1. Isolation of 27 polymorphic nuclear microsatellite markers for Roupala montana var. brasiliensis (Proteaceae)
- Author
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FERNANDA B. PEREIRA, ALEXANDRE M. SEBBENN, BRUNO C. ROSSINI, GUILHERME F. MELCHERT, CELSO L. MARINO, PAULO E.M. RIBOLLA, DIEGO P. ALONSO, EDSON VIDAL, EVANDRO V. TAMBARUSSI, Universidade Estadual Paulista (Unesp), Secretaria de Infraestrutura e Meio Ambiente do Estado de São Paulo, Laboratório de Genética e Melhoramento Florestal, and Universidade de São Paulo (USP)
- Subjects
Brazilian lacewood ,0106 biological sciences ,0301 basic medicine ,Linkage disequilibrium ,Genotype ,Science ,Population ,Locus (genetics) ,Biology ,010603 evolutionary biology ,01 natural sciences ,Proteaceae ,Gene flow ,03 medical and health sciences ,education ,Genetics ,SSR markers ,education.field_of_study ,Genetic diversity ,Polymorphism, Genetic ,High-throughput sequencing ,Multidisciplinary ,Roupala montana ,biology.organism_classification ,Null allele ,Genetics, Population ,030104 developmental biology ,Brazilian oak ,Microsatellite ,SEQUENCIAMENTO GENÉTICO ,Microsatellite Repeats - Abstract
Made available in DSpace on 2021-06-25T11:01:04Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2021-01-01. Added 1 bitstream(s) on 2021-07-15T14:35:59Z : No. of bitstreams: 1 S0001-37652021000300809.pdf: 260171 bytes, checksum: 35e354b288270ebf9f77132ef38b8de6 (MD5) Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) Microsatellite primers pairs were developed for the Neotropical tree Roupala montana var. brasiliensis for use in studies on genetic diversity, mating system, and gene flow. Forty-two primer pairs were developed, resulting in 27 polymorphic loci, with two to 27 alleles per locus. The primer pairs were validated against 34 R. montana var. brasiliensis adult trees from four populations. The observed (Ho ) and expected (He ) heterozygosities ranged among loci from 0.061 to 0.930 (mean of 0.544) and from 0.116 to 0.950 (mean of 0.700), respectively. Null alleles were observed for ten loci. No genotypic linkage disequilibrium was detected in any pair of loci. This set of loci is suitable for population genetic studies of the species. Programa de Pós-Graduação em Ciência Florestal Faculdade de Ciências Agronômicas Universidade Estadual Paulista “Júlio de Mesquita Filho” (Unesp), Av. Universitária, 3780, Altos do Paraíso Instituto Florestal de São Paulo Estação Experimental Tupi Secretaria de Infraestrutura e Meio Ambiente do Estado de São Paulo, Rodovia Luiz de Queiroz, Km 149,5, Tupi 339 Universidade Estadual Paulista “Júlio de Mesquita Filho” (UNESP) Instituto de Biosciência Departamento de Genética, R. Prof. Dr. Antônio Celso Wagner Zanin, 250, Distrito de Rubião Junior Universidade Estadual Paulista “Júlio de Mesquita Filho”(UNESP) Instituto de Biotecnologia (IBTEC), Alameda das Tecomarias, s/n, Chácara Capão Bonito (Unicentro) Laboratório de Genética e Melhoramento Florestal Departamento de Engenharia Florestal, Rua Professora Maria Roza Zanon de Almeida, s/n, Engenheiro Gutierrez Programa de Pós-Graduação em Recursos Florestais Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (Esalq) Universidade de São Paulo (USP), Av. Pádua Dias, 11 Programa de Pós-Graduação em Ciência Florestal Faculdade de Ciências Agronômicas Universidade Estadual Paulista “Júlio de Mesquita Filho” (Unesp), Av. Universitária, 3780, Altos do Paraíso Universidade Estadual Paulista “Júlio de Mesquita Filho” (UNESP) Instituto de Biosciência Departamento de Genética, R. Prof. Dr. Antônio Celso Wagner Zanin, 250, Distrito de Rubião Junior Universidade Estadual Paulista “Júlio de Mesquita Filho”(UNESP) Instituto de Biotecnologia (IBTEC), Alameda das Tecomarias, s/n, Chácara Capão Bonito CAPES: 001 CNPq: 402420/2016-0
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- 2021
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