Objetivos: Comparar efectos clínicos, antimicrobianos y antiinflamatorios de la terapia fotodinámica (TFD) y de la fototerapia con láser de Er:YAG aplicadas complementariamente al raspado y alisado radicular (RAR). Material y métodos: 45 pacientes con enfermedad periodontal crónica, fueron distribuidos aleatoriamente en 3 grupos de 15 para recibir: RAR, RAR complementado con terapia fotodinámica (RAR+TFD) o complementado con láser de Er:YAG (RAR+ERL). Se analizaron los parámetros clínicos: porcentaje de placa en boca total (PPBT), porcentaje de sangrado en boca total (PSBT) y profundidad de sondaje (PS), y se procedió a la recogida de fluido crevicular gingival (FCG) y de placa subgingival antes del tratamiento, a las 4 y 8 semanas posteriores. Se determinaron los niveles de Interleuquina 1β (IL-1β), Factor de Necrosis Tumoral α (FNT-α ) en FCG y su estado antioxidante total (EAT). Las muestras de flora subgingival fueron cultivadas para la determinación de 10 periodontopatógenos. Resultados y Discusión: No se encontraron diferencias estadísticamente significativas (DES) entre los tres tipos de tratamiento en cuanto a la evolución de los parámetros clínicos PPBT, PS, ni en cuanto al aumento de la capacidad antioxidante del FCG tras el tratamiento, ni tampoco en cuanto a la reducción de la flora subgingival total analizada, aunque sí se aprecia una ligera ralentización del proceso de recolonización bacteriana en el grupo RAR+Er:YAG. En cuanto al parámetro clínico PSBT, se observó un mayor descenso a las 8 semanas post-tratamiento en el grupo RAR+TFD, aunque no significativo. Sí se encontraron DES en cuanto a la evolución de los niveles de las citoquinas evaluadas: después del RAR los niveles de IL-1β y FNT-α se incrementaron y significativamente en el caso de FNT-α a las 8 semanas post-tratamiento. El procedimiento RAR+TFD mostró una tendencia a frenar dicho incremento y tras la aplicación de RAR+ERL dichos niveles descendieron, de forma más marcada en el caso de la IL-1β, durante el periodo de post-tratamiento evaluado. Aim: To compare clinical, microbiological and anti-inflammatory effects of the photodynamic therapy (PDT) and the Er:YAG laser phototherapy adjunctively applied to scaling and root planning (SRP). Material and Methods: Forty-five patients with chronic periodontitis were randomly assigned into 3 groups of 15 patients to receive: SRP, SRP followed by PDT (SRP+PDT) or SRP followed by Er:YAG laser phototherapy (SRP+ERL). Clinical parameters including full mouth plaque score (FMPS), full mouth bleeding score (FMBS) and probing pocket depth (PPD) were recorded and samples of gingival crevicular fluid (GCF) and subgingival plaque were taken at baseline, 4 and 8 weeks postoperatively. The GCF samples were analyzed for interleukin-1beta (IL-1β), tumour necrosis factor alpha (TNF-α ) and total antioxidative status (TAS). Subgingival plaque was analyzed by culture for 10 bacteria. Results and Discussion: No statistically significant differences were detected between the three kinds of treatment concerning the evolution of the clinical parameters FMPS and PPD, the increase of TAS in GCF and the subgingival plaque reduction, but the SRP+ERL treatment slightly slowed down the bacterial recolonization process. Concerning the clinical parameter FMBS, a slight decrease was observed 8 weeks post-therapy after SRP+PDT treatment. Statistically significant differences between groups were observed in the evolution of the levels of the cytokines evaluated: after SRP the levels of IL-1β and TNT-α increased, significatively in the case of TNT-α at 8 weeks post-therapy. The procedure SRP+PDT showed a trend to slow down this increase, and after the application of SRP+ERL these levels decreased, more severely in the case of IL-1β, during the whole post-therapy period.