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The Peruvian Paso Horse (CPP) is a breed with a four-stroke gait originating in Peru from the horses that arrived at the time of the conquest of America. The aim of this study was to know the level of inbreeding and the effect on genetic variability in the breed. In total, 8330 animals were analysed that included the population of CPP born in Ecuador and their Peruvian ancestry (PT) and two reference populations of animals born in Ecuador (PE) and born between 2008 and 2018 (PR). The average traced generations were 9.18 ± 3.89 (PT), 11.14 ± 2.23 (PE) and 12.83 ± 1.42 (PR) and the completeness of the pedigree was over 90% in the first, fourth and fifth generations of PT, PE and PR, respectively. Average generation interval of 8.72 ± 4.56 (PT), 8.79 ± 4.30 (PE) and 9.20 ± 4.61 (PR). Average individual consanguinity: 5.97% (PT), 6.83% (PE) and 8.11% (PR) and kinship relationship: 9.02% (PT), 10.56% (PE) and 11.56% (PR). Individual increase in consanguinity per year was 0.13% and per generation 1.13%. The effective size of the population was less than 50. The probabilities of origin of the genes were greater than one. The occurrence of loss of genetic variability due to the bottleneck effect and genetic drift is concluded., El Caballo Peruano de Paso (CPP) es una raza con ambladura de cuatro tiempos originaria de Perú a partir de los caballos que llegaron en la época de la conquista de América. El objetivo del estudio fue conocer el nivel de consanguinidad y el efecto sobre la variabilidad genética en la raza. Se analizaron 8330 animales que incluyó la población de CPP nacidos en Ecuador y su ascendencia peruana (PT) y dos poblaciones de referencia de animales nacidos en Ecuador (PE) y nacidos entre 2008 y 2018 (PR). Las generaciones trazadas promedio fueron de 9.18 ± 3.89 (PT), 11.14 ± 2.23 (PE) y 12.83 ± 1.42 (PR) y la completitud del pedigrí sobre el 90% en la primera, cuarta y quinta generación de PT, PE y PR, respectivamente. Intervalo generacional promedio de 8.72 ± 4.56 (PT), 8.79 ± 4.30 (PE) y 9.20 ± 4.61 (PR). Promedio de consanguinidad individual: 5.97% (PT), 6.83% (PE) y 8.11% (PR) y relación de parentesco: 9.02% (PT), 10.56% (PE) y 11.56% (PR). Incremento individual de consanguinidad por año fue de 0.13% y por generación de 1.13%. El tamaño efectivo de la población fue menor a 50. Las probabilidades de origen de los genes resultaron mayores a uno. Se concluye la ocurrencia de pérdida de variabilidad genética por efecto de cuello de botella y deriva genética.

Introduction.There is not much information on pure cattle with a genealogical certificate in Costa Rica. It is necessary to know the status of this population to direct efforts towards the productive improvement of the Zebu cattle breeds.Objective.To update the database of the Costa Rican Cebu Cattle Breeders Association (ASOCEBÚ), characterize this population and analyze the use of males of the gray Brahman breed in the country.Materials and methods.An inventory was done in 121 herds to update the Association’s database to 2018. The information was sorted by breed, sex, age, total animals, breeders, socio-economic region, province, and canton. The frequency of use of gray Brahman breeders was determined.Results.A total of 10 995 pure animals were counted, distributed in six breeds (gray Brahman, red Brahman, Nelore, Gyr, Guzerat, and Indubrasil). The gray Brahman breed predominated with 74.5 % of the population and 76.8 % of the total of breeders. The Chorotega region had the highest registered population (49.5 %) and the highest number of breeders (37.2 %). 55.8 % of the total population came from ten breeders, however, the largest number of herds corresponds to farms with few animals. In the gray Brahman breed, 60.8 % of the population comes from domestic bulls, and 39.2 % from other countries.Conclusion.Registered pure zebu cattle are distributed throughout the whole country. Attention should be put to genetic management to minimize inbreeding. Census and survey managers are encouraged to include the purebred populations in their assessments. Introducción.Existe escasa información sobre ganado puro con certificado genealógico en Costa Rica. Es necesario conocer el estado de esta población para dirigir esfuerzos en la mejora productiva del ganado cebú.Objetivo.Actualizar la base de datos de la Asociación de Criadores de Ganado Cebú de Costa Rica (ASOCEBÚ), caracterizar dicha población y analizar el uso de los machos de la raza Brahman gris en el país.Materiales y métodos.Se realizó un inventario en 121 ganaderías para actualizar la base de datos de la Asociación al año 2018. La información se clasificó por raza, sexo, edad, total de animales, criadores, región socio-económica, provincia y cantón. Se determinó la frecuencia de uso de reproductores Brahman gris.Resultados.Se contabilizaron 10 995 animales puros, distribuidos en seis razas (Brahman gris, Brahman rojo, Nelore, Gyr, Guzerat e Indubrasil). La raza Brahman gris predominó con un 74,5 % de la población y 76,8 % del total de criadores. La región Chorotega presentó la mayor población inscrita (49,5 %) y el mayor número de criadores (37,2 %). El 55,8 % de la población total provino de diez criadores, sin embargo, el mayor número de ganaderías correspondió a fincas con pocos animales. En la raza Brahman gris, el 60,8 % de la población provino de toros nacionales y el 39,2 % del extranjero.Conclusión.Los cebuinos puros registrados se distribuyen en todo el país. Se debe poner atención al manejo genético para minimizar la consanguidad. Se recomienda a los encargados de censos y encuestas, incluir la población de razas puras dentro de las evaluaciones.

Resumen Introducción. Existe escasa información sobre ganado puro con certificado genealógico en Costa Rica. Es necesario conocer el estado de esta población para dirigir esfuerzos en la mejora productiva del ganado cebú. Objetivo. Actualizar la base de datos de la Asociación de Criadores de Ganado Cebú de Costa Rica (ASOCEBÚ), caracterizar dicha población y analizar el uso de los machos de la raza Brahman gris en el país. Materiales y métodos. Se realizó un inventario en 121 ganaderías para actualizar la base de datos de la Asociación al año 2018. La información se clasificó por raza, sexo, edad, total de animales, criadores, región socio-económica, provincia y cantón. Se determinó la frecuencia de uso de reproductores Brahman gris. Resultados. Se contabilizaron 10 995 animales puros, distribuidos en seis razas (Brahman gris, Brahman rojo, Nelore, Gyr, Guzerat e Indubrasil). La raza Brahman gris predominó con un 74,5 % de la población y 76,8 % del total de criadores. La región Chorotega presentó la mayor población inscrita (49,5 %) y el mayor número de criadores (37,2 %). El 55,8 % de la población total provino de diez criadores, sin embargo, el mayor número de ganaderías correspondió a fincas con pocos animales. En la raza Brahman gris, el 60,8 % de la población provino de toros nacionales y el 39,2 % del extranjero. Conclusión. Los cebuinos puros registrados se distribuyen en todo el país. Se debe poner atención al manejo genético para minimizar la consanguidad. Se recomienda a los encargados de censos y encuestas, incluir la población de razas puras dentro de las evaluaciones. Abstract Introduction. There is not much information on pure cattle with a genealogical certificate in Costa Rica. It is necessary to know the status of this population to direct efforts towards the productive improvement of the Zebu cattle breeds. Objective. To update the database of the Costa Rican Cebu Cattle Breeders Association (ASOCEBÚ), characterize this population and analyze the use of males of the gray Brahman breed in the country. Materials and methods. An inventory was done in 121 herds to update the Association’s database to 2018. The information was sorted by breed, sex, age, total animals, breeders, socio-economic region, province, and canton. The frequency of use of gray Brahman breeders was determined. Results. A total of 10 995 pure animals were counted, distributed in six breeds (gray Brahman, red Brahman, Nelore, Gyr, Guzerat, and Indubrasil). The gray Brahman breed predominated with 74.5 % of the population and 76.8 % of the total of breeders. The Chorotega region had the highest registered population (49.5 %) and the highest number of breeders (37.2 %). 55.8 % of the total population came from ten breeders, however, the largest number of herds corresponds to farms with few animals. In the gray Brahman breed, 60.8 % of the population comes from domestic bulls, and 39.2 % from other countries. Conclusion. Registered pure zebu cattle are distributed throughout the whole country. Attention should be put to genetic management to minimize inbreeding. Census and survey managers are encouraged to include the purebred populations in their assessments.

RESUMEN Este artículo propone una aproximación etnográfica al estudio de las perspectivas, motivaciones e intereses de los individuos participantes en el proyecto "Ancestría genética e identidad". Basados en un corpus de entrevistas y en un marco teórico que utiliza los conceptos de genealogía y pedigrí, indagamos la significación que el dato genético adquiere en la recreación de las historias e identidades personales y familiares, así como el modo en que el test de ancestría genética se articula y entra en negociación con otras experiencias y registros de tipo oral o escrito. En el marco de las investigaciones desarrolladas en este campo, también señalamos la importancia de considerar los contextos sociales, jurídicos y políticos para comprender el impacto de estas nuevas tecnologías. ABSTRACT This article proposes an ethnographic approach to the study of the perspectives, motivations, and interests of the individuals participating in the "Genetic Ancestry and Identity" project. Based on a corpus of interviews and using a theoretical framework with the concepts of genealogy and pedigree, we explore the significance of genetic data in the recreation of personal and family histories and identities, and the way in which the genetic ancestry test articulates and enters into negotiation with other experiences and records of oral and written order. Taking into account research in this field we also draw attention to the importance of considering social, legal and political contexts to understand the impact of these new technologies.

Resumen Introducción. El cáncer de mama es un problema mundial de salud pública; entre el 5 y el 10 % de los casos presentan agregación familiar, lo que se explicaría por la presencia de mutaciones en genes de alto riesgo como el BRCA1 y el BRCA2. El origen fundador de la deleción BRCA1 3450del4 en Colombia ya fue reportado. Objetivo. Hacer un análisis descriptivo de seis familias del del Tolima y del Huila con la deleción BRCA1 3450del4 de la asociación de la mutación germinal, con el cáncer de mama y la agregación familiar. Materiales y métodos. Se hizo un estudio descriptivo y transversal de seis casos índice con cáncer de mama positivos para BRCA1 3450del4, que cumplían tres de los criterios establecidos por Jalkh, et al. A partir de la información de las entrevistas, se realizaron los árboles genealógicos (GenoPro™, versión 2016). Se tipificó la mutación en familiares sanos y afectados que aceptaron participar. Resultados. De los 78 individuos seleccionados por conveniencia en las seis familias, 30 presentaron la mutación BRCA1 3450del4; de ellos, seis tenían cáncer de mama, uno, cáncer de ovario, uno, cáncer de mama y ovario, y otro, cáncer de próstata; 21 no presentaban neoplasias. De los 30 individuos portadores de la variante patogénica, seis eran hombres y 24 mujeres, 13 de ellas menores de 30 años. Conclusiones. En este estudio se confirmó la asociación de la deleción BRCA1 3450del4 con el cáncer de mama de agregación familiar. Abstract Introduction: Breast cancer is a worldwide public health problem; between 5% and 10% of the cases present familial aggregation explained by genes of high risk such as BRCA1 and BRCA2. The founding origin of the deletion BRCA1 3450del4 in Colombia has been previously reported. Objective: To carry out in six families from Tolima and Huila departments a descriptive analysis of the presence of the BRCA1 3450del4 mutation associated with breast cancer and familial aggregation. Materials and methods: We conducted a descriptive and cross-sectional study of six index cases with breast cancer positive for BRCA1 3450del4 that fulfilled three of the criteria established by Jalkh, et al. The genealogical trees were made using the information of the interview data (GenoPro™, version 2016). The mutation was typified in healthy and affected relatives who agreed to participate. Results: Thirty of the 78 individuals selected by convenience in the six families presented the mutation BRCA1 3450del4 six of whom developed breast cancer, one, ovarian cancer, one ovarian and breast cancer, and one prostate cancer; 21 did not present any type of neoplasm at the time of the study. Of the 30 individuals carrying the pathogenic variant, six were men, 24 were women, and 13 of these were under 30. Conclusions: In this study of families with the deletion BRCA1 3450del4 in Tolima and Huila we confirmed its association with familial aggregation of breast cancer.

Food additives are intentionally-added ingredients in order to modify physical, chemical, biological, or sensory characteristics of foods. Allergic reactions caused by additives are uncommon in children, and their prevalence is not known; however, they can be severe.An 8-year-old male presented with anaphylaxis and recurrent anaphylactic shocks due to multiple triggering factors such as food additives and medications. Point-of-care skin tests were performed with several additives, with positive results. Personalized emergency treatment was indicated in view of the possibility of anaphylaxis (adrenaline, diphenhydramine and dexamethasone) and environmental care for aeroallergens. Owing to a history of adverse reaction to salbutamol (giant or generalized urticaria), formoterol dry powder was indicated, which was well tolerated. Organic food exclusive consumption was recommended.The diagnosis of allergy to additives should be suspected when the patient has a suggestive medical history, allergy to multiple foods or medications, reaction with manufactured foods, unrelated to organic products.Antecedentes: Los aditivos alimentarios son ingredientes agregados intencionalmente para modificar las características físicas, químicas, biológicas o sensoriales de los alimentos. Las reacciones alérgicas por aditivos son poco frecuentes en niños y se desconoce su prevalencia, sin embargo, pueden ser severas. Reporte de caso: Varón de ocho años que sufrió anafilaxia y choques anafilácticos recurrentes por múltiples desencadenantes como aditivos de alimentos y medicamentos. Se realizaron pruebas cutáneas de lectura rápida a varios aditivos, con resultados positivos. Se indicó tratamiento de urgencia personalizado ante la eventualidad de anafilaxia (adrenalina, difenhidramina y dexamentasona) y cuidado ambiental para control de aeroalérgenos. Debido al antecedente de reacción adversa al salbutamol (urticaria gigante o generalizada) se indicó formoterol en polvo seco, el cual fue bien tolerado. Se recomendó el consumo exclusivo de comidas orgánicas. Conclusiones: El diagnóstico de alergia a los aditivos debe sospecharse cuando el paciente presenta historia clínica sugerente, alergia a múltiples alimentos o fármacos, reacción con alimentos manufacturados, sin relación con productos orgánicos.

Traditionally, inbreeding estimates have been estimated based on pedigree information. However, in sheep there is a considerable proportion of unknown pedigree due to natural mating and lack of filiation analysis. Therefore, there could be an under estimation of inbreeding coefficients based on pedigree. In the genomics era, genomic information can be used to estimate inbreeding. In this study, three different inbreeding estimation methods were assessed (a pedigree-based methodology, a single SNP-based approach and a ROH based method) to analyse the genetic diversity of two populations of Latxa Cara Negra breed: Latxa Cara Negra from Euskadi (LCNEUS) and from Navarre (LCNNAF). A total of 533 animals were genotyped with the Illumina OvineSNP50 BeadChip, bringing around 41700 SNPs and 2505 animals in pedigree. The results showed an effective population size below 100 in most of the evaluated cases. In addition, LCNEUS showed a higher genetic diversity than LCNNAF for each evaluated method. These results suggest that it could be interesting to consider these estimates in the management of both populations.

El objetivo de este trabajo es crear un método para determinar y representar relaciones de parentesco entre diferentes individuos a partir de datos de RNA-seq. Actualmente no existe ningún método descrito para este tipo de datos, mientras que sí existen para otros tipos de datos como arrays de genotipado. La reconstrucción de pedigríes tiene aplicaciones diversas como la detección de problemas de etiquetado. La metodología consiste en (i) hacer un control de calidad de los datos crudos, (ii) mapear los reads en el genoma, (iii) filtrar los datos de los reads mapeados eliminando duplicados y reads con mapeo múltiple, (iv) seleccionar los SNPs comunes que no se encuentren en un sitio de repeticiones o en genes improntados, (v) filtrar los SNPs en los reads y obtener los genotipos, (vi) determinar y representar la relación entre parejas de individuos y (vii) representar el pedigrí completo. Tras seleccionar los filtros y sus valores de corte se ha obtenido un método que permite diferenciar distintas relaciones de parentesco y representarlas. Las relaciones de primer grado (padre-hijo y hermanos completos) son las que más fácilmente se detectan, mientras que las relaciones más lejanas (abuelo-nieto o tío-sobrino) son más difíciles de diferenciar de individuos no relacionados. The aim of this work is to develop a method to determine and represent kinship relationships between individuals using RNA-seq data. Currently, there are methods to reconstruct pedigrees based on data from genotyping arrays, although there is no effective method based on RNA-seq. Pedigree reconstruction has several applications such as detecting labeling mistakes. The methodology is as follows: (i) perform a quality control of raw data, (ii) map the reads to the reference genome, (iii) filter the mapped reads by eliminating duplicates and multi-mapping reads, (iv) select common SNPs that are not in repeats nor imprinted genes, (v) filter the SNPs in reads and obtain the genotypes, (vi) determine and represent the relationship between pairs of individuals and (vii) represent the whole pedigree. After the selection of filters and their thresholds, a method that allows to discriminate between different kinship relationships and to represent them has been obtained. First-degree relationships (parent-offspring and full siblings) are the most easily detected, while more distant relationships (grandparent-grandchild or uncle-nephew) are more difficult to differentiate from unrelated individuals. L'objectiu d'aquest treball és crear un mètode per a determinar i representar relacions de parentiu entre diferents individus a partir de dades d'RNA-seq. Actualment no existeix cap mètode descrit per a aquesta mena de dades, mentre que sí que existeixen per a altres tipus de dades com arrays de genotipat. La reconstrucció de pedigríes té aplicacions diverses com la detecció de problemes d'etiquetatge. La metodologia consisteix en (i) fer un control de qualitat de les dades crues, (ii) mapear els reads en el genoma, (iii) filtrar les dades dels reads mapatges eliminant duplicats i reads amb mapatge múltiple, (iv) seleccionar els SNPs comuns que no es trobin en un lloc de repeticions o en gens improntados, (v) filtrar els SNPs en els reads i obtenir els genotips, (vaig veure) determinar i representar la relació entre parelles d'individus i (vii) representar el pedigrí complet. Després de seleccionar els filtres i els seus valors de tall s'ha obtingut un mètode que permet diferenciar diferents relacions de parentiu i representar-les. Les relacions de primer grau (pare-fill i germans complets) són les que més fàcilment es detecten, mentre que les relacions més llunyanes (avi-nét o oncle-nebot) són més difícils de diferenciar d'individus no relacionats.

El objetivo principal de ésta tesis fue realizar un análisis demográfico, genético y reproductivo de la población de jaguares (Panthera onca) cautivos en Colombia. En el análisis demográfico se realizó la construcción del Studbook Regional para Jaguares (Panthera onca) (n=38), se obtuvo el censo de los animales que han estado presentes en las colecciones zoológicas de Colombia desde el año de 1970 hasta el año 2009. Se estableció la distribución de los ejemplares vivos en la actualidad por clases de edades. Se obtuvieron las características demográficas para las poblaciones actuales y poblaciones modelos de jaguares machos y hembras; también se construyó la tabla de vida para machos y hembras. En el análisis genético, a partir de los registros, se calcularon las estadísticas poblacionales. Se encontró que en la población se encuentran 2 nuevos posibles fundadores potenciales (n=2). Se realizaron las proyecciones reproductivas para un tiempo de 5, 10, 15 y 20 años con el fin de incrementar la pobalción de 25 individuos a 40. Se realizó la selección de apareamientos empleando el valor de la media de parentesco MK, y la ubicación geográfica. Se realizó una propuesta de meta poblacional para los jaguares en Colombia de conservar el 90% de la diversidad genética durante un periodo de 100 años, teniendo en cuenta las siguientes variables: Tiempo generacional (T =12), Tasa de crecimiento poblacional (λ= 1.02), Tamaño poblacional actual (N =25), Número efectivo poblacional actual (Ne =6.5), Relación Ne/N (0.26), Diversidad genética actual (GD =0.78), Población máxima permitida (n=40), Población requerida para alcanzar metas (n=37), FGE reclutado por cada nuevo fundador (FGE =0.4). El plan de manejo poblacional para el jaguar en parques zoológicos de Colombia fue propuesto estableciendo metas de manejo poblacional para los siguientes 100 años. También se realizó un análisis genético de la población de jaguares cautivos en parques zoológicos de Colombia mediante el análisis tanto de registros del Studbook Regional para Jaguares como de muestras de ADN obtenidas de 20 animales vivos (n=20), con el cual se construyó el pedigrí para la población empleando 9 microsatélites. Las paternidades y maternidades fueron asignadas por el programa CERVUS y las relaciones de parentesco fueron obtenidas por el programa KINSHIP. El análisis del Studbook se realizó por medio del programa PM2000 en donde se obtuvo el valor de la diversidad genética (GD) actual de la población (GD=0.7832), el valor de diversidad genética potencial (GDp=0.9113), valor génico (GV=0.7846), el valor del equivalente del genoma fundador actual (FGE=2.31) y potencial (FGEp=5.64), el valor del genoma fundador sobreviviente actual (FGS=3.14) y potencial (FGSp=5.64), el coeficiente medio de consanguinidad (F=0.0179), el número efectivo poblacional (Ne=5.26), al igual que la relación (Ne/N =0.2667) y la media de parentesco MK (Mean KINSHIP) para cada individuo. En el análisis de los microsatélites se calcularon las frecuencias alélicas por cada microsatélite y se encontró un promedio de alelos por locus de 5.67. El promedio de la heterocigocidad observada general fue de 0,687 y el de la heterocigocidad esperada 0,684. Se encontró que todos los locus se encuentran en equilibrio Hardy–Weinberg. Para esta población se encontró un exceso de heterocigotos en los locus FCA075, FCA043, FCA736, FCA220 y FCA391 y exceso de homocigotos solo para los locus FCA 441, FCA 008, FCA 224 mediante los estimados de Fis de Weir y Cockerham's (W and C), y Robertson y Hill's (R and H). El promedio de Fis para la población fue (Fis W and C= -0,0157) y (Fis R and H=-0,0109) indicando que la población se encuentra en exogamia. No se encontraron diferencias significativas para la prueba de desequilibrio por ligamiento. Los análisis de verosimilitud obtenidos en CERVUS resultaron con asignaciones de la maternidad y de paternidad. Los asignamientos se realizaron según el logaritmo natural de la tasa de verosimilitud (LOD). Se obtuvieron las probabilidades de relación y parentesco asignadas por KINSHIP de las simulaciones y se encontraron relaciones significativas (p0.05) en 6 parejas de jaguares, (p0.01) para 3 parejas y (p0.001) para 11 parejas. Con este estudio se logró establecer la relación entre individuos y se logró construir el pedigrí de la población de jaguares cautivos en parques zoológicos de Colombia como base fundamental para el establecimiento de un plan de conservación ex situ para el Jaguar en parques zoológicos de Colombia. Por último se realizó la caracterización reproductiva de un grupo de jaguares cautivos (n=6) en las instalaciones de la Fundación Zoológico Santa Cruz en Cundinamarca, Colombia, mediante un análisis longitudinal no invasivo de estradiol y progesterona en hembras y testosterona en machos. En un periodo de un 1 año dividido en cuatro épocas climatológicas las hembras confinadas en solitario fueron evaluadas con el objetivo de caracterizar la actividad ovárica y determinar la presentación de ovulaciones espontáneas. En los machos la actividad testicular. En las hembras se realizó un segundo seguimiento después de la aplicación de un protocolo convencional de gonadotropinas. La hormonas fueron extraídas de muestras de materia fecal de tres hembras (n=3) y dos machos (n=2). La medición de estradiol se realizó por medio de radioinmunoanálisis (RIA) y la medición de progesterona y testosterona por medio de ensayo por inmunoabsorción ligado a enzimas (ELISA). El modelo lineal de regresión de efectos mixtos encontró diferencias significativas en las concentraciones de estadiol en las diferentes estaciones (Chi square = 15.97, DF = 3, p 0.01). Las comparaciones de medias estacionales se realizó mediante el método de la diferencia significativa honesta de Tukey (DSH), revelando diferencias significativas entre las estaciones: Sequía 1 vs. Lluvias 2 (p 0.01), Lluvias 1 vs. Lluvias 2 (p 0.05), y Sequía 2 vs. Lluvias 2 (p 0.05). En las tres jaguares hembras se encontraron elevaciones de progesterona compatibles con ovulaciones expontáneas y el modelo lineal de regresión de efectos mixtos también encontró diferencias significativas en las concentraciones de progesterona en las diferentes estaciones (Chi square = 28.56, DF = 3, p 0.01). El DSH mostró diferencias significativas solo entre las estaciones: Sequía 2 vs.Lluvias 2 (p 0.01). La estación con el nivel promedio más bajo fue lluvias 2 (Octubre, Noviembre, y Diciembre). Durante esta estación periodos de anestro fueron registrados entre 31 y 83 días. Las tres hembra mostraron picos de estradiol después de la administración de gonadotropina coriónica equina (eCG). El análisis longitudinal no invasivo para los machos (Macho 1 y Macho 2) no mostró diferencias significativas en el curso del año de análisis. El análisis seminal de los tres machos adultos (n = 3) fue realizado por medio de electroeyaculación bajo anestesia general (Macho 1 and 2) y por lavado epididmal post mortem (Macho 3). La concentración media de espermatozoides encontrada fue 5.7 x 106 ± 1.1 x 106 espermatozoides/ml. La motilidad progresiva promedio fue de 80 %. El porcentaje de espermatozoides normales obtenidos por electro eyaculación + desviación estandar (DS) fue 80 ± 2.8%, y las anormalidades más frecuentemente encontradas fueron defectos de cabeza (7 ± 1.4%). El fluido obtenido en el lavado epididimal mostró 35 ± 1.4% de espermatozoides normales, y la anormalidad más frecuente fueron las gotas citoplasmáticas distales (39 ± 11.3%). Abstract. The objective of this thesis was to analyze the demographic, genetic and reproductive status of captive jaguars in Colombia. In the demographic analysis the Regional Studbook for Jaguars (Panthera onca) (n=38) was constructed using the software SPARKS. The studbook data were analyzed by the software population management 2000 (PM2000). The census of the animals that had been present in the zoological collections of Colombia from the year of 1970 until the year 2009 was obtained. The distribution of the living animals by age classes was established and the demographic characteristics were obtained for the current population and model population of male and female jaguars, as well as the life table for males and females. The reproductive projections were obtained for 5, 10, 15 and 20 years in order to increase the captive population from 25 individuals to 40. The selection of matings was based on the Mean KINSHIP (MK) value, and the geographical location. It is presented the population goals for the jaguars in Colombia to conserve 90% of the genetic diversity during a 100 year period, for the variables: Generational Time (T =12), populational growth rate (λ = 1.02), current populational size (N =25), current populational effective Number (Ne =6.5), Relationship (Ne/N =0.26), current genetic Diversity (GD =0.78), allowed maximum Population (n=40), required Population to reach goals (n=37), FGE recruited by each new founder (FGE =0.4). The population management plan for the Jaguar (Panthera onca) in Colombia was proposed for the Colombian Zoological Parks establishing population management goals for the next 100 years. Also, a genetic analysis for the captive population of jaguars (Panthera onca) was done in zoological parks of Colombia based upon the Colombian Regional Studbook for Jaguars and from DNA obtained form 20 living animals (n=20) in order to establish the pedigree for the captive population using 9 microsatellites. The assignments for paternities and maternities were done with for the program CERVUS and the relationship between animals were established with the KINSHIP program. The analysis of the Studbook was done with the PM2000 program generating the following values: genetic diversity for the population (GD=0.7832), potential genetic diversity (GD=0.9113), genic value (GV=0.7846), current founder genome equivalent (FGE=2.31) and potential p(FGE=5.64), current and potential founder genome survivor (FGS=3.14; pFGS=5.64 respectively). Other values calculated were, mean coefficient of consanguinity (F=0.0179), population effective number (Ne=5.26) and the Mean KINSHIP (MK) for each individual. With the microsatellites analysis, the allelic frequencies were calculated for each locus with an average of alleles per loci of 5.67. The averages of the observed and expected heterozigocity were 0.687 and 0.684 respectively. It was found that all loci are in Hardy-Weinberg equilibrium. For this population an excess of heterozygous was found for the locus FCA075, FCA043, FCA736, FCA220 and FCA391 and an excess of homozygous for the locus FCA 441, FCA 008, FCA 224 by Fis of Weir and Cockerham's (W and C), and Robertson and Hill's (R and H). The average of Fis for the population was (Fis W and C = -0.0157) and (Fis R and H=-0.0109) indicating that the population is in exogamy. No significant differences were found for the linkage disequilibrium test. The likelihood analyses obtained in CERVUS assigned maternities and paternities. The assignments were done according to the value Pair Top LOD. The relationship probabilities were obtained by KINSHIP. In the simulations, a significant relationship (p 0.05) were found in 6 pairs of jaguars, (p 0.01) in three pairs and (p 0.001) for 11 pairs. With this study the relationships between animals was established and the pedigree of the captive population of jaguars was built in order to develop an ex situ conservation plan for the species in the Colombian zoological parks. In the last part of the study a reproductive analysis of a captive group of jaguars (n = 6) at the Santacruz Zoological Foundation in Cundinamarca, Colombia, was conducted by performing a longitudinal, noninvasive, hormonal analysis of estradiol and progestogens in females and of androgens in males. During four seasons, female jaguars confined in solitary were evaluated for ovarian activity and spontaneous ovulation, male jaguars for testicular activity. A second hormonal follow-up was conducted in the females after administration of gonadotropins. Hormones were extracted from fecal samples of three females (n = 3) and two males (n = 2). Estradiol measurements were obtained by radioimmunoassay (RIA) and progestogens by enzyme immunoassay (EIA). The linear mixed-effect regression (LMER) showed that there was a significant effect of seasons in the concentrations of estradiol (Chi square = 15.97, DF = 3, p 0.01). Post hoc comparisons of all pairs of seasonal means were conducted according to Tukey’s honest significant difference (HSD), revealing significant differences between seasons: Dry 1 vs. Rains 2 (p 0.01), Rains 1 vs. Rains 2 (p 0.05), and Dry 2 vs. Rains 2 (p 0.05). Elevations of progestogens compatible with spontaneous ovulation occurred in three jaguars and the LMER showed that there was also a significant effect of seasons (Chi square = 28.56, DF = 3, p 0.01). Post hoc comparisons showed significant differences only between seasons: Dry 2 vs. Rains 2 (p 0.01). The season with the lowest average concentration was Rains 2 (October, November, and December). During this season, periods of anestrous were registered that lasted between 31 and 83 days. The three females presented estradiol peaks after the administration of eCG. A noninvasive longitudinal analysis for androgens was also made (Males 1 and 2) over the course of one year, and no significant differences were found between the different seasons. A seminal analysis of three adult male jaguars (Panthera onca) (n = 3) was also performed after electro-ejaculation under general anesthesia (Male 1 and 2) and by a postmortem epididymal wash (Male 3). The mean concentration of spermatozoids was 5.7 x 106 ± 1.1 x 106 spermatozoa/ml. The progressive motility + SD averaged 80 %. The percentage of normal spermatozoids obtained by electro-ejaculation was 80 ± 2.8%, and the abnormalities found more frequently were head defects (7 ± 1.4%). The seminal fluid obtained by epididymal flush contained 35 ± 1.4% normal spermatozoids, and the most frequent abnormalities found corresponded to distal cytoplasmic droplets (39 ± 11.3%). Doctorado