Search

Presently, the Solid Earth Sciences started to move towards implementing High Performance Computational (HPC) research facilities. One of the key tenants of HPC is performance, which strongly depends on the interaction between software and hardware. In this paper, they are presented benchmark results from two HPC systems. Testing a Computational Fluid Dynamics (CFD) code specific for Solid Earth Sciences, the HPC system Horus, based on Gigabit Ethernet, performed reasonably well compared with its counterpart CyberDyn, based on Infiniband QDR fabric. However, the HPCC CyberDyn based on low-latency high-speed QDR network dedicated to MPI traffic outperformed the HPCC Horus. Due to the high-resolution simulations involved in geodynamic research studies, HPC facilities used in Earth Sciences should benefit from larger up-front investment in future systems that are based on high-speed interconnects.

El problema de los flujos convectivos en un fluido altamente viscoso representa una direccion comun de investigacion en Ciencias de la Tierra. Para rastrear el movimiento convectivo de un material fluido, se utiliza una fuente pasiva de particulas (o trazadores) que fluyen en el campo local de velocidades y no afectan el flujo. Es presentado un codigo paralelizado de trazadores que utiliza particulas pasivas e ingravidas cuyas posiciones estan calculadas segun su desplazamiento durante un intervalo de tiempo pequeno -para una velocidad de flujo previamente calculada. El codigo de trazadores esta integrado en el paquete de codigo abierto CitcomS, que se utiliza ampliamente en la comunidad de las Ciencias de la Tierra (www.geodynamics.org). Es comparado el codigo de trazadores en una computadora de alto rendimiento HPCC Cyberdyn, un cluster de alto rendimiento con 1 344 nudos de calculo, disponible en el Instituto de Geodinamica de la Academia Rumana