Search

Technological advances, in particular the development of high-throughput sequencing, have led to the emergence of a new generation of molecular biomarkers for tumors. These new tools have profoundly changed therapeutic management in oncology, with increasingly precise molecular characterization of tumors leading to increasingly personalized therapeutic targeting. Detection of circulating tumor cells and/or circulating tumor DNA in blood samples -so-called 'liquid biopsies'- can now provide a genetic snapshot of the patient's tumor through an alternative and less invasive procedure than biopsy of the tumor tissue itself. This procedure for characterizing and monitoring the disease in real time facilitates the search for possible relapses, the emergence of resistance, or emergence of a new therapeutic target. In the long term, it might also provide a means of early detection of cancer. These new approaches require the treatment of ever-increasing amounts of clinical data, notably, with the goal of calculating composite clinical-biological predictive scores. The use of artificial intelligence will be unavoidable in this domain, but it raises ethical questions and implications for the health-care system that will have to be addressed., Les progrès technologiques, en particulier le développement du séquençage à haut débit, ont conduit à l’émergence d’une nouvelle génération de biomarqueurs tumoraux moléculaires. Ces nouveaux outils ont profondément modifié la prise en charge thérapeutique en oncologie avec une caractérisation moléculaire de plus en plus précise des tumeurs amenant à un ciblage thérapeutique personnalisé. La détection des cellules tumorales circulantes et/ou de l’ADN tumoral circulant dans des prélèvements sanguins, encore appelés « biopsies liquides », peut désormais fournir un instantané du profil génétique de la tumeur du patient grâce à une procédure alternative et moins invasive qu’une biopsie du tissu tumoral lui-même. Cette méthode de caractérisation moléculaire et de suivi de la maladie en temps réel facilite la recherche d’éventuelles rechutes, de l’émergence de résistances ou d’une nouvelle cible thérapeutique. À long terme, les biopsies liquides pourraient également fournir un moyen de détection précoce du cancer. Ces nouvelles approches nécessitent le traitement d’une quantité, toujours croissante, de données, en particulier cliniques, notamment dans l’optique d’élaborer des scores clinico-biologiques composites. L’utilisation de l’intelligence artificielle est un outil d’avenir dans ce domaine, mais elle soulève des questions éthiques et des implications pour l’organisation du système de santé qui devront être abordées.

We have determined the lipid, protein and miRNA composition of skeletal muscle (SkM)-released extracellular vesicles (ELVs) from Ob/ob (OB) vs wild-type (WT) mice. The results showed that atrophic insulin-resistant OB-SkM released less ELVs than WT-SkM, highlighted by a RAB35 decrease and an increase in intramuscular cholesterol content. Proteomic analyses of OB-ELVs revealed a group of 37 proteins functionally connected, involved in lipid oxidation and with catalytic activities. OB-ELVs had modified contents for phosphatidylcholine (PC 34-4, PC 40-3 and PC 34-0), sphingomyelin (Sm d18:1/18:1) and ceramides (Cer d18:1/18:0) and were enriched in cholesterol, likely to alleviated intracellular accumulation. Surprisingly many ELV miRNAs had a nuclear addressing sequence, and targeted genes encoding proteins with nuclear activities. Interestingly, SkM-ELV miRNA did not target mitochondria. The most significant function targeted by the 7 miRNAs altered in OB-ELVs was lipid metabolism. In agreement, OB-ELVs induced lipid storage in recipient adipocytes and increased lipid up-take and fatty acid oxidation in recipient muscle cells. In addition, OB-ELVs altered insulin-sensitivity and induced atrophy in muscle cells, reproducing the phenotype of the releasing OB muscles. These data suggest for the first time, a cross-talk between muscle cells and adipocytes, through the SkM-ELV route, in favor of adipose tissue expansion.

Glomus tumor are rare mesenchymal neoplasm, belonging to the pericytic (perivascular) tumor family, witch recent molecular characterization has allowed highlight recurrent molecular abnormalities. In fact, glomus tumor involves frequent MIR143-NOTCH gene fusion whereas others pericytic tumor (myopericytoma and myofibroma) involve mutations of PDGFRB gene. Glomus tumor are usually developed in superficial localization. However visceral locations have been described. Cardiac location is exceptional with only one case reported in literature. Here, we report the case of cardiac glomus tumor (glomangiomyoma) developed in the left ventricle in a 34 year-old patient, diagnosed after chest pain. The length of tumor was 4cm in greatest dimension. Histologically, the tumor concerned both round glomus cells and smooth muscle cells with prominent branching thin-walled vessels. By immunohistochemistry, these two contingents exhibited diffuse expression of smooth muscle actin and heterogeneous expression of H-caldesmone whereas cytokeratins, melanocytic markers and chomogranine were negative. Next Generation molecular analysis using RNA sequencing highlighted the characteristic MIR143-NOTCH gene fusion witch supports the diagnosis of glomus tumor. In this observation, we recall histological and immunohistochemistry features of glomus tumor and we make a synthesis concerning the molecular data recently described in sporadic glomus tumor.

The innate immune response is nonspecific and constitutes the first line of defense against infections by pathogens, mainly by enabling their elimination by phagocytosis or apoptosis. In immune cells, this response is characterized, amongst others, by the synthesis of restriction factors, a class of proteins whose role is to inhibit viral replication. Among them, the proteins of the APOBEC3 (Apolipoprotein B mRNA-editing Enzyme Catalytic polypeptide-like 3 or A3) family are major antiviral factors that target a wide range of viruses. One of their targets is the Human Immunodeficiency Virus Type 1 (HIV-1): the deaminase activity of some A3 proteins converts a fraction of cytidines of the viral genome into uridines, impairing its expression. Nevertheless, HIV-1 counteracts A3 proteins thanks to its Vif protein, which inhibits them by hijacking several cellular mechanisms. Besides, APOBEC3 proteins help maintaining the genome integrity by inhibiting retroelements but they also contribute to carcinogenesis, as it is the case for A3A and A3B, two major factors in this process. The large range of A3 activities, combined with recent studies showing their implication in the regulation of emerging viruses (Zika, SARS-CoV-2), allow A3 and their viral partners to be considered as therapeutic areas.

MicroRNAs (miRNAs) are small, single-strand non-coding RNAs that negatively regulate gene expression at the post-transcriptional level in many cellular processes. They play a key role in the regulation of osteoclastogenesis, a process of cell differentiation that leads to the formation of osteoclasts (OCs). OCs are multinucleated cells located in bone tissue that derived from myeloid precursors. OCs are the only cells capable of bone resorption, which role is essential to bone homeostasis and turnover. However, they actively participate in bone erosion in rheumatoid arthritis (RA), an autoimmune disease characterized by chronic joint inflammation associated with destruction of cartilage and bone. Based on their immunological properties, two OC subsets have been identified, the so called tolerogenic OCs (t-OCs) and inflammatory OCs (i-OCs). Recent studies have shown that the i-OCs associated with arthritis exclusively derive from circulating Ly6Chigh precursors that infiltrate inflamed joints. Combining miRNome and RNA-Seq analyses of t-OC and i-OC subsets, I aimed at identifying miRNAs markers specific for each subset and associated biological pathways. Among the miRNAs associated with i-OCs, I identified miR-342-3p, neither described yet in osteoclastogenesis or in arthritis. I demonstrated that miR-342-3p has a pro-osteoclastic effect in vitro by supporting the early phase of osteoclastogenesis, through the control of survival and motility of the precursors. I optimized the delivery of miR-342-3p agonist or neutralizing molecules in the precursors of i-OCs using the mouse model of autoimmune arthritis (K/BxN serum-transfer arthritis, STA) and the cationic liposome DMAPAP/DOPE. I showed that the systemic or intra-articular administration of miR-342-3p lipoplex selectively targets blood and joint inflammatory Ly6Chigh monocytes, and that in vivo neutralization of miR-342-3p in Ly6Chigh OC precursors of STA mice increased Adam17 expression. I identified Adam17 as a novel target for miR-342-3p. Overall, my data indicate that the in vivo modulation of miR-342-3p expression in i-OC precursors could be a potential therapeutic strategy to reduce bone erosion in arthritis.; Les micro-ARNs (miARNs) sont de petits ARN simples brins non codants qui contrôlent l’expression des gènes au niveau post-transcriptionnel, dans de nombreux processus cellulaires. Ils jouent un rôle clé dans la régulation de l’ostéoclastogenèse, un processus de différenciation cellulaire qui aboutit à la formation d’ostéoclastes (OCs). Les OCs sont des cellules multinucléées du tissu osseux issus de précurseurs myéloïdes. Ce sont les seules cellules de l’organisme capables de résorption osseuse, donc essentielles à l'homéostasie osseuse et au renouvellement osseux. Toute anomalie de leur fonctionnement est associée à des pathologies osseuses. Dans le cas de la polyarthrite rhumatoïde (PR), les OCs participent activement à l'érosion osseuse. La PR est une maladie auto-immune invalidante caractérisée par une atteinte articulaire inflammatoire associée à une destruction du cartilage et de l’os. Il a été décrit différents types d’OCs sur la base de leurs propriétés immunologiques : les OC tolérogènes (t-OCs) et les OC inflammatoires (i-OCs). Des études récentes ont montré que les i-OCs dérivent exclusivement de précurseurs circulants qui infiltrent les articulations arthritiques. Mon travail a consisté à combiner les analyses du miRNome et du transcriptome des sous-types t-OCs et i-OCs, en contexte physiologique et arthritique, afin d’identifier des miARNs spécifiques de chaque type d’OCs et les voies biologiques associées. Parmi les miARNs associés aux i-OCs, j’ai identifié miR-342-3p, encore non décrit dans l’ostéoclastogenèse ou l’arthrite. J’ai montré que miR-342-3p a un effet pro-ostéoclastique in vitro en soutenant la phase précoce de l’ostéoclastogenèse par induction de la survie et de la motilité des précurseurs myéloïdes. J’ai optimisé l’inhibition de miR-342-3p dans les précurseurs des i-OCs dans le modèle murin de l’arthrite auto-immune (K/BxN serum-transfer arthritis, STA) par l’administration systémique ou locale d’un inhibiteur ou agoniste de miR-342-3p formulé avec le liposome cationique DMAPAP/DOPE. J’ai montré le ciblage des monocytes inflammatoires Ly6Chigh du sang et de l’articulation, associée à l’inhibition d’Adam17 quand un lipoplex miR-342-3p est injecté. J’ai enfin montré qu’Adam17 est une nouvelle cible de miR-342-3p dans les précurseurs OCs. Mes travaux suggèrent que la modulation in vivo de l’expression de miR-342-3p dans les précurseurs des i-OCs pourrait être une stratégie thérapeutique intéressante pour réduire l’érosion osseuse liée à l’arthrite.

As main biological actors implicated in the regulation of many cellular processes, RNAs represent a particularly interesting target for the development of new therapeutic approaches. Many RNAs have a therapeutic interest, such as ribosomal RNAs, viral RNAs, nucleotide repeat expansion or microRNAs. These latter are a class of non-coding RNAs which is implicated in the regulation of gene expression by base pairing with messenger RNA and whose dysregulation is related to several diseases such as cancers. Indeed, in cancer cells some oncogenic microRNAs are overexpressed, this tends to promote oncogenesis and the maintenance of tumors. Also, oncogenic microRNAs are implicated in the maintenance of cancer stem cells (CSC). These tumorigenic cancer cells are resistant to current therapies and are the principal cause of therapeutic failure of chemotherapies. This failure is particularly important in the treatment of glioblastomas, an incurable brain cancer with a lifetime expectancy limited to 18 months, even with the combination of surgery, radiotherapy and chemotherapy. The main goal of my PhD work was to design, synthesize and characterize new small molecules, able to interfere with a step of oncogenic microRNAs’ biogenesis in order to inhibit their production. This can also induce the differentiation of glioblastoma cancer stem cells and lead to a potential therapy for this incurable disease. Through the biochemical study of interaction between these molecules and the target, as well as cellular tests, we were able to identify structure activity relationships and identify molecules inducing CSC differentiation, in order to render them sensitive to classical chemotherapies., Acteurs biologiques principaux impliqués dans la régulation d’un grand nombre de processus cellulaires, les ARN représentent une cible de choix pour le développement de nouvelles approches thérapeutiques. De nombreux ARN ont un intérêt thérapeutique, comme par exemple les ARN ribosomiques, les ARN viraux ou encore les microARN. Ces derniers sont une classe d’ARN non-codants impliqués dans la régulation de l’expression des gènes et dont la dérégulation a été liée à de nombreuses pathologies telles que les cancers. En effet, dans les cellules cancéreuses, certains microARN oncogènes sont surexprimés ce qui tend à promouvoir l’oncogenèse et le maintien des tumeurs. Également, les microARN oncogènes sont impliqués dans le maintien des cellules souches cancéreuses (CSC). Ces cellules tumorales, tumorigènes et résistantes aux thérapies sont la cause principale de l’échec thérapeutique des chimiothérapies. Cet échec est particulièrement important dans le traitement des glioblastomes, cancers du cerveau incurables dont la durée de vie des patients est limitée à 18 mois malgré la combinaison de la chirurgie, de la radiothérapie et de la chimiothérapie. Le but de ce travail de thèse a été de concevoir et de synthétiser de nouvelles molécules capables d’interférer avec une étape de la biogénèse des microARN oncogènes afin d’inhiber leur production. Ceci peut également induire la différentiation des CSC et permet d’envisager une thérapie pour les glioblastomes. Grâce aux études biochimiques des interactions entre ces molécules et la cible, ainsi qu’aux tests cellulaires effectués, nous avons pu dégager des relations structure-activité et identifier des composés capables d’induire la différentiation des CSC de façon à les rendre sensibles aux chimiothérapies classiques.

Left ventricular remodelling (LVR) and its mechanisms such as fibrosis and hypertrophy after myocardial infarction (MI) can lead to heart failure (HF) and are associated with modulation of microRNA levels. Extracellular vesicles (EVs) are heterogeneous transporters of microRNAs and their composition is derived from their cellular sources. This project aims to identify a microRNA-signature to predict LVR after MI and to characterize the cardiac extracellular vesicles (EVs) involved in their transport.Using molecular data of LVR after MI obtained in an experimental rat model in which MI is induced by coronary artery ligation and in post-MI patients from the REVE-2 study (REmodelage VEntriculaire), we identified a signature of 7 microRNAs able to detect LVR post-MI. To validate this signature, we quantified the 7 microRNAs after MI in rats and REVE-2 patients and we confirmed their modulation in the LV and plasma of rats and in the plasma of patients. In the cardiac fibroblasts (CFs) and myocytes (CMs) of neonatal rats, fibrosis activation and hypertrophy also lead to the modulation of the 7 microRNAs-signature. These results confirm that the 7 microRNAs-signature is able to detect LVR and its mechanisms after MI.We shown that the small cardiac EVs isolated by differential centrifugation were involved in the transport of microRNAs from the 7 microRNAs-signature. The small cardiac EVs are different between CFs and CMs and between ventricles and plasma. Proteomic analysis of EVs isolated by lipid affinity from ventricles and plasma identified the LIM domain binding 3 (Ldb3) protein that we validated to be more abundant in small cardiac EVs from ventricles than EVs from plasma, large EVs and non-EVs components separated by size exclusion chromatography. The detection of the 7 microRNAs-signature in the plasma EVs expressing Ldb3 may improve its ability to predict specifically LVR and HF after MI., Le remodelage du ventricule gauche (RVG) et ses mécanismes comme la fibrose et l'hypertrophie après l'infarctus du myocarde (IDM) peuvent mener à l'insuffisance cardiaque et sont associés à des modifications d'expression de microARNs. Les vésicules extracellulaires (VEs) sont des transporteurs hétérogènes des microARNs dont la composition dérive de leurs cellules sources. Les objectifs de cette thèse sont de définir une signature en microARNs capable de prédire le RVG et ses mécanismes après l'IDM et caractériser les vésicules extracellulaires (VEs) cardiaques impliquées dans leur transport.A partir des données moléculaires obtenues lors du RVG après l'IDM chez les rats après la ligature de l’artère coronaire et chez les patients de l’étude REVE-2 (REmodelage VEntriculaire), une signature de 7 microARNs susceptible de prédire le RVG a été identifiée. Pour valider cette signature, les microARNs ont été quantifiés après l'IDM chez les rats et chez les patients de l’étude REVE-2: leur modulation par le RVG a été confirmée dans le VG et le plasma des rats et le plasma des patients. Dans les fibroblastes (CFs) et les myocytes (CMs) cardiaques de rats néonataux, l'activation de la fibrose et de l'hypertrophie module aussi la signature en microARNs. Ces résultats confirment que la signature en microARNs permet de détecter le RVG et ses mécanismes après l'IDM.Nous avons montré que les petites VEs cardiaques isolées par ultracentrifugation sont impliquées dans le transport des microARNs de la signature. Les petites VEs cardiaques sont différentes entre les CFs et les CMs et entre le ventricule et le plasma de rats néonataux. Par analyse protéomique des VEs isolées par affinité lipidique à partir de ventricules et du plasma, la protéine 3 de liaison au domaine LIM (Ldb3) a été identifiée puis validée pour être plus abondante dans les petites VEs de ventricules comparées aux VEs de plasma, aux grandes VEs et aux particules non-VEs de ventricules séparées par chromatographie d'exclusion de taille. La détection de la signature en microARNs dans les VEs de plasma exprimant Ldb3 pourrait améliorer sa capacité à prédire spécifiquement le RVG et l'IC après l'IDM.

The main objective of this thesis was to continue the investigations carried out on the mechanisms underlying the development of foie gras in mule ducks. This process, known as hepatic steatosis and induced by overfeeding, needs to be further studied in order to contribute to overfeeding optimization.A kinetic study of the expression of genes related to hepatic steatosis, intermediate metabolism and cellular stress in mule ducks highlighted firstly the strong mobilization of carbohydrate and lipid metabolisms. Secondly a significant induction of the insulin / mTOR signalling pathway and the activation of various cellular protection mechanisms in hepatocytes were observed allowing them to fight against the increased intake of starch brought by the overfeeding. Among these are various protective mechanisms, autophagy has been the subject of extensive study in overfed ducks whose steatosis has been barely induced compared to non-overfed ducks. Autophagic flux measurements (LC3-II) showed that overfeeding induced inhibition of the autophagic process in mule ducks’ hepatocytes from the early stage of hepatic steatosis. This same study found that the mechanisms associated with cellular stress such as oxidative stress, endoplasmic reticulum stress or apoptosis did not occur early in the development of hepatic steatosis but much later. The same is true for the impact of overfeeding on mTOR signalling pathway.In addition, the kinetic study also revealed the significant induction of cholesterol metabolism correlated with the liver weight gain of ducks during overfeeding. These results aroused the interest of investigating plasma biomarkers for the development of hepatic steatosis related to cholesterol metabolism among microRNAs. Thus, duck's plasmatic miRNome was sequenced and it allowed to define the most differentially expressed microRNAs in the plasma of mule ducks but also to detect microRNAs (miR-122, miR-107 and mi-R194) as potential biomarkers that could be used for monitoring the development of fatty liver.All of this work contributes to the advancement of research on understanding the mechanisms of establishment of hepatic steatosis in mule ducks., L’objectif principal de cette thèse était de poursuivre les investigations menées sur les mécanismes sous-jacents au développement du foie gras chez le canard mulard. Ce processus appelé stéatose hépatique et induit par le gavage nécessite d’être davantage étudié afin de contribuer à l’optimisation du gavage. Une étude cinétique de l’expression des gènes en lien avec la stéatose hépatique, le métabolisme intermédiaire et le stress cellulaire chez le canard mulard a permis de mettre en évidence, outre la forte mobilisation des métabolismes glucidique et lipidique, une induction significative de la voie de signalisation de l’insuline mTOR et l’activation de mécanismes de protection cellulaire au sein des hépatocytes leur permettant de lutter contre l’apport accru d’amidon apporté par le gavage. Parmi ces différents mécanismes protecteurs, l’autophagie a fait l’objet d’une étude poussée chez des canards gavés dont la stéatose a été à peine induite comparés à des canards non gavés. Les mesures de flux autophagique (LC3-II) ont montré que le gavage induisait une inhibition du processus autophagique dans les hépatocytes de canards mulards dès la phase précoce du développement de la stéatose hépatique. Cette même étude a permis de constater que les mécanismes associés au stress cellulaires tels que le stress oxydant, le stress du réticulum endoplasmique ou encore l’apoptose ne se sont pas induits dès le début du développement de la stéatose hépatique mais bien plus tardivement. Il en est de même pour l’impact du gavage sur la voie mTOR. Par ailleurs, l’étude cinétique a également permis de mettre en évidence l’induction significative du métabolisme du cholestérol corrélé au gain de poids de foie des canards au cours du gavage. Ces résultats ont suscité l’intérêt de rechercher des biomarqueurs plasmatiques du développement de la stéatose hépatique en lien avec le métabolisme du cholestérol parmi les microARNs. Ainsi, le miRNome plasmatique du canard a été séquencé et a permis de définir les microARNs les plus différentiellement exprimés dans le plasma des canards mulards mais également de déceler des microARNs (miR-122, miR-107 et miR-194) candidats comme potentiels biomarqueurs utilisables pour le suivi du développement du foie gras.L’ensemble de ces travaux contribuent à l’avancée de la recherche sur la compréhension des mécanismes de l’établissement de la stéatose hépatique chez le canard mulard.

The main objective of this thesis was to continue the investigations carried out on the mechanisms underlying the development of foie gras in mule ducks. This process, known as hepatic steatosis and induced by overfeeding, needs to be further studied in order to contribute to overfeeding optimization.A kinetic study of the expression of genes related to hepatic steatosis, intermediate metabolism and cellular stress in mule ducks highlighted firstly the strong mobilization of carbohydrate and lipid metabolisms. Secondly a significant induction of the insulin / mTOR signalling pathway and the activation of various cellular protection mechanisms in hepatocytes were observed allowing them to fight against the increased intake of starch brought by the overfeeding. Among these are various protective mechanisms, autophagy has been the subject of extensive study in overfed ducks whose steatosis has been barely induced compared to non-overfed ducks. Autophagic flux measurements (LC3-II) showed that overfeeding induced inhibition of the autophagic process in mule ducks’ hepatocytes from the early stage of hepatic steatosis. This same study found that the mechanisms associated with cellular stress such as oxidative stress, endoplasmic reticulum stress or apoptosis did not occur early in the development of hepatic steatosis but much later. The same is true for the impact of overfeeding on mTOR signalling pathway.In addition, the kinetic study also revealed the significant induction of cholesterol metabolism correlated with the liver weight gain of ducks during overfeeding. These results aroused the interest of investigating plasma biomarkers for the development of hepatic steatosis related to cholesterol metabolism among microRNAs. Thus, duck's plasmatic miRNome was sequenced and it allowed to define the most differentially expressed microRNAs in the plasma of mule ducks but also to detect microRNAs (miR-122, miR-107 and mi-R194) as potential biomarkers that could be used for monitoring the development of fatty liver.All of this work contributes to the advancement of research on understanding the mechanisms of establishment of hepatic steatosis in mule ducks.; L’objectif principal de cette thèse était de poursuivre les investigations menées sur les mécanismes sous-jacents au développement du foie gras chez le canard mulard. Ce processus appelé stéatose hépatique et induit par le gavage nécessite d’être davantage étudié afin de contribuer à l’optimisation du gavage. Une étude cinétique de l’expression des gènes en lien avec la stéatose hépatique, le métabolisme intermédiaire et le stress cellulaire chez le canard mulard a permis de mettre en évidence, outre la forte mobilisation des métabolismes glucidique et lipidique, une induction significative de la voie de signalisation de l’insuline mTOR et l’activation de mécanismes de protection cellulaire au sein des hépatocytes leur permettant de lutter contre l’apport accru d’amidon apporté par le gavage. Parmi ces différents mécanismes protecteurs, l’autophagie a fait l’objet d’une étude poussée chez des canards gavés dont la stéatose a été à peine induite comparés à des canards non gavés. Les mesures de flux autophagique (LC3-II) ont montré que le gavage induisait une inhibition du processus autophagique dans les hépatocytes de canards mulards dès la phase précoce du développement de la stéatose hépatique. Cette même étude a permis de constater que les mécanismes associés au stress cellulaires tels que le stress oxydant, le stress du réticulum endoplasmique ou encore l’apoptose ne se sont pas induits dès le début du développement de la stéatose hépatique mais bien plus tardivement. Il en est de même pour l’impact du gavage sur la voie mTOR. Par ailleurs, l’étude cinétique a également permis de mettre en évidence l’induction significative du métabolisme du cholestérol corrélé au gain de poids de foie des canards au cours du gavage. Ces résultats ont suscité l’intérêt de rechercher des biomarqueurs plasmatiques du développement de la stéatose hépatique en lien avec le métabolisme du cholestérol parmi les microARNs. Ainsi, le miRNome plasmatique du canard a été séquencé et a permis de définir les microARNs les plus différentiellement exprimés dans le plasma des canards mulards mais également de déceler des microARNs (miR-122, miR-107 et miR-194) candidats comme potentiels biomarqueurs utilisables pour le suivi du développement du foie gras.L’ensemble de ces travaux contribuent à l’avancée de la recherche sur la compréhension des mécanismes de l’établissement de la stéatose hépatique chez le canard mulard.

Viruses are obligatory intracellular parasites that rely on a wide range of cellular factors to successfully accomplish their infectious cycle. Among those, micro (mi)RNAs have recently emerged as important modulators of viral infections. These small regulatory molecules act as repressors of gene expression. During infection, miRNAs can function by targeting either cellular or viral RNAs. In this review, we will recapitulate what has been reported to date on this interplay between cellular miRNAs and viruses and the effect on the infection. Furthermore, we will briefly discuss the possibilities of interfering with the infection through the modulation of this pathway to develop novel antiviral therapies.Importance des microARN cellulaires dans la régulation des infections virales.Parasites intracellulaires obligatoires, les virus dépendent d’un grand nombre de facteurs cellulaires pour accomplir leur cycle de multiplication. Parmi ceux-ci, les microARN (miARN) ont récemment émergé comme d’importants modulateurs des infections virales. Ces petites molécules régulatrices agissent comme des répresseurs de l’expression des gènes. Au cours de l’infection, ils peuvent agir sur des ARN cibles d’origine cellulaire mais aussi virale. Cette synthèse fait le point sur les différents mécanismes, directs et indirects, impliquant ces miARN dans la régulation des virus et aborde les possibles applications thérapeutiques qui peuvent en découler.

The oligometastatic paradigm refers to an intermediate biologic state of cancer with restricted metastatic capacity. Its phenotype is characterized by a limited number of metastases and a slow tumor growth. Various clinical and pre-clinical studies associated this state to alterations of the biological mechanisms involved in metastatic diffusion. Eventually, this transitional state leads to a wide metastatic dissemination. However, there is a period during which the patient could benefit from local ablative treatment. Depending on several prognostic factors and the treatment provided, long survival or even healing can sometimes be achieved. The selection of patients eligible for such a curative strategy may be adapted following clinical, radiological or biological markers. Recent improvement of therapeutic and imaging are changing the clinical definition of oligometastatic cancer, which should be adapted to evidence from recent clinical and preclinical data.

Synaptic scaling is a form of homeostatic plasticity where synapses adjust their own efficacy to compensate for normal or pathological variations in neuronal activity such as neurodegenerative disorders or sensory deprivation after a lesion. In a well-established paradigm, the chronic application of tetrodotoxin (TTX) in primary neurons, to block presynaptic action potential propagation, induces a significant upscaling of miniature excitatory postsynaptic currents mediated-AMPA receptors. Numerous regulators of this plasticity have been identified including microRNAs (miR), which are small endogenous non-coding RNAs, inhibiting protein translation by binding to mRNA targets. This led us to hypothesize that the most highly expressed microRNA in the brain, miR-124, could be an important regulator of homeostatic scaling by controlling the expression of synaptopodin, a structural protein of dendritic spines playing a crucial role in homeostatic plasticity.By combining qRT-PCR, immunocytochemistry and in vitro electrophysiology approaches, first we showed that a global 48hrs TTX treatment in hippocampal primary neurons led to a decrease in miR-124 level and an increase in the expression of synaptopodin and synaptic AMPA receptors containing the GluA2 subunit which is another miR-124 target. Moreover, we observed that the synaptic accumulation of AMPA receptors and synaptopodin could be synapse-specific by expressing the tetanus toxin to block the activity of individual presynapses, which suggested a local homeostatic regulation. Importantly, we found that overexpressing miR-124 or inhibiting its interaction with synaptopodin or GluA2 mRNAs blocked the synaptic homeostatic response. In addition, FRAP experiments suggested that synaptopodin controlled AMPA receptor trafficking at the membrane by probably retaining them in dendritic spines, which could explain its role during homeostatic plasticity., Le synaptic scaling est une forme de plasticité homéostatique par lequel les synapses ajustent leur efficacité pour compenser des variations normales ou pathologiques de l'activité neuronale notamment lors des maladies neurodégeneratives ou suite à la perte d’afférences sensorielles après une lésion. Dans un modèle expérimental classique, le traitement chronique des neurones primaires avec la tétrodotoxine (TTX) pour bloquer la propagation des potentiels d'action présynaptiques induit une augmentation significative de l'amplitude des courants miniatures excitateurs transmis par les récepteurs du glutamate AMPA postsynaptiques. Plusieurs voies de signalisation ont été proposées, dont celle impliquant les microARNs (miRs), de petits ARN non-codants qui inhibent la traduction des protéines en se liant aux ARN messagers cibles. Dans ce contexte, nous avons exploré l'hypothèse que le microARN, miR-124, fortement exprimé dans le cerveau, pourrait être un régulateur important de l'homéostasie synaptique en contrôlant l'expression de la protéine synaptopodine, une protéine structurante des épines dendritiques et indispensable à l'expression du synaptic scaling.En combinant des approches de RTq-PCR, d'immunocytochimie et d'électrophysiologie in vitro, nous avons montré dans un premier temps que la privation globale de l'activité des neurones primaires d’hippocampe diminuait le niveau d'expression de miR-124 et augmentait celui de la synaptopodine et des récepteurs AMPA dont la sous-unité GluA2 est une autre cible de miR-124. Par ailleurs, en rendant des synapses individuelles inactives via l’expression présynaptique de la toxine tétanique, nous avons observé que le recrutement synaptique des récepteurs AMPA et de la synaptopodine était spécifique de ces synapses, suggérant une régulation homéostatique locale. Dans un deuxième temps, nous avons trouvé que la surexpression de miR-124 ou l’inhibition de son interaction avec l’ARNm de la synaptopodine ou de GluA2 bloquaient la réponse synaptique homéostatique induite par le traitement TTX. Enfin, des expériences de FRAP ont suggéré que la synaptopodine influençait le trafic des récepteurs AMPA à la membrane probablement en les stabilisant à la synapse, ce qui expliquerait ainsi son rôle pendant la plasticité homéostatique.

Juvenile idiopathic arthritis (JIA) is a heterogeneous group of chronic inflammatory rheumatism affecting children under 16 years of age. This inflammatory disorder of unknown origin is characterized by arthritis lasting more than 6 weeks in the absence of treatments.In order to highlight mechanisms involved in the pathophysiology of JIA, an inclusion of patients suffering from septic arthritis, another form of juvenile arthritis, was performed. In parallel, comparative studies between the peripheral blood (PB) and the synovial fluid (SF) of patients with JIA were carried out in order to search for mechanisms specific of joint disturbances.We focused on monocytes and dendritic cells (DCs) subsets as well as the expression patterns of microRNAs (miRNAs) in the PB and SF of patients. These different biological markers are known to play a major role both in the regulation of inflammation and the pathogenesis of inflammatory diseases.Analysis of miRNA expression by a high-throughput sequencing approach followed by RT-qPCR validation revealed specifically deregulated miRNAs in JIA compared to AS. In addition, the phenotypic characterization of myeloid cell subpopulations showed an accumulation and activation profile specific of JIA cells. Overall, this project allowed me to identify different cellular and molecular actors that might be involved in the pathophysiology of JIA., L’arthrite juvénile idiopathique (AJI) est un groupe hétérogène de rhumatismes inflammatoires chroniques affectant les enfants de moins de 16 ans. Cette atteinte inflammatoire d’origine inconnue est caractérisée par une arthrite persistant plus de 6 semaines en l’absence de traitements.Afin de mettre en évidence des mécanismes impliqués dans la physiopathologie de l’AJI, une inclusion de patients atteints d’une autre forme d’arthrite juvénile, à savoir l’arthrite septique, a été effectuée. En parallèle, des études comparatives entre le sang périphérique (SP) et le liquide synovial (LS) des patients atteints d’AJI ont été réalisées afin de rechercher des mécanismes spécifiques aux perturbations articulaires. Un intérêt particulier a été porté sur les sous-populations de monocytes et de cellules dendritiques (DCs) ainsi que les profils d’expression des microARNs (miARNs) dans le sang périphérique et le LS des patients. Ces différents marqueurs biologiques ont été choisis car ils jouent un rôle majeur à la fois dans la régulation de l’inflammation et la pathogénèse des maladies inflammatoires.L’analyse de l’expression des miARNs par une approche de séquençage à haut débit suivie d’une validation par RT-qPCR a mis en évidence des miARNs dérégulés de façon spécifique dans l’AJI par rapport à l’AS. De plus, la caractérisation phénotypique des sous-populations de cellyles myéloïdes a montré une accumulation et une activation cellulaire propre à l’AJI. Dans l’ensemble, ce projet m’a permis d’identifier différents acteurs cellulaires et moléculaires pouvant être impliqués dans la physiopathologie de l’AJI.

The majority of gene expression studies focus on looking for genes whose mean expression is different when comparing two or more populations of samples. In this context, the variance is treated as a parameter to be controlled. However, similarly to a difference of mean, a difference of variance in gene expression between sample populations may also be biologically and physiologically relevant.MicroRNAs (miRNAs) are key gene expression regulators. The large number of their targets and the fine tuning of their regulation confer to miRNAs a buffering role. The objective of my thesis is to study the variance in expression of miRNAs and messenger RNAs (ARNm), especially those targeted by miRNAs, in particular during cancerogenesis. We hope that this approach can identify genes which cannot be identified by the tradional differential expression analysis and yet serve as potential biomarkers or therapeutic targets. Furthermore, by combining both miRNA and mRNA expression and analyzing their variance at a system level, we aim at better characterize the buffering role of miRNAs.Several methods including statistical tests of equality of variance and models based on the negative binomial distribution were evaluated. The performances of these methods were thoroughly tested on simulated datasets. Then, they were applied to The Cancer Genome Atlas datasets in order to identify genes with a differential expression variance when comparing normal and tumor samples. Many miRNAs and mRNAs with an increase of expression variance in tumors were detected. Interestingly, among these mRNAs, some key biological functions such as catabolism or autophagy are over-represented in most cancers. Thus, analyzing genes having a differential expression variance is relevant to gain knowledge in tumor progression and opens a new space for the discovery of new potential biomarkers and therapeutic avenues., La majorité des études sur l’expression des gènes cherchent à identifier des gènes présentant des différences de moyenne d’expression entre plusieurs populations d’échantillons. Dans ce cadre, la variance est considérée comme un paramètre à contrôler. Cependant, à l’instar d’une différence de moyenne, une différence de variance d’expression de gènes entre populations d’échantillons peut avoir un sens biologique et physiologique.Les microARN (miARN) sont d’importants régulateurs de l’expression des gènes. Le nombre important de leurs cibles et leur mode d’action confèrent aux miARN un rôle tampon. L’objectif de ma thèse est d’étudier la variance d’expression des miARN et des ARN messagers (ARNm), en particulier ceux ciblés par des miARN, durant la cancérogénèse. Nous espérons que cette approche permettra d’identifier des gènes qui ne peuvent pas être détectés par l’analyse classique de différence de moyenne d’expression et qui pourraient servir de biomarqueurs potentiels ou de cibles thérapeutiques. En outre, en combinant l’expression de miARN et d’ARNm et en analysant leur variance à une échelle systémique, nous espérons pouvoir mieux caractériser le rôle tampon des miARN.Plusieur méthodes incluant des tests statistiques d’égalité de variance et des modèles basés sur la distribution binomiale négative ont été évaluées. Les performances de ces méthodes ont été étudiées en détails à l’aide de jeux de données simulées. Par la suite, elles ont été appliquées aux jeux de données The Cancer Genome Atlas dans le but d’identifier des gènes ayant une différence de variance d’expression entre échantillons sains et tumoraux. De nombreux miARN et ARNm présentant une augmentation de leur variance d’expression dans les tumeurs ont été détectés. Pour la plupart des cancers, certaines fonctions biologiques importantes telles que le catabolisme ou l’autophagie sont sur-représentées parmi ces ARNm. Ainsi, analyser des gènes différentiellement variants semble être une approche pertinente pour avoir une meilleure compréhension de la progression tumorale et devrait être prise en compte dans le cadre de la recherche de nouveaux biomarqueurs et cibles thérapeutiques potentiels.

Brown adipose tissue (BAT) has grown over the last ten years into the center of interest for many laboratories due to its capacity to burn energy derived from metabolic substrates into heat. Indeed, in mammals, the development of BAT occurs at the end of gestation to become fully functional at birth. Its thermogenic capacity allows newborns to face extrauterine environment, and thereafter its activity declines with age. This suggests that the intrauterine environment plays an important role in the programming of BAT physiology and metabolism. In a well-known model of intrauterine growth retardation (IUGR), the maternal protein restriction model (called LP for low protein), the young LP progeny is normoglycemic despite an insulin secretion defect but develops insulin resistance and hyperglycemia with age. When I started my thesis work, available results in the laboratory suggested a role of BAT in the dynamic changes of the LP progeny metabolic profile according to the age. Indeed, BAT of young LP rats is hyperactive at 3 months compared to controls while this activity drops back to control levels in old 18-months LP progeny, consistent with the appearance of a type 2 diabetic phenotype. During my thesis, the first objective was to search for the causal role of BAT in the maintenance of glucose homeostasis in young LP progeny. Using a first strategy, we exposed young LP progeny to a cold challenge to activate their BAT. In a second approach, we performed surgical ablation of their BAT. Our results show that young LP progeny is more protected against a cold challenge than controls, due to the high thermogenic capacity of their BAT. However, BAT ablation induces hyperglycemia in young LP animals showing that this tissue is required to maintain their normoglycemia. This work, published in Diabetes in March 2017, suggests that a deleterious fetal environment could reprogram BAT metabolism. The second objective of my thesis was to identify the molecular mechanisms allowing the maintenance of active BAT in young LP progeny. To do so, we compared two models of BAT activation, ie our LP model and a well-known model of BAT activation with an agonist of β-3 adrenergic receptors. In both cases, when BAT is active, we observed a global increase in microRNA (miRNA) expression associated to augmented miRNA machinery expression, and in particular AGO2 expression. Interestingly, when BAT is inactive in old LP animals, miRNA expression and miRNA machinery expression return to control levels. While activation of mature brown adipocytes in vitro leads to an increase in AGO2 protein expression, partial deletion of this protein is sufficient to decrease the thermogenic activity of these cells. Collectively our data suggest that AGO2 and increased miRNA expression contribute to BAT activation. The manuscript concerning this research is in the review process at Molecular Metabolism. In the third part of my PhD research efforts, I have found that in the BAT of young LP progeny several miRNAs are robustly downregulated. We have focused on let-7cp and miR-22-3p, which have the most severe decrease in expression. Our key finding is that these two miRNAs act synergistically to hinder mature brown adipocyte thermogenic activity. This work is in the process of being finalized for publication. In conclusion, during my PhD training I have revealed several novel findings, which lead to a better understanding of BAT physiology and its dysregulation in situations eventuating in perturbed glucose homeostasis. While additional efforts are certainly needed, these contributions advance our vision to leverage BAT as a promising target for the prevention and/or treatment of metabolic perturbations associated to obesity and type 2 diabetes.; Le tissu adipeux brun (TABr) est devenu ces dix dernières années le centre d’intérêt de nombreux laboratoires en raison de sa capacité à dissiper l’énergie apportée par les substrats sous forme de chaleur. Chez les mammifères, le développement du TABr intervient à la fin de la gestation et devient fonctionnel à la naissance. Sa capacité thermogénique permet aux nouveau-nés de s’adapter face à l'environnement extra-utérin, puis son activité régresse avec l’âge. Ceci suggère que l’environnement intra-utérin joue un rôle important dans la programmation de la physiologie et du métabolisme du TABr. Dans un modèle bien décrit de retard de croissance intra-utérin, qu’est la carence protéique maternelle (CP), la jeune progéniture CP est normoglycémique malgré un défaut de sécrétion de l'insuline mais développe avec l'âge une résistance à l'insuline et une hyperglycémie. Lors de mon arrivée au laboratoire, des résultats suggéraient un rôle du TABr dans les changements dynamiques du profil métabolique de la progéniture CP en fonction de l'âge. En effet, le TABr des rats CP est hyperactif à 3 mois par rapport aux animaux contrôles alors qu’il revient au niveau des contrôles chez la progéniture CP âgée de 18 mois, ce qui corrèle avec l’apparition des troubles métaboliques caractéristiques du diabète de type 2. Durant ma thèse, mon premier objectif a été de démontrer le rôle causal du TABr dans le maintien de l’homéostasie glucidique chez les jeunes animaux CP. Pour ce faire, nous avons exposé au froid de jeunes rats CP pour solliciter leur TABr et nous avons procédé à l’ablation chirurgicale de ce tissu. Nos résultats montrent que la jeune progéniture CP est mieux protégée que les contrôles à une exposition au froid grâce à l’activité thermogénique accrue de leur TABr.

National audience; 85% of patients affected by pancreatic adenocarcinoma (PDA) are diagnosed at an advanced stage, preventing effective care and curative treatments. Therefore, it is urgent to identify reliable biomarkers for the early detection of disease status, including relapse. MiRNAs (micro ribonucleic acids) are biomarkers of PDA, with demonstrated clinical value for early detection of tumors and monitoring of response to treatment. However, current methods of extraction and detection of miRNA are not compatible with clinical use. New technologies derived from micro and nanofabrication methods have the potential to facilitate the implementation of diagnostic tests, by offering a high degree of portability and robustness, short time to results at low cost. Here, we propose a nanofluidic platform coupled to fluorescence detection for the real time measurement of molecular interactions in a confined environment. We first describe the detection platform via a one-dimension theoretical model based on molecular dynamics to predict the capture of miRNAs into biofunctionalized nanochannels. The originality of the system lies in the non-homogeneous hybridization of miRNA targets onto the sensor. We demonstrate that the analysis of the spatial hybridization profile enables the determination of the affinity of the captured miRNA with the probe sequence in a wash-free single step. We then show the rapid discrimination (less than 10 minutes) of single nucleotide difference (SND) using this strategy. The performance of the device in the context of pancreatic cancer detection is discussed: the effect of sample preparation of complex biofluids is studied and two labeling approaches compatible with the detection of endogenous miRNAs are described and compared, leading to the detection of miRNAs extracted from model cell cultures of pancreatic cancer.; 85% des patients atteints de cancer du pancréas présentent au diagnostic des formes avancées de la maladie qui empêchent leur prise en charge thérapeutique efficace. Il est donc urgent de mettre en évidence des marqueurs diagnostics permettant de détecter plus tôt ces cancers, mais également leur rechute, afin d’améliorer leur prise en charge. Les miARNs (micro acides ribonucléiques) sont des biomarqueurs du cancer du pancréas, présentant une valeur clinique démontrée pour la détection précoce des tumeurs et le suivi de la réponse au traitement. Cependant, les méthodes actuelles d’extraction et de détection de ces molécules ne sont pas adaptées à une utilisation clinique. Les nouvelles technologies issues des méthodes de micro et nanofabrication ont le potentiel de permettre la mise en place de tests diagnostiques, offrant un haut degré de portabilité et de robustesse, une lecture en temps réel, et à bas coût. Nous proposons ici une plateforme nanofluidique couplée à une détection en fluorescence permettant la mesure en temps réel d’interactions moléculaires en milieu hyper-confiné. Nous décrivons dans un premier temps la plateforme de détection via un modèle théorique à une dimension basé sur la dynamique moléculaire permettant de prédire la capture spécifique des miARNs dans un nanocanal fonctionnalisé. L’originalité du système réside dans une accroche non homogène des miARNs sur la surface du capteur. Ainsi, nous démontrons que l’étude du profil spatial d’hybridation engendré permet de déterminer l’affinité du miARN capturé avec la séquence sonde en une seule étape, sans lavage. Nous démontrons également l’excellente spécificité du biocapteur qui permet la discrimination rapide (moins de 10 minutes) de SND (single nucleotide difference). Les performances du dispositif pour des applications au plus près des problématiques biologiques dans le cadre de la détection du cancer du pancréas sont enfin discutées : les effets de la préparation d’échantillon types biofluides complexes sur l’extraction de miARNs sont étudiés, puis deux approches permettant la détection de miARNs endogènes sont décrites et comparées, conduisant à la détection de miARNs extraits de cultures cellulaires modèles du cancer du pancréas.

Graves' thyroiditis is a frequent disease. It has a considerable impact on patient's life quality and health expenses. Thus, it is important to optimize the treatment and follow up. The identification of new factors predisposing to the disease and factors that may help to predict the severity or recurrence of the disease or the occurrence of graves' orbitopathy could optimize the management. Genetic predisposition has a major role in the development of Graves' disease. The new genes in addition to those already known to be involved in Graves' disease are under study. However, genetic predisposition alone cannot explain the occurrence of the disease. MicroRNAs are non-genetic factors that are significantly associated with different severities or relapses of Graves' disease as well as with the occurrence of graves' orbitopathy. These genetic and epigenetic factors together with known environmental factors can be used to predict the risk of relapse of Graves' disease or of the occurrence of orbital orbitopathy. This will lead to new promising therapeutic targets.

miR-202, un microARN clé pour le succès reproducteur des femelles chez le poisson médaka. Journées d'Animation Scientifique du département Phase (JAS Phase 2018)

In recent years, the discovery of small non-coding RNAs has opened an all new field in molecular biology. Indeed, these non-coding sequences give rise to powerful regulators of gene expression. Nowadays, different types of small non-coding RNAs have been described. Of these, the best-characterized types are microRNAs, piRNAs (Piwi-interacting RNAs) and siRNAs (small interfering RNAs). Because of their fine-tuning important function in the regulation of gene and genome expression, an aberrant expression level of those small non-coding RNAs are associated to several pathologies. While this new research field is attracting attention, many aspects to be discovered. This review focuses on the biogenesis pathways of microRNAs, piRNAs and siRNAs in animals.

Multi-omics high throughput analyses lead to the description of multiple molecular subtypes of pancreatic adenocarcinoma with major prognostic impact for most of them. There is no consensual multilevel integrative classification yet like in colon or breast cancers. Genomic classifications have identified a tumor subtype (15% of the patients) with deficient homologous DNA repair-system leading to increase sensitivity to platinum-based therapies and possibly to PARP inhibitors and immunotherapies. Transcriptomic classifications are still debated but all have identified an aggressive subtype with a very poor prognosis, presumably unfit for a surgical approach. Finally, approaches based on metabolomic or proteomic profiling have identified subtypes with a particular sensitivity to compounds targeting the hallmarks metabolomics or oncogenic pathways of each subtype. These classifications were mostly based on tumor cell but the micro-environment is also very heterogeneous and several types of stroma will be described soon. Subtype determination in daily practice remains a major challenge as most technologies used to build these classifications are very expensive, requires dedicated bio-informatics analysis pipelines and are not adapted to routine samples that are mostly formal in fixed paraffin embedded biopsies, in which tumor cells are highly contaminated by the cell from the microenvironment and the clot.

MicroRNAs are small non-coding RNAs that modulate gene expression post-transcriptionally. Discovered more than 15 years ago, their functions start to be unraveled. Increasing evidence points to an important functional role of microRNAs in brain development. In particular, miRNAs have recently been established to play a vital role in the mechanisms underlying the infantile rise in gonadotropin-releasing hormone (GnRH) production by neurons in the hypothalamus, a phenomenon necessary for the onset of puberty in mammals.

Schizophrenia and other psychoses are categorical psychiatric diagnoses corresponding to frequent and heterogeneous disorders. Their physiopathology still remains largely unknown despite numerous recent advances. In particular, the last decade has identified different types of genetic variants, thanks to emergence of high-throughput methods. These methods allow both the identification of rare variants with a large effect such as punctual mutations or copy-number variants and the identification of frequent variants with a limited effect such as polymorphisms. Many impacted genes have been identified showing a very high genetic heterogeneity of psychoses. These genes are overrepresented in synaptic and neurotransmission pathways. Only a small fraction of psychoses could be easily explained by genetics but this screening in clinical practice is important as it can lead to therapeutic challenge or genetic counselling. Nowadays, it is clear that the pathophysiology of the psychoses can only be understood by an integrative approach taking into account the interaction between genes and environment. This interaction could be mediated by the epigenome defined as the modification of gene expression without changes in DNA sequence. Epigenome is stable but could be modified by environmental factors. Several epigenetic mechanisms have been studied in psychosis, in particular the DNA methylation, the modification of histones and the microRNA. All of these mechanisms are under regulation by genetic factors and variants in these epigenetic-involved genes and cofactors have been also associated with schizophrenia. Thus, pathophysiology of psychosis is complex and morestudiesare needed before definitive conclusions. Altogether, the recent advances in the genetics and epigenetics of psychosis are promising and could open the way to a recategorization of these disorders as well as the identification of new therapeutic targets.

Les globules gras comme source non-invasive de microARN mammaires. 23. Rencontres autour des Recherches sur les Ruminants

Hepatoblastoma (HBL) is the most common pediatric liver cancer. At molecular level it is characterized by activating mutations in β-catenin gene (CTNNB1) that cause protein accumulation and abnormal Wnt signaling pathway activation leading to malignant transformation of hepatic cells. Therefore, β-catenin is a key therapeutic target in HBL.This manuscript describes two major parts of my thesis project that aimed to understand the role of β-catenin-regulating microRNAs in HBL carcinogenesis.The first part presents the development of a new in vivo HBL model. This work consisted of making HBL-derived cells xenograft on chick embryo chorioallantoic membrane (CAM) and studying tumor development using histological and molecular approaches. My results show that HBL cells implanted on CAM modify their phenotype and activate survival and proliferation mechanisms to form organized and vascularized tumor nodules. Cell treatment with cisplatin leads to tumor progression arrest.The second part presents results concerning the regulation of β-catenin and oncogenic processes by microRNAs in HBL cells. A functional screening allowed me to identify several microRNAs with an inhibitory effect on β-catenin. Four microRNAs down-regulated in patient tumors inhibit cell proliferation and Wnt pathway activity in vitro. The most efficient microRNA directly interacts with β-catenin mRNA through a unique site localized in 3’ untranslated region and blocks HBL tumor growth on CAM.During my thesis I developed a new animal model to study HBL that allows modelling rapid tumor growth and testing the impact of therapeutic molecules. My work also led to the identification of new microRNAs down-regulated in HBL tumors that inhibit β-catenin expression and act as tumor suppressor genes. Those microRNAs represent new potential therapeutic molecules for HBL treatment and could be also used as diagnostic and prognostic biomarkers., Nouveau modèle d’étude de l’hépatoblastome in vivo et identification de microARNs régulateurs de la β-caténineL’hépatoblastome (HBL) est le cancer du foie le plus fréquent chez l’enfant. Au niveau moléculaire, il est caractérisé par des mutations activatrices dans le gène de la β-caténine (CTNNB1) entrainant une accumulation de sa protéine et une activation anormale de la voie de signalisation Wnt, responsables de la transformation maligne des cellules hépatiques. Ainsi, la β-caténine est une cible thérapeutique majeure dans l’HBL.Ce manuscrit décrit les deux parties principales de mon projet de thèse, dont l’objectif était d’étudier le rôle de microARNs régulateurs de la β-caténine sur la carcinogenèse de l’HBL.La première partie présente le développement d’un nouveau modèle d’étude in vivo de l’HBL. Ce travail a consisté à réaliser des xénogreffes de cellules dérivées d’HBL sur la membrane chorioallantoidienne (CAM) de l’embryon de poulet, et à étudier le développement des tumeurs par des approches histologiques et moléculaires. Mes résultats montrent que les cellules d’HBL modifient leur phénotype et activent des mécanismes de survie et de prolifération pour former des nodules tumoraux structurés et vascularisés au sein de la CAM. Le traitement des cellules par le cisplatine conduit à un arrêt net de la progression tumorale.La seconde partie présente les résultats concernant la régulation de la β-caténine et des processus oncogéniques par les microARNs dans les cellules d’HBL. Un crible fonctionnel m’a permis d’identifier plusieurs microARNs ayant un effet inhibiteur sur la β-caténine. Quatre microARNs, sous-exprimés dans les tumeurs de patients, bloquent la prolifération cellulaire et l’activité de la voie Wnt in vitro. Le miARN le plus efficace interagit avec l’ARNm de la β-caténine via un site unique localisé dans sa région 3’ non traduite et bloque la croissance des tumeurs d’HBL sur la CAM.Durant ma thèse j’ai développé un nouveau modèle animal d’étude de l’HBL qui permet de modéliser la croissance tumorale et de tester l’impact de molécules thérapeutiques. Ce travail a également permis d’identifier de nouveaux microARNs sous-exprimés dans les tumeurs d’HBL, qui inhibent l’expression de la β-caténine et agissent comme des gènes suppresseurs de tumeur. Ces microARNs constituent de potentielles nouvelles molécules thérapeutiques dans le traitement de l’HBL et pourraient aussi être utilisés comme des biomarqueurs diagnostiques et pronostiques.

The ALK oncogene (Anaplastic Lymphoma Kinase) is a constitutively activated tyrosine kinase implied in various cancers including Anaplastic Large Cell Lymphomas (ALCL), or some lung adenocarcinomas. The current operative treatment is standard chemotherapy, which is not optimal (30% of relapses, low quality of life). In this context, new specific ALK inhibitors such as Crizotinib have been developed, and have showed their efficiency in vitro, in vivo and in patients. However, the emergence of resistant mutations has been described. Thus, the identification of alternative therapies targeting new pathways appears as mandatory to counteract those resistances. In this context, autophagy, an intracellular catabolic lysosomal process, has been described as a new therapeutic target in the treatment of cancers resistant to tyrosine kinase inhibitors. The first aim of my project was to characterize the autophagic process in ALK+ ALCL, upon different treatments. We showed that (1) autophagy was activated in ALK+ ALCL cell lines in response to ALK inhibition (2) that this autophagy played a cytoprotective role in our model and (3) that treatment with chemotherapies did not trigger an autophagic response. In a second part of the project, we focused on the potential regulation of autophagy by microRNAs. We showed that several microRNAs including miR-7 were down-regulated upon Crizotinib treatment and that ectopic re-expression of this miR-7 potentiates the effects of Crizotinib by induction of cytotoxic autophagy in our model. We hypothesized that this switch in the role of autophagy from cytoprotection to cytotoxicity observed in our model, could be explained by the regulation of several protein targets of miR-7 such as Bcl-2 or c-Raf. Altogether, these results enable a better understanding of the role and regulation of autophagy induced upon ALK inhibition in ALCL, and could in the longer term, contribute to improvement of current therapies of cancers involving the ALK oncogene.; L'oncogène ALK (Anaplastic Lymphoma Kinase) est une tyrosine kinase constitutivement active, impliquée dans divers cancers, tels que les lymphomes anaplasiques à grandes cellules (LAGC), ou certains carcinomes bronchiques. Ces tumeurs sont traitées par chimiothérapie, ce qui n'est pas un traitement optimal (30% de rechutes, abaissement de la qualité de vie). Dans ce contexte, de nombreux inhibiteurs spécifiques de la tyrosine kinase ALK tels que le Crizotinib ont été développés et ont prouvé leur efficacité à la fois dans des modèles in vitro, in vivo ainsi que chez les patients. Néanmoins, le succès de cette thérapie ciblée est limité par l'apparition de résistances. Il est donc essentiel de mettre au jour de nouvelles stratégies thérapeutiques permettant de contrecarrer ces résistances. Récemment, l'autophagie, un processus catabolique intracellulaire de dégradation lysosomale, a été proposée comme nouvelle cible thérapeutique dans le traitement des cancers résistants aux inhibiteurs de tyrosine kinase. Le premier objectif de mon projet de thèse a été de caractériser ce processus autophagique dans les LAGC ALK+, en réponse à différents traitements. Nous avons montré que (1) l'autophagie était activée dans des lignées de LAGC en réponse à l'inhibition de ALK, (2) que cette autophagie jouait un rôle cytoprotecteur dans ce modèle et (3) que les traitements par chimiothérapies de ces cellules n'induisaient pas de réponse autophagique. Dans un deuxième temps, nous nous sommes intéressés à la régulation potentielle de l'autophagie par les microARNs. Nous avons montré que plusieurs microARNs, dont le miR-7, étaient sous-exprimés en réponse au traitement par le Crizotinib et que la réexpression ectopique de ce miR-7 permettait une potentialisation de l'effet du Crizotinib, par l'induction d'autophagie cytotoxique dans notre modèle. Nous avançons également l'hypothèse que le " switch " autophagique de la cytoprotection à la cytotoxicité, que nous observons pourrait s'expliquer par la régulation de l'expression de plusieurs protéines cibles de miR-7 telles que Bcl-2 ou c-Raf. Ainsi, l'ensemble de nos résultats nous permettent de mieux comprendre le rôle et la régulation de l'autophagie induite en réponse à l'inhibition de ALK dans les LAGC ALK+, et pourrait à terme contribuer à l'amélioration des thérapies actuelles de divers cancers dépendants de l'oncogène ALK.

MicroRNAs are nucleic acids of about twenty nucleotides that regulate about a third of the genome at the post-transcriptional level. Thanks to their different forms of transport, microRNAs are stable and can be detected in biological fluids such as blood, urine, cerebrospinal fluid, or saliva. In addition, the profile of circulating microRNAs is a specific part of the cells in which it is secreted and is modified according to the physiological or pathological conditions of these cells. MicroRNAs therefore appear as biomarkers of interest for many diseases. However, these applications face several challenges because there are currently considerable differences between the sample processing procedures, assay methods, and especially the result standardization strategies. This literature review aims to take stock of the current use of microRNAs as biomarkers mainly in biological fluids and address the perspectives that emerge from the fact that their vesicular circulating forms could be used to assess the state of the cells and the tissues that produce them.

Approximate string matching consists in identifying the occurrences of a motif within a text, modulo a given distance. This problem has many applications in bioinformatics for the analysis of biological sequences. For instance, microRNAs are short RNA molecules regulating the expression of genes by specific recognition of their sequence motif on the target gene. Understanding the mode of action of microRNAs requires the ability to identify short motifs, around 21 nucleotides in size, comprising up to 3-4 errors in a text whose size is in the order of 108-109 , representing a genome. In this thesis, Ihave proposed an efficient algorithm for the approximate search of short motifs. This algorithm is based on a new type of seeds containing errors, the 01∗ 0 seeds, and uses a compressed index structure, the FM-index. I have implemented this algorithm in a freely available software, Bwolo. I demonstrate experimentally the advantage of this approach and compare it to the state of the art of existing tools. I also show how Bwolo can be used and have set up an original study on the distribution of potential miRNA target sites in two plant genomes, Arabidopsis thaliana and Arabidopsis lyrata.; La recherche de motifs approchée consiste à identifier les occurrences d’un motif modulo une certaine distance au sein d’un texte. Ce problème trouve de nombreuses applications en bio-informatique pour l’analyse de séquences biologiques. Par exemple, les microARN sont des petits ARN qui régulent l’expression des gènes par reconnaissance d’un motisimilaire. Comprendre le mode d’action des microARN demande de pouvoir localiser de courts motifs, environ 21 nucléotides, comprenant jusqu’à 3 ou 4 erreurs dans un texte de l’ordre de 108 à 109 nucléotides, représentant un génome. Dans cette thèse, nous proposons un algorithme efficace pour la recherche de motifs approchée, qui se base sula définition d’un nouveau type de graines avec erreurs, les graines 01∗0, et qui exploite une structure d’index compressée, le FM-index. Cet algorithme a été mis en œuvre dans un logiciel librement disponible, appelé Bwolo. Nous démontrons expérimentalemenl’avantage de cette approche en nous comparant à l’état de l’art des outils existants. Nous montrons également comment utiliser Bwolo pour mettre en place une analyse originale sur l’étude de la distribution des cibles potentielles de miARN dans deux génomes de plantes, Arabidopsis thaliana et Arabidopsis lyrata.

The development of gastric MALT lymphoma (GML) originates from a chronic inflammatory process initiated by Helicobacter pylori.The gastric inflammatory response was investigated in a mouse model of GML previously described by the laboratory using BALB/c mice thymectomized at day 3 post-birth and infected by H. pylori. A deregulation of numerous cytokines and chemokines at GML stage was identified which explained the recruitment, proliferation and emergence of lymphoid infiltrates. The susceptibility of thymectomized mice to develop lymphoma was not linked to a deficiency in regulatory T cells. A deregulation of 5 microRNAs was observed at lymphoma stage. These microRNAs may be involved in cell survival and lymphocyte proliferation and act in synergy to promote the development of GML. Finally, we described an original model of GML based on infection by Helicobacter species of transgenic C57BL6 mice expressing the human form of the cytokine APRIL in T cells. This model is promising for a better understanding of gastric lymphomagenesis., Le développement d’un lymphome gastrique du MALT (LGM) émane d’un processus inflammatoire chronique initié par Helicobacter pylori.A partir du matériel issu d’un modèle animal de LGM, préalablement développé au laboratoire, basé sur des infections chez des souris thymectomisées à la naissance, la réponse inflammatoire gastrique favorable à l’émergence de LGM a été étudiée. Une dérégulation de cytokines et chimiokines au stade LGM a été identifiée permettant de recruter, faire proliférer et faire émerger des infiltrats lymphoïdes. La susceptibilité des souris thymectomisées à développer des lymphomes n’est pas liée à un déficit en lymphocytes T régulateurs. Cinq microARNs ont été retrouvés dérégulés au stade lymphome agissant probablement en synergie pour favoriser la prolifération lymphocytaire en particulier via un mécanisme anti-apoptotique. Enfin, nous décrivons un modèle original de LGM basé sur l’utilisation de souris C57BL6 exprimant la chimiokine APRIL humaine au niveau des lymphocytes T infectées par des espèces du genre Helicobacter. Ce modèle est prometteur pour une meilleure compréhension de la lymphomagénèse gastrique.

In sporadic triple-negative breast cancers BRCA1 is frequently inactivated at the transcriptional level, and it has been reported that this inactivation may be brought about by promoter methylation. More recently, it was found that BRCA1 may also be regulated at the post-transcriptional level by miRNAs. Accumulating evidence indicates that miRNAs have a causal role in tumorigenesis. Our work focused on the study of microRNAs expression and functions in vitro, in silico and ex vivo.Based on our expression profiling results, four candidate miRNAs (miR-10b, miR-26a, miR-146a and miR-153) were selected as being potentially involved in triple-negative breast cancer development. Exogenous expression assays revealed that miR-10b and miR-26a, but not miR-146a, can down-regulate the expression of BRCA1 in both triple-negative MDA-MB-231 and luminal epithelial MCF7 breast cancer-derived cells, whereas miR-153 could down-regulate BRCA1 expression only in MCF7 cells. In silico analysis of The Cancer Genome Atlas (TCGA) data confirmed that miR-146a is significantly higher expressed in triple-negative breast tumors compared to other (non triple-negative) breast tumors. The ex vivo study showed that the high level expression of miR-146a and miR-26 is associated with the absence of lymph node metastasis in triple negative breast cancer. Also a correlation between the expression of the 4 miRNAs was revealed, allowing the identification of different signaling pathways involved in the triple negative breast cancer.Our work provides evidence of the involvement of specific miRNAs as potential biomarkers in breast cancer triple negative development.; Dans les cancers du sein triple négatif sporadiques, BRCA1 est fréquemment inactivé au niveau transcriptionnel, et il a été rapporté que cette inactivation peut être réalisée par une méthylation du promoteur. Plus récemment, il a été constaté que BRCA1 peut également être régulée au niveau post-transcriptionnel par les microARNs. L'accumulation de preuves indique que les miARNs ont un rôle causal dans la tumorigenèse. Nos travaux se sont axés sur l'étude de l’expression et des fonctions des microARN in vitro, in silico et ex vivo.Basé sur nos résultats de profilage de l'expression, quatre miARN candidats (miR-10b, miR-26a, miR-146a et miR-153) ont été choisis comme étant potentiellement impliqués dans le développement du cancer du sein triple négatif. Des essais d'expression exogènes ont révélé que miR-10b et miR-26a, mais pas miR-146a, peuvent réguler négativement l'expression du gène BRCA1 dans les cellules cancéreuses triple négatif MDA-MB-231 et luminales MCF7, alors que miR-153 pourrait réguler négativement l'expression du gène BRCA1 uniquement dans les cellules MCF7. L'analyse in silico des données de Cancer Genome Atlas (TCGA) a confirmé que miR-146a est significativement plus exprimé dans les tumeurs du sein triple négatif par rapport à d'autres tumeurs (non triple négatif) mammaires. L’étude ex vivo a montré que le niveau élévé d’expression de miR-146a et de miR-26 est associé à l’absence des métastases ganglionnaires dans le cancer du sein triple négatif. Aussi une corrélation entre l’expression de 4 miARNs est révélée permettant l’identification de différentes voies de signalisations impliquées dans le cancer du sein triple negatif.Nos travaux fournissent des preuves de l'implication des miARNs spécifiques comme des biomarqueurs potentiels dans le développement du cancer de sein triple négatif.

Myocardial infarction (MI responsible for left ventricular remodeling which can be deleterious and the development of heart failure (HF). HF is one of the leading causes of mortality worldwide and despite many improvements, it remains a major challenge in clinical practice. Recent discoveries in genomics have showed the involvement of non-coding RNAs, including microRNAs (miRNAs) and long non-coding RNAs (lncRNAs), in physiological and pathological processes and notably linked to cardiovascular diseases. The goal of this work was to study the potential of miRNAs and lncRNAs as prognostic and diagnostic biomarkers and as therapeutic targets in MI and left ventricular remodeling leading to HF. First, we evaluated the diagnostic value of miRNAs in patients with chest pain. MiRNA-208b and miR-499 have shown a good diagnostic capacity for MI. However, these miARNs failed to improve the diagnosis of MI by troponins. MiRNA-208b could also predict patient mortality after MI but this capacity was modest. Then, we observed that miR-150 was present at a low level in the blood of patients with left ventricular remodeling post-MI compared to patients without remodeling. Therefore, miRNA-150 is an interesting prognostic biomarker. Finally, we have shown a significant regulation of several lncRNAs in mouse heart, 24 hours after MI, and 2 lncRNAs, MIRT1 and MIRT2, have been demonstrated for their association with left ventricular remodeling. In conclusion, our studies have shown the utility of non-coding RNAs to improve the identification of patients at risk of developing HF after MI and also allowed to identify potential therapeutic targets to prevent left ventricular remodeling, L’infarctus du myocarde (IDM), responsable du remodelage ventriculaire, peut conduire, s’il est délétère, à l’insuffisance cardiaque (IC), principale cause de mortalité à travers le monde. Les récentes découvertes ont montré l’implication des ARNs non codants, microARNs (miARNs) et les longs ARNs non codants (lncARNs), dans les processus physiologiques et pathologiques et notamment dans les maladies cardiovasculaires. L’objectif de ce travail a été d’étudier le potentiel des miARNs et des lncARNs en tant que biomarqueurs pronostiques et diagnostiques ainsi qu’en tant que cibles thérapeutiques dans l’IDM et le remodelage ventriculaire. Dans un premier temps, nous avons évalué le pouvoir diagnostique des miARNs sur une cohorte de patients présentant des douleurs thoraciques. Le miR-208b et le miR-499 ont montré une bonne capacité diagnostique de l’IDM, ne dépassant toutefois pas celle des troponines. Nous avons ensuite observé que le miR-150 présente une plus faible concentration dans le sang de patients avec un remodelage ventriculaire post-IDM par rapport aux patients sans remodelage, le positionnant comme un biomarqueur intéressant dans le pronostic de l’IC. Enfin, nous avons montré une régulation importante de plusieurs lncARNs dans le cœur de souris, 24 heures après IDM et 2 lncARNs, MIRT1 et MIRT2, ont été mis en avant pour leur association avec le remodelage. En conclusion, nos études ont montré l’utilité des ARNs non codants pour améliorer l’identification des patients à risque de développer une IC après IDM et ont permis également de mettre en évidence de nouvelles cibles thérapeutiques qui pourraient prévenir le remodelage ventriculaire post-IDM

The oocyte develops into a follicle where it is in close contact with cumulus cells (CCs), of somatic origin. The two cell types undergo a bidirectional communication via gap junctions, which results in the regulation and coordination of the metabolism during oocyte development and maturation. We assume that gene expression and regulation in the CCs play a crucial role in functions that are essential for oocyte growth and competence acquisition. The present study may be subdivided in two parts. In the first part we used deep sequencing to investigate the repertoire of miRNAs in the cumulus cells and the oocyte. MicroRNAs that are noncoding RNA sequences whose length is approximately 19-25 nucleotides have emerged as important regulators in many biological processes including aging. Our data showed that 32 miRNAs were specifically expressed in human cumulus cells while only 3 miRNAs were identified in MII human oocyte. The impact of maternal age on gene expression in cumulus cells was addressed in a second part of my thesis work. While the correlation of oocyte competence decline with advancing maternal age is well established, little is known on its molecular basis. In a first attempt to address this issue, we used microarrays to study gene expression profiles of human cumulus cells according to maternal age. Remarkably, maternal age greatly impacted expression of genes that are critical for oocyte maturation such as genes involved in angiogenesis, TGF-β signaling, and insulin signaling pathways. Also, using bioinformatic tools, we identified miRNAs that potentially target some of the genes involved in the aging-impacted processes and pathways; this could candidate them as new biomarkers to predict premature ovarian aging and oocyte quality and competence., L'ovocyte se développe au sein d'un follicule, en contact étroit avec des cellules d'origine somatique, les cellules de cumulus (CC). Ces deux types cellulaires communiquent entre eux via des jonctions intercellulaires, permettant ainsi la régulation et la coordination du métabolisme pendant le développement et la maturation de l'ovocyte. Notre hypothèse est que l'expression et la régulation des gènes dans les CC joue un rôle crucial dans des fonctions essentielles pour la croissance de l'ovocyte et l'acquisition de sa compétence. Mes travaux de thèse comportent deux parties. Dans la première partie nous avons utilisé le séquençage haut débit pour examiner le répertoire des microARN (communément appelés miRNA) dans les cellules de cumulus et dans l'ovocyte. Les miRNA, séquences d'ARN non codantes dont la longueur varie entre 19 et 25 nucléotides, ont émergé récemment comme régulateurs majeurs de nombreux processus biologiques, dont le vieillissement. Nous avons identifié 32 miRNA spécifiquement dans les cellules de cumulus humains et seulement 3 dans l'ovocyte MII. Dans la seconde partie de nos travaux, nous avons analysé l'impact de l'âge maternel sur l'expression des gènes dans les cellules de cumulus. Alors qu'une baisse de la compétence de l'ovocyte avec l'avancement de l'âge maternel est bien établie, les bases moléculaires de ce phénomène demeurent peu connues. Dans une première étape pour aborder cette question, nous avons utilisé des puces à ADN pour analyser les profils d'expression des gènes des CC en fonction de l'âge maternel. De façon remarquable l'âge maternel impacte significativement l'expression de gènes qui sont critiques pour la maturation de l'ovocyte tels que les gènes impliqués dans l'angiogenèse, les voies de signalisation de TGF-ß et de l'insuline. Par l'utilisation d'outils bioinformatiques, nous avons aussi identifié des miRNA potentiels régulateurs de gènes impliqués dans des processus ou des voies impactés par l'âge ; ils pourraient constituer de nouveaux biomarqueurs pour prédire un vieillissement ovarien prématuré ainsi que la qualité et la compétence de l'ovocyte.

International audience; Circulating nucleic acids (cell-free DNA and microRNAs) have for particularity to be easily detectable in the biological fluids of the body. Therefore, they constitute biomarkers of interest in female and male infertility care. Indeed, in female, they can be used to detect ovarian reserve disorders (polycystic ovary syndrome and low functional ovarian reserve) as well as to assess follicular microenvironment quality. Moreover, in men, their expression levels can vary in case of spermatogenesis abnormalities. Finally, circulating nucleic acids have also the ability to predict successfully the quality of in vitro embryo development. Their multiple contributions during assisted reproductive technology (ART) make of them biomarkers of interest, for the development of new diagnostic and/or prognostic tests, applied to our specialty. Circulating nucleic acids would so offer the possibility of personalized medical care for infertile couples in ART.

Following primary infections HSV-1 replicates productively in epithelial cells and enters sensory neurons via nerve termini. After retrograde transport the virus genome is delivered into the cell nucleus, where it establishes lifelong latent infections. During latency, the virus genome remains as a chromatinized episome expressing only a set of latency-associated transcripts (LAT) and a group of microRNAs that inhibit expression of key lytic viral functions. Periodically the virus can reactivate to reinitiate lytic, secondary infections at peripheral tissues. The ability to establish both lytic and latent infections relies on the coexistence in the virus genome of two alternative gene expression programs, under the control of epigenetic mechanisms. Latency is an adaptive phenotype that allows the virus to escape immune host responses and to reactivate and disseminate to other hosts upon recognizing danger signals such as stress, neurologic trauma or growth factor deprivation.

MiRNAs are small 21-22 nucleotides long RNAs transcribed from non coding genes or introns of coding genes that are involved the repression of cellular messenger RNAs by the RISC complex. Close to 2000 miRNAs have been identified in the human genome and the expression of hundreds of them is increased or decreased in pathological condition, modifying on a global scale the expression of cardiac and vascular proteins. MiRNAs regulate most cellular processes involved in the cardiovascular pathophysiology including apoptosis, proliferation and migration, left ventricle hypertrophy, cardiac fibrosis and conduction. MiRNAs form a new class of therapeutic targets that can be introduced in the cells in various forms (synthetic molecules, expression vectors) or inhibited by antisens oligonucleotides called anti-miRs. MiRNAs are actively secreted by specific cells including cardiac fibroblasts and endothelial cells during certain pathophysiological processes, or passively following cell death and can be quantified in all kind of body fluids. They emerge as a new category of cardiovascular disease biomarkers, notably in the context of myocardial infarction.

Rôle du miR122 dans la régulation nutritionnelle du métabolisme hépatique chez la truite arc-en-ciel. Le monde des microARNs