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Objetivo: Aunque los parásitos intestinales son comúnmente detectados en los cocodrilos salvajes o en criados en cautividad en otras partes del mundo, existen muy pocos informes el caso concreto del caimán chino criado en cautividad (Alligator sinensis), ya que sólo están distribuidos en las zonas del sur del río Yangtze. El presente trabajo fue realizado para investigar los parásitos intestinales y su diversidad en las especies de cocodrilo chino. Métodos: En mayo y octubre de 2013, se recopilaron aleatoriamente un total de 328 muestras fecales de caimanes chinos en cautividad de un centro de cría en el sur de la provincia de Anhui. Resultados: Fueron identificados tres géneros de protozoos (Entaoeba, Eimeria e Isospora), cinco géneros de nematodos (Ascaris, Dujardin Ascaris, Capillaria, Toxocara y Strongylus), dos géneros de trematodos (Echinostoma y Clonorchis) y dos familias de trematodos (Schistosomatidae y Cryptogonimidae), de los cuales la mayor prevalencia correspondió a Dujardin Ascaris y producían la mayor tasa de infección (14,33%); entaoeba se situó en el segundo puesto (13,11%). El número de especies, índice de riqueza, índice de diversidad y de equitatividad fue superior en los meses de julio y agosto, y éstos, relativamente más para caimanes jóvenes y sub-adultos. Conclusiones: Nuestros resultados apuntan la prevalencia de la infección por parásitos intestinales en caimanes chinos en cautividad y ello exige nuestra atención, ya sea para controlar o prevenir la propagación de la enfermedad parasitaria intestinal a los seres humanos, o para la conservación de esta especie en peligro de extinción. Objective: Although intestinal parasites are commonly detected in either wild or farmed crocodiles in other parts of the world, yet few reports have ever been on the captive bred Chinese alligators (Alligator sinensis) since they are only distributed in the southern areas of the Yangtze River. The current work was undertaken to investigate the intestinal parasites and their diversity in the Chinese crocodilian species. Methods: In May and October of 2013, we randomly collected a total of 328 fecal samples of the captive Chinese alligators in a breeding centre in south Anhui province. Results: Three genera of protozoa (Entaoeba, Eimeria and Isospora), five genera of nematodes (Ascaris, Dujardinascaris, Capillaria, Toxocara and Strongylus), two genera of trematodes (Echinostoma and Clonorchis) and two families of trematodes (Schistosomatidae and Cryptogonimidae) were identified, in which Dujardinascaris was the most prevalent and led to the highest infection rate (14.33%), and Entaoeba ranked the second (13.11%). The number of species, richness index, diversity index and evenness index were higher in July and August, and those indexes were relatively most in juvenile and subadult alligators. Conclusions: Our findings suggest that the intestinal parasites infection was prevalent in captive Chinese alligators, and this condition requires our attention, whatever it is for controlling or preventing the intestinal parasitic disease from spreading to humans or conservation of this endangered species.