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Residual feed intake is viewed as an important trait in breeding programs that could be used to enhance genetic progress in feed efficiency. In particular, improving feed efficiency could improve both economic and environmental sustainability in the dairy cattle industry. However, data remain sparse, limiting the development of reliable genomic evaluations across lactation and parity for residual feed intake. Here, we estimated novel genetic parameters for genetic residual feed intake (gRFI) across the first, second, and third parity, using a random regression model. Research data on the measured feed intake, milk production, and body weight of 7,379 cows (271,080 records) from 6 countries in 2 continents were shared through the Horizon 2020 project Genomic Management Tools to Optimise Resilience and Efficiency, and the Resilient Dairy Genome Project. The countries included Canada (1,053 cows with 47,130 weekly records), Denmark (1,045 cows with 72,760 weekly records), France (329 cows with 16,888 weekly records), Germany (938 cows with 32,614 weekly records), the Netherlands (2,051 cows with 57,830 weekly records), and United States (1,963 cows with 43,858 weekly records). Each trait had variance components estimated from first to third parity, using a random regression model across countries. Genetic residual feed intake was found to be heritable in all 3 parities, with first parity being predominant (range: 22–34%). Genetic residual feed intake was highly correlated across parities for mid- to late lactation; however, genetic correlation across parities was lower during early lactation, especially when comparing first and third parity. We estimated a genetic correlation of 0.77 ± 0.37 between North America and Europe for dry matter intake at first parity. Published literature on genetic correlations between high input countries/continents for dry matter intake support a high genetic correlation for dry matter intake. In conclusion, our results demonstrate the fea

Gene duplications are common in the vertebrate genome, and duplicated loci often show a variation in copy number that may have important phenotypic effects. Here we describe a powerful method for quantification of duplicated copies based on pyrosequencing. A reliable quantification was obtained by amplification of the duplication break-point and a corresponding nonduplicated sequence in a competitive PCR assay. A comparison with an independent method for quantification based on the Invader technology revealed an excellent correlation between the two methods. The pyrosequencing-based method was evaluated by analyzing variation in copy number at the duplicated KIT/Dominant white locus in pigs. We were able to distinguish haplotypes at this locus by combining the duplication breakpoint test with a diagnostic test for a functionally important splice mutation in the duplicated gene. An extensive allelic variation, including the presence of a new allele carrying a single KIT copy expected to encode a truncated KIT receptor, was revealed when analyzing white pigs from commercial lines.

Para ser efectivos, las estrategias para la conservación y mejora de las razas porcinas locales deben incluir idealmente tanto su caracterización genética como fenotípica. En este estudio, la información fenotípica fue recogida de individuos pertenecientes a las razas portuguesas Alentejana y Bísaro. Las muestras de ADN de estos animales fueron entonces analizadas para la variación de 6 loci Tipo I para profundizar en el origen y la integridad de estas razas. La variación detectada en estos loci fue muy baja en el Alentejano y de baja a intermedia en el Bísaro. La asociación de cada marcador con una serie de caracteres productivos fueron analizadas en el Bísaro. Los resultados sugieren que algunos de estos genes pueden estar asociados con variaciones significativas de esos caracteres. La información derivada de la caracterización de las razas porcinas locales a nivel molecular deben apoyar los esfuerzos en conservación y deben también ser utilizadas en el futuro en programas de selección asistida por marcadores.

Describimos la caracterización de dos loci determinantes del color de la capa en cerdos y demostramos cómo esta información puede ser utilizada para la identificación racial. Estos avances pueden ser útiles en esquemas para asegurar la calidad y la trazabilidad cuya demanda se está incrementando en los consumidores.

Los AFLPs han sido utilizados con éxito como herramienta para generar un gran número (más de cien) de marcadores de ADN en 2435 individuos del proyecto Europeo sobre Biodiversidad Porcina. Esta información fue utilizada para realizar un análisis inicial de distancias genéticas que permitió agrupar líneas y razas según sugería la información descriptiva.

El proyecto PigBioDiv2 evaluará y comparará la diversidad genética entre las razas de China y de Europa. Al menos 50 razas chinas serán muestreadas y comparadas con 59 razas europeas previamente estudiadas en el proyecto PigBioDiv1. La base de datos sobre la biodiversidad porcina europea se extenderá hasta al menos 100 razas, un tercio del total de las razas porcinas europeas. Serán determinadas las relaciones entre razas por medio de la estimación de las distancias genéticas basadas en marcadores microsatélites y relaciones haplotípicas desde los polimorfismos del ADN mitocondrial y del cromosoma Y. El proyecto también determinará las relaciones entre medidas generales de la diversidad genética, tales como la distancia genética, y diferencias funcionales entre razas por la caracterización de TGL (marcadores tipo I) y regiones QTL. Las medidas de la diversidad derivadas desde marcadores anónimos (microsatélites) serán comparadas con las medidas derivadas desde los genes de caracteres. También serán desarrollados nuevos avances utilizando datos de marcadores (genéticos) del ADN para identificar genes relacionados con diferencias funcionales entre razas.

Para ser efectivos, las estrategias para la conservación y mejora de las razas porcinas locales deben incluir idealmente tanto su caracterización genética como fenotípica. En este estudio, la información fenotípica fue recogida de individuos pertenecientes a las razas portuguesas Alentejana y Bísaro. Las muestras de ADN de estos animales fueron entonces analizadas para la variación de 6 loci Tipo I para profundizar en el origen y la integridad de estas razas. La variación detectada en estos loci fue muy baja en el Alentejano y de baja a intermedia en el Bísaro. La asociación de cada marcador con una serie de caracteres productivos fueron analizadas en el Bísaro. Los resultados sugieren que algunos de estos genes pueden estar asociados con variaciones significativas de esos caracteres. La información derivada de la caracterización de las razas porcinas locales a nivel molecular deben apoyar los esfuerzos en conservación y deben también ser utilizadas en el futuro en programas de selección asistida por marcadores.

Describimos la caracterización de dos loci determinantes del color de la capa en cerdos y demostramos cómo esta información puede ser utilizada para la identificación racial. Estos avances pueden ser útiles en esquemas para asegurar la calidad y la trazabilidad cuya demanda se está incrementando en los consumidores.

Los AFLPs han sido utilizados con éxito como herramienta para generar un gran número (más de cien) de marcadores de ADN en 2435 individuos del proyecto Europeo sobre Biodiversidad Porcina. Esta información fue utilizada para realizar un análisis inicial de distancias genéticas que permitió agrupar líneas y razas según sugería la información descriptiva.

El proyecto PigBioDiv2 evaluará y comparará la diversidad genética entre las razas de China y de Europa. Al menos 50 razas chinas serán muestreadas y comparadas con 59 razas europeas previamente estudiadas en el proyecto PigBioDiv1. La base de datos sobre la biodiversidad porcina europea se extenderá hasta al menos 100 razas, un tercio del total de las razas porcinas europeas. Serán determinadas las relaciones entre razas por medio de la estimación de las distancias genéticas basadas en marcadores microsatélites y relaciones haplotípicas desde los polimorfismos del ADN mitocondrial y del cromosoma Y. El proyecto también determinará las relaciones entre medidas generales de la diversidad genética, tales como la distancia genética, y diferencias funcionales entre razas por la caracterización de TGL (marcadores tipo I) y regiones QTL. Las medidas de la diversidad derivadas desde marcadores anónimos (microsatélites) serán comparadas con las medidas derivadas desde los genes de caracteres. También serán desarrollados nuevos avances utilizando datos de marcadores (genéticos) del ADN para identificar genes relacionados con diferencias funcionales entre razas.