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This Final Degree Thesis consists of an approach to one of the practical applications of the Raman effect: the molecular pigment analysis. The guiding theme chosen to do so is the pigment analysis of a painting from the expressionist period. First, the Raman effect is described, followed by a description of the scientific methodology and the laboratory devices employed. Next, the general structure of a painting is described, joined to a description of how its pigments are analyzed using a Raman spectrometer in a direct and nondestructive way. One of the highlights of this TFG consists in the creation of a pigment database, this will allow any further investigation to identify the pigments of any work painted between 1828 and 1950 more clearly. Then, the visual characteristics and results of the painting are exposed. Finally, the palette identified in the painting is described, showing also a contribution in the Raman spectroscopy identification of cobalt blue pigment and other materials containing corundum. En este Trabajo de Fin de Grado se ha hecho un acercamiento a una de las aplicaciones prácticas del efecto Raman: el análisis molecular de pigmentos, tomando como hilo conductor del trabajo la investigación de la pigmentación de una obra del periodo expresionista. En primer lugar, se describe el efecto Raman, la metodología y el instrumental empleado. A continuación, se describe la estructura general de una obra pictórica y cómo se analiza su pigmentación de manera directa y no destructiva. Uno de los aspectos destacados de este TFG consiste en la creación de una base de datos (llamada espectroteca) con espectros de referencia tomados a partir de pigmentos homologados, que permite identificar de forma clara la pigmentación obras pintadas entre 1828 y 1950. Seguidamente, se comentan los resultados visuales que caracterizan la obra investigada. Por último, se expone la paleta identificada en la obra, así como una aportación a la identificación del pigmento azul de cobalto y otros materiales que contienen la submolécula alúmina calcinada. En aquest TFG s'ha fet un apropament a una de les aplicacions pàctiques de l'efecte Raman: l'anàlisi molecular de pigments, prenent com a fil conductor del treball la investigació de la pigmantació d'una obra del període expressionista. En primer lloc, es descriu l'efecte Raman, la metodologia i l'instrumental utilitzat. A continuació, es descriu l'estructura general d'una obra pictòrica i com s'analitza la seva pigmentació de forma directa i no destructiva. Un dels aspectes a destacar d'aquest TFG consisteix en la creació d'una base de dades (anomenada espectroteca) amb espectres de referència presos a partir de pigments homologats, que permet identificar de forma clara la pigmentació utilitzada entre 1820 i 1950. Seguidament, es comenten els resultats visuals que caracteritzen l'obra investigada. Per últim s'exposa la paleta identificada i una aportació a la identificació del pigment blau de cobal i altres materials que contenen la submolécula alúmina calcinada.

espanolEl objetivo de este estudio fue establecer las caracteristicas clinico-patologicas de los pacientes con melanoma y su asociacion con mutaciones del gen BRAF. Los informes de patologia y las muestras de tumores incluidos en parafina de 47 mujeres y 30 hombres con melanoma, con una edad promedio de diagnostico de 60 anos, se revisaron en el Hospital Federico Lleras Acosta de Ibague, entre 2010 y 2016. En estos tejidos tumorales se detecto la presencia de la mutacion V600E del exon 15 del gen BRAF, mediante secuenciaron por el metodo de Sanger e inspeccion visual del electroferograma. Ademas, se estudiaron las variables clinico-patologicas con X2, t-Student e indice Kaplan Meier. La mayoria de las lesiones estaban localizadas en las extremidades inferiores (46.6%). El subtipo mas frecuente fue el melanoma lentiginoso acral (41.8%). La mayoria eran de mal pronostico: profundidad superior a 4,1 mm (52.7%), ulceracion (61.4%) y tasa mitotica media o alta (> 30%). La mutacion V600E, se identifico en cinco pacientes con tumores grandes, profundos y ulcerados, cuatro de ellos tuvieron una supervivencia menor de cuatro anos. EnglishThis study aimed to establish the clinicopathological characteristics of patients with melanoma and its association with BRAF gene mutations. The pathology reports and paraffin-embedded tumor samples from 47 women and 30 men with melanoma, with an average age of diagnosis of 60 years, were reviewed at the Hospital Federico Lleras Acosta of Ibague, between 2010 and 2016. The presence of V600E mutation at the exon 15 of BRAF gene, was analyzed in these tumoral samples by Sanger sequencing and visual inspection of the electropherograms. We also studied the clinicopathological variables with X2, t-Student and the Kaplan Meier index. Most of the lesions were located in the lower limbs (46.6%). The most frequent subtype was Acral Lentiginous Melanoma (41.8%). Most lesions were of poor prognosis: Breslow depth greater than 4.1 mm (52.7%), ulceration (61.4%) and medium or high mitotic rate (> 30 %). The V600E mutation was identified in five patients with large, deep and ulcerated tumors, four of them had less than four years of survival. In conclusion, there was a higher frequency of melanoma in women, V600E BRAF mutation was present in patients with advanced disease (high Breslow index) and, the probability of five-year survival was less than 40%.

En el presente trabajo se comparan los resultados de la estimación de sexo en restos óseos humanos antiguos de individuos adultos de la Patagonia central argentina (N=42) a partir de dos métodos: por una parte, el estudio de estructuras de la pelvis, el cráneo, el húmero, el fémur y la tibia; por otra, el análisis molecular de secuenciación masiva (Next Generation Sequencing), mediante herramientas bioinformáticas validadas para ADN antiguo. Los resultados mostraron que la concavidad subpúbica y el arco ventral de la pelvis, el proceso mastoides del cráneo y las fórmulas propuestas por Béguelin para fémur y húmero ofrecen las estimaciones del sexo más confiables en esta muestra de restos humanos arqueológicos de Patagonia central. Por el contrario, las estructuras de la tibia y el ancho bicondilar del humero y el fémur ofrecen resultados significativamente diferentes o con bajas asociaciones a los obtenidos por métodos moleculares. Futuros análisis deberán enfocarse en estudios similares en esqueletos de subadultos., The present study compares the results of sex estimation in ancient human bone remains of adult individuals from Argentine central Patagonia (N = 42) using two methods. On the one hand, the study of structures of the pelvis, skull, humerus, femur, and tibia. On the other hand, the biological sex estimated by means of molecular analysis (Next Generation Sequencing), using bioinformatic tools validated for ancient DNA. The results showed that sex estimations based on features of the pelvis (subpubic concavity and ventral arc), the mastoid process of the skull and the formulas proposed by Béguelin for humerus and femur were statistically similar to molecular results in this particular sample from Patagonia. In contrast, the estimations based on structures of the tibia and bicondylar width of humerus and femur were significantly different from molecular sex estimations. Further research needs to be conducted in order to test sex-estimation methods on subadult skeletons., Asociación de Antropología Biológica de la República Argentina

Dentro del proceso agrícola se usan diferentes tipos de cuerpos de agua, por esto el conocimiento de la productividad del cultivo debe incluir el entendimiento del flujo del material microbiológico presente en las fuentes de agua usadas. La última aproximación metodológica pretende la identificación de comunidades bacterianas mediante el análisis de secuencias de ADN reveladas en muestras ambientales. Debido a la alta contaminación que pueden tener las muestras ambientales es importante llevar a cabo un proceso de extracción de ADN óptimo que permita realizar un posterior análisis molecular por métodos basados en PCR. Por esta razón, el objetivo del presente artículo es describir un protocolo químico de extracción de ADN bacteriano para cuerpos de agua usados en la actividad agrícola local, que sea sencillo, eficiente y rápido de aplicar, para obtener ADN de calidad. A partir de muestras de agua obtenidas del lago de Tota (Boyacá, Colombia), se extrajo ADN bacteriano mediante un protocolo químico modificado y comparado con un método estándar comercial. Como resultado se obtuvo ADN bacteriano con una concentración superior a 140 ng/ul y una pureza >1,7 A260/280, resultados similares a los obtenidos con el método estándar comercial con una concentración máxima de 45,94 ng/ul y una pureza superior a 1,8 A260/280. Los resultados sugieren que este protocolo de extracción de ADN es un método rápido y de bajo costo con el cual se obtiene ADN de elevada calidad y pureza que puede ser utilizado en cualquier análisis molecular.

Introduction.Soft rot in crops is caused by a group of bacteria capable of secreting enzymes that degrade pectin in the cell wall of the plants and causes significant economic losses in agriculture worldwide. In Costa Rica, there is few data available about the distribution, hosts, and genetic diversity of the causal agents of disease.Objective.To identify the presence of bacteria causing soft rot in vegetables located in Cartago and Alajuela using molecular and enzymatic analysis, and pathogenicity techniques.Materials and methods.The study was carried out between July and October 2017 in Cartago and Alajuela, Costa Rica. Plants with soft roth symptoms were collected: sweet chili (Capcicum annum), onion leaves and bulbs (Allium cepa), zucchini plants (Cucurbita pepo), tomato fruits (Solanum lycopersicum), and potato plants (Solanum tuberosum). Bacterial isolation was performed on a selective violet crystal and pectate (CVP) medium. Hypersensitive reaction (RH) tests were performed, the isolates were inoculated into sweet chili leaves and pathogenicity tests (Koch´s postulates) were carried out for the positive bacteria. The isolates were identified by the 16S RNA-Ribosomal gene.Results.Five bacteria with pectinolytic activity were isolated: Pt1-A, 6-M2, Ech2A, CfspA, and Cfsab. According to the pathogenicity analysis, CfspA, Cfsab, and Ech2A strains were causal agents of soft rot in chile. It was not possible to reproduce the symptoms in onion and potato. According to the molecular identification, CfspA and Cfsab strains were classified within thePectobacterium carotovorumclade, while Ech2A was classified asRaoultella terrigena.Conclusion.RaoultellaandPectobacterium carotovorumwere considered the causal agents of soft rotting of chili in the areas of Cartago and Alajuela respectively. Introducción.La pudrición blanda en los cultivos es causada por un grupo de bacterias capaces de secretar enzimas que degradan la pectina de la pared celular de las plantas y ocasionan pérdidas económicas importantes en la agricultura a nivel mundial. En Costa Rica existe poca información acerca de la distribución, hospederos y diversidad genética de los agentes causales de esta enfermedad.Objetivo.Identificar la presencia de bacterias causantes de pudrición blanda en hortalizas de la zona de Cartago y Alajuela con análisis moleculares, enzimáticos y técnicas de patogenicidad.Materiales y métodos.El estudio se llevó a cabo entre julio y octubre de 2017 en Cartago y Alajuela, Costa Rica. Se recolectaron plantas con síntomas de pudrición blanda en: chile dulce (Capcicum annum), hojas y bulbos de cebolla (Allium cepa), plantas de zucchini (Cucurbita pepo), frutos de tomate (Solanum lycopersicum) y plantas de papa (Solanum tuberosum). Se realizaron aislamientos bacterianos en un medio selectivo de cristal violeta y pectato (CVP). Se efectuaron ensayos de reacción hipersensible (RH), los aislamientos se inocularon en hojas de chile dulce y se llevaron a cabo pruebas de patogenicidad (postulados de Koch) para las bacterias positivas. Los aislamientos se identificaron molecularmente mediante el gen ARN-Ribosomal 16S.Resultados.Se aislaron cinco bacterias con actividad pectinolítica: Pt1-A, 6-M2, Ech2A, CfspA y Cfsab. Según el análisis de patogenicidad, las cepas CfspA, Cfsab y Ech2A fueron causantes de pudrición blanda en chile. No se logró reproducir los síntomas en cebolla y papa. De acuerdo con la identificación molecular, las cepas CfspA y Cfsab se clasificaron dentro del clado dePectobacterium carotovorum, mientras que Ech2A se clasificó comoRaoultella terrigena.Conclusión.Las bacteriasRaoultella terrigenayPectobacterium carotovorumse consideraron los agentes causales de pudrición blanda del chile en las zonas de Cartago y Alajuela, respectivamente.

Resumen Introducción. La pudrición blanda en los cultivos es causada por un grupo de bacterias capaces de secretar enzimas que degradan la pectina de la pared celular de las plantas y ocasionan pérdidas económicas importantes en la agricultura a nivel mundial. En Costa Rica existe poca información acerca de la distribución, hospederos y diversidad genética de los agentes causales de esta enfermedad. Objetivo. Identificar la presencia de bacterias causantes de pudrición blanda en hortalizas de la zona de Cartago y Alajuela con análisis moleculares, enzimáticos y técnicas de patogenicidad. Materiales y métodos. El estudio se llevó a cabo entre julio y octubre de 2017 en Cartago y Alajuela, Costa Rica. Se recolectaron plantas con síntomas de pudrición blanda en: chile dulce (Capcicum annum), hojas y bulbos de cebolla (Allium cepa), plantas de zucchini (Cucurbita pepo), frutos de tomate (Solanum lycopersicum) y plantas de papa (Solanum tuberosum). Se realizaron aislamientos bacterianos en un medio selectivo de cristal violeta y pectato (CVP). Se efectuaron ensayos de reacción hipersensible (RH), los aislamientos se inocularon en hojas de chile dulce y se llevaron a cabo pruebas de patogenicidad (postulados de Koch) para las bacterias positivas. Los aislamientos se identificaron molecularmente mediante el gen ARN-Ribosomal 16S. Resultados. Se aislaron cinco bacterias con actividad pectinolítica: Pt1-A, 6-M2, Ech2A, CfspA y Cfsab. Según el análisis de patogenicidad, las cepas CfspA, Cfsab y Ech2A fueron causantes de pudrición blanda en chile. No se logró reproducir los síntomas en cebolla y papa. De acuerdo con la identificación molecular, las cepas CfspA y Cfsab se clasificaron dentro del clado de Pectobacterium carotovorum, mientras que Ech2A se clasificó como Raoultella terrigena. Conclusión. Las bacterias Raoultella terrigena y Pectobacterium carotovorum se consideraron los agentes causales de pudrición blanda del chile en las zonas de Cartago y Alajuela, respectivamente. Abstract Introduction. Soft rot in crops is caused by a group of bacteria capable of secreting enzymes that degrade pectin in the cell wall of the plants and causes significant economic losses in agriculture worldwide. In Costa Rica, there is few data available about the distribution, hosts, and genetic diversity of the causal agents of disease. Objective. To identify the presence of bacteria causing soft rot in vegetables located in Cartago and Alajuela using molecular and enzymatic analysis, and pathogenicity techniques. Materials and methods. The study was carried out between July and October 2017 in Cartago and Alajuela, Costa Rica. Plants with soft roth symptoms were collected: sweet chili (Capcicum annum), onion leaves and bulbs (Allium cepa), zucchini plants (Cucurbita pepo), tomato fruits (Solanum lycopersicum), and potato plants (Solanum tuberosum). Bacterial isolation was performed on a selective violet crystal and pectate (CVP) medium. Hypersensitive reaction (RH) tests were performed, the isolates were inoculated into sweet chili leaves and pathogenicity tests (Koch´s postulates) were carried out for the positive bacteria. The isolates were identified by the 16S RNA-Ribosomal gene. Results. Five bacteria with pectinolytic activity were isolated: Pt1-A, 6-M2, Ech2A, CfspA, and Cfsab. According to the pathogenicity analysis, CfspA, Cfsab, and Ech2A strains were causal agents of soft rot in chile. It was not possible to reproduce the symptoms in onion and potato. According to the molecular identification, CfspA and Cfsab strains were classified within the Pectobacterium carotovorum clade, while Ech2A was classified as Raoultella terrigena. Conclusion. Raoultella and Pectobacterium carotovorum were considered the causal agents of soft rotting of chili in the areas of Cartago and Alajuela respectively.

Introduction.The genusMeloidogynecontains many species and their correct diagnosis of these must be based on the use of multiple tools, which in diagnostic laboratories allow a correct and reliable evaluation, specially for quarantine nematodes. The proper identification of a phytonematode is important not only to establish an appropriate control strategy, but also to avoid its spread to other areas where it could cause damage that would result in economic losses.Objective.To perform taxonomic and molecular studies to confirm theMeloidogynespecies, associated to a coffee plantation located in Barva, Heredia.Materials and methods.Soil and root samples were collected in a coffee plantation located in Barva, Heredia, Costa Rica, which were processed in the Nematology laboratory of the School of Agricultural Sciences at the Universidad Nacional (UNA), using the centrifugation-flotation method in sugary solution and molecular techniques.Results.On average, 30 J2100 cc-1were counted in soil and 1000 J210 g-1of roots of the root-knot nematode. Taxonomic and molecular techniques allowed to identify that the females and juveniles extracted from coffee roots corresponded toMeloidogyne exigua. Analysis of the sequences generated by PCR and the use of the DraI enzyme confirmed the identity of the species with 99 % similarity when compared to sequences from Costa Rica and Nicaragua, reported in the Genbank.Conclusion.Using different morphometric and molecular techniques,M. exiguaassociated with a coffee plantation was identified. Introducción.El géneroMeloidogynecontiene muchas especies y el diagnóstico correcto de estas debe basarse en el uso de múltiples herramientas, mismas que en laboratorios de diagnóstico permiten una evaluación correcta y confiable, especialmente cuando podría tratarse de nematodos cuarentenarios. La identificación adecuada de un fitonematodo es importante no solo para establecer una apropiada estrategia de control, sino que también para evitar su diseminación a otras áreas donde podría provocar daños que se traducirían en pérdidas económicas.Objetivo.Realizar estudios taxonómicos y moleculares para confirmar la especie deMeloidogyne, asociada a una plantación de café en la localidad de San Pedro de Barva, Heredia.Materiales y métodos.Se recolectaron muestras de suelo y raíz en una plantación de café ubicada en Barva, Heredia, Costa Rica, las cuales se procesaron en el laboratorio de Nematología de la Escuela de Ciencias Agrarias de la Universidad Nacional (UNA), por el método centrifugación-flotación en solución azucarada y técnicas moleculares.Resultados.En promedio se contabilizaron 30 J2en 100 cc-1en suelo y 1000 J2en 10 g-1de raíces del nematodo agallador. Tanto las técnicas taxonómicas como moleculares permitieron identificar que las hembras y juveniles extraídos de raíces de café correspondieron aMeloidogyne exigua. El análisis de las secuencias generadas mediante PCR y el uso de la enzima Dral confirmaron la identidad de la especie con un 99 % de similitud al compararla con secuencias de Costa Rica y Nicaragua, reportadas en el Genbank.Conclusión.Mediante el uso de diferentes técnicas morfométricas y moleculares se identificó aM. exiguaasociada a una plantación de café.

Introducción. El género Meloidogyne contiene muchas especies y el diagnóstico correcto de estas debe basarse en el uso de múltiples herramientas, mismas que en laboratorios de diagnóstico permiten una evaluación correcta y confiable, especialmente cuando podría tratarse de nematodos cuarentenarios. La identificación adecuada de un fitonematodo es importante no solo para establecer una apropiada estrategia de control, sino que también para evitar su diseminación a otras áreas donde podría provocar daños que se traducirían en pérdidas económicas. Objetivo. Realizar estudios taxonómicos y moleculares para confirmar la especie de Meloidogyne, asociada a una plantación de café en la localidad de San Pedro de Barva, Heredia. Materiales y métodos. Se recolectaron muestras de suelo y raíz en una plantación de café ubicada en Barva, Heredia, Costa Rica, las cuales se procesaron en el laboratorio de Nematología de la Escuela de Ciencias Agrarias de la Universidad Nacional (UNA), por el método centrifugación-flotación en solución azucarada y técnicas moleculares. Resultados. En promedio se contabilizaron 30 J2 en 100 cc-1 en suelo y 1000 J2 en 10 g-1 de raíces del nematodo agallador. Tanto las técnicas taxonómicas como moleculares permitieron identificar que las hembras y juveniles extraídos de raíces de café correspondieron a Meloidogyne exigua. El análisis de las secuencias generadas mediante PCR y el uso de la enzima Dral confirmaron la identidad de la especie con un 99 % de similitud al compararla con secuencias de Costa Rica y Nicaragua, reportadas en el Genbank. Conclusión. Mediante el uso de diferentes técnicas morfométricas y moleculares se identificó a M. exigua asociada a una plantación de café. Introduction. The genus Meloidogyne contains many species and their correct diagnosis of these must be based on the use of multiple tools, which in diagnostic laboratories allow a correct and reliable evaluation, specially for quarantine nematodes. The proper identification of a phytonematode is important not only to establish an appropriate control strategy, but also to avoid its spread to other areas where it could cause damage that would result in economic losses. Objective. To perform taxonomic and molecular studies to confirm the Meloidogyne species, associated to a coffee plantation located in Barva, Heredia. Materials and methods. Soil and root samples were collected in a coffee plantation located in Barva, Heredia, Costa Rica, which were processed in the Nematology laboratory of the School of Agricultural Sciences at the Universidad Nacional (UNA), using the centrifugation-flotation method in sugary solution and molecular techniques. Results. On average, 30 J2 100 cc-1 were counted in soil and 1000 J2 10 g-1 of roots of the root-knot nematode. Taxonomic and molecular techniques allowed to identify that the females and juveniles extracted from coffee roots corresponded to Meloidogyne exigua. Analysis of the sequences generated by PCR and the use of the DraI enzyme confirmed the identity of the species with 99 % similarity when compared to sequences from Costa Rica and Nicaragua, reported in the Genbank. Conclusion. Using different morphometric and molecular techniques, M. exigua associated with a coffee plantation was identified. Universidad Nacional, Costa Rica Escuela de Ciencias Agrarias

Quinua (C. quinoa W.) is considered a cereal with excellent nutritional properties, including high protein contein, because it has all amino acids, trace elements and significant amounts of vitamins. In Colombia more accurately in the department of Narino, Cauca, Cundinamarca y Boyaca currently has had a huge boost due to their agronomic potential and different benefits derived from the production, processing and marketing of its products. Therefore, the objective of this research was to characterize the genetic diversity of a collection of 55 materials quinoa with seven microsatellite markers RAMs. The analysis by the coefficient of Nei-Li at the level of similarity of 0,65 divided the population into four groups according the site origin materials. The value of average heterozygosity was 0,34 which is considered low compared to other studied of genetic diversity in Chenopodium. Molecular Analysis of Variance (AMOVA) and Fst demonstrate the existence of genetic variability at the intraspecific level. The parameters of genetic diversity found in this study show that the quinoa materials of the Boyaca governance collection are very homogeneous, however the variability that exists must be exploited in the breeding programs of the species leading to the production of new and better quinoa materials.

El turismo generado por la observacion de delfines mular Tursiops truncatus es una de los principales atractivos turisticos en el estero El Morro, Guayas-Ecuador, sin embargo, la falta de caracterizacion de hongos en el medio acuatico como fuentes principales infecciosas en Tursiops truncatus, genera preocupacion sobre esta poblacion, ante esto es necesario la caracterizacion fungica del medio acuatico en el estero El Morro. Para tal fin, se colectaron muestras de agua durante los meses enero y febrero de 2016, para realizar cultivos de hongos en Agar Sabouraud con dextrosa a temperatura de 30˚C por tres dias; posteriormente, se realizo aislados de cepas para identificacion morfologica y molecular. La identificacion morfologica determino 17.50% de especies como potencial agente patogeno, entre ellas Aspergillus fumigatus , Blastomyces dermatitidis y Candida albicans . A traves del analisis molecular mediante la seccion del espaciador interno transcripto ITS [Internal Transcribed Spacer ( ITS )] se identifico a Rhizopus oryzae, especie reportada como agente causal de infeccion en delfines. Aunque se detecto Aspergillus carbonarius y Heteroacanthella acanthothysa, estas especies no estan catalogadas como agentes patogenos para delfines. Este estudio permite concluir que parte de la diversidad fungica del agua del estero El Morro representa un potencial riesgo para la salud de los delfines que habitan esta zona. Abstract The tourism generated by the observation of bottlenose dolphins Tursiops truncatus is one of the main tourist attractions in the El Morro estuary, Guayas-Ecuador. However, the lack of characterization of fungi in the aquatic environment as main infectious sources in Tursiops truncatus, generates concern about this population, before this is necessary the fungal characterization of the aquatic environment in the El Morro estuary. For this purpose, water samples were collected during the months of January and February 2016, to culture fungi in Sabouraud Agar with dextrose at 30˚C temperature for three days; later, isolates of strains were made for morphological and molecular identification. The morphological identification determined 17.50% of species as potential pathogenic agent, among them Aspergillus fumigatus, Blastomyces dermatitidis and Candida albicans. Through molecular analysis using the Internal Transcribed Spacer (ITS) section, Rhizopus oryzae, a species reported as a causative agent of infection in dolphins, was identified. Although Aspergillus carbonarius and Heteroacanthella acanthothysa were detected, these species are not catalogued as dolphin pathogens. This study allows to conclude that part of the fungal diversity of the water of the El Morro estuary, which represents a potential risk to the health of the dolphins that inhabit this area.

El objetivo del presente estudio fue identificar mediante PCR múltiple la posible existencia de los serovares Salmonella Typhimurium y Enteritidis en 25 cepas de Salmonella spp previamente aisladas de cuyes e identificadas por sus características metabólicas. Mediante el análisis molecular se identificaron todas las cepas como Salmonella Typhimurium, evidenciando la amplificación de los cebadores específicos para los genes invA y fliC pertenecientes al género Salmonella y Salmonella Typhimurium, respectivamente. El presente estudio permitió establecer una metodología rápida para la identificación molecular de Salmonella Typhimurium y Enteritidis aislados de cuyes., The aim of this study was to identify by mutiplex PCR-based assays the possible presence of serovars Salmonella Typhimurium and Enteritidis in 25 strains of Samonella spp that were previously isolated from guinea pigs and identified by their metabolic characteristics. The molecular analysis identified all 25 strains as Salmonella Typhimurium, evidencing the primer amplification of genes invA and fliC of Salmonella spp and Salmonella Typhimurium, respectively. This study established a rapid methodology for molecular identification of Salmonella Typhimurium and Enteritidis isolated from guinea pigs.

Las micromatrices de tejido son plataformas de alto rendimiento que permiten el análisis de decenas a cientos de muestras de tejidos en forma simultánea. Estas se han utilizado, en especial, para analizar tejidos neoplásicos. Sin embargo, los beneficios de su aplicación pueden ser aprovechados en otras áreas de investigación, como la embriología y la histología. El presente trabajo explora el uso de la técnica de micromatrices de tejido para el análisis morfológico y molecular de tejidos animales normales. Un total de 82 muestras de piel canina normal prenatal y posnatal fueron utilizadas para construir la matriz. A partir de ésta, se obtuvo una gran cantidad de secciones en las que se aplicaron técnicas de histología convencional y de inmunohistoquímica. Los resultados nos muestran la eficacia de la técnica para realizar el análisis morfológico y molecular de decenas de muestras de tejido normal en forma simultánea. Esto permite la evaluación más estandarizada de los tejidos, reduciendo así la variabilidad que puede ocurrir cuando se realizan ensayos sobre muestras individuales., Tissue microarrays are platforms for high throughput simultaneous analysis of tens to hundreds of tissue samples. They have been used especially to analyze neoplastic tissues. However, the advantages of this technique could be applied to other research areas such as embryology and histology. This study explores the use of tissue microarrays for morphological and molecular analysis of normal tissues from animals. A total of 82 samples of normal skin from prenatal and postnatal dogs were selected and used to construct the array. A large number of sections from this array block were obtained and routine stain and immunohistochemistry techniques were applied. The results show the effectiveness of the technique for morphological and molecular analysis of a large number of normal tissue samples simultaneously. This allows the standardized assessment of tissues, thus reducing the variability that can occur when testing is performed on individual samples., Facultad de Ciencias Veterinarias

Introducción: La displasia cleidocraneal (DCC) es un raro síndrome esquelético de herencia autosómica dominante que se caracteriza por anomalías dentales y anormalidades óseas. Estas manifestaciones clínicas no requieren tratamiento en la mayoría de los casos. La enfermedad es causada por mutación en el gen RUNX2 (CBAF1), ubicado en el brazo corto del cromosoma 6. Objetivo: Reportar un caso de DCC y realizar una revisión bibliográfica enfocada en hallazgos clínicos y diagnóstico. Caso clínico: Paciente de 3 años de edad, con diagnóstico clínico de DCC en el momento del nacimiento. Con evidencia de desarrollo incompleto de huesos craneales, tórax en campana, adecuada dentición y presencia de clavículas. El análisis molecular reportó que el paciente es portador de la variante patogénica c.674G>A en el gen RUNX2, confirmando el diagnóstico. Conclusiones: La DCC es una patología poco frecuente, con unas características clínicas específicas. Es de suma importancia establecer el diagnóstico oportuno en estos pacientes con el fin de ofrecerles una mejor calidad de vida, y si es el caso, un adecuado tratamiento.

Characterization of the genetic diversity of Rhinoclemmys nasuta population inhabits Isla Palma (Malaga Bay, Valle del Cauca)was carried out using three microsatellite systems (Cm72, Cm58 and Cm3). In this locality, individuals of R. nasuta are widely distributed in the inland streams and creeks system. 100 to 200 iL of peripheral blood was taken off from 10 turtles in five streams of theisland, preserving samples in in a 0.5 M EDTA. DNA was extracted using Salting-out and Chelex 100 solutiontechniques. PCR amplified products were visualized and measured in polyacrylamide gels (19:1) to 8 % silver nitrate. Successful amplification products were obtained for all systems analyzed, two of which (Cm72 and Cm3) were found to be monomorphic, while the system Cm58had a high PIC (0.698) allowing to estimate the genetic diversity of this population. The observed heterozygosity was low (Ho = 0.26 ) and inbreeding indices FIS and FIT were high (0.67857 and 0.67881 ), indicating an excess of homozygotes in each of the rivers and for the all population. The molecular analysis of variance suggested that there is no difference in genetic structure of the population (FST= 0.00075, p = 0.95112 ). Therefore, the results suggest that the genetic diversity of R. nasuta population in Isla Palma was low and exhibited a highly inbred index. DIVERSIDAD GENETICA EN UNA POBLACION DE Rhinoclemmys nasuta (TESTUDINES:GEOEMYDIDAE) ASOCIADA A UN AMBIENTE INSULAR DEL CHOCO BIOGEOGRAFICO Se realizo la caracterizacion de la diversidad genetica de la poblacion de Rhinoclemmys nasuta , que habita en la localidad insular de Isla Palma, Bahia Malaga (Valle del Cauca, Colombia), utilizando tres sistemas de microsatelites (Cm72, Cm58 y Cm3). En esta localidad, R. nasuta se encuentra ampliamente distribuida en los sistemas de riachuelos y quebradas presentes. Se tomaron entre 100 a 200 µL de sangre periferica de 10 tortugas en cinco riachuelos, preservando las muestras en una solucion 0,5 M de EDTA y el ADN fue extraido mediante las tecnicas de Salting-out y Chelex 100. Los productos amplificados por PCR fueron visualizados y medidos en geles de poliacrilamida (19:1) al 8% con nitrato de plata. Se obtuvieron productos amplificados exitosos para todos los sistemas analizados, dos de los cuales (Cm72 y Cm3) resultaron ser monomorficos, mientras que el sistema Cm58 presento un PIC alto (0,698) permitiendo estimar la diversidad genetica de esta poblacion. La heterocigosidad observada fue baja (H o = 0,26) y los indices de endogamia F IS y F IT fueron altos (0,67857 y 0,67881), indicando un exceso de homocigotos en cada uno de los rios y para la poblacion total. El Analisis Molecular de Varianza sugirio que no existe estructura genetica diferencialen esta poblacion (F ST = 0.00075; p = 0.95112). En conclusion los resultados sugieren que la diversidad genetica de la poblacion de R. nasuta en Isla Palma es baja, siendo una poblacion altamente endogamica.

RESUMEN : En este trabajo se hizo el análisis morfológico y molecular a 28 caracoles terrestres de Mega-lobulimus oblongus, colectados en diferentes departamentos de Colombia, depositados en una colección de referencia. Para la caracterización morfológica, los animales se disecaron al estéreomicroscopio. Se describieron el sistema reproductor y la concha. Del sistema re-productor se tomaron medidas a las estructuras que lo componen. De la concha se describió la forma, el color, el número de espiras y la ornamentación e igualmente se tomaron medidas básicas usando un calibrador digital. Para el análisis molecular se usaron dos marcadores mitocondriales, el 16S rRNA y el gen Citocromo Oxidasa C subunidad I (COI). Ambos mar-cadores confirmaron la presencia de un único haplotipo en los ejemplares, aun para indi-viduos situados en regiones biogeográficas diferentes y distantes. Este estudio sugiere que en Colombia M. oblongus se encuentra en peligro, por lo que urgen investigaciones sobre reproducción, genética poblacional y biogeografía que esclarezcan su situación en el país. Demuestra además que las colecciones de referencia y los bancos de tejidos son fuentes de información de gran valor, ya que permiten conocer aspectos relacionados con el riesgo en que se encuentran las especies y que sirven de insumo para el diseño de acciones de conservación. ABSTRACT : In this work was done morphological and molecular analysis to 28 land snails of Megalobulimus oblongus, collected in different departments of Colombia, deposited in a reference collection. For morphological characterization, the animals were dissected in a stereomicroscope. The reproductive system and the shell were described. Measures were taken to structures of the reproductive system. Of the shell were described its shape, color, number of whorls and ornamentation and equally basic measures were taken using a digital caliper. For molecular analysis were used two mitochondrial markers, 16S rRNA and cytochrome C oxidase subunit I (COI). Only one haplotype was obtained for each marker, even for individuals of different and distant biogeographical regions. This study suggests that M. oblongus is in danger, therefore are urgent investigations about reproduction, population genetics and biogeography to clarify its situation in Colombia. It also demonstrates that the reference collections and tissue banks are sources of valuable information since they allow knowing aspects related with the species ́ risk that serve as an input for the design of conservation actions. COL0040189 COL0015099

El conocimiento de los mecanismos implicados en la abscisión del fruto es esencial para desarrollar estrategias de control y mejora de la recolección de la cosecha o la pérdida indeseada de frutos. No obstante, los avances en los análisis moleculares sobre la abscisión de frutos carnosos han estado limitados por la falta de material genético experimental apropiado y por la pequeña cantidad de células de la zona de abscisión (ZA) disponibles en la especies modelos para estos análisis. En particular, la abscisión del fruto maduro (AFM) es un proceso fisiológico programado genéticamente y controlado mediante mecanismos que, contrariamente a la abscisión del fruto inmaduro, no han sido caracterizados completamente en ninguna especie de frutos carnosos. En el presente trabajo, se ha llevado un estudio fisiológico y molecular acerca del papel de las poliaminas (PAs) y el etileno (ET) en el proceso de la AFM en olivo, como modelo de estudio para la AFM en frutos carnosos. Este ha incluido estudios anatómicos de la zona de abscisión (ZA) y la regulación de metabolitos, actividades y transcritos del metabolismo de PA y ET en la ZA durante la AFM. De igual manera, se ha realizado un análisis transcripcional a gran escala del proceso de AFM mediante secuenciación 454 que nos ha permitido identificar genes candidatos y rutas asociadas con la activación de este proceso, constituyendo el primer análisis detallado disponible de la actividad transcripcional del proceso de la AFM en especies de frutos carnosos. La utilización conjunta de la caracterización fisiológica y molecular nos ha permitido proponer un modelo de control del proceso de la AFM que podría ser útil para mejorar el cultivo del olivo., The knowledge of mechanisms involved in fruit abscission is essential for developing strategies to control and improve the yield or undesired loss of fruit. Nevertheless, the advances in the molecular analyses of fleshy-fruit abscission have been limited by the lack of suitable experimental genetic material and by the small amount of cells in the abscission zone (AZ) available in the model species for such analyses. In particular, mature-fruit abscission (MFA) is a programmed physiological process that is genetically programmed and controlled by mechanisms which, as opposed to immature fruit abscission, have not been characterized completely in any species bearing fleshy fruits. The present work uses a physiological and molecular approach to examine the role of polyamines (PAs) and ethylene (ET) in the process of MFA in olive, as a model for studying this type of abscission in fleshy fruits. This has included anatomical studies of the AZ and metabolite regulation, activities, and transcripts of the metabolism of PAs and ET in the AZ during MFA. Also, a tanscriptomic analysis of the AZ was made using 454 sequencing or pyrosequencing, which has enabled the identification of candidate genes and associated pathways with the induction of this process, constituting the first available detailed analysis of the transcriptional activity of the process of MFA in fleshy-fruited species. The joint use of physiological and molecular characterization has led to the proposal of a model for the control of the MFA process which could prove useful in improving olive yield.

Introduccion: El incremento de la resistencia en Campylobacter sp. (una de las principales causas de gastroenteritis bacteriana de origen alimentario) a fluoro-quinolonas y macrolidos, es un problema en salud publica. Objetivo: Conocer los patrones de susceptibilidad in vitro de Campylobacter jejuni a eritromicina y ciprofloxacina y conocer el origen de su resistencia en aislados de humanos. Material y Metodo: En este estudio, se compararon las susceptibilidades a ciprofloxacina y eritromicina -CIM efectuadas por microdilucion en caldo- de 55 aislados de C. jejuni provenientes de humanos con enterocolitis, con 55 aislados de carne de pollo y 44 de bovinos obtenidos en la Region Metropolitana, Chile. Resultados: De 55 aislados de C. jejuni de humanos, 33(60%) presentaron resistencia a ciprofloxacina y todos presentaron susceptibilidad a eritromicina. De 55 aislados procedentes de carne de pollo, 32 (58,2%) presentaron resistencia a ciprofloxacina y un aislado resulto resistente a eritromicina (1,8%). De 44 aislados de bovinos, 8(18,2%) presentaron resistencia a ciprofloxacina y todos resultaron sensibles a eritromicina. Cuatro patrones de electroforesis a campo pulsado coincidieron en sus perfiles de resistencia y agruparon aislados de origen humano y animal. Conclusiones: Los resultados muestran que eritromicina continua siendo efectiva para el tratamiento de la campilobacteriosis y que existe un alto porcentaje de cepas resistentes a ciprofloxacina. Se considera probable que la presencia de cepas resistentes a ciprofloxacina en la carne de pollo puede ser en parte el origen de la resistencia a este farmaco en humanos.

Six multiresistant, NDM-1-producing Klebsiella pneumoniae strains were recovered from an outbreak that affected six neonatal patients in a Colombian hospital. Molecular analysis showed that all of the isolates harbored the bla NDM-1 , qnrA , and intI1 genes and were clonally related. Multilocus sequence typing showed that the isolates belonged to a new sequence type (ST1043) that was different from the sequence types that had previously been reported. This is the first report of NDM-1-producing isolates in South America.

The aim of this study was to evaluate the effect of culture medium supplementation with conjugated linoleic acid (CLA) on embryo cleavage, embryo production, sex ratio and embry o quality inin vitroproduced bovine embryos at day 7 of culture. 308 COCs were used for the group supplemented with 100µM of the CLA isomer Cis-9 trans-11 and Cis-10-Trans-12 and 257 COCs for the untreated control group; the embryo production was 25.32% vs 35.40%, respectively, with significant difference between them (P < 0.05). The embryos were classified according to the IETS in Mo, Bt, Bl and Bx stages for morphological and molecular analysis. PCR was used for sex determination; embryo quality was assessed as grade 1 (excellent or good) and Grade 2 (regular). The results showed no significant difference in the proportion of embryos male:female for any of the stages in the CLA supplemented group achieving the expected natural ratio (50:50), while the control maintained a greater number of males. The CLA improved quality in Bl and Bt stages for both females and males (P < 0.05) having a greater number of grade 1 embryos in supplemented group, while control embryos were more in grade 2. In conclusion, CLA adversely affects the production of bovine embryosin vitro, but the sex ratio equals the natural one in all stages and improves embryo quality in some stages of early development. &nbsp, El objetivo de este estudio fue evaluar el efecto de la suplementación del medio de cultivo con ácido linoleico conjugado (CLA) sobre el clivaje, producción, proporción de sexos y calidad embrionaria en embriones bovinos producidosin vitroal día 7 de cultivo. Se fertilizaron 308 CCO suplementados en cultivo con 100µM del isómero de CLA Cis-9 Trans-11 y Cis-10-Trans-12 y 257 CCO en el grupo control; la producción de embriones fue 25,32% vs 35,40% respectivamente con diferencia significativa (P < 0,05). Los embriones fueron clasificados por estadios según la IETS en Mo, Bt, Bl y Bx para su análisis morfológico y molecular. Se empleó PCR para la determinación del sexo y se evaluó la calidad como grado 1 (excelente o buena) y grado 2 (regular). Los resultados no muestran diferencia significativa en la proporción de sexos para ninguno de los estadios en el grupo suplementado con CLA; sin embargo, se igualó la proporción natural esperada (50:50), mientras que en el control hubo mayor cantidad de machos, al observar el total de los estadios. El CLA mejoró calidad en el estadio de Bl para las hembras y Bt para los machos (P < 0,05), teniendo un mayor número de embriones grado 1 en los embriones suplementados, mientras que el control presentó más embriones grado 2. En conclusión, el CLA afecta negativamente la producción de embriones bovinosin vitro, pero iguala la proporción de sexos a la natural en el total de estadios y mejora calidad en algunos estadios del desarrollo temprano. &nbsp

Resumen. El objetivo de la investigación fue determinar la asociación del polimorfismo (C/T) del intrón 6 del gen de la bLTF, con la incidencia de algunas enfermedades en ganado lechero. Para ello fueron observadas 482 vacas Holstein, durante al menos una lactancia, determinando la incidencia de algunas de las enfermedades mas importantes en la ganaderia de leche. La genotipificación para el polimorfismo de bLTF, se hizo usando la técnica de PCR-RFLP con DNA extraído de sangre periférica mediante la técnica de salting out. Para estudiar la asociación de los alelos del gen LTF, se utilizó el alelo B como control y se determinó el Odds Ratio (OR). Como resultados se obtiene que las frecuencias de los alelos A y B para el gen bLTF fueron 0,78 y 0,22 respectivamente. Las frecuencias genotípicas fueron 0,60, 0,36 y 0,04 para AA, AB y BB respectivamente. Una asociación altamente significativa (P≤0,001) fue hallada entre la incidencia de mastitis clínica y el polimorfismo del gen LTF. Los individuos portadores del alelo B tuvieron una probabilidad de incidencia de mastitis dos veces superior a los portadores del alelo A (OR=2.115 IC del 95%, 1.392-3.213). En el caso de la mastitis subclínica la probabilidad de incidencia fue de 1,6 veces más en los portadores del alelo B, con un OR=1.637 IC del 95% 1.184-2.264. Para la incidencia de enfermedades metabólicas, reproductivas, respiratorias, parasitarias, cáncer y cojeras, no se halló diferencia significativa (P>0,05) y se encontró asociación del alelo B del polimorfismo del intrón 6 del gen bLTF con la incidencia de mastitis clínica y subclínica. Abstract. The research objective was to determine the association of polymorphism (C/T) of intron 6 bLTF gene, with the incidence of some diseases on dairy cattle. A total of 482 Holstein cows located in different herds in the department of Antioquia - Colombia, were used to follow the incidence of disease, for at least a full lactation. Genotyping was performed using PCR-RFLP with DNA extracted from peripheral blood by salting out technique. DNA amplification was obtained of the 482 samples with frequencies of alleles A and B of 0.78 and 0.22 respectively. The genotype frequencies were 0.60, 0.36 and 0.04 for AA, AB and BB respectively. This study find a significant association (P ≤ 0.001) between the incidence of clinical mastitis and LTF gene polymorphism. It was found a two fold risk of infection in animals that had the B allele compared with those with the A allele (OR = 95% 2115, 1392-3213). Shared situation in the case of subclinical mastitis with an OR = 95% 1637 1184-2264. In the case of metabolic diseases, reproductive, respiratory, parasitic, cancer and lameness, there were no significant difference (P>0.05). It was found association of B allele of ribosomal gene 6 intron of the bLTF with the incidence of clinical and subclinical mastitis.

El trabajo se realizó en el Centro de Estudios de Biotecnología Vegetal de la Facultad de Ciencias Agrícolas, perteneciente a la Universidad de Granma, Cuba; para lo cual, se emplearon raíces tuberosas del clon de boniato (camote) INIVIT B 93-1, trasladadas al laboratorio y colocadas en frascos con agua para inducir la brotación de las yemas, y vitroplantas de embriones somáticos obtenidos de callos a partir de limbos foliares, sembrados en medio MS; y para ambos casos se tomaron al azar muestras de limbos foliares para estudiar la estabilidad del material propagado mediante análisis moleculares del ADN (RAPD), empleando diez cebadores arbitrarios (OPF y OPA), evaluándose las bandas existentes entre el donante y el regenerante por su presencia y ausencia. Es necesario el monitoreo molecular del material vegetal para la conservación de la biodiversidad genética en las diferentes localidades, regiones y países. Como resultado, siete cebadores produjeron una amplificación aceptable en cuanto a la intensidad de bandas en el donante y las vitroplantas obtenidas a partir de embriones somáticos, existiendo un alto monomorfismo entre ambos materiales, lo cual puede brindar mayor y más certera información del material vegetal para el establecimiento de estrategias y procedimientos a favor de la conservación y difusión de la biodiversidad. This work was conducted in the Centre of Studies of Plant Biotechnology of the Faculty of Agricultural Sciences of the University of Granma. We used tuberous roots of the sweet potato clone INIVIT B 93-1 and vitroplants derived from somatic embryos coming from calli obtained from leaf tissue grown in MS medium. Tissue samples from both types of plant material were randomly obtained and their genetic stability analyzed by molecular analysis of the ADN (RAPD), using ten arbitrary primers (OPF y OPA) and evaluating the bands in terms of presence and absence. Such a molecular monitoring is required for any study of genetic diversity conservation to be conducted in different localities, regions and countries. As a result, seven primers produced an acceptable amplification, indicated by the intensity of the bands found in the donor and the somatic embryo-derived vitroplants. The high monomorphism appearing between both materials gives more accurate information for the establishment of strategies and procedures for the conservation and diffusion of the biodiversity.

Cherubism, a case-report Cherubism is a benign osteofibrous disorder affecting facial bones. It is produced by an abnormalfunctioning of osteoblasts and osteoclasts, leading to replacement of normal bone by cellular fibroustissue and immature bone, producing painless progressive growing of the jaw, with round facial appearance. Case-report: An 11 years-old female patient is presented, with 8 years of progressive facial swelling. Theclinical and radiologic diagnosis of cherubism was confirmed by molecular analysis, detecting de novo mutation in SH3BP2 gene.( Key words: cherubism, mutation, genes, dominant).Rev Chil Pediatr 2009; 80 (1): 65-69 RESUMEN El Querubismo es una alteracion osteofibrosa benigna que los huesos de la cara originada por unfuncionamiento anormal de osteoblastos y osteoclastos que ocasiona reemplazo de tejido oseo por matrizfibrosa y hueso inmaduro que como consecuencia desarrolla un crecimiento progresivo no doloroso de lamandibula, dando un aspecto redondeado a la cara.

Publicado en el año 2008 en: Revista ITEA, 104 (2), 295-302. http://www.aida-itea.org/index.php/revista/contenidos?idArt=87&lang=esp Webs desde donde descargar las ponencias: http://acteon.webs.upv.es/ Web del congreso: http://www.uco.es/genetica/MERAGEM/xivreunion.htm La raza Merina ha tenido a lo largo de la historia un importante papel desde el punto de vista político, biológico, económico y ganadero, siendo hoy día la raza de aptitud cárnica de mayor censo de nuestro país. El objetivo de este trabajo ha sido conocer la situación de las estirpes tradicionales más importantes de la raza Merina en España (“Serena”, “Hidalgo”, “Granda” y “López-Montenegro”) mediante el uso de herramientas genealógicas y moleculares. Según nuestros resultados las estirpes que más influencia mantienen actualmente son la “Serena” y la “Hidalgo” con un 27% y un 15% respectivamente mientras que “López-Montenegro” y “Granda” cuentan con sólo un 0,3%. Se ha puesto de manifiesto la predilección de los criadores por determinados tipos de merino lo que podría poner en peligro la variabilidad genética intrarracial del Merino haciendo desaparecer alguna de las estirpes tradicionales, que por sus características morfológicas y productivas son menos rentables económicamente. Las dos estirpes con más influencia en la población son las que han presentado unos valores de variabilidad genética, estimada a partir de marcadores moleculares, mas reducida. Sin embargo las estirpes “Granda” y “López-Montenego” han presentado los valores mayores de heterocigosidad observada (Ho) (0,67 y 0,70), esperada (He) (0,68, 0,72) y número medio de alelos por locus (Nma) (7,45 y 7,97) respectivamente. La comparación entre ambas metodologías determinó que el coeficiente de diferenciación genética (FST) para los animales de las cuatro líneas identificadas, fue un 30% más elevado mediante genealogías que mediante información molecular. Preliminary assessment of population structure of Spanish Merino Breed: traditional strains situation using genealogical and molecular analysis Merino sheep breed is the most important breed in Spain according to their census. It is the most censed meat production sheep breed in Spain. It has played an important role in the politic, biologic, economical and livestock aspects. The aim of this study is assess the situation of the most important traditional strains in Spain of Merino breed (“Serena”, “Higalgo”, “Granda” y “López-Montenegro”) using genealogical and molecular information. The most influential strains in the present Merino population are “Serena” and “Hidalgo” (27% and 15% respectively). “Lopez-Montenegro” and “Granda” strains have only 0.3% of influence. The breeder’s preferences in raise some strains have been evidenced. This task could endanger the intra population genetic variability of the Merino breed and some traditional strains could disappear because of their economical worse morphological and productive trait. The two more influential strains (“Serena” and “Hidalgo”) have shown the lowest value of the molecular variability parameters. However the highest values have been shown by “Granda” and “López-Montenego” strains (observed heterozygosis (Ho) = 0.67 and 0.70; expected heterozygosis (He) = 0,68 and 0,72; and average number of alleles per locus was 7,45 and 7,97 respectively). We found that the coefficient of genetic differentiation value (FST) using genealogical information, for the four strains analyzed, was 30% higher than using molecular information.

La citología exfoliativa es una técnica sencilla, no agresiva y bien aceptada por los pacientes, por lo que podría ser útil en el diagnóstico precoz del cáncer oral. Sin embargo, su utilización como método diagnóstico de atipias epiteliales y especialmente del carcinoma oral de células escamosas ha perdido importancia, sobre todo debido a su baja sensibilidad representada por el elevado número de resultados falsos negativos. Se atribuye esta baja sensibilidad a diversos factores, entre ellos: toma inadecuada de la muestra, error en la técnica e interpretación subjetiva de los hallazgos citológicos. Afortunadamente, en los últimos tiempos, el desarrollo del análisis cuantitativo, la citomorfología, el análisis del ADN, la detección de marcadores tumorales y el análisis molecular ha contribuido al resurgir de esta técnica. Exfoliative cytology is a simple non-aggressive technique that is well accepted by the patient, and that is therefore an attractive option for the early diagnosis of oral cancer, including epithelial atypias and especially squamous cell carcinoma. However, traditional exfoliative cytology methods show low sensitivity (i.e. a high proportion of false negatives) in the diagnosis of these pathologies. This low sensitivity is attributable to various factors, including inadequate sampling, procedural errors, and the need for subjective interpretation of the findings. More recently, the continuing development of automated cytomorpho-metric methods, DNA content determination, tumour marker detection, and diverse molecular-level analyses has contributed to renewed interest in exfoliative cytology procedures for the diagnosis of oral cancer. The present study briefly reviews developments in these areas.