1. Draft genome sequence of Fermentimonas caenicola strain SIT8, isolated from the human gut
- Author
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Beye, Mamadou, Bakour, Sofiane, Traore, Sory Ibrahima, Rathored, Jaishriram, Labas, Noémie, Raoult, Didier, Fournier, Pierre-Edouard, Microbes évolution phylogénie et infections (MEPHI), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU), Vecteurs - Infections tropicales et méditerranéennes (VITROME), Institut de Recherche Biomédicale des Armées (IRBA)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche Biomédicale des Armées (IRBA), and Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche Biomédicale des Armées [Brétigny-sur-Orge] (IRBA)
- Subjects
lcsh:Genetics ,Genome ,lcsh:QH426-470 ,Microbiota ,[SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN] ,Fermentimonas caenicola ,Extended Genome Report ,Human gut ,[SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology - Abstract
We report the properties of a draft genome sequence of the bacterium Fermentimonas caenicola strain SIT8 (= CSUR P1560). This strain, whose genome is described here, was isolated from the fecal flora of a healthy 28-month-old Senegalese boy. Strain SIT8 is a facultatively anaerobic Gram-negative bacillus. Here we describe the features of this organism, together with the complete genome sequence and annotation. The 2,824,451-bp long (1 chromosome but no plasmid) contains 2354 protein-coding and 46 RNA genes, including four rRNA genes. Electronic supplementary material The online version of this article (10.1186/s40793-018-0310-6) contains supplementary material, which is available to authorized users.
- Published
- 2018