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FACEPE Porinaceae Reichenbach (Ostropales, Lecanoromycetes) é um dos grupos mais diversos de fungos liquenizados, considerados os primeiros colonizadores de comunidades de liquens corticícolas e foliícolas de florestas tropicais. Apresentam ascoma peritecial sobre o córtex de árvores, folhas e rochas, produzindo ascosporos hialinos, com paredes finas, transversalmente septados a muriformes e paráfises não ramificadas. Os gêneros e espécies de Porinaceae ainda não são bem delimitados, tornando dúbia a identificação de espécies baseada apenas em dados morfológicos. Assim, conhecer os táxons neotropicais a partir de dados morfológicos e moleculares, contribui com a delimitação de grupos naturais dentro da família. Neste trabalho, foram utilizados para a análise morfológica e molecular, espécimes coletados em diferentes estados do Brasil, somados a amostras coletadas em outros países, como Cuba, Costa Rica e Panamá. A topologia da árvore demonstrou três diferentes soluções taxonômicas: (1) reconhecer toda a família dentro de um único gênero, Porina s.lat.; (2) reconhecer dois gêneros correspondendo aos dois clados maiores, o primeiro clado correspondendo ao gênero Segestria e o segundo ao gênero Porina; ou (3) reconhecer um número mais alto de aproximadamente 20 gêneros. A última opção parece ser a mais apropriada para reconhecer o alto número de mais de 300 espécies na família e a variação morfológica. De modo geral, observou-se que as sequências da região mtSSU foram úteis para o delineamento das espécies, principalmente em espécies evolutivamente próximas. Porinaceae Reichenbach (Ostropales, Lecanoromycetes) one of the most diverse groups of lichenized fungi, considered the first colonizers of communities of corticolous and saxicolous lichens in tropical forests. The family exhibits perithecial ascomata, mostly growing on bark, leaves and rocks, producing septate to muriform, with thin-walled, hyaline ascospores and unbranched paraphyses. The genera and species of Porinaceae are still not well delimited, which makes species identifications difficult when using exclusively morphological data. Thus, the knowledge of neotropical taxa based on both morphological and molecular data, contributes with the delimitation of natural groups within the family. In this work, specimens collected in different states of Brazil, in addition to samples collected in others countries, such as Cuba, Costa Rica and Panamá, were used for morphological and molecular analysis. The overall topology offers three different taxonomic solutions: (1) recognition of the whole family as a single genus, Porina s.lat.; (2) recognition of two genera corresponding to the two large clades, the first clade with the oldest available name being Segestria, and the second representing Porina; or (3) establishment of a higher number of approximately 20 genera. The latter option seems to be the most appropriate, given the high number of well over 300 species and the documented morphological variation within the family. In general, it was observad that sequences of the mtSSU region are useful for species delimitation, mostly species that are closely related.

CNPq Lecanorales, considerada a maior ordem de fungos liquenizados, possui uma classificação controversa, com uma enorme variedade de caracteres morfológicos e representantes em todos os ecossistemas terrestres. Lecanoraceae e Parmeliaceae estão entre as principais famílias desta ordem, e ambas têm sido amplamente estudadas. Lecanoraceae abriga 25 gêneros, sendo Lecanora seu principal representante, com 550 espécies. Parmeliaceae foi, recentemente, subdividida em duas subfamílias: Parmelioideae e Protoparmelioideae, com o objetivo de classificar melhor os fungos liquenizados tropicais e subtropicais que estão agora no gênero Neoprotoparmelia. A pluralidade de critérios taxonômicos sempre dificultou a classificação desses grupos. Por outro lado, a combinação de caracteres morfológicos, químicos e moleculares das regiões ITS e mtSSU (rDNA) tem resolvido muitos problemas nessas classificações. No presente estudo, foi extraído o DNA genômico de amostras frescas de Lecanora e Neoprotoparmelia, amplificadas as regiões ITS e mtSSU e, posteriormente, os produtos enviados para sequenciamento. Foram obtidas 41 sequências de Lecanora e 16 de Neoprotopormelia da região ITS, e 29 da região mtSSU de Lecanora. As sequências formaram novos clados e linhagens diferentes das existentes. Os espécimes identificados como Lecanora tropica, Lecanora spec. nov. LAS128, Lecanora spec. nov. LAS129 e L. subalbellina LAS130 agruparam com clados preexistentes. Dezesseis espécies novas foram descritas, nove novos registros e três novas combinações. Dezoito metabólitos foram identificados e foram eficazes na determinação das espécies. Esses resultados demonstram a importância da combinação de vários critérios taxonômicos na identificação e classificação dos fungos liquenizados. Lecanorales, considered the largest order of lichenized fungi, has a controversial classification, with a huge variety of morphological characters and representatives in all terrestrial ecosystems. Lecanoraceae and Parmeliaceae are among the major families of this order, and both have been extensively studied. Lecanoraceae is home to 25 genera, with Lecanora as its main representative, with 550 species. Parmeliaceae was recently subdivided into two subfamilies, with the objective of better classifying the tropical and subtropical lichenized fungi that are now in the genus Neoprotoparmelia. The plurality of taxonomic criteria has always made it difficult to classify these groups. On the other hand, the combination of morphological, chemical and molecular characters of the ITS and mtSSU (rDNA) regions has solved many problems in these classifications. In the present study, the genomic DNA was extracted from fresh samples of Lecanora and Neoprotoparmelia, amplified the ITS and mtSSU regions and, later, the products sent for sequencing. 41 Lecanora and 16 Neoprotopormelia sequences were obtained from the ITS region and 29 from the mtSSU region of Lecanora. The sequences formed new clades and lineages different from the existing ones. Specimens identified as Lecanora tropica, L. spec. nov. L S128, L. spec. nov. LAS129 and L. subalbellina LAS130 grouped with preexisting clades. Sixteen are new species, nine new records and three new combinations. Eighteen metabolites were identified and were effective in determining the speci. These results demonstrate the importance of combining several taxonomic criteria in the identification and classification of lichenized fungi.

CAPES Compreender como e de que forma ocorre a distribuição das comunidades de organismos nos mais diversos ambientes, tem levantado vários questionamentos sobre: quais são os grupos predominantes, como as espécies estão distribuídas nos biomas (aglomeradas ou dispersas) e quais são os processos ecológicos estruturadores das comunidades biológicas. Para atingir esse conhecimento em relação aos fungos liquenizados, foi conduzido um levantamento sobre a ocorrência de liquens epifíticos para o Norte e Nordeste do Brasil, nos biomas Amazônia, Caatinga, Mata Atlântica e Cerrado, utilizando as bases de dados SpeciesLink e GBIF, análise de exsicatas nos herbários ISE e URM, além de consulta dos registros em publicações (artigos, teses, dissertações, resumos de eventos); verificou-se a existência de depósitos de sequências de DNA das regiões ITS, mtSSU e nuLSU na base de dados do NCBI para as espécies registradas. O objetivo geral do trabalho foi avaliar a diversidade filogenética e o grau de parentesco filogenético entre as comunidades de liquens em diferentes formações vegetais e biomas distribuídos nas regiões Norte e Nordeste do país. Testou-se a hipótese de que as comunidades de liquens nesses biomas apresentam padrões de distribuição que sugerem estreitas relações filogenéticas entre gêneros de Mata Atlântica e Amazônia, enquanto que gêneros de Caatinga formam clados separados. Cladogramas filogenéticos foram construídos manualmente no formato Newick baseados na literatura analisada. Adicionalmente, foram realizadas coletas de liquens epifíticos (maioria crostosos), nos biomas Caatinga e Mata Atlântica, e no ecossistema associado à Mata Atlântica, a Restinga, nos estados de Pernambuco e Paraíba. Foram identificadas 18 novas espécies: Astrochapsa inspersa E.L. Lima, Lücking, L.C. Maia & M. Cáceres, Astrochapsa sp. nov., Chapsa angustispora E.L. Lima, Lücking, L. C. Maia & M. Cáceres, Chiodecton sp. nov., Diorygma sp. nov. 1, Diorygma sp. nov. 2, Graphis cilindrospora E.L. Lima, Lücking, L.C. Maia & M. Cáceres, Graphis sp. nov, Hemithecium sp. nov., Malmidea sp. nov., Myriotrema sp. nov, Opegrapha sp. nov., Phaeographis sp. nov, Porina sp. nov, Pyrenula cinnabarina Aptroot, E. L. Lima & M. Cáceres, Sarcographa sp. nov., Schizotrema sp. nov., Thelotrema sp. nov., além de novos registros para os biomas estudados. Amazônia e a Mata Atlântica apresentaram maior diversidade filogenética, seguido da Caatinga. As comunidades de liquens da Caatinga e dos Brejos de altitude são filogeneticamente mais próximas, e a Caatinga e o Cerrado apresentam maior número de táxons em comum. Através da análise de estrutura de comunidade foi possível verificar que a Amazônia, a Mata Atlântica, o Brejo de Altitude e a Caatinga estão mais relacionadas filogeneticamente. O Carrasco e o Cerradão abrigam muitas espécies estreitamente relacionadas. O Brejo de Altitude, a Caatinga e a Mata Atlântica apresentam aglomerados filogenéticos e no Cerrado e na Restinga existe uma superdispersão das espécies. Fatores como clima, temperatura, índice de luminosidade, altitude, além dos processos evolutivos ocorrentes ao longo do tempo nos biomas, ecossistemas associados e fitofisionomias estão diretamente relacionados à distribuição e grau de parentesco das famílias de liquens no Norte e Nordeste do Brasil. Understanding how and in what form the distribution of the communities of organisms occurs in the most diverse environments has raised several questions such as: what are the predominant groups, how the species are distributed in the biomes (agglomerated or dispersed) and what are the ecological processes structuring the biological communities. In order to reach this knowledge, a survey was carried out on the occurrence of epiphytic lichens for the North and Northeast Regions of Brazil, in the Amazonia, Caatinga, Atlantic Forest and Cerrado biomes, using the SpeciesLink and GBIF databases, ISE and URM exsiccates analysis, besides consulting the species records in publications (articles, theses, dissertations, conference abstracts); the existence of the DNA sequences deposits of the ITS, mtSSU and nuLSU regions in the NCBI database for registered species was investigated. The objective of this work was to evaluate the phylogenetic diversity and the degree of phylogenetic relatedness between the lichen communities in different plant formations and biomes distributed in the North and Northeast regions of the country. It has been hypothesized that lichen communities in these biomes have distributional patterns that suggest close phylogenetic relatedness between Atlantic Forest and Amazon genera, while Caatinga genera form separate clades. Phylogenetic cladograms were manually constructed in the Newick format based on the analyzed literature. In addition, epiphytic lichen collections, mostly crustose, were collected in the Caatinga and Atlantic Forest biomes, and in the ecosystem associated with the Atlantic Forest, the Restinga in the states of Pernambuco and Paraíba. Eighteen new species were identified: Astrochapsa inspersa E. L. Lima, Lücking, L.C. Maia & M. Cáceres, Astrochapsa sp. nov., Chapsa angustispora E.L. Lima, Lücking, L.C. Maia & M. Cáceres, Chiodecton sp. nov., Diorygma sp. nov.1, Diorygma sp. nov. 2, Graphis cilindrospora E.L. Lima, Lücking, L.C. Maia & M. Cáceres, Graphis sp. nov, Hemithecium sp. nov., Malmidea sp. nov., Myriotrema sp. nov, Opegrapha sp. nov., Phaeographis sp. nov, Porina sp. nov, Pyrenula cinnabarina Aptroot, E. L. Lima & M. Cáceres, Sarcographa sp. nov., Schizotrema sp. nov., Thelotrema sp. nov., as well to the new records for the studied biomes. The results indicated that the Amazon and the Atlantic Forest presented greater phylogenetic diversity, followed by Caatinga. The lichen communities of Caatinga and Brejos de Altitudes are phylogenetically closer, and the Caatinga and Cerrado have a greater number of taxa in common. Through the analysis of community structure it was possible to verify that the Amazon, Atlantic Forest, Brejo de Altitude and Caatinga are more related phylogenetically. Carrasco and Cerradão ecosystems harbor many closely related species. Brejo de Altitude, Caatinga and Atlantic Forest have phylogenetic clusters and, in Cerrado and Restinga areas there is a superdispersion of the species. Factors such as climate, temperature, luminosity index, altitude, besides evolutionary processes occurring over time in biomes, associated ecosystems and phytophysiognomies are directly related to the distribution and degree of relatedness of lichen families in the North and Northeast of Brazil.

Os liquens foliícolas apresentam uma distribuição ampla em florestas tropicais úmidas. A Mata Atlântica, uma das florestas mais diversas do mundo, apresenta diversas fitofisionomias, entre elas os Brejos de Altitude. Estes Brejos, também chamados Refúgios florestais, estão localizados na região Nordeste do Brasil, circundados por vegetação de Caatinga. Nosso objetivo foi registrar a diversidade de liquens foliícolas em cinco Brejos, nos estados da Bahia, Paraíba, Pernambuco e Sergipe e analisar a origem biogeográfica desses organismos. A composição da liquenobiota foliícola dos cinco Brejos foi comparado com a composição de 21 áreas situadas em seis regiões neotropicais na América Central e América do Sul desde a Mata Atlântica do Sul, na Argentina, e a Floresta Tropical andina no Equador até a grande bacia amazônica e as terras baixas e montanas na Costa Rica, Guatemala e México. Foram identificadas 158 espécies de liquens foliícolas nos cinco Brejos de Altitude. Os resultados mostram que os Brejos, a Mata Atlântica e a Amazônia Oriental possuem uma liquenobiota biogeograficamente semelhante, enquanto a liquenobiota da Amazônia Ocidental é similar a da porção andina e de terras baixas e montanas da América Central. A maioria das espécies dos Brejos apresentou ampla distribuição nas Américas tropicais, e somente 10 espécies, identificadas como novas neste estudo, tem potencial para serem endêmicas. Poucas espécies foram consideradas raras, por exemplo Calenia dictyospora, Echinoplaca leucomuralis, Gyalectidium areolatum, G. denticulatum, G. fuscum, G. laciniatum, G. puntilloi, Gyalideopsis cochlearifera, Microtheliopsis uniseptata, Porina cubana, Strigula vulgaris, Tricharia aulaxiniformis, T. paraguayensis, e Trichothelium intermedium que apresentam distribuição restrita a poucas localidades nos neotrópicos. Não foram identificadas espécies indicadoras para os Brejos de Altitude. As maiores diferenças biogeográficas entre as regiões devem estar relacionadar ao período Pleistoceno, onde ocorreram diversas mudanças climáticas e geológicas que proporcionaram o isolamento das áreas de Brejos de Altitude da Mata Atlântica e a fragmentação temporária das regiões amazônicas. Foliicolous lichenized fungi have a wide distribution in humid tropical forests. The Atlantic forest, worldwide one of the most diverse forests, has multiple phyto-physiognomies, and one of these are the 'mountainous forest fragments' ('Brejos of Altitude'). These 'Brejos', also called 'forest refuges', are located in the northeastern region of Brazil, within the semiarid Caatinga vegetation. Our objective was to determine the diversity of foliicolous lichenized fungi at five 'Brejos' mountains in the States of Bahia, Paraíba, Pernambuco and Sergipe, we also analyze the biogeographic origin of these organisms. The composition of the foliicolous lichen flora of the 'Brejos' was compared with the lichen flora of 21 other areas covering in total six other neotropical regions in Central and Southern America from the Atlantic forest in Argentina and the mountainous tropical forests in Ecuador up to the large Amazonia basin and the lowland and mountainous rainforests in Costa Rica, Guatemala and Mexico. In total, 158 foliicolous lichenized fungi were identified in the five 'Brejos of Altitude'. The results show that the 'Brejos', the Atlantic forest and Eastern Amazonia biogeographically have a closely related lichen biota, while the lichen biota of Western Amazonia is more similar to that of the Andes and the lowland and mountainous forests in Central America. The majority of the species identified in the 'Brejos' have a wide distribution in tropical America, and only 10 species, recognized as un-described species, have the potential to be endemic. A few species were considered rare, for instance Calenia dictyospora, Echinoplaca leucomuralis, Gyalectidium areolatum, G. denticulatum, G. fuscum, G. laciniatum, G. puntilloi, Gyalideopsis cochlearifera, Microtheliopsis uniseptata, Porina cubana, Strigula vulgaris, Tricharia aulaxiniformis, T. paraguayensis, and Trichothelium intermedium, having a distribution restricted to only a few areas in the neotropics. No indicator species for the 'Brejos' were identified. The major biogeographic differences between the regions should be related to the Pleistocene period, when diverse climatic and geological changes occurred affecting the isolation of the 'Brejos of Altitude' and the temporary fragmentation of the Amazonian regions.