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International audience; Pectins, complex polysaccharides and major components of the plant primary cell wall, can be degraded by pectate lyases (PLs). PLs cleave glycosidic bonds of homogalacturonans (HG), the main pectic domain, by β-elimination, releasing unsaturated oligogalacturonides (OGs). To understand the catalytic mechanism and structure/function of these enzymes, we characterized VdPelB from Verticillium dahliae. We first solved the crystal structure of VdPelB at 1.2 Å resolution showing that it is a right-handed parallel β-helix structure. Molecular dynamics (MD) simulations further highlighted the dynamics of the enzyme in complex with substrates that vary in their degree of methylesterification, identifying amino acids involved in substrate binding and cleavage of non-methylesterified pectins. We then biochemically characterized wild type and mutated forms of VdPelB. Pectate lyase VdPelB was most active on non-methylesterified pectins, at pH 8.0 in presence of Ca2+ ions. The VdPelB-G125R mutant was most active at pH 9.0 and showed higher relative activity compared to native enzyme. The OGs released by VdPelB differed to that of previously characterized PLs, showing its peculiar specificity in relation to its structure. OGs released from Verticillium-partially tolerant and sensitive flax cultivars differed which could facilitate the identification VdPelB-mediated elicitors of defence responses.

L’objectif de cette étude est de mesurer l’évolution de la densité osseuse (DO) dans une population de patients vus en pratique courante et de voir si elle est comparable aux données de la littérature pour les patients traités pour une ostéoporose. Nous avons analysé les 107 premiers patients se présentant pour une nouvelle mesure de DO entre juin 2005 et décembre 2006 et qui avaient effectué leur précédente mesure au moins 2 ans avant. Nous avons recueilli parallèlement les traitements pris dans l’intervalle entre les deux mesures et parallèlement un certain nombre de facteurs pronostiques : poids, taille, âge, âge au moment de la ménopause, antécédents personnels ou familiaux de fracture, médicament ou pathologies fragilisantes. L’intervalle moyen entre les deux mesures s’échelonne entre 3,9 ± 1,4 et 4,6 ± 1,8 années selon les traitements pris. L’évolution de la masse osseuse est significativement plus favorable sous traitement par risedronate, alendronate, raloxifène et traitement hormonal qu’en l’absence de traitement. Elle est non significative pour l’association calcium vitamine D. Par contre l’amplitude de cette évolution est plus faible et la dispersion des résultats plus importante que dans les données de la littérature. L’effet des traitements anti-ostéoporotiques en pratique courante pourrait être très inférieur à ce que laissent supposer les essais randomisés publiés. Ce travail incite à entreprendre des études à plus grande échelle pour le connaître dans les conditions “réelles” d’utilisation., The purpose of this study is to measure bone density in routine practice and to compare it to literature data of patients treated for osteoporosis Material and method We analyzed 107 first patients presenting in our centre for a new bone density measure between June 2005 and December 2006 who had their previous measure 2 years before or more. We collected the drugs intake for osteoporosis and some prognosis factors : weigh, birth date, age of menopause, personal or familial fracture, fragilising drug or pathology. Results Time between two measure is between 3,9 ± 1,4 et 4,6 ± 1,8 years according the treatment. Evolution of bone density is significantly more favourable under treatment by risedronate, alendronate, raloxifene and hormonal treatment than with no treatment. It is not significant for calcium vitamin D association. Oppositely, this evolution is lower and dispersion of results higher than in the published littertaure. Conclusions Effect of treatment against osteoporosis in clinical practice could be very lower that what shows the published randomised clinical trial. This work incite to realize studies with a greater sample size to know it in “real life”.