, Nolan, Matthew J., Noyce, Karen, O’Brien, Sarah L., Okamoto, Noriko, Orlando, Ludovic, Castellano, Yadira Ortiz, Osuolale, Olayinka, Oswald, Wyatt, Parnell, Jacob, Peralta-Sánchez, Juan M., Petraitis, Peter, Pfister, Catherine, Pilon-Smits, Elizabeth, Piombino, Paola, Pointing, Stephen B., Pollock, F. Joseph, Potter, Caitlin, Prithiviraj, Bharath, Quince, Christopher, Rani, Asha, Ranjan, Ravi, Rao, Subramanya, Rees, Andrew P., Richardson, Miles, Riebesell, Ulf, Robinson, Carol, Rockne, Karl J., Rodriguezl, Selena Marie, Rohwer, Forest, Roundstone, Wayne, Safran, Rebecca J., Sangwan, Naseer, Sanz, Virginia, Schrenk, Matthew, Schrenzel, Mark D., Scott, Nicole M., Seger, Rita L., Seguin-Orlando, Andaine, Seldin, Lucy, Seyler, Lauren M., Shakhsheer, Baddr, Sheets, Gabriela M., Shen, Congcong, Shi, Yu, Shin, Hakdong, Shogan, Benjamin D., Shutler, Dave, Siegel, Jeffrey, Simmons, Steve, Sjöling, Sara, Smith, Daniel P., Soler, Juan J., Sperling, Martin, Steinberg, Peter D., Stephens, Brent, Stevens, Melita A., Taghavi, Safiyh, Tai, Vera, Tait, Karen, Tan, Chia L., Tas¸, Neslihan, Taylor, D. Lee, Thomas, Torsten, Timling, Ina, Turner, Benjamin L., Urich, Tim, Ursell, Luke K., van der Lelie, Daniel, Van Treuren, William, van Zwieten, Lukas, Vargas-Robles, Daniela, Thurber, Rebecca Vega, Vitaglione, Paola, Walker, Donald A., Walters, William A., Wang, Shi, Wang, Tao, Weaver, Tom, Webster, Nicole S., Wehrle, Beck, Weisenhorn, Pamela, Weiss, Sophie, Werner, Jeffrey J., West, Kristin, Whitehead, Andrew, Whitehead, Susan R., Whittingham, Linda A., Willerslev, Eske, Williams, Allison E., Wood, Stephen A., Woodhams, Douglas C., Yang, Yeqin, Zaneveld, Jesse, Zarraonaindia, Iratxe, Zhang, Qikun, and Zhao, Hongxia

Abstract

Our growing awareness of the microbial world’s importance and diversity contrasts starkly with our limited understanding of its fundamental structure. Despite recent advances in DNA sequencing, a lack of standardized protocols and common analytical frameworks impedes comparisons among studies, hindering the development of global inferences about microbial life on Earth. Here we present a meta-analysis of microbial community samples collected by hundreds of researchers for the Earth Microbiome Project. Coordinated protocols and new analytical methods, particularly the use of exact sequences instead of clustered operational taxonomic units, enable bacterial and archaeal ribosomal RNA gene sequences to be followed across multiple studies and allow us to explore patterns of diversity at an unprecedented scale. The result is both a reference database giving global context to DNA sequence data and a framework for incorporating data from future studies, fostering increasingly complete characterization of Earth’s microbial diversity.

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2017
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27. A communal catalogue reveals Earth's multiscale microbial diversity

Author

Biological Sciences, Thompson, Luke R., Sanders, Jon G., McDonald, Daniel, Amir, Amnon, Ladau, Joshua, Locey, Kenneth J., Prill, Robert J., Tripathi, Anupriya, Gibbons, Sean M., Ackermann, Gail, Navas-Molina, Jose A., Janssen, Stefan, Kopylova, Evguenia, Vazquez-Baeza, Yoshiki, Gonzalez, Antonio, Morton, James T., Mirarab, Siavash, Xu, Zhenjiang Zech, Jiang, Lingjing, Haroon, Mohamed F., Kanbar, Jad, Zhu, Qiyun, Song, Se Jin, Kosciolek, Tomasz, Bokulich, Nicholas A., Lefler, Joshua, Brislawn, Colin J., Humphrey, Gregory, Owens, Sarah M., Hampton-Marcell, Jarrad, Berg-Lyons, Donna, McKenzie, Valerie, Fierer, Noah, Fuhrman, Jed A., Clauset, Aaron, Stevens, Rick L., Shade, Ashley, Pollard, Katherine S., Goodwin, Kelly D., Jansson, Janet K., Gilbert, Jack A., Knight, Rob, Rivera, Jose L. Agosto, Al-Moosawi, Lisa, Alverdy, John, Amato, Katherine R., Andras, Jason, Angenent, Largus T., Antonopoulos, Dionysios A., Apprill, Amy, Armitage, David, Ballantine, Kate, Barta, Jiri, Baum, Julia K., Berry, Allison, Bhatnagar, Ashish, Bhatnagar, Monica, Biddle, Jennifer F., Bittner, Lucie, Boldgiv, Bazartseren, Bottos, Eric M., Boyer, Donal M., Braun, Josephine, Brazelton, William, Brearley, Francis Q., Campbell, Alexandra H., Caporaso, J. Gregory, Cardona, Cesar, Carroll, JoLynn, Cary, S. Craig, Casper, Brenda B., Charles, Trevor C., Chu, Haiyan, Claar, Danielle C., Clark, Robert G., Clayton, Jonathan B., Clemente, Jose C., Cochran, Alyssa, Coleman, Maureen L., Collins, Gavin, Colwell, Rita R., Contreras, Monica, Crary, Benjamin B., Creer, Simon, Cristol, Daniel A., Crump, Byron C., Cui, Duoying, Daly, Sarah E., Davalos, Liliana, Dawson, Russell D., Defazio, Jennifer, Delsuc, Frederic, Dionisi, Hebe M., Dominguez-Bello, Maria Gloria, Dowell, Robin, Dubinsky, Eric A., Dunn, Peter O., Ercolini, Danilo, Espinoza, Robert E., Ezenwa, Vanessa, Fenner, Nathalie, Findlay, Helen S., Fleming, Irma D., Fogliano, Vincenzo, Forsman, Anna, Freeman, Chris, Friedman, Elliot S., Galindo, Giancarlo, Garcia, Liza, Alexandra Garcia-Amado, Maria, Garshelis, David, Gasser, Robin B., Gerdts, Gunnar, Gibson, Molly K., Gifford, Isaac, Gill, Ryan T., Giray, Tugrul, Gittel, Antje, Golyshin, Peter, Gong, Donglai, Grossart, Hans-Peter, Guyton, Kristina, Haig, Sarah-Jane, Hale, Vanessa, Hall, Ross Stephen, Hallam, Steven J., Handley, Kim M., Hasan, Nur A., Haydon, Shane R., Hickman, Jonathan E., Hidalgo, Glida, Hofmockel, Kirsten S., Hooker, Jeff, Hulth, Stefan, Hultman, Jenni, Hyde, Embriette, Ibanez-Alamo, Juan Diego, Jastrow, Julie D., Jex, Aaron R., Johnson, L. Scott, Johnston, Eric R., Joseph, Stephen, Jurburg, Stephanie D., Jurelevicius, Diogo, Karlsson, Anders, Karlsson, Roger, Kauppinen, Seth, Kellogg, Colleen T. E., Kennedy, Suzanne J., Kerkhof, Lee J., King, Gary M., Kling, George W., Koehler, Anson V., Krezalek, Monika, Kueneman, Jordan G., Lamendella, Regina, Landon, Emily M., Lane-deGraaf, Kelly, LaRoche, Julie, Larsen, Peter, Laverock, Bonnie, Lax, Simon, Lentino, Miguel, Levin, Iris I., Liancourt, Pierre, Liang, Wenju, Linz, Alexandra M., Lipson, David A., Liu, Yongqin, Lladser, Manuel E., Lozada, Mariana, Spirito, Catherine M., MacCormack, Walter P., MacRae-Crerar, Aurora, Magris, Magda, Martin-Platero, Antonio M., Martin-Vivaldi, Manuel, Margarita Martinez, L., Martinez-Bueno, Manuel, Marzinelli, Ezequiel M., Mason, Olivia U., Mayer, Gregory D., McDevitt-Irwin, Jamie M., McDonald, James E., McGuire, Krista L., McMahon, Katherine D., McMinds, Ryan, Medina, Monica, Mendelson, Joseph R., III, Metcalf, Jessica L., Meyer, Folker, Michelangeli, Fabian, Miller, Kim, Mills, David A., Minich, Jeremiah, Mocali, Stefano, Moitinho-Silva, Lucas, Moore, Anni, Morgan-Kiss, Rachael M., Munroe, Paul, Myrold, David, Neufeld, Josh D., Ni, Yingying, Nicol, Graeme W., Nielsen, Shaun, Nissimov, Jozef I., Niu, Kefeng, Nolan, Matthew J., Noyce, Karen, O'Brien, Sarah L., Okamoto, Noriko, Orlando, Ludovic, Castellano, Yadira Ortiz, Osuolale, Olayinka, Oswald, Wyatt, Parnell, Jacob, Peralta-Sanchez, Juan M., Petraitis, Peter, Pfister, Catherine, Pilon-Smits, Elizabeth, Piombino, Paola, Pointing, Stephen B., Pollock, F. Joseph, Potter, Caitlin, Prithiviraj, Bharath, Quince, Christopher, Rani, Asha, Ranjan, Ravi, Rao, Subramanya, Rees, Andrew P., Richardson, Miles, Riebesell, Ulf, Robinson, Carol, Rockne, Karl J., Rodriguezl, Selena Marie, Rohwer, Forest, Roundstone, Wayne, Safran, Rebecca J., Sangwan, Naseer, Sanz, Virginia, Schrenk, Matthew, Schrenzel, Mark D., Scott, Nicole M., Seger, Rita L., Seguin-Orlando, Andaine, Seldin, Lucy, Seyler, Lauren M., Shakhsheer, Baddr, Sheets, Gabriela M., Shen, Congcong, Shi, Yu, Shin, Hakdong, Shogan, Benjamin D., Shutler, Dave, Siegel, Jeffrey, Simmons, Steve, Sjoling, Sara, Smith, Daniel P., Soler, Juan J., Sperling, Martin, Steinberg, Peter D., Stephens, Brent, Stevens, Melita A., Taghavi, Safiyh, Tai, Vera, Tait, Karen, Tan, Chia L., Tas, Neslihan, Taylor, D. Lee, Thomas, Torsten, Timling, Ina, Turner, Benjamin L., Urich, Tim, Ursell, Luke K., van der Lelie, Daniel, Van Treuren, William, van Zwieten, Lukas, Vargas-Robles, Daniela, Thurber, Rebecca Vega, Vitaglione, Paola, Walker, Donald A., Walters, William A., Wang, Shi, Wang, Tao, Weaver, Tom, Webster, Nicole S., Wehrle, Beck, Weisenhorn, Pamela, Weiss, Sophie, Werner, Jeffrey J., West, Kristin, Whitehead, Andrew, Whitehead, Susan R., Whittingham, Linda A., Willerslev, Eske, Williams, Allison E., Wood, Stephen A., Woodhams, Douglas C., Yang, Yeqin, Zaneveld, Jesse, Zarraonaindia, Iratxe, Zhang, Qikun, Zhao, Hongxia, Biological Sciences, Thompson, Luke R., Sanders, Jon G., McDonald, Daniel, Amir, Amnon, Ladau, Joshua, Locey, Kenneth J., Prill, Robert J., Tripathi, Anupriya, Gibbons, Sean M., Ackermann, Gail, Navas-Molina, Jose A., Janssen, Stefan, Kopylova, Evguenia, Vazquez-Baeza, Yoshiki, Gonzalez, Antonio, Morton, James T., Mirarab, Siavash, Xu, Zhenjiang Zech, Jiang, Lingjing, Haroon, Mohamed F., Kanbar, Jad, Zhu, Qiyun, Song, Se Jin, Kosciolek, Tomasz, Bokulich, Nicholas A., Lefler, Joshua, Brislawn, Colin J., Humphrey, Gregory, Owens, Sarah M., Hampton-Marcell, Jarrad, Berg-Lyons, Donna, McKenzie, Valerie, Fierer, Noah, Fuhrman, Jed A., Clauset, Aaron, Stevens, Rick L., Shade, Ashley, Pollard, Katherine S., Goodwin, Kelly D., Jansson, Janet K., Gilbert, Jack A., Knight, Rob, Rivera, Jose L. Agosto, Al-Moosawi, Lisa, Alverdy, John, Amato, Katherine R., Andras, Jason, Angenent, Largus T., Antonopoulos, Dionysios A., Apprill, Amy, Armitage, David, Ballantine, Kate, Barta, Jiri, Baum, Julia K., Berry, Allison, Bhatnagar, Ashish, Bhatnagar, Monica, Biddle, Jennifer F., Bittner, Lucie, Boldgiv, Bazartseren, Bottos, Eric M., Boyer, Donal M., Braun, Josephine, Brazelton, William, Brearley, Francis Q., Campbell, Alexandra H., Caporaso, J. Gregory, Cardona, Cesar, Carroll, JoLynn, Cary, S. Craig, Casper, Brenda B., Charles, Trevor C., Chu, Haiyan, Claar, Danielle C., Clark, Robert G., Clayton, Jonathan B., Clemente, Jose C., Cochran, Alyssa, Coleman, Maureen L., Collins, Gavin, Colwell, Rita R., Contreras, Monica, Crary, Benjamin B., Creer, Simon, Cristol, Daniel A., Crump, Byron C., Cui, Duoying, Daly, Sarah E., Davalos, Liliana, Dawson, Russell D., Defazio, Jennifer, Delsuc, Frederic, Dionisi, Hebe M., Dominguez-Bello, Maria Gloria, Dowell, Robin, Dubinsky, Eric A., Dunn, Peter O., Ercolini, Danilo, Espinoza, Robert E., Ezenwa, Vanessa, Fenner, Nathalie, Findlay, Helen S., Fleming, Irma D., Fogliano, Vincenzo, Forsman, Anna, Freeman, Chris, Friedman, Elliot S., Galindo, Giancarlo, Garcia, Liza, Alexandra Garcia-Amado, Maria, Garshelis, David, Gasser, Robin B., Gerdts, Gunnar, Gibson, Molly K., Gifford, Isaac, Gill, Ryan T., Giray, Tugrul, Gittel, Antje, Golyshin, Peter, Gong, Donglai, Grossart, Hans-Peter, Guyton, Kristina, Haig, Sarah-Jane, Hale, Vanessa, Hall, Ross Stephen, Hallam, Steven J., Handley, Kim M., Hasan, Nur A., Haydon, Shane R., Hickman, Jonathan E., Hidalgo, Glida, Hofmockel, Kirsten S., Hooker, Jeff, Hulth, Stefan, Hultman, Jenni, Hyde, Embriette, Ibanez-Alamo, Juan Diego, Jastrow, Julie D., Jex, Aaron R., Johnson, L. Scott, Johnston, Eric R., Joseph, Stephen, Jurburg, Stephanie D., Jurelevicius, Diogo, Karlsson, Anders, Karlsson, Roger, Kauppinen, Seth, Kellogg, Colleen T. E., Kennedy, Suzanne J., Kerkhof, Lee J., King, Gary M., Kling, George W., Koehler, Anson V., Krezalek, Monika, Kueneman, Jordan G., Lamendella, Regina, Landon, Emily M., Lane-deGraaf, Kelly, LaRoche, Julie, Larsen, Peter, Laverock, Bonnie, Lax, Simon, Lentino, Miguel, Levin, Iris I., Liancourt, Pierre, Liang, Wenju, Linz, Alexandra M., Lipson, David A., Liu, Yongqin, Lladser, Manuel E., Lozada, Mariana, Spirito, Catherine M., MacCormack, Walter P., MacRae-Crerar, Aurora, Magris, Magda, Martin-Platero, Antonio M., Martin-Vivaldi, Manuel, Margarita Martinez, L., Martinez-Bueno, Manuel, Marzinelli, Ezequiel M., Mason, Olivia U., Mayer, Gregory D., McDevitt-Irwin, Jamie M., McDonald, James E., McGuire, Krista L., McMahon, Katherine D., McMinds, Ryan, Medina, Monica, Mendelson, Joseph R., III, Metcalf, Jessica L., Meyer, Folker, Michelangeli, Fabian, Miller, Kim, Mills, David A., Minich, Jeremiah, Mocali, Stefano, Moitinho-Silva, Lucas, Moore, Anni, Morgan-Kiss, Rachael M., Munroe, Paul, Myrold, David, Neufeld, Josh D., Ni, Yingying, Nicol, Graeme W., Nielsen, Shaun, Nissimov, Jozef I., Niu, Kefeng, Nolan, Matthew J., Noyce, Karen, O'Brien, Sarah L., Okamoto, Noriko, Orlando, Ludovic, Castellano, Yadira Ortiz, Osuolale, Olayinka, Oswald, Wyatt, Parnell, Jacob, Peralta-Sanchez, Juan M., Petraitis, Peter, Pfister, Catherine, Pilon-Smits, Elizabeth, Piombino, Paola, Pointing, Stephen B., Pollock, F. Joseph, Potter, Caitlin, Prithiviraj, Bharath, Quince, Christopher, Rani, Asha, Ranjan, Ravi, Rao, Subramanya, Rees, Andrew P., Richardson, Miles, Riebesell, Ulf, Robinson, Carol, Rockne, Karl J., Rodriguezl, Selena Marie, Rohwer, Forest, Roundstone, Wayne, Safran, Rebecca J., Sangwan, Naseer, Sanz, Virginia, Schrenk, Matthew, Schrenzel, Mark D., Scott, Nicole M., Seger, Rita L., Seguin-Orlando, Andaine, Seldin, Lucy, Seyler, Lauren M., Shakhsheer, Baddr, Sheets, Gabriela M., Shen, Congcong, Shi, Yu, Shin, Hakdong, Shogan, Benjamin D., Shutler, Dave, Siegel, Jeffrey, Simmons, Steve, Sjoling, Sara, Smith, Daniel P., Soler, Juan J., Sperling, Martin, Steinberg, Peter D., Stephens, Brent, Stevens, Melita A., Taghavi, Safiyh, Tai, Vera, Tait, Karen, Tan, Chia L., Tas, Neslihan, Taylor, D. Lee, Thomas, Torsten, Timling, Ina, Turner, Benjamin L., Urich, Tim, Ursell, Luke K., van der Lelie, Daniel, Van Treuren, William, van Zwieten, Lukas, Vargas-Robles, Daniela, Thurber, Rebecca Vega, Vitaglione, Paola, Walker, Donald A., Walters, William A., Wang, Shi, Wang, Tao, Weaver, Tom, Webster, Nicole S., Wehrle, Beck, Weisenhorn, Pamela, Weiss, Sophie, Werner, Jeffrey J., West, Kristin, Whitehead, Andrew, Whitehead, Susan R., Whittingham, Linda A., Willerslev, Eske, Williams, Allison E., Wood, Stephen A., Woodhams, Douglas C., Yang, Yeqin, Zaneveld, Jesse, Zarraonaindia, Iratxe, Zhang, Qikun, and Zhao, Hongxia

Abstract

Our growing awareness of the microbial world's importance and diversity contrasts starkly with our limited understanding of its fundamental structure. Despite recent advances in DNA sequencing, a lack of standardized protocols and common analytical frameworks impedes comparisons among studies, hindering the development of global inferences about microbial life on Earth. Here we present a meta-analysis of microbial community samples collected by hundreds of researchers for the Earth Microbiome Project. Coordinated protocols and new analytical methods, particularly the use of exact sequences instead of clustered operational taxonomic units, enable bacterial and archaeal ribosomal RNA gene sequences to be followed across multiple studies and allow us to explore patterns of diversity at an unprecedented scale. The result is both a reference database giving global context to DNA sequence data and a framework for incorporating data from future studies, fostering increasingly complete characterization of Earth's microbial diversity.

Published
2017

30. A communal catalogue reveals Earth’s multiscale microbial diversity

Author

Thompson, Luke R., Sanders, Jon G., McDonald, Daniel, Amir, Amnon, Ladau, Joshua, Locey, Kenneth J., Prill, Robert J., Tripathi, Anupriya, Gibbons, Sean M., Ackermann, Gail, Navas-Molina, Jose A., Janssen, Stefan, Kopylova, Evguenia, Vázquez-Baeza, Yoshiki, González, Antonio, Morton, James T., Mirarab, Siavash, Zech Xu, Zhenjiang, Jiang, Lingjing, Haroon, Mohamed F., Kanbar, Jad, Zhu, Qiyun, Jin Song, Se, Kosciolek, Tomasz, Bokulich, Nicholas A., Lefler, Joshua, Brislawn, Colin J., Humphrey, Gregory, Owens, Sarah M., Hampton-Marcell, Jarrad, Berg-Lyons, Donna, McKenzie, Valerie, Fierer, Noah, Fuhrman, Jed A., Clauset, Aaron, Stevens, Rick L., Shade, Ashley, Pollard, Katherine S., Goodwin, Kelly D., Jansson, Janet K., Gilbert, Jack A., Knight, Rob, Rivera, Jose L. Agosto, Al-Moosawi, Lisa, Alverdy, John, Amato, Katherine R., Andras, Jason, Angenent, Largus T., Antonopoulos, Dionysios A., Apprill, Amy, Armitage, David, Ballantine, Kate, Bárta, Jirˇí, Baum, Julia K., Berry, Allison, Bhatnagar, Ashish, Bhatnagar, Monica, Biddle, Jennifer F., Bittner, Lucie, Boldgiv, Bazartseren, Bottos, Eric, Boyer, Donal M., Braun, Josephine, Brazelton, William, Brearley, Francis Q., Campbell, Alexandra H., Caporaso, J. Gregory, Cardona, Cesar, Carroll, JoLynn, Cary, S. Craig, Casper, Brenda B., Charles, Trevor C., Chu, Haiyan, Claar, Danielle C., Clark, Robert G., Clayton, Jonathan B., Clemente, Jose C., Cochran, Alyssa, Coleman, Maureen L., Collins, Gavin, Colwell, Rita R., Contreras, Mónica, Crary, Benjamin B., Creer, Simon, Cristol, Daniel A., Crump, Byron C., Cui, Duoying, Daly, Sarah E., Davalos, Liliana, Dawson, Russell D., Defazio, Jennifer, Delsuc, Frédéric, Dionisi, Hebe M., Dominguez-Bello, Maria Gloria, Dowell, Robin, Dubinsky, Eric A., Dunn, Peter O., Ercolini, Danilo, Espinoza, Robert E., Ezenwa, Vanessa, Fenner, Nathalie, Findlay, Helen S., Fleming, Irma D., Fogliano, Vincenzo, Forsman, Anna, Freeman, Chris, Friedman, Elliot S., Galindo, Giancarlo, Garcia, Liza, Garcia-Amado, Maria Alexandra, Garshelis, David, Gasser, Robin B., Gerdts, Gunnar, Gibson, Molly K., Gifford, Isaac, Gill, Ryan T., Giray, Tugrul, Gittel, Antje, Golyshin, Peter, Gong, Donglai, Grossart, Hans-Peter, Guyton, Kristina, Haig, Sarah-Jane, Hale, Vanessa, Hall, Ross Stephen, Hallam, Steven J., Handley, Kim M., Hasan, Nur A., Haydon, Shane R., Hickman, Jonathan E., Hidalgo, Glida, Hofmockel, Kirsten S., Hooker, Jeff, Hulth, Stefan, Hultman, Jenni, Hyde, Embriette, Ibáñez-Álamo, Juan Diego, Jastrow, Julie D., Jex, Aaron R., Johnson, L. Scott, Johnston, Eric R., Joseph, Stephen, Jurburg, Stephanie D., Jurelevicius, Diogo, Karlsson, Anders, Karlsson, Roger, Kauppinen, Seth, Kellogg, Colleen T. E., Kennedy, Suzanne J., Kerkhof, Lee J., King, Gary M., Kling, George W., Koehler, Anson V., Krezalek, Monika, Kueneman, Jordan, Lamendella, Regina, Landon, Emily M., Lane-deGraaf, Kelly, LaRoche, Julie, Larsen, Peter, Laverock, Bonnie, Lax, Simon, Lentino, Miguel, Levin, Iris I., Liancourt, Pierre, Liang, Wenju, Linz, Alexandra M., Lipson, David A., Liu, Yongqin, Lladser, Manuel E., Lozada, Mariana, Spirito, Catherine M., MacCormack, Walter P., MacRae-Crerar, Aurora, Magris, Magda, Martín-Platero, Antonio M., Martín-Vivaldi, Manuel, Martínez, L. Margarita, Martínez-Bueno, Manuel, Marzinelli, Ezequiel M., Mason, Olivia U., Mayer, Gregory D., McDevitt-Irwin, Jamie M., McDonald, James E., McGuire, Krista L., McMahon, Katherine D., McMinds, Ryan, Medina, Mónica, Mendelson, Joseph R., Metcalf, Jessica L., Meyer, Folker, Michelangeli, Fabian, Miller, Kim, Mills, David A., Minich, Jeremiah, Mocali, Stefano, Moitinho-Silva, Lucas, Moore, Anni, Morgan-Kiss, Rachael M., Munroe, Paul, Myrold, David, Neufeld, Josh D., Ni, Yingying, Nicol, Graeme W., Nielsen, Shaun, Nissimov, Jozef I., Niu, Kefeng, Nolan, Matthew J., Noyce, Karen, O’Brien, Sarah L., Okamoto, Noriko, Orlando, Ludovic, Castellano, Yadira Ortiz, Osuolale, Olayinka, Oswald, Wyatt, Parnell, Jacob, Peralta-Sánchez, Juan M., Petraitis, Peter, Pfister, Catherine, Pilon-Smits, Elizabeth, Piombino, Paola, Pointing, Stephen B., Pollock, F. Joseph, Potter, Caitlin, Prithiviraj, Bharath, Quince, Christopher, Rani, Asha, Ranjan, Ravi, Rao, Subramanya, Rees, Andrew P., Richardson, Miles, Riebesell, Ulf, Robinson, Carol, Rockne, Karl J., Rodriguezl, Selena Marie, Rohwer, Forest, Roundstone, Wayne, Safran, Rebecca J., Sangwan, Naseer, Sanz, Virginia, Schrenk, Matthew, Schrenzel, Mark D., Scott, Nicole M., Seger, Rita L., Seguin-Orlando, Andaine, Seldin, Lucy, Seyler, Lauren M., Shakhsheer, Baddr, Sheets, Gabriela M., Shen, Congcong, Shi, Yu, Shin, Hakdong, Shogan, Benjamin D., Shutler, Dave, Siegel, Jeffrey, Simmons, Steve, Sjöling, Sara, Smith, Daniel P., Soler, Juan J., Sperling, Martin, Steinberg, Peter D., Stephens, Brent, Stevens, Melita A., Taghavi, Safiyh, Tai, Vera, Tait, Karen, Tan, Chia L., Tas¸, Neslihan, Taylor, D. Lee, Thomas, Torsten, Timling, Ina, Turner, Benjamin L., Urich, Tim, Ursell, Luke K., van der Lelie, Daniel, Van Treuren, William, van Zwieten, Lukas, Vargas-Robles, Daniela, Thurber, Rebecca Vega, Vitaglione, Paola, Walker, Donald A., Walters, William A., Wang, Shi, Wang, Tao, Weaver, Tom, Webster, Nicole S., Wehrle, Beck, Weisenhorn, Pamela, Weiss, Sophie, Werner, Jeffrey J., West, Kristin, Whitehead, Andrew, Whitehead, Susan R., Whittingham, Linda A., Willerslev, Eske, Williams, Allison E., Wood, Stephen A., Woodhams, Douglas C., Yang, Yeqin, Zaneveld, Jesse, Zarraonaindia, Iratxe, Zhang, Qikun, Zhao, Hongxia, Thompson, Luke R., Sanders, Jon G., McDonald, Daniel, Amir, Amnon, Ladau, Joshua, Locey, Kenneth J., Prill, Robert J., Tripathi, Anupriya, Gibbons, Sean M., Ackermann, Gail, Navas-Molina, Jose A., Janssen, Stefan, Kopylova, Evguenia, Vázquez-Baeza, Yoshiki, González, Antonio, Morton, James T., Mirarab, Siavash, Zech Xu, Zhenjiang, Jiang, Lingjing, Haroon, Mohamed F., Kanbar, Jad, Zhu, Qiyun, Jin Song, Se, Kosciolek, Tomasz, Bokulich, Nicholas A., Lefler, Joshua, Brislawn, Colin J., Humphrey, Gregory, Owens, Sarah M., Hampton-Marcell, Jarrad, Berg-Lyons, Donna, McKenzie, Valerie, Fierer, Noah, Fuhrman, Jed A., Clauset, Aaron, Stevens, Rick L., Shade, Ashley, Pollard, Katherine S., Goodwin, Kelly D., Jansson, Janet K., Gilbert, Jack A., Knight, Rob, Rivera, Jose L. Agosto, Al-Moosawi, Lisa, Alverdy, John, Amato, Katherine R., Andras, Jason, Angenent, Largus T., Antonopoulos, Dionysios A., Apprill, Amy, Armitage, David, Ballantine, Kate, Bárta, Jirˇí, Baum, Julia K., Berry, Allison, Bhatnagar, Ashish, Bhatnagar, Monica, Biddle, Jennifer F., Bittner, Lucie, Boldgiv, Bazartseren, Bottos, Eric, Boyer, Donal M., Braun, Josephine, Brazelton, William, Brearley, Francis Q., Campbell, Alexandra H., Caporaso, J. Gregory, Cardona, Cesar, Carroll, JoLynn, Cary, S. Craig, Casper, Brenda B., Charles, Trevor C., Chu, Haiyan, Claar, Danielle C., Clark, Robert G., Clayton, Jonathan B., Clemente, Jose C., Cochran, Alyssa, Coleman, Maureen L., Collins, Gavin, Colwell, Rita R., Contreras, Mónica, Crary, Benjamin B., Creer, Simon, Cristol, Daniel A., Crump, Byron C., Cui, Duoying, Daly, Sarah E., Davalos, Liliana, Dawson, Russell D., Defazio, Jennifer, Delsuc, Frédéric, Dionisi, Hebe M., Dominguez-Bello, Maria Gloria, Dowell, Robin, Dubinsky, Eric A., Dunn, Peter O., Ercolini, Danilo, Espinoza, Robert E., Ezenwa, Vanessa, Fenner, Nathalie, Findlay, Helen S., Fleming, Irma D., Fogliano, Vincenzo, Forsman, Anna, Freeman, Chris, Friedman, Elliot S., Galindo, Giancarlo, Garcia, Liza, Garcia-Amado, Maria Alexandra, Garshelis, David, Gasser, Robin B., Gerdts, Gunnar, Gibson, Molly K., Gifford, Isaac, Gill, Ryan T., Giray, Tugrul, Gittel, Antje, Golyshin, Peter, Gong, Donglai, Grossart, Hans-Peter, Guyton, Kristina, Haig, Sarah-Jane, Hale, Vanessa, Hall, Ross Stephen, Hallam, Steven J., Handley, Kim M., Hasan, Nur A., Haydon, Shane R., Hickman, Jonathan E., Hidalgo, Glida, Hofmockel, Kirsten S., Hooker, Jeff, Hulth, Stefan, Hultman, Jenni, Hyde, Embriette, Ibáñez-Álamo, Juan Diego, Jastrow, Julie D., Jex, Aaron R., Johnson, L. Scott, Johnston, Eric R., Joseph, Stephen, Jurburg, Stephanie D., Jurelevicius, Diogo, Karlsson, Anders, Karlsson, Roger, Kauppinen, Seth, Kellogg, Colleen T. E., Kennedy, Suzanne J., Kerkhof, Lee J., King, Gary M., Kling, George W., Koehler, Anson V., Krezalek, Monika, Kueneman, Jordan, Lamendella, Regina, Landon, Emily M., Lane-deGraaf, Kelly, LaRoche, Julie, Larsen, Peter, Laverock, Bonnie, Lax, Simon, Lentino, Miguel, Levin, Iris I., Liancourt, Pierre, Liang, Wenju, Linz, Alexandra M., Lipson, David A., Liu, Yongqin, Lladser, Manuel E., Lozada, Mariana, Spirito, Catherine M., MacCormack, Walter P., MacRae-Crerar, Aurora, Magris, Magda, Martín-Platero, Antonio M., Martín-Vivaldi, Manuel, Martínez, L. Margarita, Martínez-Bueno, Manuel, Marzinelli, Ezequiel M., Mason, Olivia U., Mayer, Gregory D., McDevitt-Irwin, Jamie M., McDonald, James E., McGuire, Krista L., McMahon, Katherine D., McMinds, Ryan, Medina, Mónica, Mendelson, Joseph R., Metcalf, Jessica L., Meyer, Folker, Michelangeli, Fabian, Miller, Kim, Mills, David A., Minich, Jeremiah, Mocali, Stefano, Moitinho-Silva, Lucas, Moore, Anni, Morgan-Kiss, Rachael M., Munroe, Paul, Myrold, David, Neufeld, Josh D., Ni, Yingying, Nicol, Graeme W., Nielsen, Shaun, Nissimov, Jozef I., Niu, Kefeng, Nolan, Matthew J., Noyce, Karen, O’Brien, Sarah L., Okamoto, Noriko, Orlando, Ludovic, Castellano, Yadira Ortiz, Osuolale, Olayinka, Oswald, Wyatt, Parnell, Jacob, Peralta-Sánchez, Juan M., Petraitis, Peter, Pfister, Catherine, Pilon-Smits, Elizabeth, Piombino, Paola, Pointing, Stephen B., Pollock, F. Joseph, Potter, Caitlin, Prithiviraj, Bharath, Quince, Christopher, Rani, Asha, Ranjan, Ravi, Rao, Subramanya, Rees, Andrew P., Richardson, Miles, Riebesell, Ulf, Robinson, Carol, Rockne, Karl J., Rodriguezl, Selena Marie, Rohwer, Forest, Roundstone, Wayne, Safran, Rebecca J., Sangwan, Naseer, Sanz, Virginia, Schrenk, Matthew, Schrenzel, Mark D., Scott, Nicole M., Seger, Rita L., Seguin-Orlando, Andaine, Seldin, Lucy, Seyler, Lauren M., Shakhsheer, Baddr, Sheets, Gabriela M., Shen, Congcong, Shi, Yu, Shin, Hakdong, Shogan, Benjamin D., Shutler, Dave, Siegel, Jeffrey, Simmons, Steve, Sjöling, Sara, Smith, Daniel P., Soler, Juan J., Sperling, Martin, Steinberg, Peter D., Stephens, Brent, Stevens, Melita A., Taghavi, Safiyh, Tai, Vera, Tait, Karen, Tan, Chia L., Tas¸, Neslihan, Taylor, D. Lee, Thomas, Torsten, Timling, Ina, Turner, Benjamin L., Urich, Tim, Ursell, Luke K., van der Lelie, Daniel, Van Treuren, William, van Zwieten, Lukas, Vargas-Robles, Daniela, Thurber, Rebecca Vega, Vitaglione, Paola, Walker, Donald A., Walters, William A., Wang, Shi, Wang, Tao, Weaver, Tom, Webster, Nicole S., Wehrle, Beck, Weisenhorn, Pamela, Weiss, Sophie, Werner, Jeffrey J., West, Kristin, Whitehead, Andrew, Whitehead, Susan R., Whittingham, Linda A., Willerslev, Eske, Williams, Allison E., Wood, Stephen A., Woodhams, Douglas C., Yang, Yeqin, Zaneveld, Jesse, Zarraonaindia, Iratxe, Zhang, Qikun, and Zhao, Hongxia

Abstract

Our growing awareness of the microbial world’s importance and diversity contrasts starkly with our limited understanding of its fundamental structure. Despite recent advances in DNA sequencing, a lack of standardized protocols and common analytical frameworks impedes comparisons among studies, hindering the development of global inferences about microbial life on Earth. Here we present a meta-analysis of microbial community samples collected by hundreds of researchers for the Earth Microbiome Project. Coordinated protocols and new analytical methods, particularly the use of exact sequences instead of clustered operational taxonomic units, enable bacterial and archaeal ribosomal RNA gene sequences to be followed across multiple studies and allow us to explore patterns of diversity at an unprecedented scale. The result is both a reference database giving global context to DNA sequence data and a framework for incorporating data from future studies, fostering increasingly complete characterization of Earth’s microbial diversity.

Published
2017
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31. A communal catalogue reveals Earth’s multiscale microbial diversity

Author

Thompson, Luke R., Sanders, Jon G., McDonald, Daniel, Amir, Amnon, Ladau, Joshua, Locey, Kenneth J., Prill, Robert J., Tripathi, Anupriya, Gibbons, Sean M., Ackermann, Gail, Navas-Molina, Jose A., Janssen, Stefan, Kopylova, Evguenia, Vázquez-Baeza, Yoshiki, González, Antonio, Morton, James T., Mirarab, Siavash, Zech Xu, Zhenjiang, Jiang, Lingjing, Haroon, Mohamed F., Kanbar, Jad, Zhu, Qiyun, Jin Song, Se, Kosciolek, Tomasz, Bokulich, Nicholas A., Lefler, Joshua, Brislawn, Colin J., Humphrey, Gregory, Owens, Sarah M., Hampton-Marcell, Jarrad, Berg-Lyons, Donna, McKenzie, Valerie, Fierer, Noah, Fuhrman, Jed A., Clauset, Aaron, Stevens, Rick L., Shade, Ashley, Pollard, Katherine S., Goodwin, Kelly D., Jansson, Janet K., Gilbert, Jack A., Knight, Rob, Rivera, Jose L. Agosto, Al-Moosawi, Lisa, Alverdy, John, Amato, Katherine R., Andras, Jason, Angenent, Largus T., Antonopoulos, Dionysios A., Apprill, Amy, Armitage, David, Ballantine, Kate, Bárta, Jirˇí, Baum, Julia K., Berry, Allison, Bhatnagar, Ashish, Bhatnagar, Monica, Biddle, Jennifer F., Bittner, Lucie, Boldgiv, Bazartseren, Bottos, Eric, Boyer, Donal M., Braun, Josephine, Brazelton, William, Brearley, Francis Q., Campbell, Alexandra H., Caporaso, J. Gregory, Cardona, Cesar, Carroll, JoLynn, Cary, S. Craig, Casper, Brenda B., Charles, Trevor C., Chu, Haiyan, Claar, Danielle C., Clark, Robert G., Clayton, Jonathan B., Clemente, Jose C., Cochran, Alyssa, Coleman, Maureen L., Collins, Gavin, Colwell, Rita R., Contreras, Mónica, Crary, Benjamin B., Creer, Simon, Cristol, Daniel A., Crump, Byron C., Cui, Duoying, Daly, Sarah E., Davalos, Liliana, Dawson, Russell D., Defazio, Jennifer, Delsuc, Frédéric, Dionisi, Hebe M., Dominguez-Bello, Maria Gloria, Dowell, Robin, Dubinsky, Eric A., Dunn, Peter O., Ercolini, Danilo, Espinoza, Robert E., Ezenwa, Vanessa, Fenner, Nathalie, Findlay, Helen S., Fleming, Irma D., Fogliano, Vincenzo, Forsman, Anna, Freeman, Chris, Friedman, Elliot S., Galindo, Giancarlo, Garcia, Liza, Garcia-Amado, Maria Alexandra, Garshelis, David, Gasser, Robin B., Gerdts, Gunnar, Gibson, Molly K., Gifford, Isaac, Gill, Ryan T., Giray, Tugrul, Gittel, Antje, Golyshin, Peter, Gong, Donglai, Grossart, Hans-Peter, Guyton, Kristina, Haig, Sarah-Jane, Hale, Vanessa, Hall, Ross Stephen, Hallam, Steven J., Handley, Kim M., Hasan, Nur A., Haydon, Shane R., Hickman, Jonathan E., Hidalgo, Glida, Hofmockel, Kirsten S., Hooker, Jeff, Hulth, Stefan, Hultman, Jenni, Hyde, Embriette, Ibáñez-Álamo, Juan Diego, Jastrow, Julie D., Jex, Aaron R., Johnson, L. Scott, Johnston, Eric R., Joseph, Stephen, Jurburg, Stephanie D., Jurelevicius, Diogo, Karlsson, Anders, Karlsson, Roger, Kauppinen, Seth, Kellogg, Colleen T. E., Kennedy, Suzanne J., Kerkhof, Lee J., King, Gary M., Kling, George W., Koehler, Anson V., Krezalek, Monika, Kueneman, Jordan, Lamendella, Regina, Landon, Emily M., Lane-deGraaf, Kelly, LaRoche, Julie, Larsen, Peter, Laverock, Bonnie, Lax, Simon, Lentino, Miguel, Levin, Iris I., Liancourt, Pierre, Liang, Wenju, Linz, Alexandra M., Lipson, David A., Liu, Yongqin, Lladser, Manuel E., Lozada, Mariana, Spirito, Catherine M., MacCormack, Walter P., MacRae-Crerar, Aurora, Magris, Magda, Martín-Platero, Antonio M., Martín-Vivaldi, Manuel, Martínez, L. Margarita, Martínez-Bueno, Manuel, Marzinelli, Ezequiel M., Mason, Olivia U., Mayer, Gregory D., McDevitt-Irwin, Jamie M., McDonald, James E., McGuire, Krista L., McMahon, Katherine D., McMinds, Ryan, Medina, Mónica, Mendelson, Joseph R., Metcalf, Jessica L., Meyer, Folker, Michelangeli, Fabian, Miller, Kim, Mills, David A., Minich, Jeremiah, Mocali, Stefano, Moitinho-Silva, Lucas, Moore, Anni, Morgan-Kiss, Rachael M., Munroe, Paul, Myrold, David, Neufeld, Josh D., Ni, Yingying, Nicol, Graeme W., Nielsen, Shaun, Nissimov, Jozef I., Niu, Kefeng, Nolan, Matthew J., Noyce, Karen, O’Brien, Sarah L., Okamoto, Noriko, Orlando, Ludovic, Castellano, Yadira Ortiz, Osuolale, Olayinka, Oswald, Wyatt, Parnell, Jacob, Peralta-Sánchez, Juan M., Petraitis, Peter, Pfister, Catherine, Pilon-Smits, Elizabeth, Piombino, Paola, Pointing, Stephen B., Pollock, F. Joseph, Potter, Caitlin, Prithiviraj, Bharath, Quince, Christopher, Rani, Asha, Ranjan, Ravi, Rao, Subramanya, Rees, Andrew P., Richardson, Miles, Riebesell, Ulf, Robinson, Carol, Rockne, Karl J., Rodriguezl, Selena Marie, Rohwer, Forest, Roundstone, Wayne, Safran, Rebecca J., Sangwan, Naseer, Sanz, Virginia, Schrenk, Matthew, Schrenzel, Mark D., Scott, Nicole M., Seger, Rita L., Seguin-Orlando, Andaine, Seldin, Lucy, Seyler, Lauren M., Shakhsheer, Baddr, Sheets, Gabriela M., Shen, Congcong, Shi, Yu, Shin, Hakdong, Shogan, Benjamin D., Shutler, Dave, Siegel, Jeffrey, Simmons, Steve, Sjöling, Sara, Smith, Daniel P., Soler, Juan J., Sperling, Martin, Steinberg, Peter D., Stephens, Brent, Stevens, Melita A., Taghavi, Safiyh, Tai, Vera, Tait, Karen, Tan, Chia L., Tas¸, Neslihan, Taylor, D. Lee, Thomas, Torsten, Timling, Ina, Turner, Benjamin L., Urich, Tim, Ursell, Luke K., van der Lelie, Daniel, Van Treuren, William, van Zwieten, Lukas, Vargas-Robles, Daniela, Thurber, Rebecca Vega, Vitaglione, Paola, Walker, Donald A., Walters, William A., Wang, Shi, Wang, Tao, Weaver, Tom, Webster, Nicole S., Wehrle, Beck, Weisenhorn, Pamela, Weiss, Sophie, Werner, Jeffrey J., West, Kristin, Whitehead, Andrew, Whitehead, Susan R., Whittingham, Linda A., Willerslev, Eske, Williams, Allison E., Wood, Stephen A., Woodhams, Douglas C., Yang, Yeqin, Zaneveld, Jesse, Zarraonaindia, Iratxe, Zhang, Qikun, Zhao, Hongxia, Thompson, Luke R., Sanders, Jon G., McDonald, Daniel, Amir, Amnon, Ladau, Joshua, Locey, Kenneth J., Prill, Robert J., Tripathi, Anupriya, Gibbons, Sean M., Ackermann, Gail, Navas-Molina, Jose A., Janssen, Stefan, Kopylova, Evguenia, Vázquez-Baeza, Yoshiki, González, Antonio, Morton, James T., Mirarab, Siavash, Zech Xu, Zhenjiang, Jiang, Lingjing, Haroon, Mohamed F., Kanbar, Jad, Zhu, Qiyun, Jin Song, Se, Kosciolek, Tomasz, Bokulich, Nicholas A., Lefler, Joshua, Brislawn, Colin J., Humphrey, Gregory, Owens, Sarah M., Hampton-Marcell, Jarrad, Berg-Lyons, Donna, McKenzie, Valerie, Fierer, Noah, Fuhrman, Jed A., Clauset, Aaron, Stevens, Rick L., Shade, Ashley, Pollard, Katherine S., Goodwin, Kelly D., Jansson, Janet K., Gilbert, Jack A., Knight, Rob, Rivera, Jose L. Agosto, Al-Moosawi, Lisa, Alverdy, John, Amato, Katherine R., Andras, Jason, Angenent, Largus T., Antonopoulos, Dionysios A., Apprill, Amy, Armitage, David, Ballantine, Kate, Bárta, Jirˇí, Baum, Julia K., Berry, Allison, Bhatnagar, Ashish, Bhatnagar, Monica, Biddle, Jennifer F., Bittner, Lucie, Boldgiv, Bazartseren, Bottos, Eric, Boyer, Donal M., Braun, Josephine, Brazelton, William, Brearley, Francis Q., Campbell, Alexandra H., Caporaso, J. Gregory, Cardona, Cesar, Carroll, JoLynn, Cary, S. Craig, Casper, Brenda B., Charles, Trevor C., Chu, Haiyan, Claar, Danielle C., Clark, Robert G., Clayton, Jonathan B., Clemente, Jose C., Cochran, Alyssa, Coleman, Maureen L., Collins, Gavin, Colwell, Rita R., Contreras, Mónica, Crary, Benjamin B., Creer, Simon, Cristol, Daniel A., Crump, Byron C., Cui, Duoying, Daly, Sarah E., Davalos, Liliana, Dawson, Russell D., Defazio, Jennifer, Delsuc, Frédéric, Dionisi, Hebe M., Dominguez-Bello, Maria Gloria, Dowell, Robin, Dubinsky, Eric A., Dunn, Peter O., Ercolini, Danilo, Espinoza, Robert E., Ezenwa, Vanessa, Fenner, Nathalie, Findlay, Helen S., Fleming, Irma D., Fogliano, Vincenzo, Forsman, Anna, Freeman, Chris, Friedman, Elliot S., Galindo, Giancarlo, Garcia, Liza, Garcia-Amado, Maria Alexandra, Garshelis, David, Gasser, Robin B., Gerdts, Gunnar, Gibson, Molly K., Gifford, Isaac, Gill, Ryan T., Giray, Tugrul, Gittel, Antje, Golyshin, Peter, Gong, Donglai, Grossart, Hans-Peter, Guyton, Kristina, Haig, Sarah-Jane, Hale, Vanessa, Hall, Ross Stephen, Hallam, Steven J., Handley, Kim M., Hasan, Nur A., Haydon, Shane R., Hickman, Jonathan E., Hidalgo, Glida, Hofmockel, Kirsten S., Hooker, Jeff, Hulth, Stefan, Hultman, Jenni, Hyde, Embriette, Ibáñez-Álamo, Juan Diego, Jastrow, Julie D., Jex, Aaron R., Johnson, L. Scott, Johnston, Eric R., Joseph, Stephen, Jurburg, Stephanie D., Jurelevicius, Diogo, Karlsson, Anders, Karlsson, Roger, Kauppinen, Seth, Kellogg, Colleen T. E., Kennedy, Suzanne J., Kerkhof, Lee J., King, Gary M., Kling, George W., Koehler, Anson V., Krezalek, Monika, Kueneman, Jordan, Lamendella, Regina, Landon, Emily M., Lane-deGraaf, Kelly, LaRoche, Julie, Larsen, Peter, Laverock, Bonnie, Lax, Simon, Lentino, Miguel, Levin, Iris I., Liancourt, Pierre, Liang, Wenju, Linz, Alexandra M., Lipson, David A., Liu, Yongqin, Lladser, Manuel E., Lozada, Mariana, Spirito, Catherine M., MacCormack, Walter P., MacRae-Crerar, Aurora, Magris, Magda, Martín-Platero, Antonio M., Martín-Vivaldi, Manuel, Martínez, L. Margarita, Martínez-Bueno, Manuel, Marzinelli, Ezequiel M., Mason, Olivia U., Mayer, Gregory D., McDevitt-Irwin, Jamie M., McDonald, James E., McGuire, Krista L., McMahon, Katherine D., McMinds, Ryan, Medina, Mónica, Mendelson, Joseph R., Metcalf, Jessica L., Meyer, Folker, Michelangeli, Fabian, Miller, Kim, Mills, David A., Minich, Jeremiah, Mocali, Stefano, Moitinho-Silva, Lucas, Moore, Anni, Morgan-Kiss, Rachael M., Munroe, Paul, Myrold, David, Neufeld, Josh D., Ni, Yingying, Nicol, Graeme W., Nielsen, Shaun, Nissimov, Jozef I., Niu, Kefeng, Nolan, Matthew J., Noyce, Karen, O’Brien, Sarah L., Okamoto, Noriko, Orlando, Ludovic, Castellano, Yadira Ortiz, Osuolale, Olayinka, Oswald, Wyatt, Parnell, Jacob, Peralta-Sánchez, Juan M., Petraitis, Peter, Pfister, Catherine, Pilon-Smits, Elizabeth, Piombino, Paola, Pointing, Stephen B., Pollock, F. Joseph, Potter, Caitlin, Prithiviraj, Bharath, Quince, Christopher, Rani, Asha, Ranjan, Ravi, Rao, Subramanya, Rees, Andrew P., Richardson, Miles, Riebesell, Ulf, Robinson, Carol, Rockne, Karl J., Rodriguezl, Selena Marie, Rohwer, Forest, Roundstone, Wayne, Safran, Rebecca J., Sangwan, Naseer, Sanz, Virginia, Schrenk, Matthew, Schrenzel, Mark D., Scott, Nicole M., Seger, Rita L., Seguin-Orlando, Andaine, Seldin, Lucy, Seyler, Lauren M., Shakhsheer, Baddr, Sheets, Gabriela M., Shen, Congcong, Shi, Yu, Shin, Hakdong, Shogan, Benjamin D., Shutler, Dave, Siegel, Jeffrey, Simmons, Steve, Sjöling, Sara, Smith, Daniel P., Soler, Juan J., Sperling, Martin, Steinberg, Peter D., Stephens, Brent, Stevens, Melita A., Taghavi, Safiyh, Tai, Vera, Tait, Karen, Tan, Chia L., Tas¸, Neslihan, Taylor, D. Lee, Thomas, Torsten, Timling, Ina, Turner, Benjamin L., Urich, Tim, Ursell, Luke K., van der Lelie, Daniel, Van Treuren, William, van Zwieten, Lukas, Vargas-Robles, Daniela, Thurber, Rebecca Vega, Vitaglione, Paola, Walker, Donald A., Walters, William A., Wang, Shi, Wang, Tao, Weaver, Tom, Webster, Nicole S., Wehrle, Beck, Weisenhorn, Pamela, Weiss, Sophie, Werner, Jeffrey J., West, Kristin, Whitehead, Andrew, Whitehead, Susan R., Whittingham, Linda A., Willerslev, Eske, Williams, Allison E., Wood, Stephen A., Woodhams, Douglas C., Yang, Yeqin, Zaneveld, Jesse, Zarraonaindia, Iratxe, Zhang, Qikun, and Zhao, Hongxia

Abstract

Our growing awareness of the microbial world’s importance and diversity contrasts starkly with our limited understanding of its fundamental structure. Despite recent advances in DNA sequencing, a lack of standardized protocols and common analytical frameworks impedes comparisons among studies, hindering the development of global inferences about microbial life on Earth. Here we present a meta-analysis of microbial community samples collected by hundreds of researchers for the Earth Microbiome Project. Coordinated protocols and new analytical methods, particularly the use of exact sequences instead of clustered operational taxonomic units, enable bacterial and archaeal ribosomal RNA gene sequences to be followed across multiple studies and allow us to explore patterns of diversity at an unprecedented scale. The result is both a reference database giving global context to DNA sequence data and a framework for incorporating data from future studies, fostering increasingly complete characterization of Earth’s microbial diversity.

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2017
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32. Arquitectura religiosa del Renacimiento en Álava (1530-1611)

Author

Vélez Chaurri, José Javier, Historia del Arte y la Música;;Artearen eta Musikaren Historia, Historia del arte y música, Artearen eta musikaren historia, Urresti Sanz, Virginia, Vélez Chaurri, José Javier, Historia del Arte y la Música;;Artearen eta Musikaren Historia, Historia del arte y música, Artearen eta musikaren historia, and Urresti Sanz, Virginia

Abstract

601 p., Esta tesis doctoral presenta una panorámica de la arquitectura religiosa en Álava durante los dos últimos tercios del siglo XVI, momento en el que se introduce y desarrolla el Renacimiento en el interior de los espacios sagrados. Hemos dividido la arquitectura religiosa alavesa del siglo XVI en dos momentos, el primero ocupa el segundo tercio de la centuria, y en el conviven las estructuras arquitectónicas góticas y las novedades renacentistas, principalmente decorativas. En el último tercio del siglo XVI y los comienzos de la siguiente centuria se desarrolla un segundo período en el que se asimilan y emplean esquemas clásicos, especialmente visible en el sistema de cubrición y en el uso de los órdenes. Estas innovaciones llegaron, en el segundo tercio, desde Burgos y Valladolid, a través de Oñate, y desde Andalucía, a través de Viana, en el último tercio. Los responsables de la introducción de estos cambios fueron primero nobles y burgueses vitorianos presentes en la Corte de Carlos V, como el licenciado Ortuño de Aguirre o el doctor Fernán López de Escoriaza, y, después prelados de la diócesis de Calahorra y La Calzada, como los obispos Bernal Díaz de Luco y Juan de Quiñones, o el vicario general Francisco de Vicio, que fueron difundiendo las novedades renacentistas, a la vez que los hidalgos vitorianos las introducían en sus capillas funerarias. Los artífices que levantaron estas iglesias fueron canteros sobre todo guipuzcoanos, vizcaínos y cántabros. En el primer momento destaca la presencia de los maestros guipuzcoanos que trabajaron en las obras patrocinadas por el obispo Rodrigo Mercado de Zuazola en Oñate, y en el último tercio los vizcaínos que estuvieron en contacto con los maestros responsables de la construcción de la portada de Santa María de Viana. A finales de siglo tomaron el relevo, los arquitectos cántabros que introdujeron los modelos clasicistas cortesanos desde Valladolid o Lerma.

Published
2016

33. Los panteones reales del Monasterio de San Lorenzo de El Escorial. Muerte, sistemas sepulcrales y construcción de imagen dinástica, (1563-1833)

Author

Merino Thomas, Andrés, León Sanz, Virginia, Merino Thomas, Andrés, and León Sanz, Virginia

Abstract

Estudio de la importancia histórica del panteón real y los demás espacios que configuran el monasterio de san Lorenzo de El Escorial, construido a iniciativa de Felipe II entre 1563 y 1584, como lugar de creación y proyección de imagen funeraria de la monarquía de España, durante la Edad Moderna, a partir de la mentalidad ante la muerte de los soberanos españoles, sus consortes y familiares, y el depósito de sus restos mortales en el mismo, cuya custodia era confiada a su comunidad jerónima.

Published
2016

34. Arquitectura religiosa del Renacimiento en Álava (1530-1611)

Author

Vélez Chaurri, José Javier, Historia del Arte y la Música;;Artearen eta Musikaren Historia, Historia del arte y música, Artearen eta musikaren historia, Urresti Sanz, Virginia, Vélez Chaurri, José Javier, Historia del Arte y la Música;;Artearen eta Musikaren Historia, Historia del arte y música, Artearen eta musikaren historia, and Urresti Sanz, Virginia

Abstract

601 p., Esta tesis doctoral presenta una panorámica de la arquitectura religiosa en Álava durante los dos últimos tercios del siglo XVI, momento en el que se introduce y desarrolla el Renacimiento en el interior de los espacios sagrados. Hemos dividido la arquitectura religiosa alavesa del siglo XVI en dos momentos, el primero ocupa el segundo tercio de la centuria, y en el conviven las estructuras arquitectónicas góticas y las novedades renacentistas, principalmente decorativas. En el último tercio del siglo XVI y los comienzos de la siguiente centuria se desarrolla un segundo período en el que se asimilan y emplean esquemas clásicos, especialmente visible en el sistema de cubrición y en el uso de los órdenes. Estas innovaciones llegaron, en el segundo tercio, desde Burgos y Valladolid, a través de Oñate, y desde Andalucía, a través de Viana, en el último tercio. Los responsables de la introducción de estos cambios fueron primero nobles y burgueses vitorianos presentes en la Corte de Carlos V, como el licenciado Ortuño de Aguirre o el doctor Fernán López de Escoriaza, y, después prelados de la diócesis de Calahorra y La Calzada, como los obispos Bernal Díaz de Luco y Juan de Quiñones, o el vicario general Francisco de Vicio, que fueron difundiendo las novedades renacentistas, a la vez que los hidalgos vitorianos las introducían en sus capillas funerarias. Los artífices que levantaron estas iglesias fueron canteros sobre todo guipuzcoanos, vizcaínos y cántabros. En el primer momento destaca la presencia de los maestros guipuzcoanos que trabajaron en las obras patrocinadas por el obispo Rodrigo Mercado de Zuazola en Oñate, y en el último tercio los vizcaínos que estuvieron en contacto con los maestros responsables de la construcción de la portada de Santa María de Viana. A finales de siglo tomaron el relevo, los arquitectos cántabros que introdujeron los modelos clasicistas cortesanos desde Valladolid o Lerma.

Published
2016

35. Los panteones reales del Monasterio de San Lorenzo de El Escorial. Muerte, sistemas sepulcrales y construcción de imagen dinástica, (1563-1833)

Author

Merino Thomas, Andrés, León Sanz, Virginia, Merino Thomas, Andrés, and León Sanz, Virginia

Abstract

Estudio de la importancia histórica del panteón real y los demás espacios que configuran el monasterio de san Lorenzo de El Escorial, construido a iniciativa de Felipe II entre 1563 y 1584, como lugar de creación y proyección de imagen funeraria de la monarquía de España, durante la Edad Moderna, a partir de la mentalidad ante la muerte de los soberanos españoles, sus consortes y familiares, y el depósito de sus restos mortales en el mismo, cuya custodia era confiada a su comunidad jerónima.

Published
2016

36. Los panteones reales del Monasterio de San Lorenzo de El Escorial. Muerte, sistemas sepulcrales y construcción de imagen dinástica, (1563-1833)

Author

León Sanz, Virginia, Merino Thomas, Andrés, León Sanz, Virginia, and Merino Thomas, Andrés

Abstract

Estudio de la importancia histórica del panteón real y los demás espacios que configuran el monasterio de san Lorenzo de El Escorial, construido a iniciativa de Felipe II entre 1563 y 1584, como lugar de creación y proyección de imagen funeraria de la monarquía de España, durante la Edad Moderna, a partir de la mentalidad ante la muerte de los soberanos españoles, sus consortes y familiares, y el depósito de sus restos mortales en el mismo, cuya custodia era confiada a su comunidad jerónima., This study analyses the historical significance of the Royal Pantheon and the other rooms that form the Royal Site of San Lorenzo de El Escorial, built on the initiative of Philip II between 1563 and 1584, as a place of historical creation, projection and evolution of funerary image of the Spanish Monarchy, during the Modern Age, taking into consideration the attitude towards the death of the Spanish sovereigns, their spouses and other relatives, and the placing or their mortal remains in the Monastery, whose custody was entrusted to the monks of the Order of St. Jerome.

Published
2016

37. Los panteones reales del Monasterio de San Lorenzo de El Escorial. Muerte, sistemas sepulcrales y construcción de imagen dinástica, (1563-1833)

Author

León Sanz, Virginia, Merino Thomas, Andrés, León Sanz, Virginia, and Merino Thomas, Andrés

Abstract

Estudio de la importancia histórica del panteón real y los demás espacios que configuran el monasterio de san Lorenzo de El Escorial, construido a iniciativa de Felipe II entre 1563 y 1584, como lugar de creación y proyección de imagen funeraria de la monarquía de España, durante la Edad Moderna, a partir de la mentalidad ante la muerte de los soberanos españoles, sus consortes y familiares, y el depósito de sus restos mortales en el mismo, cuya custodia era confiada a su comunidad jerónima., This study analyses the historical significance of the Royal Pantheon and the other rooms that form the Royal Site of San Lorenzo de El Escorial, built on the initiative of Philip II between 1563 and 1584, as a place of historical creation, projection and evolution of funerary image of the Spanish Monarchy, during the Modern Age, taking into consideration the attitude towards the death of the Spanish sovereigns, their spouses and other relatives, and the placing or their mortal remains in the Monastery, whose custody was entrusted to the monks of the Order of St. Jerome.

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2016

38. Arquitectura religiosa del Renacimiento en Álava (1530-1611)

Author

Vélez Chaurri, José Javier, Historia del Arte y la Música;;Artearen eta Musikaren Historia, Historia del arte y música, Artearen eta musikaren historia, Urresti Sanz, Virginia, Vélez Chaurri, José Javier, Historia del Arte y la Música;;Artearen eta Musikaren Historia, Historia del arte y música, Artearen eta musikaren historia, and Urresti Sanz, Virginia

Abstract

601 p., Esta tesis doctoral presenta una panorámica de la arquitectura religiosa en Álava durante los dos últimos tercios del siglo XVI, momento en el que se introduce y desarrolla el Renacimiento en el interior de los espacios sagrados. Hemos dividido la arquitectura religiosa alavesa del siglo XVI en dos momentos, el primero ocupa el segundo tercio de la centuria, y en el conviven las estructuras arquitectónicas góticas y las novedades renacentistas, principalmente decorativas. En el último tercio del siglo XVI y los comienzos de la siguiente centuria se desarrolla un segundo período en el que se asimilan y emplean esquemas clásicos, especialmente visible en el sistema de cubrición y en el uso de los órdenes. Estas innovaciones llegaron, en el segundo tercio, desde Burgos y Valladolid, a través de Oñate, y desde Andalucía, a través de Viana, en el último tercio. Los responsables de la introducción de estos cambios fueron primero nobles y burgueses vitorianos presentes en la Corte de Carlos V, como el licenciado Ortuño de Aguirre o el doctor Fernán López de Escoriaza, y, después prelados de la diócesis de Calahorra y La Calzada, como los obispos Bernal Díaz de Luco y Juan de Quiñones, o el vicario general Francisco de Vicio, que fueron difundiendo las novedades renacentistas, a la vez que los hidalgos vitorianos las introducían en sus capillas funerarias. Los artífices que levantaron estas iglesias fueron canteros sobre todo guipuzcoanos, vizcaínos y cántabros. En el primer momento destaca la presencia de los maestros guipuzcoanos que trabajaron en las obras patrocinadas por el obispo Rodrigo Mercado de Zuazola en Oñate, y en el último tercio los vizcaínos que estuvieron en contacto con los maestros responsables de la construcción de la portada de Santa María de Viana. A finales de siglo tomaron el relevo, los arquitectos cántabros que introdujeron los modelos clasicistas cortesanos desde Valladolid o Lerma.

Published
2016

41. Utrecht, 1713. A Peace possible for Europe

Author

León Sanz, Virginia and León Sanz, Virginia

Abstract

The Treaties of Utrecht ended the War of the Spanish Succession, a conflict that in recent years has been the subject of intense historical debate. The Peace of Utrecht is now analyzed from different perspectives. During negotiations, Philip V of Spain tried to impose their conditions, but eventually he had to accept the agreement of Louis XIV of France with the Maritime powers. The Spanish king had to renounce to the French throne –something h e never really admitted–, and lost his Spanish territories in Europe. He kept instead the Empire in America, being the content of the Treaties regarding colonial trade the subject of a growing historiographical interest. This contribution analyzes also the position of Charles VI of Austria, who claimed the Spanish throne and faced the peace negotiations from a position of apparent strength –although in the final stage of the war he was guided by conflicting interests regarding the rigid defense of his two main scenarios: Catalonia and Italy. In Utrecht-Rastatt, Spanish Habsburg hegemony in Italy was transferred to the Habsburgs of Vienna and this new domain was interpreted in terms of continuity. The Peace of Utrecht is considered a major European peacekeeping project, but it failed to forget a conflict that still remains close in memory., Los Tratados de Utrecht ponían fin a la guerra de Sucesión española, un conflicto que ha sido objeto de un intenso debate historiográfico en los últimos años. La Paz de Utrecht es ahora analizada desde diversas ópticas de aproximación. Durante las negociaciones, Felipe V quiso imponer sus condiciones, pero finalmente debió aceptar lo acordado por Luis XIV con las potencias marítimas. El monarca borbónico tuvo que renunciar al trono francés, algo que nunca admitió realmente, y perdió los territorios europeos extrapeninsulares, pero mantuvo su imperio en América, debiéndose destacar el interés creciente de la historiografía sobre el contenido de los Tratados con relación al comercio colonial. Se analiza también la posición de Carlos VI, el rival al trono español, quien afrontó las negociaciones de la paz desde una aparente posición de fuerza, aunque se guió en la etapa final de la guerra por intereses contradictorios en la firme defensa de sus dos escenarios principales: Cataluña e Italia. La hegemonía de los Austrias de Madrid en Italia pasaba en Utrecht-Rastatt a los Austrias de Viena y su nuevo dominio era interpretado en clave de continuidad. Considerado como uno de los grandes proyectos europeos encaminados a salvaguardar la paz, Utrecht no consiguió hacer olvidar un conflicto que permanece cercano en la memoria.

Published
2013

42. Utrecht, 1713. A Peace possible for Europe

Author

León Sanz, Virginia and León Sanz, Virginia

Abstract

The Treaties of Utrecht ended the War of the Spanish Succession, a conflict that in recent years has been the subject of intense historical debate. The Peace of Utrecht is now analyzed from different perspectives. During negotiations, Philip V of Spain tried to impose their conditions, but eventually he had to accept the agreement of Louis XIV of France with the Maritime powers. The Spanish king had to renounce to the French throne –something h e never really admitted–, and lost his Spanish territories in Europe. He kept instead the Empire in America, being the content of the Treaties regarding colonial trade the subject of a growing historiographical interest. This contribution analyzes also the position of Charles VI of Austria, who claimed the Spanish throne and faced the peace negotiations from a position of apparent strength –although in the final stage of the war he was guided by conflicting interests regarding the rigid defense of his two main scenarios: Catalonia and Italy. In Utrecht-Rastatt, Spanish Habsburg hegemony in Italy was transferred to the Habsburgs of Vienna and this new domain was interpreted in terms of continuity. The Peace of Utrecht is considered a major European peacekeeping project, but it failed to forget a conflict that still remains close in memory., Los Tratados de Utrecht ponían fin a la guerra de Sucesión española, un conflicto que ha sido objeto de un intenso debate historiográfico en los últimos años. La Paz de Utrecht es ahora analizada desde diversas ópticas de aproximación. Durante las negociaciones, Felipe V quiso imponer sus condiciones, pero finalmente debió aceptar lo acordado por Luis XIV con las potencias marítimas. El monarca borbónico tuvo que renunciar al trono francés, algo que nunca admitió realmente, y perdió los territorios europeos extrapeninsulares, pero mantuvo su imperio en América, debiéndose destacar el interés creciente de la historiografía sobre el contenido de los Tratados con relación al comercio colonial. Se analiza también la posición de Carlos VI, el rival al trono español, quien afrontó las negociaciones de la paz desde una aparente posición de fuerza, aunque se guió en la etapa final de la guerra por intereses contradictorios en la firme defensa de sus dos escenarios principales: Cataluña e Italia. La hegemonía de los Austrias de Madrid en Italia pasaba en Utrecht-Rastatt a los Austrias de Viena y su nuevo dominio era interpretado en clave de continuidad. Considerado como uno de los grandes proyectos europeos encaminados a salvaguardar la paz, Utrecht no consiguió hacer olvidar un conflicto que permanece cercano en la memoria.

Published
2013

43. Intraspecific competition replaces interspecific facilitation as abiotic stress decreases: The shifting nature of plant-plant interactions

Author

García-Cervigón, Ana I., Gazol Burgos, Antonio, Sanz, Virginia, Camarero, Jesús Julio, Olano Mendoza, José Miguel, García-Cervigón, Ana I., Gazol Burgos, Antonio, Sanz, Virginia, Camarero, Jesús Julio, and Olano Mendoza, José Miguel

Abstract

Plant-plant interactions change depending on environmental conditions, shifting from competition to facilitation when the stress is high. In addition to these changes, the relevance of intraspecific compared to interspecific interactions may also shift as abiotic stress does. We inferred intra- and interspecific plant-plant interactions of the cushion plant Hormathophylla spinosa as related to the dominant shrub Juniperus sabina in two sites with contrasting abiotic conditions (a slope with high-stress conditions vs. a valley bottom with milder conditions) in a Mediterranean high mountain. Specifically, we studied the spatial patterns and several variables related to plant performance (plant size and form, non-structural carbohydrate - NSC - concentrations and radial growth) of H. spinosa.The spatial pattern varied depending on site conditions. H. spinosa plants were positively associated with juniper in the high-stress slope site, probably through higher establishment rates due to the amelioration of soil conditions. In contrast, in the milder valley site H. spinosa establishment occurred mostly in open areas. Age structure, inferred from annual rings, reflected a massive establishment event in the whole study area which occurred 30-50 years ago. Canopy variables and radial growth were density dependent: both were negatively affected by the high density of H. spinosa individuals in the valley, but favoured by junipers on the slope. Interestingly, NSCs showed the opposite pattern, suggesting lower investment in growth by H. spinosa plants in the valley than on the slope.Our results reinforce the strong links existing between intra- and interspecific relationships and the need to include both when studying the influence of abiotic conditions on plant-plant interactions. This approach enabled us to detect that the direction and intensity of plant-plant interactions may shift at different ecological levels. Particularly interesting was the finding that optimal sites at

Published
2013

44. La motivación laboral, estudio descriptivo de algunas variables

Author

García Sanz, Virginia, Merino Tejedor, Enrique, Universidad de Valladolid. Facultad de Ciencias Sociales, Jurídicas y de la Comunicación, García Sanz, Virginia, Merino Tejedor, Enrique, and Universidad de Valladolid. Facultad de Ciencias Sociales, Jurídicas y de la Comunicación

Abstract

La motivación laboral es la fuerza que impulsa al trabajador a realizar determinadas acciones o comportamientos para la consecución de los objetivos de la empresa. La retribución económica por sí sola no es suficiente fuente de motivación laboral, el trabajador espera recibir además un salario emocional, que podemos definir como toda retribución que recibe el trabajador distinta del dinero. El reconocimiento por parte de los superiores y compañeros, el fomento del sentimiento de autonomía y responsabilidad del trabajador, son principales fuentes de motivación. Las empresas deben invesrtir en estos factores, que implican bajos costes y aumento de la motivación del trabajador. Un empleado motivado buscará la consecución de sus objetivos para conseguir sus expectativas, y a su vez esos objetivos serán los de la empresa, aumentando la productividad de la misma., Grado en Relaciones Laborales y Recursos Humanos

Published
2012

45. La motivación laboral, estudio descriptivo de algunas variables

Author

García Sanz, Virginia, Merino Tejedor, Enrique, Universidad de Valladolid. Facultad de Ciencias Sociales, Jurídicas y de la Comunicación, García Sanz, Virginia, Merino Tejedor, Enrique, and Universidad de Valladolid. Facultad de Ciencias Sociales, Jurídicas y de la Comunicación

Abstract

La motivación laboral es la fuerza que impulsa al trabajador a realizar determinadas acciones o comportamientos para la consecución de los objetivos de la empresa. La retribución económica por sí sola no es suficiente fuente de motivación laboral, el trabajador espera recibir además un salario emocional, que podemos definir como toda retribución que recibe el trabajador distinta del dinero. El reconocimiento por parte de los superiores y compañeros, el fomento del sentimiento de autonomía y responsabilidad del trabajador, son principales fuentes de motivación. Las empresas deben invesrtir en estos factores, que implican bajos costes y aumento de la motivación del trabajador. Un empleado motivado buscará la consecución de sus objetivos para conseguir sus expectativas, y a su vez esos objetivos serán los de la empresa, aumentando la productividad de la misma., Grado en Relaciones Laborales y Recursos Humanos

Published
2012

46. La motivación laboral, estudio descriptivo de algunas variables

Author

García Sanz, Virginia, Merino Tejedor, Enrique, Universidad de Valladolid. Facultad de Ciencias Sociales, Jurídicas y de la Comunicación, García Sanz, Virginia, Merino Tejedor, Enrique, and Universidad de Valladolid. Facultad de Ciencias Sociales, Jurídicas y de la Comunicación

Abstract

La motivación laboral es la fuerza que impulsa al trabajador a realizar determinadas acciones o comportamientos para la consecución de los objetivos de la empresa. La retribución económica por sí sola no es suficiente fuente de motivación laboral, el trabajador espera recibir además un salario emocional, que podemos definir como toda retribución que recibe el trabajador distinta del dinero. El reconocimiento por parte de los superiores y compañeros, el fomento del sentimiento de autonomía y responsabilidad del trabajador, son principales fuentes de motivación. Las empresas deben invesrtir en estos factores, que implican bajos costes y aumento de la motivación del trabajador. Un empleado motivado buscará la consecución de sus objetivos para conseguir sus expectativas, y a su vez esos objetivos serán los de la empresa, aumentando la productividad de la misma., Grado en Relaciones Laborales y Recursos Humanos

Published
2012

47. La motivación laboral, estudio descriptivo de algunas variables

Author

García Sanz, Virginia, Merino Tejedor, Enrique, Universidad de Valladolid. Facultad de Ciencias Sociales, Jurídicas y de la Comunicación, García Sanz, Virginia, Merino Tejedor, Enrique, and Universidad de Valladolid. Facultad de Ciencias Sociales, Jurídicas y de la Comunicación

Abstract

La motivación laboral es la fuerza que impulsa al trabajador a realizar determinadas acciones o comportamientos para la consecución de los objetivos de la empresa. La retribución económica por sí sola no es suficiente fuente de motivación laboral, el trabajador espera recibir además un salario emocional, que podemos definir como toda retribución que recibe el trabajador distinta del dinero. El reconocimiento por parte de los superiores y compañeros, el fomento del sentimiento de autonomía y responsabilidad del trabajador, son principales fuentes de motivación. Las empresas deben invesrtir en estos factores, que implican bajos costes y aumento de la motivación del trabajador. Un empleado motivado buscará la consecución de sus objetivos para conseguir sus expectativas, y a su vez esos objetivos serán los de la empresa, aumentando la productividad de la misma., Grado en Relaciones Laborales y Recursos Humanos

Published
2012

50. 'Abandono de patria y hacienda'. El exilio austracista valenciano

Author

León Sanz, Virginia and León Sanz, Virginia

Abstract

A partir del triunfo de Felipe V en la batalla de Almansa en la primavera de 1707 fueron muchos los valencianos, que solos o con sus familias, tuvieron que dejar casa y hacienda por su lealtad a la Casa de Austria y por el temor a las represalias borbónicas. Aunque fue un destino compartido por muchos austracistas que apoyaron al Archiduque Carlos, en este trabajo se estudia el caso valenciano. Se pueden establecer dos etapas diferenciadas en el exilio austracista valenciano: un primer período que abarcaría desde la derrota de Almansa hasta el fin del conflicto sucesorio peninsular, es decir, hasta la caída de Barcelona el 11 de septiembre de 1714; y una segunda etapa a partir de ese momento. Se ha prestado un particular interés al asentamiento de los valencianos en los dominios imperiales y a la trayectoria seguida por muchos de ellos hasta el final del reinado del emperador Carlos VI, ya que algunos no regresaron a su patria ni siquiera después de la Paz de Viena de 1725., Since the victory of Felipe V in the battle of Almansa, a lot of loyal people to the Archduke Charles, alone or with their families, had to leave and abandon their landed properties; because of they were afraid of the Borbon reprisal. This article analyses the situation of expatriates from Valencia, although his destiny was common to many others Spanish allies of the Archduke Charles. In the case of the people exiled from Valencia, we have established two different stages: a first period from the defeat of Almansa until the end of the War of the Spanish Succession, until the taking possession of Barcelona in 11 September 1714; and the second stage since this time. The article emphasised the study of the settlement of the people from Valencia in the imperial Austrian territories. I analyse also the itinerary follows by many of the refugees until the end of Charles VI's reign. Some of them did not come back to Spain neither after the Peace of Vienna, in 1725.

Published
2007

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