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Pathogen transfers between wild and domestic animals and between animals and humans are increasing. Their dramatic consequences for public and veterinary health as well as for conservation call for innovative and user-friendly methods for pathogen surveillance in wildlife. Xenosurveillance, a method based on the use of invertebrates (e.g., mosquitoes, hematophagous flies, leeches, cadaveric arthropods) to sample animal tissues (e.g., blood) and the associated pathogens, is one of these tools. Previously, we demonstrated that hematophagous flies, such as tsetse flies, could be useful to detect and identify the etiological agents of malaria in a diverse range of mammals in Gabon. However, we did not assess whether this method can be also used to detect viruses. In the present study, we experimentally fed tsetse flies (Glossina fuscipes fuscipes) rabbit blood containing different viruses of medical or veterinary importance (Zika, Dengue, Chikungunya, African swine fever, Bluetongue, and peste des petits ruminants viruses). Then, we used quantitative PCR (i) to determine for how long viral nucleic acid fragments remained detectable in the tsetse midgut during blood digestion and (ii) to compare two blood meal preservation methods (i.e., FTA cards and RNAlater solution) tested using tsetse flies engorged with blood and dengue-2 virus. All viruses remained detectable for 6 days after feeding, although the detection probability significantly decreased over time. FTA cards and RNAlater solution gave similar results in terms of virus detection. Our results demonstrate that xenosurveillance using blood-engorged tsetse flies is a valuable tool to track and survey viruses in wildlife in Sub-Saharan Africa.

The contact between human and wild fauna has considerably increased during these last decades due to the increase of human population size but also to conservation policies. As a consequence, the number of zoonotic diseases soared with a mean of six new infectious diseases per year, 75% of whom being vectorially transmitted. The way to avoid the human contamination by these emergent diseases is based on the efficient vector control resulting from a deep knowledge of the ecology and the feeding behavior of the different vector species. During our work, we have identified and characterized the ecology of 6 tsetse species (Glossina palpalis palpalis, G. fuscipes fuscipes, G. fusca congolense, G. pallicera newsteadi, G. caliginea and G. tabaniformis) that live in forests and 6 stomoxe species (Stomoxys calcitrans, S. inornatus, S. niger niger, S. niger bilineatus, S. omega omega and S. transvittatus) that live in and around (anthropized places) conservation areas. We have also identified 6 tabanid species (Ancala sp., Atylotus sp., Chrysops sp., Haematopota sp., Tabanus par and T. taeniola). The feeding ecology of the tsetse species have been studied through the determination of host extracted from blood meals in the insect caught with molecular techniques. These hematophagous insects had a diversified diet that was constituted of diverse mammal species but also reptiles and birds. The food intake results mostly from wild fauna (86%) and more rarely from humans (14%). However, in anthropised habitats (villages and research’s camps within the parks), the blood intakes from human origin were important, in particular in the villages (100%), suggesting that without wild fauna the flies shift on human host. In the last part of our work, we tried to identify pathogens in the blood samples extracted from the tsetse species in order to test whether these species could be used as living sampling syringe of the wild fauna. This new proposed non-invasive sampling techniques allowed to detect the DNA of various infectious agents (plasmodiums and trypanosomes), but failed to detect the RNA of viruses (arbovirus) suggesting that this approach could be useful but need to be improved.; Avec la mise en place des politiques de conservation des espèces sauvages, l'extension de l'urbanisation et l'accroissement des populations humaines, le contact homme-faune a considérablement augmenté au cours de ces dernières décennies. Par conséquent, le nombre de maladies d'origines zoonotiques a explosé avec six apparitions d'agents infectieux par an, dont 75% sont susceptibles d’être transmises par un vecteur. La plupart de ces maladies n'ayant pas encore de vaccins, les principales méthodes d'évitement sont basées sur les stratégies de lutte anti-vectorielle adaptées à l'écologie et au comportement alimentaire des vecteurs. Au Gabon, particulièrement dans les parcs nationaux, nous avons identifié six espèces de glossines (Glossina palpalis palpalis, G. fuscipes fuscipes, G. fusca congolense, G. pallicera newsteadi, G. caliginea et G tabaniformis) vivant principalement en milieux forestiers, six espèces de stomoxes (Stomoxys calcitrans, S. inornatus, S. niger niger, S. niger bilineatus, S. omega omega et S. transvittatus) inféodées aux milieux ouverts types forêt secondaire, savane et villages. Nous avons également identifié six espèces de tabanides (Ancala sp., Atylotus sp., Chrysops sp., Haematopota sp., Tabanus par et T. taeniola), mais leur distribution n'était pas claire dans les milieux prospectés. Par ailleurs, nous constatons que ces mouches hématophages ont un régime alimentaire très diversifié, comprenant les mammifères terrestres et aquatiques, les reptiles et les oiseaux. Elles se nourrissent à 86% sur la faune, contre seulement 14% sur l'homme. Cependant, dans les milieux anthropisés les repas sanguins d'origine humaine sont très importants, notamment dans les villages (100%) et autour des camps de recherche implantés dans les parcs (24%). Ainsi en l'absence de faune dans le milieu, ces mouches hématophages se nourrissent sur l'homme. Comme 75% des maladies émergentes chez l'homme proviennent de la faune sauvage et que près de ¾ d'entre elles circulent via le sang, elles sont donc susceptibles d’être détectées dans les repas sanguins de mouches hématophages. Cette technique d'échantillonnage non-invasif de la faune sauvage semble être un bon moyen d'identifier les agents infectieux à ADN (plasmodiums et trypanosomes), mais reste encore imprécise pour les agents infectieux à ARN (arbovirus).

The contact between human and wild fauna has considerably increased during these last decades due to the increase of human population size but also to conservation policies. As a consequence, the number of zoonotic diseases soared with a mean of six new infectious diseases per year, 75% of whom being vectorially transmitted. The way to avoid the human contamination by these emergent diseases is based on the efficient vector control resulting from a deep knowledge of the ecology and the feeding behavior of the different vector species. During our work, we have identified and characterized the ecology of 6 tsetse species (Glossina palpalis palpalis, G. fuscipes fuscipes, G. fusca congolense, G. pallicera newsteadi, G. caliginea and G. tabaniformis) that live in forests and 6 stomoxe species (Stomoxys calcitrans, S. inornatus, S. niger niger, S. niger bilineatus, S. omega omega and S. transvittatus) that live in and around (anthropized places) conservation areas. We have also identified 6 tabanid species (Ancala sp., Atylotus sp., Chrysops sp., Haematopota sp., Tabanus par and T. taeniola). The feeding ecology of the tsetse species have been studied through the determination of host extracted from blood meals in the insect caught with molecular techniques. These hematophagous insects had a diversified diet that was constituted of diverse mammal species but also reptiles and birds. The food intake results mostly from wild fauna (86%) and more rarely from humans (14%). However, in anthropised habitats (villages and research’s camps within the parks), the blood intakes from human origin were important, in particular in the villages (100%), suggesting that without wild fauna the flies shift on human host. In the last part of our work, we tried to identify pathogens in the blood samples extracted from the tsetse species in order to test whether these species could be used as living sampling syringe of the wild fauna. This new proposed non-invasive sampling techniques allowed to detect the DNA of various infectious agents (plasmodiums and trypanosomes), but failed to detect the RNA of viruses (arbovirus) suggesting that this approach could be useful but need to be improved., Avec la mise en place des politiques de conservation des espèces sauvages, l'extension de l'urbanisation et l'accroissement des populations humaines, le contact homme-faune a considérablement augmenté au cours de ces dernières décennies. Par conséquent, le nombre de maladies d'origines zoonotiques a explosé avec six apparitions d'agents infectieux par an, dont 75% sont susceptibles d’être transmises par un vecteur. La plupart de ces maladies n'ayant pas encore de vaccins, les principales méthodes d'évitement sont basées sur les stratégies de lutte anti-vectorielle adaptées à l'écologie et au comportement alimentaire des vecteurs. Au Gabon, particulièrement dans les parcs nationaux, nous avons identifié six espèces de glossines (Glossina palpalis palpalis, G. fuscipes fuscipes, G. fusca congolense, G. pallicera newsteadi, G. caliginea et G tabaniformis) vivant principalement en milieux forestiers, six espèces de stomoxes (Stomoxys calcitrans, S. inornatus, S. niger niger, S. niger bilineatus, S. omega omega et S. transvittatus) inféodées aux milieux ouverts types forêt secondaire, savane et villages. Nous avons également identifié six espèces de tabanides (Ancala sp., Atylotus sp., Chrysops sp., Haematopota sp., Tabanus par et T. taeniola), mais leur distribution n'était pas claire dans les milieux prospectés. Par ailleurs, nous constatons que ces mouches hématophages ont un régime alimentaire très diversifié, comprenant les mammifères terrestres et aquatiques, les reptiles et les oiseaux. Elles se nourrissent à 86% sur la faune, contre seulement 14% sur l'homme. Cependant, dans les milieux anthropisés les repas sanguins d'origine humaine sont très importants, notamment dans les villages (100%) et autour des camps de recherche implantés dans les parcs (24%). Ainsi en l'absence de faune dans le milieu, ces mouches hématophages se nourrissent sur l'homme. Comme 75% des maladies émergentes chez l'homme proviennent de la faune sauvage et que près de ¾ d'entre elles circulent via le sang, elles sont donc susceptibles d’être détectées dans les repas sanguins de mouches hématophages. Cette technique d'échantillonnage non-invasif de la faune sauvage semble être un bon moyen d'identifier les agents infectieux à ADN (plasmodiums et trypanosomes), mais reste encore imprécise pour les agents infectieux à ARN (arbovirus).

11 pages; International audience; In order to minimize risks of pathogen transmission with the development of ecotourism in Gabon, a seasonal inventory has been performed in five contrasted biotopes in Ivindo (INP) and Moukalaba-Doudou (MDNP) National Parks. A total of 10,033 hematophagous flies were captured. The Glossinidae, with six different species identified, was the most abundant group and constitutes about 60% of the captured flies compared to the Stomoxys (6 species also identified) and Tabanidae with 28% and 12%, respectively. The Glossinidae showed a higher rate of capture in primary forest and in research camps. In INP, the Stomoxys showed a higher rate of capture in secondary forest and at village borders, whereas in MDNP the Stomoxys were captured more in the savannah area. Thus, each fly group seemed to reach maximum abundance in different habitats. The Glossinidae were more abundant in primary forest and near research camps while Stomoxys were more abundant in secondary forest and savannah. The Tabanidae did not show a clear habitat preference.; Afin de minimiser les risques de transmission de pathogènes avec le développement de l’écotourisme au Gabon, un inventaire saisonnier a été mené dans cinq biotopes caractéristiques des parcs nationaux de l’Ivindo (PNI) et de Moukalaba-Doudou (PNMD). Au total, 10 033 mouches hématophages ont été capturées. Les Glossinidae, avec 6 espèces différentes identifiées, constituaient le groupe le plus abondant avec 60 % de mouches capturées, suivi des Stomoxys (6 espèces différentes identifiées) et des Tabanidae avec respectivement 28 % et 12 %. Les glossines ont été majoritairement capturées en forêt primaire et au niveau des camps de recherche. Au PNI, les stomoxes ont été majoritairement capturés en forêt secondaire et en périphérie des villages. Alors qu’au PNMD, ces stomoxes ont été majoritairement capturés au niveau des savanes. Ainsi, chaque groupe de mouches semble être inféodé à un type de milieu. Les glossines préfèrent la forêt primaire et camps de recherche, alors que les stomoxes préfèrent la forêt secondaire et la savane. Les tabanides ne dégagent aucune préférence particulière pour un type de milieu.