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International audience; Rift Valley fever (RVF) is a major emerging arboviral disease with a complex epidemiological cycle. RVF virus (RVFV) is transmitted by mosquito vectors to ruminants, causing epizootics, and then from animals to humans, triggering epidemics. During its cycle, RVFV infects a wide range of hosts, but the associated pathogenesis has yet to be elucidated. RVFV displays a predominant hepatic tropism, but also has a multicellular tropism inducing physiopathological effects in several tissues. However, there is variability between species in terms of physiopathology : a common clinical picture is found (severe hepatitis, hemorrhages, leukopenia), but certain forms are mainly found in humans (neurological and ocular damage) or in ruminant herds (waves of abortions). Although the molecular mechanisms involved are still poorly understood, it seems that early inflammatory response is related to the severity of the pathology. A better understanding of the pathogenesis of RVFV seems essential, especially since no specific treatment exists to date.; La fièvre de la vallée du Rift (FVR) est une arbovirose émergente majeure possédant un cycle de transmission complexe. Le virus de la FVR (RVFV) est transmis aux élevages de ruminants par des moustiques vecteurs, provoquant des épizooties, puis de l’animal à l’Homme, déclenchant alors des épidémies. Au cours de son cycle, le RVFV infecte une large gamme d’hôtes, la pathogenèse associée soulevant de nombreuses questions. Malgré un tropisme principalement hépatique, le RVFV a également un tropisme multicellulaire induisant un effet physiopathologique dans de nombreux tissus. Un tableau clinique commun est habituellement retrouvé (hépatite sévère, hémorragies, leucopénie) mais une variabilité interspécifique a également été décrite. Ainsi, certaines formes sont principalement retrouvées chez l’Homme (atteintes neurologiques et oculaires) ou dans les élevages de ruminants (vagues d’avortements). Bien que les mécanismes moléculaires impliqués soient encore mal connus, il semblerait que la sévérité de la pathologie soit liée à la réponse inflammatoire précoce. De même, la pathogenèse du RVFV semble être soumise à de nombreux facteurs responsables d’une variabilité inter-individuelle importante dans la sévérité de l’infection. Devant l’absence de traitement spécifique, il semble primordial de mieux comprendre la pathogenèse du RVFV.

Human enteroviruses (EV) are the most frequent cause of paediatric aseptic meningitis. Detection of enterovirus by PCR in cerebrospinal fluid (CSF) specimens is recommended for diagnosis. Fever without source and sepsis-like diseases are frequent affections in infants (0 to 2 years) which can be the consequence of a viral infection in particular to EV. At present, the daily routin diagnosis of EV in the blood is rarely performed. The concerning data 1) existence of EV replication in the blood leukocytes, 2) the EV viral load level in blood and CSF specimens and its possible relation with the intensity of the associated inflammatory process are fragmented. In the first part of this PhD thesis, the aim was to assess detection of enterovirus by PCR in blood specimens of newbrons, infants, and children with fever without source, sepsis-like disease or suspected meningitis. We did a prospective, multicentre, observational study (BLEDI study) at 35 paediatric departements during the seasonal period of increased EV circulation in 2015-2016. Our results showed that detection of EV was significantly higher in the blood than in the CSF from newborns and infants admitted with fever without source or sepsis-like disease. These data open up the perspectives for a new diagnostic algorithm of febrile illness in patients aged 2 years or younger. We also explored prospectively EV viral load in blood and in CSF specimens of infected patients. Our results showed that EV viral load in the blood varied by age group, clinical presentation and EV type. Three profiles of infection kinetics comparing EV viral load in the blood and the CSF have been considered and are under study. Finally, we explored the hypothesis of an EV replication in the blood leukocytes. We showed from blood samples infected in vitro by EV that the replication of these viruses varied by EV genotypes.; Les entérovirus humains (EV) représentent la première cause des méningites aseptiques chez l'enfant. Le diagnostic de certitude repose sur la détection génomique de l'entérovirus par RT-PCR dans des échantillons de liquide céphalorachidien (LCR) est recommandée pour le diagnostic. La fièvre sans point d'appel et les maladies de type "sepsis" sont également des affections fréquentes chez les nourrissons (0 à 2 ans), qui peuvent être la conséquence d'une infection virale, en particulier à EV. Actuellement, le diagnostic des EV dans le sang est rarement établi dans la pratique courante.Les données concernant 1) l’existence d’une réplication de l’EV dans les leucocytes sanguins, 2) le niveau de charge virale de l’EV dans le sang et les échantillons de LCR et sa corrélation éventuelle avec l’intensité du processus inflammatoire réactionnel sont fragmentaires. Dans la première partie de cette thèse, l'objectif était d'évaluer la détection des EV par PCR dans des échantillons de sang de nouveau-nés, de nourrissons et d'enfants hospitalisés pour une fièvre isolée, un sepsis ou un syndrome méningé. Nous avons mené une étude observationnelle prospective multicentrique nationale (étude BLEDI) dans 35 départements de pédiatrie au cours de la période estivo-automnale (augmentation des circulations d'EV) en 2015-2016. Nos résultats ont montré que le taux de détection des EV dans le sang était significativement plus élevé que dans le LCR chez les nouveaux-nés et les nourrissons hospitalisés pour une fièvre isolée, un sepsis ou un syndrome méningé.Ces données ouvrent des perspectives pour un nouvel algorithme de diagnostic des fièvres inexpliquées chez les enfants âgés de moins de 2 ans. Dans le second volet de cette thèse, nous avons étudié de manière prospective la charge virale d'EV dans le sang et dans des échantillons de LCR de patients infectés. Nos résultats ont montré que la charge virale d'EV dans le sang variait selon le groupe d'âge, la présentation clinique et le type d'EV. Trois profils de cinétique d'infection comparant la charge virale dans le sang et le LCR ont été envisagés et sont en cours d'étude. Enfin, le dernier axe était de déterminer s'il existait une réplication de l’EV dans les leucocytes sanguins. Nous avons montré à partir d'échantillons de sang infectés in vitro par EV que la réplication de ces virus variait selon les génotypes d'EV.

La question abordée dans ce mémoire concerne le rôle de la vocalité dans l’œuvre de Nathalie Sarraute. Nous chercherons à comprendre comment le caractère sonore de la voix influence la constitution et la réception de l’œuvre. Sachant que presque toutes les œuvres théâtrales de Sarraute ont d’abord été conçues pour la radio, médium où le son est le seul producteur de sens, nous nous interrogerons sur la fonction de la voix et le développement des tropismes, « ces mouvements indéfinissables, qui glissent très rapidement aux limites de notre conscience » (L’Ère du soupçon, 1956), dans ces œuvres. Ainsi, nous nous concentrerons sur les versions écrite et radiophonique de la dernière pièce de Sarraute, Pour un oui ou pour un non (1980-1981), afin de mieux saisir l’impact de la voix dans chacune des versions. En premier lieu, nous nous interrogerons sur les débuts de la création radiophonique chez Sarraute et sur l’adaptation de son écriture à ce nouveau médium. En deuxième lieu, nous aborderons les conditions de production et de diffusion qui ont entouré la pièce radiophonique au moment de sa parution. Finalement, en nous appuyant sur une analyse comparée du texte écrit et de l’enregistrement radiophonique de la pièce, nous comparerons l’expérience du lecteur et de l’auditeur, afin de comprendre l’importance de la voix au sein des deux versions. Mots-clés : Nathalie Sarraute, Théâtre radiophonique, Pièce radiophonique, Radio, Pour un oui ou pour un non, Oralité, Vocalité, Voix, Tropisme, Nouveau roman, Intermédialité, This thesis looks at the importance of vocality in the works of Nathalie Sarraute. More specifically, the research focuses on how the addition of sound, a unique characteristic of vocality, can influence the making and reception of a work of art. Since many of Sarraute’s works for theatre were originally created for radio, a medium where meaning is conveyed only by sound, we will study the voice’s different functions, and how tropisms, « interior movements that precede and prepare our words and actions, at the limits of or consciousness » (L’Ère du soupçon, 1956) develop throughout these works. The research focuses on the written and recorded for radio versions of Nathalie Sarraute’s last play, For no Reason (1980-1981). Our aim is to better understand the impact of voice in each of the versions. First, we will take a glance at Sarraute’s beginnings in the arrays of radiophonic creation, and how she adapted her writing for this new medium. Second, we will look at the production and broadcasting conditions upon the play’s initial release. Finally, with a comparative analysis of the written and recorded versions of the play, we will try to compare the reader and the listener’s experiences, to better understand the importance of voice in both versions. Keywords : Nathalie Sarraute, Radio Theater, Radio play, Radio, For no Reason, Orality, Vocality, Voice, Tropism, New Novel, Intermediality

Musculoskeletal lesions caused by arthropod-borne-viruses (arboviruses) are invalidating for patients and remain poorly understood. In this study, we investigated the development of these manifestations after infection with two arboviruses: chikungunya virus (CHIKV) from the Togaviridae family, and Zika virus (ZIKV) from the Flaviviridae family. The first part of the study focused on arthritis following CHIKV infection. For this purpose, we developed a reporter virus expressing NanoLuciferase and performed experimental infections in a murine model. In vivo, a strong bioluminescent signal indicated viral replication and we observed persistence of the signal in the joints up to 34 days post-infection. By isolating primary murine cells from cartilage, we demonstrated the susceptibility of chondrocytes to CHIKV infection suggesting a role of reservoir of these cells. Furthermore, we investigated the consequences of the infection using in vitro models. We showed that primary human chondrocytes are also susceptible to CHIKV infection, which leads to the production of several cytokines involved in cartilage catabolism and induces apoptosis. In the second part of the study, we studied ZIKV muscular tropism and the associated lesions. Firstly, we confirmed the development of muscular lesions in a mouse model of ZIKA. Then, using human primary muscle cells we observed the infection of myoblasts but not myotubes, suggesting a differentiation-dependent tropism. We compared three viral strains and observed no significant difference in terms of replication, number of infected cells and viral production. Myoblasts infection induced a caspase-independent cells death mechanism and electronic microscope observations revealed intense vacuolization of cytoplasm, suggesting a paraptosis-like cell death. Proteomic analysis revealed that the Asian ZIKV strain modulated protein expression of infected cells with an increased effect after 48 hours. ZIKV-infection induced an important upregulation of biological processes associated with type I interferon and an inhibition of protein synthesis in the infected cells. These results provide valuable information about the mechanisms involved in the development of musculoskeletal lesions during arboviroses; En vue de contribuer à une meilleure compréhension des atteintes du système musculo-squelettique consécutives à une infection par un arthropod-borne-virus (arbovirus), deux arbovirus ont été étudiés : le virus du chikungunya (CHIKV) et le virus Zika (ZIKV), respectivement de la famille des Togaviridae et des Flaviviridae. Cette étude a été réalisée selon deux axes. Le premier s’intéresse aux atteintes articulaires consécutives à l’infection par le CHIKV. Nous avons mis au point un modèle d’imagerie in vivo reposant sur l’utilisation d’un virus recombinant exprimant la NanoLuciférase. Dans ce modèle, nous démontrons une persistance du signal bioluminescent dans les articulations 34 jours après infection. Par isolement des cartilages articulaires et des cellules constitutives, nous avons pu démontrer que les chondrocytes des cartilages métatarso-phalangiens sont infectés par le CHIKV de manière persistante, suggérant un rôle de réservoir de ces cellules. Les conséquences de l’infection au niveau cellulaire ont ensuite été étudiées in vitro. En utilisant des chondrocytes primaires humains, nous avons confirmé ces observations. De plus, les chondrocytes infectés produisent de nombreuses cytokines, induisant une stimulation du catabolisme du cartilage avec en particulier la synthèse de métalloprotéinases de matrice 3 et 9. De plus, l’infection par le CHIKV provoque la mort des cellules par apoptose, comme démontré par marquage TUNEL et par mesure de l’activité des caspases. Nous avons ensuite étudié les atteintes musculaires et le tropisme cellulaire du ZIKV. Dans un modèle murin, nous avons confirmé la présence de lésions musculaires, et l’utilisation de cellules musculaires primaires humaines a montré la sensibilité des myoblastes à l’infection, les myotubes étant résistants, suggérant un tropisme du ZIKV dépendant de la différenciation cellulaire. Trois souches virales ont été testées, sans relever de différences significatives en termes de cinétique d’infection, de nombre de cellules infectées et de production virale. L’infection des myoblastes entraîne la mort de ces cellules par un mécanisme caspase-indépendant. Des observations en microscopie électronique ont mis en évidence une vacuolisation du cytoplasme suite à l’infection, caractéristique d’une mort cellulaire par paraptose. Une analyse protéomique a démontré que l’infection des myoblastes par une souche asiatique conduit à une modification du protéome s’accentuant entre 24 heures et 48 heures post-infection, avec 225 protéines modulées 24 heures après infection contre 473 après 48 heures, indiquant une activation des voies de synthèse Interferon de type I et l’inhibition des capacités de synthèse des protéines. Ces résultats permettent une meilleure compréhension des atteintes du système-musculo-squelettique par les arbovirus

Introduction. Le VIH-1 évolue en fonction de la réponse immunitaire spécifique de l’hôte. La pression sélective exercée par la réponse immunitaire VIH-spécifique de l’hôte entraine l’évolution des gènes viraux et à terme détermine l’évolution de la maladie. Cette évolution du virus à l’échelle d’un individu façonne également l’évolution du virus à l’échelle de la population et détermine le devenir de l’épidémie. Le VIH utilise les corécepteurs d’entrée CCR5 (virus R5) et CXCR4 (virus X4) afin d’infecter la cellule cible, et l’évolution du tropisme du virus de R5 vers X4, appelé switch du tropisme, est associé à la progression de la maladie. Les virus R5 sont rencontrés en début d’infection tandis que les virus X4 apparaissent en fin de maladie chez un certain de nombre de patients et sont considérés comme plus virulents. La pression sélective immunitaire exercée sur le gène de l’enveloppe (env) peut donc entrainer l’évolution du tropisme du VIH. La grossesse est un état immunitaire particulier considéré comme étant principalement caractérisé par un biais Th2 nécessaire à l’établissement de la tolérance materno-fétale. Le switch de tropisme de R5 vers X4 en grossesse n’a jamais été documenté, de même que l’évolution des déterminants du tropisme à l’échelle de la population. Hypothèses. Les changements immunitaires associés à l’initiation et la progression de la grossesse engendrent des changements dans la pression immunitaire exercée sur l’enveloppe et peuvent favoriser le switch du tropisme. L’évolution du tropisme du VIH-1 peut être observé à l’échelle de la population au même titre que l’évolution de l’enveloppe virale. Objectifs. Analyser l’évolution du tropisme et décrire la pression sélective sur l’enveloppe des femmes enceintes infectées par le VIH-1. Analyser l’évolution des déterminants du tropisme à l’échelle de la population. Méthodes. Nous avons dans un premier temps analysé l’évolution des déterminants du tropisme et déterminé le génotype et phénotype du VIH-1 chez 19 femmes enceintes issues de la cohorte du centre maternel et infantile sur le SIDA de l’hôpital Sainte-Justine (CMIS). Nous avons ensuite caractérisé et comparé la pression sélective exercée sur env, par une méthode bayésienne, chez 31 femmes enceinte et 29 femmes non-enceintes. Enfin, nous avons analysé et comparé des déterminants du tropisme entre des séquences d’enveloppe contemporaines et anciennes, issues des bases de données du NCBI. Résultats. Nos résultats montrent la présence de virus X4 chez la moitié de notre cohorte, et un switch de tropisme de R5 vers X4 chez 5/19 sujets. Les séquences des femmes enceintes présentaient des taux de substitutions plus élevées que celles des femmes non-enceintes. La pression sélective dans la région C2 était plus faible chez les femmes enceintes que chez les femmes non-enceintes, et différait dans 4 positions entre ces 2 groupes. Cette sélection diminuait au cours de la grossesse chez les patientes traitées. Enfin, une accumulation de mutations X4 a été observée dans les séquences R5 contemporaines par rapport aux séquences R5 anciennes. Conclusion. Les changements immunitaires associés à la grossesse semblent induire des modifications subtiles dans la pression sélective exercée sur env, suffisant à influencer l’évolution du tropisme de R5 vers X4. Un switch du tropisme à l’échelle de la population impliquerait une épidémie évoluant vers une plus grande virulence du virus. Nos résultats sont d’importance en ce qui concerne la prophylaxie antirétrovirale pour la santé de la mère et la prévention de la transmission mère-enfant du VIH-1. Ils sont aussi importants concernant l’avenir de la thérapie antirétrovirale dans le contexte d’une épidémie évoluant vers une plus grande virulence, Introduction. HIV-1 evolves as a function of the immune specific response of the host. The selective pressure exerted by HIV-specific immune responses lead to the evolution of the viral genes and ultimately determine the evolution of the disease. HIV evolution at the individual level also shapes the evolution of the virus the population level and determines the future of the epidemic. HIV enters the target cell via CCR5 (R5 viruses) or CXCR4 (X4 viruses) coreceptors, and switch of tropism from R5 to X4, is associated with progression disease. Indeed, R5 virus characterize earlier stages of infection while X4 emerge at later disease stages in some patients and are considered more virulent. The immune pressures exerted on the envelope gene (env) can therefore cause HIV coreceptor switch. Pregnancy is considered a particular immune state mainly characterized by a Th2 bias necessary for the establishment of materno-fetal tolerance. Tropism switch from R5 to X4 during pregnancy has never been documented, and changes in the determinants of tropism during the HIV epidemic at the population level have never been reported. Hypotheses. Immune changes associated with initiation and progression of pregnancy generate changes in the immune pressure exerted on env and may influence coreceptor tropism switch. The evolution HIV-1 coreceptor tropism can be observed at the population level as well as the evolution of the viral envelope. Objectives. Analyze the evolution of tropism and describe the selective pressure on the envelope of pregnant women infected with HIV-1. Analyze the evolution of the determinants of tropism in at the population level. Methods. We first analyzed the evolution of determinants of tropism and determined the genotype and phenotype of HIV-1 in 19 pregnant women from centre maternel et infantile sur le SIDA de l’hôpital Sainte-Justine (CMIS). We then characterized and compared the selective pressure on env, using a Bayesian method, in 31 pregnant and 29 non-pregnant women. Finally, we analyzed and compared the determinants of tropism between contemporary and early envelope sequences retrieved from the NCBI databases. Results. Our results show the presence of X4 virus in half of our cohort, and R5 to X4 tropism switch in 5/19 subjects. Higher substitution rates were found in sequences from pregnant women as compared to sequences from non-pregnant subjects. Selective pressure in the C2 region was lower in pregnant than in non-pregnant women, and differed in 4 positions between these 2 groups. This selection decreased during pregnancy in patients who received antiretroviral therapy. Finally, accumulation of X4 mutations was observed in contemporary R5 sequences compared to early R5 sequences. Conclusion. Immune changes that are associated with pregnancy appear to induce subtle changes in selective pressures in env, changes that may influence the evolution of tropism towards X4. Switch of tropism at the population level would imply an evolving epidemic towards greater virulence. Our results are of importance regarding antiretroviral prophylaxis for the health of the mother and for the prevention of mother-to-child transmission of HIV-1. These results are also important for the future of antiretroviral therapy in the context of evolving epidemic

Endometrial receptivity to embryo implantation is one of the fundamental features of reproduction. Success of natural or assisted embryo implantation is low (20-25%). Implantation remains the result of a successful collaboration, tightly regulated and closely coordinated, between maternal and embryonic tissues located at the crossroads of endocrinology and immunology. In scientific terms, this collaboration is a mystery of human reproduction. The implanted blastocyst within the endometrium is dependent on a fine-tuned synchronization. Therefore, an accurate dialogue between the mother and the embryo is timely required to orchestrate mutual and well-synchronized changes in the developing embryo and maternal responsiveness in order to achieve a successful implantation. Maternal-derived mediators, such as steroid hormones, matrix-degrading enzymes, integrins, cytokines, chemokines, and many embryonic growth factors could be involved in the feto-maternal dialogue. Therefore, what is the maternal molecular signature compatible with embryo implantation?

Mesenchymal stem cells (MSC) have attracted recent attention for their cell therapy potential, based in particular on their immunosuppressive properties, which have served as the basis for the treatment of autoimmune diseases. Interestingly, MSC have been used in cell therapy strategies to deliver therapeutical genes. Cell therapy approaches taking advantages of MSC have been proposed, as MSC display a potential tropsim for tumors. However, all these strategies raise a series of questions about the safety of MSC, as MSC could enhance tumor growth and metastasis. This review summarizes recent findngs about MSC in carcinogenesis.

Herpesviruses are widespread throughout the biosphere and infect a wide variety of different animal species. They all belong to the order Herpesvirales and the three families Herpesviridae, Alloherpesviridae, and Malacoherpesviridae. They share numerous properties : an enveloped large DNA structure, an ability to persist indefinitely as a silent infection in the host after primary infection and to reactivate and produce again a lytic infection, an ability to maintain a balance with the host defences, and the development of serious symptoms when these defences weaken. The eight human herpesviruses are herpes simplex viruses type 1 and 2 (HSV-1, HSV-2), varicella-zoster virus (VZV), human cytomegalovirus (CMV), Epstein-Barr virus (EBV), and human herpesviruses (HHV) 6, 7, and 8 (-6, HHV-7, HHV-8), the last one being also known as Kaposi’s sarcoma-associated herpesvirus (KSHV). Cell tropism, either during active infection or latency, differs according to each virus species and partly determines the pathogenicity of herpesviruses which behave as opportunistic agents. The diagnosis of acute infections is mainly based on PCR, and particularly real-time to quantify the viral load. Preventive vaccines only exist against VZV. Antiviral chemotherapy, based on viral DNA polymerase inhibitors, is efficient against active infections but has no effect against latent infection or in case of drug resistance due to viral DNA mutations., Les herpèsvirus sont des virus largement répandus dans la biosphère et infectant un très grand nombre d’espèces animales différentes. Ils appartiennent tous à l’ordre des Herpesvirales et aux trois familles Herpesviridae, Alloherpesviridae, et Malacoherpesviridae. Ils partagent de nombreuses propriétés communes : une structure de virus à ADN enveloppé de grande taille, une capacité à persister indéfiniment de façon silencieuse chez leur hôte après la primo-infection et à se réactiver ensuite pour donner à nouveau une infection lytique, l’établissement d’un équilibre vis-à-vis des mécanismes de défense de l’hôte, et la gravité des symptômes quand ces défenses sont amoindries. Les huit herpèsvirus humains sont les virus herpes simplex de type 1 et 2 (HSV-1, HSV-2), le virus de la varicelle et du zona (VZV), le cytomégalovirus (CMV), le virus Epstein-Barr (EBV) et les herpèsvirus humains HHV-6, -7 et -8, ce dernier étant encore appelé herpèsvirus associé à la maladie de Kaposi (KSHV). Le tropisme cellulaire, qu’il s’agisse de la multiplication active ou de l’état de latence, varie selon l’espèce virale et détermine en partie le pouvoir pathogène de ces virus qui ont un comportement opportuniste. Le diagnostic des infections aiguës repose actuellement essentiellement sur la PCR, en particulier les techniques en temps réel permettant un quantification virale. La prévention des infections humaines par la vaccination se limite au VZV. La chimiothérapie antivirale, fondée sur des inhibiteurs de l’ADN polymérase des herpèsvirus, permet de traiter les infections aiguës mais elle n’est pas efficace sur l’infection latente ou en cas de résistance consécutive à la sélection de mutations du génome viral., Agut Henri. Herpèsvirus et herpèsviroses humaines. In: Bulletin de l'Académie Vétérinaire de France tome 164 n°4, 2011. pp. 287-291.

Resume Le tropisme d’un virus se definit comme l’ensemble des cellules cibles et permissives a ce virus. Le connaitre permet de determiner le ou les organes cibles, ainsi que la ou les especes animales pouvant etre infectees. Le changement de tropisme permet aux virus d’evoluer, notamment en leur permettant de franchir la barriere d’espece et de s’installer chez un nouvel hote. Les coronavirus representent un tres large groupe de virus infectant de nombreuses especes animales. Ces virus a ARN sont dotes d’un potentiel evolutif important, et leur histoire comporte plusieurs exemples de changement de tropisme ayant pour consequence soit l’emergence d’une nouvelle maladie (coronavirus associe au SRAS, coronavirus respiratoire du porc), soit une nouvelle expression de l’infection (peritonite infectieuse fatale du chat et du furet).

A consensus seems to have been reached on the pathogen responsible for SARS (Severe Acute Respiratory Syndrome) being a newly recognised coronavirus. To answer some of the questions raised by the emergence of this previously unknown pathogen, the author presents the classification and characteristics of coronaviruses : single positive RNA strand of approximately 30,000 bases (the largest known RNA genome), complexe mode of expression of the genetic information, yet simple organisation of the virions with only 4 structural proteins. Coronaviruses have a relatively small host spectrum and a narrow tissue tropism. They have a special affinity for epithelial cells in the respiratory and digestive tracts. The author presents data on the mechanisms of this tissue specificity, using as an example group 1 coronaviruses, which include the transmissible gastroenteritis virus (TGEV). These viruses use aminopeptidase N as their receptor to break into the target cells. This molecule, expressed at the surface of epithelial cells, is recognised by the virus spike proteins. Receptor recognition is a major determinant of the species specificity in these viruses. This is why none of the group 1 animal coronaviruses is able to infect human cells, whose aminopeptidase N they do not recognise. The author describes the way the TGEV coronavirus has muted into the Porcine Respiratory Coronavirus (PRCV), responsible for a new respiratory infection which spread explosively in swine populations. The deletion of approximately 250 amino acids in the N-terminal region of the spike protein may be associated with the reduced virulence and switch of tissue tropism. Coronavirus infections induce early on a marked synthesis of interferon alpha. The identified induction mechanism partly differs from the mechanism generally described in RNA viruses, as it is essentially independent from viral replication, and involves the glycosylated M protein associated to the virions. The genome mutation rate in coronaviruses is relatively high, as expected with RNA viruses. And yet, the genetic drift associated with the SARS virus is the same as in the TGEV. Coronaviruses are also specialists in intergenomic recombination, a characteristic which could allow them to reconstitute viable genomes from altered ones. However, the SARS virus does not appear to originate from a recent recombination between a human virus and one of the currently identified animal coronavirus. To which of three known groups of coronaviruses does the SARS virus belong ? The comparison of the complete genome sequence of the SARS virus, now known, with that of the other coronaviruses shows that its position is somewhere between the avian coronavirus group (e. g. Infectious Bronchitis Virus or IBV), and group 2 coronaviruses which affect mammals (e. g. bovine coronavirus). The author also points out that the organisation of the SARS virus genome (including the distribution of so-called “ accessory” genes) shows intriguing similarities with that of the avian coronavirus group. All these characteristics would justify putting this new coronavirus in the group of its own, distinct from the existing ones., Un consensus semble maintenant établi selon lequel l‘ agent causal du Syndrome Respiratoire Aigu Sévère (SRAS) est un coronavirus nouvellement apparu. Pour tenter de répondre aux questions que pose l‘ émergence de ce pathogène inconnu jusqu‘ alors, l’auteur présente la classification et les caractéristiques des coronavirus : génome ARN simple brin de près de 30 000 bases (le plus grand génome ARN connu), originalité du mode d’expension de l’expression de l’information génétique, organisation relativement simple des virions avec seulement 4 protéines structurales. Les coronavirus ont un spectre d’hôte relativement étroit et un tropisme tissulaire restreint. Ils présentent une affinité particulière pour les cellules épithéliales de la sphère respiratoire ou digestive. L’auteur présente des données sur les mécanismes qui sous-tendent cette spécificité de tissu en prenant comme exemple les coronavirus du Groupe 1, auquel appartient l’agent de la gastro-entérite transmissible (TGEV). Ces virus utilisent comme récepteur l’aminopeptidase N pour pénétrer dans les cellules cibles. Cette molécule, exprimée à la surface des cellules épithéliales, est reconnue par les protéines de spicule du virus. La reconnaissance du récepteur est aussi chez ces virus un déterminant majeur de leur spécificité d’espèce. Ainsi, aucun des coronavirus animaux du groupe 1 n’est capable d’infecter des cellules humaines, dont ils ne reconnaissent pas l’aminopeptidase N. L’auteur décrit ensuite la manière dont le coronavirus de la gastro-entérite transmissible (TGEV) a muté pour donner le coronavirus respiratoire porcin (PCRV), responsable d’une nouvelle virose respiratoire qui a diffusé de façon explosive dans l’espèce porcine. Une délétion d’environ 250 acides aminés dans la région N-terminale de la protéine de spicule a pu être associée à la perte de virulence observée et au changement de tropisme tissulaire. Lors d’une infection par un coronavirus, s’observe une synthèse d’interféron alpha forte et précoce. Le mécanisme d’induction mis en évidence diffère de celui classiquement décrit chez les virus à ARN, puisqu’il est essentiellement indépendant de la réplication virale et met en jeu la protéine glycosylée M associée aux virions. Le génome des coronavirus présente un taux de mutation relativement élevé, comme attendu pour un virus à ARN. Pour autant, dans le cas du virus du SRAS, la dérive génétique ne diffère guère de celle du TGEV. Les coronavirus sont également des spécialistes de la recombinaison intergénomique, faculté qui leur permettrait de reconstituer des génomes viables à partir de génomes altérés. Cependant, il ne semble pas que le virus du SRAS soit issu d’une recombinaison récente entre un virus humain et un virus animal parmi les coronavirus actuellement recensés. Comment le virus du SRAS se positionne-t-il au sein des trois groupes présentement définis chez les coronavirus? La comparaison de la séquence complète du génome du SRAS, maintenant disponible, avec celle du génome des autres coronavirus révèle que ce virus se situe dans une position intermédiaire entre le groupe des virus des oiseaux (par exemple le virus de la bronchite infectieuse ou IBV) et le groupe 2 des coronavirus de mammifères (ex. : coronavirus bovin). Toutefois, l’auteur fait remarquer que, sur la base d’un examen de l’organisation génomique globale du virus (incluant la distribution des gènes dits “accessoires”), le virus SRAS présente des similitudes, qui ne manquent pas d’intriguer, avec le groupe des virus aviaires. L’ensemble de ces caractéristiques justifierait l’inclusion de ce nouveau coronavirus dans un groupe distinct de ceux existants., Laude Hubert. Les coronavirus, biologie cellulaire et moléculaire. In: Bulletin de l'Académie Vétérinaire de France tome 156 n°3, 2003. pp. 17-30.