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Base teórica: O Rio Grande do Sul se caracteriza por padrões epidemiológicos específicos, no que diz respeito a transmissão, prevalência e mortalidade. Possui como característica, a circulação predominante do Subtipo C do HIV-1, pouco observado em outros estados. Este subtipo viral possui predisposição para emergência mais rápida e frequente da mutação K65R, a qual reduz a atividade da classe de Inibidores Nucleosídios da Transcriptase Reversa (INTR), exceto da zidovudina (AZT). Objetivo: Examinar a associação do Subtipo C e variáveis sócio demográficas com a mutação K65R em pacientes em falha virológica. Métodos: Análise de uma grande base de dados do Sistema Nacional de Genotipagem (SISGENO) do Ministério da Saúde, incluímos pacientes em falha virológica que realizaram testes de genotipagem no período 2010-2017. Identificamos os subtipos virais circulantes, a prevalência da mutação K65R e fatores sócio-demográficos. Testamos a associação destas variáveis utilizando testes de qui-quadrado e utilizamos um modelo multivariado de regressão logística para medir o efeito do subtipo C na prevalência da mutação K65R, ajustando para outros fatores que podem estar associados com sua ocorrência. Resultados: Identificamos na base de dados, 58.155 pacientes que haviam realizado genotipagem no período. Excluimos gestantes, indivíduos com idade inferior a 16 anos e testes sem data de resultado,permanecendo com uma amostra de 32.111 pacientes em falha virológica. Subtipo B (72%) e subtype C (14%) foram os mais frequentes no Brasil. Subtipo B foi o mais prevalente em todas regiões, exceto na região sul, onde o subtipo C chegou a taxa de 48%. O estado de Santa Catarina apresentou a maior taxa entre os estados. Também observamos uma expansão do subtipo C para a região Centro-oeste, Ceará, Bahia e Rondônia. A prevalência da mutação K65R foi de 6,1% no período e aumentou ao longo do tempo. Na análise multivariada, encontramos associação independente da mutação K65R com subtipo C, sexo masculino e maior nível educacional. Conclusões: O subtipo C é o mais prevalente na região sul do Brasil e está se expandindo para a região Centro-oeste e outros estados. Encontramos uma associação independente entre a mutação K65R e subtipo C, gênero masculino e maior nível educacional. Este é o primeiro estudo que encontrou associação entre subtipo C e K65R em uma grande amostra de pacientes brasileiros. Background: HIV-1 subtype B is the most prevalent HIV subtype in Brazil, except in South region where subtype C predominates. A possible association between subtype C and K65R mutation have been proposed. This mutation can reduce the antiviral activity of inhibitors transcriptase reverse nucleoside (INTR), particularly tenofovir. Objective: To evaluate the association between HIV-1 subtype C and K65R mutation in patients with virological failure in Brazil. Methods: We analysed a large public dataset from the Ministry of Health, of patients undertaking genotypic tests during virological failure. Descriptive statistics were used to describe HIV-1 subtypes distribution, prevalence of K65R mutation and sociodemographic factors. Association between K65R mutation and socio-demographic factors, and HIV-1 subtypes were tested using chi-square tests. A multivariate logistic regression model measured the effect of subtype on the prevalence of K65R, adjusting for other factors significantly associated with its occurrence. Results: Results: We found 58,155 patients with available genotypic tests in the dataset. Excluding pregnant females and patients under 16 years old, we included 32,11 patients with virological failure. Subtype B (72%) and Subtype C (14%) was the more common clades in Brazil. Subtype B was the most prevalent in all regions, except in South Region, that Subtype C reached 48%. Santa Catarina State had the most prevalence of Subtype C. We also identified its expansion to Center-west Region, Ceará, Bahia and Rondônia. The K65R prevalence in Brazil was 6,1% increasing overtime. In a univariate analysis, we found a subtype C association with female gender, ethnicity and K65R mutation. In a multivariate analysis, we found a independent association between K65R mutation and subtype C, male gender and higher educational level. Conclusion: Subtype C is the most prevalent subtype in Brazilian South, and is expanding to Center-west and other states. We found a independent association between K65R mutation and subtype C, male gender and higher educational level. This is the first study in Brazil with a large sample that found an association between Subtype C and K65R mutation.

O herpesvírus bovino tipo 5 (BoHV-5) é classificado na ordem Herpesvirales, família Herpesviridae, subfamília Alphaherpesvirinae, gênero Varicellovirus. O BoHV-5 é um agente importante de encefalites ou meningoencefalites em bovinos. Até o presente três subtipos de BoHV-5 são reconhecidos (BoHV-5a, b & c), para que tais correlações possam ser investigadas como maior profundidade, a disponibilidade das sequências genômicas dos diferentes subtipos é de particular importância. Até o presente, somente uma sequência completa de BoHV-5a (SV507/99) encontra-se disponível. No presente estudo é apresentada a sequência genômica completa de uma amostra de BoHV-5 subtipo c, denominada P160/96. O genoma viral foi obtido através de sequenciamento de alto desempenho. As sequências obtidas foram analisadas com o software Geneious (versão 9.1.4). O genoma contém 137.740 pb, com 99% de similaridade em nível de nucleotídeos com a amostra SV507/99. Embora semelhante à sequência de genoma de BoHV-5 já publicada, existe um número de substituições de nucleotídeos e deleções/inserções ao longo do genoma, muitas das quais afetam as sequências de codificação. O genoma da amostra P160/96 apresenta um sítio adicional de clivagem para BstEII, localizado na região repetida interna (IR) da sequência, que revela o perfil de restrição enzimática característico de amostras do subtipo c. Este é o segundo genoma de BoHV-5 até o presente publicado, sendo o primeiro do subtipo c. Espera-se que esta sequência venha representar uma contribuição significativa para uma maior compreensão da biologia dos herpesvírus bovinos, especialmente na investigação de potenciais diferenças na patogenicidade de distintos subtipos de BoHV-5. Esse conhecimento poderá trazer subsídios adicionais para a definição de estratégias de controle ou erradicação mais apropriadas, contribuindo assim para a melhoria a saúde dos rebanhos bovinos. Bovine herpesvirus type 5 (BoHV-5) is classified in the order Herpesvirales, family Herpesviridae, subfamily Alphaherpesvirinae, genus Varicellovirus. BoHV-5 is an important agent of encephalitis or meningoencephalitis in cattle. For such correlations to be further investigated, the availability of the genomic sequences of the different subtypes is of particular importance. To date, only one complete sequence of BoHV-5 subtype a (SV507/99) is available. In the present study the complete genomic sequence of BoHV-5 subtype c, named P160/96, is presented. The viral genome was determined by high-throughput sequencing. The obtained sequence was analyzed with the Geneious software (version 9.1.4). The P160/96 genome has 137.740 bp, with 99% similarity at the nucleotide level with SV507/99. Although similar to the published BoHV-5 genome sequence, there are a number of nucleotide substitutions and deletions/insertions throughout the genome, many of which affect the coding sequences. The P160/96 genome has the additional BstEII cleavage site located in the internal repeat region (IR), which gives rise to the reveals the characteristic enzyme restriction profile of subtype c samples. This is the second published BoHV-5 genome and the, first of subtype c. It is expected that this sequence will represent a significant contribution to a better understanding of bovine herpesvirus biology, especially in the investigation of potential differences in pathogenicity of distinct BoHV-5 subtypes. This is expected to provide additional information for the definition of appropriate control or eradication strategies, thus contributing to the improvement of cattle health.