1. Unravelling the mechanisms of longevity control by mobile RNAs
- Author
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Camara, Henrique, 1993, Mori, Marcelo Alves, 1980, Cunha, Fernanda Marques da, Geraldo, Murilo Vieira, Marques-Souza, Henrique, Kihara, Alexandre Hiroaki, Universidade Estadual de Campinas. Instituto de Biologia, Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular, and UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS
- Subjects
MicroRNAs ,RNA não codificante ,Aging ,Cell signaling ,Envelhecimento ,Sinalização celular ,Caenorhabditis elegans ,Non-coding RNA - Abstract
Orientador: Marcelo Alves da Silva Mori Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia Resumo: RNAs não codificantes como miRNAs e siRNAs possuem importante papel de regulação gênica em diferentes tipos celulares, contribuindo para a saúde do organismo. Além de seu papel como regulador da função celular autônoma, RNAs não codificantes também são secretados e regulam a função de células alvo distantes. Entretanto, os mecanismos de transporte destes RNAs e as consequências fisiológicas desta regulação ainda não estão completamente compreendidos. Em C. elegans, a família de proteínas SID (do inglês Systemic RNAi Defective) foi relacionada à secreção e incorporação de RNAs extracelulares. Em projeto prévio, avaliei vermes mutantes para as diferentes proteínas SID e observei alteração de diversos fenótipos como postura de ovos, tempo de desenvolvimento, resistência ao estresse e envelhecimento, sobretudo para os mutantes para SID-1 e SID-3, proteínas fundamentais para a internalização de RNAs extracelulares. Na presente tese expandi esta avaliação, utilizando novos alelos mutantes para sid-1 e sid-3, assim como modelos de expressão transgênica tecido-específica de sid-1. Confirmei os efeitos deletérios da mutação para sid-3 (ok973) com o alelo sid-3 (tm342). Por outro lado, os alelos de sid-1 (qt2) e sid-1(qt9) não promoveram os defeitos observados previamente com sid-1 (pk3321), que se revelou decorrente de mutações off-target no verme utilizado. Entretanto, observei que a expressão tecido específica de SID-1 em intestino, músculo ou neurônio afeta o tempo de vida do nematoide. Essa modulação do tempo de vida depende da dieta do animal e das vias de RNAi sistêmico e de miRNAs. Por fim, a expressão neuronal de SID-1 induz o fenótipo locomotor coil nos vermes, sugerindo alteração da função neuronal. Coletivamente, os dados indicam que alterar a função da maquinaria de transporte de RNAs tem efeitos profundos e diversos na fisiologia de C. elegans. Estes efeitos sugerem que os RNAs extracelulares são usados para regular diferentes funções biológicas e que a atividade de transporte de RNAs deve ser mantida sob controle fino a fim de evitar disfunção celular Abstract: Non-coding RNAs such as miRNAs and siRNAs have an important role in gene regulation in different cell types, contributing to the health of the organism. In addition to their role as an autonomous regulator of cellular function, non-coding RNAs are also secreted and regulate the function of distant target cells. However, the transport mechanisms of these RNAs and the physiological consequences of this regulation are not yet fully understood. In C. elegans, the Systemic RNAi Defective (SID) protein family was related to the secretion and incorporation of extracellular RNAs. In a previous project, we evaluated mutant worms for the different SID proteins and observed changes in several phenotypes such as egg laying, development time, resistance to stress and aging. These were more evident in mutants for SID-1 and SID-3, fundamental proteins for internalization of extracellular RNAs. In the present thesis I have expanded this evaluation, using new mutant alleles for sid-1 and sid-3, as well as models of transgenic tissue-specific expression of sid-1. I confirmed the deleterious effects of the sid-3 (ok973) mutation with the sid-3 (tm342) allele. On the other hand, the sid-1 (qt2) and sid-1 (qt9) alleles did not show the defects previously observed with sid-1 (pk3321), which was revealed to result from off-target mutations in the worm used. However, I observed that the tissue-specific expression of SID-1 in the intestine, muscle or neuron affects the nematode's lifespan. This modulation of lifespan depends on the animal's diet and with the systemic RNAi and miRNA pathways. Finally, the neuronal expression of SID-1 induces the locomotor coil phenotype in worms, suggesting changes in neuronal function. Collectively, the data indicate that changing the function of RNA transport machinery has profound and diverse effects on the physiology of C. elegans. These effects suggest that extracellular RNAs are used to regulate different biological functions and that RNA transport activity must be kept under fine control in order to avoid cellular dysfunction Doutorado Genética Animal e Evolução Doutor em Genética e Biologia Molecular FAPESP 2017/01339-2 CAPES 0
- Published
- 2021