Search

Baze podataka važne su zbog objedinjenog prikaza informacija prema određenom ključu. Javno dostupne baze podataka imaju dodatnu vrijednost zbog olakšanog pristupa znanju i informacijama. U članku je opisana baza proteinskih struktura, Protein Data Bank – PDB, njezino osnivanje, skromni početak te vrlo važan status koji ima danas. Posebno je naglašen dio baze posvećen profesorima i učenicima odnosno studentima da bi lakše pristupali podatcima u bazi te ih primjenjivali u svojem radu ili obrazovanju., Databases are important because of the unified presentation of information according to a specific subject. Publicly available databases have additional value due to easier access to knowledge and information. The article describes the database of protein structures, Protein Data Bank – PDB, its establishment, humble beginnings, and the very important status it has today. Particular emphasis is placed on the part of the database dedicated to professors and students in order to access the data in the database more easily and use them in their work or education.

Истраживање има фокус на хуманим ензимима из суперфамилије алдо-кето редуктаза, које имају велики метаболички значај за хомеостатско функционисање организма. Неки од чланова подфамилије 1С алдо-кето редуктаза (AKR1C) имају улогу у развоју одређених патолошких стања, као што су леукемија, тумори простате, дојке и ендометријума, као и у смањивању ефекта хемотерапија. До сада није регистрован лек који директно утиче на протеине ове групе и самим тим је акценат на изналажењу специфичних лиганада (супстрата, инхибитора), који би могли да имају фармаколошку примену, али и на утврђивању везе између структуре и функције испитиваних лиганада према ензиму. Теза је имала фокус на протеину AKR1C3. У овој дисертацији је представљена оптимизација ензимског есеја и испитивање потенцијалних лиганада и њиховог ефекта на ензимску активност одређених хуманих изоформи протеина из подфамилије AKR1C. Тестирана су синтетисанa стероиднa jeдињења, комерцијална једињења и биљни екстракти. Стероидни лиганди (AKR-1, -2, -3, -7, -9, -19 и -22) који су показали добре инхибиторне карактеристике су детаљније описани одређеним добијеним кинетичким параметрима и затим су кокристализовани са протеином и кофакторм. Од 7 различитих комплекса протеина са најбољиминхибитором, за два комплекса су добијене дифракције са инхибитором и решене кристалне структуре са лигандом у везном месту и врло добром резолуцијом, AKR-7: 1.7 Å, AKR -19: 1.6 Å. Ови резултати представљају прве протеинске кристале чију су структуру решили истраживачи из Србије, а у научном смислу и одличну основу за даљи дизајн и тестирање једињења и кокристализације. Istraživanje ima fokus na humanim enzimima iz superfamilije aldo-keto reduktaza, koje imaju veliki metabolički značaj za homeostatsko funkcionisanje organizma. Neki od članova podfamilije 1S aldo-keto reduktaza (AKR1C) imaju ulogu u razvoju određenih patoloških stanja, kao što su leukemija, tumori prostate, dojke i endometrijuma, kao i u smanjivanju efekta hemoterapija. Do sada nije registrovan lek koji direktno utiče na proteine ove grupe i samim tim je akcenat na iznalaženju specifičnih liganada (supstrata, inhibitora), koji bi mogli da imaju farmakološku primenu, ali i na utvrđivanju veze između strukture i funkcije ispitivanih liganada prema enzimu. Teza je imala fokus na proteinu AKR1C3. U ovoj disertaciji je predstavljena optimizacija enzimskog eseja i ispitivanje potencijalnih liganada i njihovog efekta na enzimsku aktivnost određenih humanih izoformi proteina iz podfamilije AKR1C. Testirana su sintetisana steroidna jedinjenja, komercijalna jedinjenja i biljni ekstrakti. Steroidni ligandi (AKR-1, -2, -3, -7, -9, -19 i -22) koji su pokazali dobre inhibitorne karakteristike su detaljnije opisani određenim dobijenim kinetičkim parametrima i zatim su kokristalizovani sa proteinom i kofaktorm. Od 7 različitih kompleksa proteina sa najboljiminhibitorom, za dva kompleksa su dobijene difrakcije sa inhibitorom i rešene kristalne strukture sa ligandom u veznom mestu i vrlo dobrom rezolucijom, AKR-7: 1.7 Å, AKR -19: 1.6 Å. Ovi rezultati predstavljaju prve proteinske kristale čiju su strukturu rešili istraživači iz Srbije, a u naučnom smislu i odličnu osnovu za dalji dizajn i testiranje jedinjenja i kokristalizacije. This research focuses on human enzymes of the aldo-keto reductase superfamily, whose functions have a significant metabolic impact on organism homeostasis. Some members of the 1C aldo-keto reductase (AKR1C) subfamily play role in the development of specific pathological conditions, such as leukaemia, prostate cancer, breast cancer and endometrial cancer, as well as reducing the effectivness of chemotherapy. However, currently there are no approved and registered drugs that directly affect proteins from this subfamily. Therefore our main aim was to screen for specific ligands (substrates, inhibitors) with potential pharmacological applications, and to establish structure-activity relationships for these ligands and enzymes. This thesis mainly focuses on isoform AKR1C3. In this dissertation, optimization of an enzymatic assay and testing of potential ligands and their effects on the enzymatic activity of specific human isoforms of proteins from subfamily AKR1C are presented. Tested ligands include synthetic steroidal compounds, commercial compounds and plant extracts. Steroid compounds, AKR-1, -2, -3, -7, -9, -19 and -22, were found to be good inhibitors of AKR1C3, and further kinetic studies were conducted. Finally, cocrystalization of protein AKR1C3 with cofactor and these inhibitors was accomplished. From 7 different complexes of protein with inhibitors, two structures were solved to very high resolution, AKR-7: 1.7 Å, AKR -19: 1.6 Å. These results represent the first protein crystal structures solved by researchers from Serbia, and results provide an excellent basis for further design and testing of new inhibitors.

Corrosion protection using conventional coatings is the most used method. Application of polyaniline (PANI) as an inhibitor in conventional coating is based on its proven and well examined protective nature, with motivation for replacement of hazardous materials used as inhibitors. Experimental procedures for investigation of the influence of PANI in coatings are focused both on evaluation of physical properties of the coatings studied by FTIR, Raman and UV spectroscopy, thermogravimetric analysis, SEM and TEM microcopies, while the protective nature of the coating, applied at the first place on steel, is studied by accelerated corrosion testing using humidity and salt chamber, electrochemical impedance spectroscopy and polarization measurements upon immersion in corrosion media. Primena sistema klasičnih organskih prevlaka za zaštitu metala i legura od korozije je najrasprostranjeniji vid zašte. Primena inhibitora korozije na bazi polianilina (PANI) je zasnovana na njegovom eksperimentalno potvrđenom zaštitnom dejstvu. Osnovni motiv za primenu PANI je zamena ekološki neprihvatljivih materijala koji se korite kao inhibitori. Eksperimentalna istraživanja u ovoj oblsti bazirana su na proučavanju fizičkih svojstava prevlaka primenom spektoskopskih tehnika: FTIR, Ramanske spektroskopije i UV spektroskopije, termogravimetrijske analize, SEM i TEM mikroskopija, dok se ispitivanja zaštitnih svojstava prevlaka na baziraju na ubrzanim korozionim testovima primenom slane i vlažne komore, eksperimentima spektroskopije elektrohemijske impedancije i polarizacionim merenjima.

Acetilkolinesteraza (AChE; E.C. 3.1.1.7) i butirilkolinesteraza (BChE; E.C. 3.1.1.8) enzimi su koji se zbog svoje uloge u organizmu intenzivno istražuju unutar područja biomedicine i toksikologije. Iako strukturno homologni, ovi enzimi razlikuju se prema katalitičkoj aktivnosti, odnosno specifi čnosti prema supstratima koje mogu hidrolizirati te selektivnosti za vezanje mnogih liganada. U ovom radu dan je pregled dosadašnjih istraživanja kolinesteraza i njihovih interakcija s ligandima i inhibitorima te su izdvojene aminokiseline aktivnog mjesta koje sudjeluju u tim interakcijama., Enzymes acetylcholinesterase (AChE; E.C. 3.1.1.7) and butyrylcholinesterase (BChE; E.C. 3.1.1.8) have intensively been investigated in biomedicine and toxicology due to important role in organisms. Even if structurally homologous, they differ in catalytic activity, specificity, for substrates, and selectivity in binding to many ligands. This paper compiles the results of research on cholinesterases and their interactions with ligands and inhibitors, and identifies amino acids of active sites involved in these interactions.

In the course of the pasteurization treatment of milk and dairy products the temperature of the technological process is kept at a constant value. The regulation of the temperature is carried out by means of technological water that comes from certain pools cooled to the temperature of 5ºC. the water heated in the process of pasteurization is sent back through steel pipes to the pool where it is cooled to the working temperature. the pools for water cooling are fitted with a bundle of pipes made of plain carbon steel that corrode over the time. the protection of pipes against corrosion is possible to be performed in two ways: by use of inhibitors and by cathodic protection. The application of either method depends on a number of factors. It is cheaper to protect new pipes from corrosion using inhibitors, whereas pipes already attacked by corrosion are more efficiently protected against further corrosion by applying the cathodic protection. U toku postupka pasterizacije mleka i mlečnih proizvoda temperatura tehnološkog procesa održava se na konstantnoj temperaturi. Regulacija temperature se vrši pomoću tehnološke vode koja dolazi iz bazena rashlađena do temperature od 5°C. zagrejana voda iz procesa pasterizacije vraća se cevima u bazen gde se pomoću tečnog amonijaka hladi do radne temperature. U bazenima za hlađenje tehnološke vode nalazi se snop cevi od običnog čelika kroz koji prolazi tečni amonijak, a koje vremenom počinju da korodiraju. Zaštita cevi od korozije je moguća na dva načina: primenom određenih inhibitora korozije i primenom katodne zaštite. Koji će od ova dva načina da bude primenjen zavisi od više faktora. Za nove cevi je jeftinija zaštita od korozije primenom inhibitora. za cevi koje su već u upotrebi ili je kod njih počela korozija, primena katodne zaštite je efikasniji postupak dalje zaštite od korozije.