The conditioned media in which the tumor cells are cultured represents a model object for studying of secretome and proteomic composition of exosomes. This pool of proteins is of particular interest in terms of the search for potential markers of malignant diseases. The efficiency of the isolation of exosomes and secretome from the cell culture media largely determines the success of their analysis by the mass spectrometric method. In this paper, we have applied various approaches to isolate secretome and exosomes originated from Caco-2 colorectal adenocarcinoma cells. The combination of ultrafiltration and centrifugation provided a deep proteomic analysis of the secretome and exosomes obtained from the one initial volume of conditioned medium without the addition of fetal bovine serum. Applying tandem mass spectrometric analysis we have identified 436 secreted proteins. In exosomes, the characteristic proteins ALIX, CD63, syntenin, lactadherin (MFGE8) were identified. Using targeted mass spectrometry, the exosome markers CD82, CD9 and HSPA8 were determined at the levels of 0.08 ± 0.03 fmol/μg, 0.13 ± 0.03 fmol/μg and 2.6 ± 0.02 fmol/μg of total protein, respectively. Among the secreted proteins, there were many markers associated with tumor progression and metastasis, such as DAG1, PODXL, LRRN4, TGFBI, IL6ST, DSC1, DSG1, and NPC2., Кондиционированная среда, в которой культивируют опухолевые клетки, служит модельным объектом для исследования секретома и протеомного состава экзосом. Данный пул белков представляет особый интерес с точки зрения поиска потенциальных маркеров злокачественных заболеваний. Эффективность выделения экзосом и секретома из среды культивирования клеток во многом определяет успешность их анализа масс-спектрометрическим методом. В данной работе мы применили различные подходы к выделению секретома и экзосом линии колоректальной аденокарциномы Caco-2. Сочетание ультрафильтрации и центрифугирования обеспечило глубокий протеомный анализ секретома и экзосом, полученных из одного начального объема кондиционированной среды без добавления фетальной бычьей сыворотки. Панорамный масс-спектрометрический анализ позволил идентифицировать 436 секретируемых белков. В экзосомах были идентифицированы характерные белки ALIX, СD63, синтенин, лактадгерин (MFGE8). С применением таргетной масс- спектрометрии были определены маркеры экзосом CD82, CD9 и HSPA8 на уровне 0.08±0.03 фмоль/мкг, 0.13±0.03 фмоль/мкг и 2.6±0.02 фмоль/мкг общего белка соответственно. Среди секретируемых белков оказалось множество маркеров, ассоциированных с опухолевой прогрессией и метастазированием, таких как DAG1, PODXL, LRRN4, TGFBI, IL6ST, DSC1, DSG1и NPC2.