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The aim was to analyze the characteristics and predictors of unfavorable outcomes in solid organ transplant recipients (SOTRs) with COVID-19. We conducted a prospective observational cohort study of 210 consecutive SOTRs hospitalized with COVID-19 in 12 Spanish centers from 21 February to 6 May 2020. Data pertaining to demographics, chronic underlying diseases, transplantation features, clinical, therapeutics, and complications were collected. The primary endpoint was a composite of intensive care unit (ICU) admission and/or death. Logistic regression analyses were performed to identify the factors associated with these unfavorable outcomes. Males accounted for 148 (70.5%) patients, the median age was 63 years, and 189 (90.0%) patients had pneumonia. Common symptoms were fever, cough, gastrointestinal disturbances, and dyspnea. The most used antiviral or host-targeted therapies included hydroxychloroquine 193/200 (96.5%), lopinavir/ritonavir 91/200 (45.5%), and tocilizumab 49/200 (24.5%). Thirty-seven (17.6%) patients required ICU admission, 12 (5.7%) suffered graft dysfunction, and 45 (21.4%) died. A shorter interval between transplantation and COVID-19 diagnosis had a negative impact on clinical prognosis. Four baseline features were identified as independent predictors of intensive care need or death: advanced age, high respiratory rate, lymphopenia, and elevated level of lactate dehydrogenase. In summary, this study presents comprehensive information on characteristics and complications of COVID-19 in hospitalized SOTRs and provides indicators available upon hospital admission for the identification of SOTRs at risk of critical disease or death, underlining the need for stringent preventative measures in the early post-transplant period., This study was supported by Plan Nacional de I+D+i 2013-2016 and Instituto de Salud Carlos III, Subdireccio´n General de Redes y Centros de Investigacio´n Cooperativa, Ministerio de Ciencia, Innovacio´n y Universidades, Spanish Network for Research in Infectious Diseases (REIPI RD16/0016); co-financed by European Development Regional Fund “A way to achieve Europe”, Operative Program Intelligence Growth 2014-2020. EC and JSC received grants from the Instituto de Salud Carlos III, Ministerio de Ciencia e Innovacio´n, Proyectos de Investigacio´n sobre el SARSCoV-2 y la enfermedad COVID-19 (COV20/ 00370; COV20/00580). JSC is a researcher belonging to the program “Nicola´s Monardes”(C0059–2018), Servicio Andaluz de Salud, Junta de Andalucı´a, Spain. SS-A is supported by a grant from the Instituto de Salud Carlos III, Ministerio de Ciencia e Innovacio´n, Proyectos de Investigacio´n sobre el SARS-CoV-2 y la enfermedad COVID-19 (COV20/00370).

Autoantibodies neutralizing type I interferons (IFNs) can underlie critical COVID-19 pneumonia and yellow fever vaccine disease. We report here on 13 patients harboring autoantibodies neutralizing IFN-α2 alone (five patients) or with IFN-ω (eight patients) from a cohort of 279 patients (4.7%) aged 6-73 yr with critical influenza pneumonia. Nine and four patients had antibodies neutralizing high and low concentrations, respectively, of IFN-α2, and six and two patients had antibodies neutralizing high and low concentrations, respectively, of IFN-ω. The patients' autoantibodies increased influenza A virus replication in both A549 cells and reconstituted human airway epithelia. The prevalence of these antibodies was significantly higher than that in the general population for patients 70 yr of age (3.1 vs. 4.4%, P = 0.68). The risk of critical influenza was highest in patients with antibodies neutralizing high concentrations of both IFN-α2 and IFN-ω (OR = 11.7, P = 1.3 × 10-5), especially those, The Laboratory of Human Genetics of Infectious Diseases is supported by the Howard Hughes Medical Institute, the Rockefeller University, the St. Giles Foundation, the National Institutes of Health (NIH; R01AI088364 and R01AI163029), the National Center for Advancing Translational Sciences, NIH Clinical and Translational Science Award program (UL1 TR001866), the Fisher Center for Alzheimer’s Research Foundation, the Meyer Foundation, the JPB Foundation, the French National Research Agency (ANR) under the “Investments for the Future” program (ANR-10-IAHU-01), the Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases Laboratory of Excellence (ANR-10-LABX-62-IBEID), the French Foundation for Medical Research (EQU201903007798), the ANRS-COV05, ANR-RHU program ANR-21-RHUS-08, ANR GENVIR (ANR-20-CE93-003), ANR GenMISC (ANR-21-COVR-0039), and ANR AABIFNCOV (ANR-20-CO11-0001) projects, the European Union’s Horizon 2020 research and innovation program under grant agreement 824110 (EASI-genomics), the HORIZON-HLTH-2021-DISEASE-04 program under grant agreement 01057100 (UNDINE), the Square Foundation, Grandir–Fonds de solidarité pour l’enfance, the Fondation du Souffle, the SCOR Corporate Foundation for Science, the French Ministry of Higher Education, Research, and Innovation (MESRI-COVID-19), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), REACTing-INSERM, and the Université Paris Cité. This work was partly supported by the Center for Research on Influenza Pathogenesis and Transmission, a National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID)–funded Center of Excellence for Influenza Research and Response (contract no. 75N93021C00014), and the FLUOMICS Consortium (NIH-NIAID grant U19AI135972) to both A. García-Sastre and R.A. Medina, and by NIAID grant U19AI142733 and U19AI168631 to A. García-Sastre. Work in the Medina laboratory was also supported by the PIA ACT 1408, FONDECYT 1161971 and 1212023 grants from Agencia Nacional de Investigación y Desarrollo of Chile. The VirPath team is supported by INSERM REACTing (Research & Action Emerging Infectious Diseases), CNRS, and Mérieux Research grants. B. Padey is supported by an ANRT CIFRE PhD scholarship. For the Lyon cohort, specimen collection and study was supported by a grant from the French Ministry of Health PHRC-I 2013 ANTIGRIPPE. C. Rodríguez-Gallego and colleagues were supported by the Instituto de Salud Carlos III (COV20_01333, COV20_01334, and PI12/01565, Spanish Ministry for Science and Innovation RTC-2017-6471-1; AEI/FEDER, UE), Grupo DISA, Fundación MAPFRE Guanarteme, Sociedad Española de Neumología y Cirugía Torácica and Cabildo Insular de Tenerife (CGIEU0000219140 and “Apuestas, científicas del Instituto Tecnológico y de Energías Renovables para colaborar en la lucha contra la COVID-19”). E. Andreakos is supported by the Hellenic Foundation for Research and Innovation (INTERFLU, no. 1574). P. Bastard was supported by the French Foundation for Medical Research (EA20170638020) and by the MD-PhD program of the Imagine Institute (with the support of the Fondation Bettencourt-Schueller). This study was supported by Plan Nacional de I+D+i 2013-2016 and Instituto de Salud Carlos III, Subdirección General de Redes y Centros de Investigación Cooperativa, Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades, Spanish Network for Research in Infectious Diseases (REIPI RD16/0016/0009); cofinanced by European Regional Development Fund “A way to achieve Europe”; Operative Program Intelligence Growth 2014-2020 (CB21/13/00006) also was supported by CIBER-Consorcio Centro de Investigación Biomédica en Red, Instituto de Salud Carlos III, Ministerio de Ciencia e Innovación and Unión Europea–Next Generation EU and Consejería de Economía, Conocimiento, Empresas y Universidad, Secretaría General de Universidades, Investigación y Tecnología, Junta de Andalucía, Spain (P18-RT-3320). I. Meyts is a Senior Clinical Investigator at the Research Foundation–Flanders and is supported by the CSL Behring Chair of Primary Immunodeficiencies, a CSL-Behring Research Grant, KU Leuven C1 grant C16/18/007, a VIB GC PID Grant, Fonds Wetenschappelijk Onderzoek grants G0C8517N, G0B5120N, and G0E8420N, and the Jeffrey Modell Foundation. Open Access funding provided by Rockefeller University.

The main objective was to evaluate the viability of the SARS-CoV-2 viral particles excreted in stools. In addition, we aimed to identify clinical factors associated with the detection of SARS-CoV-2 RNA in feces, and to determine if its presence is associated with an unfavorable clinical outcome, defned as intensive care unit (ICU) admission and/or death. A prospective multicenter cohort study of COVID-19 adult patients, with confrmed SARS-CoV-2 infection by RT-PCR assay in nasopharyngeal (NP) swabs admitted to four hospitals in Spain, from March 2020 to February 2021. Sixty-two adult COVID-19 patients had stool samples collected at admission and/or during the follow up, with a total of 79 stool samples. SARS-CoV-2 RNA was detected in stool samples from 27 (43.5%) out of the 62 patients. Replicative virus, measured by the generation of cytopathic efect in cell culture and subsequent RT-PCR confrmation of a decrease in the Ct values, was not found in any of these stool samples. Fecal virus excretion was not associated with the presence of gastrointestinal symptoms, or with diferences in the evolution of COVID-19 patients. Our results suggest that SARS-CoV-2 replicative capacity is null or very limited in stool samples, and thus, the fecal–oral transmission of SARS-CoV-2 as an alternative infection route is highly unlikely. In our study, the detection of SARS-CoV-2 RNA in feces at the beginning of the disease is not associated with any clinical factor nor with an unfavorable clinical outcome.

The aim was to assess the ability of nasopharyngeal SARS-CoV-2 viral load at frst patient’s hospital evaluation to predict unfavorable outcomes. We conducted a prospective cohort study including 321 adult patients with confrmed COVID-19 through RT-PCR in nasopharyngeal swabs. Quantitative Synthetic SARS-CoV-2 RNA cycle threshold values were used to calculate the viral load in log10 copies/mL. Disease severity at the end of follow up was categorized into mild, moderate, and severe. Primary endpoint was a composite of intensive care unit (ICU) admission and/or death (n= 85, 26.4%). Univariable and multivariable logistic regression analyses were performed. Nasopharyngeal SARS-CoV-2 viral load over the second quartile (≥7.35 log10 copies/mL, p = 0.003) and second tertile (≥ 8.27 log10 copies/mL, p = 0.01) were associated to unfavorable outcome in the unadjusted logistic regression analysis. However, in the fnal multivariable analysis, viral load was not independently associated with an unfavorable outcome. Five predictors were independently associated with increased odds of ICU admission and/or death: age≥ 70 years, SpO2, neutrophils > 7.5 × ­103 /µL, lactate dehydrogenase≥ 300 U/L, and C-reactive protein≥ 100 mg/L. In summary, nasopharyngeal SARS-CoV-2 viral load on admission is generally high in patients with COVID-19, regardless of illness severity, but it cannot be used as an independent predictor of unfavorable clinical outcome.

Human adenovirus (HAdV) can produce disseminated disease with high mortality in pediatric allogenic hematopoietic stem cell transplant (allo-HSCT) recipients. In adult recipients, prospective studies addressing the incidence of HAdV infection and disease are lacking. The aim of this study was to characterize the kinetics of HAdV replication, the specific T-cell immune response, and the clinical impact of HAdV infection in adult allo- HSCT recipients. We found a high incidence of HAdV viremia, which was controlled by the T-cell immune response and without association with disseminated HAdV disease. Therefore, these data argue against the pre-emptive therapy for HAdV infection in adult allo- HSCT recipients.

XXVII Reunión de la Sociedad Española de Arcillas, Madrid, 19 de Noviembre de 2021., Nanomaterials with inherent antimicrobial and/or biocidal activity are increasingly demanded in fields such as food packaging, medical devices and water purification systems. Clay minerals are nanostructured materials since one of their dimensions is within the range of 1-100 nm. They can be modified by anchoring biocidal molecules on their surface. Quaternary ammonium compounds (QACs) have been reported to have antimicrobial activity, that is dependent on their structure and size (Undabeytia, et al., 2014). In the current work, the bactericidal activity of a series of QACs-clay nanocomposites made of QACs differing in their structure was examined, The authors acknowledge to Junta de Andalucía for financial support (grant P18-RT-5098).

Motivación: El adenovirus humano (HAdV) es un virus que causa infecciones autolimitadas y leves en individuos inmunocompetentes, en cambio, en pacientes inmunodeprimidos las infecciones suelen ser de caracter grave, presentando elevada morbilidad y mortalidad. En la actualidad no existe un antiviral específico para tratar este tipo de infecciones y los antivirales de amplio espectro disponibles en la práctica clínica habitual no presentan una actividad satisfactoria(1). El objetivo de este proyecto es obtener, partir de diferentes librerías químicas de pequeñas moléculas, compuestos líderes capaces de bloquear la infección por HAdV como primer paso para el desarrollo de un antiviral específico frente HAdV. Métodos: Partimos de una librería de 50 moléculas de una quimioteca de derivados di- y trisustituidos de piperazina. Primero se realizaron ensayos en placa para evaluar su actividad anti-HAdV a una concentración de 10 µM utilizando células 293β5 y el HAdV-GFP no replicativo. Se seleccionaron aquellas moléculas que presentaron actividad inhibidora de la infección superior al 50% y un concentración citotóxica 50 (CC50) superior a 100 µM. Luego, se realizaron diferentes ensayos funcionales para poder identificar en qué punto del ciclo replicativo del virus actuaban dichos compuestos: Ensayo de entrada con el HAdV-GFP y células A549 para evaluar su actividad (50 µM) en etapas tempranas de la entrada del virus en la célula huésped, hasta la liberación de su ADN en el núcleo, y PCR a tiempo real cuantitativa (50 µM) para determinar si aquellos compuesto que no presentaron actividad en fases tempranas presentaban como diana el proceso de replicación del ADN del virus o si por el contrario estaban afectando pasos posteriores de su ciclo infectivo(2). Resultados: Se seleccionaron las moléculas 11, 12, 18 y 19 en base a los resultados del ensayo en placa (inhibición 81%- 96%). Las moléculas 11 y 12 presentaron así mismo inhibición en los ensayos de entrada. La molécula 19 mostró además actividad nhibitoria de la replicación del ADN viral. Conclusiones: Las moléculas 11, 12, 18 y 19 inhiben significativamente la infección por HAdV a bajas concentraciones sin presentar efectos citotóxicos. Además las moléculas 11 y 12 actuarían en fases tempranas del ciclo viral, la molécula 18 ejercería su actividad antiviral durante las fases tardías del ciclo viral y la molécula 19 tendría su diana de acción, al menos en parte, en el proceso de replicación del ADN viral.

Motivación: La incidencia de infecciones por adenovirus (HAdV) en pacientes receptores de órgano sólido y especialmente de receptores de progenitores hematopoyéticos, ha aumentado en los últimos años, presentando una elevada morbi- mortalidad (1, 2). Actualmente no existen tratamientos específicos para este tipo de infecciones. Nuestro objetivo fundamental fue identificar moléculas capaces de inhibir la infección por HAdV y determinar su mecanismo de acción como primer paso para el desarrollo de un nuevo antiviral específico frente a HAdV. Métodos: Partimos de una librería de 30 derivados de piperazina. Las moléculas que presentaron actividad inhibitoria > 50% de la infección por HAdV mediante ensayo en placa o mediante "single round infection" se seleccionaron para su caracterización posterior. Su citotoxicidad (CC50) se evaluó mediante cuantificación del XTT metabolizado. Se realizaron así mismo estudios dosis-respuesta de los compuestos activos. También se evaluó la capacidad de las moléculas de inhibir la replicación del virus, para lo cual se llevaron a cabo infecciones de 24h y se cuantificó la producción de "de novo" HAdV ADN mediante PCR cuantitativa a tiempo real (3). La cuantificación de la reducción de la progenie viral por la acción de las moléculas seleccionadas se realizó mediante un ensayo de producción viral y posterior titulación. Resultados: Las moléculas 511, 512 y 513 (50 µM) generaron inhibiciones >50% en el ensayo en placa. Sólo el compuesto 511 generaba una inhibición leve dosis-dependiente. Los valores de CC50 fueron 190, 546 y 85 µM, respectivamente, en base a los cuales el compuesto 513 fue descartado para su posterior caracterización por su elevada toxicidad. Los moléculas 511 y 512 (30 µM) produjeron inhibiciones de la replicación viral del 80% y del 50%, respectivamente. Las moléculas 511 y 512 (30 µM) generaron reducciones en la progenie viral del 44% y del 25%, respectivamente. Conclusiones: Las moléculas 511 y 512 inhiben de manera significativa la infección por HAdV a nivel de la replicación del ADN viral. La optimización de ambos compuestos supone un excelente punto de partida para la obtención de un nuevo agente antiviral específico frente a infecciones por HAdV.

DE LA TESIS:Desde la aparición de las quinolonas, las resistencias bacterianas a las mismas han evolucionado de forma paralela. Conforme han ido apareciendo nuevas moléculas con mayor capacidad bactericida y mejores parámetros farmacodinámicos y farmacocinéticos, también se han ido identificando nuevos y más sofisticados mecanismos de resistencia, que se han ido adaptando a las necesidades de cada momento. Es por ello que se hace necesaria una nueva metodología para el diseño y la síntesis de nuevos agentes antibacterianos con el objetivo de aumentar su potencia antibacteriana y, al mismo tiempo, disminuir la probabilidad de generar a corto plazo nuevos mecanismos de resistencia. Con este fin, es fundamental conocer todos los mecanismos de resistencia y cuál es, en detalle, su mecanismo de acción, para poder diseñar nuevas moléculas capaces de, manteniendo su capacidad bactericida, eludir dichos mecanismos.En esta tesis nos propusimos como objetivos fundamentales, en primer lugar, investigar las bases moleculares de los mecanismos de resistencia a quinolonas en bacterias Gram-negativas. En concreto, en Escherichia coli, Yersinia enterocolitica y Citrobacter freundii. Por otro lado, se llevaron a cabo cálculos de acoplamiento o "docking" mediante la utilización de programas informáticos con el fin de incrementar nuestros conocimientos respecto al modelo de interacción entra ADN-ADN girasa-quinolona, para de esta manera mejorar nuestra comprensión de los mecanismos de resistencia a fluoroquinolonas asociados a las mutaciones más comúnmente encontradas en el gen gyrA. Finalmente, el último de los objetivos que nos propusimos fue el de diseñar, sintetizar y evaluar diferentes derivados de ciprofloxacino y norfloxacino con el fin de encontrar entre ellos alguno que tuviera la capacidad de interaccionar con la enzima ADN girasa, poseyendo ésta uno o dos cambios aminoacídicos en su subunidad A.

Els microorganismes han desenvolupat diversos mecanismes per resistir els efectes tòxics dels agents antibacterians. Entre aquests es troba la disminució de l'acumulació de l'agent antibacterià a l'interior del bacteri, la qual cosa pot ésser deguda a la disminució de la permeabilitat de la membrana externa en els bacteris gramnegatius i a la sobrexpressió de sistemes d'expulsió activa en ambdós tipus de bacteris, gramnegatius i positius. En bacteris gramnegatius la interacció entre aquests dos mecanismes és el que probablement es dóna amb més freqüència. Els sistemes d'expulsió activa s'han dividit en diferents famílies segons llur arquitectura molecular, mecanisme d'acció, requeriments energètics i especificitat de substrat. Aquests sistemes d'expulsió activa s'han de considerar com a potencials dianes terapèutiques, ja que llur inhibició restauraria l'activitat antibacteriana. Així doncs, una possible nova estratègia terapèutica seria el desenvolupament d'inhibidors d'aquests sistemes d'expulsió activa, que serien administrats conjuntament amb l'agent antibacterià que es veuria afectat pel sistema d'expulsió., Microorganisms have developed several mechanisms to resist toxic effects from antibacterial agents; among them we found decrease in drug accumulation, which can be due to a decrease of permeability in Gram-negative bacteria or/and to an increased expression of one or more efflux pumps in both Gram-negative and Gram-positive bacteria. Among Gram-negative bacteria the interplay between both mechanisms is frequently found. Active efflux systems can be distributed in several families, depending on their molecular architecture, mechanism of action, energetic requirements and substrate specificity. Those active efflux systems have been considered as potential therapeutic targets, since their inhibition can restore antibacterial agent activity. Therefore, a possible new therapeutic strategy would be found in development of efflux pumps inhibitors, which would be administered together with the antibacterial agent.

The aim was to assess the ability of nasopharyngeal SARS-CoV-2 viral load at first patient’s hospital evaluation to predict unfavorable outcomes. We conducted a prospective cohort study including 321 adult patients with confirmed COVID-19 through RT-PCR in nasopharyngeal swabs. Quantitative Synthetic SARS-CoV-2 RNA cycle threshold values were used to calculate the viral load in log10 copies/mL. Disease severity at the end of follow up was categorized into mild, moderate, and severe. Primary endpoint was a composite of intensive care unit (ICU) admission and/or death (n = 85, 26.4%). Univariable and multivariable logistic regression analyses were performed. Nasopharyngeal SARS-CoV-2 viral load over the second quartile (≥ 7.35 log10 copies/mL, p = 0.003) and second tertile (≥ 8.27 log10 copies/mL, p = 0.01) were associated to unfavorable outcome in the unadjusted logistic regression analysis. However, in the final multivariable analysis, viral load was not independently associated with an unfavorable outcome. Five predictors were independently associated with increased odds of ICU admission and/or death: age ≥ 70 years, SpO2, neutrophils > 7.5 × 103/µL, lactate dehydrogenase ≥ 300 U/L, and C-reactive protein ≥ 100 mg/L. In summary, nasopharyngeal SARS-CoV-2 viral load on admission is generally high in patients with COVID-19, regardless of illness severity, but it cannot be used as an independent predictor of unfavorable clinical outcome., This work was supported by National Plan R+D+I 2013–2016 and Instituto de Salud Carlos III, Subdirección General de Redes y Centros de Investigación Cooperativa, Ministry of Economy, Industry, and Competitiveness, Spanish Network for Research in Infectious Diseases [REIPI RD16/0016/0009]; cofinanced by European Development Regional Fund “A way to achieve Europe”, Operative program Intelligent Growth 2014–2020; and supported by Grants from the Instituto de Salud Carlos III, Ministerio de Ciencia e Innovación, Proyectos de Investigación sobre el SARS-CoV-2 y la enfermedad COVID-19 [COV20/00370; COV20/00580]. J.S.C. is a researcher belonging to the program “Nicolás Monardes” (C-0059-2018), Servicio Andaluz de Salud, Junta de Andalucía, Spain.

The repositioning of drugs already approved by regulatory agencies for other indications is an emerging alternative for the development of new antimicrobial therapies. The repositioning process involves lower risks and costs than the de novo development of novel antimicrobial drugs. Currently, infections by adenovirus show a steady increment with a high clinical impact in immunosuppressed and immunocompetent patients. The lack of a safe and efficacious drug to treat these infections supports the search for new antiviral drugs. Here we evaluated the anti-adenovirus activity of niclosanide, oxyclozanide, and rafoxanide, three salicylanilide anthelmintic drugs. Also, we carried out the cytotoxicity evaluation and partial characterization of the mechanism of action of these drugs. The salicylanilide anthelmintic drugs showed significant anti-adenovirus activity at low micromolar concentrations with little cytotoxicity. Moreover, our mechanistic assays suggest differences in the way the drugs exert anti-adenovirus activity. Niclosamide and rafoxanide target transport of the HAdV particle from the endosome to the nuclear envelope, whilst oxyclozanide specifically targets adenovirus immediately early gene E1A transcription. Data suggests that the studied salicylanilide anthelmintic drugs could be suitable for further clinical evaluation for the development of new antiviral drugs to treat infections by adenovirus in immunosuppressed patients and in immunocompetent individuals with community-acquired pneumonia., Supported by Plan Nacional de I + D + i 2013–2016 and Instituto de Salud Carlos III, Ministerio de Economía, Industria y Competitividad, Spanish Network for Research in Infectious Diseases (REIPI RD16/0016/0009) – co-financed by “A way to achieve Europe” ERDF, the Instituto de Salud Carlos III, Proyectos de Investigación en Salud (PI15/00489) and Proyectos de Desarrollo Tecnológico en Salud (DTS17/00130), and the Spanish Adenovirus Network (AdenoNet, BIO2015/68990-REDT). J.S.C. is supported by the “Contract to Access to the Spanish System of Research and Innovation of the Program of R + D + i of the University of Seville” (USE-13901-D) grant.

La PCR en tiempo real para virus respiratorios ha ampliado el diagnóstico etiológico de la neumonía adquirida en la comunidad (NAC), pero, a pesar de un trabajo de diagnóstico intensivo, aproximadamente la mitad de los casos permanecen sin diagnóstico etiológico. El alto potencial epidémico de los virus respiratorios endémicos (VRE) ha sido ampliamente reconocido, pero no hay consenso sobre su relevancia en el desenlace clínico de estos pacientes. Las muestras de esputo representativas son el estándar de referencia para el diagnóstico etiológico de la NAC, ya que no se conoce bien la especificidad de la detección de virus en las vías respiratorias superiores. Además, las conocidas puntuaciones de gravedad de la NAC, como el PSI y el CURB-65, son útiles para una rápida clasificación de los pacientes y un buen manejo, pero no son capaces de diferenciar entre etiologías. El objetivo de este trabajo es identificar la frecuencia y la diversidad de los virus como etiología de la NAC en adultos, evaluar la sensibilidad y la especificidad de los exudados nasofaríngeos para el diagnóstico etiológico de la NAC viral y estudiar la importancia de los agentes bacterianos y virales en el resultado de los pacientes y el valor de las puntuaciones de gravedad para la NAC en pacientes con etiología identificada. Los resultados del presente trabajo ponen de manifiesto la elevada frecuencia de la etiología viral detectada, mediante el uso de métodos moleculares para su diagnóstico, en muestras de las vías respiratorias superiores, las cuales tiene un alto valor predictivo positivo y especificidad para el diagnóstico de los VRE en la NAC viral en adultos en comparación con el esputo representativo. Además, los VRE no parecieron asociarse a un desenlace clínico desfavorable, pero sí la presencia de cualquier agente etiológico, aunque el índice de severidad CURB-65 no predijo correctamente la mortalidad en el grupo de pacientes con etiología viral.

El adenovirus humano (HAdV) destaca como el virus que mayor incremento ha experimentado en cuanto a su incidencia en pacientes receptores de trasplante de progenitores hematopoyéticos (TPH), especialmente en niños. La infección por HAdV suele ser autolimitada en pacientes inmunocompetentes, pero puede dar lugar a infecciones diseminadas o neumonías con mortalidad superior al 50% en casos de pacientes inmunocomprometidos, como los receptores de TPH. En la actualidad no existe un antiviral específico aprobado para su uso frente a infecciones por HAdV, y los tratamientos utilizados (cidofovir, ribavirina y ganciclovir) presentan una gran variabilidad en cuanto a su eficacia. El tratamiento de este tipo de infecciones debe basarse en el conocimiento de la cinética de replicación del virus, así como la identificación de la respuesta inmune específica generada por el mismo, ya sea para tratar o para prevenir la infección. A pesar de la controversia existente en cuanto al seguimiento de la carga viral sistemática mediante PCR cuantitativa, éste es cada vez más utilizado, especialmente en pacientes de alto riesgo. La reconstitución inmune frente a HAdV juega un papel fundamental en el control de la infección. Incrementos en los recuentos linfocitarios totales o de células T CD4+ se asocian con el aclaramiento de la infección y la mejora de la supervivencia. El establecimiento de una metodología para la detección de la respuesta inmune específica frente a infecciones por HAdV nos permitiría predecir la evolución del paciente y la necesidad de tratamiento en cada caso. El objetivo de este estudio escaracterizar la incidencia y cinética de replicación de HAdV en pacientes adultos receptores de TPH, caracterizar la respuesta inmune celular específica de HAdV tras el trasplante y evaluar su influencia en la evolución clínica de los mismos, así como estudiar la potencial utilidad de ganciclovi en el tratamiento de infecciones por HAdV en estos pacientes. Nuestros resultados muestran que la infección por HAdV es un evento frecuente después del trasplante, sin embargo, no encontramos asociación con el desarrollo de enfermedad diseminada por HAdV ni con la mortalidad, y además, que la respuesta inmune de células T específicas para HAdV puede ayudar a controlar las infecciones por HAdV en receptores adultos de TPH. Finalmente, demostramos que la actividad de ganciclovir frente a HAdV es óptima siempre que el tratamiento se realice en condiciones de co-infección con citomegalovirus (CMV), de manera que la quinasa de CMV (UL97) complemente la ausencia de una quinasa en HAdV para la fosforilación óptima de ganciclovir a su forma activa.

El adenovirus humano (HAdV) es un patógeno oportunista común raramente relacionado con sintomatología grave en individuos inmunocompetentes. Sin embargo, en pacientes immunocomprometidos como los receptores de trasplantes de órgano sólido o de progenitores hematopoyéticos su incidencia se ha incrementado en los últimos años. La creciente implementación de tratamientos inmunosupresores ha provocado, principalmente en los pacientes pediátricos, un aumento en la incidencia de infecciones provocadas por HAdV, con una elevada morbilidad y mortalidad asociada. Además, con los avances en las técnicas de diagnóstico molecular, cada vez se han detectado más HAdV involucrados en casos esporádicos y brotes graves de neumonía adquirida en la comunidad en adultos sanos. Puesto que no existe un tratamiento específico aprobado por las Autoridades Sanitarias para el tratamiento de infecciones por HAdV, en este trabajo se presenta la síntesis, evaluación biológica, y las relaciones estructura-actividad de una nueva biblioteca de pequeñas moléculas como el primer paso en el desarrollo de un medicamento específico para el tratamiento de las infecciones por HAdV. Basándonos en el hecho de que los derivados de la piperazina han demostrado ser una fuente efectiva para la generación de compuestos antivirales con diversos mecanismos de acción, se diseñaron y sintetizaron, siguiendo una metodología sencilla y de alto rendimiento, tres nuevas generaciones de derivados de 4-acil-1-fenilaminocarbonil-2-metilpiperazina y 4-acil-1-fenilaminocarbonil-2-fenilpiperazina. Los ensayos biológicos y el estudio de las relaciones estructura-actividad permitieron identificar, de un total de 52 compuestos, 6 derivados de fenilpiperazinas que inhibieron de manera significativa la infección por HAdV. Estos compuestos mostraron la capacidad de inhibir la replicación no solo de HAdV, sino también de HCMV, a bajas concentraciones micromolares y presentando poca o nula citotoxicidad. En base a los estudios biológicos, estas moléculas pueden bloquear las infecciones de HAdV y HCMV en distintas fases de su ciclo vital, evidenciando candidatos potenciales para el desarrollo de compuestos antivirales para el tratamiento de las infecciones por virus de ADN. In immunocompetent individuals, human adenovirus (HAdV) infections are mostly self-limiting; however, in immunocompromised patients, such as solid-organ transplant (TOS) or hematopoietic stem cell transplant (HSCT) recipients, HAdV infections are the cause of high morbidity and mortality; in fact, HAdV has the highest reported increase in incidence of any virus in transplantation recipients in recent years, especially in pediatric units. In addition, with the advances in molecular diagnosis techniques, HAdV has been increasingly found to be involved in sporadic cases and outbreaks of severe community-acquired pneumonia (CAP) in healthy adults. Since there are no currently approved antiviral drugs to specifically treat HAdV infections, here we report the synthesis, biological evaluation, and structure−activity relationships of a new library of small molecules as the first step in the development of a specific drug to treat infections by HAdV. Based on the fact that piperazine derivatives had previously proved their utility as an effective source of antiviral compounds with different mechanisms of action, we synthesize by a short and high yielded methodology, three generations of new 4-acyl-1-phenylaminocarbonyl-2-methylpiperazine and 4-acyl-1-phenylaminocarbonyl-2-phenylpiperazine derivatives, comprising a total of 52 compounds. By using the biological evaluation and structure-activity relationships, we have identified six phenylpiperazine derivatives that significantly inhibited HAdV infection. These six compounds showed the capacity to block HAdV and human cytomegalovirus (HCMV) replication at low micromolar concentration, with little or no cytotoxicity and targeting different phases of their life cycle, providing potential candidates for the development of a new family of antiviral drugs for the treatment of infections by DNA viruses. Premio Extraordinario de Doctorado US