Search

Objective. The aim of this study is to evaluate the hygienic and sanitary quality of bovine milk from dairy farms of Nariño, Colombia by determining the presence of environmental microorganisms of public health importance such as Salmonella spp., Escherichia coli O157, Listeria monocytogenes, Staphylococcus aureus and Yersinia enterocolitica and to evaluate the impact that the rainy seasons have on milk quality Materials and methods. Milk samples were taken in 180 farms located in four natural subregions, both in the high rainfall season and in the low rainfall season. Mesophilic aerobic count, a somatic cell count by automated methods, and a total coliform count in 3M Petrifilm® plates were done to each milk sample. Detection of Salmonella spp., Escherichia coli O157:H7 and Listeria monocytogenes was done by the 3M MDS system, Staphylococcus aureus and Yersinia enterocolitica were isolated by conventional microbiology techniques. Results. The highest somatic cell counts were found during the high rain season. The median of the mesophilic, total coliform and somatic cell counts were 20,085 CFU/ml, 265 CFU/ml and 219,170 cells/ml, respectively, with no significant differences in the two rainy periods. Neither Salmonella spp. nor E. coli O157/H7 were detected. There was no significant difference among the presence of Listeria sp., L. monocytogenes, Y. enterocolitica, Staphylococcus aureus and coagulase negative Staphylococcus between the two rainy seasons. Conclusions. 80% of the milk samples met the hygienic and sanitary quality standards and no influence of the sampling period on the hygienic quality of the milk was observed., Objetivo. Evaluar la calidad higiénico-sanitaria de la leche bovina de Nariño mediante los recuentos de mesófilos aerobios y de células somáticas y determinar presencia de microorganismos ambientales importantes en salud pública como Salmonella spp., Escherichia coli O157, Listeria monocytogenes, Staphylococcus aureus y Yersinia enterocolítica y evaluar las variaciones de los parámetros de calidad en dos periodos lluviosos diferentes. Materiales y métodos. Se tomaron muestras de leche en 180 predios de cuatro subregiones naturales, en épocas de diferente precipitación. A cada muestra se le realizó recuento de aerobios mesófilos, y el recuento de células somáticas por citometría de flujo, y el de Coliformes totales mediante lectura en placa. La detección de Salmonella spp., Escherichia coli O157:H7 y Listeria monocytogenes por el sistema de detección molecular MDS 3M, Staphylococcus aureus y Yersinia enterocolitica por microbiología convencional. Resultados. Los recuentos de células somáticas fueron superiores en la época de altas precipitaciones. La mediana de los recuentos de mesófilos y coliformes totales fue de 20.085 UFC/ml, 265 UFC/ml respectivamente sin diferencias significativas en los dos periodos. No se detectó Salmonella spp. ni E. coli O157/H7. No se observaron diferencias significativas en la frecuencia de presentación de Listeria sp., L. monocytogenes, Y. enterocolítica, Staphylococcus aureus y Staphylococcus coagulasa negativa entre los dos periodos de lluvia evaluados”. Conclusiones. Se observó que el 80% de las muestras de leche analizadas en este estudio cumplen con los estándares de calidad higiénico-sanitaria y no se observó influencia de la época de muestreo sobre la calidad higiénica de la leche.

No estamos solos. Bacterias, hongos, parásitos y virus habitan cualquier parte de nuestro organismo y pueden cumplir funciones biológicas importantes, bien sea benéficas o dañinas. Conocerlos es fundamental para un manejo adecuado. Con las herramientas que utiliza el Grupo de Investigaciones Microbiológicas se pueden identificar la presencia del microorganismo y los marcadores moleculares de interés para la salud, como los relacionados con la resistencia a antibióticos, lo que aporta una información muy útil para el manejo de los pacientes. We are not alone. Bacteria, fungi, parasites and viruses inhabit any part of our body and can perform important biological functions, either beneficial or harmful. Knowing them is essential for proper management. With the tools used by the Microbiological Research Group, the presence of the microorganism and molecular markers of interest for health, such as those related to antibiotic resistance, can be identified, which provides very useful information for patient management.

[ES] Actualmente el consumo de vegetales orgánicos presenta una tendencia creciente, debido a una mayor preocupación por el medio ambiente. Sin embargo, al no utilizar fertilizantes, herbicidas o pesticidas químicos, este tipo de cultivos puede conllevar un riesgo asociado debido a la posible presencia de ciertos organismos como las amebas de vida libre (free-living amoebae, FLA). Estos protozoos pueden actuar como reservorios de microorganismos vivos, pudiendo ser algunos de estos, patógenos humanos. Las técnicas microbiológicas convencionales como el cultivo permiten la detección de microorganismos, pero resultan poco específicas, y, en ocasiones, los organismos pueden adoptar el estado viable no cultivable (VBNC), no pudiéndose detectar mediante este método. Por ese motivo, se decidió analizar el contenido bacteriano del interior de estas FLA por medio de la técnica molecular DVC-FISH, que permite la detección de formas bacterianas viables debido a la preincubación en el medio DVC (favorece el crecimiento, pero no permite la división celular) combinándose con la técnica de hibridación fluorescente in situ (FISH) que emplea sondas fluorescentes específicas. Este método permite diferenciar el género o incluso la especie de las bacterias que se quieren identificar y además confirmar la viabilidad de estas. Se analizaron diversas muestras de vegetales y frutas orgánicas para, en primer lugar, determinar cualitativamente la presencia de FLA, y posteriormente, detectar la presencia y viabilidad de bacterias de los géneros Pseudomonas, Salmonella, Listeria y Helicobacter como parte del microbioma de las FLA aisladas de dichos vegetales y frutas orgánicas. Se procesaron un total de 35 muestras representativas de vegetales y fresas ecológicas, pertenecientes al proyecto `ECOFOOD¿. En todas las muestras se recuperaron FLA por cultivo (100%). Los resultados del DVC-FISH indicaron la presencia de células viables de Pseudomonas spp. en un 88,57% de las muestras y, de Salmonella spp. en un 2,86% de las muestras como parte del microbioma de las FLA aisladas. En cambio, no se detectó Helicobacter spp., ni Listeria monocytogenes. La presencia de ciertas bacterias internalizadas de interés para la salud pública, indica que las FLA son posibles vehículos de transmisión de patógenos, ofreciéndoles protección y favoreciendo su diseminación., [EN] Currently organic vegetables consumption presents a growing trend, due to higher concern about environment. However, as chemical fertilizers, herbicides and pesticides are not used, this type of cultivation may carry an associated risk due to the possible presence of certain organisms, such as free-living amoebae (FLA). These protozoa can act as reservoirs of alive microorganisms, some of which may be human pathogens. Conventional microbiological techniques such as culture allow the detection of microorganisms, but they result not very specific, and occasionally, organisms can adopt the viable non-culturable state (VBNC) and cannot be detected by this method. For this reason, analysing the internal content of this dangerous amoeba was decided through the molecular technique of DVC-FISH, that allows the detection of viable bacterial forms due to preincubation in DVC medium (it promotes cell growth, but it does not permit cell division) combined with the fluorescent in situ hybridization (FISH) technique that uses specific fluorescent probes. This method allows to differentiate the genus or even the bacterial specie that wants to be identified and it enables to confirm their viability. Organic vegetable and fruit samples were studied in order to firstly, qualitatively establish the presence of FLA, and subsequently, determining the presence and viability of bacteria from the genus of Pseudomonas, Salmonella, Listeria and Helicobacter as a part of isolated FLA microbiome from the organic vegetables mentioned. A total of 35 representative samples of organic vegetables and strawberries were processed from the 'ECOFOOD' project. In all samples FLA were recovered by culture (100%). Results of DVC-FISH indicated the presence of viable cells of Pseudomonas spp. in 88,57% of the samples and Salmonella spp. in 2,86% of samples as part of microbiome isolated from FLA. In contrast, neither Helicobacter spp. nor Listeria monocytogenes was detected. The presence of certain internalized bacteria of interest for public health indicates that FLA are possible vehicles for the transmission of pathogens, offering them protection and favouring their dissemination.

Trabajo Integrador Final (Especialista en Bioquímica Clínica Área Bacteriología) -- Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas, 2022. Los antibióticos son fundamentales para el abordaje terapéutico exitoso de las enfermedades infecciosas. Sin embargo, su uso masivo ha traído aparejado un creciente aumento de la resistencia. Actualmente la resistencia a los antibióticos es un grave problema de salud pública a nivel global. Mitigar la diseminación de microorganismos resistentes a los antimicrobianos (MRAM), requiere un abordaje integral que estudie la circulación de los mismos tanto en humanos, como en el ambiente y en animales. Entre los principales MRAM se encuentran los Enterobacterales productores de beta-lactamasas de espectro extendido (E-BLEE). Estas confieren resistencia a penicilinas, cefalosporinas de 1ª a 4ª generación y monobactams y se asocian a resistencia a múltiples antibióticos. En este trabajo se estudió, a nivel fenotípico y molecular, la presencia de E-BLEE en el Río Suquía (RS) y en aguas residuales (AR) del ambiente urbano y periurbano de la ciudad de Córdoba. 2024-06-30 Fil: Bujedo, María José. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas; Argentina.

[ES] Actualmente el consumo de vegetales orgánicos presenta una tendencia creciente, debido a una mayor preocupación por el medio ambiente. Sin embargo, al no utilizar fertilizantes, herbicidas o pesticidas químicos, este tipo de cultivos puede conllevar un riesgo asociado debido a la posible presencia de ciertos organismos como las amebas de vida libre (free-living amoebae, FLA). Estos protozoos pueden actuar como reservorios de microorganismos vivos, pudiendo ser algunos de estos, patógenos humanos. Las técnicas microbiológicas convencionales como el cultivo permiten la detección de microorganismos, pero resultan poco específicas, y, en ocasiones, los organismos pueden adoptar el estado viable no cultivable (VBNC), no pudiéndose detectar mediante este método. Por ese motivo, se decidió analizar el contenido bacteriano del interior de estas FLA por medio de la técnica molecular DVC-FISH, que permite la detección de formas bacterianas viables debido a la preincubación en el medio DVC (favorece el crecimiento, pero no permite la división celular) combinándose con la técnica de hibridación fluorescente in situ (FISH) que emplea sondas fluorescentes específicas. Este método permite diferenciar el género o incluso la especie de las bacterias que se quieren identificar y además confirmar la viabilidad de estas. Se analizaron diversas muestras de vegetales y frutas orgánicas para, en primer lugar, determinar cualitativamente la presencia de FLA, y posteriormente, detectar la presencia y viabilidad de bacterias de los géneros Pseudomonas, Salmonella, Listeria y Helicobacter como parte del microbioma de las FLA aisladas de dichos vegetales y frutas orgánicas. Se procesaron un total de 35 muestras representativas de vegetales y fresas ecológicas, pertenecientes al proyecto `ECOFOOD¿. En todas las muestras se recuperaron FLA por cultivo (100%). Los resultados del DVC-FISH indicaron la presencia de células viables de Pseudomonas spp. en un 88,57% de las muestras y, de Salmonella spp. en un 2,86% de las muestras como parte del microbioma de las FLA aisladas. En cambio, no se detectó Helicobacter spp., ni Listeria monocytogenes. La presencia de ciertas bacterias internalizadas de interés para la salud pública, indica que las FLA son posibles vehículos de transmisión de patógenos, ofreciéndoles protección y favoreciendo su diseminación. [EN] Currently organic vegetables consumption presents a growing trend, due to higher concern about environment. However, as chemical fertilizers, herbicides and pesticides are not used, this type of cultivation may carry an associated risk due to the possible presence of certain organisms, such as free-living amoebae (FLA). These protozoa can act as reservoirs of alive microorganisms, some of which may be human pathogens. Conventional microbiological techniques such as culture allow the detection of microorganisms, but they result not very specific, and occasionally, organisms can adopt the viable non-culturable state (VBNC) and cannot be detected by this method. For this reason, analysing the internal content of this dangerous amoeba was decided through the molecular technique of DVC-FISH, that allows the detection of viable bacterial forms due to preincubation in DVC medium (it promotes cell growth, but it does not permit cell division) combined with the fluorescent in situ hybridization (FISH) technique that uses specific fluorescent probes. This method allows to differentiate the genus or even the bacterial specie that wants to be identified and it enables to confirm their viability. Organic vegetable and fruit samples were studied in order to firstly, qualitatively establish the presence of FLA, and subsequently, determining the presence and viability of bacteria from the genus of Pseudomonas, Salmonella, Listeria and Helicobacter as a part of isolated FLA microbiome from the organic vegetables mentioned. A total of 35 representative samples of organic vegetables and strawberries were processed from the 'ECOFOOD' project. In all samples FLA were recovered by culture (100%). Results of DVC-FISH indicated the presence of viable cells of Pseudomonas spp. in 88,57% of the samples and Salmonella spp. in 2,86% of samples as part of microbiome isolated from FLA. In contrast, neither Helicobacter spp. nor Listeria monocytogenes was detected. The presence of certain internalized bacteria of interest for public health indicates that FLA are possible vehicles for the transmission of pathogens, offering them protection and favouring their dissemination.

[Resumen] Klebsiella pneumoniae es un patógeno nosocomial que empeora el pronóstico de la gran mayoría de pacientes inmunocomprometidos. En líneas generales, se trata de una bacteria patógena oportunista capaz de colonizar una gran variedad de ambientes, especialmente los hospitalarios. Pertenece al grupo de bacterias gram-negativas y, debido a su elevada patogenicidad, es capaz de provocar cuadros clínicos graves que aumentan las tasas de mortalidad y morbilidad. El creciente incremento del número de bacterias multirresistentes a antibióticos de amplio espectro, como β-lactámicos o carbapenémicos, ha supuesto la búsqueda de nuevos métodos para combatir estas bacterias. En este contexto, la experimentación con fagoterapia está despertando un gran interés, gracias a su eficacia y seguridad, que se traducen en un incremento de las tasas de supervivencia. Es por ello que el presente TFM se centra en la caracterización de la actividad antimicrobiana de dos fagos líticos vB_KpnS_VAC35 y vB_KpnM_VAC36, así como de la combinación de estos fagos con inhibidores del QS, mecanismo de comunicación bacteriano que favorece la resistencia a los fagos. Para el desarrollo de este trabajo, en primer lugar, se realizó un análisis del genoma de los fagos con el objetivo de asegurar la ausencia de genes potencialmente virulentos. En segundo lugar, se caracterizó la capacidad de infección de los fagos vB_KpnS_VAC35 y vB_KpnM_VAC36 frente a sus sus cepas huésped: K3574 y K3573. Para ello se ha determinó la familia a la que pertenecen los fagos mediante el estudio morfológico empleando la técnica de Microscopía Electrónica de Transmisión (TEM) y se han determinado diversos parámetros de infección, como el tiempo de adsorción, el tamaño de explosión (burst size) o el período de latencia. Por último, se realizó el ensayo de infección e inhibición de QS empleando la molécula furanona 4-Metoxi-2(5H) con el objetivo de aumentar la capacidad de infección de los fagos frente a K. pneumoniae y mejorar su potencial uso en fagoterapia. [Resumo] Klebsiella pneumoniae é un patóxeno nosocomial que empeora o pronóstico da gran maioría de pacientes inmunocomprometidos. En liñas xerais, trátase dunha bacteria patóxena oportunista capaz de colonizar unha gran variedade de ambientes, especialmente os hospitalarios. Pertenece ao grupo de bacterias gram-negativas e, debido a súa elevada patogenicidade, é capaz de provocar cadros clínicos graves que aumentan as tasas de mortalidade e morbilidade. O crecente incremento do número de bacterias multirresistentes a antibióticos de amplo espectro, como β-lactámicos ou carbapenémicos, supuxo a búsqueda de novos métodos para combater estas bacterias. Neste contexto, a experimentación con fagoterapia está despertando unha gran interese, grazas á súa eficacia e seguridade que se traduce nun incremento das taxas de supervivencia. É por isto que o presente TFM se centra na caracterización da actividade antimicrobiana dos fagos líticos vB_KpnS_VAC35 e vB_KpnM_VAC36, así como da combinación destes fagos con inhibidores do Quorum sensing, mecanismo de comunicación bacteriano que favorece a resistencia aos fagos. Para o desenvolvemento deste traballo, no primeiro lugar realizóuse unha análise do xenoma dos fagos co obxectivo de asegurar a ausencia de xenes potencialmente virulentos. En segundo lugar, caracterizóuse a capacidade de infección dos fagos vB_KpnS_VAC35 e vB_KpnM_VAC36 fronte as súas cepas huésped: K3574 e K3573. Para elo se determinou a familia á que pertencen os fagos mediante o estudio morfológico empregando a técnica de Microscopía Electrónica de Transmisión (TEM) e se han determinado diversos parámetros de infección, como o tempo de adsorción, o tamaño de explosión (burst size) o período de latencia. Por último, realizouse o ensayo de infección e inhibición de Quorum Sensing empregando a molécula furanona 4-Metoxi-2(5H) co obxectivo de aumentar a capacidade de infección dos fagos fronte a K. pneumoniae e mellorar o seu potencial uso en fagoterapia. [Abstract] Klebsiella pneumoniae is a nosocomial pathogen that worsens the prognosis of the vast majority of immunocompromised patients. In general, it is an opportunistic pathogenic bacterium capable of colonizing a wide variety of environments, especially hospital ones. It belongs to the group of gram-negative bacteria and, due to its high pathogenicity, is able to cause serious clinical conditions that increase mortality and morbidity rates. The growing number of multidrug-resistant antibiotic-resistant bacteria, such as β-lactams or carbapenems, has led to the search for new methods to combat these bacteria. In this context, experimentation with phage therapy.is arousing great interest, thanks to its effectiveness and safety which translate into an increase in survival rates. This is why the present TFM focuses on the characterization of the antimicrobial activity of two lytic phages vB_KpnS_VAC35 and vB_KpnM_VAC36, as well as the combination of these phages with inhibitors of Quorum sensing, a bacterial communication mechanism that promotes resistance to phages. For the development of this work, an analysis of the phage genome was first performed with the aim of securing the lack of potentially virulent genes. Second, the infection capacity of the phages vB_KpnS_VAC35 and vB_KpnM_VAC36 was characterized against their host strains: K3574 and K3573. To this end, the family to which the phages belong has been determined by morphological study using the technique of Transmission Electron Microscopy (TEM) and various infection parameters have been determined, such as adsorption time, burst size. or the latency period. Finally, the Quorum Sensing infection and inhibition assay was performed using the furanone 4-Methoxy-2 (5H) molecule with the aim of increasing the infectivity of phages against K. pneumoniae and improving their potential use in phage therapy. Traballo fin de mestrado (UDC.CIE). Bioloxía molecular, celular e xenética. Curso 2021/2022

[Resumen]: Aeromonas salmonicida subsp salmonicida es una bacteria Gram negativa de interés para la industria de la acuicultura, por su papel como agente etiológico de la forunculosis. Esta enfermedad afecta a los peces y provoca una alta mortalidad, lo que se refleja en una disminución de la producción y grandes pérdidas económicas. El mecanismo por el que la bacteria patógena causa esta enfermedad está relacionado con sus sistemas de captación de hierro, concretamente con la producción y liberación del sideróforo amonabactina al medio extracelular. Los sideróforos actúan como quelantes de Fe (III), un elemento esencial para el metabolismo, y son internalizados de nuevo a través de receptores de membrana externa, como FstC, y otros presentes en la membrana interna. El objetivo de este trabajo es la producción y purificación de la proteína FstC para emplearla como componente activo en la formulación de una vacuna contra la forunculosis, mediante su encapsulación en liposomas. El desarrollo de esta vacuna permitiría luchar contra la enfermedad de forma preventiva, asegurando un mayor bienestar animal y aumentando el rendimiento del proceso de producción piscícola. [Resumo]: Aeromonas salmonicida subsp salmonicida é unha bacteria Gram negativa de interés para a industria da acuicultura, polo seu papel como axente etiolóxico da forunculose. Esta enfermidade afecta aos peixes e provoca una elevada mortalidade, o que se reflicte nunha disminución da producción e grandes perdas económicas. O mecanismo polo que a bacteria patóxena causa esta enfermidade está relacionado cos seus sistemas de captación de ferro, concretamente coa producción e liberación do sideróforo amonabactina ao medio extracelular. Os sideróforos actúan como quelantes de Fe (III), un elemento esencial para o metabolismo, e entran de novo na célula mediante receptores da membrana externa, como FstC, e outros da membrana interna. O obxectivo deste traballo é a producción e purificación da proteína FstC para empregala como componente activo na formulación dunha vacina contra a forunculose, mediante a súa encapsulación en liposomas. O desenvolvemento desta vacina permitiría loitar contra a enfermidade de forma preventiva, garantizando un maior benestar animal e aumentando o rendemento do proceso da producción piscícola. [Abstract]: Aeromonas salmonicida subsp salmonicida is a Gram negative bacterium of interest to the aquaculture industry, due to its role as an etiological agent of furunculosis. This disease affects fish and causes high mortality, which is reflected in a decrease in production and large economic losses. The mechanism by which the pathogenic bacteria cause this disease is related to their iron uptake systems, specifically with the production and release of the amonabactin siderophore to the extracellular environment. Siderophores act as chelators of Fe (III), an essential element for metabolism, and are internalized again through outer membrane receptors, such as FstC, and others inners membrane receptors. The aim of this work is the production and purification of the FstC protein, in order to use it as an active component in the formulation of a furunculosis vaccine, by means of its encapsulation in liposomes. The development of this vaccine would make possible to fight against the disease in a preventive way, ensuring greater animal welfare and increasing the performance of the fish production process. Traballo fin de mestrado (UDC.CIE). Biotecnoloxía avanzada. Curso 2020/2021

"En nuestro grupo de investigación se ha trabajado con una cepa de Bacillus thuringiensis ELI 52 cuya actividad bactericida fue evaluada contra varias bacterias de interés clínico. En este trabajo se obtendrán y purificarán algunos compuestos de tipo indólicos además de compuesto ftalato y se realizará la evaluación biológica de todos los compuestos contra hongos y bacterias. Estos compuestos fueron aislados e identificados mediante técnicas de separación por columna, técnicas espectométricas y espectroscópicas. Cabe destacar que del compuesto de tipo ftalato se obtuvo un enantiómero de forma pura y por ello se decidió realizar la síntesis asimétrica de los dos estereoisómeros. Este compuesto tuvo poco poder inhibitorio a diferentes bacterias y hongos de interés clínico y agrícola respectivamente. Respecto a los compuestos de tipo indólico mostraron alto poder inhibitorio ante diferentes bacterias y hongos."

The abuse and misuse of antibiotics, such as through self-medication, treatment dropout, or cattle fattening, result in the emergence of resistant or multi-resistant pathogenic bacteria. This emergence could be due to an increased selective pressure that kills sensitive strains, new antibiotic resistances appearing at a faster rate than in nature, with higher minimum inhibitory concentrations (MICs), and than the drug discovery process. Awareness and a drop in consumption seem essential to slow down this rate of increased resistance. In this study, we asked ourselves if controlling the use of antibiotics and, hence, a drop in selective pressure are sufficient for resistant pathogenic bacteria to revert to their sensitive condition. To answer this question, we carried out a bibliographic review. The analyzed data suggests that bacteria will compensate for the fitness cost due to their high adaptive capacity. Therefore, bacterial resistance will not be reverted just by lowering the selective pressure. We suggest further research on bacterial evolution at the molecular level is necessary in order to find a solution to this problem as soon as possible. El abuso y el mal uso de los antibióticos como, por ejemplo, la automedicación, el abandono de tratamientos o su utilización para el engorde de animales de granja, da como resultado la aparición de bacterias patógenas resistentes o multirresistentes a antibióticos. Posiblemente, esto se deba a un exceso de presión selectiva que permite eliminar la competencia de cepas sensibles, apareciendo nuevas resistencias a antibióticos a una velocidad mayor que en la naturaleza, con concentraciones mínimas inhibitorias (CMI) más altas y en menos tiempo que el requerido para crear nuevos fármacos. Para frenar este avance, la sensibilización, la concienciación y la bajada en el consumo parecen fundamentales. En este estudio, nos preguntamos si el control del uso de los antibióticos y, por tanto, la bajada en la presión selectiva es suficiente para que las bacterias patógenas resistentes o multirresistentes reviertan a su condición de sensibles. Para dar respuesta a esta pregunta, hemos llevado a cabo un análisis bibliográfico. Tras analizar los datos, todo parece indicar que las bacterias resistentes no van a revertir al estado de sensibles tras bajar solamente la presión selectiva debido a su gran capacidad de adaptación. Sugerimos, entre otras cosas, una mayor investigación sobre la evolución bacteriana a nivel molecular, para encontrar cuanto antes una solución a este problema. O abuso e uso indevido de antibióticos, como por exemplo, a automedicação, o abandono de tratamentos ou o uso para engordar animais de criação, têm como resultado o aparecimento de bactérias patogénicas resistentes ou multirresistentes aos antibióticos. Provavelmente, devido ao excesso de pressão seletiva que permite eliminar a competência de cepas sensíveis, aparecendo novas resistências aos antibióticos com uma rapidez superior à que ocorre na natureza, com concentrações mínimas inibitórias (CIM) mais altas e em menos tempo do que o necessário, para a criação de novos medicamentos. Para conter este avanço é fundamental, a sensibilização, a conscientização e a diminuição do consumo. Neste estudo, questionamos se o controle do uso de antibióticos e portanto, a redução da pressão seletiva é suficiente, para que as bactérias patogénicas resistentes ou multirresistentes voltem à sua condição de sensíveis. Para responder a esta pergunta, realizamos uma análise bibliográfica. Depois de analisar os dados, tudo parece indicar que depois de baixar apenas a pressão seletiva, as bactérias resistentes não voltarão ao seu estado sensível, devido à sua grande adaptabilidade. Sugerimos, entre outras coisas, estudos adicionais sobre a evolução bacteriana a nível molecular, para encontrar uma solução para este problema, o mais breve possível.

El Streptococcus agalactiae (SGB); es un coco gran positivo que coloniza el tracto genitourinario femenino; siendo un patógeno encontrado en el tracto respiratorio superior del neonato asociado a sepsis neonatal temprana, morbimortalidad neonatal y aumento de costo en atención en salud (1, 2, 3, 4). la colonización por este microorganismo oscila entre el 15% y el 40%. El SGB siendo un agente causal de mortalidad neonatal, ha llevado a nivel mundial a realizar manejo antibiótico periparto basado en la tamización por toma de cultivo recto vaginal para SGB en el III trimestre recomendado por el CDC desde el 2002 o con la identificación de factores de riesgo en ausencia del cultivo recto vaginal.5), logrando de esta manera una reducción del 70% en la sepsis neonatal de aparición temprana (5,6,7). En estudios se han identificado diferentes factores de riesgo en gestantes que se asocian a colonización por SGB, la obesidad, raza, paridad, tabaquismo, hipertensión arterial, infección vaginal y diabetes gestacional entre otros (8,9,10,11,12) siendo algunos de estos resultados contradictorios y que no se han establecido como indicación para tratamiento antibiótico intraparto. En este estudio se buscó identificar los factores de riesgo en la paciente obstétrica atendida en el Hospital Militar Central que presentaron colonización por SGB para proporcionar recomendaciones para profilaxis antibiótica a mujeres con un tamizaje de colonización desconocida en el momento del parto e impactar en la reducción de la incidencia global de complicaciones perinatales infecciosas. Se realizó un Estudio analítico, casos y controles anidado en una cohorte prospectiva en la sala de trabajo de parto y recuperación del hospital militar central, se ingresaron al estudio todas las maternas con cultivo recto vaginal que fueron hospitalizadas entre noviembre de 2019 y agosto de 2020. Se obtuvo una muestra de 341 pacientes a las cuales a su ingreso se realizó encuesta y finalmente se valoraron las historias clínicas para recolección de variables. Se aceptó un nivel de confianza del 95% y una potencia del 80%. Y finalmente el procesamiento de la información para dar respuesta a los objetivos bajo el programa Real Statistics. Se obtuvo un porcentaje de tamización del 52%, con una prevalencia de colonización por el germen descrito del 26.9%. como variables en relación significativa estadísticamente se relacionan la vaginosis y la IVU . RESUMEN 6 ABSTRACT 7 IDENTIFICACION Y FORMULACION DEL PROBLEMA 9 Planteamiento del problema: 11 Pregunta de investigación: 11 OBJETIVOS 12 Objetivo general 12 Objetivos específicos 12 Formulación de hipótesis 13 Hipótesis Nula 13 Hipótesis Alterna 13 METODOLOGIA 14 Diseño 14 Tipo de estudio: 14 Variables 14 Muestra 21 Criterios de inclusión 22 Criterios de exclusión 22 Mediciones e instrumentos utilizados. 22 PLAN DE ANALISIS 23 Plan de recolección y procesamiento 23 ASPECTOS ETICOS 25 RESULTADOS 27 DISCUSIÓN 33 CONCLUSIONES 38 REFERENCIAS BIBLIOGRAFICAS 39 ABSTRACT Streptococcus agalactiae (SGB); Is a gram positive coco that colonizes the female genitourinary tract; Being a pathogen found in the upper respiratory tract of neonate associated with early neonatal sepsis, neonatal morbidity and increased cost in health care. Colonization by this microorganism ranges from 15% to 40%. GBS, a causal agent of neonatal mortality, has led to carry out a worldwide peripartum antibiotic management based on GBS rectovaginal screening cultures for GBS in the III trimester recommended by the CDC since 2002 or with the identification of risk factors in the absence of vaginal rectum culture.5), thus achieving a 70% reduction in early-onset neonatal sepsis (5,6,7). Studies have identified different risk factors in pregnant women associated with STB colonization, obesity, race, parity, smoking, high blood pressure, vaginal infection and gestational diabetes among others,being some of these contradictory results and which have not been established as an indication for intrapartum antibiotic treatment. This study sought to identify risk factors in the obstetric patient at the Hospital Militar Central , that had GBS colonization to provide recommendations for antibiotic prophylaxis to women with unknown colonization screening at the time of delivery and impact on reducing the overall incidence of infectiousn perinatal complications. An analytical study of cases and controls nested in a prospective cohort in the delivery and recovery room of the Hospital Militar Central were entered into the study all mothers with rectovaginal culture who were hospitalized between November 2019 and August 2020. A sample of 341 patients was obtained to whom a survey was conducted upon admission and clinical stories for variable collection were finally valued. A 95% confidence level and 80% power were accepted. And finally the processing of information to respond to the objectives under the Real Statistics program. A prevalence of 26% was obtained with screening of 52%. Statistically significant variables were vaginosis and urinary tract infection.Términos MESH: "Streptococcus","Streptococcus agalactiae" and "Pregnancy"; "Streptococcal Infections" Especialización

Fil: Dinamarca, Sofía. Universidad Juan Agustín Maza. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Laboratorio de Biología Celular y Molecular (BIOCyM). Mendoza. Argentina. Fil: Salafia, Cesia. Universidad Juan Agustín Maza. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Laboratorio de Biología Celular y Molecular (BIOCyM). Mendoza. Argentina. Fil: Quintero, Cristian. Universidad Juan Agustín Maza. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Laboratorio de Biología Celular y Molecular (BIOCyM). Mendoza. Argentina. Este informe técnico científico fue elaborado por Estudiantes Becarias de Investigación en el marco de proyectos I+D desarrollados en el Laboratorio de Biología Celular y Molecular UMaza dirigido por el Dr. Cristián Quintero, durante el ciclo 2020.

El presente estudio evaluó la actividad antimicrobiana de diferentes aceites esenciales (limón, naranja, mandarina, laurel, eucalipto y burro) en bacterias benéficas como Lactobacillus plantarum ES147 y ATCC 8014, patógenas como Escherichia coli ATCC 25922 y una bacteria alterante de alimentos, Leuconostoc mesenteroides MS1. En los aceites que se registraron halos de inhibición significativo (al menos 10 mm de halo en 3 cepas analizadas) se procedió a determinar las concentraciones mínimas inhibitoria y bactericida. Los aceites esenciales de limón, eucalipto y burro mostraron un efecto bactericida en todas las cepas analizadas. Los aceites esenciales de naranja y mandarina presentaron muy bajo o nulo poder antimicrobiano en las cepas en estudio. Los aceites esenciales de burro, laurel, mandarina y naranja no inhibieron o inhibieron muy poco a las bacterias benéficas y generaron grandes halos de inhibición en bacterias patógenas o alterantes de alimentos. Dichos aceites pueden considerarse para su adición en films o recubrimientos de alimentos. The present study evaluated the antimicrobial activity of different essential oils (lemon, orange, mandarin, laurel, eucalyptus and burro) in beneficial bacteria such as Lactobacillus plantarum ES147 and ATCC 8014, pathogens such as Escherichia coli and a food-altering bacterium, Leuconostoc mesenteroides MS1. Subsequently, the minimal inhibitory concentrations and minimal bactericidal concentrations of the essential oils that had a significant bactericidal effect (at least 10 mm inhibition zone in tree strains) were determined. Lemon, eucalyptus and burro essential oils showed a bactericidal effect in all analyzed strains. Mandarin and orange essential oils presented very low or null antimicrobial inhibition in the strains under study. Laurel and burro essential oils generated significantly lower inhibition halos in beneficial bacteria compared to pathogenic or food-altering bacteria. Such essential oils can be considered for addition in films or food coatings. Fil: Vignola, María Belén. Universidad Tecnológica Nacional. Facultad Reg.san Francisco. Departamento de Ingeniería Química; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; Argentina Fil: Serra, Mónica Andrea. Universidad Tecnológica Nacional. Facultad Reg.san Francisco. Departamento de Ingeniería Química; Argentina Fil: Andreatta, Alfonsina Ester. Universidad Tecnológica Nacional. Facultad Reg.san Francisco. Departamento de Ingeniería Química; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; Argentina

RESUMEN Objetivo: Se evaluó la actividad antimicrobiana de un extracto crudo de B. bassiana y dos fracciones del mismo contra bacterias de importancia clínica. Métodos: El micelio de cepa B. bassiana se remojó en metanol durante una semana, después se evaporo en un rotovapor a 45°C aplicando vacío. El extracto metanólico se hizo pasar con dos fases móviles para obtener una fracción A y B. La fracciones A, B y el extracto crudo C se evaluaron contra las cepas Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Salmonella tiphy, Pseudomonas aeruginosa y Acinetobacter baumannii con la técnica de microdilución en placa. Resultados: En la fracción A se observó un efecto antimicrobiano contra Salmonella typhi, Pseudomonas aeruginosa y Acinetobacter baumannii el crecimiento bacteriano alcanzó el 70, 60 y 83 % respectivamente. La fracción B causó un efecto antimicrobiano en Klebsiella pneumoniae, S. typhi, P. aeruginosa y A. baumannii con un crecimiento bacteriano del 62, 58, 41 y 7 % respectivamente. Y El extracto crudo no causó inhibición del crecimiento en A. baumannii, pero para el resto de la bacterias hubo un crecimiento del 56 al 88 %. Conclusiones: Beauveria bassiana es un hongo entomopatógeno que produce diferentes metabolitos con actividad insecticida, citotóxica, antifúngica, antibiótica y antiviral. Este es el primer estudio de los efectos antimicrobianos de un extracto metanólico del hongo entomopatógeno B. bassiana contra cepas bacterianas de importancia clínica. ABSTRACT Objective: The antimicrobial activity of a crude extract of B. bassiana and two fractions thereof against clinically important bacteria was evaluated. Methods: The mycelium of strain B. bassiana was soaked in methanol for a week, then it was evaporated in a rotovap at 45 ° C applying a vacuum. The methanolic extract was passed through two mobile phases to obtain a fraction A and B. Fractions A, B and crude extract C were evaluated against the strains Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Salmonella tiphy, Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter baumannii with the plate microdilution technique. Results: In fraction A an antimicrobial effect against Salmonella typhi, Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter baumannii was observed, bacterial growth reached 70, 60 and 83% respectively. Fraction B caused an antimicrobial effect in Klebsiella pneumoniae, S. typhi, P. aeruginosa and A. baumannii with a bacterial growth of 62, 58, 41 and 7% respectively. And the crude extract did not cause growth inhibition in A. baumannii, but for the rest of the bacteria there was a growth of 56 to 88%. Conclusions: Beauveria bassiana is an entomopathogenic fungus that produces different metabolites with insecticidal, cytotoxic, antifungal, antibiotic and antiviral activity. This is the first study of the antimicrobial effects of a methanolic extract of the entomopathogenic fungus B. bassiana against bacterial strains of clinical importance.

ilustraciones, fotografías, gráficas, tablas La pudrición blanda bacteriana de ciclamen (Cyclamen persicum Mill.) es un problema fitosanitario que ocasiona pérdidas del 20% en producción en el mundo y en Colombia se desconocen sus síntomas y agentes causales. Como objetivo de esta investigación se planteó describir el desarrollo de esta enfermedad con base en su sintomatología e identificar a nivel de especie sus agentes causales. Para ello, se visitaron viveros del municipio de San Antonio del Tequendama, Colombia, donde se seleccionaron plantas enfermas para la descripción de los síntomas, realizar los aislamientos y caracterizarlos morfológica, bioquímica y molecularmente, además de evaluar su actividad pectolítica en papa y su patogenicidad en plantas de ciclamen. Como resultado, se asociaron seis síntomas con la enfermedad: marchitez generalizada, cormo blando, presencia de exudado en el cormo, pudrición blanda de raíces, pudriciones blandas y pudriciones blandas necróticas en peciolos y pedúnculos; de los cuales 47 morfotipos fueron aislados siendo siete patógenicos, uno provenía de síntomas de cormos blandos, dos de peciolos con pudriciones blandas, dos de peciolos con pudriciones blandas necróticas y dos de pudriciones blandas en raiz. Un análisis de correspondencia múltiple considerando las características, morfológicas, bioquímicas y patogénicas, agrupó los siete aislamientos en los géneros Pseudomonas, Dickeya y Pectobacterium. Un análisis multilocus (MLSA) a partir de las secuencias de la región del 16S rADN y housekeeping genes (gapA, icdA, mdh, pgi, rpoB y rpoD) confirmó las especies bacterianas, Pseudomonas asplenii, Dickeya solani y Pectobacterium atrosepticum como los agentes causales de la pudrición blanda bacteriana del ciclamen en Colombia. (Texto tomado de la fuente). The cyclamen bacterial soft rot (Cyclamen persicum Mill.) is a phytosanitary problem that causes 20% production losses worldwide, however in Colombia its symptoms and causal agents are unknown. The aim of this research was the description of the bacterial soft rot disease development, based on symptomatology, and the identification to the species level of the causal bacterial agents. For that, nurseries of the San Antonio del Tequendama municipality in Colombia were visited, diseased plants were selected to describe the symptoms, isolate the pathogens, and characterize them morphological, biochemical and molecularly, besides evaluating its pectolytic activity on potato and pathogenicity on cyclamen plants. As a result, six symptoms were associated with the disease: wilt, soft corm, exudate on corm, rot roots, soft rot and necrotic soft rot on petioles and peduncles. Seven morphotypes, out of 47 isolated were pathogenic; one from the soft corms, two from petioles with soft rot, two from petioles necrotic soft rot, and two from root rot. Considering the morphological, biochemical and pathogenic characteristics, a multiple correspondence analysis clustered the seven isolates in the genera Pseudomonas, Dickeya and Pectobacterium. From the sequences of the 16S rADN region and housekeeping genes (gapA, icdA, mdh, pgi, rpoB y rpoD), a multi-locus analysis (MLSA) confirmed the bacterial species, Pseudomonas asplenii, Dickeya solani and Pectobacterium atrosepticum as the causal agents of the cyclamen bacterial soft rot in Colombia. Proyectos de investigación entre la Universidad de Cundinamarca y la Universidad Nacional de Colombia, Bogotá, 2017 Identificación del agente etiológico de la pudrición bacteriana de violeta de los Alpes (Cyclamen persicum Mill.), No. 39398 Incluye anexos Maestría Magíster en Ciencias Agrarias Fitopatologia Ciencias Agronómicas

Este artículo recopila información sobre la Legionella Pneumophila en aguas termales, bacteria transmitida por el agua y causante de la enfermedad del legionario, la cual puede estar presente en gran número en los balnearios naturales que utilizan agua de manantial termal, así como en jacuzzis mal operados, equipos asociados a sistemas de calentamiento y ventilación de aire acondicionado. En Colombia los estudios sobre esta bacteria son limitados, al igual que la normativa referente a aguas termales; por esta razón se recurrió a reglamentación internacional para la Legionella Pneumophila, en la cual se evidenció como en algunos países se tiene un límite aceptable para la presencia de esta bacteria o por el contrario se exige su ausencia total en los sistemas que usen agua para su funcionamiento., This article collects information about Legionella Pneumophila in hot springs, a waterborne bacteria that causes Legionnaire's disease, which can be present in large numbers in natural spas that use thermal spring water, as well as in poorly operated hot tubs, equipment associated with air conditioning heating and ventilation systems. In Colombia the studies on this bacterium are limited, as well as the regulations referring to thermal waters; for this reason international regulations for the Legionella Pneumophila were resorted to, in which it was evidenced as in some countries there is an acceptable limit for the presence of this bacterium or on the contrary it is demanded its total absence in the systems that use water for its operation., Pregrado, Ingeniero(a) Civil

Las plantas producen compuestos con propiedades antimicrobianas que pueden ser empleadas en el control de diversas enfermedades. La obtención de los extractos vegetales y el estudio de sus compuestos activos propician su empleo contra diferentes bacterias. México cuenta con una extensa variedad de plantas que son usadas con fines medicinales, una de ellas es el cornezuelo (Acacia cornígera), el cual ha sido ocupado como remedio para tratar enfermedades infecciosas, como la gastroenteritis, disentería, disípela, entre otras. En el presente proyecto se obtuvo y evaluó la eficacia del extracto etanólico de cornezuelo a diferentes concentraciones en cepas de bacterias patógenas, con el propósito de ampliar la gama de antimicrobianos a los ya existentes, y en un futuro se utilice como tratamiento en padecimientos infecciosos.

Xylella fastidiosa es una bacteria que habita solamente los vasos xilemáticos de las plantas. Ha sido asociada mundialmente con enfermedades que causan grandes pérdidas en cultivos económicamente importantes (fig. 1 y 2). En Argentina se la encontró en la década del ´40 en plantaciones de ciruelo japonés de la zona del Delta del Paraná, produciendo la escaldadura del borde de la hoja del ciruelo (Fernandez Valiela y Bakarcic, 1963) (fig. 3). Esta grave enfermedad afectó a la mayoría de las variedades cultivadas de ciruelo en esa zona. No había antecedentes de alguna afección similar en ese momento y se pensó que el agente causal era un virus. Fue declarada plaga de la agricultura (Dec. P. E. Nac. 15523/56), provocando la muerte de más de 500.000 plantas, pero afortunadamente no pasó a otra región del país y desapareció cuando la zona dejó de ser frutícola. Instituto de Patología Vegetal Fil: Tolocka, Patricia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina Fil: Paccioretti, Mauro Andres. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina Fil: Haelterman, Raquel Mercedes. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina

[Resumen]: La creciente importancia adquirida por la industria acuícola se ve reflejada en el espectacular incremento de un 29% en su producción durante el período 2011-2016. Sin embargo, su notable expansión asociada con los efectos del cambio climático lleva pareja la dispersión de patógenos responsables de unas pérdidas anuales para el sector acuícola estimadas en más 6000 millones de dólares por la FAO. Uno de los patógenos más relevantes es Vibrio anguillarum responsable de la vibriosis, una septicemia hemorrágica capaz de afectar a más de 50 especies de peces y moluscos entre los que se encuentran algunos de interés piscícola a nivel mundial. Dentro de sus principales factores de virulencia encontramos a los sistemas de captación de Fe (III) mediados por sideróforos. Estos sistemas han sufrido adaptaciones desde su función ancestral de captación de hierro en condiciones de baja solubilidad en el medio externo, hacia la captación de hierro en el medio interno de los organismos, un medio en donde la disponibilidad de hierro en estado libre alcanza concentraciones attomolares. Recientemente se ha descubierto un nuevo sistema de sideróforos en V. anguillarum. Este sistema es responsable de la síntesis de la piscibactina, sideróforo caracterizado previamente en otro importante patógeno acuícola; Photobacterium damselae subespecie piscicida. El nuevo sistema se une a otros descubiertos previamente en V. anguillarum como son los de la vancrobactina y la anguibactina. La importancia de este nuevo elemento se ha hecho patente tras la secuenciación de un gran número de cepas de V. anguillarum. En este análisis se ha comprobado que el sistema de la piscibactina está presente en buena parte de las cepas con mayor mortalidad asociada (RV22, HI610, DSM 21597, 90-11-286). Esta evidencia ha sido puesta a prueba en ensayos de virulencia con la cepa RV22. En ellos se ha apuntado hacia el sistema de la piscibactina como un importante factor de virulencia, lo que supone una nueva posibilidad de cara a la generación de estrategias frente a V. anguillarum. Por todo ello, en el presente trabajo se propone el clonaje del supuesto receptor de la piscibactina, el gen frpAang, su producción en E. coli y su purificación de cara a un futuro ensayo de vacunación. [Abstract]: The growing importance acquired by the aquaculture industry is reflected in its recent production increase of 29% over the period of 2011-2016. However, its remarkable expansion in association with climate change effects drives to the dispersion of several associated pathogens responsible for annual losses to the industry estimated at 6000 million dollars according to the FAO. One of the most relevant pathogens is Vibrio anguillarum responsible for the vibriosis, an hemorrhagic septicemia capable of affecting more than 50 species of fish and molluscs among which are some of the fish interest worldwide. One of its main virulence factors are Fe (III) uptake systems mediated by siderophores. These systems have been adapted from their ancestral role of iron uptake in the environment, towards the uptake of iron in the internal environment of the hosts, where the availability of iron in a free state is found in attomolar concentrations. Recently a new siderophore system has been found out in V. anguillarum. This system is responsible for the synthesis of piscibactin, siderophore related with another important aquaculture pathogen; Photobacterium damselae subspecies piscicida. The new system is added to other systems already known in V. anguillarum such as vancrobactin and anguibactin systems. The importance of this new discovery seems to be noted after the recent sequencing of several V. Anguillarum strains. It has been observed that the system is present in much of the strains with higher associated mortality (RV22, HI610, DSM 21597, 90-11-286). This observation has been tested in virulence tests with the strain RV22. These studies point out that the piscibactin system is an important virulence factor, which implies a new possibility for the generation of new strategies against V. anguillarum. With all this knowledge about V. Anguillarum, the present Master Dissertation proposes the cloning of the putative receptor of piscibactin, the coding gene frpAang, its production and purification in E. coli for the development of a future vaccination assay. Traballo fin de mestrado (UDC.CIE). Biotecnoloxía avanzada. Curso 2018/2019

Legionella pneumophila es una bacteria que se encuentra de forma natural en ambientes acuáticos, su hábitat predomina en fuentes de agua natural superficiales, como lagos, ríos o estanques. Desde su hábitat natural puede colonizar los sistemas de abastecimiento hídrico de una ciudad, y a través de las redes de distribución ingresar como organismo patógeno al ser humano. El presente trabajo asumió como objetivo principal evaluar la presencia de Legionella pneumophila en muestras de agua tomadas de tres puntos diferentes de un hospital municipal, que, si bien no es habitual su detección, si resulta ser bastante oportuno su identificación, cuantificación y posible eliminación del recurso hídrico., Legionella pneumophila is a bacterium that is found naturally in aquatic environments, its habitat predominates in superficial natural water sources, such as lakes, rivers or ponds. From its natural habitat it can colonize the water supply systems of a city, and through the distribution networks enter the human being as a pathogenic organism. The present work assumed as main objective to evaluate the presence of Legionella pneumophila in water samples taken from three different points of a municipal hospital, which, although its detection is not usual, if its identification, quantification and possible elimination of the hidric resource., Maestría, Magíster el Ingeniería Civil con Énfasis en Ingeniería Ambiental

Tesis (Doctora en Ciencias Químicas) - - Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas, 2019 Chlamydia trachomatis es el patógeno bacteriano de transmisión sexual más común en humanos y una causa frecuente de infecciones asintomáticas y persistentes que conducen a complicaciones graves, particularmente en mujeres jóvenes. Chlamydia presenta un estilo de vida intracelular obligado único que involucra la transición cíclica entre su forma de desarrollo infectiva o cuerpo elemental y su forma replicativa o cuerpo reticular dentro de una vacuola denominada “inclusión”. En presencia de factores estresantes como el interferón gamma (IFNγ) o los antibióticos beta-lactámicos, C. trachomatis sufre una interrupción en su ciclo replicativo y entra en un estado viable pero no cultivable, “persistente”, también llamado persistencia clamidial, generalmente asociado a la presencia de cuerpos reticulares aberrantes y de mayor tamaño. Al removerse los factores de estrés, estas bacterias reanudan la división celular y las transiciones entre sus formas de desarrollo. Por lo tanto, la persistencia clamidial se considera un factor clave en la capacidad de estas bacterias para evadir diferentes efectos antimicrobianos. En esta tesis, se describe un screening genético para identificar y caracterizar mutantes de C. trachomatis con defectos en la recuperación post-estrés inducido por IFNγ y/o penicilina. Utilizando una colección de aproximadamente 1000 mutantes químicas completamente secuenciadas de C. trachomatis LGV-L2, se encontró que la mutante M275 es defectuosa en la recuperación de estrés inducido por IFNγ pero no por penicilina. Mediante la transferencia lateral de genes y análisis de recombinantes se identificó ptr, que codifica una posible proteasa, como un gen probablemente requerido para la recuperación del estrés inducido por IFNγ. Para confirmar estos resultados se construyó una cepa nula para ptr (L2 ptr::GII), la cual también mostró defectos en la recuperación del estrés inducido por IFNγ, y este defecto se restableció mediante la complementación de la expresión de Ptr. L2 ptr::GII, al igual que M275, mostró una menor tasa de diferenciación de RB a EB y una replicación del genoma reducida durante la recuperación después del tratamiento con IFNγ, lo que indica que Ptr es necesaria para una salida rápida del estrés inducido por IFNγ. Asimismo, se desarrollaron anticuerpos contra Ptr que nos permitieron observar que esta proteína es secretada al lumen de la inclusión clamidial. Utilizando un modelo murino de infección vaginal se observó un clearance disminuido a los 14 días post-infección para L2 ptr::GII, sugiriendo que la anulación de ptr causa una demora en la eliminación de C. trachomatis en el tracto genital femenino durante la infección in vivo. Por otro lado, se caracterizó la mutante M111, que presentó defectos en la recuperación luego del estrés inducido por IFNγ o por penicilina. Dicha mutante porta una única mutación sin sentido en pmpC, además de mutaciones con cambio de sentido en 5 genes adicionales. El gen pmpC codifica para una proteína polimórfica de membrana perteneciente a una familia de proteínas exclusiva de Chlamydia. Mediante la inactivación sitio-dirigida de genes por inserción se identificó pmpC como un gen necesario para la recuperación del estrés inducido por IFNγ o penicilina. Adicionalmente, se observó que la anulación de pmpC causa un defecto en la adherencia e invasión en las células hospedadoras, e induce la formación de agregados bacterianos dentro de la inclusión clamidial. En conclusión, este trabajo de tesis identificó a ptr y pmpC como genes involucrados en la persistencia clamidial. 2021-12-31

Los objetivos del presente trabajo han sido: Evaluar la eficacia antimicrobiana de NaClO al 2.5%, CHX al 2%, ALX al 2% y CTR al 0,2%, frente a biopelículas polimicrobianas de origen endodóntico, formadas en dentina, mediante tinción de fluorescencia y microscopía de barrido láser confocal. Comparar entre sí la efectividad antimicrobiana de las distintas soluciones ensayadas sobre biopelículas polimicrobianas maduras. Determinar si la adicción de cetrimida al 0,2% mejora la actividad antimicrobiana de soluciones de CLX y ALX., Tesis Univ. Granada. Programa Oficial de Doctorado en Medicina Clínica y Salud Pública

En el presente documento se describe el proceso y resultados obtenidos de la realización de Antibiogramas en Dermatopatías Bacterianas en Caninos, mediante la aplicación de discos de antibióticos (método Kirby Bauer) en una colonia de bacterias; y determinando su reacción como sensible, intermedio o resistente. The present document describes the process and results obtained from the performance of Antibiogramas in Dermatopatias Bacterianas in Canines through the application of antibiotic discs (The Kirby Bauer Method) in a colony of bacteria and determining its reaction as sensitive, intermediate or resistant.

El documento consiste en la identificación de los microorganismos bacterianos causantes de dermatopatías en perros en la ciudad de Cuenca, mediante cultivos bacteriológicos en laboratorio, con el fin de conocer la principal bacteria que afecta a la piel, que servirá de ayuda a médicos veterinarios para llegar a un diagnóstico autentico para cada paciente. The document consists of the identification of bacterial microorganisms that cause dermatopathies in dogs in the city of Cuenca, through bacteriological cultures in the laboratory, in order to know the main bacteria that affects the skin, that will help veterinarians to reach an authentic diagnosis for each patient.

La producción de biosólidos en la Planta de Tratamiento de Aguas Residuales (PTAR) San Fernando de propiedad de Empresas Públicas de Medellín (EPM) en Medellín, Antioquia, Colombia, está regulada por el Ministerio de Medio Ambiente Colombiano y custodiada por la autoridad regional ambiental Corporación Autónoma Regional del Centro de Antioquia (Corantioquia). Uno de los metales más cuestionados y vigilados en la producción de biosólidos en el mundo es el cromo derivado de múltiples actividades antrópicas, cuyas formas más significativas son la especie hexavalente (Cr6+) conocida por sus propiedades ácidas de naturaleza oxidante, que ocasiona daño a los tejidos y lesiones en los órganos, generando serios trastornos en la salud humana y animal con efectos mutagénicos, teratogénicos y carcinogénicos y la especie trivalente (Cr3+), considerada vital y necesaria para la síntesis de la glucosa, algunos lípidos y proteínas. Las posibilidades de oxidoreducción entre estas dos especies son motivo de serias discusiones y múltiples investigaciones, pero todavía son inciertos algunos de los mecanismos que influyen y gobiernan estas reacciones de doble vía. Cinco experimentos fueron llevados a cabo en la Universidad Nacional de Medellín tendientes a encontrar hongos y bacterias que fuesen capaces de crecer en medios de cultivo enriquecidos con cromo, con el objeto de aislarlos, purificarlos y multiplicarlos; para someterlos a concentraciones crecientes del metal, hasta encontrar la Concentración Mínima Inhibitoria (CMI), con el objeto de ser utilizados posteriormente como posibles alternativas biotecnológicas en la remediación de ambientes con presencia de cromo. Los microorganismos fueron obtenidos mediante aislados de aguas residuales de la empresa Curtiembres de Itagüí, Antioquia y de los biosólidos de la PTAR San Fernando, de los ceparios de la Universidad Nacional y de la Universidad de Antioquia, aportes de las empresas privadas Natural Control y Soluciones Microbiales para el Trópico; también se recurrió al interior del laboratorio a contaminantes ambientales colonizadores de un medio de cultivo enriquecido con cromo y fueron evaluados algunos fitopatógenos aleatorios obtenidos del cultivo del cacao. Aquellos organismos seleccionados por su cromotolerancia, fueron evaluados en forma de consorcio microbiano bajo invernadero, en macetas plásticas de 2 kilogramos de peso, con suelos contrastantes (Andisol e Inceptisol) y adiciones de biosólidos (20 Ton Ha-1) de la PTAR San Fernando, en presencia de una dosis alta de dicromato de potasio equivalente al doble de la CMI explorada (2.400 mg kg-1). Como planta bioindicadora se utilizó frijol arbustivo Phaseolus vulgaris durante todo el período vegetativo y reproductivo por 4 meses al cabo de los cuales se tomaron muestras de suelo rizosférico y no rizosférico con el propósito de llevar a cabo pruebas de metagenómica para rastrear la trazabilidad de las especies adicionadas y observar potenciales géneros nuevos que no hayan sido investigados. Los microorganismos que demostraron mayor potencial por su capacidad para remover cromo total o reducir cromo hexavalente a trivalente fueron caracterizados molecularmente en la Universidad de Antioquia y bioquímicamente en la Universidad Nacional, sede de Medellín mediante el empleo del Kit API y del sistema Biolog Microstation ID System. Posteriormente purificados y escalados y previa confrontación con los hallazgos de otros investigadores a nivel global, fueron empleados en pruebas de biotest de toxicidad, para confirmar su capacidad remediadora en presencia de silicato de magnesio y en ausencia de él como posible agente neutralizador del cromo en el suelo, usando prototipos no comerciales de Rhizotrones como herramientas de diagnóstico. Plantas de lechuga Lactuca sativa y lenteja Lens culinaris fueron empleadas como biosensores por su alta sensibilidad a los metales traza. Finalmente las bacterias Ochrobactrum antropi, O. intermedium, Bacillus amyloliquefacien, Bacillus cereus , B. megaterium, B. firmus; Staphylococcus saprophyticus y los hongos Scedosporium dehoogii, S. boydii, Paecilomyces lilacinus y Trichoderma sp., fueron elegidos como los organismos con mayor potencial para ser usados como bioremediadores de ambientes con presencia de cromo mediante la utilización de un biofiltro a través de un consorcio microbiano, o de manera individual empleados in situ, en combinación con correctivos que contengan silicatos de magnesio, dado su poder neutralizador de cromo en el suelo, como fue demostrado en este estudio. The biosolid production in the water treatment plant (PTAR) San Fernando property of EPM de Medellin is regulated by the environment minister of Colombia and monitored by the regional environment authority Corantioquia. One of the most questioned and guarded metals in the production of biosolids is Chrome. This metal originates in several anthropic activities and has as its most representative forms the hexavalent (Cr6+) species. This from is known for its acidic properties and oxidant nature, it produces damage to tissues and organ injuries generating serious disorders in human and animal health that include mutagenic, teratogenic and carcinogenic effects. The trivalent species (Cr3+) is considered vital and necessary for the synthesis of glucose, and some lipids and proteins. The possibilities of oxide reduction between these two species are object of serious discussions and multiple researches but the mechanisms that govern and influentiate these double way reactions are still uncertain. Five experiments were made in the Universidad Nacional de Medellin aiming to find fungus and bacteria that were able to grow in chrome enriched environment with the objective of aisle, purify and multiply them. Then they would be exposed to incremental concentration of the metal until finding the minimum inhibitory concentration (CMI), with the objective of using them in possible biotechnological alternatives aiming to remediate environments with chrome presence. The microorganisms where obtained by isolating samples from the company Curtiembres de Itagui and from the Biosolids of the PTAR San Fernando property of Empresas Públicas de Medellín (EPM), borrowings from the stumps of Universidad Nacional and Universidad de Antioquia, contributions from the private companies Natural Control and Soluciones Microbiales para el Tropico, environmental colonizer contaminants to the chrome enriched media where also used and some phytopathogens obtained randomly from cacao plantations where also evaluated. The microorganisms selected due to their chrome tolerance where exposed to react under a greenhouse microbiological consortium in plastic pots weighing 2kg. Contrasting soils (Andisol and Inceptisol) and added biosolids (20 Ton Ha-1) of the PTAR San Fernando un presence of a high dose of potassium dichromate equivalent to double of the explored CMI (2.400 mg kg-1). The arbustive bean Phaseolus vulgaris was used as a bioindicator, the whole vegetative and reproductive period was followed for a period of 4 moths during which samples of rizospheric and non rizospheric soil where taken with the purpose of developing metagenomics tests keeping track of the traceability of the added genera and observe potential new genera that haven’t been investigated. The microorganism that demonstrated a higher potential based on their capacity to remove total chrome, reduce hexavalent chrome to trivalent where characterized molecularly at the Universidad de Antioquia and biochemically at the Universidad Nacional using the API protocol and Biolog Microstation ID System. After a confrontation against other researchers at a global level the microorganisms where purified and escalated and then used in bio toxicity tests in order to confirm their corrective capacity in presence and absence of magnesium silicate as a possible neutralizing agent of Chrome in the soil, non-commercial prototypes of Rhizotrones where used to as diagnostic tools. Lettuce Lactuca sativa and lentil Lens culinaris where used as biosensors due to their high sensitivity to trace metals. Finally the bacteria Ochrobactrum antropi, O. intermedium, Bacillus amyloliquefacien, B. cereus, B. megaterium, B. firmus; Staphylococcus saprophyticus and fungus Scedosporium dehoogii, S. boydii, Paecilomyces lilacinus y Trichoderma sp. Where selected as the microorganisms with the highest potential to be used as bio-remediating agents for environments with chrome presence using them as a biofilter in a microbial consortium or in a individual way using them in situ in combination with correctives containing magnesium silicates due to its chrome neutralizing capacity as shown in this study. Doctorado Doctor en Ecología

ilustraciones, gráficas, tablas Los sustitutos de leche materna son usados a nivel mundial desde temprana edad, en Bogotá se usan féculas que reemplazan las fórmulas lácteas infantiles, las cuales no son alimentos estériles y su calidad microbiológica cobra relevancia ya que pueden ser suministrados a menores de un año y en algunos casos a lactantes. Las patologías infecciosas asociadas con Cronobacter spp han sido reportadas mundialmente y por la importancia clínica son consideradas un problema de salud pública. El objetivo del trabajo fue, determinar la presencia de Cronobacter spp en féculas de maíz y de plátano distribuidas en la ciudad de Bogotá, destinadas a la alimentación infantil. A través de encuestas de consumo se identificaron las principales marcas de estos alimentos vendidos en la ciudad y con la metodología ISO/TS 22964:2006 se verificó la presencia del microorganismo en las féculas. Nuestros resultados muestran que el 71% de las muestras positivas fueron las féculas de plátano con un 35% de prevalencia de Cronobacter spp. La identificación de especies se realizó usando el blanco molecular cgcA y la distribución de especies fue 74% para C. sakazakii, 14% C. malonaticus y 12% C. dublinensis. Se concluyó, por primera vez, que existe el riesgo por consumo para Cronobacter spp en los alimentos seleccionados y que tiene la misma tendencia de distribución mundial. (Texto tomado de la fuente). Breastmilk substitutes are used globally at an early age to replace infant formula. The ones distributed in the city of Bogotá are mainly composed of maize and banana starches. The objective of this work was to determine the presence of Cronobacter spp in maize and banana starches, destined to infant feeding. Through consumer surveys the main brands of these foods sold in the city were identified and analyzed following the methodology ISO / TS 22964: 2006, to evaluate the presence of the microorganism in the starches. Our results showed that 71% of the positive samples were banana starches, with a 35% prevalence of Cronobacter spp. A detailed species identification was performed using the molecular target cgcA and the species distribution was 74% for C. sakazakii, 14% for C. malonaticus and 12% for C. dublinensis. These findings revealed by the first time the existence of a consumption risk for Cronobacter spp in breastmilk substitutes consumed in the city of Bogota, that follows the same trend of Cronobacter global distribution previously reported. Incluye anexos Maestría Magíster en Ciencia y Tecnología de Alimentos Calidad de los alimentos Alimentos y Agroindustria

Programa Oficial de Doutoramento en Ciencias da Saúde. 5007V01, [Resumen] En los últimos años ha crecido el interés en el estudio de la comunicación intercelular bacteriana, la cual juega un papel importante en la regulación de diferentes factores de virulencia. Las bacterias, pueden intercambiar información mediante un proceso conocido como quorum sensing (QS), basado en la expresión y reconocimiento de moléculas señal. Este proceso permite a las bacterias compartir información de su densidad celular y así regular adecuadamente su expresión génica. Por esta razón, el QS podría ser una diana clave para la búsqueda y diseño de nuevas alternativas terapéuticas para el tratamiento de infecciones causadas por patógenos multirresistentes como Acinetobacter baumannii. Este patógeno, además de presentar una resistencia intrínseca a multitud de antibióticos, posee una gran facilidad en la adquisición de elementos genéticos y en el desarrollo de mutaciones convirtiéndolo en uno de los principales microorganismos causantes de infecciones nosocomiales en todo el mundo. La inhibición de la comunicación entre bacterias conocida como quorum quenching puede llevarse a cabo a través de diferentes vías, como la inhibición en la síntesis de las moléculas señal, la intercepción de estas mediante degradación enzimática (a través de acilasas o lactonasas) o mediante el empleo de antagonistas del receptor de las mismas. En la presente tesis doctoral se estudian los sistemas de quorum sensing/quorum quenching en diferentes cepas clínicas de A. baumannii y su relación con diversas condiciones de estrés (respuesta ROS, sales biliares y fagos en estado lisogénico/ lítico), con la finalidad de desarrollar nuevas terapias antiinfecciosas (conocidas como terapias antivirulentas) que permitan inhibir la movilidad bacteriana, la formación de biofilm y por tanto el desarrollo de infección., [Resumo] Nos últimos anos medrou o interese no estudo da comunicación intercelular bacteriana, a cal xoga un papel importante na regulación de diferentes factores de virulencia. As bacterias poden intercambiar información mediante un proceso coñecido como quorum sensing (QS), baseado na expresión e recoñecemento de moléculas sinal. Este proceso permite ás bacterias compartir información da súa densidade celular e así regular adecuadamente a súa expresión xénica. Por esta razón, o QS podería ser unha diana clave para a procura e deseño de novas alternativas terapéuticas para o tratamento de infeccións causadas por patóxenos multirresistentes como Acinetobacter baumannii. Este patóxeno, ademáis de presentar unha resistencia intrínseca a multitude de antibióticos, posúe unha gran facilidade na adquisición de elementos xenéticos e no desenvolvemento de mutacións converténdoo nun dos principais microorganismos causantes de infeccións nosocomiais en todo o mundo. A inhibición da comunicación entre bacterias coñecida como quorum quenching pode levarse a cabo a través de diferentes vías como a inhibición na síntese das moléculas sinal, a intercepción destas mediante degradación enzimática (a través de acilasas ou lactonasas) ou mediante o emprego de antagonistas do receptor das mesmas. Na presente tese de doutoramento, estúdanse os sistemas de quorum sensing/quorum quenching en diferentes cepas clínicas de A. baumannii e a súa relación con diversas condicións de estrés (resposta ROS, sales biliares e fagos en estado lisoxénico/lítico), coa finalidade de desenvolver novas terapias antiinfecciosas (conocidas como terapias antivirulentas) que permitan inhibir a movilidade bacteriana, a formación de biofilm e, polo tanto, o desenvolvemento da infección., [Abstract] In recent years, bacterial intercellular communication, which plays an important role in the regulation of different virulence factors, has been of great interest. Bacteria are able to exchange information using cell-to cell communication systems, known as quorum sensing (QS), based in chemical signaling molecules. This process allows the bacteria to share information about cell density and regulate gene expression accordingly. Therefore, QS could be a key target to seek and to design new therapeutic alternatives for the treatment of infections caused by multidrug resistant pathogens, such as Acinetobacter baumannii. This pathogen not only shows an intrinsic resistance to a multitude of antibiotics, but also possesses a great facility to acquire genetic elements and/or mutations increasing its multidrug resistance phenotype, which makes it one of the main microorganisms that cause nosocomial infections worldwide. Inhibition of communication between bacteria (quorum quenching) may be performed by different approaches such as inhibition of signal molecules synthesis, interference of these signal molecules by enzymatic degradation (by acylase or lactones) or by using receptor antagonists of these signal molecules. In the present doctoral thesis, the quorum sensing/quorum quenching systems of different clinical strains of A. baumannii and their relationship with various stress conditions (ROS response, bile salts and lytic/lysogenic phages) are studied in order to develop new anti-infective therapies (known as anti-viral therapies) that allow inhibiting bacterial mobility, biofilm formation and thus the development of infection.

[ES] En los últimos años en España se ha incrementado el consumo de pescado denominado “low cost” entre los que destacan la tilapia y la panga, siendo este último la especie más habitual en los comedores escolares, la más consumida, la que está bajo sospecha y la que más mala fama tiene. Estos pescados “low cost” se caracterizan por estar criados en condiciones productivas extremas en distintas zonas de Asia; y a su vez en piscifactorías en ríos con altos índices de contaminación como el río Mekong. Además, en los últimos meses se han producido acontecimientos dónde se ha creado alarma entre la población llegando incluso a anunciarse su retirada de los lineales de las grandes cadenas de distribución alimentaria. Los consumidores cada vez son más conscientes que la presencia de estos pescados “low cost”, sobre todo de la panga, podrían poner en riesgo la calidad y la seguridad alimentaria debido a la presencia de antibióticos, metales pesados e incluso de distintas bacterias patógenas que podrían causar graves problemas de salud. En este trabajo se ha evaluado la calidad microbiológica de muestras de ambas especies para su estudio y poder determinar si existe presencia de patógenos., [EN] Recently, Spain has increased the consumption of fish known "low-cost" including tilapia and catfish, this last species most common in school canteens, the most consumed, which is under suspicion and has more notoriety. These "low-cost" fish are characterized to being bred in extreme production conditions in different parts of Asia; at the same time at fish farms in rivers with high levels of pollution as the Mekong river. In addition, in recent months there have been events which alarm has been created, among the population even to announce their retirement from the shelves of the large food retail chains. Consumers are become more aware that the presence of these “low-cost fish”, especially catfish, could put at risk the quality and food safety due to the presence of antibiotics, heavy metals and even pathogenic bacteria could cause serious health problems. In this aim, we have evaluated the microbiological quality of different samples of both species for study and determine if there is presence of pathogens., [CA] En els últims anys a Espanya s’ha incrementat el consum de peix “low cost” on destaquen la tilàpia i el panga, sent aquest últim l’espècie més habitual als menjadors escolars, la més consumida, la què es trova sota sospita i la què més mala fama té. Aquests peixos “low cost” es caracteritzen per estar criats en condicions productives extremes a distintes zones d’Àsia; i al mateix temps a piscifactories de rius amb elevats índexs de contaminació com és el riu Mekong. A més, durant els últims mesos s’han produït esdeveniments on s’ha creat alarma entre la población arribant inclús a anunciar-se la seva retirada als lineals de les grans cadenes de distribució alimentària. Els consumidors cada volta són més conscients que la presencia d’aquests peixos “low cost”, sobretot el panga, podrien posar en perill la qualitat i la seguretat alimentària a causa de la presencia d’antibiòtics, metalls pesants i inclús de diverses bacteris patògens què podrien causar greus problemas de salut. En aquest treball s’ha avaluat la qualitat microbiològica de diverses mostres d’ambdues espècies per al seu estudi i així poder determinar si existeixen presència de patògens.

La placa bacteriana es el principal causante de las enfermedades bucodentales, por ello buscamos métodos alternativos para su control, el objetivo principal fue corroborar el efecto de su remoción mediante la masticación de manzana roja y verde en 56 alumnos, de 5 a 10 años. Se les suministro gelatina sin sabor diluida en agua, posterior una tinción de placa en la cavidad oral con eritrosina, llevando un índice O’Leary antes y después de masticar una manzana de 200 gr encontrando que la manzana roja reduce el 68% de placa y la verde un 71%. Según resultados por Birkeland el efecto de la masticación de manzanas reduce el índice de placa bacteriana un 55%-65% datos similares a los obtenidos en este estudio. Odontólogo Pregrado

"The current methods used for detection of C. pneumoniae include cell culture, serological tests and molecular techniques. DNA amplification by PCR has been used successfully in the diagnosis of C. pneumoniae infection because of its high sensitivity, specificity and simplicity. However, its use is restricted due in part to the need for costly equipment and relatively long times for the detection of reaction products. The present study reports the development of a method for detection of C. pneumoniae based on gold nanoparticles and DNA probes. The system presented here integrates DNA amplification by PCR and a lateral flow assay, which proved to be useful in the colorimetric detection of DNA amplicons of C. pneumoniae, in a time of about 35 min after amplification of DNA." -- Tomado del Formato de Documento de Grado. "Entre los métodos utilizados para la detección de C. pneumoniae se encuentran el cultivo celular, pruebas serológicas y técnicas moleculares. La amplificación de ADN por PCR ha sido empleada exitosamente en el diagnóstico de la infección por C. pneumoniae por su gran sensibilidad, especificidad y simplicidad. Sin embargo, su uso es restringido debido en parte, a la necesidad de equipos costosos y tiempos relativamente largos para la detección de los productos de la reacción. El presente estudio reporta el desarrollo de un método para la detección de C. pneumoniae basado en el uso de nanopartículas de oro y sondas de ADN. El sistema aquí presentado integró el proceso de amplificación de ADN del organismo por PCR y un ensayo de flujo lateral que demostró ser útil en la detección de amplicones de ADN de C. pneumoniae mediante resultados colorimétricos, en un tiempo de aproximado de 35 min después de la amplificación de ADN." -- Tomado del Formato de Documento de Grado. Magíster en Ciencias Biológicas Maestría

Las enfermedades hemotrópicas afectan animales que viven en zonas tropicales y subtropicales del mundo, debido a la presencia de vectores transmisores de los agentes, tales como garrapatas y moscas hematófagas. Dentro de este grupo de enfermedades se encuentran la anaplasmosis, tripanosomosis y babesiosis bovina, las cuales afectan negativamente las producciones ganaderas, por lo que el diagnóstico certero permite el control y tratamiento racional de estas enfermedades. En Ecuador, estas enfermedades han sido poco estudiadas, por lo que el objetivo del presente trabajo fue realizar una prospección sobre la presencia de estos hemotrópicos en la Provincia de Pastaza, para lo cual se evaluaron tres fincas ganaderas, ubicadas en la región Amazónica del Ecuador, Provincia de Pastaza, donde se realizó el diagnóstico de anaplasmosis y tripanosomosis por ELISAi y babesiosis mediante la prueba de PCR. En esta evaluación se obtuvo una prevalencia del 65,5 % de anticuerpos anti MSP5r de Anaplasma marginale; 31,03 % anti Trypanosoma spp. por ELISAi y 0 % para Babesia spp. por PCR. No se encontró ningún tipo de correlación de la presencia de anticuerpos (anti A. marginale o Trypanosoma spp.) con el hematocrito ni con las proteínas totales. Igualmente no se observó diferencias significativas de los anticuerpos anti MSP5r con la presencia o ausencia de garrapatas en las fincas. En conclusión, se puede señalar la elevada seroprevalencia de Trypanosoma spp. y A. marginale en la zona estudiada, por lo que resulta eminente el establecimiento de medidas de control. Otro aspecto importante, fue el haber encontrado fincas sin garrapatas con la presencia de anticuerpos de anti MSP5r, señalando la posible presencia de otros vectores en esta zona.

Los probióticos se definen como microorganismos vivos que, cuando son administrados en adecuadas cantidades, confieren beneficios para la salud del huésped. Entre estos efectos beneficiosos figuran la reducción de los síntomas de mala digestión de la lactosa, reducción de hipercolesterolemia, disminución de la duración y gravedad de procesos diarreicos, mejora de la barrera de permeabilidad intestinal, prevención de algunos tipos de cáncer por adsorción o inactivación de agentes genotóxicos, incremento de la resistencia a infecciones intestinales y extraintestinales, atenuación de la enfermedad inflamatoria intestinal, y prevención de alergias (especialmente alimentarias). La cepa C4 de Lactobacillus plantarum ha sido aislada de kéfir y largamente estudiada en nuestro laboratorio por su potencial probiótico. En la presente memoria de tesis doctoral se describen nuevas actividades y propiedades que configuran el potencial probiótico de esta cepa. L. plantarum C4 resistió las condiciones de la digestión gastrointestinal simulada in vitro; en presencia del fructooligosacárido prebiótico FOS se prolongó la viabilidad de la bacteria que adquirió la capacidad de inhibir cepas de las bacterias patógenas intestinales Yersinia enterocolitica, Escherichia coli, Salmonella enterica serovar Typhimurium y Enterococcus faecalis. L. plantarum C4 ejerció antibiosis sobre Clostridium difficile y demostró capacidad para inactivar sus citotoxinas, efectos mediados por la producción de ácidos. Además, L. plantarum C4 inhibió de forma significativa la mutagenicidad del 2-nitrofluoreno sobre la cepa auxotrofa S. typhimurium TA98 en el ensayo de Ames, en condiciones en las que la viabilidad de C4 se vió abolida, lo que sugiere un mecanismo de adsorción que retira el mutágeno. Ensayos de inmunomodulación in vitro, sobre líneas celulares, e in vivo, en animales de experimentación, demostraron un excelente comportamiento de la cepa probiótica, que potenció mecanismos defensivos sin una contrapartida proinflamatoria en las condiciones basales, lo que se reflejó finalmente en un incrementos de la resistencia en el modelo de infección experimental del ratón por Y. enterocolitica. La discusión general de estos resultados pone de manifiesto que L. plantarum utiliza mecanismos directos (antibiosis, inactivación o adsorción de toxinas y de mutágenos) e indirectos (a través de la modulación de mecanismos inmunitarios) para producir los diversos efectos beneficiosos que se describen por primera vez en esta memoria., Tesis Univ. Granada. Programa Oficial de Doctorado en: Biología Fundamental y de Sistemas

Dental practice is regulated by biosafety methods, techniques and procedures; because one of the most important factors to be taken into account within the consultation is infection control. Orthodontic treatment aims to increase the quality of life of the patient by improving the function of the masticatory appliance and dentofacial aesthetics. This requires a correct treatment plan and the application and control of forces on the teeth through the use of mechanical devices and intraoral attachments. La práctica odontológica es regulada por métodos, técnicas y procedimientos de bioseguridad; debido a que uno de los factores de mayor importancia que se deben de tomar en cuenta dentro de la consulta es el control de infecciones. El tratamiento de ortodoncia tiene por objetivo aumentar la calidad de vida del paciente mediante la mejora de la función del aparato masticatorio y de la estética dentofacial para esto es necesario un correcto plan de tratamiento así como la aplicación y el control de fuerzas sobre los dientes mediante la utilización de dispositivos mecánicos y aditamentos intraorales.

Los efectores (T3E) del sistema de secreción tipo III (T3SS) son factores de virulencia esenciales en la interacción de bacterias fitopatógenas con sus hospedadores, debido a que: (i) promueven la penetración y permanencia del patógeno en el tejido del hospedador, (ii) interfieren con las respuestas de defensa de las plantas y (iii) facilitan el acceso a los nutrientes, promoviendo la proliferación y el crecimiento del patógeno (Gohre and Robatzek, 2008). La secuenciación y análisis de los genomas de diferentes cepas pertenecientes al complejo Pseudomonas syringae, ha permitido identificar el catálogo de T3E hipotéticos de cada una de ellas, así como clasificarlos en más de 60 familias génicas que constituyen el pangenoma de este relevante complejo de bacterias fitopatógenas (http://www.pseudomonassyringae.org/) (Baltrus et al., 2011; Lindeberg et al., 2012). Aunque la función concreta de la mayoría de los T3E identificados hasta la fecha en la interferencia con los mecanismos de defensa de la planta es aún desconocida, durante los últimos años se han producido grandes avances en el conocimiento del papel de los T3E del complejo P. syringae durante la interacción con plantas herbáceas. Estudios recientes, han establecido a Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi NCPPB 3335 como una cepa modelo en el estudio de la interacción de este complejo bacteriano con plantas leñosas (Ramos et al., 2012). El análisis bioinformático del borrador del genoma de esta cepa identificó 33 posibles T3E (Rodriguez-Palenzuela et al., 2010; Ramos et al., 2012), cuya translocación a través del T3SS se demostró para 7 de ellos (AvrRpm2, HopA1, HopAA1, HopAZ1, HopBK1, HopBL1 y HopBL2) durante el desarrollo de esta Tesis Doctoral (Matas et al., 2014). Además, la secuenciación de los tres plásmidos de esta cepa reveló que los genes codificantes de los T3E HopAF1 y HopAO1 se localizan en los plásmidos pPsv48A y pPsv48B, respectivamente, codificándose en el cromosoma un homólogo de HopAF1 (HopAF1-2). Teniendo en cuenta estos antecedentes, el objetivo principal que se planteó en esta Tesis Doctoral fue el análisis funcional de los T3E de NCPPB 3335, prestando mayor atención a las familias HopAF y HopAO. Para llevar a cabo este objetivo general, se plantearon los siguientes abordajes: 1) estudiar la distribución de los efectores de las familias HopAF y HopAO en los patovares de P. savastanoi y P. syringae, 2) analizar la translocación a través del T3SS de NCPPB 3335 y el papel en virulencia de los efectores de las familias HopAF y HopAO y, 3) analizar la interacción con los sistemas de defensa de la planta de los siete efectores de NCPPB 3335 cuya translocación a través del sistema de secreción tipo III ha sido demostrada, así como de los pertenecientes a las familias HopAF y HopAO. El análisis bioinformático y filogenético de las familias HopAF y HopAO permitió identificar que ambas se encuentran ampliamente distribuidas dentro del complejo P. syringae, si bien, P. savastanoi pv. savastanoi NCPPB 3335 codifica dos genes de la familia hopAO (hopAO1 y hopAO2) y tres genes de la familia hopAF (dos copias del gen hopAF1 y una del gen hopAF1-2). La filogenia de esta última familia reveló que el alelo hopAF1 se codifica mayoritariamente en cepas patógenas de plantas leñosas. Análisis de translocación y transcripcionales validaron a los T3E HopAF1, HopAF1-2, HopAO1 y HopAO2 como nuevos T3E del secretoma del T3SS de NCPPB 3335. Por otra parte, en este trabajo hemos demostrado que tanto los T3E AvrRpm2, HopBK1, HopBL1, HopBL2, HopAF1, HopAF1-2, HopAO1 y HopAO2, así como los efectores truncados HopAA1 y HopAZ1, interfieren con la respuesta de defensa primaria (PTI) de Nicotiana tabacum. Además, presentamos evidencias de que HopAZ1, HopBL1, HopAF1-2, HopAO1 y HopAO2 también inhiben la inmunidad mediada por efectores (ETI) en este mismo hospedador. Por otro lado, y utilizando fusiones traduccionales a la proteína verde fluorescente (GFP), hemos podido comprobar que los T3E HopAF1, HopAF1-2, HopAO1 y HopAO2 se localizan en la membrana plasmática de las células de Nicotiana benthamiana, así como que HopAO2 también se localiza en vesículas del aparato de Golgi. Con el fin de averiguar el papel de los T3E HopAF1 y HopAO1 en la virulencia de NCPPB 3335 se construyeron mutantes simples de los mismos. La deleción del gen hopAF1 del plásmido pPsv48A en NCPPB 3335 tuvo como consecuencia una ligera reducción en el tamaño de los tumores inducidos por este patógeno en plantas de olivo lignificadas, mientras que la deleción del gen hopAO1 conllevó una clara disminución de la virulencia del mismo. Los resultados incluidos en esta Tesis Doctoral, convierten a NCPPB 3335 en la cuarta cepa del complejo P. syringae cuyo secretoma del T3SS incluye un mayor número de T3E demostrados, y en la primera cepa aislada de un hospedador leñoso.

Programa Oficial de Doutoramento en Ciencias da Saúde. 5007V01, [Resumen] El patógenos oportunista Acinetobacter baumannii es uno de los seis microorganismos multirresistentes que más preocupa en hospitales de todo el mundo. Esto es debido a su capacidad para persistir en ambientes extremos, ya que es capaz de sobrevivir en el ambiente hospitalario, y a su versatilidad genética, ya que tiene la capacidad para desarrollar mecanismos de resistencia a antibióticos y desinfectantes. Múltiples brotes hospitalarios producidos por cepas de A. baumannii multirresistentes han sido descritos en todos los continentes. El presente trabajo aborda el estudio de uno de los brotes más importantes de la historia producido por varias cepas de A. baumannii multirresistentes, que surgió en el Hospital 12 de Octubre de Madrid, durante los años 2006‐2008 y que afectó a 377 pacientes. La presente tesis doctoral está dividida en cuatro capítulos: En el capítulo 1 se presenta el estudio la epidemiología clínica y molecular de un brote hospitalario causado por varias cepas de A. baumannii multirresistentes portadoras de la β‐ lactamasa OXA‐24. En el capítulo 2 se describe el estudio del posible mecanismo de diseminación de la β‐ lactamasa OXA‐24 entre las distintas cepas de un mismo brote hospitalario. Además, se describió por primera vez una cepa de A. calcoaceticus productora de la β‐lactamasa OXA‐24. En el capítulo 3 se describe el genoma completo del clon mayoritario del brote hospitalario, la cepa de A. baumannii AbH12O‐A2 (código de acceso a GenBank: CP009534.1) Finalmente, en el capítulo 4, se describe la implicación de un sistema de dos componentes, el sistema AbFhaB/AbFhaC, perteneciente al sistema de secreción tipo V, en adherencia a células epiteliales humanas y en virulencia., [Resumo] O patóxeno oportunista Acinetobacter baumannii é un dos seis microorganismos multirresistentes que máis preocupa nos hospitais de todo o mundo. Isto débese á súa capacidade para persistir en ambientes extremos, xa que ten a capacidade de sobrevivir no ambiente hospitalario, e á súa versatilidade xenética, xa que ten a capacidade para desenrolar mecanismos de resistencia a antibióticos e desinfectantes. Múltiples brotes hospitalarios producíronse por cepas de A. baumannii multirresistentes ao longo de tódolos continentes. A presente tese de doutoramento trata do estudo dun dos brotes máis longos da historia producido por varias cepas de A. baumannii multirresistentes, no Hospital 12 de Octubre de Madrid durante os anos 2006‐2008 e que afectou a 377 doentes. A presente tese doutoral divídese en catro capítulos: No capítulo 1, preséntase o estudo da epidemioloxía clínica e molecular dun brote hospitalario causado por varias cepas de A. baumannii multirresistentes portadoras da β‐ lactamasa OXA‐24. No capítulo 2, preséntase o estudo do posible mecanismo de diseminación da β‐ lactamasa OXA‐24 entre ás distintas cepas dun mesmo brote hospitalario. Ademáis, describiuse por primeira vez unha cepa de A. calcoaceticus productora desta β‐lactamasa OXA‐ 24. No capítulo 3, descríbese o xenoma completo do clon maioritario do brote hospitalario, a cepa de A. baumannii AbH12O‐A2 (código de acceso ao GenBank: CP009534.1) E, finalmente, no capítulo 4, descríbese a implicación dun sistema de dúas compoñentes, o sistema AbFhaB/AbFhaC, pertencente ao sistema de secreción tipo V, en adherencia a células epiteliais humanas e en virulencia., [Abstract] Acinetobacter baumannii is an opportunistic pathogen belonging to the six multirresistant organisms of greatest concern in hospitals worldwide. This fact is due to its ability to persist in adverse environments being able to survive in the hospital settings, and to its genetic versatility, being able to develop resistance mechanisms to antibiotics and disinfectants. Multiple hospital outbreaks caused by multidrug‐resistant strains of A. baumannii have been described in all continents. This work is focused in the study of the largest outbreak produced by various multidrug‐resistant A. baumannii strains, which has emerged in the Hospital 12 de Octubre, Madrid, Spain, affecting 377 patients during the years 2006‐2008. The present work is divided into four chapters: In chapter 1, we studied the clinical and molecular epidemiology of the above mentioned hospital outbreak caused by various multidrug‐resistant A. baumannii strains harboring the β‐lactamase OXA‐24. In chapter 2, we described the possible spread mechanism for the β‐lactamase OXA‐24 among different strains during the hospital outbreak. Furthermore, the first A. calcoaceticus strain producing the β‐lactamase OXA‐24 was described. In chapter 3, we described the complete genome of the A. baumannii AbH12O‐A2 strain (GenBank accession code: CP009534.1), the main clone found in during the hospital outbreak. Finally, in Chapter 4, we studied the involvement of a two component system, AbFhaB/AbFhaC, belonging to the type V secretion system, in adherence to human epithelial cells and virulence.