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El presente artículo pretende analizar la convencionalidad de una institución procesal cuya legitimidad y validez se da por descontada, pero que, en realidad, riñe con nociones básicas de justicia asociadas al debido proceso. Con tal propósito, los autores estudian el desarrollo de la figura del juzgamiento en ausencia en la jurisprudencia de los principales tribunales internacionales en materia de derechos humanos y de los tribunales penales internacionales y mixtos, para concluir que esta figura, tal como está consagrado en Colombia, riñe con el derecho internacional de los derechos humanos. Finalmente, se valoran los argumentos sostenidos por la Corte Constitucional para afirmar la constitucionalidad para de la figura de la declaratoria de persona ausente y se demuestra que estos no resisten no un análisis serio desde el DIDH.

Background: The genetic etiology of several primary immunodeficiency diseases (PID) remains elusive. Next generation technologies represent a cost-effective and rapid first-line genetic approach for the evaluation of diseases underlying mendelian traits involved in PID which are characterized by a difficult and late diagnosis. Methods: In the PID group in Medellin (Colombia), up-today we have performed whole exome sequencing in 93 patients and relatives with severe phenotypes expecting for a gene causing disease underlying a PID. Results: From 93 WES analysis, gene causing disease have been identified in (n = 15/93) as follows: recurrent infections (n = 4/5, CYBB), BCGitis (n = 1/1, AR IL-12RB1), disseminated infection by Mycobacterium sp. (n = 1/7, AR IL-12RB1), BCGosis, salmonellosis, Mycobacterium tuberculosis and Klebsiella (n = 1, (PR)-IFNGR1), disseminated infection such as candidiasis (n = 5/5, AD- STAT1-GOF), histoplasmosis (n = 1/6, AR NCF4), invasive Corynespora cassiicola infection (n = 1/1, AR CARD9), recurrent infections and glomerulonephritis (n = 1/1, AR C3). Also, we have found several good candidate genes in a cohort of selective IgA deficiency (n = 2/23, PIK3CD, NFKB2), juvenile paracoccidioidomycosis (n = 3/3, IL17RA, IL18R1, PIK3CA) and finally, a cohort with impaired response against pneumococcal vaccines (n = 1/4, NFKBIA). We are performing further analysis in these candidate genes and exome reanalysis in the rest of patients. Conclusions: We analyzed 93 WES in patients and relatives with several PID phenotypes, we found gene causing defect (n = 15/93) from different cohort of PID patients. WES is emerging as a valuable tool to reach in a timely manner, a PID diagnosis with considerable potential to draw genotype-phenotype correlation.

Background: The transcription factor STAT1 plays a critical role in the immune response against mycobacterial, viral and fungal infections. Different mutations in STAT1 result in diverse clinical phenotypes: AR complete/partial biallelic mutations are associated with mycobacterial and viral infections while AD loss-of-function (LOF) mutations with mycobacterial disease only; in addition, AD gain-of-function (GOF) mutations are associated with autoimmunity and fungal infections. We now report novel mutations in STAT1 in six individuals from a large cohort of Colombians affected with mycobacterial, fungal and bacterial infectious diseases. Methods: We performed whole exome sequencing (WES) in four sporadic cases (P1, P2, P3 and P4) and the proband of one family case (P5). We confirmed mutations via Sanger sequencing in patients and family members. To assess the functional impact, we evaluated the STAT1 phosphorylation after stimulation with IFN-gamma in patients’ PBMC by flow cytometry and using the in vitro dual-glo luciferase assay. Results: Infections in the patients included chronic mucocutaneous candidiasis and pulmonary histoplasmosis in P1, chronic mucocutaneous candidiasis and pulmonary tuberculosis in P2, and chronic mucocutaneous candidiasis in P3, P4, P5 and P6. We found three novel (Q20R, E235G and L354R) and one previously reported (C324Y), heterozygous missense mutations in STAT1 in four sporadic cases (P1, P3, P2 and P4, respectively) and the previously reported P329L mutation in P5 and her father (P6). The novel mutations are predicted to be deleterious by SIFT and polyphen2. Patients’ PBMCs and the GAS reporter assay showed higher phosphorylation of STAT1 in response to IFN-gamma stimulation demonstrating that all mutant alleles were GOF. Conclusions: GOF-STAT1 mutations in our patients lead to a spectrum of chronic mucocutaneous candidiasis, histoplasmosis and tuberculosis, therefore STAT1 investigation should be addressed in patients with these types of infectious diseases. In addition, WES has become an important tool in the identification of genetic defects in patients with PID.

Background: Chronic granulomatous disease (CGD) is a primary immunodeficiency characterized by susceptibility to early-onset life-threatening bacterial and fungal infections as well as dysregulated chronic inflammation. CGD results from mutations in one of the components of the phagocyte NADPH oxidase, a multimeric complex that consists of two membrane-bound components (gp91phox and p22phox) and 3 cytoplasmic subunits (p40phox, p47phox y p67phox) that function to induce reactive O2 species (ROS) in phagocytic cells to induce microbial killing. To date, only a single patient with granulomatous colitis and compound heterozygous mutations in NCF4 encoding p40phox has been reported as a genetic subgroup of CGD. Method: We performed whole exome-sequencing in a patient with early-onset systemic histoplasmosis. Functional testing to Investigate phagocyte NADPH oxidase included dihydrorhodamine oxidation assay as well as amplex red and luminol. Protein expression was assessed by FACS and immunoblotting. Results: We found a missense homozygous variation in NCF4 within the phox homology (PX) domain, predicted to be damaging by polyphen and SIFT2 with a CADD score of 35. RT-PCR and immunoblotting demonstrated decreased p40phox protein expression protein both in neutrophils and EBV-transformed B cells from the patient, but not from controls. In addition, intracellular (IC) ROS production was significantly impaired after physiological stimulation with fMLP, Histoplasma capsulatum and Candida albicans on neutrophils and EBV-B, but not with phorbol 12-myristate 13-acetate (PMA). Conclusions: We report a novel homozygous mutation in NCF4 selectively impairing IC ROS production in a Colombian child. Remarkably, systemic histoplasmosis has not been previously reported in association with classical CGD, therefore our results expand the spectrum of genetic and infectious diseases underlying CGD in humans.

Antecedentes: La enfermedad granulomatosa crónica es una inmunodeficiencia primaria producida por mutaciones en los genes que codifican para alguna de las cinco proteínas que conforman el sistema NADPH oxidasa, el cual se encarga de destruir los microorganismos fagocitados mediante la producción de especies reactivas de oxígeno. El diagnóstico bioquímico se realiza mediante la prueba de dihidrorodamina 123 y el diagnóstico definitivo mediante técnicas moleculares como la secuenciación completa del exoma. Objetivo: Describir las características clínicas y realizar el diagnóstico molecular mediante la secuenciación completa del exoma de cuatro pacientes colombianos con enfermedad granulomatosa crónica. Métodos: Se revisaron las historias clínicas de los pacientes; se analizó la explosión respiratoria a través de la prueba de dihidrorodamina 123; se realizó secuenciación completa del exoma y las variantes encontradas se confirmaron por secuenciación de Sanger. Resultados: Los cuatro pacientes son de sexo masculino, con padres no consanguíneos, que presentaron manifestaciones clínicas desde temprana edad. El paciente 1 tuvo abscesos, lesiones osteolíticas e infecciones recurrentes. El paciente 2 presentó infección del tracto urinario (ITU) complicada, neumonía necrotizante multilobar e infecciones gastrointestinales a repetición. Los pacientes 3 y 4 son gemelos; el paciente 3 presentó neumonías e ITU recurrentes, absceso cervical y linfadenitis, mientras que el paciente 4 presentó síndrome febril sin foco, colitis granulomatosa, adenomegalias mesentéricas y retroperitoneales. Todos los pacientes obtuvieron resultados anormales en la dihidrorodamina 123 y mediante secuenciación completa del exoma y Sanger se hallaron las siguientes mutaciones en el gen CYBB ubicado en el cromosoma X que codifica para la proteína gp91phox: el paciente 1 presentó una mutación sin sentido en el exón 8 (c.G809A:p.W270X), el paciente 2 una mutación no sinónima en el exón 9 (c.T935A:p.M312K), los pacientes 3 y 4, cuatro una mutación sin sentido en el exón 6 (c.T563G:p.L188X). Conclusiones: La técnica de secuenciación completa del exoma es de gran utilidad en el diagnóstico de la enfermedad granulomatosa crónica pues permite determinar mutaciones en los genes del sistema NADPH oxidasa y brindar la adecuada consejería genética al paciente y su familia. Los pacientes con enfermedad granulomatosa crónica presentaron una mutación ligada al cromosoma X en el gen CYBB, dos de ellas corresponden a mutaciones sin sentido y una es no sinónima.

Resumen Diariamente los seres humanos están en interacción con objetos de uso continuo, como el papel moneda, sin el conocimiento de que estos almacenan microorganismos y de que nos exponemos al contacto con potenciales patógenos. La composición de la comunidad bacteriana en un billete colombiano fue determinada mediante el secuenciamiento profundo de librerías de amplicones 16S. Se encontraron 233 géneros bacterianos; 12 de estos géneros corresponden a especies con potencial patogénico. El género más abundante fue Propionibacterium, seguido de Streptococcus, Staphylococcus Pseudomonas . Este es el primer reporte de la diversidad bacteriana que puede ser alojada en este objeto de alta circulación en Colombia. Pocos estudios en el mundo han mostrado este nivel de detalle de la microbiota en billetes de circulación y ofrece un panorama mucho más amplio de la exposición diaria a microorganismos al utilizar papel moneda en las condiciones en las que se utiliza en Colombia.