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40 results on '"Azam, Didier"'

4. Optimizing the design of a reproduction toxicity test with the pond snail Lymnaea stagnalis

Author

Charles, Sandrine, Ducrot, Virginie, Azam, Didier, Benstead, Rachel, Brettschneider, Denise, De Schamphelaere, Karel, Filipe Goncalves, Sandra, Green, John W., Holbech, Henrik, Hutchinson, Thomas H., Faber, Daniel, Laranjeiro, Filipe, Matthiessen, Peter, Norrgren, Leif, Oehlmann, Jörg, Reategui-Zirena, Evelyn, Seeland-Fremer, Anne, Teigeler, Matthias, Thome, Jean-Pierre, Tobor Kaplon, Marysia, Weltje, Lennart, and Lagadic, Laurent

Published
2016
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5. Inventaire de biodiversité des poissons et crustacés d’eau douce par pêche à l’électricité en petits cours d’eau tropicaux : réglages, efficacité et recommandations

Author

Roussel, Jean-marc, Pottier, Gaétan, Azam, Didier, Vigouroux, Régis, Marchand, Frédéric, Bargier, Nicolas, Nevoux, Marie, Raitif, Julien, Penil, Caroline, Cosson, Eddy, Beaulaton, Laurent, Roussel, Jean-marc, Pottier, Gaétan, Azam, Didier, Vigouroux, Régis, Marchand, Frédéric, Bargier, Nicolas, Nevoux, Marie, Raitif, Julien, Penil, Caroline, Cosson, Eddy, and Beaulaton, Laurent

Abstract

La pêche à l’électricité est une méthode classiquement utilisée pour les inventaires de biodiversité des poissons et crustacés dans le cadre de la surveillance réglementaire de l’état écologique des cours d’eau. Elle pose un certain nombre de difficultés en territoires ultramarins tropicaux, de par certaines spécificités physiques (conductivité de l’eau basse à très basse) et écologiques (communautés mixtes de poissons et de crustacés, biodiversité forte à très forte) qui les caractérisent. Issues du partenariat OFB-INRAE, les recherches menées en collaboration avec l’entreprise HYDRECO-Guyane ont permis de définir des conditions spécifiques d’application de la pêche à l’électricité pour les petits cours d’eau (< 6 mètres de large) tropicaux. Grâce à des essais au laboratoire et in situ, en Guyane, aux Antilles et à La Réunion, nous avons identifié les réglages électriques les plus efficaces pour la capture, l’estimation de la richesse spécifique et de l’abondance des espèces et le respect de la santé animale. Ces recherches se placent dans l’objectif plus large d’améliorer la qualité des données bancarisées pour le suivi environnemental des masses d’eau. Elles donnent lieu à des recommandations pour la maitrise d’œuvre et la maitrise d’ouvrage de la pêche à l’électricité en petits cours d’eau tropicaux.

Published
2023
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6. Compositions comprising a botanical extract as insecticidal agent

Author

Clervil, Emmanuelle, Houël, Emeline, Amusant, Nadine, Dusfour, Isabelle, Duchemin, Jean-Bernard, Azam, Didier, Coke, Maïra, Clervil, Emmanuelle, Houël, Emeline, Amusant, Nadine, Dusfour, Isabelle, Duchemin, Jean-Bernard, Azam, Didier, and Coke, Maïra

Abstract

The present invention relates to a composition comprising an oil phase comprising notably a botanical extract and an oil in water emulsion comprising said composition. It further relates to the use of such composition and emulsion as an insecticidal agent, in particular a larvicidal agent.

Published
2023

7. Inventaire de biodiversité des poissons et crustacés d’eau douce par pêche à l’électricité en petits cours d’eau tropicaux : réglages, efficacité et recommandations

Author

ROUSSEL, Jean-Marc, primary, POTTIER, Gaétan, additional, AZAM, Didier, additional, VIGOUROUX, Régis, additional, MARCHAND, Frédéric, additional, BARGIER, Nicolas, additional, NEVOUX, Marie, additional, RAITIF, Julien, additional, PENIL, Caroline, additional, COSSON, Eddy, additional, and BEAULATON, Laurent, additional

Published
2023
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8. Contrasting trends between species and catchments in diadromous fish counts over the last 30 years in France

Author

Legrand Marion, Briand Cédric, Buisson Laëtitia, Artur Gwenaël, Azam Didier, Baisez Aurore, Barracou David, Bourré Nicolas, Carry Laurent, Caudal Anne-Laure, Charrier Fabien, Corre Jérémie, Croguennec Eric, Der Mikaélian Sophie, Josset Quentin, Le Gurun Laëtitia, Schaeffer Frédéric, and Laffaille Pascal

Subjects
diadromous fish, anadromous migration, monitoring, long-term study, Aquaculture. Fisheries. Angling, SH1-691
Abstract

The decline and collapse of populations have been reported for a large range of taxa. Diadromous fishes migrate between fresh water and the sea and encounter many anthropogenic pressures during their complex life cycle. In spite of being of ecological, cultural and economic interest, diadromous fishes have been in decline for decades in many parts across the world. In this study, we investigated the change in five diadromous fish counts in France over a 30-year period using 43 monitoring stations located in 29 rivers across 18 catchments. Our hypothesis was that the counts of these species evolved in a contrasting way between catchments. We also tested the effect of five drivers potentially contributing to the observed trends: catchment, latitude, presence of commercial fisheries, improvement of ecological continuity and salmon stocking. We found contrasting trends in fish counts between species at the national scale, with some taxa increasing (Anguilla anguilla and Salmo trutta), some showing a slight increase (Salmo salar) and some decreasing (Alosa spp. and Petromyzon marinus). For each taxon, except Anguilla anguilla, we highlighted a significant catchment effect indicating contrasting trends between catchments and stations. However, we found no significant effect of catchment characteristics for any of the studied taxa.

Published
2020
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9. La pêche scientifique à l'électricité dans les milieux aquatiques continentaux

Author

Pottier, Gaëtan, Azam, Didier, Beaulaton, Laurent, Vigneron, Thibault, Rives, Jacques, Marchand, Frédéric, Pénil, Caroline, and Beaulaton, Laurent

Subjects
[SDE.BE] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Indices d’abondance, Protocoles, Pêche à l’électricité, Champ électrique, Réglages, Poissons, Gradient de tension, Fréquence
Abstract

La pêche scientifique à l’électricité est une méthode largement utilisée pour les échantillonnages piscicoles en cours d’eau (suivis annuels des populations et des communautés de poissons, approche de types « indices poissons rivière [IPR] » ou indicateurs mono spécifiques saumon, anguille, truite). Cependant l’évolution des matériels, de leurs caractéristiques et des réglages possibles ainsi que la formation des personnels utilisant cette technique nécessitent que soient décrits les principaux facteurs influençant la qualité de ces échantillonnages. Ce nouveau guide vise à fournir les éléments de compréhension des phénomènes électriques et de la réaction des poissons soumis à un champ électrique. Il synthétise également un ensemble de conseils pour la mise en œuvre de la pêche à l’électricité : configuration des engins de pêche, moyens de prospection, bien-être animal et sécurité/réglementation. Cet ouvrage est destiné à toutes les personnes souhaitant connaître le fonctionnement de la pêche scientifique à l’électricité ou mettre en œuvre cette méthode de manière adéquate.

Published
2022

11. Rapport final des travaux liés à la convention 1078068

Author

Druet, Morgan, Rault, Pablo, Acou, Antony, Azam, Didier, Bardonnet, Agnes, Lasne, Emilien, Evanno, Guillaume, Feunteun, Eric, LAUNEY, Sophie, Lizé, Anne, Martignac, François, Nevoux, Marie, Prod’homme, Jordane, Emma, Robin, TEICHERT, Nils, Petit, Eric, Marchand, Frédéric, Unité Expérimentale d'Ecologie et d'Ecotoxicologie Aquatique - U3E (Rennes, France) (U3E ), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Patrimoine naturel (PatriNat), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Office français de la biodiversité (OFB), pôle OFB-INRAE- Agrocampus Ouest-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement, AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Office français de la biodiversité (OFB), Ecologie Comportementale et Biologie des Populations de Poissons (ECOBIOP), Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Écologie et santé des écosystèmes (ESE), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Biologie des Organismes et Ecosystèmes Aquatiques (BOREA), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA), Agence de l'Eau Seine-Normandie (AESN), dans le cadre du Programme Sélune, Agence de l'Eau Seine-Normandie, Pôle OFB-INRAE- Agrocampus Ouest-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement, AGROCAMPUS OUEST-Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Office français de la biodiversité (OFB), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-INSTITUT AGRO Agrocampus Ouest, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), and Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)

Subjects
Sélune, [SDV.EE]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment
Published
2021

12. Dispersion et (re)colonisation du cours de la Sélune et de ses affluents : terminer un état de référence pour les poissons migrateurs amphihalins et anticiper l’expansion spatiale de l’écrevisse de Californie

Author

Druet, Morgan, Rault, Pablo, Acou, Antony, Azam, Didier, Bardonnet, Agnes, Lasne, Emilien, Evanno, Guillaume, Feunteun, Eric, Launey, Sophie, Lizé, Anne, Martignac, François, Nevoux, Marie, Prod’homme, Jordane, Emma, Robin, Teichert, Nils, Petit, Eric, Marchand, Frédéric, and NICOL, Clotilde

Subjects
Sélune, [SDV.EE] Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment
Published
2021

14. From wood protection to health protection: larvicidal potential of formulations containing Sextonia rubra wood residues extract against Aedes aegypti mosquitoes

Author

Clervil, Emmanuelle, Amusant, Nadine, Wozniak, Edmond, Dusfour, I., Duchemin, Jean-Bernard, Azam, Didier, Coke, Maïra, Houël, Emeline, Institut Pasteur de la Guyane, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Ecologie des forêts de Guyane (UMR ECOFOG), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-AgroParisTech-Université de Guyane (UG)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Entomologie médicale, Laboratoire de Parasitologie [Cayenne, Guyane française], Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Institut Pasteur de la Guyane, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Institut Pasteur de Madagascar, Unité d'Ecologie et Ecotoxicologie Aquatiques (UEEA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), The International Research Group on Wood Protection (IRG-WP), and European Project: FEDER/2017/N°65,SextoniAedes

Subjects
Bio-refinery, Natural durability, [SDE]Environmental Sciences, Heartwood extractives, Human health, [CHIM]Chemical Sciences, Valorization, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Wood protection, [SDV.BID]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity, Botanical insecticides
Abstract

International audience; French Guiana is a French overseas territory almost entirely covered by Amazonian rainforest and characterized by its incredible biodiversity. Several woody species harboured by this tropical forest are exploited sustainably for timber industry. They are commercialized notably for carpentry and outdoor applications because of their remarkable natural durability. Among them, stand Dicorynia guianensis Amshoff (Angélique), Qualea rosea Aubl. (Gonfolo rose), Ruizterania albiflora (Warm.) Marc.-Berti (Gonfolo gris) and Sextonia rubra Mez. Van der Werff (Grignon franc), representing around 80% of the global exploitation volume.This industry however generates large volumes of wastes, in particular because more than 50% of the ligneous material are lost between cutting down and sawing. Moreover, the strong demographic growth (around 2.5% per year) in French Guiana will lead to a notable increase of the need for timber, in construction as well as for energy, and the amount of induced wood wastes will increase concurrently. Sawdust residues are used currently only for biomass energy factories, but owing to the presence of molecules displaying interesting biological properties, wood residues and sawdust definitively deserve more attention. In recent years, a rising interest in value-added forest products, and in particular wood extractives, has indeed been observed, with the aim of reducing the lost generated by the forest industry due to undervalorized biomass components (Royer et al., 2013a; Khan et al., 2014; Borges et al., 2019). It is therefore relevant to integrate a new step in forest resources valorisation, putting the bio-refinery concept into practice (Royer et al., 2013b). In fact, regarding their longevity, trees have developed a wide range of chemical defense mechanisms in several organs (leaves, roots, bark, stem) in response to biotic and abiotic stress. The study of these particular traits alongside with morphological and physiological traits and life history parameters is crucial to understand the mechanisms that support numerous ecological processes (Chave et al., 2009). Wood notably provides the tree mechanical strength as well as storage and conduction capacity, alongside with resistance to decay and pathogens or insects attacks. Compounds produced during heartwood formation, a complex process characterized by the programmed death of parenchyma cells in the transition zone and accompanied by high enzymatic activities generating many specialized metabolites from carbohydrate sources stored in the sapwood, are indeed widely acknowledged as one of the most important passive defense mechanisms of the tree. As they are therefore fundamental for species ecological success, but also present the greatest interest for manhood, wood specialized metabolites extensive study should be clearly promoted. They could in particular inspire the search for novel botanical insecticides (Miresmailli and Isman, 2014). As French Guiana faces severe issues linked to insects, notably the strong incidence of vector-borne infectious diseases such as dengue, zika virus or chikungunya, and as vector control remains an important, if not the sole tool to fight diseases spread, we decided to intensify our research on wood extractives and their ability to control the mosquito Aedes aegypti. In previous studies, we identified Sextonia rubra (Mez) Van der Werff (Lauraceae) as a species of particular interest (Falkowski et al. 2016; 2020). This tropical tree is a rather frequent species in the Guyanas, Venezuela and Amazonian Brazil from the Atlantic coast to Manaus and the featured long lasting heartwood drives the wide exploitation of this species in French Guiana forest industry. S. rubra heartwood is indeed known to possess strongly defensive compounds, the two γ-lactones rubrenolide and rubrynolide, exhibiting activities against lignivorous fungi and termites and representing around 50% of heartwood extractives (Rodrigues et al., 2011; Houël et al., 2017). Interestingly, S. rubra wood extract and molecules were also strongly insecticidal when tested against mosquito larvae of the vector Ae. aegypti. Considering this strong bioactivity, some members of our group (WO2016046489A1) filed a patent and a new research project entitled “SextoniAedes” and funded by the European Regional Development (ERDF) is currently ongoing to build upon this discovery.In this project, we aim at gaining inspiration from wood protection on a wide meaning to develop innovative solutions to protect human health. On the one side, we will investigate S. rubra wood extractives, naturally protecting the tree tissue against insects and pathogens attacks, to develop novel botanical insecticides to fight against the mosquito Ae. aegypti, responsible for the spread of numerous pathogens. On the other side, we will propose aqueous-based formulations of S. rubra extract, influenced by the wood protection industry and more particularly the advances observed in green chemistry. We will test these formulations in semi-operational conditions to evaluate their larvicidal activity and remanence under tropical conditions. Moreover, we will concurrently evaluate eco- and cytotoxity of the extract and formulation in accordance to current regulations. Indeed heartwood metabolites, acting as defensive compounds, can be highly toxic molecules. Therefore, its safety for potential users and selectivity against non-targeted organisms has to be carefully tested.In this context, the “SextoniAedes” project aims to study S. rubra defensive heartwood molecules to inspire economically valuable and environmentally friendly solutions for vector control, and set up the valorization of forest extractives from durable wood species in a circular economy approach. This valorization would constitute a link between the wood industry and the biomass energy sector, with the aim of reducing the environmental impact of wastage products from forest industry. At the same time, this project wants to promote opportunities related to green technology or green innovation. Through concepts such as bio-inspiration or bio-refinery, durable trees give us the potential to inspire scientific innovation and stimulate economic sectors, in a sustainable development context, supporting the ambition to strive for a development model that is fair, and respectful of people and natural resources.

Published
2020

15. Diadromous fish modified timing of upstream migration over the last 30 years in France

Author

Legrand, Marion, primary, Briand, Cédric, additional, Buisson, Laëtitia, additional, Besse, Timothée, additional, Artur, Gwenaël, additional, Azam, Didier, additional, Baisez, Aurore, additional, Barracou, David, additional, Bourré, Nicolas, additional, Carry, Laurent, additional, Caudal, Anne‐Laure, additional, Corre, Jérémie, additional, Croguennec, Eric, additional, Der Mikaélian, Sophie, additional, Josset, Quentin, additional, Le Gurun, Laëtitia, additional, Schaeffer, Frédéric, additional, Toussaint, Romuald, additional, and Laffaille, Pascal, additional

Published
2020
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16. ORE sur les poissons diadromes dans les fleuves côtiers (ORE DiaPFC). Bresle - Oir - Scorff - Nivelle. Trois décennies d’observations et de recherche sur les poissons migrateurs

Author

Azam, Didier, Basilico, Laurent, Beaulaton, Laurent, Marchand, Frédéric, Prévost, Etienne, Unité Expérimentale d'Ecologie et d'Ecotoxicologie Aquatique - U3E (Rennes, France) (U3E ), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), pôle OFB-INRAE- Agrocampus Ouest-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement, AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Office français de la biodiversité (OFB), Chercheur indépendant, Office français de la biodiversité (OFB), Ecologie Comportementale et Biologie des Populations de Poissons (ECOBIOP), and Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)

Subjects
[SDV.EE]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment, Nivelle, Observatoire, Migrateur, Saumon, Oir, Bresle, Truite de mer, Anguille, ORE DiaPFC, [SDV.EE.ECO]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Ecosystems, Amphihalin, Alose, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Scorff, Lamproie
Abstract

International audience; Depuis les années 1970 sur les berges de la Bresle, de l'Oir, du Scorff et de la Nivelle, chercheurs et techniciens poursuivent une action scientifique sans équivalent en Europe au service de la connaissance, de la conservation et de la gestion des poissons migrateurs : le Saumon atlantique, la Truite de mer, l’Anguille européenne, les aloses et les lamproies. Fédérée sous l’enseigne de l’ORE DiaPFC (Observatoire de recherche en environnement sur les poissonsdiadromes dans les fleuves côtiers), cette aventure au long cours s’appuie sur une collecte de données systématique : année après année, les stations de contrôle implantées sur l’aval des cours d’eau permettent d’évaluer les effectifs de migrateurs qu’ils accueillent et d’étudier leurs rythmes de migration, en lien avec différentes variables environnementales ; des opérations de pêche électrique régulières renseignent sur la distribution des poissons dans ces rivières ; la constitution de banques d’échantillons biologiques, prélevés sur certains individus, ouvre des possibilités d’analyse complémentaire sur leur régimes alimentaires, leur histoire de vie, leur origine, etc.Cette collecte ininterrompue de données constitue la matière première de dizaines de projets de recherche partenariaux, apportant des éléments de compréhension inédits sur ces espèces, des subtilités de leur reproduction à leurs réponses aux pressions anthropiques. Elle a occasionné de nombreux développements méthodologiques et livre des éléments utiles à la bonne gestion des populations de migrateurs et des cours d’eau en général, bien au-delà des limites des quatre bassins qui constituent l’Observatoire. Cet ouvrage collectif, nourri d’échanges et d’entretiens avec plus de 50 chercheurs, techniciens et gestionnaires impliqués dans l’ORE DiaPFC, donne à voir les fruits de ces travaux. Destiné à un large public, il comporte cinq grandes parties qui proposent successivement : -une présentation générale de l’ORE DiaPFC, de son histoire, de ses installations et des espèces qui y sont étudiées ;-un inventaire de la « boîte à outils » de l’ORE DiaPFC, méthodes d’observation dont certaines ont été développéesou perfectionnées sur place ;-un ensemble de connaissances nouvelles en écologie aquatique issues des travaux menés à l’ORE DiaPF(du rôle des « mâles précoces » dans la reproduction du saumon à la spéciation des lamproies, du sexe des anguilles aux « bulls » d’aloses) ;-des exemples d’utilisation des travaux de l’ORE DiaPFC par les gestionnaires des milieux aquatiques ;-des éléments de conclusion et de perspectives.

Published
2020

17. Évaluation des populations et des captures de poissons migrateurs. Rapport d’étape CNICS 2019. Rapport d’étape CNICS 2019. OFB, INRAE, Agrocampus Ouest, UPPA

Author

Koubaa, Adly, André, Guirec, Azam, Didier, Unité Expérimentale d'Ecologie et d'Ecotoxicologie Aquatique - U3E (Rennes, France) (U3E ), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), pôle OFB-INRAE- Agrocampus Ouest-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement, AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Office français de la biodiversité (OFB), and INRAE

Subjects
[SDE]Environmental Sciences
Published
2019

18. ACOR -Apport de Connaissances aux Opérations de Repeuplement en anguille. Expérimentation in situ et ex situ

Author

Delage, Nicolas, Azam, Didier, Beaulaton, Laurent, Unité Expérimentale d'Ecologie et d'Ecotoxicologie Aquatique - U3E (Rennes, France) (U3E ), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), pôle OFB-INRAE- Agrocampus Ouest-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement, AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Office français de la biodiversité (OFB), Agence Française pour la Biodiversité (AFB), AFB, and Inra

Subjects
[SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology
Abstract

L’anguille européenne (Anguilla anguilla) est un poisson migrateur catadrome. Il colonise les rivières européennes au stade civelle avant sa métamorphose en anguille jaune. Depuis le début des années 1980, un déclin important de l’abondance de l’espèce a été observé dans l’ensemble de son aire de répartition, en particulier une chute du recrutement en civelle. Le repeuplement est envisagé comme solution dans un certain nombre de pays afin de pallier à cette disparition. Cette méthode implique que les civelles soient capturées par des pêcheurs professionnels, stockées chez des mareyeurs pour une durée variable, déplacées et subissent, dans certains cas, un marquage de masse (à l’alizarine en France). Chacune de ces étapes représentent un stress potentiel pour les civelles pouvant altérer leurs performances en termes de croissance et de survie.Le programme ACOR (apport de connaissances aux opérations de repeuplement en anguille) a, entre autre, étudié l’impact du repeuplement sur la survie et la croissance des civelles jusqu’au stade anguillette, soit pendant environ trois mois, dans l’Oir, affluent de la Sélune. Pour ce faire des civelles naturelles, c’est-à-dire ayant subi le moins de manipulation possible, et des civelles repeuplées, ayant subi l’ensemble des étapes relative aux opérations de repeuplement, ont été suivies. En 2017 et 2018, un échantillon de 8 085 individus d’origine naturelle a été capturé au tamis sur la Sélune (méthode douce) et marqué au VIE (visible implant elastomer) ; à cela s’ajoute 320 civelles capturées en 2017 directement dans l’Oir lors des suivis. Un échantillon de 15 870 civelles a été acheté à un mareyeur et marqué à l’alizarine. Parmi ces dernières, 12 235 individus ont été marqués au VIE. Au total, 24 275 civelles ont été relâchées et suivies dans l’Oir, affluent de la Sélune. Trois mois après les lâchers, deux séries de pêches électriques ont été effectuées et ont permis de capturées 865 anguillettes, dont 192 marquées au VIE. Le suivi s’est également effectué à l’aide de dispositifs de captures passifs (les flottangs), disposés sur dix secteurs en amont et en aval de la zone de lâcher. Ceux-ci ont été relevés une à deux fois par semaine pendant six mois en 2017 et en 2018 afin d’observer la dispersion et la colonisation des civelles. Les flottangs ont permis de capturer au total 1 970 civelles et anguillettes, dont 283 marquées VIE. En parallèle, des expérimentations en milieu contrôlé ont été effectuées pendant 43 jours sur 240 civelles issues du repeuplement et 2 lots (58 et 160) de civelles pêchées dans la Sélune pour mesurer leur survie dans ces conditionsL’analyse des différentes expérimentations montre que, malgré la variabilité des lots, la survie des civelles de repeuplement est significativement réduite, d’environ 50 %, par rapport aux civelles directement issues du milieu naturel. Les civelles des différentes origines ne montrent en revanche aucune différence en terme de dispersion. Enfin la croissance a été trop faible pour mettre en évidence de quelconques différences.Ce rapport donne également les résultats de la mise au point d’un marquage interne avec la calcéine sans choc osmotique. Une concentration de 5 000 mg/L pendant 3 heures permet d’avoir un bon marquage sans impacter la survie. Le coût plus élevé de ce marquage le limite néanmoins à des expérimentations particulières.

Published
2019

20. ACOR -Apport De Connaissances Aux Opérations De Repeuplement En Anguille. Synthèse Bibliographique

Author

Beaulaton, Laurent, Azam, Didier, Agence Française pour la Biodiversité (AFB), pôle OFB-INRAE- Agrocampus Ouest-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement, AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Office français de la biodiversité (OFB), Unité Expérimentale d'Ecologie et d'Ecotoxicologie Aquatique - U3E (Rennes, France) (U3E ), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), AFB, INRA, and Beaulaton, Laurent

Subjects
[SDE.BE] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology
Abstract

Depuis les années 1980, un fort déclin des populations d’anguilles européennes a été observé (Anonyme, 2018a). Ce déclin concerne non seulement le recrutement (civelles et anguillettes), mais aussi les stades anguilles jaunes et argentées. Le règlement UE 1100/2007 (Anonyme, 2007), dit "règlement anguille", oblige chaque État Membre à constituer un plan de gestion de l'anguille européenne en vue de la restauration des stocks de cette espèce.Le repeuplement est une mesure de gestion qui trouve ses origines en France en 1840. Elle est désormais très utilisée par les États Membres européens dans le cadre de leur plan de gestion anguille. Cette mesure nécessite actuellement la capture et le transport d’environ 15 t de civelles par an. Elle mobilise des financements publics européens et nationaux, mais aussi des financements privés.La mise en œuvre de cette mesure varie de manière importante d’un pays à l’autre. Certains pays ont un fonctionnement très centralisé et reposant majoritairement sur des organismes publiques, alors que d’autres ont une fonctionnement très décentralisé, reposant sur des acteurs privés (pêcheurs en général). Le repeuplement peut se faire à tous les stades : civelles, anguille jaunes (civelle après quarantaine, anguilles pré-grossies en aquaculture, anguilles naturelles) ou anguilles argentées.Le choix des sites de déversement se fait en général de manière à maximiser la production d’anguilles et à assurer l’échappement des anguilles argentées. Les critères précis varient néanmoins d’un pays à l’autre, voire à l’intérieur de certains pays. Les densités au déversement varie de 40 g/ha à 3,6 kg/ha.Le suivi des opérations de repeuplement s’effectue en général par marquage-recapture. Le marquage s’effectue avec de l’alizarine, du strontium ou du baryum. La recapture mobilise soit des moyens scientifiques type pêche électrique soit les pêcheries professionnelles.Peu de pays évalue l’efficacité de cette mesure et la plupart de ceux qui le font se contentent d’un calcul théorique prenant en compte la mortalité naturelle supposée et la croissance. La contribution à l’échappement est estimée entre 20g et 150g par anguilles repeuplées.Compte tenu de l’enjeu de gestion et financier, de nombreuses publications scientifiques sont disponibles sur les différents aspects du repeuplement : protocole de marquage, comparaison de différentes stratégies de repeuplement, suivi de l’efficacité, conséquences sanitaires, comportement des anguilles argentées issues du repeuplement.

Published
2019

22. Brucella microti‐ like prevalence in French farms producing frogs

Author

Jaÿ, Maryne, primary, Freddi, Luca, additional, Mick, Virginie, additional, Durand, Benoit, additional, Girault, Guillaume, additional, Perrot, Ludivine, additional, Taunay, Benoit, additional, Vuilmet, Thomas, additional, Azam, Didier, additional, Ponsart, Claire, additional, and Zanella, Gina, additional

Published
2019
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24. Diadromous fish modified timing of upstream migration over the last 30 years in France.

Author

Legrand, Marion, Briand, Cédric, Buisson, Laëtitia, Besse, Timothée, Artur, Gwenaël, Azam, Didier, Baisez, Aurore, Barracou, David, Bourré, Nicolas, Carry, Laurent, Caudal, Anne‐Laure, Corre, Jérémie, Croguennec, Eric, Der Mikaélian, Sophie, Josset, Quentin, Le Gurun, Laëtitia, Schaeffer, Frédéric, Toussaint, Romuald, and Laffaille, Pascal

Subjects
SCIENTIFIC literature, GLASS eels, PLANT phenology, FISH migration, NORTH Atlantic oscillation, OCEAN temperature, ADAPTIVE natural resource management, SCIAENIDAE
Abstract

Numerous studies have documented a change in the phenology of migration of diadromous fish in response to climate change. Only few studies have, however, been conducted simultaneously for multiple species and at a large spatial scale.We investigated the change in the timing of upstream migration of diadromous fish species in France. We used an original dataset collected from 40 fish‐counting devices in 28 French rivers over 10–30 years for five diadromous taxa: Alosa spp., Anguilla anguilla (with a distinction between glass eel and yellow eel), Petromyzon marinus, Salmo salar, and Salmo trutta.Except for glass eel, we found that taxa shifted their migration for earlier arrival dates. This result is consistent with numerous studies reporting advancement of the phenology of species life‐events. On average, we highlighted a phenological change of −2.3 days per decade (min = −0.2, max = −3.7). Moreover, the North Atlantic Oscillation Index, sea surface temperature, air temperature, and river discharge were found to explain the timing of upstream migration of diadromous fish taxa, highlighting the importance of factors acting at different spatial scales.Given the important phenological changes observed in our study and more widely in the scientific literature, we recommend that managers incorporate these changes into the management rules; in particular, in the case of dams whose migratory transparency (i.e. the possibility for the fishes to cross the dam) is ensured by adaptive water management and gate operations.This study benefited from large‐scale monitoring of migratory phenology of multiple species and environmental variables. These monitoring data are valuable and could allow better predictive modelling of the response of species to climate change. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Published
2021
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25. Étude de la qualité des milieux aquatiques : caractérisation des impacts écotoxiques

Author

Burgeot, Thierry, Bustamante, P., Fort, J., Coutellec, Marie-Agnès, Azam, Didier, Olivier, Geffard, Chaumot, Arnaud, Armengaud, J., Maltby, L., Minier, C., Sanchez, W., Porcher, J.M., Bado Nilles, A., Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHAMBRE REGIONALE D'AGRICULTURE POITOU CHARENTES FRA, Partenaires IRSTEA, Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), RiverLy (UR Riverly), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), UNIVERSITY OF SHEFFIELD GBR, Université Le Havre Normandie (ULH), Normandie Université (NU), and Institut National de l'Environnement Industriel et des Risques (INERIS)

Subjects
ORGANISMES MODÈLES, BIOMARQUEURS, RISQUE ÉCOLOGIQUE, DÉFI D'ÉCHELLE EN ÉCOTOXICOLOGIE, BIOESSAIS, SURVEILLANCE EAU DOUCE ET EAU MARINE, [SDE]Environmental Sciences, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
2018

26. Mise au point d'une méthode de quantification des anguilles en milieu profond

Author

Allou, Sabine, Rault, Pablo, Tréguier, Anne, Marchand, Frédéric, Azam, Didier, Beaulaton, Laurent, Unité Expérimentale d'Ecologie et d'Ecotoxicologie Aquatique - U3E (Rennes, France) (U3E ), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Pôle Gest'Aqua, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Office national de l'eau et des milieux aquatiques (ONEMA), Ministère de l'écologie, du développement durable et de l'énergie-Ministère de l'écologie, du développement durable et de l'énergie, Agence Française pour la Biodiversité (AFB), AFB, and INRA

Subjects
[SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology
Published
2018

28. Brucella microti‐like prevalence in French farms producing frogs.

Author

Jaÿ, Maryne, Freddi, Luca, Mick, Virginie, Durand, Benoit, Girault, Guillaume, Perrot, Ludivine, Taunay, Benoit, Vuilmet, Thomas, Azam, Didier, Ponsart, Claire, and Zanella, Gina

Subjects
FARM produce, BRUCELLA, FROGS, ENVIRONMENTAL sampling, ANIMAL feeds, AMPHIBIANS
Abstract

In the last 10 years, many atypical novel members of Brucella species have been reported, including several Brucella inopinata‐like strains in wild‐caught and "exotic" amphibians from various continents. In 2017, a strain of Brucella was isolated for the first time in animals from a French farm producing frogs—Pelophylax ridibundus—for human consumption and identified as B. microti‐like. Following this first isolation, investigations were performed in this farm as well as in the farm of the research unit that provided the domestic frog strain to estimate the prevalence of B. microti‐like infection and its presence in the surrounding environment. Farming practices were investigated and samples including frogs at different development stages, surface tank swabs, water, feed and soil were analysed by real‐time PCR and bacteriological methods. High B. microti‐like prevalence values (higher than 90%) were obtained in frog samples in the commercial farm, and its presence was highlighted in the environmental samples except feed. In the research unit farm, B. microti‐like species was also isolated and detected in frog and environmental samples. These results show that B. microti‐like organisms are able to colonize amphibians and persist in their environment. Its presence could constitute a possible risk for consumers and workers proving the importance of assessing the zoonotic and pathogenic potentials of these new and atypical Brucella species. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Published
2020
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29. Electrofishing in streams of low water conductivity but high biodiversity value: Challenges, limits and perspectives.

Author

Pottier, Gaetan, Beaumont, William R., Marchand, Frédéric, Le Bail, Pierre‐Yves, Azam, Didier, Rives, Jacques, Vigouroux, Régis, and Roussel, Jean‐Marc

Subjects
ELECTRIC fishing, ENDANGERED species, SPECIES diversity, RIVERS, BIODIVERSITY
Abstract

Electrofishing in streams of low water conductivity has technical limitations leading to the widespread use of poison fishing. In theory, provided a high enough voltage gradient can be created in water, electrofishing should be possible in all but the lowest of conductivities (<10 µS/cm). Using custom‐made equipment delivering up to 1,500 V DC, tests were carried out in French Guiana on 27 streams with water conductivity as low as 16 µS/cm. Approximately 5,800 fish of 93 species were captured, with an electrofishing mortality rate of 1.83%. Poison treatments were used within enclosed sections to assess how efficient multiple pass electrofishing removal is when assessing species richness and population number. The Chao II estimator on 2 electrofishing passes gave the best results for species richness, but rare species can elude electrofishing. Estimates of total fish abundance (i.e. all species pooled) were possible with the use of depletion models. Capture efficiencies by species were highly biased, however, and abundance could be underestimated for the most difficult species to catch. These results show that with the right equipment and settings, electrofishing can be an efficient alternative to poison fishing surveys in small tropical streams of low water conductivity but high biodiversity value. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Published
2020
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30. Abundance indices and biological traits of juvenile salmon (Salmo salar) sampled in three rivers on the Atlantic and Channel coasts (France)

Author

Beaulaton, Laurent, Prévost, Etienne, Delanoë, Richard, Destouches, Jean-Pierre, Gueraud, François, Guilloux, Yoann, Jeannot, Nicolas, Huchet, Emmanuel, Lange, Frédéric, Rives, Jacques, Tremblay, Julien, Herrard, Nadine, Azam, Didier, and Marchand, Frédéric

Subjects
Animal biology, Biologie animale, abundance, biological traits, juvenile, coastal river, Salmo salar, salmon
Abstract

BACKGROUND Atlantic Salmon (Salmo salar) is an anadromous migratory species adapted to cool temperatures. It is protected by the Bern convention and by the European Habitats Directive. It has been listed as vulnerable by the French IUCN Red List. Salmon decline is the result of combined and cumulated, mainly anthropic, causes: climate change, increasingly high number of impoundments, degradation of water quality and habitat and over-exploitation by fisheries. Monitoring of this species has been carried out on three rivers in France (Southern part of the distribution area) to produce data and knowledge (growth, precocious maturity, survival) for stock management. For 24 years, a specific and standardised electric fishing protocol has been used to target young-of-the-year (0+ parr) Atlantic salmon. Sampling was restricted to areas with shallow running water that flows over a coarse bottom substrate, i.e. the preferred habitat of young salmon. This monitoring and inventory of growing areas thus allows assessment of juvenile recruitment and provides baseline data required to calculate total allowable catches (TACs). NEW INFORMATION The dataset currently consists of 47,077 occurrence data points from 105 sites spanning up to 24 years in three different watersheds in France. Beyond our project, this dataset has a clear utility to research since it associates abundance measurements with the measurement of biological traits and the collection of tissue samples. It allows for current and retrospective characterisation of individuals or populations, according to life history traits and genetic features in relation to changes in environmental conditions. The fact that the monitoring takes place in France, the southern part of the distribution area, over 24 years, makes the dataset particularly relevant for climate change studies.

Published
2017

31. Abundance indices and biological traits of juvenile salmon (Salmo salar) sampled in three rivers on the Atlantic and Channel coasts (France)

Author

Marchand, Frédéric, Beaulaton, Laurent, Prévost, Etienne, Delanoë, Richard, Destouches, Jean-Pierre, Gueraud, François, Guilloux, Yoann, Jeannot, Nicolas, Huchet, Emmanuel, Lange, Frédéric, Rives, Jacques, Tremblay, Julien, Herrard, Nadine, Azam, Didier, Unité d'Ecologie et Ecotoxicologie Aquatiques (UEEA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Pôle Gest'Aqua, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Office national de l'eau et des milieux aquatiques (ONEMA), Ministère de l'écologie, du développement durable et de l'énergie-Ministère de l'écologie, du développement durable et de l'énergie, Ecologie Comportementale et Biologie des Populations de Poissons (ECOBIOP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA), Fédération du Morbihan pour la Pêche et la Protection du Milieu Aquatique (FDPPMA 56), Pôle Gest’Aqua, and Agence Française pour la Biodiversité (AFB)

Subjects
Salmoniformes, abundance, Actinopterygii, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, Salmo salar, coastal, salmon, biological traits, juvenile, lcsh:Biology (General), Animalia, Salmo, coastal river, Chordata, lcsh:QH301-705.5, Salmonidae, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience; BACKGROUND Atlantic Salmon (Salmo salar) is an anadromous migratory species adapted to cool temperatures. It is protected by the Bern convention and by the European Habitats Directive. It has been listed as vulnerable by the French IUCN Red List. Salmon decline is the result of combined and cumulated, mainly anthropic, causes: climate change, increasingly high number of impoundments, degradation of water quality and habitat and over-exploitation by fisheries. Monitoring of this species has been carried out on three rivers in France (Southern part of the distribution area) to produce data and knowledge (growth, precocious maturity, survival) for stock management. For 24 years, a specific and standardised electric fishing protocol has been used to target young-of-the-year (0+ parr) Atlantic salmon. Sampling was restricted to areas with shallow running water that flows over a coarse bottom substrate, i.e. the preferred habitat of young salmon. This monitoring and inventory of growing areas thus allows assessment of juvenile recruitment and provides baseline data required to calculate total allowable catches (TACs). NEW INFORMATION The dataset currently consists of 47,077 occurrence data points from 105 sites spanning up to 24 years in three different watersheds in France. Beyond our project, this dataset has a clear utility to research since it associates abundance measurements with the measurement of biological traits and the collection of tissue samples. It allows for current and retrospective characterisation of individuals or populations, according to life history traits and genetic features in relation to changes in environmental conditions. The fact that the monitoring takes place in France, the southern part of the distribution area, over 24 years, makes the dataset particularly relevant for climate change studies.

Published
2017
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32. Rapport d'étape 2015

Author

Petit, Eric, Acou, Anthony, Azam, Didier, Bardonnet, Agnes, Barloy, Dominique, Benneveault, Yoann, Besnard, Anne-Laure, Bolliet, Valérie, Boulenger, Clarisse, Coste-Heinrich, Pascale, Coudreuse, Julie, Daroux, Aurélie, Evanno, Guillaume, Feunteun, Eric, Forget, Guillaume, Guillard, Jean, Huchet, Emmanuel, Prévost, Etienne, Lepais, Olivier, Huteau, Dominique, Launey, Sophie, Le Quilliec, Patricia, Marchand, Frédéric, Martignac, François, Nevoux, Marie, Oger, Adrien, Ombredane, Dominique, Paillisson, J.M., Poupelin, Maxime, Réveillac, Elodie, Rault, Pablo, Rives, Jacques, Baglinière, Jean-Luc, Écologie et santé des écosystèmes (ESE), AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Biologie des Organismes et Ecosystèmes Aquatiques (BOREA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Unité Expérimentale d'Ecologie et d'Ecotoxicologie Aquatique - U3E (Rennes, France) (U3E ), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), pôle OFB-INRAE- Agrocampus Ouest-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Office français de la biodiversité (OFB), Ecologie Comportementale et Biologie des Populations de Poissons (ECOBIOP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA), Centre Alpin de Recherche sur les Réseaux Trophiques et Ecosystèmes Limniques (CARRTEL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry]), Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Agence de l'Eau Seine-Normandie (AESN), dans le cadre du Programme Sélune, Agence de l'Eau Seine-Normandie, Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-INSTITUT AGRO Agrocampus Ouest, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA), Unité Experimentale d'Ecologie et d'Ecotoxicologie Aquatique - U3E (Rennes, France) (U3E), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Pôle OFB-INRAE- Agrocampus Ouest-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement, AGROCAMPUS OUEST-Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Office français de la biodiversité (OFB), Université de Rennes (UR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), and Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
Sélune, [SDV.EE]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment
Abstract

Ce rapport reprend les principaux objectifs du projet d'étude de la recolonisation de la Sélune et de ses affluents. Ces rappels sont suivis d'une synthèse des résultats obtenus en 2015, année qui a été écourtée du fait de la signature tardive de la convention de recherche entre l'INRA et l'AESN : il s'agit de ce fait d'un rapport d'étape sur les actions prévues pour 2015, et non d'un rapport final.

Published
2016

33. Un ensemble coordonné de plateformes ouvertes la recherche internationale en écotoxicologie : Analyse et Expérimentation sur les Ecosystèmes – France

Author

Mougin, Christian, Azam, Didier, Caquet, Thierry, Cheviron, Nathalie, Dequiedt, Samuel, Le Galliard, Jean-François, Guillaume, Olivier, Houot, Sabine, Lacroix, Gérard, Lafolie, Francois, Maron, Pierre-Alain, Michniewicz, Radika, Pichot, Christian, Ranjard, Lionel, Roy, Jacques, Zeller, Bernhard, Clobert, Jean, Chanzy, Andre, Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Unité d'Ecologie et Ecotoxicologie Aquatiques (UEEA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Département Ecologie des Forêts, Prairies et milieux Aquatiques (DEPT EFPA), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Laboratoire des interactions plantes micro-organismes (LIPM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystèmes (EMMAH), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Ecologie des Forêts Méditerranéennes (URFM), Écotron Européen de Montpellier, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Interactions Sol Plante Atmosphère (UMR ISPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure des Sciences Agronomiques de Bordeaux-Aquitaine (Bordeaux Sciences Agro), Station d'écologie théorique et expérimentale (SETE), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes ( ECOSYS ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Unité d'Ecologie et Ecotoxicologie Aquatiques ( UEEA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Département Ecologie des Forêts, Prairies et milieux Aquatiques ( DEPT EFPA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), Interactions plantes-microorganismes et santé végétale, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Nice Sophia Antipolis ( UNS ), Université Côte d'Azur ( UCA ) -Université Côte d'Azur ( UCA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales ( UMR AGAP ), Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris ( IEES ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 ( UPEC UP12 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystèmes ( EMMAH ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ), Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ), Ecologie des Forêts Méditerranéennes ( URFM 629 ), UPS 3248, Écotron Européen de Montpellier - Baillarguet, Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Interactions Sol Plante Atmosphère ( ISPA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Ecole Nationale Supérieure des Sciences Agronomiques de Bordeaux-Aquitaine ( Bordeaux Sciences Agro ), CNRS, Centre National de la Recherche Scientifique - MNHN - CNRS - USR 2936, Station d’Ecologie Expérimentale, Moulis, France, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (IEES), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Ecologie des Forêts Méditerranéennes [Avignon] (URFM 629), Écotron Européen de Montpellier - UPS 3248, Interactions Sol Plante Atmosphère (ISPA), Station d’Ecologie Expérimentale du CNRS à Moulis (SEEM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
[ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

Un ensemble coordonné de plateformes ouvertes la recherche internationale en écotoxicologie : Analyse et Expérimentation sur les Ecosystèmes – France. Colloque « Construire le réseau ANTIOPES 2.0 - La toxicologie et l’écotoxicologie prédictives : de l’appliqué à l’opérationnel »

Published
2016

34. Supplementary material 1 from: Marchand F, Beaulaton L, Prévost E, Delanoë R, Destouches J, Gueraud F, Guilloux Y, Jeannot N, Huchet E, Lange F, Rives J, Tremblay J, Herrard N, Azam D (2017) Abundance indices and biological traits of juvenile salmon (Salmo salar) sampled in three rivers on the Atlantic and Channel coasts (France). Biodiversity Data Journal 5: e15125. https://doi.org/10.3897/BDJ.5.e15125

Author

Marchand, Frédéric, primary, Beaulaton, Laurent, additional, Prévost, Etienne, additional, Delanoë, Richard, additional, Destouches, Jean-Pierre, additional, Gueraud, François, additional, Guilloux, Yoann, additional, Jeannot, Nicolas, additional, Huchet, Emmanuel, additional, Lange, Frédéric, additional, Rives, Jacques, additional, Tremblay, Julien, additional, Herrard, Nadine, additional, and Azam, Didier, additional

Published
2017
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35. Figure 1 from: Marchand F, Beaulaton L, Prévost E, Delanoë R, Destouches J, Gueraud F, Guilloux Y, Jeannot N, Huchet E, Lange F, Rives J, Tremblay J, Herrard N, Azam D (2017) Abundance indices and biological traits of juvenile salmon (Salmo salar) sampled in three rivers on the Atlantic and Channel coasts (France). Biodiversity Data Journal 5: e15125. https://doi.org/10.3897/BDJ.5.e15125

Author

Marchand, Frédéric, primary, Beaulaton, Laurent, additional, Prévost, Etienne, additional, Delanoë, Richard, additional, Destouches, Jean-Pierre, additional, Gueraud, François, additional, Guilloux, Yoann, additional, Jeannot, Nicolas, additional, Huchet, Emmanuel, additional, Lange, Frédéric, additional, Rives, Jacques, additional, Tremblay, Julien, additional, Herrard, Nadine, additional, and Azam, Didier, additional

Published
2017
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36. Aedes aegypti Larvicidal Sesquiterpene Alkaloids from Maytenus oblongata

Author

Touré, Seindé, primary, Nirma, Charlotte, additional, Falkowski, Michael, additional, Dusfour, Isabelle, additional, Boulogne, Isabelle, additional, Jahn-Oyac, Arnaud, additional, Coke, Maïra, additional, Azam, Didier, additional, Girod, Romain, additional, Moriou, Céline, additional, Odonne, Guillaume, additional, Stien, Didier, additional, Houël, Emeline, additional, and Eparvier, Véronique, additional

Published
2017
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37. L’Oir, territoire de sciences. 30 ans de recherche sur une petite rivière normande

Author

Azam, Didier, Beaulaton, Laurent, Marchand, Frédéric, Marhin, Patricia, Unité Expérimentale d'Ecologie et d'Ecotoxicologie Aquatique - U3E (Rennes, France) (U3E ), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Pôle Gest'Aqua, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Office national de l'eau et des milieux aquatiques (ONEMA), Ministère de l'écologie, du développement durable et de l'énergie-Ministère de l'écologie, du développement durable et de l'énergie, Office national de l'eau et des milieux aquatiques (ONEMA), Ministère de l'écologie, du développement durable et de l'énergie, and Marchand, Frédéric

Subjects
[SDE.BE] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, [SDE.MCG] Environmental Sciences/Global Changes, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology
Published
2015

38. A coordinated set of ecosystem research platforms open to international research in ecotoxicology, AnaEE-France

Author

Mougin, Christian, primary, Azam, Didier, additional, Caquet, Thierry, additional, Cheviron, Nathalie, additional, Dequiedt, Samuel, additional, Le Galliard, Jean-François, additional, Guillaume, Olivier, additional, Houot, Sabine, additional, Lacroix, Gérard, additional, Lafolie, François, additional, Maron, Pierre-Alain, additional, Michniewicz, Radika, additional, Pichot, Christian, additional, Ranjard, Lionel, additional, Roy, Jacques, additional, Zeller, Bernd, additional, Clobert, Jean, additional, and Chanzy, André, additional

Published
2015
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39. Aedes aegyptiLarvicidal Sesquiterpene Alkaloids from Maytenus oblongata

Author

Touré, Seindé, Nirma, Charlotte, Falkowski, Michael, Dusfour, Isabelle, Boulogne, Isabelle, Jahn-Oyac, Arnaud, Coke, Maïra, Azam, Didier, Girod, Romain, Moriou, Céline, Odonne, Guillaume, Stien, Didier, Houël, Emeline, and Eparvier, Véronique

Abstract

Four new sesquiterpene alkaloids (1–4) with a β-dihydroagrofuran skeleton and a new triterpenoid (5) were isolated from an ethyl acetate extract of Maytenus oblongatastems. Their structures were elucidated using 1D and 2D NMR spectroscopy as well as MS and ECD experiments. The M. oblongatastem EtOAc extract and the pure compounds isolated were tested for larvicidal activity against Aedes aegyptiunder laboratory conditions, and compounds 2and 3were found to be active.

Published
2017
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40. Abundance indices and biological traits of juvenile salmon ( Salmo salar ) sampled in three rivers on the Atlantic and Channel coasts (France).

Author

Marchand F, Beaulaton L, Prévost E, Delanoë R, Destouches JP, Gueraud F, Guilloux Y, Jeannot N, Huchet E, Lange F, Rives J, Tremblay J, Herrard N, and Azam D

Abstract

Background: Atlantic Salmon ( Salmo salar ) is an anadromous migratory species adapted to cool temperatures. It is protected by the Bern convention and by the European Habitats Directive. It has been listed as vulnerable by the French IUCN Red List. Salmon decline is the result of combined and cumulated, mainly anthropic, causes: climate change, increasingly high number of impoundments, degradation of water quality and habitat and over-exploitation by fisheries. Monitoring of this species has been carried out on three rivers in France (Southern part of the distribution area) to produce data and knowledge (growth, precocious maturity, survival) for stock management.For 24 years, a specific and standardised electric fishing protocol has been used to target young-of-the-year (0+ parr) Atlantic salmon. Sampling was restricted to areas with shallow running water that flows over a coarse bottom substrate, i.e. the preferred habitat of young salmon. This monitoring and inventory of growing areas thus allows assessment of juvenile recruitment and provides baseline data required to calculate total allowable catches (TACs)., New Information: The dataset currently consists of 47,077 occurrence data points from 105 sites spanning up to 24 years in three different watersheds in France. Beyond our project, this dataset has a clear utility to research since it associates abundance measurements with the measurement of biological traits and the collection of tissue samples. It allows for current and retrospective characterisation of individuals or populations, according to life history traits and genetic features in relation to changes in environmental conditions. The fact that the monitoring takes place in France, the southern part of the distribution area, over 24 years, makes the dataset particularly relevant for climate change studies.

Published
2017
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