Avibacterium paragallinarum es el agente responsable de la coriza infecciosa en pollos. Este microorganismo provoca una enfermedad aguda del tracto respiratorio superior, que se caracteriza principalmente por la descarga nasal e inflamación facial. La enfermedad tiene significancia económica en la avicultura comercial por las pérdidas que ocasiona en la producción de huevo, una disminución de hasta un 40%, además de retraso en el crecimiento en pollos de engorda. Serologicamente la bacteria se clasifica en tres serogrupos que incluyen nueve serovariedades: A-1 a A-4; B-1 y C-1 a C-4. En Ecuador y México se reportó recientemente la serovariedad C-1. Esta serovariedad se encontraba geográficamente restricta a Japón. De manera particular en México, los aislamientos serovariedad C-1 estudiados muestran una relación clonal. El propósito del presente estudio fue determinar la relación filogenética de 5 aislamientos de campo C-1 de Ecuador y 10 aislamientos de México. Se analizaron los genotipos de los 15 aislamientos mostraron un genotipo ERIC-PCR único, lo cual indicó también una relación clonal. Asimismo, un aislamiento de A. paragallinarum NAD-independiente, serovariedad C-1, mostró un genotipo ERIC idéntico al obtenido para los aislamientos NAD-dependientes. El análisis filogenético se realizó a partir de las secuencias de los genes 16S rRNA y hagA. En ambos análisis, los resultados mostraron una identidad del 100% entre los 15 aislamientos y no se observó una relación estrecha (97.8%) con la cepa de referencia H-18 (serovariedad C-1) de Japón. Estos resultados indican que existe una relación clonal entre los aislamientos de Ecuador y México estudiados.
