1. Which tools for monitoring emerging arboviruses within their mammalian hosts and arthropod vectors ?
- Author
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Migné, Camille Victoire, Beck, Cécile, Gonzalez, Gaëlle, Lecollinet, Sylvie, Moutailler, Sara, Biologie moléculaire et immunologie parasitaires et fongiques (BIPAR), École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Laboratoire de santé animale, sites de Maisons-Alfort et de Dozulé, Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Virologie UMR1161 (VIRO), and École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
- Subjects
Arbovirus ,Surveillance ,LAMP assay ,Loop-mediated isothermal amplification ,outils de nouvelle génération arboviruses ,Arthropodes ,Arboviral diseases ,Next generation sequencing ,outils classiques ,MESH: Arboviruses ,MESH: Arthropods ,[SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology ,MESH: LAMP assay ,[SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie ,Public Health ,Arthropods ,Arboviruses - Abstract
International audience; Arboviruses are viruses transmitted to humans and/or animals by hematophagous arthropods. They have a significant economic and public health impact. Given the number of arboviruses already identified and their great genetic variability, it is essential to have highly flexible tools for their monitoring. Arbovirus circulation within animal populations can be demonstrated by direct and/or indirect screening of a specific virus within vertebrate hosts and/or arthropod vectors. Viruses have great adaptive capacities that enable them to emerge into new geographic areas and/or cross species barriers. Over the decades, arbovirus monitoring has considerably evolved due to innovations in detection technologies. The objectives of this review are to list and assess (i) the current tools for direct or indirect screening for arboviruses, (ii) the new generation tools that best meet expectations in terms of optimal arbovirus monitoring and (iii) the potentials for improved arbovirus monitoring.; Les arbovirus sont des virus transmis à l'Homme et/ou à des animaux par des arthropodes hématophages. Ils sont importants en termes de santé publique mais également d'un point de vue économique. Au vu du nombre d'arbovirus déjà identifiés et de leur grande variabilité génétique, il est nécessaire, voire indispensable, d'avoir des outils ayant une grande flexibilité pour leur surveillance. La circulation des arbovirus au sein d'une population animale peut se démontrer par recherche directe du virus au sein de l'hôte et/ou du vecteur ou par recherche indirecte du virus en mettant en évidence une séroconversion chez l'hôte vertébré. Les virus ont des grandes capacités d'adaptation qui leur permettent d'émerger dans de nouvelles zones géographiques et/ou de franchir les barrières d'espèces. Au fil des décennies, la surveillance des arbovirus a considérablement évolué grâce à toutes les technologies innovantes qui ont vu le jour. Les objectifs de cette revue sont de faire l'état de l'art sur (i) les outils classiques pour la recherche directe ou indirecte des arbovirus, (ii) les outils de nouvelle génération qui répondent au mieux aux attentes en termes de surveillance optimale des arbovirus et (iii) les axes d'amélioration pour la surveillance des arbovirus.
- Published
- 2021