1. New set of candidate gene SNPs and microsatellites to disentangle selective and neutral processes shaping population responses of European flounder (Platichthys flesus) to anthropogenic stress and contrasted environments
- Author
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Grégory Charrier, Romain Morvezen, Jean Laroche, Alan Le Moan, Bruno Guinand, Nicolas Pédron, José-Luis Zambonino-Infante, Laboratoire des Sciences de l'Environnement Marin (LEMAR) (LEMAR), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Brest (IFREMER Centre de Bretagne), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier (UMR ISEM), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR226-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ANR-10-LABX-0019,LabexMER,LabexMER Marine Excellence Research: a changing ocean(2010), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Brest (UBO)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Brest (IFREMER), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR226-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and ANR-10-LABX-0019/10-LABX-0019,LabexMER,LabexMER Marine Excellence Research: a changing ocean(2010)
- Subjects
0106 biological sciences ,Candidate gene ,Range (biology) ,Platichthys flesus ,Population ,BHMT ,SNP ,Flounder ,Single-nucleotide polymorphism ,01 natural sciences ,03 medical and health sciences ,L-PGDS ,Genetics ,AMPD ,EUROPEAN FLOUNDER ,education ,Ecology, Evolution, Behavior and Systematics ,030304 developmental biology ,European flounder ,P53 ,0303 health sciences ,education.field_of_study ,biology ,GAPDH ,Ecology ,ACL ,010604 marine biology & hydrobiology ,Multiplexes ,biology.organism_classification ,Platichthys ,Microsatellite ,[SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology - Abstract
International audience; Six candidate gene SNP assays and 12 new microsatellites were developed in the European flounder (Platichthys flesus), in order to provide new tools to (1) further investigate signatures of selection suspected on candidate genes, and (2) better depict the neutral evolutionary background shaping the differentiation of populations. All markers were successfully tested in two populations from contrasted estuaries, and should be helpful to better understand the possible adaptive responses of flounder populations to anthropogenic pressures (e.g. global warming, eutrophication, pollutions), over the whole distribution range of the species.
- Published
- 2015
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