Search

Le colloque de Génomique Environnementale (GE) est une manifestation nationale permettant aux chercheurs français et internationaux travaillant sur l’écologie, l’évolution de la biodiversité ou le fonctionnement des écosystèmes d’échanger sur l’utilisation des nouvelles technologies de séquençages (NTS) et des développements récents en bioinformatique. Il s’agit de la quatrième édition du colloque de Génomique Environnementale après Lyon (2011), Rennes (2013) et de Montpellier (2015) organisé sous l'égide du GDR "Génomique Environnementale" (http://gdr3692.wix.com/gdrge) dont les actions sont soutenues par le CNRS, l’INRA et le MNHN. Ce colloque représente une opportunité exceptionnelle pour échanger entre chercheurs/doctorants/post-doctorants et répondre aux défis posés en matière d’environnement, de réchauffement climatique et plus généralement de maîtrise des impacts globaux sur les écosystèmes. Le colloque GE est un lieu d’échanges privilégié permettant un dialogue efficace entre, d’une part, la communauté scientifique et, d’autre part, les acteurs gérant les systèmes d’observation et d’analyse des écosystèmes (zones ateliers, ORE, parcs naturels etc...) ou les demandes sociétales dont les entreprises sont souvent porteuses.

La naturalité biologique n'est pas intrinsèquement liée à l'arrêt de l'exploitation mais correspond à la présence d'éléments structuraux typiques de forêts en évolution naturelle tels que les bois morts ou les dendromicrohabitats. Par ailleurs d'autres attributs ou propriétés du peuplement peuvent influencer la biodiversité. Les effets de l'ensemble de ces caractéristiques sur les 7 taxons du projet GNB sont examinés ici, avec une discussion sur la manière d'interpréter ces résultats pour la gestion forestière.

Pour saisir la portée et l'intérêt du projet GNB, il ne suffit pas de connaître ses objectifs, dûment fondés sur un bilan circonstancié de l'état des connaissances. Il faut aussi appréhender sa démarche « expérimentale », à commencer par la stratégie d'échantillonnage et d'inventaires ; il faut comprendre le choix de méthodes d'analyse statistique innovantes mais complexes, avec en particulier la notion de magnitude des effets pour que les résultats puissent avoir une « lecture » opérationnelle. Impossible de résumer en quelques mots la réflexion exigeante qui a présidé à la conception du projet.

Cet article conclut le dossier consacré au projet Gestion forestière, Naturalité, Biodiversité, qui s'est attaché à comparer la biodiversité de sept groupes taxonomiques (flore vasculaire, bryophytes, champignons lignicoles, carabes, coléoptères saproxyliques, oiseaux et chiroptères) dans des réserves forestières intégrales et dans leurs équivalents en forêt exploitée. Que retenir des résultats ? Tout d'abord, que des mesures directes de biodiversité confortent les dispositions en vigueur pour la conservation de la biodiversité forestière. Ensuite, que les premiers constats appellent de nouvelles analyses et invitent à approfondir la présentation des résultats, en travaillant avec les forestiers pour des analyses de magnitude plus réalistes.

Wild pollinators have been shown to enhance the pollination of Brassica napus(oilseed rape) and thus increase its market value. Several studies have previously shown that pollination services are greater in crops adjoining forest patches or other seminatural habitats than in crops completely surrounded by other crops.\ud In this study, we investigated the specific importance of forest edges in providing potential pollinators in B. napus fields in two areas in France. Bees were caught with yellow pan traps at increasing distances from both warm and cold\ud forest edges into B. napus fields during the blooming period. A total of 4594 individual bees, representing six families and 83 taxa, were collected. We found that both bee abundance and taxa richness were negatively affected by the distance from forest edge. However, responses varied between bee groups and edge orientations. The ITD (Inter-Tegular distance) of the species, a good proxy for\ud bee foraging range, seems to limit how far the bees can travel from the forest edge. We found a greater abundance of cuckoo bees (Nomada spp.) of Andrena spp. and Andrena spp. males at forest edges, which we assume indicate suitable nesting sites, or at least mating sites, for some abundant Andrena species and their parasites (Fig. 1). Synthesis and Applications. This study provides one of\ud the first examples in temperate ecosystems of how forest edges may actually act as a reservoir of potential pollinators and directly benefit agricultural crops by\ud providing nesting or mating sites for important early spring pollinators. Policymakers and land managers should take forest edges into account and encourage their protection in the agricultural matrix to promote wild bees and their pollination services.

International audience; Wild pollinators contribute to enhance the pollination of Brassica napus (oilseed rape) and thus increase its market value. Several studies have shown that pollination services are greater in crops adjoining forest patches or other semi-natural habitats than in crops completely surrounded by other crops. In this study we investigated the importance of forest edges in providing potential pollinators to Brassica napus fields in two areas in France. Bees were caught with yellow pan traps at different distances from forest edges inside Brassica napus fields during the blooming period. A total of 4,000 individual bees, representing six families and 82 species (or genera) were collected. We found that both bee abundance and species richness were negatively affected by the distance from forest edge. However, responses differed between species, sex and life history traits. There was a greater abundance of cuckoo bees of Andrena spp. (Nomada spp.) and Andrena spp. males at forest edges, which we assume is linked to the local availability of nesting and mating sites. Forest edges seem to play a different role for another speciose family, Halictidae, by providing a diversity of floral resources or establishing a corridor between nesting sites and the forage crop. Furthermore, the mean body size of the species seems to limit how far the bees can travel from the forest edge. Our findings indicate that forest edges are potential early spring pollinator sources for Brassica napus, particularly when they are well exposed to the sun. It might be useful to take into account crop size and forest edge length when planning crop rotation systems and landscape management to promote wild bees and their pollination services.

La présente note traite de la capture récente de deux individus du Ripiphoride Ripidius quadriceps, endoparasite de blattes assez peu commun dans le nord de la France.

Par leur immense diversité, leur rôle écologique majeur et le caractère bio-indicateur de certains, la prise en compte des insectes dans la gestion et la conservation des espaces naturels est croissante depuis une dizaine d'années. Cependant, l'étude de ce groupe souffre d'un manque de ressources professionnelles (entomologistes professionnels, formation) et d'une connaissance encore trop lacunaire de la part des gestionnaires, pourtant fortement intéressés par ce vaste groupe. Du simple état des lieux (inventaire) à l'étude de l'effet d'un type de gestion (étude comparative) en passant par des suivis, l'approche de la diversité entomologique passe par des méthodes et des techniques d'échantillonnage particulières. Les gestionnaires d'espaces forestiers ont depuis longtemps mené des études entomologiques avec des divergences fréquentes, d'un site à un autre, dans les protocoles d'échantillonnage et les groupes taxonomiques abordés. Ces approches quasi- indépendantes de la part d'un gestionnaire à un autre conduisent à une comparaison des résultats entre sites difficile. En 2001, à la demande d'organismes gestionnaires, un groupe de travail dénommé Inv.Ent.For. (Inventaires Entomologiques en Forêt) s'est constitué pour mener une réflexion sur la prise en compte de la faune entomologique dans les espaces naturels forestiers. Composé d'entomologistes professionnels (chercheurs, chargés d'étude de bureaux d'étude ou d'associations, etc.) et de gestionnaires d'espaces naturels (ONF, Réserves Naturelles de France), le groupe a eu pour objectifs de faire des propositions concrètes sur un cadre technique minimal et standardisé concernant les groupes à prendre à compte dans les études entomologiques et les méthodes permettant de les échantillonner. Le présent document présente ces propositions en cinq chapitres. Le premier chapitre reprend des éléments conceptuels et pratiques sur la réalisation d'un inventaire ou d'un échantillonnage. Il fait le point sur les étapes incontournables d'une étude scientifique et sur l'importance de quelques grands principes à respecter. Le deuxième chapitre dresse la liste de l'ensemble des méthodes et techniques permettant d'échantillonner les insectes, aussi bien dans les milieux terrestres, forestiers ou non, que dans les milieux aquatiques. Puis il détaille avec des conseils pratiques, quatre méthodes proposées par le groupe de travail Inv.Ent.For. pouvant être utilisées en forêt tempérée : le piège à fosse, les pièges à vitres, le piège Malaise et les pièges lumineux. Quelques groupes entomologiques pouvant être appréhendés pour des inventaires en milieux forestiers tropicaux sont également abordés avec leurs méthodes spécifiques dans le troisième chapitre. Face à l'impossibilité d'appréhender la colossale diversité des insectes, les membres d'Inv.Ent.For. ont dégagé cinq groupes d'insectes méritant une prise en compte systématique en forêt : les Coléoptères Carabidae et saproxyliques, les Diptères Syrphidae, les Lépidoptères diurnes et nocturnes et les Fourmis rousses (Hyménoptères). Ceux-ci sont présentés un par un dans le quatrième chapitre avec quelques généralités, l'intérêt de leur étude et les méthodes permettant de les échantillonner en fonction des objectifs assignés par le gestionnaire. Enfin, le dernier chapitre donne des conseils pratiques sur la gestion des récoltes d'insectes, depuis le conditionnement après la récolte jusqu'à la valorisation des données d'inventaires en passant par la préparation des individus. / Due to their high diversity, their crucial ecological roles and their use as bio-indicators, insects have been increasingly taken into account into the management of natural areas for ten years. However, the study of insects currently suffers from a lack of professional resources (entomologists, diplomas) and from insufficient background knowledge among land managers, despite an increasing interest. Insect studies include not only rough inventories but also monitoring designs or studies comparing the environmental effects of management practices. All these approaches require particular sampling methods. Even though forest managers have been leading entomological studies for a long time, sampling protocols and study groups often differ between study sites. The comparison of results is therefore quite misleading. In 2001, upon request of several land managers, a working group called Inv.Ent.For. emerged. This group, composed of professional and non-professional entomologists, aimed at defining a technical and standardized framework for forest insect sampling; i.e. key insect groups and common sampling techniques. Proposals are detailed in five chapters of this report. Chapter 1 includes conceptual and practical information about the basic principles and steps of sampling designs. Chapter 2 gives a detailed list of techniques to sample insects in terrestrial (not only forest)ecosystems as well as landwaters. Four families of methods are precisely described, with a practical perspective in temperate forests: pitfall traps, window-flight traps, Malaise traps and light traps. Insect groups and related techniques in tropical forests are highlighted in Chapter 3. Since it is really difficult to encompass the huge diversity of forest insects, the Inv.Ent.For. group suggests to focus insect studies on 5 representative insect groups: ground beetles, saproxylic beetles, Hoverflies, Butterflies and moths, and Formica ants. The interests of these 5 groups, as well as their sampling techniques, are discussed in Chapter 4. The last chapter points out some practical tips to maintain and preserve insect samples, from sampling to packaging, mounting and data management.

Le Domaine des Barres, mondialement connu pour son Arboretum National, est situé dans l'est du département du Loiret. Cet îlot de 280 ha, à l'histoire et au statut particulier, offre une forte concentration d'espèces ligneuses et une mosaïque de sols et de milieux ouverts et forestiers à petite échelle. Malgré sa faible superficie, il héberge une biodiversité floristique, fongique et ornithologique importante. En complément, nous dressons ici une liste de 344 espèces de coléoptères, dans laquelle se côtoient des espèces de régions plutôt froides et des espèces à affinités méridionales, des coléoptères saproxyliques liés au bois mort feuillu ou aux résineux introduits, des taxa inféodés aux sols secs et sablonneux ou aux zones humides. 17 espèces déterminantes de ZNIEFF en région Centre ont été recensées. / The Barres estate is located in the Eastern part of the Loiret department. It includes a National Arboretum, one of the most important botanical collections in the world. It's a 280ha woodlot, whose history and status are quite original. Tree species, soil types, forest and open areas cluster at a small spatial scale. In spite of the small surface, flora, fungus and bird diversity are high. As a complement, we draw here a list of 344 beetle species, including thermophilous meridional species but also cold forest species, saproxylic beetles from deciduous and conifer trees, and species associated to sandy dry or damp soils. 17 species are indicators of important regional ecological areas (ZNIEFF).

Par leur immense diversité, leur rôle écologique majeur et le caractère bio-indicateur de certains, la prise en compte des insectes dans la gestion et la conservation des espaces naturels est croissante depuis une dizaine d'années. Cependant, l'étude de ce groupe souffre d'un manque de ressources professionnelles (entomologistes professionnels, formation) et d'une connaissance encore trop lacunaire de la part des gestionnaires, pourtant fortement intéressés par ce vaste groupe. Du simple état des lieux (inventaire) à l'étude de l'effet d'un type de gestion (étude comparative) en passant par des suivis, l'approche de la diversité entomologique passe par des méthodes et des techniques d'échantillonnage particulières. Les gestionnaires d'espaces forestiers ont depuis longtemps mené des études entomologiques avec des divergences fréquentes, d'un site à un autre, dans les protocoles d'échantillonnage et les groupes taxonomiques abordés. Ces approches quasi- indépendantes de la part d'un gestionnaire à un autre conduisent à une comparaison des résultats entre sites difficile. En 2001, à la demande d'organismes gestionnaires, un groupe de travail dénommé Inv.Ent.For. (Inventaires Entomologiques en Forêt) s'est constitué pour mener une réflexion sur la prise en compte de la faune entomologique dans les espaces naturels forestiers. Composé d'entomologistes professionnels (chercheurs, chargés d'étude de bureaux d'étude ou d'associations, etc.) et de gestionnaires d'espaces naturels (ONF, Réserves Naturelles de France), le groupe a eu pour objectifs de faire des propositions concrètes sur un cadre technique minimal et standardisé concernant les groupes à prendre à compte dans les études entomologiques et les méthodes permettant de les échantillonner. Le présent document présente ces propositions en cinq chapitres. Le premier chapitre reprend des éléments conceptuels et pratiques sur la réalisation d'un inventaire ou d'un échantillonnage. Il fait le point sur les étapes incontournables d'une étude scientifique et sur l'importance de quelques grands principes à respecter. Le deuxième chapitre dresse la liste de l'ensemble des méthodes et techniques permettant d'échantillonner les insectes, aussi bien dans les milieux terrestres, forestiers ou non, que dans les milieux aquatiques. Puis il détaille avec des conseils pratiques, quatre méthodes proposées par le groupe de travail Inv.Ent.For. pouvant être utilisées en forêt tempérée : le piège à fosse, les pièges à vitres, le piège Malaise et les pièges lumineux. Quelques groupes entomologiques pouvant être appréhendés pour des inventaires en milieux forestiers tropicaux sont également abordés avec leurs méthodes spécifiques dans le troisième chapitre. Face à l'impossibilité d'appréhender la colossale diversité des insectes, les membres d'Inv.Ent.For. ont dégagé cinq groupes d'insectes méritant une prise en compte systématique en forêt : les Coléoptères Carabidae et saproxyliques, les Diptères Syrphidae, les Lépidoptères diurnes et nocturnes et les Fourmis rousses (Hyménoptères). Ceux-ci sont présentés un par un dans le quatrième chapitre avec quelques généralités, l'intérêt de leur étude et les méthodes permettant de les échantillonner en fonction des objectifs assignés par le gestionnaire. Enfin, le dernier chapitre donne des conseils pratiques sur la gestion des récoltes d'insectes, depuis le conditionnement après la récolte jusqu'à la valorisation des données d'inventaires en passant par la préparation des individus. / Due to their enormous diversity, crucial ecological role and, in some cases, their use as bio-indicators, insects have been increasingly taken into account in the management and conservation of natural areas over the last decade or so. However, the study of insects is currently suffering from a lack of professional resources (professional entomologists, training) and insufficient background knowledge among land managers, despite their strong interest in this vast group. Ranging from rough inventories to the examination of the effects of a given management approach (comparative studies) including monitoring, any approach to entomological diversity will involve specific sampling methods and techniques. Despite the fact that forest managers have long conducted entomological studies, sampling protocols and study groups often differ from one site to the next. Such virtually independent approaches between managers lead to difficulties in comparing the results from different sites. In 2001, at the request of land management bodies, a working group entitled, Inv.Ent.For.', was set up to reflect upon how consideration could be given to entomological fauna within forest areas. This group, composed of professional entomologists (researchers, research managers in consultancies and not profit associations, etc.) and management bodies for natural areas (e.g. ONF, Réserves Naturelles de France), aimed to define a minimum technical and standardised framework for the insect groups to be targeted in entomological studies and the methods for their sampling. These proposals are detailed in the five chapters of this report. Chapter 1 contains conceptual and practical information on conducting inventories and sampling. It sets out the imperative stages any scientific study must go through and the importance of a small number of broad principles to be followed. Chapter 2 provides a detailed list of techniques for insect sampling in terrestrial (not only forest) ecosystems as well as aquatic environments. It goes on to detail, with accompanying practical advice, four methods proposed by the working group for use in temperate forests: pitfall traps, window flight traps, Malaise traps and light traps. Chapter 3 describes a small number of insect groups that can be captured for tropical forest inventories, along with the specific techniques required. Given the impossibility of encompassing the huge diversity of forest insects, the members of Inv.Ent.For. have defined five insect groups that merit systematic attention in the forest context: ground beetles, saproxylic beetles, hoverflies, butterflies and moths, and red ants. Each of these is discussed in turn in Chapter 4, addressing the benefits to be gained from studying them, and the methods whereby they can be sampled in accordance with the objectives defined by forest managers. The final chapter contains some practical advice on the management of those insect samples that have been collected, from packaging after sampling, to the use of the data and including the mounting of individual insects.

Pourquoi est-il nécessaire de connaître l'identité des espèces en entomologie forestière ? La réponse peut-être déclinée selon 4 axes, qui correspondent à différents secteurs d'application de l'expertise taxinomique des entomologistes forestiers : la comptabilité écologique de la biodiversité forestière, l'écologie forestière, l'ingénierie phytosanitaire, la veille à l'égard des espèces envahissantes dans le contexte du changement global. Toutefois, les nombreuses contraintes inhérentes à l'identification des espèces du groupe hautement diversifié des Insectes forestiers ont suscité l'émergence d'approches alternatives, telles que les approches supra-spécifiques, morpho-spécifiques, sélectives ou génétiques. / Why is it necessary to know the identity of the species in forest entomology? This issue may be tackled through four axes corresponding to the major expertises areas in current forest entomologists : forest biodiversity, forest ecology, forest health and detection surveys of invasive species in the context of total change.

Le bois mort est un facteur clé pour la biodiversité forestière, retenu au titre des indicateurs de gestion durable des forêts. Un des objectifs du projet RESINE était d'améliorer les connaissances susceptibles de valider ou d'améliorer la définition des indicateurs et les pratiques de gestion forestière durable. Le projet RESINE visait ainsi, entre autres, à évaluer, dans un cadre pluridisciplinaire, la relation entre différents descripteurs du bois mort (volume, qualité, diversité de types) à différentes échelles spatiales (pièce, peuplement, paysage) et la biodiversité saproxylique. Une approche similaire a été conduite sur deux régions forestières concernant 2 essences d'importance économique majeure : la forêt de pin maritime des Landes de Gascogne, et la chênaie de plaine de Rambouillet. Notre approche livre un lot de résultats plutôt contrastés, qui souligne la difficulté de généraliser des indicateurs simples sur les relations entre variables mésologiques et biodiversité et des normes sylvicoles universelles pour dépasser la seule recommandation d'ordre qualitatif. Dans notre étude, la relation entre volume de ressource et biodiversité est bien moins significative dans la chênaie gérée de Rambouillet que dans les plantations de pin des Landes, et dans la chênaie claire à molinie et fougère aigle que dans la chênaie-charmaie à Rambouillet. Dans les Landes, la quantité de bois mort dans le paysage n'a pas d'effet significatif sur la composition ou sur la richesse spécifique des assemblages de Coléoptères saproxyliques. En chênaie à Rambouillet, la densité périphérique de réserves biologiques (un indicateur paysager indirect du volume de bois mort, notamment en raison des forts volumes de bois mort maintenus dans les réserves après la tempête de 1999) a un effet positif et significatif sur la richesse saproxylique locale. Cet effet est plus fort que celui du volume local et maximal à l'échelle de 800m (200 ha). La qualité des pièces de bois influence significativement la richesse et la composition des assemblages de Coléoptères et de Champignons saproxyliques. Sur chêne et pin, les 4 facteurs décrivant les pièces de bois mort étudiées (type, strate, diamètre, décomposition) expliquent une fraction importante de la variance. L'intérêt de certains types de bois mort pour la conservation de la biodiversité est confirmé mais partiellement différent dans le chêne et le pin. Le maintien de bois mort pour contribuer à entretenir un réservoir de prédateurs auxiliaires et aider à juguler les pullulations de ravageurs n'est pas tangible dans nos données. La divergence des résultats observés entre Landes et Rambouillet, et entre les 2 stations en chênaie rambolitaine, renforce l'intérêt de reproduire la double mesure de nécromasse et de biodiversité sur des gradients géographiques et forestiers plus larges ou des gradients ciblés. / The RESINE project (2006-2009) aims at assessing the relationship between dead wood parameters (volume, quality, diversity) and saproxylic fungus and beetle diversity, in order to define sustainable forest practices and biodiversity indicators based on dead wood. The ecological study was lead in two forest regions: (i) the private pine forest in South-Western Landes, (ii) the state lowland oak forest of Rambouillet in Northern France, with a multi-scale approach from micro-habitat to stand and landscape. The in situ monitoring of oak and pine dead wood pieces by sampling emerging beetles was meant to assess the relative influence of wood properties on species preference and assemblage composition. The effect of log diameter (from 2 to 70 cm), strata (stumps, canopy, standing and lying dead wood) and decay stage was measured. The beetle species richness was higher in snags and stumps than in lying dead wood, whereas the opposite trend was observed for fungi. The poorly known dead wood in living canopies showed the lowest species richness, but a distinct species composition. The highest number of beetle species was observed in the largest (>30cm) and mid-decayed pieces. The fungus assemblages were richer in the largest (all classes > 10cm) and late decayed classes. At the stand scale, the relative influence of dead wood parameters (volume, diversity, profile) on saproxylic local diversity was investigated. In plots along a range of dead wood volume, dead wood stocks were described, beetle assemblages were sampled using window-flight traps. In contrast with French pine plantations, beetle richness in oakwoods did not seem to be correlated with the volume of dead wood at a 1ha-scale. Nonetheless, the number of fungus species increased with the volume of dead wood, and large dead wood volume in particular.

L'intensification de la récolte de biomasse forestière a des impacts sur la biodiversité des écosystèmes forestiers, sur la physico-chimie des sols et des ressources en eau. Ce chapitre présente les préconisations en l'état des connaissances actuelles pour limiter ces impacts, lors des opérations de récolte du bois, pour la conduite des peuplements (régénération, choix des essences, âges d'exploitabilité) et dans le cas particulier des cultures dédiées (TTCR). / The increase in forest biomass harvesting has an impact on forest biodiversity and natural resources (soils, water). In ordre to limit these impacts, this chapter gives guidelines concerning biomass harvesting, forest stand management (regeneration, objective species, rotation age) as also the particular case of short rotation coppices.

L'objet de ce chapitre est de faire le point sur ce que l'on sait de l'état, des enjeux et des pressions - et des facteurs favorables - pesant sur la biodiversité forestière en France. Le croisement de ces différents aspects nous amène à avoir une attention particulière pour les taxons saproxyliques. / This chapter of the Bio2 study synthesizes what is known on the state, the stakes and the pressures of forest biodiversity in France. These different points of view meet to promote a particular emphasis on saproxylic taxa. Bio2 is a collective report financed by the Ministry of Ecology on the interactions between the potential increase in forest biomass harvesting and biodiversity and natural resources (soils, water...).

Saproxylic beetles are species-rich, mostly small and cryptic, and difficult to sample. Different methods are traditionally used to collect saproxylic beetles. These are (i) direct active collection techniques, (ii) rearing techniques and (iii) mass trapping methods. Window-flight trapping is currently the most frequently used technique for catching flying active saproxylic beetles. Thanks to the combination of different trap principles, window-flight trap devices may differ by a large number of intrinsic parameters. This paper offers further insight into the infl uence of 3 trap factors on the catches of dead wood associated beetles, by comparing (i) cross-vanes or single-plane WFT (shape effect), (ii) black or transparent CWFT (silhouette effect), (iii) low or high CWFT (height effect). Six ecological data sets from French upland or lowland, deciduous or coniferous forests, with paired freely hanging window traps on each plot, were compiled in this study and analysed with a methodological point of view to compare the effi ciency of sampling methods. Trap shape had a signifi cant and strong effect on the abundance and species richness of saproxylic beetles. The single-plane traps caught a higher number of individuals and species. Nevertheless, given time/ cost constraints, cross-vanes traps are recommended. Our study shows that black and transparent cross-vanes traps yielded similar saproxylic samples in terms of abundance, richness and overall composition. Our results confirm the vertical differentiation of saproxylic beetle assemblage. They suggest that low cross-vanes window traps yield more species-rich and individual-rich samples than canopy traps. Except Melyrids, no abundant species showed a strong association with top traps. Further optimisation analyses based on larger datasets are required to make sampling methods more reliable. Abbreviations : Cross-vanes Window Flight Trap (CWFT) ; Single-Plane Window Flight Trap (PWFT), Regards méthodologiques sur l’échantillonnage des coléoptères saproxyliques au moyen des pièges-vitres. — Les coléoptères saproxyliques constituent un groupe riche en espèces, souvent petites et cryptiques, et difficiles à échantillonner. Différentes méthodes sont traditionnellement utilisées pour les collecter : les techniques (i) de collecte active, (ii) d’élevage et (iii) de piégeage. Le piège-vitre est actuellement la méthode la plus fréquemment utilisée pour la capture des coléoptères saproxyliques aériens mobiles. Grâce à la combinaison de différents principes, les pièges-vitres comportent de multiples modèles. Cette étude concerne l’influence de 3 facteurs sur les captures de coléoptères saproxyliques, en comparant (i) des pièges plans bidirectionnels ou multidirectionnels en croix (effet de forme), (ii) des pièges transparents ou noirs (effet silhouette), (iii) des pièges suspendus à faible hauteur ou dans la canopée. Six jeux de données écologiques de plaine ou d’altitude, de forêts françaises feuillues ou résineuses, et comportant deux pièges différents appariés par placette, ont été compilés et analysés pour comparer l’efficacité respective des méthodes. La forme du piège a un fort effet significatif sur l’abondance et la richesse spécifique, à l’avantage des pièges plans. Néanmoins, en raison de contraintes pratiques ou fi nancières, les pièges-croix sont recommandés. Les pièges noirs ou transparents fournissent des échantillons comparables en termes d’abondance, de richesse et de composition. Nos résultats confirment la différenciation verticale des assemblages de coléoptères saproxyliques, les pièges bas capturant davantage d’individus et d’espèces que les pièges de la canopée. A l’exception des Melyridae, aucune espèce n’est associée aux strates hautes. Des analyses complémentaires fondées sur de plus amples jeux de données sont requises pour optimiser les méthodes d’échantillonnage., Bouget Christophe,Brustel Hervé,Brin Antoine,Noblecourt Thierry. Sampling saproxylic beetles with window flight traps: methodological insights. In: Revue d'Écologie (La Terre et La Vie), supplément n°10, 2008. 4ème colloque sur la conservation des coléoptères saproxyliques, tenu à Vivoin (Sarthe – France) du 27 au 29 juin 2006 / Proceedings of the 4th symposium and workshop on the conservation of Saproxylic beetles, held in vivoin, sarthe department – France 27–29 June 2006. pp. 21-32.

International audience; Le suivi temporel de la biodiversité à grande échelle constitue une des rares façons de mettre en évidence l’impact de facteurs environnementaux globaux et de juger de l’efficacité des mesures de conservations prises. De tels programmes nationaux de suivi reposent nécessairement sur un nombre important d’observateurs, d’expérience et d’origine géographique variées. Garantir la qualité de ces suivis requiert de minimiser les biais d’échantillonnage (sources de variation systématique des relevés de biodiversité) et de maximiser leur précision (écart autour de la valeur moyenne), ce qui implique généralement un effort d’échantillonnage élevé. La réussite d’un suivi dépend donc du compromis trouvé entre la faisabilité de l’échantillonnage, la qualité et la représentativité des données. Dans une premier temps, nous illustrerons les principaux facteurs de biais et d’imprécision des relevés de biodiversité, parmi lesquels : -méthode d’échantillonnage comme la taille du quadrat, le type de piège, le temps de recherche, -effet opérateur (% d’espèces manquées, % d’espèces mal identifiées), -saisonnalité (en interaction avec l’heure et les conditions météorologiques du relevé), -variations dans la probabilité de détecter les espèces entre habitats et entre années. Ces exemples montreront que, pour la plupart des groupes taxonomiques, l’exhaustivité des relevés de biodiversité est un objectif irréaliste mais qu’elle n’est pas une condition nécessaire pour estimer un état ou une tendance de la biodiversité. Dans un second temps, nous présenterons comment la mise en place d’un système d’assurance qualité (exercices d’intercalibration des observateurs, visites de contrôle ponctuelles) et l’utilisation de dispositifs répliqués de manière emboîtée (spatialement et temporellement) permettent de limiter l’impact de ces facteurs de biais ou d’imprécision. Nous choisirons des exemples pour la flore, les Coléoptères ainsi que les oiseaux forestiers à partir du programme RENECOFOR de suivi à long terme des écosystèmes forestiers et d’études ponctuelles et du programme STOC de suivi temporel des oiseaux communs.

Le suivi temporel de la biodiversité à grande échelle constitue une des rares façons de mettre en évidence l’impact de facteurs environnementaux globaux et de juger de l’efficacité des mesures de conservations prises. De tels programmes nationaux de suivi reposent nécessairement sur un nombre important d’observateurs, d’expérience et d’origine géographique variées. Garantir la qualité de ces suivis requiert de minimiser les biais d’échantillonnage (sources de variation systématique des relevés de biodiversité) et de maximiser leur précision (écart autour de la valeur moyenne), ce qui implique généralement un effort d’échantillonnage élevé. La réussite d’un suivi dépend donc du compromis trouvé entre la faisabilité de l’échantillonnage, la qualité et la représentativité des données. Dans une premier temps, nous illustrerons les principaux facteurs de biais et d’imprécision des relevés de biodiversité, parmi lesquels : -méthode d’échantillonnage comme la taille du quadrat, le type de piège, le temps de recherche, -effet opérateur (% d’espèces manquées, % d’espèces mal identifiées), -saisonnalité (en interaction avec l’heure et les conditions météorologiques du relevé), -variations dans la probabilité de détecter les espèces entre habitats et entre années. Ces exemples montreront que, pour la plupart des groupes taxonomiques, l’exhaustivité des relevés de biodiversité est un objectif irréaliste mais qu’elle n’est pas une condition nécessaire pour estimer un état ou une tendance de la biodiversité. Dans un second temps, nous présenterons comment la mise en place d’un système d’assurance qualité (exercices d’intercalibration des observateurs, visites de contrôle ponctuelles) et l’utilisation de dispositifs répliqués de manière emboîtée (spatialement et temporellement) permettent de limiter l’impact de ces facteurs de biais ou d’imprécision. Nous choisirons des exemples pour la flore, les Coléoptères ainsi que les oiseaux forestiers à partir du programme RENECOFOR de suivi à long terme des écosystèmes forestiers et d’études ponctuelles et du programme STOC de suivi temporel des oiseaux communs.

L'adaptation de la gestion forestière à la conservation de la biodiversité se traduit notamment par l'évolution des pratiques d'exploitation. Le Guide de reconstitution des forêts de l'ONF (2001) a défini des orientations et conseils d'exploitation des chablis de la tempête de 1999. Nous expliquons pourquoi nous pensons que deux des propositions de ce guide - le maintien de sur-réserves et de houppiers non démembrés - pourraient atténuer les effets délétères des coupes de grande taille sur la biodiversité - et notamment sur les espèces forestières. Nous discutons enfin de l'application éventuelle de ces pratiques dans les exploitations futures. / A conservation based forest management implies the evolution of timber harvesting practices. The ONF Guide for forest reconstruction (2001) defines the harvesting scheme in windstorm areas disturbed in 1999. We explain why we think two of these guidelines, namely, the retention in cutting areas of large old trees and of unharvested tree crowns, could counteract the negative effects of large cuts on biodiversity - peculiarly on forest species. We finally discuss the potential applications of these guidelines in ordinary forest harvesting.

Nous nous interrogeons sur la vulnérabilité de la biodiversité forestière dans la perspective d'une intensification des prélèvements de biomasse ligneuse en forêt. Les principaux moteurs de l'intensification de la sylviculture sont les suivants : augmentation des exploitations (mobilisation accrue des bois dans des formations forestières peu exploitées au cours des dernières décennies, dynamisation des éclaircies), augmentation des récoltes (gros bois, arbre-entier, rémanents, souches),modification des pratiques de récolte (mécanisation), raccourcissement des cycles,développement du réseau de desserte. Les changements majeurs d'habitat forestier associés à l'intensification des prélèvements de biomasse seraient : moins de vieux peuplements, de gros et vieux arbres, et de surfaces forestières peu ou pas exploitées depuis des décennies, moins de bois mort ? une augmentation de la surface totale des coupes, des habitats plus fragmentés en raison, notamment, de dessertes et de coupes plus denses,des conditions de sol et une ambiance forestière dégradées,davantage de dérangement de la faune, une augmentation des cultures dédiées. La réponse de plusieurs segments de la biodiversité spécifique à ces différentes caractéristiques de l'intensification est examinée. A titre d'exemple, l'augmentation, dans un contexte de valorisation du bois énergie, de la récolte de bois auparavant peu valorisé (produits d'éclaircie, autres pièces non marchandes, souches, houppiers et arbres entiers) pourrait modifier le profil de bois mort des forêts, et affecter notamment la fraction des petits diamètres et du bois mort ensoleillé au détriment des espèces saproxyliques. Il sera toutefois pertinent de faire l'assemblage des impacts locaux à l'échelle d'une mosaïque territoriale, pour établir par exemple le bilan global de l'accroissement des surfaces de coupe (avec leurs rémanents) et de la proportion de récolte locale. Un autre exemple repose sur la réponse de faune et flore du sol aux modifications d'humidité, de pH, de quantité de biomasse, de rapport C/N suite à l'enlèvement des rémanents, au tassement et à la mise en lumière liés à une exportation accrue. L'importance de contextualiser les prédictions, en fonction de l'histoire des forêts et du type de station, est mise en exergue. Dans le cas particulier des filières spécialisées (cultures dédiées : futaies à courte révolution et taillis à courte ou très courte rotation), l'effet sur la biodiversité est examiné localement en fonction de leur substitution à des forêts « naturelles » ou à des cultures agricoles, et pour leur éventuel rôle de corridor, tampon voire habitat de substitution entre les fragments de forêt « naturelle ». Les conséquences potentiellement favorables d'une intensification des systèmes de production pour certains compartiments de la biodiversité sont également explorées. L'accent est finalement porté sur le besoin de recherches et de suivis de gestion nécessaires pour améliorer le niveau de connaissance sur les impacts d'une gestion forestière dynamisée. / What is the vulnerability of forest biodiversity in the context of the increase of wood biomass harvesting? The main drivers of forestry intensification are the following: increase in cutting and in harvesting, change in harvesting practices (whole-tree and stump harvest ), decrease in forestry cycle duration, development of forest road. The consequent changes in forest habitat would be: decrease in old stands, big and veteran trees, and dead wood?, increase in the cumulative surface of cutting areas, in habitat fragmentation and in short-rotation coppices, damages to soil and forest ambiance, disturbance to fauna. The response to these trends of different forest biodiversity components (saproxylic organisms, soil fauna for instance) is stressed. These predictions clearly depend on local history and environmental conditions.

International audience; Aim: Biodiversity monitoring and conservation are extremely complex, and surrogate taxa may represent proxies to test methods and solutions. However, cross-taxon correlations in species diversity (i.e., cross-taxon congruence) may vary widely with spatial scale. Our goal is to assess how cross-taxon congruence varies with spatial scale in European temperate forests. We expect that congruence in species diversity increases when shifting from fine to coarse spatial scales, with differences between species richness and composition, and across pairs of taxonomic groups. Location: European temperate forests. Time period: Present. Major taxa studied: Vascular plants, bryophytes, birds, epiphytic lichens, saproxylic beetles and wood-inhabiting fungi. Methods: We used field data (354 plots across 23 sites) encompassing Italy, France and Hungary, with species information for six taxonomic groups. We accounted separately for spatial grain (the size of elementary sampling unit) and extent (the geographical area included in the survey) and evaluated the relationships within all the possible pairs of taxa. Results: Although no pair of taxa had its species richness consistently correlated across scales, we found no changes in the direction of correlations when analysing species composition. However, when increasing grain and extent, we did find a general increase in the magnitude of correlations in species composition and partial changes in significance, with plants having the highest number of significant correlations. Main conclusions: Species richness congruence among taxa is strongly scale dependent owing to differences in the relative contribution of large- and small-scale processes across taxa. Cross-taxon congruence in species composition is scale dependent only for its magnitude, because life-history traits of individual species make responses to environmental factors similar across scales. Forest monitoring should consider multi-taxon sampling and limit the use of surrogates at specific spatial scales, especially for species richness. Sampling plant species composition in scattered plots across different sites may effectively summarize the whole community composition.