1. DIVERSIDAD GENÉTICA EN UNA POBLACION DE Rhinoclemmys nasuta (TESTUDINES:GEOEMYDIDAE) ASOCIADA AUN AMBIENTE INSULAR DEL CHOCÓ BIOGEOGRÁFICO
- Author
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Guillermo Barreto, Alan Giraldo, and Leslie Anais Castillo-Cutiva
- Subjects
education.field_of_study ,tortuga río Chocoana ,Chocó ,Neotrópico ,tortugas ,Population ,turtles ,conservation ,Chocó Biogeográfico ,conservación ,large-nosed wood turtle ,Biology ,Colombia ,biology.organism_classification ,Neotropical turtles ,Peripheral blood ,Molecular analysis ,Genetic structure ,Rhinoclemmys nasuta ,General Agricultural and Biological Sciences ,education ,Humanities - Abstract
Characterization of the genetic diversity of Rhinoclemmys nasuta population inhabits Isla Palma (Malaga Bay, Valle del Cauca)was carried out using three microsatellite systems (Cm72, Cm58 and Cm3). In this locality, individuals of R. nasuta are widely distributed in the inland streams and creeks system. 100 to 200 iL of peripheral blood was taken off from 10 turtles in five streams of theisland, preserving samples in in a 0.5 M EDTA. DNA was extracted using Salting-out and Chelex 100 solutiontechniques. PCR amplified products were visualized and measured in polyacrylamide gels (19:1) to 8 % silver nitrate. Successful amplification products were obtained for all systems analyzed, two of which (Cm72 and Cm3) were found to be monomorphic, while the system Cm58had a high PIC (0.698) allowing to estimate the genetic diversity of this population. The observed heterozygosity was low (Ho = 0.26 ) and inbreeding indices FIS and FIT were high (0.67857 and 0.67881 ), indicating an excess of homozygotes in each of the rivers and for the all population. The molecular analysis of variance suggested that there is no difference in genetic structure of the population (FST= 0.00075, p = 0.95112 ). Therefore, the results suggest that the genetic diversity of R. nasuta population in Isla Palma was low and exhibited a highly inbred index. DIVERSIDAD GENETICA EN UNA POBLACION DE Rhinoclemmys nasuta (TESTUDINES:GEOEMYDIDAE) ASOCIADA A UN AMBIENTE INSULAR DEL CHOCO BIOGEOGRAFICO Se realizo la caracterizacion de la diversidad genetica de la poblacion de Rhinoclemmys nasuta , que habita en la localidad insular de Isla Palma, Bahia Malaga (Valle del Cauca, Colombia), utilizando tres sistemas de microsatelites (Cm72, Cm58 y Cm3). En esta localidad, R. nasuta se encuentra ampliamente distribuida en los sistemas de riachuelos y quebradas presentes. Se tomaron entre 100 a 200 µL de sangre periferica de 10 tortugas en cinco riachuelos, preservando las muestras en una solucion 0,5 M de EDTA y el ADN fue extraido mediante las tecnicas de Salting-out y Chelex 100. Los productos amplificados por PCR fueron visualizados y medidos en geles de poliacrilamida (19:1) al 8% con nitrato de plata. Se obtuvieron productos amplificados exitosos para todos los sistemas analizados, dos de los cuales (Cm72 y Cm3) resultaron ser monomorficos, mientras que el sistema Cm58 presento un PIC alto (0,698) permitiendo estimar la diversidad genetica de esta poblacion. La heterocigosidad observada fue baja (H o = 0,26) y los indices de endogamia F IS y F IT fueron altos (0,67857 y 0,67881), indicando un exceso de homocigotos en cada uno de los rios y para la poblacion total. El Analisis Molecular de Varianza sugirio que no existe estructura genetica diferencialen esta poblacion (F ST = 0.00075; p = 0.95112). En conclusion los resultados sugieren que la diversidad genetica de la poblacion de R. nasuta en Isla Palma es baja, siendo una poblacion altamente endogamica.
- Published
- 2014