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International audience; Marine-estuarine opportunist (MEO) species are fish that occur in the continental shelf and use estuaries and/or shallow coastal areas as nurseries. These commercially important resources are facing significant environmental modifications caused by direct and/or indirect anthropogenic climate change effects. In this study, we investigated the directionality and the magnitude of the distribution shifts (i.e., range size, gravity centroids, and margins) in marine environment suitability for six main MEO fish species within the Northeast Atlantic expected for the end of the 21st century. In the framework of this study, we have distinguished ‘sub-boreal’ from ‘sub-tropical’ species. The ‘hierarchical filters’ concept was adopted for modelling the potential species distributions and combined the predictions of i) a bioclimatic model with ii) a habitat model. The bioclimatic model is based on large-scale and time-variant variables while variables of the habitat model are fine-grained and time-invariant. Two Intergovernmental Panel on Climate Change (IPCC) scenarios are tested: an intermediate (SSP2-4.5) and a pessimistic one (SSP5-8.5). We applied this framework using international databases of biodiversity occurrences, ensemble forecasting producing consensual predictions, and innovative indices of distribution shifts. A visible north-westward shift was predicted for all six species in our study area. However, the northward expansion was greater for ‘sub-tropical’ than for ‘sub-boreal’ species due to faster gravity centroid displacement shifts and faster margins shifts. These range shifts may lead to major ecological and socio-economic impacts (e.g., changes in recruitment to estuarine and coastal nurseries, as well as changes in spawning grounds) that may alter populations’ connectivity.

National audience; L’Association Française d’Halieutique réunit environ 200 scientifiques français de divers organismes d’enseignement supérieur et de recherche, de diverses disciplines, tous intéressés par l’halieutique (la science de la pêche, mais aussi des ressources aquatiques exploitées, des écosystèmes qui les supportent et des systèmes d’exploitation). Tous les deux ans, l’association organise un colloque scientifique de trois jours. Le dernier a eu lieu en juillet 2015 à Montpellier; l’occasion de faire un point sur les grandes tendances et les grands défis auxquels fait face la communauté. Cet article repose en grande partie sur les présentations faites au cours de ce colloque et qui sont consultables en ligne (http://association-francaise-halieutique.fr/conferences/).

Imagine you are a young and hungry fish looking for food in an estuary (the part of a river where it meets the ocean). You need to grow big and strong before you migrate to the ocean, and depend on tiny floating creatures (plankton) for food. However, the occurrence of these tiny creatures in the estuary varies seasonally. Lucky for you, nature has synchronized both your time in the estuary and that of your prey, and you survive. This synchronization depends on many different factors, among them the temperature of the water. Now imagine someone turning up the heat (like we humans are doing by changing the climate). Could the rising water temperatures mess up the timing for you, the predator, and your prey? To answer this question we looked at climate related changes in the synchronization of predator and prey in the biggest estuary in Western Europe. And indeed, we found signs of temporal mismatches in its aquatic food web. We fear that the observed changes can put this important ecosystem and its role as a big fish nursery at risk., Imagine que tu sois un poisson jeune et affamé à la recherche de nourriture dans un estuaire (la partie d'une rivière où elle rencontre l'océan). Tu dois devenir grand et fort avant de nager vers l'océan, et tu dépends de minuscules animaux flottants : le plancton pour manger. Cependant, la présence de ces créatures dans l'estuaire varie selon les saisons. Heureusement pour toi, la nature a fait en sorte que tu sois dans l'estuaire en même temps que ton repas et donc tu survivras (on parle alors de synchronisation). Cette synchronisation dépend néanmoins de nombreux paramètres, comme la température de l'eau. Maintenant, imagine que quelqu'un fasse monter cette température (comme nous, les humains, en changeant le climat). Cette augmentation de la température peut-elle perturber ton calendrier et celui des animaux que tu manges (tes proies) ? Pour répondre à la question, nous avons examiné la synchronisation de plusieurs espèces de poissons (prédateurs) avec celle de leurs proies dans le plus grand estuaire d'Europe occidentale (La Gironde) et son lien avec le changement du climat. Et en effet, nous avons trouvé des signes de décalage au sein de la chaine alimentaire. Nous craignons que les changements observés ne mettent en péril la fonction de nourricerie de cet écosystème.

International audience; Estuarine intertidal flats and marshes act as refuge, feeding and nursery grounds for fish and macrocrustaceans. Because of land claim, those habitats have greatly declined in Europe. However, an increasing number of former polders have been tidally restored since 1990. Tidal restoration raises concern about the ecological trajectories of restored sites and their functional equivalence with natural intertidal habitats. In the Gironde estuary, two sites have been tidally restored since 1999 and 2010 respectively: the Mortagne marsh, a former polder of the mesohaline zone, and the northern part of the île Nouvelle, an island in the oligohaline zone. Both sites were monitored during 2011-2013. Fish assemblages of the restored sites showed striking structural similarities with natural marshes and mudflats. Both sites were numerically dominated by Pomatoschistus microps whereas Liza ramada was the main contributor to biomass. The restored habitats seemed to act as feeding grounds for juveniles and adults or subadults of P. microps, L. ramada, Anguilla anguilla and Platichthys flesus. Juveniles of estuary-dependent marine species were seldom caught on the île Nouvelle but seasonally abundant in Mortagne marsh suggesting nursery function. In summer, 0-group Dicentrarchus labrax and Sparus aurata and 1-group L. ramada were shown to reside and grow in artificial ponds dug in the vincinity of Mortagne marsh. Tidal restoration had a strong extinction effect on the exotic species which thrive in the ditches of the southern part of the île Nouvelle. Tidal restoration promoted species with recreational or commercial fishing interest. Nevertheless, no clear positive effect was observed for species threatened with extinction or protected by european regulation. Mid-term feedback from the restoration of Mortagne marsh also reveals that its habitat value for aquatic organisms may have started to decline as a result of the natural filling dynamics and the development of extensive reed and cordgrass stands.

La difficulté d’établir un lien formel entre structure des communautés et fonctionnement des écosystèmes est un thème relativement ancien en écologie. Il a donné naissance à un débat particulièrement vif depuis une quinzaine d’années dans un contexte général d’érosion de la biodiversité (BDEF debate pour ‘Biodiversity Effects on Ecosystem functions’). Quel que soit l’angle sous lequel cette question est abordée, il apparaît que mettre en évidence cette relation au travers d’études empiriques est loin d’être une question triviale. Elle est particulièrement complexe dans le cas des écosystèmes estuariens (EE). En effet, l’une des particularités majeures des communautés estuariennes est leur extrême adaptation aux contraintes naturelles fortes de l’environnement. Dans le même temps, les EE sont associés à de nombreuses fonctions écologiques -dont une production biologique réputée particulièrement élevée. Leur importante homéostasie environnementale conduit ainsi à (1) une remise en question du lien entre biodiversité et processus écosystémiques et (2) une difficulté corollaire à distinguer les effets additionnels d’un stress d’origine anthropique de ceux d’un stress d’origine naturelle sur la structure des communautés et le fonctionnement des réseaux trophiques. Dans ce contexte, il apparaît nécessaire de changer de paradigme afin de faire reposer l’évaluation des systèmes sur des fondements théoriques plus solides et ainsi mieux appréhender la trajectoire fonctionnelle des EE dans le contexte du changement global. Une telle problématique requiert de combiner des approches en écologie des communautés et en écologie des écosystèmes. L’écologie des réseaux trophiques et, en particulier, la modélisation des réseaux trophiques fournissent un cadre quantitatif pertinent pour combiner à la fois des aspects sur (1) la richesse spécifique et la structure des communautés et (2) l’évaluation des processus écologiques à partir de l’estimation des flux de matière et d’énergie. Les travaux de recherche que je mène vise donc à acquérir et mobiliser des connaissances sur la fonctionnalité des habitats, la structure des communautés écologiques, le fonctionnement de l’écosystème et sur les relations entre ces composantes. Plus particulièrement, ils se sont articulés autour de 2 axes : (1) caractériser et analyser la structure et la dynamique des communautés biologiques et (2) décrire et modéliser le fonctionnement trophique des écosystèmes côtiers et estuariens sous contraintes anthropiques. Le modèle biologique que j’ai privilégié est le poisson. L’approche est essentiellement comparative, centrée sur la Gironde, où des données sont disponibles depuis plus de 30 ans permettant la prise en compte de l’évolution temporelle du milieu (approche diachronique), mais elle intègre aussi la considération d’autres estuaires (approche synchronique) au plan national et à l’échelle européenne, pour assurer la généralisation des résultats acquis. D’un point de vue opérationnel, l’objectif d’une telle approche écosystémique, associée à une démarche de comparaison multi-échelles (géographique, temporelle et biologique) est de mieux évaluer l’état et la fonctionnalité écologique de ces milieux en vue, notamment, d’aboutir à la définition d’indicateurs fonctionnels (vs structuraux) pertinents. D’un point de vue plus fondamental, il s’agit de contribuer à reconstruire un cadre d’analyse des propriétés fondamentales de fonctionnement des EE en lien avec leur stabilité dans un contexte de modifications profondes de leur biodiversité.

National audience; Cet exposé traite plus largement de la trajectoire de l'écosystème de l'estuaire de la Gironde en termes de biodiversité, de poissons ainsi qu'en termes de fonctionnement écologique.

National audience; Les estuaires sont des milieux très anthropisés, qui subissent de plein fouet le changement global. Ainsi, un suivi biologique effectué en Gironde a montré une remontée progressive de l'eau de mer dans les terres, modifiant la composition des peuplements de poissons au profit des espères marines. Y trouveront-elles des conditions favorables pour s'installer durablement ? Les chercheurs enquêtent.

Ce rapport comprend quatre parties : - une présentation générale du bassin de la Gironde - un suivi expérimental de la petite faune circulante (poissons, crevettes) aux abords du Centre Nucléaire de Production d'Electricité du Blayais - les résultats du suivi des captures professionnelles 2014 dans l'ensemble de l'estuaire - une synthèse et conclusion générale.