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The Warburg effect is one of the hallmarks of cancer cells in humans. It is a true metabolic reprogramming to aerobic glycolysis, allowing cancer cells to meet their particular energy needs for growth, proliferation, and resistance to apoptosis, depending on the microenvironment they encounter within the tumor. We have recently discovered that the Crassostrea gigas oyster can naturally reprogram its metabolism to the Warburg effect. Thus, the oyster becomes a new invertebrate model useful for cancer research. Due to its lifestyle, the oyster C. gigas has special abilities to adapt its metabolism to the extreme changes in the environment in which it is located. The oyster C. gigas is therefore a model of interest to study how the environment can control the Warburg effect under conditions that could not be explored in vertebrate model species.

Although viruses have been associated with mortality outbreaks in different mollusc species, little information is available on their exact affiliation and taxonomic position. Herpes viruses have attracted particular attention because of their economic and ecological impact on both farmed and wild marine molluscs over the past 20 years. Investigations based on molecular approaches have been carried out on the herpes virus infecting Pacific oysters in France. Molecular and ultra-structural data were used to classify the virus under the name ostreid herpesvirus 1 (OsHV-1), as the first known species in the family Malacoherpesviridae. Since 2008, massive mortality outbreaks were reported in several Crassostrea gigas oyster farms in France, Ireland, and the United Kingdom. The outbreaks were attributed to adverse environmental conditions associated with a particular variant of OsHV-1, called OsHV-1 μVar., Bien que des épisodes de mortalité associés à la détection de virus aient été rapportés chez différentes espèces de mollusques, peu d’informations sont aujourd’hui disponibles concernant l’affiliation exacte de ces virus et leur position taxinomique. Parmi les virus infectant les coquillages, les herpèsvirus ont fait l’objet d’une attention particulière du fait de leurs impacts économiques et écologiques sur les animaux en élevage et sauvages. Des recherches par des approches de biologie moléculaire ont été menées en France sur le virus infectant les huîtres creuses, Crassostrea gigas. Sur la base des données moléculaires et ultra-structurales, ce virus a été classé, sous le nom d’ostreid herpesvirus 1 (OsHV-1), comme première espèce virale de la famille Malacoherpesviridae. Depuis 2008, des épisodes de surmortalité ont été rapportés dans différentes régions de production des huîtres creuses C. gigas, en France, en Irlande et au Royaume Uni. Ils ont été attribués à des conditions environnementales défavorables associées à la découverte d’un variant génotypique viral particulier, appelé OsHV-1 μVar., Renault Tristan. Les virus infectant les mollusques marins: un exemple d'actualité, les herpèsvirus. In: Bulletin de l'Académie Vétérinaire de France tome 164 n°4, 2011. pp. 359-364.

The 14th International Conference on Shellfish Restoration (ICSR) comes this year to the United Kingdom for the first time in its 26 years history. The conference will be held at the University of Stirling in the heart of Scotland and its title and theme will be “Shellfish: our undervalued resource”. The theme of the conference, “Shellfish: our undervalued resource”, reflects the UK perception of shellfish as something that is good to eat, often in upmarket restaurants. Shellfish fisheries and aquaculture are indeed a very important part of the UK economy; shellfish reefs however form an ecosystem that provides myriad benefits (“ecosystem services”) many of which have been lost through acute fishing pressures, disease, pollution and other factors. On a global scale, shellfish reefs are considered amongst the most threatened habitats. This conference hopes to change perceptions of the value of shellfish as a resource by bringing scientists from all over the world to discuss how we can learn from experience overseas, particularly in the USA, where there has been considerable investment and community-based efforts to restore and enhance shellfish populations., Cette conférence fait partie d’une série annuelle opérée depuis 26 ans, sous l’égide principalement de chercheurs et aménageurs de la côte Est des USA, sur le thème de la restauration des écosystèmes conchylicoles. Les Etats Unis et en particulier les Etats de la côte est ont en effet subi un effondrement drastique de la production conchylicole (huîtres, clams…), sous l’effet de la surexploitation et de la dégradation de la qualité d’eau (eutrophisation en particulier) : l’emblème de cet effondrement est la baie de Chesapeake, la plus vaste du pays (300 km). Des efforts financiers et humains considérables ont été engagés, au niveau fédéral et local, sans succès patent, ce qui témoigne de la difficulté intrinsèque à restaurer un écosystème dégradé et qui doit alerter sur l’importance d’actions préventives. La conscience des services écosystémiques rendus par ces gisements coquilliers notamment comme supports de biodiversité s’est étendue depuis, certains n’hésitant pas comparer l’enjeu de préservation de ces habitats coquilliers menacés à celui des récifs tropicaux ou même des forêts. C’est dans ce domaine des relations entre coquillages et environnement (clarification de l’eau et dénitrification, couplage entre compartiments pélagique et benthique, support d’habitat et de biodiversité…) que cette conférence fournit le plus d’informations d’intérêt.

In the framework of the French diploma "Habilitation à Diriger des Recherches", Sylvie Lapègue's synthesis of research includes ten years (1998-2007) of work in bivalve genetics, and mainly cupped and flat oysters. This research has been developed in (1) flat oyster population genetics at the European level and cupped oyster populations and species genetics at a global scale, (2) the characterization of a cytogenetic particularity observed in oysters that corresponds to a high rate of aneuploidy in somatic cells, and (3) more recently in the use of molecular markers for the construction or improvement of genetic maps, allowing (4) the identification of areas of the genome related to the resistance to summer mortality in the Pacific oyster and the resistance to the parasite responsible for bonamiosis in the European flat oyster. This research has achieved many scientific advances, some of which can be used in the management of the genetic diversity of natural or cultivated populations, in the genetic improvement through breeding programs, or in a better understanding of the genetic architecture of characters of interest such as resistance to diseases., La synthèse du travail de recherche dans le cadre de l'Habilitation à Diriger des Recherches de Sylvie Lapègue regroupe dix années (1998-2007) de travaux en génétique des mollusques bivalves et principalement des huîtres, creuses et plates. Cette activité de recherche s'est développée autour de (1) la génétique des populations d'huîtres plates au niveau européen et des populations et espèces d'huîtres creuses au niveau mondial, (2) la caractérisation d'une particularité cytogénétique des huîtres qui correspond à un fort taux d'aneuploïdie dans les cellules somatiques, puis (3) plus récemment sur l'utilisation de marqueurs moléculaires pour la construction ou l'amélioration de cartes génétiques, permettant de (4) détecter de zones du génome respectivement liées à la résistance aux mortalités estivales chez l'huître creuse et la résistance au parasite responsable de la bonamiose pour l'huître plate. Ces recherches ont permis de réaliser de nombreuses avancées scientifiques, dont certaines sont utilisables en gestion de la diversité génétique des populations naturelles ou exploitées, en amélioration génétique dans des programmes de sélection, ou encore pour une meilleure compréhension de l'architecture génétique des caractères d'intérêt tels que des résistances à des maladies.

A comprehensive knowledge of Crassostrea gigas oyster reproduction processes is essential to optimize controlled reproduction in hatchery. This study aimed to determine the origin and the mechanisms of annual renewal of germ cells, still unknown in oysters, and the influence of temperature and photoperiod parameters on the regulation of the reproductive cycle. We characterized an orthologue of the vasa gene, the Oyvlg (Oyster vasa-like gene), the first germ cell specific marker isolated in molluscs. This marker was used to study C. gigas germline development. Oyster germ cells appeared specified during early development from mesentoblast 4d, as primordial germ cells (PGCs) determined by maternal cytoplasmic determinants, including Oyvlg mRNA. In adult oysters, the annual renewal of germ cells results from a proliferation of germinal stem cells (GSCs), self-renewing cells, scattered in the conjunctive tissue during the resting period. One-year experimental conditionings were realized to determine temperature and photoperiod parameter effects on oyster gametogenesis. Experimental conditionings consisted in (1) natural temperature and photoperiod conditions corresponding to Marennes-Oléron bay values, (2) accelerated conditions, twice faster than natural cycles and (3) constant wintering conditions adjusted to 8°C and 8 hours day-length. These analyses revealed a high plasticity of C. gigas reproduction since the rhythm of the reproductive cycle was entirely modelled by temperature and photoperiod variations. Decreasing photoperiod may regulate GSCs proliferation while low temperature (8°C-11°C) would enhance gonial mitosis and high temperature would accelerate germ cell maturation. As a result, manipulation of temperature and photoperiod conditions allows effective controlled reproduction all over the year., Le renouvellement annuel de la population de cellules germinales chez l'huître creuse Crassostrea gigas est une étape clé de son cycle de reproduction. La compréhension de ces mécanismes est essentielle à la maîtrise de la reproduction contrôlée de C. gigas, indispensable pour répondre à une demande croissante des ostréiculteurs, de naissain produit en écloserie. Les objectifs de cette étude étaient de déterminer l'origine et les mécanismes de renouvellement annuel des cellules germinales de C. gigas et de comprendre l'infuence des facteurs environnementaux sur ces processus. Le gène Oyster vasa-like gene (Oyvlg), premier marqueur spécifique des cellules germinales découvert chez les bivalves a été caractérisé. Ce gène, exprimé spécifiquement dans les cellules de la lignée germinale, nous a permis de déterminer que les cellules germinales de C. gigas, d'origine mésodermique, étaient différenciées dès le stade embryonnaire sous la forme de cellules germinales primordiales (PGCs). Ces PGCs seraient spécifiées par la localisation de déterminants cytoplasmiques transmis maternellement à l'embryon, dans une structure équivalente à un cytoplasme germinal. Les ARNm Oyvlg seraient l'un de ces déterminants germinaux. Au stade adulte, la population de cellules germinales apparaît renouvelée annuellement par la prolifération, au début du cycle de reproduction, de cellules germinales souches (GSCs), dispersées en petits groupes dans le tissu conjonctif pendant la période de repos sexuel. La différenciation des GSCs en gonies et la multiplication de ces gonies marque le début de la gamétogenèse. Afin de tester l'effet de la température et de la photopériode sur la gamétogenèse, des huîtres adultes ont été conditionnées expérimentalement pendant un an en écloserie, dans trois conditions de température et de photopériode différentes : (1) conditions dites "naturelles" reproduisant les cycles de température et de photopériode moyens enregistrés à Marennes- Oléron, (2) conditions "accélérées", deux fois plus rapides que les cycles naturels, (3) conditions "hivernales" constantes à 8°C et 8 heures de jour. Ces expérimentations ont mis en évidence une grande plasticité physiologique de la reproduction de C. gigas, dont le rythme se synchronise parfaitement sur celui des facteurs température / photopériode. Des photopériodes décroissantes pourraient stimuler la prolifération des cellules germinales souches alors que la température apparaît comme le facteur prédominant dans la régulation des mitoses goniales et de la maturation. Les températures basses (8°C ¿ 11°C) semblent déclencher les mitoses goniales et les températures élevées accélèrent le processus de maturation des cellules germinales. L'utilisation de cycles de température et de photopériode modifiés (accélérés ou hivernaux) permettraient d'obtenir des pontes toute l'année en écloserie, y compris en période automnale généralement considérée comme réfractaire pour le conditionnement.

A comprehensive knowledge of Crassostrea gigas oyster reproduction processes is essential to optimize controlled reproduction in hatchery. This study aimed to determine the origin and the mechanisms of annual renewal of germ cells, still unknown in oysters, and the influence of temperature and photoperiod parameters on the regulation of the reproductive cycle. We characterized an orthologue of the vasa gene, the Oyvlg (Oyster vasa-like gene), the first germ cell specific marker isolated in molluscs. This marker was used to study C. gigas germline development. Oyster germ cells appeared specified during early development from mesentoblast 4d, as primordial germ cells (PGCs) determined by maternal cytoplasmic determinants, including Oyvlg mRNA. In adult oysters, the annual renewal of germ cells results from a proliferation of germinal stem cells (GSCs), self-renewing cells, scattered in the conjunctive tissue during the resting period. One-year experimental conditionings were realized to determine temperature and photoperiod parameter effects on oyster gametogenesis. Experimental conditionings consisted in (1) natural temperature and photoperiod conditions corresponding to Marennes-Oléron bay values, (2) accelerated conditions, twice faster than natural cycles and (3) constant wintering conditions adjusted to 8°C and 8 hours day-length. These analyses revealed a high plasticity of C. gigas reproduction since the rhythm of the reproductive cycle was entirely modelled by temperature and photoperiod variations. Decreasing photoperiod may regulate GSCs proliferation while low temperature (8°C-11°C) would enhance gonial mitosis and high temperature would accelerate germ cell maturation. As a result, manipulation of temperature and photoperiod conditions allows effective controlled reproduction all over the year., Le renouvellement annuel de la population de cellules germinales chez l'huître creuse Crassostrea gigas est une étape clé de son cycle de reproduction. La compréhension de ces mécanismes est essentielle à la maîtrise de la reproduction contrôlée de C. gigas, indispensable pour répondre à une demande croissante des ostréiculteurs, de naissain produit en écloserie. Les objectifs de cette étude étaient de déterminer l'origine et les mécanismes de renouvellement annuel des cellules germinales de C. gigas et de comprendre l'infuence des facteurs environnementaux sur ces processus. Le gène Oyster vasa-like gene (Oyvlg), premier marqueur spécifique des cellules germinales découvert chez les bivalves a été caractérisé. Ce gène, exprimé spécifiquement dans les cellules de la lignée germinale, nous a permis de déterminer que les cellules germinales de C. gigas, d'origine mésodermique, étaient différenciées dès le stade embryonnaire sous la forme de cellules germinales primordiales (PGCs). Ces PGCs seraient spécifiées par la localisation de déterminants cytoplasmiques transmis maternellement à l'embryon, dans une structure équivalente à un cytoplasme germinal. Les ARNm Oyvlg seraient l'un de ces déterminants germinaux. Au stade adulte, la population de cellules germinales apparaît renouvelée annuellement par la prolifération, au début du cycle de reproduction, de cellules germinales souches (GSCs), dispersées en petits groupes dans le tissu conjonctif pendant la période de repos sexuel. La différenciation des GSCs en gonies et la multiplication de ces gonies marque le début de la gamétogenèse. Afin de tester l'effet de la température et de la photopériode sur la gamétogenèse, des huîtres adultes ont été conditionnées expérimentalement pendant un an en écloserie, dans trois conditions de température et de photopériode différentes : (1) conditions dites "naturelles" reproduisant les cycles de température et de photopériode moyens enregistrés à Marennes-Oléron, (2) conditions "accélérées", deux fois plus rapides que les cycles naturels, (3) conditions "hivernales" constantes à 8°C et 8 heures de jour. Ces expérimentations ont mis en évidence une grande plasticité physiologique de la reproduction de C. gigas, dont le rythme se synchronise parfaitement sur celui des facteurs température / photopériode. Des photopériodes décroissantes pourraient stimuler la prolifération des cellules germinales souches alors que la température apparaît comme le facteur prédominant dans la régulation des mitoses goniales et de la maturation. Les températures basses (8°C – 11°C) semblent déclencher les mitoses goniales et les températures élevées accélèrent le processus de maturation des cellules germinales. L'utilisation de cycles de température et de photopériode modifiés (accélérés ou hivernaux) permettraient d'obtenir des pontes toute l'année en écloserie, y compris en période automnale généralement considérée comme réfractaire pour le conditionnement.

Levels of nickel and vanadium, trace metals found in high concentration in the oil spilled from the "Erika" tanker off Brittany (France) in December 1999 (41 +/- 1 and 87 +/- 3 mg kg(-1) respectively), have been monitored over a one-year period following this accidental event in several benthic invertebrates. Ni and V in mussels (Mytilus edulis) and oysters (Crassostrea gigas) soft tissues were analysed twice a month by graphite furnace atomic absorption spectrometry and a scallop (Pecten maximus) shell daily growth bands were sampled every three bands by laser ablation and analysed by ICP-MS for these two contaminants. Survey data for mollusc tissues were compared with reference data arising from the national monitoring database. Ni concentrations in dried tissues, comparable with reference data (1.8 +/- 0.9 mug g(-1) in mussels and 1.2 +/- 0.5 mug g(-1) in oysters) do not show any additional input during the whole period. Conversely, a sharp increase in vanadium concentrations (up to 4.6 and 3.2 mug g(-1d) for mussels and oysters respectively) is observed around May 2000, i.e. 5 months after the wreck, compared with the monitoring data (1.4 +/- 0.6 mug g(-1) in mussels and 1.3 +/- 0.6 mug g(-1) in oysters). Furthermore, no Ni peak is detectable in the time profiles of scallop shell growth bands where a V peak is observed also in May 2000. This study shows that although a "mussel-watch-type" network, based on the monitoring of vanadium concentration in mollusc tissues, is able to identify contamination due to oil spills, similar information might be obtained a posteriori by analysing daily growth bands of scallop shells., Les concentrations en nickel et en vanadium, métaux traces présents en quantité importante dans le fioul échappé du pétrolier "Erika" au large de la Bretagne (France) en décembre 1999 ( et mg kg -1 respectivement) ont fait l'objet d'un suivi d'un an après le naufrage chez quelques invertébrés benthiques. Ni et V ont été analysés deux fois par mois dans les tissus mous de moules (Mytilus edulis) et d'huîtres (Crassostrea gigas) par absorption atomique à four graphite et tous les trois jours dans les stries journalières de croissance des valves d'une coquille Saint-Jacques (Pecten maximus) par ICP-MS après ablation laser. Les données obtenues pour les tissus de mollusques ont été comparées avec les valeurs de références fournies par le programme national de surveillance. Durant toute la période d'étude, on n'observe pas d'apport occasionnel en nickel, dont les concentrations dans la chair séchée sont comparables aux valeurs de référence ( g g -1 chez les moules et g g -1 chez les huîtres). En revanche, une élévation importante des concentrations en vanadium (jusqu'à 4,6 et g g -1 chez les moules et les huîtres respectivement) comparées aux donnés de la surveillance ( g g -1 chez les moules et g g -1 chez les huîtres), est observée en mai 2000, soit 5 mois après le naufrage. De la même manière, aucun pic de nickel n'a été détecté dans les profils temporels de stries journalières de coquille de pectinidé alors qu'un pic de vanadium est observable en mai 2000. Cette étude montre qu'un réseau d'observation de type "mussel-watch" basé sur la surveillance des concentrations en vanadium dans les tissus de mollusques est apte à identifier une contamination due à une marée noire, et une information du même type pourrait être obtenue a posteriori en analysant les stries journalières des valves de coquilles Saint-Jacques

L 'huître creuse japonaise Crassostrea gigas et portugaise C. angulata ont été respectivement décrites par Thunberg (1793) et Lamarck (1819). Mais les similitudes morphologiques et l 'homogénéité des fréquences allozymiques entre populations ont conduit de nombreux auteurs à proposer l'existence d'une seule et mênle espèce. L'analyse récente d'un gène mitochondrial a pennis de déterminer l'origine asiatique de C. angulata, soulignant l'intérêt de l'étude de la différenciation génétique et phénotypique entre les deux taxons. La notion biologique d'espèce a tout d'abord été examinée. Des croisements de 1ère et 2ème génération ont montré la viabilité et fertilité des hybrides. L'analyse de la compétition spennatique par marqueurs microsatellites ne montre pas d'isolement reproductif, mênle partiel et le séquençage du fragment ITS 1 confirme la forte proximité génétique des deux taxons. Les patrons de différenciation génétique observés par marqueurs microsatellites et mitochondriaux apparaissent sitnilaires. L'origine asiatique de C. angulata est donc confinnée. Le fort niveau de polymorphisme des marqueurs microsatellites explique partiellement les plus faibles valeurs observées de différenciation. Une bimodalité des tailles d'allèles microsatellites entre taxons a pennis le développement d'un nouveau marqueur nucléaire, mettant en évidence des phénomènes d'hybridation naturelle dans la zone du sud de l'Europe où l'activité ostréicole met aujourd'hui les 2 taxons en contact. L'étude de caractères phénotypiques a été réalisée en milieu naturel et contrôlé sur des descendances d'écloserie. Les résultats montrent une meilleure croissance de C. gigas et une période de reproduction plus longue chez C. angulata. Des mesures physiologiques montrent un plus fort taux de respiration du naissain C. gigas, ainsi qu'un temps de filtration supérieur chez les adultes. La différence de croissance entre taxons pourraient donc être expliquée par le temps de filtration et l'effort de reproduction.

Heavy metals (Cd, Cu, Hg and Zn) and metallothionein levels were determined in oysters Crassostrea gigas from two sites: the Gironde Estuary (contaminated site) and Bourgneuf Bay (uncontaminated site). Metallothionein levels led us to suspect the presence of cadmium in the environment when quantified in the gills. Soluble cadmium and metallothioneins were positively correlated in the digestive gland of oysters from Gironde (contaminated site), but metallothionein levels in this organ were not significantly different from levels observed in the digestive gland of oysters from Bourgneuf Bay (uncontaminated site). Conversely, no correlation was noticed between metals and metallothioneins in the gills of oysters from Gironde despite metallothionein levels significantly higher than levels observed in oyster gills from Bourgneuf Bay. This significant difference of metallothionein levels is attributed to a higher ratio of soluble metals (Cd, Cu, Zn) in the gills of oysters from Gironde. The generalization of the use of metallothioneins as biomarkers of metal contamination of aquatic environments is questioned., Chez Crassostrea gigas, les teneurs en zinc, cuivre et cadmium dans les huı̂tres de Gironde sont significativement supérieures à celles des huı̂tres de la baie de Bourgneuf. Cadmium soluble et métallothionéines sont corrélés positivement dans la glande digestive des huı̂tres prélevées en Gironde (site contaminé). Pour autant, les teneurs en métallothionéines dans cet organe ne sont pas significativement différentes de celles d'huı̂tres de la baie de Bourgneuf (site de référence). À l'opposé, il n'y a pas de corrélation entre métaux et métallothionéines dans les branchies des huı̂tres de Gironde, mais leurs teneurs en métallothionéines sont significativement supérieures à celles des huı̂tres de la baie de Bourgneuf. L'augmentation significative des teneurs en métallothionéines est liée à une proportion plus importante des métaux (Cd, Cu, Zn) sous forme soluble dans les branchies des huı̂tres de Gironde. Chez l'huı̂tre Crassostrea gigas, les niveaux de métallothionéines dans les branchies permettent de préjuger de la présence de cadmium dans le milieu

L'étude de la taxonomie des huîtres est longtemps restée basée sur des critères morphologiques (forme de la coquille et description des organes) et géographiques. Ces considérations sont relativement peu fiables en particulier au niveau interspécifique du fait de la plasticité des caractères morphologiques d'une part de des introductions d'espèces étrangères sur les lieux de culture d'autre part. La biologie moléculaire est donc, depuis quelques années, un outil très utilisé pour différencier les espèces d'huîtres. La phylogéographie des huîtres de la région sud-atlantique a ainsi pu être étudiée grâce à différentes méthodes de recherche du polymorphisme réalisées sur le fragment mitochondrial 16S. La PCR-RFLP, la SSCP et le séquençage ont été utilisés pour déterminer les haplotypes de 9 populations d'huîtres creuses du genre Crassostrea provenant du Sénégal, de Guyane, de Martinique et du Brésil. Ceci a permis par extension à d'autres espèces d'apporter des informations complémentaires à la phylogénie de ce genre. Les résultats obtenus par ces 3 méthodes ont permis de montrer que ces 9 populations se différencient en 2 haplotypes : un africain correspondant à l'espèce Crassostrea gasar et un martiniquais correspondant à l'espèce Crassostrea rhizophorae. De plus,C. gasar, huître caractéristique des côtes africaines, est présente dans 2 sites d'Amérique du sud, ont un en sympatrie avec C. rhizophorae au Brésil, ce qui n'a jamais été décrit jusqu'à présent. L'étude d'un point de vue génétique de cette espèce ainsi que la détermination de sa position phylogénétique, sont également une nouveauté. La sympatrie observée au Brésil permet de s'interroger sur l'existence d'une interfécondité possible et d'un flux de gènes entre les 2 espèces. Des études complémentaires à partir d'un échantillonnage plus vaste réalisé sur toute la côte atlantique sud-américaine permettront de confirmer ces résultats. Par ailleurs, la construction d'un arbre phylogénétique à partir des séquences obtenues dans cette étude et de séquences d'autres espèces du même genre, a permis de préciser les positions de ces espèces les unes par rapport aux autres. Ainsi, C. gasar a une position intermédiaire entre les groupes gigas-angulata et virginica-rhizophorae.

L'objectif scientifique de l'Unité de Recherche Marine n0 16 est de partager les savoir faire conceptuels et méthodologiques des deux équipes, pour faire aboutir des programmes appliqués ou fondamentaux dans le domaine de la génétique des organismes marins. Ces programmes concernent plus particulièrement le développement et l'utilisation des marqueurs génétiques fournis par les techniques de biologie moléculaire dans les programmes suivants: Chez les huîtres des genres Ostrea et Crassostrea : Le modèle prioritaire de l'URM sera les huîtres Crassostrea et Ostrea. Pour des raisons historiques, les recherches sur Ostrea sont plus avancées et donneront des résultats plus rapidement. 1-Sélection assistée par marqueurs chez Ostrea edulis et Crassostrea gigas 1.1. Recherche de marqueurs liés à la résistance à la bonamiose chez Ostrea edulis. 1.2. Recherche de locus à caractère quantitatif (QTL) sur les principaux caractères physiologiques chez Crassostrea gigas et Ostrea eclulis. 1.3. A terme contribution à l'obtention de cartes génétiques chez Crassastrea gigas et Ostrea eclulis. 2-Caractérisation et gestion des ressources génétiques naturelles : 2.1. Etablissement et contrôle génétique d'un conservatoire de souches dans le genre Crassostrea dans le but du maintien et de l'utilisation de la biodiversité. 2.2. Identification génétique et contrôle des stocks chez Ostrea edulis et Crassostrea gigas. 3-Déterminisme génétique du recrutement: 3.1. Relation hétérozygotie-croissance. 3.2.Génétique en phase larvaire: analyse des paramètres génétiques impliqués dans la croissance et la survie à ce stade. II-Autres espèces : Des collaborations sont envisagées avec des laboratoires d'IFREMER impliqués dans des programmes similaires. Cela pourra se faire par des moyens annexes comme l'accueil de stagiaires ou de doctorants. La présente structure pourrait également servir de centre d'accueil pour d'autres équipes françaises (Université ou autres organismes) désireuses de développer des recherches dans ce domaine. Des propositions seront faites aux différentes instances concernées (CNRS, ORSTOM, Universités) pour la mise sur pied éventuelle d'un centre de formation en génétique des espèces marines. L'URM 16 aura ainsi vocation à aborder chez les poissons des problèmes analogues à ceux cités précédemment, par exemple chez le loup Dicentrarchus labrax. Une collaboration entre le GPI et l'ifremer-Palavas est déjà en cours sur cette espèce: elle a donné lieu à l'identification de marqueurs microsatellites (8). Ces marqueurs ont étédéveloppés pour deux raisons principales qui correspondent aux objectifs affichés par l'URM : 1-Utilisation dans des tests de patemité, génotypage des géniteurs. 2-Evaluation de la biodiversité dans l'espèce D. labrax et identification génétique des stocks de ce poisson dans le Bassin Méditerranéen. 3- Aide à la sélection. L'URM 16 aura également vocation à travailler sur d'autres espèces cultivées comme les crevettes du genre Penaeus. Une collaboration entre le GPI et le Ifremer-Tahiti est en effet en cours sur l'identification de marqueurs microsatellites, initiée dans le cadre de l'appel d'offres Biotechnologie 93 de l'ifremer. Les premiers microsatellites ont, là aussi, été identifiés. Cette démarche a été amorcée dans un but de : 1-Génotypage des géniteurs, 2-0util de simplification des procédures d'expérimentation (possibilité de mélange de différents lots avec assurance de pouvoir les départager par la suite), 3-Evaluation du polymorphisme des populations d'élevage, 4-Aide à la sélection.

En France, ainsi que dans de nombreux autres pays, l'histoire de l'ostréiculture est émaillée d'une succession de phases de développement, de surexploitation et d'apparition de maladies qui perturbent lourdement la profession. Depuis la disparition massive de l'huître portugaise, Crassostrea angulata, victime entre 1969 et 1971 d'une épidémie virale et l'effondrement de l'élevage de l'huître plate Ostrea edulis dû à deux parasitoses, la marteiliose et la bonamiose, l'ostréiculture française connaît actuellement une situation de monoculture de l'huître creuse japonaise Crassostrea gigas, suite à l'introduction de l'espèce entre 1971 et 1975 (Grizel & al. 1991). Pour tenter de remédier à cette situation de monoculture, qui reste une des inquiétudes majeures des professionnels, la région Poitou-Charentes a apporté une aide financière pour la création d'un "conservatoire de souches", implanté dans les locaux du Laboratoire Génétique, Aquaculture et Pathologie de La Tremblade. Les principaux objectifs sont d'étudier les possibilités d'acclimatation des huîtres étrangères dans les eaux françaises afin de diversifier la production ou de préparer une éventuelle substitution à C. gigas en cas d'épizootie majeure, de développer des hybrides intra et inter-spécifiques au sein du genre Crassostrea (performants en ce qui concerne la résistance aux maladies parasitaires, la croissance et la fertilité) et enfin d'effectuer une étude de la différenciation génétique (intra et inter spécifique).

Les objectifs pour l'année 1996 étaient les suivants: Poursuivre les premières reproductions des espèces pour lesquelles nous disposons de géniteurs GO. L'objectif est toujours de limiter le stockage d'animaux importés en produisant une descendance simultanément à des témoins C. gigas qui serviront de comparaison. Tenter des hybridations inter-spécifiques des différents taxons présents au sein du conservatoire en fonction des connaissances disponibles dans la littérature sur ce sujet (voir pour revue Gaffney et Allen, 1993). • Importer de nouvelles souches ou espèces. Élargir la gamme des espèces présentes au sein du conservatoire de souches (les capacités d'accueil de la salle de quarantaine étant Limitée).

This ecophysiological study was conducted on the Japanese oyster (Crassostrea gigas) reared in Marennes-Oléron bay (France), in May 1992. Measurements were achieved using natural food conditions on three different days (a, b, c) at different tide levels (coefficient of 49, 57, and 88). Total particulate matter was continuously monitored with a micro-computer and a turbidimeter probe. The "consumption" function was calculated using a new formula allowing for particulate leakage prior to the pre-ingestive particle sorting. This particle leakage represents a passive loss of particles flowing through the branchial filter. Comparisons of the consumption and absorption rates of organic matter and chlorophyll a showed significant differences between seston availabilities of 55 mg.1-l (e) and less than 30 mg.1-' seston load (a, b). Comparisons of the selection efficiency and absorption rate of the chlorophyll a, (43.3 and 81.6%), respectively, and total organic matter (33.4 and 68.7%), respectively, demonstrated the oysters' capacity to sort out organic matter. The energy budget was calculated using chlorophyll a and total organic matter. The estimated scope for growth of 0.88-11.60 and 47.60 J.h-'.g-' for the conditions 13.5-28.9 and 54.6 rng.1-l seston load respectively (a, b, c), illustrated the large daily variability in available energy allocated to organic production in the wild. These results were consistent with the growth data of cultured oysters in Marennes-Oléron bay., Cette étude d'écophysiologie a été réalisée sur l'huître japonaise (Crassostrea gigas) cultivée en baie de Marennes-Oléron (France) en mai 1992. Les mesures sont effectuées dans des conditions alimentaires naturelles au cours de trois cycles de mesure (a, b, c) à des coefficients de marée de 49.57 et 88. La matière particulaire totale est mesurée en continu durant les cycles de marée. La fonction de consommation est calculée selon une nouvelle formulation prenant en compte un « échappement particulaire » précédant le tri pré-ingestif et représentant une perte passive de particules de petites tailles entraînées par la masse d'eau à travers le filtre branchial. La comparaison des fonctions de consommation et d'absorption de la matière organique totale et de la chlorophylle a, montre des différences significativement supérieures pour la charge particulaire de 55 mg.1-l (c) comparée aux autres conditions (a, b) de charges particulaires inférieures à 30 mg.] '. La comparaison des coefficients de sélectivité et des taux d'absorption de la chlorophylle a, (43,3 et 81,6%), respectivement, supérieurs à ceux de la matière organique totale (33,4 et 68,7%), respectivement, montre le tri de la matière organique effectué par l'huître. Le bilan énergétique calculé prend en compte le matériel d'origine phytoplanctonique et le matériel organique total. Ides potentiels de croissance ainsi obtenus de 0,88-11,60 et 47.60 J.h-'.g-' respectivement pour les conditions à 13,5-28.9 et 54,6 mg.1-' de charge particulaire totale, traduisent une forte variabilité journalière d'énergie disponible pour la production organique dans le milieu naturel. Ces résultats sont cohérents avec les résultats de croissance d'huîtres en élevage dans la baie de Marennes-Oléron

The germicide properties of ultra-violet radiation in a wave length ranging from 100 to 400 mm were already discovered back in the late 19th century. These properties specific to UV-C radiation (200-280 mm) result from its action on the nucleic acids of the micro-organisms. Each micro-organism, depending on its composition, therefore presents a specific sensitivity to this radiation.

European regulations (Directive EEC/15.07.91) provide that marketing of live bivalve molluscs intended for human consumption must comply with strict bacteriological criteria. In order to comply with these requirements along the Nord/Pas de Calais coast and to preserve shellfish culture activities, a transfer through a depuration plant is the only solution at the present time. IFREMER, with the support of the Nord/Pas-de-Calais regional authorities, conducted an initial study on the use of UV for mussel depuration and on the design of a shellfish depuration plant. This study was used as a basis by TECHMAR Company to design a project for a modular type plant, under contract from the Nord/Pas-de-Calais Region. The basic module consists of two ponds with a daily depuration capacity of 1,900 kg of shellfish (maximum 3,800 kg in 48 hours). The necessary infrastructures include a pumping station, buffer and reserve tanks, facilities for filtration, sterilization and oxygenation (and temperature control if needed), a treatment building and auxiliary buildings. Capital investment for a standard module which can be integrated into an existing building is estimated at 450 KF. For a complete plant (building + equipment) capable of treating 2,000 tons of shellfish annually, the estimated budget is approximately 3,900 KF, to which should be added the cost of the pumping station as well as the layout and integration into the site selected for construction. Figures from the operating budget forecast indicate a treatment cost of approximately 63 centimes per kilogram, for a total of 2,000 tons treated annually. A first plant of this type should be installed in Wimereux in 1992. The financial package for this operation is nearly complete. The planned facilities include a shipping center located on the shellfish growing site and designed to house a dozen shipping companies.

The temporary bad bacteriological results in some shellfish harvesting areas in Brittany (France) lead us to recommand the use of insubmersible aerate tanks in shellfish plant. The shellfish depuration kinetics are as good as those noted in purification plants using chemically or physically purificated water. The generalisation of this technic to a regional scale corroborates its efficiency and allows us to fix good practice rules. The observance of these rules must lead shellfish-grower to sell, permanently, bacteriologically proper products.

Des infections virales ont été décrites chez les huîtres portugaises Crassostrea angulata des côtes françaises successivement affectées par la maladie des branchies et par la mortalité massive de 19670. Ultérieurement, un nouveau virus a été trouvé chez Crassostrea gigas durant des mortalités dans la Baie d'Arcachon. Les virus impliqués ont des caractéristiques similaires pour ce qui concerne la taille, la morphologie, l'ultrastructure et la morphogénèse intracytoplasmique. Dans le cas des virus de mortalité, les cellules infectées du tissu interstitiel renferment une inclusion cytoplasmique et des granulations basophiles correspondant à un stroma virogène et à des particules. Les vibrions matures de structure icosaèdre mesurent 380 nm. Ils sont limités par un système de deux membranes et possèdent une zone centrale dense de 190 nm. Pour les virus de la maladie des branchies, les cellules infectées au niveau de l'épithélium branchial, sont hypertrophiées et contiennent des particules de 380 nm associées à des masses de matériel dense où la présence d'ADN a été mise en évidence par les techniques histochimiques. Ces virus et le virus récemment découvert chez des larves de C. gigas peuvent être rapprochés du groupe des iridovirus.