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[Resumo] A resistencia antibiótica, con Acinetobacter baumannii e Enterobacter cloacae complex (ECC) como microorganismos clave, constitúe unha das principais causas de morbimortalidade a nivel mundial. O estudo destas poboacións resulta esencial para desenvolver estratexias que mitiguen o impacto das infeccións na saúde pública. Nesta Tese Doutoral analízanse dúas coleccións multicéntricas nacionais de cepas clínicas, unha de Acinetobacter spp. e outra de ECC, co propósito de determinar a súa epidemioloxía, patróns e mecanismos de resistencia antibiótica, así como de explorar a actividade de novas alternativas terapéuticas. Deste xeito, cefiderocol posicionouse como o antibiótico máis activo contra A. baumannii, seguido pola colistina, a pesar do descenso significativo na eficacia desta na última década. Sublíñase tamén a problemática relacionada co ST2, con numerosos illamentos XDR, e cunha representación destacada da OXA-23, que evidencia un cambio paradigmático na epidemioloxía de A. baumannii resistente a carbapenémicos en España. Esta resistencia, mediada na súa maioría por carbapenemasas de clase D, queda aplacada polo inhibidor LN-1-255, o cal restaura o potencial de antibióticos como imipenem ou sulbactam. Doutra banda, nesta Tese caracterízase por primeira vez a diseminación plasmídica da carbapenemasa OXA-24/40 entre illamentos de Acinetobacter no-baumannii pertencentes á colección, así como a súa propagación internacional. Finalmente, en referencia a ECC, demostrouse a asociación de VIM-1 coa redución da sensibilidade ao cefiderocol, abordando aspectos microbiolóxicos, bioquímicos e moleculares. Ademais, destácase a influencia de factores adicionais na restrición da actividade desta cefalosporina de última xeración en ECC., [Resumen] La resistencia antibiótica, con Acinetobacter baumannii y Enterobacter cloacae complex (ECC) como microorganismos clave, constituye una causa importante de morbimortalidad a nivel global. El estudio de estas poblaciones es esencial para desarrollar estrategias que mitiguen el impacto de sus infecciones en la salud pública. En la presente Tesis Doctoral se analizan dos colecciones multicéntricas nacionales de cepas clínicas, una de Acinetobacter spp. y otra de ECC, con el propósito de determinar su epidemiología, sus patrones y mecanismos de resistencia antibiótica, así como de explorar la actividad de nuevas alternativas terapéuticas. En este sentido, cefiderocol se posiciona como el antibiótico más activo contra A. baumannii, seguido de colistina, a pesar de la disminución significativa en la eficacia de esta en la última década. Se subraya asimismo la problemática relacionada con el ST2, con numerosos aislados XDR, y una representación destacada de OXA-23, que evidencia un cambio paradigmático en la epidemiología de A. baumannii resistente a carbapenémicos en España. Esta resistencia, mediada en su mayoría por carbapenemasas de clase D, queda aplacada por el inhibidor LN-1-255, que recupera el potencial de compuestos como imipenem o sulbactam. Por otro lado, en esta Tesis se caracteriza por primera vez la diseminación plasmídica de la carbapenemasa OXA-24/40 entre aislados de Acinetobacter no-baumannii pertenecientes a la colección, así como su propagación internacional. Finalmente, en referencia a ECC, se demuestra la asociación de VIM-1 con la reducción de la sensibilidad a cefiderocol, abordando aspectos microbiológicos, bioquímicos y moleculares. Además, se destaca la influencia de factores adicionales en la restricción de la actividad de esta cefalosporina de última generación en ECC., [Abstract] Antibiotic resistance, involving Acinetobacter baumannii and the Enterobacter cloacae complex (ECC) as pivotal microorganisms, significantly contributes to global morbimortality. Studying these populations is crucial for developing effective strategies to lessen the impact of the resulting infections on public health. In this Doctoral Thesis two multicentric national collections of clinical strains, one comprising Acinetobacter spp. and the other ECC isolates, are examined to discern their epidemiology, resistance patterns and mechanisms, and to ultimately explore the activity of new therapeutic alternatives. Cefiderocol emerges as the most potent antibiotic against A. baumannii, followed by colistin, despite its notable decrease in efficacy over the past decade. Attention is drawn to the issue of ST2, characterized by numerous XDR isolates and a notable representation of OXA-23, signaling a paradigm shift in carbapenem-resistant A. baumannii epidemiology in Spain. This resistance, largely mediated by class D carbapenemases, is mitigated by the LN-1-255 inhibitor, restoring the potential of compounds like imipenem or sulbactam. On another note, in this Thesis, plasmid-mediated dissemination of the carbapenemase OXA-24/40 among isolates of Acinetobacter non-baumannii belonging to the collection is characterized for the first time, highlighting its international spread. Concerning ECC, the association of VIM-1 with diminished susceptibility to cefiderocol is demonstrated, addressing microbiological, biochemical, and molecular factors. Furthermore, emphasis is placed on the influence of additional factors restricting the activity of this latest generation cephalosporin in ECC.

[Resumo] A resistencia antibiótica, con Acinetobacter baumannii e Enterobacter cloacae complex (ECC) como microorganismos clave, constitúe unha das principais causas de morbimortalidade a nivel mundial. O estudo destas poboacións resulta esencial para desenvolver estratexias que mitiguen o impacto das infeccións na saúde pública. Nesta Tese Doutoral analízanse dúas coleccións multicéntricas nacionais de cepas clínicas, unha de Acinetobacter spp. e outra de ECC, co propósito de determinar a súa epidemioloxía, patróns e mecanismos de resistencia antibiótica, así como de explorar a actividade de novas alternativas terapéuticas. Deste xeito, cefiderocol posicionouse como o antibiótico máis activo contra A. baumannii, seguido pola colistina, a pesar do descenso significativo na eficacia desta na última década. Sublíñase tamén a problemática relacionada co ST2, con numerosos illamentos XDR, e cunha representación destacada da OXA-23, que evidencia un cambio paradigmático na epidemioloxía de A. baumannii resistente a carbapenémicos en España. Esta resistencia, mediada na súa maioría por carbapenemasas de clase D, queda aplacada polo inhibidor LN-1-255, o cal restaura o potencial de antibióticos como imipenem ou sulbactam. Doutra banda, nesta Tese caracterízase por primeira vez a diseminación plasmídica da carbapenemasa OXA-24/40 entre illamentos de Acinetobacter no-baumannii pertencentes á colección, así como a súa propagación internacional. Finalmente, en referencia a ECC, demostrouse a asociación de VIM-1 coa redución da sensibilidade ao cefiderocol, abordando aspectos microbiolóxicos, bioquímicos e moleculares. Ademais, destácase a influencia de factores adicionais na restrición da actividade desta cefalosporina de última xeración en ECC., [Resumen] La resistencia antibiótica, con Acinetobacter baumannii y Enterobacter cloacae complex (ECC) como microorganismos clave, constituye una causa importante de morbimortalidad a nivel global. El estudio de estas poblaciones es esencial para desarrollar estrategias que mitiguen el impacto de sus infecciones en la salud pública. En la presente Tesis Doctoral se analizan dos colecciones multicéntricas nacionales de cepas clínicas, una de Acinetobacter spp. y otra de ECC, con el propósito de determinar su epidemiología, sus patrones y mecanismos de resistencia antibiótica, así como de explorar la actividad de nuevas alternativas terapéuticas. En este sentido, cefiderocol se posiciona como el antibiótico más activo contra A. baumannii, seguido de colistina, a pesar de la disminución significativa en la eficacia de esta en la última década. Se subraya asimismo la problemática relacionada con el ST2, con numerosos aislados XDR, y una representación destacada de OXA-23, que evidencia un cambio paradigmático en la epidemiología de A. baumannii resistente a carbapenémicos en España. Esta resistencia, mediada en su mayoría por carbapenemasas de clase D, queda aplacada por el inhibidor LN-1-255, que recupera el potencial de compuestos como imipenem o sulbactam. Por otro lado, en esta Tesis se caracteriza por primera vez la diseminación plasmídica de la carbapenemasa OXA-24/40 entre aislados de Acinetobacter no-baumannii pertenecientes a la colección, así como su propagación internacional. Finalmente, en referencia a ECC, se demuestra la asociación de VIM-1 con la reducción de la sensibilidad a cefiderocol, abordando aspectos microbiológicos, bioquímicos y moleculares. Además, se destaca la influencia de factores adicionales en la restricción de la actividad de esta cefalosporina de última generación en ECC., [Abstract] Antibiotic resistance, involving Acinetobacter baumannii and the Enterobacter cloacae complex (ECC) as pivotal microorganisms, significantly contributes to global morbimortality. Studying these populations is crucial for developing effective strategies to lessen the impact of the resulting infections on public health. In this Doctoral Thesis two multicentric national collections of clinical strains, one comprising Acinetobacter spp. and the other ECC isolates, are examined to discern their epidemiology, resistance patterns and mechanisms, and to ultimately explore the activity of new therapeutic alternatives. Cefiderocol emerges as the most potent antibiotic against A. baumannii, followed by colistin, despite its notable decrease in efficacy over the past decade. Attention is drawn to the issue of ST2, characterized by numerous XDR isolates and a notable representation of OXA-23, signaling a paradigm shift in carbapenem-resistant A. baumannii epidemiology in Spain. This resistance, largely mediated by class D carbapenemases, is mitigated by the LN-1-255 inhibitor, restoring the potential of compounds like imipenem or sulbactam. On another note, in this Thesis, plasmid-mediated dissemination of the carbapenemase OXA-24/40 among isolates of Acinetobacter non-baumannii belonging to the collection is characterized for the first time, highlighting its international spread. Concerning ECC, the association of VIM-1 with diminished susceptibility to cefiderocol is demonstrated, addressing microbiological, biochemical, and molecular factors. Furthermore, emphasis is placed on the influence of additional factors restricting the activity of this latest generation cephalosporin in ECC.

La carne es un alimento muy perecedero debido a que contiene microorganismos alterantes que causan olores y sabores desagradables y bacterias patógenas que provocan daños en la salud del consumidor. Con el fin de investigar la actividad antimicrobiana de extractos de Allium sativum fresco y negro, se realizaron ensayos de inhibición en bacterias patógenas; Escherichia coli, Cronobacter sakazakii, Listeria monocytogenes y Salmonella enteritidis y alterantes; Lactobacillus sakei, Leuconostoc mesenteroides, Carnobacterium divergens, Carnobacterium viridans y Brochothrix thermosphacta mediante el método de difusión en agar por pocillos. También se estudió el volumen mínimo inhibitorio de un extracto acuoso de ajo fresco, finalmente se estudiaron los compuestos organosulfurados con poder antimicrobiano presentes en ese extracto mediante cromatografía de gases. Los resultados indicaron el poder inhibitorio del ajo fresco en todas las bacterias, sin embargo, el extracto de ajo negro no mostró inhibición en ninguna de las cepas ensayadas. Asimismo, al analizar el extracto soluble de ajo fresco se observó una amplia variedad de compuestos azufrados con poder antimicrobiano como 3-vinil-2,1-dietilaciclohexano-5-eno y 2-vinil-4H-1,3diitina, dialil sulfuro, dialil trisulfuro entre otros, mientras que en el extracto soluble de ajo negro no.., Grado en Nutrición Humana y Dietética

A notable characteristic of Streptomyces bacteria is their ability to produce secondary metabolites. The aims of this study were to identify streptomycetes that exert antibacterial activity against plant and human pathogenic bacteria, and to evaluate antibiotic production in various culture media. To identify streptomycetes that exert broad antibacterial activity using the agar-disk diffusion method, 31 isolates were screened, after which a selected isolate was cultured in nine different growth media to evaluate the production of inhibitory metabolites. Three streptomycete isolates were identified that exert inhibitory activity against at least four pathogens species. The Y15 isolate showed broad antibacterial activity on Escherichia coli, Staphylococcus epidermidis, Listeria monocytogenes, Staphylococcus aureus, Pseudomonas syringae pv. phaseolicola, Dickeya dadantii, and Pectobacterium carotovorum. The production rate of antimicrobial metabolites was maintained when Y15 was grown in culture media containing limited organic nitrogen sources. The presence of organic nitrogen compounds in the media decreased the production of antibacterial metabolites. The Y15 isolate was identified by 16S rDNA gene sequencing as member of the genus Streptomyces. We show that the composition of the fermentation medium is likely an important factor for modulating antibiotic production by streptomycetes, with impacts on the quantity and diversity of antimicrobial metabolites production., Una característica notable de las bacterias Streptomyces es la capacidad para producir metabolitos secundarios. El objetivo del estudio fue identificar estreptomicetos con actividad antibacteriana y usarlos contra bacterias patógenas de plantas y humanos, así como evaluar la producción de antibióticos en diferentes medios de cultivo. Para seleccionar estreptomicetos con actividad antibacteriana, se empleó el método de difusión de disco de agar en 31 aislados, de los que fue seleccionado un aislado, que posteriormente se cultivó en nueve medios para evaluar la producción de metabolitos inhibitorios. Se detectaron tres aislados con actividad inhibitoria contra al menos cuatro especies patógenas. El estreptomiceto nombrado Y15 presentó actividad antibacteriana contra Escherichia coli, Staphylococcus epidermidis, Listeria monocytogenes, Staphylococcus aureus, Pseudomonas syringae pv. phaseolicola, Dickeya dadantii, y Pectobacterium carotovorum. La producción de los metabolitos antimicrobianos se mantuvo cuando Y15 creció en un medio con limitada concentración de fuente de nitrógeno. La presencia de compuestos con nitrógeno orgánico provocó una disminución en la producción de los metabolitos antibacterianos. El aislado Y15 se identificó como miembro del género Streptomyces mediante la secuencia del gen 16S rDNA. La composición del medio de fermentación es un factor importante para modular la producción de antibióticos, que tiene impacto sobre la cantidad y diversidad de los metabolitos secundarios producidos.

Aquest treball fa una breu revisió bibliogràfica sobre els bacteriòfags, les seves característiques i els seus mecanismes de replicació. A partir dels estudis revisats, s’avalua la fagoteràpia, com a mesura profilàctica en l’agricultura i els animals de renda. Es comenta la legislació sobre aquesta tècnica, i es constata que a la Unió Europea (UE) no s’inclou la fagoteràpia com a mètode de tractament, raó per la qual, actualment, no és possible aplicar-la. S’aporten i s’exposen els avantatges i les dificultats derivades de l’aplicació dels bacteriòfags com a eina de prevenció i de control enfront de les infeccions d’etiologia bacteriana., This paper provides a brief literature review on bacteriophages, their key features and their replication mechanisms. On the basis of the reviewed studies, phage therapy is evaluated as a prophylactic measure in agriculture and for livestock. The relevant legislation is discussed and it is noted that phage therapy is not contemplated in the European Union (EU), which is why it is currently not possible to apply it. The benefits and difficulties involved in the application of bacteriophages as a tool for the prevention and control of infections of bacterial etiology are listed and discussed., Este artículo realiza una breve revisión bibliográfica sobre los bacteriófagos, sus características y sus mecanismos de replicación. A partir de los estudios revisados, se evalúa la fagoterapia, como medida profiláctica en agricultura y animales de renta. Se comenta la legislación, y se constata que en la Unión Europea (UE) no está incluida la fagoterapia, por lo que, actualmente, no es posible aplicarla. Se aportan y se exponen las ventajas y dificultades derivadas de la aplicación de bacteriófagos como herramienta de prevención y de control frente a las infecciones de etiología bacteriana.

Background: Respiratory infections caused by pathogenic bacteria are a very common health problem and, according to the World Health Organization, this are one of the leading causes of morbidity in developing countries. The origin of respiratory infections emerges from an imbalance of the normal microbiota or from the invasion of pathogenic bacteria in the mucous membranes that line the respiratory tract. Some of the most common microorganisms responsible for infections in the respiratory tract are Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Pseudomonas aeruginosa. Objective: to determine the frequency of pathogenic bacteria in respiratory tract infections in patients at the Vicente Corral Moscoso Hospital 2017 - 2019. Methodology: A descriptive, cross-sectional study was carried out. The variables proposed in this study were analyzed using simple and crossed tables to obtain information on the frequency of the type of condition or bacterial agent, age, sex and hospitalization area. The SPSS and Microsoft Excel programs were used for data tabulation and graphing. Results: the positive cultures of pathogenic bacteria during the years 2017-2019 gave a total of 739 cases, 219 (29,6%) were Klebsiella pneumoniae, 135 (18,3%) Pseudomona aeruginosa, 123 (16,6%) Streptococcus pyogenes, 111 (15%) Staphylococcus aureus, 51 (6,9%) Serratia marcescens, 43 (5,8%) Acinetobacter baumannii/calcoaceticus complex, 27 (3,7%) Streptococcus pneumoniae, 24 (3,2 %) Acinetobacter baumannii and 6 (0,8%) for Moraxella catarrhalis. There was a higher number of cases of lower respiratory tract infection 70,6%, predominantly male with a 41,1%. Conclusions: Klebsiella pneumoniae is the most frequent pathogenic bacterium in our environment and it is considered the main cause of pneumonia.