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El presente trabajo tiene como objetivo principal es determinar las relaciones filogenéticas del taxón tschudii, con respecto a otras formas del género Lagothrix. Por primera vez se secuenció el gen mitocondrial COII, para muestras del taxón tschudii, procedente del sur de Perú y norte de Bolivia, que fueron contrastadas con muestras de las subespecies (£. l. lagotricha, L. I. lugens, L. I. poeppigii y L. I. cana) tradicionales de Lagothrix lagotricha. Los principales resultados de esta investigación son los siguientes: los arboles obtenidos con diferentes procedimientos mostraron que los individuos clasificados como tschudii formaron un ciado monofilético. Las distancias genéticas más bajas de L. I. tschudii con respecto a otros taxones fueron con L. I. cana (1.6%) y con L. I. lagothricha (1.7%), mientras que las distancias genéticas más altas fueron con L. I. lugens (3.3%) y L. /. poeppigii (2.5%); también mostró niveles altos de diversidad genética. Los análisis de heterogeneidad y flujo genético mostraron que otros taxones de L. lagothricha como L. I. lugens, podría estar más relacionado con L. I. tschudii que con L. I. cana; ratificando que las montañas Andinas podrían haber jugado un papel importante en el inicio de la divergencia dentro de Lagothrix en general y dentro de L. lagothricha en particular. The aim of work is determining the phylogenetic relationships of tschudii taxon. This is the first molecular work, which analyzed mitochondrial sequences of the tschudii taxon from southern Peru (Cuzco and Puno Departments) and northern Bolivia (La Paz Department) and compared with other Lagothrix taxa {poeppigii, lagotricha, lugens and cana). The results in this work were: the phylogenetics trees obtained clearly showed that the 10 individuals classified as tschudii conformed a monophyletic clade. The lowest genetic distances of L. I. tschudii were with L. I. cana (1.6 %) and with L. I. lagotricha (1.7 %), whilst the highest genetic distances were with L. I. lugens (3.3 %) and £. I. ooeppigii (2.5 %). Some of the genetic heterogeneity and gene flow analysis also showed that other L. lagotricha's taxa as L. I. lugens, could be more related with L. I. tschudii than with L. I. cana. This could ratify that the Andean mountains could had played an extremely important role in the initial divergence within Lagothrix and within L. lagotricha. Magíster en Ciencias Biológicas Maestría

Este estudio evaluó la estructura de la población de Hydrochoerus hydrochaeris en los llanos orientales colombianos y evaluó si las características geográficas de la región influencian la estructura observada. El estudio incluyó 104 secuencias de fragmentos de genes mitocondriales de chigüiro (67 secuencias del gen D-loop y 37 de citocromo B) y un conjunto de 8 microsatélites para 34 muestras de los departamentos de Arauca, Casanare y Meta. El uso conjunto de marcadores mitocondriales y nucleares permitió observar que las poblaciones de H. hydrochoerus presentan una diversidad genética baja y no presentan estructura genética a lo largo de la región. Al comparar con otras poblaciones suramericanas, se encontró que la población colombiana es la que presenta menor estructuración genética y la menor diversidad genética después de las poblaciones venezolanas. Los resultados sugieren que la población colombiana pasó recientemente por un evento de cuello de botella y que en los llanos venezolanos existe un mayor efecto de la cacería furtiva sobre la estructura poblacional de la especie. Sin embargo, para comprobarlo es necesario realizar un análisis de estas poblaciones con marcadores microsatelitales que permitan obtener información de la historia reciente de la población. Finalmente, recientes eventos de expansión de poblaciones fueron observados en poblaciones colombianas. Eventos similares han sido observados también en Paraguay y la especie H. isthmius, los cuales parecen estar asociados a eventos climáticos. Abstract: This study aimed to characterize the population structure of Hydrochaeris hydrochoerus in the Eastern plains of Colombia, and to evaluate whether the geographical characteristics of the region influence the observed structure. The study included 104 mitochondrial sequences (67 of Dloop and 37 of cytochrome B) and a set of 8 microsatellites for 34 individuals from Arauca, Casanare, and Meta (Colombia). Overall, using this set of mitochondrial and nuclear genes, populations exhibited a low genetic diversity and did not show a genetic structure across the region. Colombian populations have the lowest genetic structure and the second lowest genetic diversity in South America, and the Venezuelan populations are the least diverse. These results suggest a greater effect of furtive hunting on the genetic structure of capybara populations from Colombia and Venezuelan plains. Nevertheless, further studies of Venezuela populations using microsatellites are required to better understand the actual effect of this anthropic activity. Finally, recent events of population expansion were observed in Colombian populations. Similar events have been also observed in Paraguay and H. isthmius populations; these events seem to be associated to past climatic events. Maestría

Este estudio pretende aportar datos para dar a conocer la posible correspondencia filogenética de las subespecies morfológicas descritas hasta el momento para Eira barbara (Mustelidae) en su rango de distribución a través de Suramérica y parte de CentroAmérica con los resultados de un marcador mitocondrial (NADH5). Para este estudio se trabajaron 100 muestras correspondientes a seis de las siete subespecies descritas para esta especie en CentroAmérica y Suramérica (Brasil, Perú, Ecuador, Colombia, Guyana Francesa, Bolivia, Paraguay, Argentina, Panamá y Trinidad): E. b. barbara, E. b. inserta, E. b. madeirensis, E. b. peruana, E. b. poliocephala y E. b. sinuensis. A partir de los datos obtenidos no solo se estableció si la correspondencia de las subespecies se ajusta con las descritas morfológicamente, si no también si se han dado cambios demográficos de la especie a través del tiempo y su relación con eventos climáticos y geológicos. De igual manera se establecieron los posibles tiempos de divergencia entre los diversos grupos moleculares encontrados en el seno de E. barbara. Del estudio realizado se puede concluir lo siguiente: 1. La especie presenta una alta diversidad mitocondrial. 2. Se pueden distinguir claramente dos subespecies, una que corresponde a Suramérica que puede agruparse dentro de E. b. barbara y otra subespecie que corresponde a E. b. Inserta y que representa las poblaciones de CentroAmérica. 3. Se observan dos pequeñas agrupaciones significativas en el interior de Sudamérica, una en el Departamento del Cesar (Colombia) y otra en Argentina. 4. La especie presenta una expansión poblacional pleistocénica importante a lo largo de su historia. We sequenced the mitochondrial (mt) ND5 gene of 100 specimens of Eira barbara (Mustelidae, Carnivora). The samples represented six out of the seven putative morphological subspecies recognized for this Mustelidae species (£. b. inserta, E. b. sinuensis, E. b. poliocephala, E. b. peruana, E. b. madeirensis, and E. b. barbara} throughout Panama, Colombia, Venezuela, French Guiana, Brazil, Ecuador, Peru, Bolivia, Paraguay, and Argentina. The main results show that the genetic diversity levels for the overall samples and within each one of the aforementioned putative taxa were very high. The phylogenetic analyses showed that the ancestor of the Central and South-American E. barbara originated during the Miocene or Pliocene (6.3-4 millions of years ago, MYA). Furthermore, the ancestors of some geographical groups, (we detected at least four) originated during the Pliocene (3.7-2.5 MYA). These four groups were placed in the Cesar-Antioquia Departments (northern Colombia), Bolivia and northwestern Argentina, northern-central Peru, and in the trans-Andean area of Ecuador. However, during the Pleistocene, this species experienced a strong population expansion and many haplotypes expanded their geographical distributions. They became superimposed on the geographical areas of older geographical groups that originally differentiated during the Pliocene. Until new molecular studies are completed, including those with nuclear markers, we proposed the existence of only two subspecies of E. barbara (E. b. inserta in southern Central America, and E. b. barbara for all South America). All of the demographic analyses showed a very strong population expansion for this species in the last 400,000 YA during the Pleistocene. Magíster en Ciencias Biológicas Maestría