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Orientador: Fernando Roberto Martins Dissertação (mestrado profissional) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia Resumo: O ensino da evolução biológica é fundamental para o entendimento da biologia como um todo; portanto, é importante que se dê de forma eficiente na educação básica. Atualmente, existe uma carência de materiais didáticos adequados para o ensino de evolução no Ensino Médio, o que muitas vezes acarreta um ensino genérico por parte dos professores, não proporcionando aos alunos um conhecimento adequado sobre o tema. Por isso, propomos uma sequência didática de caráter investigativo, com vista a contribuir para o ensino de evolução no Ensino Médio, disponibilizando um material crítico que abrange as teorias evolutivas e os mecanismos da evolução biológica, para que os professores de biologia possam fazer uso. Desse modo, o material desenvolvido durante este trabalho busca contribuir para a qualidade do ensino de biologia nas escolas de educação básica Abstract: The teaching of biological evolution is fundamental to understanding biology as a whole; therefore, it should be carried out efficiently in basic education. Currently, there is a lack of adequate teaching materials for teaching evolution in high school, which often leads to generic teaching on the part of teachers, not providing students with adequate knowledge on the subject. Therefore, we propose a didactic sequence of an investigative nature, intending to contribute to the teaching of evolution in High School and providing critical material that covers evolutionary theories and the mechanisms of biological evolution, so that biology teachers can make use of it. Thus, the material developed during this work seeks to contribute to the quality of biology teaching in basic education schools Mestrado Ensino de Biologia Mestra em Ensino de Biologia CAPES 001

Orientador: Mariana Freitas Nery Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia Resumo: Os peixes-boi possuem três espécies viventes: T. manatus (Costa da América do Norte, Central e parte do Sul), T. inunguis (endêmico da Bacia Amazônica), e T. senegelensis (Costa da República do Congo). Essas espécies têm sido estudadas durante as últimas décadas em relação a seus aspectos ecológicos (comportamento, hábitos, locomoção), fisiológicos (equilíbrio de osmorregulação, trato gastroinestinal) e também do ponto de vista da genética de populações. O presente trabalho apresenta análises comparativas inéditas do ponto de vista genômico para as três espécies, utilizando sequenciamento completo do genoma mitocondrial (para as três espécies) e nuclear (para as espécies brasileiras). A tese está dividida em dois capítulos em forma de artigo científico, sendo um já publicado. O primeiro capítulo utiliza o genoma mitocondrial das três espécies viventes de peixe-boi para inferirmos sobre a história evolutiva do gênero, ainda, testamos alguns genes mitocondriais sob seleção que estão relacionados à respiração celular. No segundo capítulo, analisamos o genoma das espécies de peixe-boi encontradas no Brasil, T. manatus e T. inunguis, utilizamos a plataforma Hi-Seq 2500 e quatro lanes de bibliotecas paired-end, e duas para mate- pair, para atingir a cobertura de 80X. Foram realizadas análises de qualidade dos genomas e montagem, além de análises comparativas sobre a quantidade de elementos repetitivos, grupos ortólogos, expansão e retração de famílias gênicas, e análises demográficas. As análises nos mostraram expansão e retração em algumas famílias gênicas relacionada à receptores olfativos, verificamos também a quantidade de elementos exclusivos para ambas as espécies. Sobre a história demográfica das espécies verificamos que em alguns momentos quando havia aumento do Ne em uma população, a outra sofria com redução de seu Ne. Em suma, os dois capítulos geram importantes dados que podem ser utilizados como base para estudos posteriores em relação à essas espécies Abstract: Manatees have three living species: T. manatus (Coast of North, Central and South America), T. inunguis (endemic to the Amazon Basin), and T. senegelensis (Coast of the Republic of Congo). These species have been studied during the last decades in relation to their ecological aspects (behavior, habits, locomotion), physiological (osmoregulation balance, gastrointestinal tract) and also from the point of view of population genetics. The present work presents unprecedented comparative analyzes from the genomic point of view for the three species, using complete sequencing of the mitochondrial genome (for the three species) and nuclear (for the Brazilian species). The thesis is divided into two chapters in the form of a scientific article, one of which has already been published. The first chapter uses the mitochondrial genome of the three living species of manatee to infer about the evolutionary history of the genus, in addition, we tested some mitochondrial genes under selection that are related to cellular respiration. In the second chapter, we analyzed the genome of the manatee species found in Brazil, T. manatus and T. inunguis, using the Hi-Seq 2500 platform and four lanes of paired-end libraries, and two for mate-pair, to reach 80X coverage. Genome quality and assembly analyzes were performed, as well as comparative analyzes on the number of repetitive elements, orthologous groups, expansion and retraction of gene families, and demographic analysis. The analyzes showed us expansion and retraction in some gene families related to olfactory receptors, we also verified the number of unique elements for both species. Regarding the demographic history of the species, we found that at times when there was an increase in Ne in one population, the other suffered from a reduction in its Ne. In short, the two chapters generate important data that can be used as a basis for further studies in relation to these species Doutorado Genética Animal e Evolução Doutora em Genética e Biologia Molecular CAPES 2019-1/88882.329516 FAPESP 2015/18269-1