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Hajer Aouani,1 Maamer Slimani,1–3 Nicola Luigi Bragazzi,2–4 Sabeur Hamrouni,1 Mohamed Elloumi1 1High Institute of Sport and Physical Education of Ksar Said, Manouba University, Manouba, Tunisia; 2Department of Health Sciences (DISSAL), Postgraduate School of Public Health, Genoa University, Genoa, Italy; 3Department of Neuroscience, Rehabilitation, Ophthalmology, Genetics, Maternal and Child Health (DINOGMI), Section of Psychiatry, Genoa University, Genoa, Italy; 4UNESCO Chair “Anthropology of Health – Biosphere and Healing System”, University of Genoa, Genoa, Italy Background: Emotional intelligence refers to how individuals deal with intrapersonal or interpersonal emotional information and how a subject identifies, expresses, understands, regulates, and uses his/her own emotions or those of others. The purpose of the present study was to validate the Arabic version of the “Profile of Emotional Competence” (PEC) questionnaire. Methods: A sample of 285 Tunisian participants (153 men and 132 women) was recruited, age range: 12–18years (15.2±2.4years). The participants were prospectively classified into the following two groups: athletes (n=101) and nonathletes (n=184). Results: Findings of the present study indicated that the Arabic version of the PEC questionnaire has good psychometric properties. The Cronbach’s α suggested that all subscales had adequate internal consistency. Test–retest reliability was excellent. The correlations between interpersonal and intrapersonal subscales were low to moderate (from 0.37 to 0.59), except for the regulation interpersonal, utilization interpersonal, and utilization intrapersonal subscales, which showed negligible correlations with the other subscales. The two-factor solution (interpersonal and intrapersonal competence models) accounted for 62.1% of variance. All subscales loaded on the expected factor, except for the utilization intrapersonal and regulation interpersonal subscales, which did not yield a satisfactory loading. Age and athletes’ status impacted on all the PEC dimensions, except for some subscales. Conclusion: Finally, psychologists and practitioners in the Arab world could use the PEC questionnaire as a valid and reliable instrument for planning ad hoc interventions. Keywords: emotion, gender, age, sport exercise, validation &nbsp

Mediterranean wetlands are of key interest in the preservation of biodiversity. However, their ecological water requirement is in constant competition with human uses, particularly in a context of aridity and climate change. This paper examines the case of the Ichkeul Lake-Lagoon system located in the north of Tunisia in a river basin that is heavily contributing to the water supply of southern regions through water transfers. It maps out the various actors involved, their stakes, discourses and strategies, and explains the current degradation of the Ichkeul system by unpacking the decision-making power of these actors. It confirms that marginal social groups, ecosystems and next generations are the main parties affected by current water allocation patterns.

The Tunisian adult's Hodgkin lymphoma (HL) Study Group was created in 1999. It aimed to improve the management of this curable hematologic malignancy by standardizing the diagnosis, assessment of disease, treatment management and therapeutic evaluation in different Tunisian centers (Hematology, oncology and radiotherapy).Since 1998, four versions of the prospective national protocol for treating adult Hodgkin lymphoma have succeeded (MDH99, MDH2002, MDH2008, MDH2015). Each version was based on the results of the previous version and analyzed according to new data from the literature. Due to this national study group, the number of patients lost to follow decreased significantly (30% before the creation of the group and only 3% for patients treated with MDH2008), the complete and uncertain response rates have improved (75% before the creation of the group and 92% in patients treated with MDH2008) with dramatically improved rates of overall survival from 57% to 90%. On the other hand there was an improvement of toxic death rate (13% of toxic deaths in MDH2002 to 4.37% in the MDH2008) with a decrease of the respective rate of primary failure and relapse by 17% and 12.5% in MDH2002 against the 11.4% and 7.8% in the MDH2008. This resulted in an improvement in overall survival (90%) and event-free survival at 5 years (75%). Now with the introduction of positron emission tomography in Tunisia, we hope yet to finalize the assessment of response and thus better adapt the treatment of this disease. Our objective remains the improvement of event-free survival rate to reach 80%.

2 congrès organisés par le Réseau Foncimed : - Gouvernance des Crises Economiques et Dynamique d'Utilisation des Terres dans les Zones Agricoles et Périurbaines. Séminaire international Foncimed, 2014/10/16-18, Athènes (Grèce) - Le Dualisme Foncier Agricole en Méditerranée : Concurrence ou Coopération ? Séminaire international Foncimed, 2015/10/15-17, Tunis (Tunisie); International audience; Cette publication d’Options Méditerranéennes (OM) réunit les travaux du réseau Foncimed présentés lors des séminaires d’Athènes en octobre 2014 et de Tunis en octobre 2015. Le premier séminaire portait sur l’importance des questions foncières dans les moments de crises économiques et sociales, quelques années après le début de la crise économique et politique qui frappe la Grèce. Le second interrogeait l’importance et les conséquences des inégalités foncières en Méditerranée, l’année où la FAO célébrait l’exploitation agricole familiale à travers le monde. A l’heure de la mondialisation des échanges, de la généralisation du productivisme et de l’uniformisation des modes de vie, cette publication interroge l’intérêt de maintenir un foncier rural composé de petits parcellaires portant des exploitations agricoles nombreuses et de taille modeste. Elle est éclairée par les travaux de terrain originaux, menés sur les trois rives de la Méditerranée - occidentale, balkanique et nord-africaine -, par les membres du réseau de chercheurs et praticiens Foncimed. Avec l’ambition de nourrir le partage d’expériences multidisciplinaires, de croiser le monde scientifique et celui du développement, le réseau Foncimed est un réseau méditerranéen pluridisciplinaire et interinstitutionnel d’échanges et de comparaison d’expériences sur la question foncière. Il fonctionne depuis 2007 animé et financé conjointement par le CIHEAM-IAMM et l’INRA-SAD.

We studied the effect of three programs, diet restriction (D), individualized exercise training (E) at the maximal lipid oxidation point (LIPOXmax) and diet combined with exercise (D+E), on body mass, plasma lipoprotein and adiponectin levels in obese girls. Eighteen obese adolescents girls aged 12-14 years were studied. A longitudinal intervention was carried out, consisting of a two-month diet (D; -500 kcal·day-1), of individualized exercise (E; 4 days/week, 90 min·day-1) and of diet combined with exercise (D+E). Body mass, body mass index (BMI), body fat mass, waist circumference, substrate crossover point, LIPOXmax point, homeostasis model assessment (HOMA-IR) index, fasting levels of lipids and circulatory adiponectin, were measured in all subjects before and after the program. In subjects of the D+E group, body mass, BMI, body fat mass, waist circumference, HOMA-IR, low-density lipoprotein cholesterol (LDL-C) and total cholesterol / high-density lipoprotein cholesterol (TC/HDL-C) ratio were significantly lower, and HDL-C and adiponectin were higher after the program than that of subjects in the D or E groups. Diet/exercise improved the ability to oxidize lipids during exercise (crossover point: + 18.5 ± 3.4 of % Wmax; p0.01 and fat oxidation rate at LIPOXmax: + 89.7 ± 19.7 mg·min(-1); p0.01). In the D+E group, significant correlations were found between changes in body mass and adiponectin and between changes in the TC/HDL-C ratio and LIPOXmax. These findings show that the combined program of diet restriction and individualized exercise training at the LIPOXmax point is necessary to simultaneously improve body mass loss, adiponectin levels, as well as metabolic parameters, in obese girls. Key pointsDiet combined with exercise training improved body composition, adiponectin levels and metabolic parameters in obese girls.Diet only decreases body mass and LDL-C without improving fat oxidation and HDL- C.Individualized exercise training at LIPOXmax point improved the HDL-C and the circulatory adiponectin levels with any change of LDL-C and body composition.

International audience; Le système agraire méditerranéen est caractérisé par de fortes disparités d’accès aux ressources naturelles, aux financements et à l’information des agriculteurs. Ce caractère prend la forme d’un dualisme faisant coexister une agriculture dite moderne et une agriculture dite traditionnelle. Prenant acte de cette évolution, le séminaire du réseau de recherche Foncimed, organisé à Tunis les 16 et 17 octobre 2015, a choisi d’étudier les interrelations entre ces deux types d’agricultures. S’appuyant sur les communications présentées lors de ce séminaire, cette contribution est structurée en trois points : persistance du dualisme agraire méditerranéen ; crise des agricultures familiales ; facteurs de résilience.

National audience; Access to land for the young generation of farmers is hardly taken into account in the debates concerning the agriculture sustainability of agriculture in the Southern countries. In these countries, where the population is often very young, the procedures for the transfer of agricultural assets are frequently absent and generally ineffective when they exist. We show in this article through the case study of three irrigated situations in Tunisia, that measures to transfer lands to a young generation of farmers operate informally through indirect farming. We analyze the role of indirect farming in creating flexibility in local land use systems and discuss the sustainability of the resulting dynamics. We finally discuss finally the major challenge for the policy makers in Tunisia and in North Africa, to include informal agriculture in policy making to provide more sustainable perspectives. Better knowledge about the role of the indirect farming in providing flexibility to local land use and agrarian systems can provide ideas for a better use of land and water resources, which are disputed contested in Tunisia and elsewhere in North Africa.; L’accès des jeunes agriculteurs aux ressources foncières est peu pris en compte dans les débats sur la durabilité des agricultures dans les pays du Sud. Les dispositifs de transfert foncier vers cette catégorie sociale, importante sur le plan démographique, restent rares et peu opérants. Nous montrons ici, à travers l’étude de trois situations irriguées en Tunisie, que des transferts de terres vers les jeunes existent mais qu’ils s’effectuent souvent de manière informelle et plus à travers différentes formes de faire-valoir indirect (FVI) qu’à travers un transfert de propriété. Nous analysons le rôle joué par le faire-valoir indirect dans la flexibilité des systèmes fonciers locaux et nous discutons le caractère durable des dynamiques qui en découlent. Nous discutons enfin le défi majeur que représente pour les décideurs politiques en Tunisie et au Maghreb, l’inscription de cette agriculture informelle dans une perspective durable. Approfondir les connaissances sur le rôle joué par le FVI dans la flexibilité des systèmes fonciers et agraires locaux, peut fournir des pistes de réflexions pour mieux valoriser des ressources en terre et en eau très disputées en Tunisie, et ailleurs au Maghreb.

Dans le contexte de la croissance des inégalités au niveau mondial, les conséquences sociales et environnementales de la pression qui s'exerce sur les ressources naturelles sont particulièrement visibles au sud de la Méditerranée. Elles sont souvent la cause des bouleversements politiques qui frappent ces régions. Les modes d'accès à la terre, à l'eau et aux ressources biologiques, voire patrimoniales, qui prennent forme dans la globalisation des normes et des droits se caractérisent par une diversité de modèles et de pratiques. Il s'agira ici d'appréhender la diffusion des modèles marchands et des règles privatives, mais aussi des modes d'action collective ou des mécanismes d'atténuation des impacts marchands, pour montrer comment les principes du développement durable autorisent certaines appropriations exclusives. Plus généralement se posent et la question du rôle que jouent les régimes internationaux dans l'évolution des régimes institutionnels de ressources et celle du pluralisme des normes eu égard aux conflits portant sur les droits l'accès.

Dans le contexte de la croissance des inégalités au niveau mondial, les conséquences sociales et environnementales de la pression qui s'exerce sur les ressources naturelles sont particulièrement visibles au sud de la Méditerranée. Elles sont souvent la cause des bouleversements politiques qui frappent ces régions. Les modes d'accès à la terre, à l'eau et aux ressources biologiques, voire patrimoniales, qui prennent forme dans la globalisation des normes et des droits se caractérisent par une diversité de modèles et de pratiques. Il s'agira ici d'appréhender la diffusion des modèles marchands et des règles privatives, mais aussi des modes d'action collective ou des mécanismes d'atténuation des impacts marchands, pour montrer comment les principes du développement durable autorisent certaines appropriations exclusives. Plus généralement se posent et la question du rôle que jouent les régimes internationaux dans l'évolution des régimes institutionnels de ressources et celle du pluralisme des normes eu égard aux conflits portant sur les droits l'accès.

International audience

No abstract.

International audience; no abstract

15th Annual Meeting of the European-Hematology-Association, Barcelona, SPAIN, jun-13, 2010; International audience; no abstract

15th Annual Meeting of the European-Hematology-Association, Barcelona, SPAIN, jun-13, 2010; International audience; no abstract

Étude réalisée dans le cadre du volet recherche du projet mobilisateur « Appui à l’élaboration des politiques foncières »; International audience; Historiquement, la société rurale a connu dans le sud tunisien, comme dans les autres pays du Maghreb, des formes de gestion communautaire des terres et des ressources naturelles. En effet, les populations pastorales (organisées en tribus) étaient, jadis, très soucieuses de s’adapter aux conditions d’un milieu rude et contraignant. Chaque fraction ou sous- fraction s’organise en groupe de familles (douar) sous la responsabilité du conseil des notables (myad) pour gérer au mieux l’énergie disponible (humaine et animale), recycler avec soin les éléments fertilisants (minéraux et organiques) et valoriser les ressources de la flore et de la faune afin de produire sur place et/ou en se déplaçant l’essentiel des besoins du groupe. Cette vie pastorale, dominée par l’insécurité du milieu et des hommes, oblige les groupes tribaux à rester unis ce qui explique le caractère collectif de la propriété de la terre, d’où le nom de terres de tribus ou terres collectives (aradhi arouch). Avec la colonisation du pays en 1881, un processus de transformation des anciennes structures d’organisation de la société rurale s’est mis en place provoquant ainsi une mutation considérable dans la gestion des terres et des ressources naturelles.

International audience

In North Africa, very few studies dealt with livestock and meat marketing channels. In order to contribute to covering this gap, surveys were conducted Moroccan, Algerian and Tunisian rural communities. Additionally, and in order to describe the role of different actors in the marketing channels, other surveys were organized in several animal markets. The objective was to reconstruct the different pathways through which sheep move from producers to consumers and understand transactions’ modalities. This first hand descriptive analysis helped gaining insights on sheep marketing channels and strategies adopted by farmers, traders’ characterization, price and margin formation and meat consumption trends. The paper emphasizes also distinctive and common features across the three countries. Meat market analysis revealed the beginning of a price differentiation according to market and consumer types, season and social event and finally by the recent development of super markets that provide new types of meat cuts. These changes could influence distribution channels with the emergence of differentiated whole carcass sales with different pieces targeting different socio-economic niches. The present research faced some difficulties of reliable data availability as it is the case of the Algerian trans-border informal transactions towards Tunisia and Morocco. This study is first hand description of sheep marketing channels in North Africa with a preliminary understanding of sheep and meat marketing channels and transactions in the three communities studied. Up scaling such research to include a larger and a more comprehensive sampling is necessary in order to gain more representation of different realities and gathering more accurate and reliable data., En Afrique du Nord, les recherches consacrées à l’étude de la commercialisation du cheptel et de la viande sont très limitées. Afin de contribuer à combler cette lacune, des enquêtes ont été menées dans trois communautés rurales au Maroc, en Algérie et en Tunisie. Par ailleurs, et afin de cerner le rôle des différents acteurs dans les circuits de commercialisation des ovins vifs et de leur viande, d’autres enquêtes ont été menées dans plusieurs marchés. Le but était de reconstituer les différents circuits dans lesquels évolue l’animal depuis l’exploitation jusqu’au consommateur, et de comprendre les modalités de transaction. L’analyse descriptive préliminaire a permis de s’informer sur les circuits et les stratégies de commercialisation des producteurs et des intermédiaires, la caractérisation des intermédiaires, la formation des prix et des marges et la dynamique des modèles de consommation et de commercialisation. La présente recherche a rencontré des difficultés relatives à la fiabilité des données collectées, comme c’est le cas du commerce ovin transfrontalier entre l’Algérie et les deux pays riverains. Le temps limité consacré à l’étude n’a pas permis d’élargir son étendue à un niveau régional ou national, empêchant l’élaboration de modèles des fonctions de l’offre et de la demande. Cette recherche a fourni une description préliminaire sur les circuits de commercialisation des ovins dans trois communautés respectivement Marocaine, Algérienne et Tunisienne. L’augmentation de la taille de l’échantillon est nécessaire dans un souci de représentativité de diverses réalités des systèmes de production.

MSH / FSP Maghreb : Programme mobilisateur d’appui à la coopération pour la recherche en sciences humaines et sociales entre le Maghreb et la France. Thématique 5 : Les processus de territorialisation en Méditerranée : dynamiques rurales et dynamiques urbaines. Rapport Final. CREAD Alger, ENA Meknès, INRAT et IRA Tunisie, IAM-Montpellier, PACTE-Territoires/UJF Grenoble, Université de Cordoue, Université de Volos, Université de Tirana, Université du Caire, Université Libanaise, Gaza university.; International audience; Ce rapport de recherche propose une analyse croisée des processus d'émergence des territoires ruraux dans les pays du pourtour méditerranéen. La contribution d'équipes de recherche de 10 pays permet une analyse originale qui mobilise des approches nationales et des études de terrain issues de l'ensemble de ces pays. Les questions des formes de gouvernance, de décentralisation ou encore les trajectoires de développement sont mises en perspective.

We introduce a new type of workflow design system called e-BioFlow and illustrate it by means of a simple sequence alignment workflow. E-BioFlow, intended to model advanced scientific workflows, enables the user to model a workflow from three different but strongly coupled perspectives: the control flow perspective, the data flow perspective, and the resource perspective. All three perspectives are of equal importance, but workflow designers from different domains prefer different perspectives as entry points for their design, and a single workflow designer may prefer different perspectives in different stages of workflow design. Each perspective provides its own type of information, visualisation and support for validation. Combining these three perspectives in a single application provides a new and flexible way of modelling workflows.

We describe an improvement of an algorithm for detecting frequently occurring patterns and modules in biological networks. The improvement is based on the observation that the problem of finding frequent network parts can be reduced to the problem of finding maximal frequent item sets (MFI). The MFI problem is a classical problem in the data mining community and there exist numerous efficient tools for it, most of them publicly available. We apply MFI tools to find frequent subgraphs in metabolic pathways from the KEGG database. Our experimental results show that, compared to the existing specialized tools for frequent subgraphs detection, the MFI tools coupled with an adequate postprocessing are much more efficient with regard to the running time and the size of the frequent graphs.

International audience; Purpose: the aim of this study was to determine the prevalence of cobalamin (vitamin B12) deficiency in different populations of patients with clinical manifestations associated or secondary to cobalamin or folates deficiency and to analyse the demographic, clinical, paraclinical investigations in cobalamin deficient patients in Tunisia. Methods: it was a prospective (19992001) multicenter study of 604 patients divided into four groups. The first group is composed of 478 consecutive patients with anaemia and/or macrocytosis with megaloblastic haemopoiesis on bone marrow examination without myelodyslasic or malignancy signs. The second group is made up of 34 patients with unexplained neurological symptoms without the presence of anaemia. The third group was composed of 82 invidious with isolated psychiatric disorders and the 10 patients with Hashimoto thyroiditis constituted the last,group. Results: serum cobalamin level was low in 98%, 23%, 14% of cases, respectively, in the first three groups. Only one case of patients with Hashimoto thyroiditis has serum cobalamin deficiency. Pernicious anaemia (Biermer's disease) was established by dual isotope schilling examination in 103 patients among a sample of 120 serum cobalamin deficient patients (86%). The median age at presentation was 45.5 years. Severe chronic atrophic gastritis was diagnosed in 97.5% of patients with Biermer's disease. Serum antibodies against intrinsic factor and gastric parietal cells were detected in (42.5%) and (60.6%) patients, respectively; (25.5%) patients had the both types of antibodies. 23.4% patients were positive for antithyroid antibodies. Anti-nuclear antibodies were detected in 3% patients. Conclusion: an interesting finding of our study was the high frequency of cobalamin deficiency in Tunisia, particularly in relative young patients. Our patients had classic features of florid cobalamin deficiency (severe haematological manifestations and neuro-psychiatric disorders). The main underlying causes of such deficiencies were Biermer's disease. Subtle clinical manifestations should be recognized and investigated even in young patients at risk.; Objectif : déterminer la prévalence des déficits en cobalamines (vitamine B12) chez différentes populations de patients présentant des manifestations cliniques pouvant être associées ou secondaires à un déficit en vitamine B12 ou en folates et analyser les données démographiques, cliniques et paracliniques chez les patients déficitaires en vitamine B12 en Tunisie. Méthodes : il s’agissait d’une étude prospective (1999-2001), multicentrique, incluant 604 patients répartis en quatre groupes : le premier groupe comportait 478 patients consécutifs présentant une hématopoïèse mégaloblastique sans signe de myélodysplasie avec ou sans anémie. Le deuxième groupe était composé de 34 patients présentant un tableau neurologique inexpliqué sans anémie mégaloblastique associée. Le troisième groupe était constitué de 82 individus présentant des manifestations psychiques isolées. Le quatrième groupe comportait dix patients ayant une thyroïdite d’Hashimoto. Résultats : le taux des cobalamines sériques était bas dans 98 %, 23 %, 14 % des cas, respectivement, des trois premiers groupes, alors qu’un seul patient du quatrième groupe était déficitaire en vitamine B12. Le test de Schilling réalisé chez un échantillon de 120 patients déficitaires en cobalamines a montré que 103 patients (86 %) étaient atteints par la maladie de Biermer. Ils avaient une médiane d’âge de 45,5 ans ; 97,5 % d’entre eux avaient une gastrite fundique atrophique sévère. L’Helicobacter pylori a été détecté chez seulement 5 parmi les 43 patients où il a été histologiquement recherché. Le bilan auto-immun chez ces patients montre : anticorps anti-cellules pariétales : 60,6 % ; anticorps anti-facteur intrinsèque : 42,5 % ; concordance entre les 2 anticorps : 48% ; anticorps anti-thyroïdiens : 23,4 % (2 % chez les témoins normaux) ; anticorps anti-nucléaire : 3 %. Conclusion : notre travail souligne la fréquence élevée des déficits en vitamine B12 en Tunisie particulièrement chez les sujets relativement jeunes. Nos patients présentaient un tableau clinique des formes florides des déficits en cobalamines (manifestations hématologiques sévères et troubles neuropsychiatriques). La cause principale sous-jacente de ces déficits était la maladie de Biermer. Les formes cliniques frustes méritent d’être recherchées et explorées même chez les sujets jeunes à risque.

National audience

Economie et développement; National audience; Cet ouvrage est le résultat de recherches menées dans le cadre du Programme d'Action Régionale (PAR) sur les politiques agricoles et alimentaires réalisées par le CIHEAM et la Commission européenne. Les auteurs présentent ici la question foncière à la lumière de la globalisation en abordant les dynamiques territoriales, l'agriculture périurbaine dans le cadre de la pression urbaine et de la stratégie des acteurs. Politiques de libéralisation et réformes foncières, interdépendance de plus en plus forte entre villes et campagnes dessinent la trame de fond d'un devenir régional en plein bouleversement.

Economie et développement; National audience; Durant trois décennies, les pays de la région méditerranéenne ont cherché à modeler leurs structures foncières afin de répondre aux objectifs de développement agricole. Le nouveau contexte de mondialisation des économies et de libéralisation des échanges impose des infléchissements à ces politiques et remet la question foncière au cours de la problématique de développement. Qu'il s'agisse de la concurrence sur la terre autour des villes ou de la privatisation des terres collectives, étatiques ou coopératives, une recomposition des structures est à l'oeuvre, accompagnée par de nouvelles formes de valorisation de la terre et de l'émergence de nouveaux acteurs. La question qui se pose est alors de savoir quelle est la dynamique territoriale qu'engendre ce nouveau contexte et quelle est la réponse des agriculteurs et des propriétaires fonciers à ces changements ? Cherchant à répondre à cette question, l'ouvrage réunit des analyses qui s'appuient sur des recherches de terrain et portent sur les espaces périurbains et les territoires qui connaissent des processus de privatisation foncière. Il est le résultat d'une recherche en réseau menée dans le cadre d'un programme de coopération régionale entre le CIHEAM et la Communauté européenne.

In this paper, we tackle the problem of the prediction by energy computation of RNA stable secondary structures. We present, under the Hypothesis of Loops Dependent Energy (HLDE), our dynamic programming algorithm to compute the free energies of the stable secondary structures and our traceback algorithm to predict these structures. We compute the free energies of the stable secondary structures by using a new approach, called m-Multiloop Approach ( mMA), m > 1. This computation is achieved within a time proportional to n4 and using a memory space proportional to n2. The prediction of the stable secondary structures is achieved within a time proportional to n3 * log3(n). Compared to other approaches, the m-MA enables us to improve the estimation of the minimum energetic contributions of the multiloops. And hence, it enables us to improve the estimation of the free energies of the stable secondary structures.

International audience

1. Séminaire FONCIMED sur les Modes de Régulation des Echanges Fonciers et de l'Occupation du Sol, 2008/10/08-12, Antalya (Turquie); International audience

DNA sequences are the basic data type that is processed to perform a generic study of biological data analysis. One key component of the biological analysis is represented by sequence classification, a methodology that is widely used to analyze sequential data of different nature. However, its application to DNA sequences requires a proper representation of such sequences, which is still an open research problem. Machine Learning (ML) methodologies have given a fundamental contribution to the solution of the problem. Among them, recently, also Deep Neural Network (DNN) models have shown strongly encouraging results. In this chapter, we deal with specific classification problems related to two biological scenarios: (A) metagenomics and (B) chromatin organization. The investigations have been carried out by considering DNA sequences as input data for the classification methodologies. In particular, we study and test the efficacy of (1) different DNA sequence representations and (2) several Deep Learning (DL) architectures that process sequences for the solution of the related supervised classification problems. Although developed for specific classification tasks, we think that such architectures could be served as a suggestion for developing other DNN models that process the same kind of input.

We analyze the problem of response suggestion in a closed domain along a real-world scenario of a digital library. We present a text-processing pipeline to generate question-answer pairs from chat transcripts. On this limited amount of training data, we compare retrieval-based, conditioned-generation, and dedicated representation learning approaches for response suggestion. Our results show that retrieval-based methods that strive to find similar, known contexts are preferable over parametric approaches from the conditioned-generation family, when the training data is limited. We, however, identify a specific representation learning approach that is competitive to the retrieval-based approaches despite the training data limitation.

Contient les communications à 2 séminaires : - Gouvernance des Crises Economiques et Dynamique d'Utilisation des Terres dans les Zones Agricoles et Périurbaines. Séminaire international Foncimed, 2014/10/16-18, Athènes (Grèce) - Le Dualisme Foncier Agricole en Méditerranée : Concurrence ou Coopération ? Séminaire international Foncimed, 2015/10/15-17, Tunis (Tunisie).; International audience; Albania has experienced a wider range of land reforms than any other European country in the twentieth century, with total collectivization (1945-1970) followed by an egalitarian “asset” redistribution after the fall of the communist regime (1990-1993). The subsequent agricultural land structure defined by the law of 1991 has led to agriculture without dualism ... unless we interpret the concept of dualism by highlighting both a set of small-scale private farms and all public properties (i.e. pastureland and forests) currently undergoing a process of devolution to the municipalities and “end-users”. Systematically ignored when considering the general interaction of farming and land, these areas are nevertheless crucial to the economic, social and ecological functioning of contemporary Albanian agriculture. Once this non-polarized agrarian-land structure has been described and interpreted, it is important to examine the nature of “problematizations” and agricultural, food, rural and land processes in such a non-dualistic agrarian structure. In this article, we discuss only one aspect relating to public policy and the explicit intention to find ways of intensifying and modernizing by supporting the most “efficient” farms which are supposed to become the heart of an agricultural specialization. A pipe dream of dualism?; L’Albanie est le pays européen qui a connu la plus grande amplitude de réformes foncières au cours du XXe siècle, d’une collectivisation totale dans les années 1945-1970 à une redistribution « patrimoniale » et égalitaire après la chute du régime communiste. La structure foncière-agricole ainsi définie par la Loi de 1991 conduit à une agriculture sans dualisme… sauf si l’on déplace la notion de dualisme en pointant, d’un côté un ensemble de micro-exploitations privées et, de l’autre, une propriété publique regroupant les terres de pâturages et les forêts – en cours de dévolution aux communes et aux « usagers finaux ». Laissés pour compte dans la réflexion générale sur l’articulation entre le foncier et l’agricole, ces espaces sont cependant d’une importance primordiale pour le fonctionnement économique, écologique et social de l’agriculture albanaise contemporaine. Une fois décrite et interprétée cette structure agraire-foncière non-polarisée (cette absence de dualisme), on doit s’interroger sur la nature des « problématisations » et des processus agricoles, alimentaires, ruraux et fonciers, qui devraient en découler… Nous n’aborderons dans cet article qu’un de ces aspects : celui concernant les politiques publiques et l’intention de trouver des voies d’intensification et de modernisation en soutenant de manière privilégiée (voire exclusive) les exploitations les plus performantes, supposées devenir le coeur d’une spécialisation agricole. Un fantasme de dualisme ?

Séminaire international Foncimed : Le Dualisme Foncier Agricole en Méditerranée : Concurrence ou Coopération ? 2015/10/15-17, Tunis (Tunisie).; International audience; Options Méditerranéennes, A 117, 2017-La petite exploitation agricole méditerranéenne, une réponse en temps de crise Préface Le foncier, ressource stratégique tant pour l'agriculture que pour les dynamiques urbaines, peut s'appréhender sous plusieurs angles. Objet de recherche, c'est un marqueur de l'histoire et un indicateur des dynamiques sociales à l'oeuvre dans les zones considérées. Témoin d'alliances ou de conflits, il matérialise les tensions permanentes générées par la confrontation d'enjeux locaux et de bouleversements planétaires. Objet de politique publique (agricole, environnementale, territoriale, etc.), le foncier peut se révéler comme un levier efficace pour atteindre les objectifs de développement économique et social que les gouvernements se fixent. Cependant, ce levier est particulièrement difficile à mettre en oeuvre, étant donnée son inscription profonde dans les fabriques sociales et politiques locales et nationales, ainsi que dans les représentations des acteurs. En Méditerranée, l'évolution du foncier est intimement liée à l'histoire des sociétés, notamment depuis la période de l'Empire ottoman. Il cristallise les relations entre groupes sociaux et constitue bien souvent un facteur important de blocage du développement durable. Malgré les nombreuses tentatives dans les pays du Sud et de l'Est méditerranéens, les différentes réformes agraires mises en oeuvre sous et depuis la colonisation ont échoué à instaurer un ordre plus équitable tant à la ville que dans les campagnes, ou à leur interface. C'est une des raisons pour lesquelles il convient de revisiter la question foncière en Méditerranée avec un oeil neuf, débarrassé des idées préconçues et capable de déceler dans l'analyse de cas concrets des pistes innovantes de réforme. C'est l'ambition de ce volume d'Options Méditerranéennes qui réunit les travaux du réseau FONCIMED présentés aux séminaires d'Athènes (octobre 2014) et de Tunis (octobre 2015). FONCIMED réunit des chercheurs et des praticiens de tout le pourtour méditerranéen. J'espère ainsi que par la richesse de ses analyses, ce livre intéressera les différents acteurs et observateurs de la question foncière et du développement agricole et rural en Méditerranée, dont les décideurs en quête de nouvelles idées au service des politiques publiques touchant au foncier. Le CIHEAM-IAMM est fier d'animer avec l'INRA les activités du réseau FONCIMED et de mettre la collection Options Méditerranéennes au service de la diffusion de ses travaux. Pascal Bergeret Directeur de l'IAMM

Séminaire international Foncimed : Le Dualisme Foncier Agricole en Méditerranée : Concurrence ou Coopération ? 2015/10/15-17, Tunis (Tunisie).; International audience; Options Méditerranéennes, A 117, 2017-La petite exploitation agricole méditerranéenne, une réponse en temps de crise Préface Le foncier, ressource stratégique tant pour l'agriculture que pour les dynamiques urbaines, peut s'appréhender sous plusieurs angles. Objet de recherche, c'est un marqueur de l'histoire et un indicateur des dynamiques sociales à l'oeuvre dans les zones considérées. Témoin d'alliances ou de conflits, il matérialise les tensions permanentes générées par la confrontation d'enjeux locaux et de bouleversements planétaires. Objet de politique publique (agricole, environnementale, territoriale, etc.), le foncier peut se révéler comme un levier efficace pour atteindre les objectifs de développement économique et social que les gouvernements se fixent. Cependant, ce levier est particulièrement difficile à mettre en oeuvre, étant donnée son inscription profonde dans les fabriques sociales et politiques locales et nationales, ainsi que dans les représentations des acteurs. En Méditerranée, l'évolution du foncier est intimement liée à l'histoire des sociétés, notamment depuis la période de l'Empire ottoman. Il cristallise les relations entre groupes sociaux et constitue bien souvent un facteur important de blocage du développement durable. Malgré les nombreuses tentatives dans les pays du Sud et de l'Est méditerranéens, les différentes réformes agraires mises en oeuvre sous et depuis la colonisation ont échoué à instaurer un ordre plus équitable tant à la ville que dans les campagnes, ou à leur interface. C'est une des raisons pour lesquelles il convient de revisiter la question foncière en Méditerranée avec un oeil neuf, débarrassé des idées préconçues et capable de déceler dans l'analyse de cas concrets des pistes innovantes de réforme. C'est l'ambition de ce volume d'Options Méditerranéennes qui réunit les travaux du réseau FONCIMED présentés aux séminaires d'Athènes (octobre 2014) et de Tunis (octobre 2015). FONCIMED réunit des chercheurs et des praticiens de tout le pourtour méditerranéen. J'espère ainsi que par la richesse de ses analyses, ce livre intéressera les différents acteurs et observateurs de la question foncière et du développement agricole et rural en Méditerranée, dont les décideurs en quête de nouvelles idées au service des politiques publiques touchant au foncier. Le CIHEAM-IAMM est fier d'animer avec l'INRA les activités du réseau FONCIMED et de mettre la collection Options Méditerranéennes au service de la diffusion de ses travaux. Pascal Bergeret Directeur de l'IAMM

Séminaire international Foncimed : Le Dualisme Foncier Agricole en Méditerranée : Concurrence ou Coopération ? 2015/10/15-17, Tunis (Tunisie).; International audience; Options Méditerranéennes, A 117, 2017-La petite exploitation agricole méditerranéenne, une réponse en temps de crise Préface Le foncier, ressource stratégique tant pour l'agriculture que pour les dynamiques urbaines, peut s'appréhender sous plusieurs angles. Objet de recherche, c'est un marqueur de l'histoire et un indicateur des dynamiques sociales à l'oeuvre dans les zones considérées. Témoin d'alliances ou de conflits, il matérialise les tensions permanentes générées par la confrontation d'enjeux locaux et de bouleversements planétaires. Objet de politique publique (agricole, environnementale, territoriale, etc.), le foncier peut se révéler comme un levier efficace pour atteindre les objectifs de développement économique et social que les gouvernements se fixent. Cependant, ce levier est particulièrement difficile à mettre en oeuvre, étant donnée son inscription profonde dans les fabriques sociales et politiques locales et nationales, ainsi que dans les représentations des acteurs. En Méditerranée, l'évolution du foncier est intimement liée à l'histoire des sociétés, notamment depuis la période de l'Empire ottoman. Il cristallise les relations entre groupes sociaux et constitue bien souvent un facteur important de blocage du développement durable. Malgré les nombreuses tentatives dans les pays du Sud et de l'Est méditerranéens, les différentes réformes agraires mises en oeuvre sous et depuis la colonisation ont échoué à instaurer un ordre plus équitable tant à la ville que dans les campagnes, ou à leur interface. C'est une des raisons pour lesquelles il convient de revisiter la question foncière en Méditerranée avec un oeil neuf, débarrassé des idées préconçues et capable de déceler dans l'analyse de cas concrets des pistes innovantes de réforme. C'est l'ambition de ce volume d'Options Méditerranéennes qui réunit les travaux du réseau FONCIMED présentés aux séminaires d'Athènes (octobre 2014) et de Tunis (octobre 2015). FONCIMED réunit des chercheurs et des praticiens de tout le pourtour méditerranéen. J'espère ainsi que par la richesse de ses analyses, ce livre intéressera les différents acteurs et observateurs de la question foncière et du développement agricole et rural en Méditerranée, dont les décideurs en quête de nouvelles idées au service des politiques publiques touchant au foncier. Le CIHEAM-IAMM est fier d'animer avec l'INRA les activités du réseau FONCIMED et de mettre la collection Options Méditerranéennes au service de la diffusion de ses travaux. Pascal Bergeret Directeur de l'IAMM

This chapter descibes the basic algorithmic components that are involved in clustering, with particular attention to classification of microarray data.

Four biotechnological advances have been accomplished of the last decade: i) sequencing of whole genomes giving chance to the discovery of thousands of genes, ii) functional genomics using high-throughput DNA microarrays to measure expression of each of these genes in multiple physiological and environmental conditions, iii) scaling of proteins using Proteome to map all the proteins produced by a genome, and iv) the dynamics of these genes and proteins in a network of interactions that gives life to any biological activity and phenotype. These major breakthroughs resulted in massive collection of data in the field of Life Sciences. Considerable efforts have been made to sort out, curate and integrate every relevant piece of information from multiple information sources in order to understand complex biological phenomena.