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Characteristics such as tolerance to pH, temperature, salinity and high aluminum concentration can be verified in rhizobia native to tropical soils. These particularities are relevant to biological nitrogen fixation studies, such as those about Vigna unguiculata L. Walp. (cowpea), which is of great economic importance to family farmers in different parts of Brazil, especially the North and Northeast regions. The objective of this study was to morphologically and physiologically characterize the native bacteria from Cerrado soils in eastern Maranhão, using the cowpea as plant bait. The study was conducted in Caxias (MA) between 2014 and 2015. The isolates were derived from cowpea nodules sampled from three different areas of soil, especially forest composed of babassu and cultivated Manihot esculenta (cassava) and Desmanthus virgatus L. (jureminha). They were morphologically characterized based on their colonies and the following physiological tests: tolerance to high temperatures, acidity, aluminum and high salinity. The isolates showed significant morphological diversity. The physiological tests showed that most of them are resistant to high temperatures, acidity and aluminum toxicity, but only a few are resistant to high salinity. Características como tolerância ao pH, à temperatura, à salinidade e à concentração elevada de alumínio podem ser verificadas em rizóbios nativos oriundos de solos tropicais. Essas particularidades são relevantes em estudos de fixação biológica de nitrogênio, especialmente em Vigna unguiculata L. Walp. (feijão-caupi), uma cultura representativa de suma importância econômica para a agricultura familiar das diferentes regiões brasileiras, especialmente do Norte e Nordeste. Assim, o objetivo deste trabalho foi isolar e caracterizar morfofisiologicamente bactérias nativas de solos do Cerrado leste maranhense, utilizando o feijão-caupi como planta-isca. O estudo foi realizado em Caxias, MA entre os anos de 2014 e 2015. Os isolados foram oriundos de nódulos de feijão-caupi, provenientes de amostras de solos de três áreas diferentes: mata especialmente composta de babaçuais, de cultivos de Manihot esculenta (mandioca) e de Desmanthus virgatus L. (jureminha). Os isolados foram submetidos à caracterização morfológica de suas colônias e a testes fisiológicos como: teste de tolerância às altas temperaturas, à acidez, ao alumínio e às altas salinidades. Os isolados obtidos evidenciaram significativa diversidade morfológica. Os testes fisiológicos demonstraram que a maioria deles é resistente às altas temperaturas, à acidez e ao alumínio tóxico, mas poucos deles são resistentes às altas salinidades.