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Contractualisation Ifremer/Office de l'eau Réunion. Synthèse collective des travaux menés dans le cadre des Groupes de travail DCE de La Réunion réunissant des experts de l'Université de La Réunion (Lab. ECOMAR), de l'IRD de La Réunion, de l'ARVAM, de PARETO, du GIP RNMR et de la DEAL Réunion sous la coordination de la Délégation Ifremer océan Indien. Comment citer ce document : GT DCE Réunion "Physico-Chimie & Phytoplancton". 2015. Fascicule technique pour la mise en œuvre du suivi " Physico-Chimie & Phytoplancton" du réseau de contrôle de surveillance DCE à La Réunion : Réseau Hydrologique du Littoral Réunionnais.Convention Ifremer/Office de l'Eau Réunion n° 14/1211501/F. http://archimer.ifremer.fr/doc/00168/27915/; International audience; De 2010 à 2012, le projet " Bon Etat : Actualisation de l’état des lieux du SDAGE, volet eaux côtières réunionnaises " (DEAL de La Réunion/Ifremer) a permis la mise en place de 4 groupes de travail DCE experts dont les travaux ont été synthétisés à travers 4 fascicules techniques définissant les conditions de mise en œuvre des différents suivis du réseau de contrôle de la surveillance (RCS) DCE en milieu marin à la Réunion. Une première version du fascicule "Physico-chimie & phytoplancton", a été produite en 2012 et validée au niveau national par les référents DCE (Coordination "phytoplancton", Coordination "hydrologie", Coordination nationale DCE milieu Marin, responsable projet Quadrige). Une mise à jour a été proposée en 2015 (Office de l'eau Réunion/Ifremer) dans la double perspective des recommandations du GT DCE de la Réunion et des nouvelles campagnes de suivi du "Réseau Hydrologique du Littoral Réunionnais - RHLR". Ce fascicule a vocation à constituer le support technique des méthodes et des référentiels pour la réalisation du suivi "RHLR" du RCS DCE à La Réunion. Il précise les protocoles de prélèvement, d’analyse, de bancarisation, de synthèse et de diffusion des données. Il présente également les indicateurs associés aux différents éléments de qualité, adaptés à La Réunion.

This thesis is a comprehensive work aiming to improve scientific knowledge on the green turtle (Chelonia mydas) in order to provide key scientific evidences needed for the implementation of coherent and effective management measures to protect at the Western Indian Ocean scale this threatened species. In a first step, this work aimed to established baseline data on the abundance of green turtles nesting females and long term trends of some key nesting populations of the region by applying different modelling methods. In a second step, this work determined the regional genetic structure of this species and the relationships that exists between the different populations. Finally, the conservation of marine turtles being closely dependant to external pressures, this work tried to characterize theanthropogenic pressures they face, more specifically those related to fishing activities. All these results allowed unraveling some key gaps on the biology and ecology of the green turtle in the region and led to a global vision of the conservation status of this species in the Western Indian Ocean. The compilation of the results enabled the identification of regional priority areas for protection, but also some more specific threatened sites such as Europa. Finally, this synthesis shedslight on research priorities and scientific approaches to be promote in the future to unlock other keyscientific issues and refine conservation priorities, not only of marine turtles, but also of marine megafauna as a whole., Ce travail de thèse s'insère dans une démarche globale d'acquisition des connaissances sur la tortue verte (Chelonia mydas) dans l'océan Indien occidental et ce afin de disposer d'éléments scientifiques essentiels à la mise en place d'une gestion cohérente et efficace de cette espèce menacée. Dans un premier temps, appliquant différentes modèles statistiques, ce travail a visé à établir des données de référence sur l'abondance des tortues vertes femelles en reproduction et les tendances sur le long terme des principales populations. Dans un second temps, il a consisté à déterminer la structure génétique et les relations qui existent entre les différentes populations de cette espèce. Enfin, la conservation des tortues marines étant étroitement liée aux pressions extérieures, ce travail a tenté dans un troisième temps de caractériser les pressions anthropiques qu'elles subissent, et notamment celles liées à la pêche. L'ensemble de ces résultats a permis de réaliser des avancées majeures dans la connaissance de la biologie et de l'écologie de la tortue verte et de disposer d'une vision régionale fiable de l'état de conservation de cette espèce dans l'océan Indien occidental. Leur compilation a ainsi permis d'identifier des zones régionales prioritaires de protection mais aussi des sites de vigilance plus spécifiques comme celui d'Europa. Enfin cette synthèse met en lumière les priorités de recherche et les approches scientifiques à favoriser à l'avenir pour améliorer les connaissances et affiner les priorités de conservation non seulement des tortues marines, mais aussi de la mégafaune marine en général.

Contractualisation Ifremer/Office de l'eau Réunion. Synthèse collective des travaux menés dans le cadre des Groupes de travail DCE de La Réunion réunissant des experts de l'Université de La Réunion (Lab. ECOMAR), de l'IRD de La Réunion, de l'ARVAM, de PARETO, du GIP RNMR et de la DEAL Réunion sous la coordination de la Délégation Ifremer océan Indien. Comment citer ce document : GT DCE Réunion "Benthos de Substrat Durs". 2014. Fascicule technique pour la mise en oeuvre du suivi "Benthos de Substrats Durs " du réseau de contrôle de surveillance DCE à La Réunion.Convention Ifremer/Office de l'Eau Réunion n° 14/1211501/F; De 2010 à 2012, le projet " Bon Etat : Actualisation de l’état des lieux du SDAGE, volet eaux côtières réunionnaises " (DEAL de La Réunion/Ifremer) a permis la mise en place de 4 groupes de travail DCE experts dont les travaux ont été synthétisés à travers 4 fascicules techniques définissant les conditions de mise en œuvre des différents suivis du réseau de contrôle de la surveillance (RCS) DCE en milieu marin à la Réunion. Une première version du fascicule "Benthos de substrats durs", a été produite en 2012 et validée au niveau national par les référents DCE (Cellule REBENT de l'Ifremer, Coordination nationale DCE milieu Marin, responsable projet Quadrige). Une mise à jour a été proposée en 2014 (Office de l'eau Réunion/Ifremer) dans la double perspective des recommandations nationales (GT MNHN/ONEMA) et de la programmation en 2015 de la première campagne de suivi "benthos de substrats durs" à La Réunion. Ce fascicule a vocation à constituer le support technique des méthodes et des référentiels pour la réalisation du suivi "benthos de substrats durs" du RCS DCE à La Réunion. Il précise les protocoles de prélèvement, d’analyse, de bancarisation, de synthèse et de diffusion des données. Il présente l’indicateur proposé à La Réunion pour les pentes externes des zones récifales, indicateur basé sur l'étude des données historiques, la connaissance des récifs réunionnais et approuvé par les experts locaux.

Les crustacés décapodes et stomatopodes sont inventoriés pour la première fois de l’île de Juan de Nova. Au total 111 espèces sont reconnues, 69 crabes, 28 anomoures, 10 crevettes, 3 stomatopodes et 1 langouste. Cette liste est disponible sur Internet, avec des photographies, dans la base IRENav/CRUSTA (http://crustiesfroverseas.free.fr/search_result.php?refregion=Juan de Nova). Le bilan de cet inventaire est plus modeste que ceux effectués précédemment pendant les campagnes BIORECIE, à Europa en 2011 (175 espèces) et aux Glorieuses en 2012 (157 espèces). Plus qu’à une plus faible biodiversité, ce résultat est attribué aux difficultés d’échantillonnage à Juan de Nova, avec un platier difficile d’accès, très étendu (2-3 km) et découvrant par ailleurs peu aux moments des basses mer de cette campagne. La faune terrestre est un peu plus riche qu’à Europa, avec la présence du crabe de cocotier Birgus latro et du crabe Geograpsus grayi, mais un peu plus pauvre qu’aux Glorieuses qui compte deux espèces supplémentaires (Coenobita brevimanus et Discoplax rotunda). Une tentative de distribution des espèces par habitats est proposée en adoptant une cartographie simplifiée : milieu terrestre, supra et intertidal, platier sableux, platier corallien, front récifal et récif externe. Les inventaires pour les îles Eparses sont également comparés à celui réalisé pour les Comores, essentiellement Mayotte (483 espèces), zone mieux échantillonnée et beaucoup plus riche car disposant de biotopes plus étendus et plus variés. La faune des îles Eparses est typiquement indo-ouest pacifique dans sa composition avec cependant un petit groupe d’espèces qui ne sont connues que de l’ouest de l’océan Indien. Trois espèces ne sont toujours connues que de îles Eparses : Pagurixus annulus et P. europa Komai & Poupin (2013) et Thalamita pseudospinifera Crosnier (1975) Une forme a été identifiée comme cryptique, correspondant vraisemblablement à une nouvelle espèce (Calcinus aff. pulcher).

International audience; Species composition and structure of marin fisj communities of Mayoote Island (South-western Indian Ocean). The first checklist of Mayotte marin fish species was conducted mostly from unpublished data. A total of 759 species belonging to 118 families and 360 genera was recorded. Regarding the species composition, and especially the relative diversity of the principal families, high similarities with other areas of the southwestern Indian Ocean region were observed. However, Mayotte communities stand out for their high diversity in several major families (Carangidae, Serranidae, Mullidae) and their high percentage of high trophic level species. This feature indicates ecosystems with complex biomass structures and high capacities of resistance against various pressures.The geographical location of Mayotte, in the centre of the western Indian Ocean “Coral Triangle”, characterized by general currents favouring larval dispersal and inter-reef connectivity, its geological history and the stage of development of its reef structures are factors explaining this high biodiversity. Fish communities closely related to particular habitats, including non-reef habitats and deep water environments, being largely unknown this first work highlights the need to strengthen the prospecting effort to apprehend this exceptional biodiversity as a whole and thus promote an appropriate conservation policy.; Ce premier inventaire des poissons marins de l’île de Mayotte a été réalisé en majorité à partir d’informations issues de données non publiées. Un total de 759 espèces appartenant à 118 familles et 360 genres a été recensé. De grandes similarités avec d’autres zones de la région sud-ouest de l’océan Indien sont observées dans la composition des peuplements, notamment dans la diversité relative des principales familles. Les peuplements de l’île se démarquent toutefois par une diversité supérieure de certaines familles (Carangidae, Serranidae, Mullidae) ainsi que par une forte proportion d’espèces de haut niveau trophique, caractéristiques qui témoignent d’un écosystème fortement structuré présentant de bonnes capacités de résistance face aux pressions diverses. Une comparaison de la richesse spécifique théorique du peuplement ichtyologique de l'île avec les données régionales indique, par ailleurs, que le peuplement présent à Mayotte serait l'un des plus diversifiés de la zone. La localisation géographique de Mayotte, au centre du “triangle de corail” de l’océan Indien occidental où la courantologie régionale favorise le transport de larves et la connectivité inter-récifale, l’ancienneté géologique de l’île et le degré de développement des constructions récifales sont autant de facteurs expliquant cette forte diversité. Les communautés ichtyologiques inféodées à certains habitats, notamment les habitats non récifaux et les milieux profonds, étant en outre encore largement méconnues, ce premier travail met en évidence la nécessité de renforcer l'effort de prospection afin d'appréhender cette biodiversité exceptionnelle dans sa globalité et ainsi promouvoir une politique de conservation adaptée.

International audience; First record of Pseudanthias bicolor (Serranidea) from different artificial habitats at Reunion Island.Despite the large number of studies on fish populations of coral reef areas of Reunion island during the past forty years, the bicolor anthias Pseudanthias bicolor (Randall, 1979), previously recorded from Mauritius and the Maldives in the Indian Ocean, was never observed on the coral reefs of the island. Recently, two specimens of were photographed on different artificial habitats during scientific monitoring programs in scuba diving. This study, based en morphologic and morphometric evidences, validates the identification of these specimens as P. bicolor, and therefore represents the westernmost record of the species in the Indian Ocean. In a general context of degradation of coral reef habitats and considering the difficult access to certain non-reef habitats (e.g. depth, large surface area, distance from a port), the example of P. bicolor presented in this study illustrates the importance of artificial habitats for the observation of marine fish diversity. These small habitats of substitution, often monitored according to European regulations, allow occasional identification of new fish species, monitoring of exotic invasive populations or observation of rare species.; Malgré le nombre élevé d’études réalisées sur les peuplements ichtyologiques des zones récifales de l’île de la Réunion au cours des quarante dernières années, l’anthias bicolore Pseudanthias bicolor (Randall, 1979), précédemment recensé à Maurice et aux Maldives dans l’océan Indien, n’a jamais été observé sur les récifs coralliens de l’île. Deux spécimens de cette espèce ont été photographiés récemment sur des habitats artificiels lors de suivis scientfiques en plongée sous-marine. La présente étude, fondée sur des données morphologiques et morphométiques, valide l'identification de ces spécimens comme P. bicolor et constitue ainsi le signalement le plus occidental de l’espèce dans l’océan Indien. Dans un contexte général de dégradation des habitats récifaux et d'accès difficile à certains habitats naturel non-récifaux (e.g. profondeur, surface importantes, éloignement d’un port), l’exemple de P. bicolor présenté dans cette étude illustre l’intérêt des habitats artificiels comme observatoires de la diversité ichtyologique marine. Ces habitats de substitution aux petites surfaces d'emprise, souvent suivis scientifiquement selon la réglementation européenne en vigueur, permettent le signalement occasionnel de nouvelles espèces de poissons, le suivi de populations exotiques en extension ou l’observation d’espèces rares.

The aim of this thesis was to study the feeding habits of coastal fish species of commercial interest andto use stable isotopes of carbon (δ13C) and nitrogen (δ15N) to investigate the trophic niches of fish and their use of coastal habitats in the south-west Indian Ocean. In the Bay of La Possession, the species among the most abundant around the artificial reefs immersed in 2003 (Luljanus kasmira, Priacanthus hamrur and Selar crumenophthalmus) feed essentially on pelagic prey and partition their trophic niche to limit interspecific competition. There was also a positive correlation between fish size and muscle δ15N values due to fish larvae contributing more to the diet of fish with age. The stable isotopie composition of the particulate organic matter (POM) was measured at the microscale (< 10 km) in the Bay of La Possession, the mesoscale (10's of km) around Reunion Island and, for the fish muscles, at the macroscale 100’s of km) along the Mascarene plateau and the Mozambique channel. At microscale, POM δ15N values do not show any spatial variability; at mesoscale, POM is 15N-enriched in the south-west of Reunion Island; at macroscale, fish muscles are gradually 15N-enriched towards the north. At microscale, POM shows a 13C-enrichment on the shallowest station; at mesoscale, stations on the east coast of the island are 13C-enriched compared to the west; at macroscale, POMδ13C values are not significantly correlated with latitude. Thus, the stable isotopes of carbon do not seem to be appropriate for the study of fish coastal habitat use at the meso- and macroscale, and the stable isotopes of nitrogen represent a better indicator of fish habitat use at the macroscale., L'objectif de cette thèse est l'étude du régime alimentaire de poissons côtiers commerciaux et la compréhension de l'utilité des isotopes stables du carbone (δ13C) et de l'azote (δ15N) dans l'étude des niches trophiques et de l'occupation des habitats côtiers par les poissons dans le sud-ouest de l'océan Indien. Dans la Baie de La Possession, les espèces représentatives des récifs artificiels immergés en 2003 (Luljanus kasmira, Priacanthus hamrur et Selar crumenophthalmus) ingèrent surtout des proies pélagiques et partitionnent leurs niches trophiques afin de limiter la compétition. Les valeurs de δ15N sont positivement corrélées avec la taille des poissons, traduisant une contribution croissante des larves de poissons au régime alimentaire. Les isotopes stables de la matière organique particulaire (MOP) ont été analysés à microéchelle (< 10 km) dans la Baie de La Possession, à mésoéchelle (10aines de km) autour de La Réunion et, pour les muscles de poissons à macroéchelle (l00aines de km) le long,du plateau .des Mascareignes.et du cana1 du Mozambique. À microéchelle, le δ15N de la MOP ne varie pas; à mésoechelle, Il existe un enrichissement significatif en 15N dans le sud-ouest de l'île; à macroéchelle, les muscles des poissons s'enrichissent progressivement en 15N vers le nord. À microéchelle, la MOP est enrichie en 13C à faible profondeur; à mésoéchelle, les stations de l'est sont enrichies en 13C ; à macroéchelle, aucune tendance n'est observée. Ainsi, l'utilité des isotopes stables du carbone pour l'étude de l'utilisation des habitats côtiers est limitée à méso- et macroéchelle et les isotopes stables de l'azote constituent un outil plus pertinent à macroéchelle

Rapport UR/MNHN/AR/APMR

Rapport de recherche sur Réseau d'Observation des impacts du changement climatique sur les récifs coralliens de la Réserve Naturelle Marine de la Réunion et modélisation prédictive des Trajectoires (OT-RUN Mer)

Les crustacés décapodes récoltés dans la zone marine située au pied du volcan du Piton de la Fournaise à La Réunion, entre 0-800 m, sont étudiés à partir de récoltes faites en plongées (0-80 m) ou aux casiers (300-800 m). Au total 69 espèces sont reconnues. Dix huit de ces espèces sont signalées pour la première fois à La Réunion, dont 12 déterminées avec certitude : Anapagrides reesei, Carupella natalensis, Coralliocryptus caementa, Dardanus pedunculatus, Lophozozymus pulchellus, Lybia plumosa, Neoliomera sabaea, Nucia speciosa, Oreotlos pala, Petrolisthes tomentosus, Pilodius spinipes, Pylopaguropsis lewinsohni. Cette collection représente 11 % des espèces connues de La Réunion. La composition faunistique dans cette zone marine est similaire à celle de la côte ouest de l'île de La Réunion.

Phelsuma grandis Gray, 1870 est un gecko introduit sur l'île de La Réunion. Le régime alimentaire de ce reptile, considéré comme invasif, a été étudié afin d'évaluer la menace qu'il pourrait représenter pour la faune indigène. Le contenu stomacal de 171 individus a été analysé. À La Réunion, P. grandis se nourrit principalement d'Arthropodes. Les ressources végétales occupent également une part non négligeable de son alimentation et il consomme régulièrement d'autres espèces de geckos. P. grandis manifeste un comportement alimentaire de type opportuniste, à large spectre de proies. Ces résultats indiquent que P. grandis pourrait avoir des incidences négatives importantes sur la faune locale, notamment sur l'entomofaune et l'herpétofaune par prédation ou par compétition. Phelsuma grandis Gray, 1870 is an introduced invasive gecko at Reunion Island. The aim of the present study was to assess its diet in order to evaluate the threat it could represent for native fauna. Stomach contents of 171 individuals were analyzed. At Reunion Island, P. grandis feeds mostly on arthropods and, to a lesser extent, plant materials. P. grandis feeds also, and regularly, on other gecko species. P. grandis shows an opportunistic feeding behavior with a broad spectrum of prey. These outcomes indicate that P. grandis may have significant negative impacts on the local wildlife, including entomofauna and herpetofauna, through predation or competition.

Rapport sur Les herbiers du sud-ouest de l'océan Indien : espaces-ressources de biodiversité, programme HILOI, rapport FRB

Rapport sur les infrastructures de transport, urbanisation et environnement : construction d'une approche intégrée de l'aménagement du Territoire à La Réunion. Rapport Université de La Réunion pour Conseil Régional de La Réunion

Rapport sur Le blanchissement des coraux à la Réunion en 2009. Rapport ARVAM/PARETO/Université de la Réunion/MNHN pour le compte du GIP Réserve naturelle marine de la Réunion

Rapport sur la caractérisation de l'état de référence biologique des masses d'eau côtières (de La Réunion) au regard de la Directive Cadre sur l'Eau. Rapport Ifremer/ARVAM/ECOMAR /Pareto pour DEAL de La Réunion

Oral presentation about Les Iles Eparses, observatoire de la biodiversité dans l'océan Indien tropical

Oral presentation about Seagrass beds hydroid diversity in SWIO islands exposed to contrasted anthropogenic pressures

International audience

Oral presentation about Conservation et Services écosystémiques des Oiseaux Marins de l'Océan Indien Occidental tropical

Marine ecosystems are made vulnerable by climate change but also by overexploitation of certain species like the forage fish which are food for a large proportion of the marine predators, from large fish to marine mammals and birds. IRD scientists and their research partners from the South have recently made major scientific advances concerning the relations between the different components of the marine ecosystems. The results, obtained from ecological field data and models, provide the support for promoting ecosystem-based fisheries management.

Poster; Poster about Application des isotopes stables à l'étude de réseaux trophiques associés à des récifs artificiels

Reproduction of sea turtles primarily relies on body reserves stored during the time spent on foraging grounds prior to the nesting season. Accordingly, the investigation of foraging behaviour of sea turtles is critical for better assessing their biology but also for conservation issues of these endangered species. Sea turtles contribute significantly to the consuming biomass of their ecosystem and hence to its functioning, thus providing natural indications of the health of the ecosystem. Yet the trophic ecology of sea turtles is poorly documented because their feeding grounds remain poorly known and for most of them hardly accessible. Among sea turtles the green turtle is the only species where sub-adults and adults are mostly herbivorous feeding on seagrass and algae patches in shallow coastal waters. Such fairly accessible marine ecosystems provide a unique opportunity to investigate sea turtle ecology under natural conditions. The study was conducted in two foraging sites of green turtles located in the south-western Indian Ocean: Mayotte (seagrass meadow) and Reunion Island (algae spots). Thanks to fine-scale sampling of feeding activities, we addressed the lack of research investigating the food requirements and the trophic role of green turtles. To day, feeding activities of green turtles are better known on seagrass. We described the habitat use, the food intake, and the herbivory pressure of green turtles exploiting a multi-sepcies seagrass meadow of Mayotte. In Reunion Island, first results provide some information about the habitat use of green turtles. Such results are paramount for the management and conservation sea turtles and their habitats.; Les relations interspécifiques sont un indicateur naturel de l'état de santé d'un écosystème et de son éventuelle évolution. Dans le contexte actuel de changement climatique et d'intensification des activités humaines, nous décrivons, par une approche intégrée, les interactions existant entre les tortues vertes et leurs ressources trophiques, afin de contribuer à la compréhension de la dynamique de la biodiversité marine. La tortue verte est la seule tortue marine herbivore aux stades sub-adulte et adulte. Elle se nourrit principalement sur des herbiers de phanérogames marines et des algueraies en milieu côtier relativement peu profonds et constitue ainsi un modèle privilégié pour étudier l'écologie trophique et fonctionnelle des tortues marines en conditions naturelles. Le travail présenté dans ce manuscrit étudie deux populations de tortues vertes : la première s'alimentant de phanérogames marines sur le site de N'Gouja à Mayotte et la seconde d'algues benthiques sur la côte ouest de l'Ile de La Réunion. A ce stade de l'étude, le système tortues vertes-herbier est le mieux connu. Nous proposons une synthèse des relations existant entre le comportement de plongée et d'alimentation d'individus juvéniles et adultes avec la disponibilité trophique au sein d'un herbier marin plurispécifique. Ceci a été obtenu à partir de systèmes d'acquisition embarqués, d'observation directes de tortues vertes et de relevés phyto-écologiques conventionnels. Par ailleurs, notre étude a permis d'engager le suivi du système tortues vertes – herbier marin de N'Gouja et d'en décrire les premières tendances. En quatre ans, une diminution de près de 80 % de la biomasse végétale du site de N'Gouja accentue la pression d'herbivorie des tortues vertes sur l'herbier. Ce phénomène entraîne l'appauvrissement de la diversité spécifique des phanérogames en faveur des espèces végétales pionnières. La diminution parallèle de l'effectif de la population de tortues vertes du site de N'Gouja suggère un modèle alimentaire basé sur le principe de densité-dépendance. Les conséquences d'une surexploitation de l'herbier par les tortues vertes sont alors en opposition avec celles obtenues suite à la simulation d'une pression d'herbivorie nulle. Nous montrons que sous une pression d'herbivorie modérée, un stade successionel intermédiaire de l'herbier est maintenu et la diversité spécifique est favorisée par la diminution des capacités compétitives des espèces consommées. Il découle ainsi de notre étude des indicateurs du stade phytodynamique d'un herbier plurispécifique et de la pression d'herbivorie exercée par les tortues vertes qui permettent d'envisager les réponses écosystémiques d'un système tel que celui de N'Gouja sous différents scénarios environnementaux. Enfin, dans un cadre plus large, nous posons la question de savoir si l'évolution statutaire de Mayotte peut contribuer à approfondir et pérenniser la protection des tortues marines qui se trouvent sur son territoire. Nous décrivons la départementalisation comme un moyen d'accentuer le processus de clarification du droit applicable à Mayotte et d'assurer des moyens humains, matériels, et financiers nécessaires à la protection de l'environnement. Des recensements aériens réalisés au dessus de la côte ouest de l'île de La Réunion révèlent la présence d'individus sexuellement matures et immatures, dont le nombre augmente depuis 1996. Cette approche nous aura permis d'identifier une fréquentation préférentielle des habitats coralliens et de décrire, à partir d'observations sous-marines parallèles, la côte ouest de l'île comme un site d'alimentation d'individus matures et d'individus en phase de croissance. Ce travail renforce les bases scientifiques nécessaires à la mise en place de stratégies de conservation des tortues marines et de leurs habitats.

Reproduction of sea turtles primarily relies on body reserves stored during the time spent on foraging grounds prior to the nesting season. Accordingly, the investigation of foraging behaviour of sea turtles is critical for better assessing their biology but also for conservation issues of these endangered species. Sea turtles contribute significantly to the consuming biomass of their ecosystem and hence to its functioning, thus providing natural indications of the health of the ecosystem. Yet the trophic ecology of sea turtles is poorly documented because their feeding grounds remain poorly known and for most of them hardly accessible. Among sea turtles the green turtle is the only species where sub-adults and adults are mostly herbivorous feeding on seagrass and algae patches in shallow coastal waters. Such fairly accessible marine ecosystems provide a unique opportunity to investigate sea turtle ecology under natural conditions. The study was conducted in two foraging sites of green turtles located in the south-western Indian Ocean: Mayotte (seagrass meadow) and Reunion Island (algae spots). Thanks to fine-scale sampling of feeding activities, we addressed the lack of research investigating the food requirements and the trophic role of green turtles. To day, feeding activities of green turtles are better known on seagrass. We described the habitat use, the food intake, and the herbivory pressure of green turtles exploiting a multi-sepcies seagrass meadow of Mayotte. In Reunion Island, first results provide some information about the habitat use of green turtles. Such results are paramount for the management and conservation sea turtles and their habitats., Les relations interspécifiques sont un indicateur naturel de l'état de santé d'un écosystème et de son éventuelle évolution. Dans le contexte actuel de changement climatique et d'intensification des activités humaines, nous décrivons, par une approche intégrée, les interactions existant entre les tortues vertes et leurs ressources trophiques, afin de contribuer à la compréhension de la dynamique de la biodiversité marine. La tortue verte est la seule tortue marine herbivore aux stades sub-adulte et adulte. Elle se nourrit principalement sur des herbiers de phanérogames marines et des algueraies en milieu côtier relativement peu profonds et constitue ainsi un modèle privilégié pour étudier l'écologie trophique et fonctionnelle des tortues marines en conditions naturelles. Le travail présenté dans ce manuscrit étudie deux populations de tortues vertes : la première s'alimentant de phanérogames marines sur le site de N'Gouja à Mayotte et la seconde d'algues benthiques sur la côte ouest de l'Ile de La Réunion. A ce stade de l'étude, le système tortues vertes-herbier est le mieux connu. Nous proposons une synthèse des relations existant entre le comportement de plongée et d'alimentation d'individus juvéniles et adultes avec la disponibilité trophique au sein d'un herbier marin plurispécifique. Ceci a été obtenu à partir de systèmes d'acquisition embarqués, d'observation directes de tortues vertes et de relevés phyto-écologiques conventionnels. Par ailleurs, notre étude a permis d'engager le suivi du système tortues vertes – herbier marin de N'Gouja et d'en décrire les premières tendances. En quatre ans, une diminution de près de 80 % de la biomasse végétale du site de N'Gouja accentue la pression d'herbivorie des tortues vertes sur l'herbier. Ce phénomène entraîne l'appauvrissement de la diversité spécifique des phanérogames en faveur des espèces végétales pionnières. La diminution parallèle de l'effectif de la population de tortues vertes du site de N'Gouja suggère un modèle alimentaire basé sur le principe de densité-dépendance. Les conséquences d'une surexploitation de l'herbier par les tortues vertes sont alors en opposition avec celles obtenues suite à la simulation d'une pression d'herbivorie nulle. Nous montrons que sous une pression d'herbivorie modérée, un stade successionel intermédiaire de l'herbier est maintenu et la diversité spécifique est favorisée par la diminution des capacités compétitives des espèces consommées. Il découle ainsi de notre étude des indicateurs du stade phytodynamique d'un herbier plurispécifique et de la pression d'herbivorie exercée par les tortues vertes qui permettent d'envisager les réponses écosystémiques d'un système tel que celui de N'Gouja sous différents scénarios environnementaux. Enfin, dans un cadre plus large, nous posons la question de savoir si l'évolution statutaire de Mayotte peut contribuer à approfondir et pérenniser la protection des tortues marines qui se trouvent sur son territoire. Nous décrivons la départementalisation comme un moyen d'accentuer le processus de clarification du droit applicable à Mayotte et d'assurer des moyens humains, matériels, et financiers nécessaires à la protection de l'environnement. Des recensements aériens réalisés au dessus de la côte ouest de l'île de La Réunion révèlent la présence d'individus sexuellement matures et immatures, dont le nombre augmente depuis 1996. Cette approche nous aura permis d'identifier une fréquentation préférentielle des habitats coralliens et de décrire, à partir d'observations sous-marines parallèles, la côte ouest de l'île comme un site d'alimentation d'individus matures et d'individus en phase de croissance. Ce travail renforce les bases scientifiques nécessaires à la mise en place de stratégies de conservation des tortues marines et de leurs habitats.

The main objective of this work is to improve our understanding of the eco-ethological processes that govern marine resources associated with coastal artificial habitats. To understand this system, we have first presented a synthesis of the aggregation processes of fish found in association with artificial habitats.We described the reasoning approach shared by the two main types of fishery tools that are the Artificial Reefs and Fish Aggregation Device (FAD). Our Work was then focused on the analysis of fish distribution in a network of coastal FADs, moored in St. Paul's bay. This analysis, based on acoustic surveys, has shown that the intensity of association varied depending on the fish community (benthic or pelagic), the diel period and the development stage of the fish (adult or juvenile). In particular, it has been pointed out that whatever the fish community the aggregations of juveniles were more extensive than the adults.We then described the tagging experiments performed on two representative species: the Selar crumenophthalmus (pelagic) and Lutjanus kasmira (benthic). The results of these experiments have allowed specifying the fish dependence on FAD.Concerning the associative behaviour of adult pelagic fish, the analyses have confirmed the meeting point hypothesis, suggesting that fish used the FADs to form larger schools. This reinforces the idea that these fish optimize their survival by focusing on social interaction with conspecific.The study of the benthic species has shown a strong association of the fish to the structures and has validated the hypothesis of an increasing trophic activity by night out of the FAD.From these observations, an estimate of the entire FAD network influence has been performed and then input, firstly into the geostatistical analysis of the biomass distribution in the bay, and secondly into the distribution analysis of the biomass as influenced or not by the FAD. This work showed a significant linear relationship between FAD associated and free biomass.We then explored the contribution of the association behaviour and the environmental factors (turbidity and bottom slope), integrating both into a generalized additive model. This study showed that the FAD effect is not always a prior factor influencing the biomass in the bay. We, therefore, hypothesized that the FAD is a habitat that would enrich the bay by providing new conditions for fish in search of optimal living conditions for their survival or comfort. In general, it will be important to deepen the impact of the two major factors influencing the ecological dynamics of aggregation around FADs namely trophic conditions and predation. In prospect, we could apply our methodology on drifting FADs and also use our results for improvement and restoration of natural habitats.; L'objectif général de ce travail est d'améliorer notre compréhension des processus éco-éthologiques qui gouvernent les ressources marines côtières associées à des habitats artificiels. Afin d'appréhender ce système, nous avons tout d'abord présenté une synthèse du fonctionnement écologique des agrégations de poissons trouvées en association avec les habitats artificiels. Nous avons notamment posé la base commune de fonctionnement des deux grands types d'outils d'aide à la pêche que sont les Récifs Artificiels et les Dispositifs de Concentration de Poissons (DCP). Notre travail s'est ensuite focalisé sur l'analyse de la répartition des poissons dans un réseau de DCP côtiers, immergés dans la baie de Saint-Paul. Cette analyse basée sur des campagnes de prospection acoustique, a permis de montrer que l'intensité de la relation d'association variait en fonction de la communauté de poissons considérée (démersale ou pélagique), des différentes phases du nycthémère et du stade de développement des individus (adulte ou juvénile). En particulier, il a été montré que les agrégations des juvéniles étaient plus étendues que les agrégations d'adultes et ce quelle que soit la communauté de poissons étudiée. Nous avons ensuite présenté les expériences de marquage acoustique effectuées sur les deux espèces représentatives des deux communautés : le Selar crumenophthalmus (espèce pélagique) et le Lutjanus kasmira (espèce démersale). Les résultats de ces expériences ont permis de spécifier le degré de dépendance aux DCP des espèces sélectionnées. En ce qui concerne le comportement d'association des poissons pélagiques adultes, l'étude détaillée des données a permis de confirmer l'hypothèse du point de rencontre suggérant que les poissons utilisaient le DCP pour se retrouver et pour former des bancs plus gros.L'étude de l'espèce démersale a permis de montrer la forte association des poissons aux structures et de valider l'hypothèse d'une augmentation de l'activité trophique nocturne hors des structures. A partir de ces résultats, une estimation de l'influence de l'intégralité du réseau de DCP a été effectuée et intégrée d'une part, à l'analyse Géostatistique de la répartition des biomasses dans la baie de Saint-Paul et d'autre part, à l'étude de la répartition des biomasses selon les zones sous influence ou hors d'influence des structures. Les résultats sont discutés et montrent notamment qu'il existe une relation linéaire significative entre les biomasses associées et libres.Nous avons ensuite exploré les parts respectives des effets liés au comportement d'association et aux facteurs abiotiques mesurés : la turbidité et la pente du fond (qui intègre l'effet du courant et de la houle), en intégrant ces facteurs dans un modèle additif généralisé. Cette étude a montré que l'effet DCP n'est pas systématiquement le facteur influençant le plus la répartition des biomasses dans la baie. Nous avons donc émis l'hypothèse que le DCP est un habitat qui permettrait d'enrichir l'habitat naturel en offrant des nouvelles conditions à des poissons en quête de conditions de vie optimales pour leur survie ou leur confort. Ainsi, concernant les poissons pélagiques, les possibilités supplémentaires qu'apportent les DCP, à la fois de rencontre des congénères mais aussi de protection vis-à-vis des prédateurs, conduiraient les poissons à s'associer à ces structures. Néanmoins, cette hypothèse reste à vérifier, tout autant que celle supposant que le processus amenant les poissons à quitter les DCP pour rejoindre les zones de forte pente serait lié aux conditions trophiques plus avantageuses sur ces zones que sous les DCP. De façon générale, il sera important d'approfondir l'effet des deux principaux facteurs écologiques influençant la dynamique d'agrégation autour des DCP à savoir les conditions trophiques et la prédation car tous deux sont susceptibles d'influencer le comportement d'association. Les perspectives de ce travail sont ainsi envisagées tant sur la possibilité de transposer notre méthodologie aux structures dérivantes que sur l'utilisation des DCP pour l'amélioration et la restauration des habitats naturels.

National audience; Oral presentation about Les oiseaux marins des Iles Éparses face aux changements globaux

The main objective of this work is to improve our understanding of the eco-ethological processes that govern marine resources associated with coastal artificial habitats. To understand this system, we have first presented a synthesis of the aggregation processes of fish found in association with artificial habitats.We described the reasoning approach shared by the two main types of fishery tools that are the Artificial Reefs and Fish Aggregation Device (FAD). Our Work was then focused on the analysis of fish distribution in a network of coastal FADs, moored in St. Paul's bay. This analysis, based on acoustic surveys, has shown that the intensity of association varied depending on the fish community (benthic or pelagic), the diel period and the development stage of the fish (adult or juvenile). In particular, it has been pointed out that whatever the fish community the aggregations of juveniles were more extensive than the adults.We then described the tagging experiments performed on two representative species: the Selar crumenophthalmus (pelagic) and Lutjanus kasmira (benthic). The results of these experiments have allowed specifying the fish dependence on FAD.Concerning the associative behaviour of adult pelagic fish, the analyses have confirmed the meeting point hypothesis, suggesting that fish used the FADs to form larger schools. This reinforces the idea that these fish optimize their survival by focusing on social interaction with conspecific.The study of the benthic species has shown a strong association of the fish to the structures and has validated the hypothesis of an increasing trophic activity by night out of the FAD.From these observations, an estimate of the entire FAD network influence has been performed and then input, firstly into the geostatistical analysis of the biomass distribution in the bay, and secondly into the distribution analysis of the biomass as influenced or not by the FAD. This work showed a significant linear relationship between FAD associated and free biomass.We then explored the contribution of the association behaviour and the environmental factors (turbidity and bottom slope), integrating both into a generalized additive model. This study showed that the FAD effect is not always a prior factor influencing the biomass in the bay. We, therefore, hypothesized that the FAD is a habitat that would enrich the bay by providing new conditions for fish in search of optimal living conditions for their survival or comfort. In general, it will be important to deepen the impact of the two major factors influencing the ecological dynamics of aggregation around FADs namely trophic conditions and predation. In prospect, we could apply our methodology on drifting FADs and also use our results for improvement and restoration of natural habitats., L'objectif général de ce travail est d'améliorer notre compréhension des processus éco-éthologiques qui gouvernent les ressources marines côtières associées à des habitats artificiels. Afin d'appréhender ce système, nous avons tout d'abord présenté une synthèse du fonctionnement écologique des agrégations de poissons trouvées en association avec les habitats artificiels. Nous avons notamment posé la base commune de fonctionnement des deux grands types d'outils d'aide à la pêche que sont les Récifs Artificiels et les Dispositifs de Concentration de Poissons (DCP). Notre travail s'est ensuite focalisé sur l'analyse de la répartition des poissons dans un réseau de DCP côtiers, immergés dans la baie de Saint-Paul. Cette analyse basée sur des campagnes de prospection acoustique, a permis de montrer que l'intensité de la relation d'association variait en fonction de la communauté de poissons considérée (démersale ou pélagique), des différentes phases du nycthémère et du stade de développement des individus (adulte ou juvénile). En particulier, il a été montré que les agrégations des juvéniles étaient plus étendues que les agrégations d'adultes et ce quelle que soit la communauté de poissons étudiée. Nous avons ensuite présenté les expériences de marquage acoustique effectuées sur les deux espèces représentatives des deux communautés : le Selar crumenophthalmus (espèce pélagique) et le Lutjanus kasmira (espèce démersale). Les résultats de ces expériences ont permis de spécifier le degré de dépendance aux DCP des espèces sélectionnées. En ce qui concerne le comportement d'association des poissons pélagiques adultes, l'étude détaillée des données a permis de confirmer l'hypothèse du point de rencontre suggérant que les poissons utilisaient le DCP pour se retrouver et pour former des bancs plus gros.L'étude de l'espèce démersale a permis de montrer la forte association des poissons aux structures et de valider l'hypothèse d'une augmentation de l'activité trophique nocturne hors des structures. A partir de ces résultats, une estimation de l'influence de l'intégralité du réseau de DCP a été effectuée et intégrée d'une part, à l'analyse Géostatistique de la répartition des biomasses dans la baie de Saint-Paul et d'autre part, à l'étude de la répartition des biomasses selon les zones sous influence ou hors d'influence des structures. Les résultats sont discutés et montrent notamment qu'il existe une relation linéaire significative entre les biomasses associées et libres.Nous avons ensuite exploré les parts respectives des effets liés au comportement d'association et aux facteurs abiotiques mesurés : la turbidité et la pente du fond (qui intègre l'effet du courant et de la houle), en intégrant ces facteurs dans un modèle additif généralisé. Cette étude a montré que l'effet DCP n'est pas systématiquement le facteur influençant le plus la répartition des biomasses dans la baie. Nous avons donc émis l'hypothèse que le DCP est un habitat qui permettrait d'enrichir l'habitat naturel en offrant des nouvelles conditions à des poissons en quête de conditions de vie optimales pour leur survie ou leur confort. Ainsi, concernant les poissons pélagiques, les possibilités supplémentaires qu'apportent les DCP, à la fois de rencontre des congénères mais aussi de protection vis-à-vis des prédateurs, conduiraient les poissons à s'associer à ces structures. Néanmoins, cette hypothèse reste à vérifier, tout autant que celle supposant que le processus amenant les poissons à quitter les DCP pour rejoindre les zones de forte pente serait lié aux conditions trophiques plus avantageuses sur ces zones que sous les DCP. De façon générale, il sera important d'approfondir l'effet des deux principaux facteurs écologiques influençant la dynamique d'agrégation autour des DCP à savoir les conditions trophiques et la prédation car tous deux sont susceptibles d'influencer le comportement d'association. Les perspectives de ce travail sont ainsi envisagées tant sur la possibilité de transposer notre méthodologie aux structures dérivantes que sur l'utilisation des DCP pour l'amélioration et la restauration des habitats naturels.

Une exploration sous-marine à l'aide d'un engin de type R.O.V a été menée pour la première fois entre 100 et 400 m de profondeur sur les reliefs volcaniques de l'île de la Réunion. 20 plongées ont été effectuées dans le sud-est de l'île sur les coulées récentes et 13 dans l'ouest sur un substrat plus ancien. Des pillow-lavas ont ainsi été observées à 250 m sur les coulées volcaniques de 2007 prouvant que la lave a fait irruption sous l'eau, occasionnant des perturbations importantes en profondeur et sur des kilomètres aux alentours. Des conglomérats de galets ont également été découverts au nord-ouest, en baie de St-Paul, entre 100 et 200 m, révélant probablement la présence de la sédimentation ancienne du cône de déjection de la Rivière des Galets. De gros basculements de ces formations témoignent d'une instabilité, d'âge indéterminé, des dépôts à cette profondeur. Concernant les peuplements, de nombreuses espèces ont été recensées. Parmi les mieux représentées, 66 espèces de poissons ont été inventoriées, 16 de cnidaires, 8 d'arthropodes et 7 d'échinodermes. Certaines n'avaient encore jamais été observées à la Réunion.

International audience; Article sur les récifs coralliens de la Réunion en 2007: état des lieux et réseau de suivi

La Réunion est une île volcanique jeune des Mascareignes. Son plateau continental est étroit et les habitats souvent constitués par des fonds sédimentaires répartis sur une grande partie du littoral abritent des communautés diversifiées de macrofaune. L anthropisation croissante ces 20 dernières années est source de différentes pollutions. Les zones côtières non-récifales et le benthos des substrats meubles sont peu connus. La structure de ces communautés est décrite essentiellement pour le nord, et l est de l île et détermine les modalités de leur fonctionnement, notamment en réponse aux perturbations. Un premier inventaire des espèces benthiques trouvées entre 20 et plus de 140 m de profondeur a été réalisé. L étude de la macrofaune et des principales variables environnementales a mis en évidence le rôle déterminant de la bathymétrie. La granulométrie des sédiments et l hydrodynamisme sont importants, notamment en zone littorale, où le macrobenthos est soumis aux perturbations naturelles (cyclones et dépressions) et anthropiques. La réponse du macrobenthos à des perturbations dues à des activités industrielles a été suivie pendant plusieurs années sur deux secteurs de l est de l ile où les rejets en mer se font différemment. Elle s est traduite par un impact croissant des rejets sur le milieu, et une réponse de la macrofaune selon un schéma-type de succession secondaire de communautés, impliquant des espèces originales bio-indicatrices de perturbation, les polychètes Eunicidae Diopatra cuprea, des Spionidae et des Capitellidae. Un outil de diagnostic de la santé de ces écosystèmes côtiers tropicaux a été adapté au contexte local ; il est basé sur le calcul d un indice biotique intégrateur de la qualité de milieu prenant en considération toute la communauté benthique. Il répond aux exigences de la Directive Européenne Cadre sur l Eau. La macrofaune sédimentaire constitue donc un outil pertinent et complémentaire pour ces analyses, tant en terme de biodiversité, que de suivi des pollutions, et s intègre dans les stratégies de gestion intégrée des littoraux tropicaux insulaires., no abstract

Coral reefs are very productive ecosystems. Soft-sediment plays generally a role in storing place, in transforming and in producing of matter, and therefore it could play a key role in coral reefs ecosystems. The goal of this study was to evaluate the role of soft-bottom compartment during the transfer of matter and energy in the reef of La Saline (Reunion Island). Three main lines of research were developed: the physicochemical characterisation of studied site, the metabolism of soft bottom in view to estimate the trophic production and its status and finally, the characterisation of biological component by the study of macrobentos and megabentos (i.e. Holothurians). A limited disturbance was detected by physicochemical data although locally enrichment of freshwater by nutrients (nitrates+nitrites+silicates) were measured (reef back hollow of Planch'Alizé and Grand Trou d'Eau). At the reef scale (9 stations and 2 seasons), the soft-sediment was found heterotrophic (net production = 31.6, respiration R = 109.6, gross production Pg = 77.9 mmolC m-2 d-1 et Pg/R = 0.7). Opposite to the two holothurians studied population Holothuria atra et H. leucospilota, macrobenthos (> 1 mm) did not constitute a major group in the food web (134 taxa, with a mean of 32.86 individuals per 0.2 m- 2 et 0.059 gPS 0.2m-2) compared to Echinoderm biomass that could reach 7.92 gPS m-2. At the station scale, spatial heterogeneity of metabolism was in agreement with the physicochemical characteristics of environment reflecting the double influence of both ocean and continent (freshwater enrichment). The most productive and heterotrophic stations were located in the reef back hollow where the oceanic influence was the lowest. Finally, macrofauna was under hydrodynamic influence although holothurians are growing in the most productive area. The soft-bottom sediment played a key role in filtrating organic matter provided from the back reef. This mechanism was deeply influenced by the high hydrodynamism (narrow reef and low water level) which modulated the loss of mater and energy of the reef. These losses were however limited by the action of holothurians (high density ind m-2), which store organic matter such as biomass and enhanced probably local production via excretion and bioturbation. To conclude, at the ecosystem scale, soft-bottom was responsible of recycling, which, Les récifs coralliens sont des écosystèmes très productifs. Lieu de stockage, transformation, et production de matière, les sédiments pourraient également jouer un rôle dans le fonctionnement du récif. L'objectif était d'évaluer ce rôle dans le transfert de matière et d'énergie du récif de La Saline (île de la Réunion). Trois axes de recherches ont été développés : la caractérisation de la zone via des analyses physicochimiques, l'étude du métabolisme des sédiments (production et statut trophique), et, de la composante biologique, macrofaune et mégafaune (holothuries). Les mesures physicochimiques ont montré un état de perturbation limité, même si localement, des enrichissements par les eaux douces en éléments nutritifs sont bien réels (arrière-récifs de Planch'Alizé et Grand Trou d'Eau). Á l'échelle du récif (9 stations, 2 saisons), les sédiments sont hétérotrophes (production nette = 31.6, respiration R = 109.6, production brute Pg = 77.9 mmolC m-2 j-1 et Pg/R = 0.7). La macrofaune ne constitue pas un groupe important dans le réseau trophique (134 taxons, avec en moyenne, 32.86 individus 0.2 m-2 et 0.059 gPS 0.2m-2). Par comparaison, les biomasses des populations de Holothuria atra et H. leucospilota, atteignent 7.92 gPS m-2. L'hétérogénéité spatiale du métabolisme des stations est en accord avec des caractéristiques physicochimiques du milieu reflétant la double influence océan - terre (enrichissement par eaux douces). Les stations les plus productives et hétérotrophes se situent dans l'arrière-récif où l'influence océanique est minime. La macrofaune est sous l'influence du facteur hydrodynamisme alors que les holothuries se développent dans les zones très productives. Le compartiment sédimentaire joue donc un rôle essentiel de filtre pour la matière organique importée. Ce fonctionnement est influencé par l'hydrodynamisme qui conditionne les pertes de matière et d'énergie. Ces pertes sont limitées par l'action des holothuries (forte densité 3 ind m-2) qui stockent la matière organique sous forme de biomasse, et stimulent probablement la production locale (excrétion et bioturbation). En conclusion, à l'échelle de l'écosystème, les sédiments assurent un recyclage essentiel, fonction renforcée par les holothuries qui limitent les pertes de matière et d'énergie dues à l'hydrodynamisme.

Les peuplements ichtyologiques des récifs artificiels sont denses et diversifiés, leur étude nécessite la mise au point d'une méthode adaptée, mettant en oeuvre simultanément des observations visuelles et enregistrements vidéo. L'habitat est un facteur clé dans la structure et l'évolution des peuplements ichtyologiques. La majorité des indicateurs utilisés distinguent les peuplements des récifs artificiels (RA) et des récifs coralliens (RC). La comparaison des trois types de RA montre que la complexité de l'habitat intervient sur l'évolution des peuplements ichtyologiques, et interéagit avec les éléments extérieur (recrutements, cyclones Le rôle des RA dans l'attraction ou la production des espèces exploitées dépend de l'écologie des espèces. Pour les espèces sédentaires, il y a une sélection des biotopes lors du recrutement et le taux de survie semble lié à la disponibilité en microhabitats. Les espèces démersales, plus mobiles, semblent se déplacer au cours de la croissance, soit entre RA d'architectures différentes soit entre RA et RC. La répartition spatiale des espèces pélagiques montre une plus forte association aux RA de jour que de nuit, no abstract

The study of the food web requires the understanding of natural processes related to the distribution and abundance of organisms in their environment. Tropical seabirds show a hierarchical distribution that depends on the position of their colonies in relation to the physical structures of the environment, which favours biological production and to their dispersion capability, which is strongly affected by their status (breeder, migrant, ...). At macro-scale (103km), this distribution reflects the boundaries of their habitat, at meso-scale (10²km) the presence of structure aggregating prey, and at micro-scale (101km), the temporary presence at the surface, of prey driven by foraging marine predatory schools, mostly tunas. In the south-west Indian Ocean, more than 6 million of birds are present, of which 99% are sooty terns. They breed seasonally, in austral winter, at the Seychelles and at Europa, in austral summer at Juan de Nova. High chlorophyll concentration found around islands during breeding season favours the development of the food web that leading to the terns. The location of the Glorieuses Islands drives a sub-annual breeding regime, led by the presence of prey in the vicinity of the colony all year round. Sooty tern biomass removed during the reproduction, is estimated at 55,000 tons yearly, in the Mozambique Channel. The ain preys are squids, pelagic fishes and fish larvae, in various proportions according to the location.; L'étude des réseaux trophiques nécessite une compréhension des phénomènes naturels relatifs à la distribution et l'abondance des organismes dans leur environnement. Les oiseaux marins tropicaux ont une distribution hiérarchique qui dépend de la position de leurs colonies vis à vis des structures physiques du milieu favorisant la production biologique, et de la capacité de dispersion des oiseaux, qui est fortement influencée par leur statut (reproducteur, migrateur, ...). A macro-échelle (103km) cette distribution reflète les limites de leurs habitats, à méso-échelle (10²km) la présence de structures qui agrègent les proies et à micro-échelle (101 km), la présence temporaire en surface, de proies rendues accessibles le plus souvent par les bancs de prédateurs en chasse, tels que les thons. Dans le sud-ouest de l'océan Indien, plus de 6 millions d'oiseaux sont présents, dont 99% sont des sternes fuligineuses. Elles se reproduisent de façon saisonnière en hiver austral aux Seychelles et à Europa, en été austral à Juan de Nova. La concentration en chlorophylle plus élevée autour des colonies saisonnières favorise le développement de chaînes alimentaires qui aboutissent aux sternes. La position des Glorieuses semble avoir favorisé une reproduction sub-annuelle,soutenue par la présence de proies autour des colonies toute l'année. Les rélèvements de biomasse effectués par les sternes en reproduction sont estimés à plus de 55 000 tonnes par an, dans le canal du Mozambique. Ces prélèvements concernent des calmars, des poissons pélagiques et des larves de poissons, avec des proportions variables suivant les sites.

Dans le cadre du thème "Biodiversité et ressources marines" développé par le Laboratoire d'écologie marine de l'Université de La Réunion, une étude sur la colonisation du récif frangeant de la Saline par les post-larves de poissons a été réalisée en utilisant la technique du filet de crête. Le but de ce travail était, de comprendre les mécanismes qui régissent le retour des post-larves dans les populations parentales, de suivre l'installation des nouvelles recrues dans le milieu, puis enfin d'apporter des éléments sur la biologie de ces jeunes poissons en les plaçant dans des conditions d'élevage. Les résultats montrent que la colonisation des platiers a lieu essentiellement du mois d'août au mois de mars, avec deux pics d'abondance et de richesse spécifique au mois d'août-septembre et au mois de février. Un cycle annuel de colonisation apparaît et correspondrait à une période de reproduction plus intense de juin à décembre pour de nombreuses espèces. Les variations de la température de l'eau de mer semblent déclencher ce phénomène de colonisation et les nuits calmes de nouvelle lune seraient les plus favorables à l'arrivée des post-larves sur les récifs. Avec un total de 106 espèces échantillonnées, la colonisation des platiers ne concerne que 40 à 50 % des espèces coralliennes recensées sur l'île. Le flux moyen de post-larves est de 5,2 individus par jour et par mètre linéaire de crête récifale, ce qui correspond à une biomasse de 1,2 kg de post-larves par an, soit 100 à 400 fois moins que sur certains récifs du Pacifique. Les platiers de La Réunion seraient ainsi proches du modèle de "recrutement limitant" basé sur un faible apport larvaire, alors que les ressources et l'habitat seraient toujours en quantité suffisante. La taille standard des poissons au moment de la colonisation est extrêmement variable selon les familles ou les genres et va de 4,5 mm (Monodactylus argenteus) à 142 mm (Aulostomus chinensis), mais elle reste le plus souvent homogène au sein d'une même espèce, montrant ainsi que les poissons colonisent les platiers à un stade de développement bien précis. Les chances de survie de ces post-larves sont de 0,8 à 4,6 %. La prédation serait l'une des principales causes de la diminution rapide de ces poissons durant cette phase critique de colonisation. La densité de jeunes poissons qui recrutent et se répartissent ensuite sur toute la superficie du platier est de 0,04 à 0,22 ind.m-2. Ils sont surtout observés de novembre à mai, soit un décalage d'environ 3 mois par rapport à la période de colonisation. Un total de 50 espèces de poissons juvéniles a pu ainsi être répertorié, principalement dans la zone de platier interne où se développent les colonies coralliennes, mais également dans le chenal d'arrière récif pour certaines espèces. Ces juvéniles installés dans leur nouveau milieu ont, 30 jours après le recrutement, une chance de survie de 33 à 40 %. Certaines espèces comme Naso unicornis migreraient ensuite vers la pente externe après une phase de croissance de 4 à 5 mois sur le platier. L'élevage des post-larves a été réalisé pour 10 espèces parmi les plus abondantes. La quantité de nourriture à base de granulés, distribuée à ces nouvelles recrues peut représenter jusqu'à 20 % du poids du poisson par jour, notamment lorsque les individus sont de petite taille comme Scarus sordidus. Elle se stabilise ensuite pour l'ensemble des espèces étudiées autour de 3 à 4 % de la biomasse par jour. La plupart de ces poissons ont une croissance qui se rapporche du type puissance (paramètre puissance de 1,07 à 3,5) avec un Taux de Croissance Spécifique journalier de 0,9 % (Chromis viridis) à 3,8 % (Monodactylus argenteus) et des Indices de Conversions moyens de 1,1 (Monodactylus argenteus) à 6,1 (Chromis viridis). La survie de ces post-larves et juvéniles en captivité est de 60 à 92 % après 196 jours d'élevage, ce qui montre les capacités d'adaptation importantes des poissons coralliens à ce stade de développement. Le grossissement des post-larves est donc possible et ouvre de nouvelles perspectives dans de nombreux domaines comme la recherche, l'aquaculture, l'aquariologie ou la gestion des milieux naturels., no abstract

International audience; Depuis une quinzaine d'années, les phénomènes de blanchissement de coraux ont été observés de manière étendue sur divers récifs, mais leurs causes sont encore mal lucidées. Au cours de la saison chaude 1997-1998, des blanchissements importants ont été observés, tant à la Réunion que dans toutes les zones récifales mondiales. Il est maintenant admis que des relations existent entre les paramètres environnementaux, en particulier la température de surface de la mer, et les phénomènes de blanchissement. Cependant ces phénomènes sont insuffisamment répertoriés. L'objectif général du programme était de fournir une meilleure connaissance des phénomènes à la Réunion, où ils n'avaient pas encore été étudiés, en approchant leurs causes et leurs conséquences, de manière à proposer des méthodologies simples de suivi. L'originalité du projet a été de travailler à trois échelles spatiales complémentaires. La petite échelle permet une approche des conditions de température de l'eau de mer de surface, à la fois par utilisation de températures relevées in situ et de données satellitales. La moyenne échelle, récifs et colonies coralliennes, permet de suivre les différentes étapes du blanchissement et la sensibilité des différentes espèces, à partir d'observations et d'enquêtes. A grande échelle, après la mort des coraux, les différentes étapes de la colonisation par le cortège d'algues épiphytes (macroscopique et microscopique) sont identifiées et le risque ciguatérique évalué. Ces approches complémentaires apportent des outils nécessaires pour une meilleure compréhension des causes, des étapes et des conséquences du phénomène. Elles permettront aussi la prévision de blanchissements futurs dont la probabilité risque de fortement augmenter dans le contexte global du réchauffement.

International audience; This paper compares metabolic budgets in two areas of the Saint-Gilles/La Saline fringing reef (Reunion Island). The control zone is characterized by flourishing Acropora communities. On the other hand, coral mortality and macroalgal surface cover are high at Planch'Alizés, where the back reef is anthropogenically enriched with nutrients due to groundwater discharge. Community gross primary production is higher and calcification lower on the Planch'Alizés reef flat compared to Toboggan. Data suggest that nutrient availability is enhanced at Planch'Alizés by oxidation of exogenous organic matter which may originate from the back reef. This could relate eutrophication on the Planch'Alizés reef flat to an indirect impact of groundwater discharge.; Cette étude compare les bilans métaboliques de deux secteurs du récif frangeant de Saint-Gilles/La Saline (île de la Réunion). Dans le secteur de référence, les communautés d'acropores sont florissantes. En revanche, une mortalité corallienne et un recouvrement algal importants caractérisent le site de Planch'Alizés, dont l'arrière-récif est enrichi en éléments nutritifs d'origine anthropique par la décharge de la nappe phréatique. La production communautaire brute est plus élevée, et la calcification réduite, sur le platier récifal de Planch'Alizés. Les données suggèrent que les quantités de sels nutritifs disponibles y sont accrues par l'oxydation de matière organique exogène provenant vraisemblablement de l'arrière-récif, ce qui permettrait de relier l'eutrophisation observée sur le platier récifal à un impact indirect des eaux souterraines.