35 results on '"Pereira, Welison Andrade"'
Search Results
2. Genome-wide characterization of the common bean kinome: Catalog and insights into expression patterns and genetic organization
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Aono, Alexandre Hild, Pimenta, Ricardo José Gonzaga, Dambroz, Caroline Marcela da Silva, Costa, Francisco Cleilson Lopes, Kuroshu, Reginaldo Massanobu, de Souza, Anete Pereira, and Pereira, Welison Andrade
- Published
- 2023
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3. Development and validation of a diagrammatic scale for white mold incidence in tobacco leaf discs
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Lopes, Fernanda Souza, Pozza, Edson Ampélio, Porto, Antonio Carlos Mota, da Silva, Caroline Marcela, Miguel, Luciana Aparecida, and Pereira, Welison Andrade
- Published
- 2022
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4. Genome-wide analysis of MLO genes reveals evolutionary characteristics and patterns favorable for understanding plant-pathogen interactions
- Author
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Pereira, Welison Andrade, primary, Maciel, Yasmin Meireles Costa, additional, Costa, Francisco Cleilson Lopes, additional, Rodrigues, Lais Nóbrega, additional, and Kanyuka, Kostya, additional
- Published
- 2024
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5. Differential gene expression in common bean during interaction with race 65 of Colletotrichum lindemuthianum
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da Silva, Caroline Marcela, Costa, Larissa Carvalho, Porto, Antonio Carlos Mota, Lima, André Almeida, Chalfun-Junior, Antonio, de Souza, Elaine Aparecida, and Pereira, Welison Andrade
- Published
- 2021
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6. Epigenetic Marks Associated to the Study of Nucleolar Dominance in Urochloa P. Beauv.
- Author
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Santos, Yasmim Dutra, Pereira, Welison Andrade, de Paula, Cristina Maria Pinto, de Campos Rume, Gabriel, Lima, André Almeida, Chalfun-Junior, Antonio, Souza Sobrinho, Fausto, and Techio, Vânia Helena
- Published
- 2020
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7. Location of low copy genes in chromosomes of Brachiaria spp.
- Author
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Nani, Thaís Furtado, Schnable, James C., Washburn, Jacob D., Albert, Patrice, Pereira, Welison Andrade, Sobrinho, Fausto Souza, Birchler, James A., and Techio, Vânia Helena
- Published
- 2018
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8. Color traits of soybean conventional and trangenic cultivars are affected by glyphosate concentrations using digital imaging
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Costa, Francisco Cleilson Lopes, primary, Piza, Mateus Ribeiro, additional, Rodrigues, Lais Nóbrega, additional, Bruzi, Adriano Teodoro, additional, and Pereira, Welison Andrade, additional
- Published
- 2023
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9. Seed reserve mobilization and seedling morphology of genetically modified soybean treated with glyphosate
- Author
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Costa, Francisco Cleilson Lopes, Peña, Samanda López, and Pereira, Welison Andrade
- Subjects
Glycine max ,herbicide ,dynamics of seed reserve ,herbicida ,dinâmica de reservas de sementes - Abstract
The objective of this work was to evaluate the effects of the application of the glyphosate herbicide on seed reserve mobilization and seedling morphology of genetically modified soybean. Two herbicide-tolerant (TMG 1264RR and P98Y11) and two herbicide-sensitive (Emgopa 315 and UFUS 7415) cultivars were selected for the study and subjected to germination, seedling length, and reserve mobilization tests after treatments with glyphosate solutions at the concentrations of 0.00, 0.06, and 0.12%. The hypocotyl/radicle ratio and the efficiency of conversion of reserves to seedlings were also determined. The higher the concentration of glyphosate, the lower the percentage of normal seedlings and the shorter seedling length, mainly in the herbicide-sensitive cultivars. The 'TMG 1264RR' glyphosate-tolerant genotype mobilized more reserves and was more efficient in converting biomass into seedlings. Herbicide application reduced the average length of the seedlings and caused the roots to become shorter than the hypocotyls. During germination, the herbicide changes seedling morphology since the seedling hypocotyl becomes proportionally larger than the radicle. Although, when applied, glyphosate altered the length, weight, and reserve mobilization of the four evaluated genotypes, the most affected were 'Emgopa 315' and 'UFUS 7415', the glyphosate-sensitive ones. Resumo O objetivo deste trabalho foi avaliar os efeitos da aplicação do herbicida glifosato na mobilização de reservas e na morfologia de plântulas de soja geneticamente modificada. Duas cultivares tolerantes (TMG 1264RR e P98Y11) e duas sensíveis ao herbicida (Emgopa 315 e UFUS 7415) foram selecionadas para o estudo e submetidas aos testes de germinação, comprimento de plântulas e mobilização de reservas após tratamentos com soluções de glifosato nas concentrações de 0,00, 0,06 e 0,12%. A relação hipocótilo/radícula e a eficiência da conversão de reservas em plântulas também foram determinadas. Quanto maior a concentração de glifosato, menor a percentagem de plântulas normais e o comprimento das plântulas, principalmente nas cultivares sensíveis ao herbicida. O genótipo 'TMG 1264RR', tolerante ao glifosato, mobilizou mais reservas e foi mais eficiente na conversão de biomassa em mudas. A aplicação do herbicida reduziu o comprimento médio das plântulas e fez com que as raízes ficassem menores que os hipocótilos. Durante a germinação, o herbicida também altera a morfologia da muda uma vez que o hipocótilo fica proporcionalmente maior que a radícula. Embora, quando aplicado, o herbicida glifosato tenha alterado o crescimento, o peso e a mobilização de reservas dos quatro genótipos avaliados, os mais afetados foram 'Emgopa 315' e 'UFUS 7415', que são sensíveis ao herbicida.
- Published
- 2023
10. The Cucumber Kinome: genome-wide, identification, characterisation and expression analysis of the Cucumis sativus protein kinases in response to Powdery Mildew, Alternaria Leaf Spot and Root-Knot Nematode
- Author
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Costa, Francisco Cleilson Lopes, primary, Aono, Alexandre Hild, additional, Silva, Edson Mario de Andrade, additional, and Pereira, Welison Andrade, additional
- Published
- 2023
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11. Genome-wide analysis and characterization of the LRR-RLK gene family provides insights into anthracnose resistance in common bean
- Author
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Dambroz, Caroline Marcela da Silva, primary, Aono, Alexandre Hild, additional, Silva, Edson Mario de Andrade, additional, and Pereira, Welison Andrade, additional
- Published
- 2022
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12. Genome-wide characterization of the common bean kinome: catalog and insights into expression patterns and genetic organization
- Author
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Aono, Alexandre Hild, primary, Pimenta, Ricardo José Gonzaga, additional, Dambroz, Caroline Marcela da Silva, additional, Costa, Francisco Cleilson Lopes, additional, Kuroshu, Reginaldo Massanobu, additional, de Souza, Anete Pereira, additional, and Pereira, Welison Andrade, additional
- Published
- 2022
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13. Development and validation of a diagrammatic scale for white mold incidence in tobacco leaf discs
- Author
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Lopes, Fernanda Souza, primary, Pozza, Edson Ampélio, additional, Porto, Antonio Carlos Mota, additional, da Silva, Caroline Marcela, additional, Miguel, Luciana Aparecida, additional, and Pereira, Welison Andrade, additional
- Published
- 2021
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14. Karyotype analysis and mode of reproduction of two species of Urochloa P. Beauv.
- Author
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Moraes, Isabella de Campos, primary, Pereira, Welison Andrade, additional, Nani, Thaís Furtado, additional, Paula, Cristina Maria Pinto de, additional, Rocha, Mara Jane da, additional, Souza Sobrinho, Fausto, additional, and Techio, Vania Helena, additional
- Published
- 2021
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15. The Wild Sugarcane and Sorghum Kinomes: Insights Into Expansion, Diversification, and Expression Patterns
- Author
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Aono, Alexandre Hild, primary, Pimenta, Ricardo José Gonzaga, additional, Garcia, Ana Letycia Basso, additional, Correr, Fernando Henrique, additional, Hosaka, Guilherme Kenichi, additional, Carrasco, Marishani Marin, additional, Cardoso-Silva, Cláudio Benício, additional, Mancini, Melina Cristina, additional, Sforça, Danilo Augusto, additional, dos Santos, Lucas Borges, additional, Nagai, James Shiniti, additional, Pinto, Luciana Rossini, additional, Landell, Marcos Guimarães de Andrade, additional, Carneiro, Monalisa Sampaio, additional, Balsalobre, Thiago Willian, additional, Quiles, Marcos Gonçalves, additional, Pereira, Welison Andrade, additional, Margarido, Gabriel Rodrigues Alves, additional, and de Souza, Anete Pereira, additional
- Published
- 2021
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16. SNP genotyping for fast and consistent clustering of maize inbred lines into heterotic groups
- Author
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Oliveira, Lander Santos de, primary, Schuster, Ivan, additional, Novaes, Evandro, additional, and Pereira, Welison Andrade, additional
- Published
- 2021
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17. The sugarcane and sorghum kinomes: insights into evolutionary expansion and diversification
- Author
-
Aono, Alexandre Hild, primary, Pimenta, Ricardo José Gonzaga, additional, Garcia, Ana Letycia Basso, additional, Correr, Fernando Henrique, additional, Hosaka, Guilherme Kenichi, additional, Carrasco, Marishani Marin, additional, Cardoso-Silva, Cláudio Benício, additional, Mancini, Melina Cristina, additional, Sforça, Danilo Augusto, additional, dos Santos, Lucas Borges, additional, Nagai, James Shiniti, additional, Pinto, Luciana Rossini, additional, Landell, Marcos Guimarães de Andrade, additional, Carneiro, Monalisa Sampaio, additional, Balsalobre, Thiago Willian, additional, Quiles, Marcos Gonçalves, additional, Pereira, Welison Andrade, additional, Margarido, Gabriel Rodrigues Alves, additional, and de Souza, Anete Pereira, additional
- Published
- 2020
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18. Molecular Characterization of the S-alleles and Compatibility among Hybrid Pear Tree Cultivars for Subtropical Regions
- Author
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Bisi, Rayane Barcelos, primary, Pio, Rafael, additional, da Hora Farias, Daniela, additional, Locatelli, Guilherme, additional, de Alcântara Barbosa, Caio Morais, additional, and Pereira, Welison Andrade, additional
- Published
- 2019
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19. Protocol adjustment improves the extraction of high-quality total RNA from common bean stems infected by Sclerotinia sclerotiorum
- Author
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Miranda, Rafael Novais de, primary, Silva, Caroline Marcela da, additional, Porto, Antonio Carlos da Mota, additional, and Pereira, Welison Andrade, additional
- Published
- 2019
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20. Karyotype analysis and mode of reproduction of two species of UrochloaP. Beauv.
- Author
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Moraes, Isabella de Campos, Pereira, Welison Andrade, Nani, Thaís Furtado, Paula, Cristina Maria Pinto de, Rocha, Mara Jane da, Souza Sobrinho, Fausto, and Techio, Vania Helena
- Abstract
Grasses with desirable traits for agriculture and livestock production are continually being sought. The genus Urochloacomprises many species of good forage potential, although studies have mostly focused on commercial cultivars. Karyotype data can be used to characterize species and generate information for taxonomy and evolutionary studies and contribute to breeding programs. The mode of reproduction is also an essential piece of information to determine breeding strategies. This study aimed to characterize the karyotypes of Urochloa arrecta(Hack. ex T. Dur. & Schniz) O. Morrone & F. Zuloaga and a pentaploid cytotype of U. brizantha(Hochst. ex A. Rich.) R. Webster, including the mapping of ribosomal DNA (rDNA) sites and nuclear DNA content and indicating the mode of reproduction. Slides were prepared using the flame drying technique and were subjected to fluorescent in situ hybridization with 35S and 5S rDNA probes. DNA content was estimated by flow cytometry. The classification of the reproduction mode was based on the amplification of the primers N14 and p779/p780. Urochloa arrectapresented 2C = 2.66 pg of DNA, karyotype formula 2n= 4x= 34 m + 2sm, four chromosomes with 35S rDNA sites, and four other chromosomes with 5S rDNA sites. The absence of amplification products with the primers N14 and p779/p780 provided evidence of sexual reproduction. Urochloa brizanthapresented 2C = 4.52 pg of DNA and karyotype formula 2n= 5x= 45 m. Five chromosomes presented 35S rDNA, and eight other chromosomes displayed 5S rDNA sites. Polymerase chain reaction results indicated that this cytotype has an apomictic mode of reproduction. The organization of karyotypes suggests an allopolyploid origin for both genotypes. Possible applications of the information found are discussed. The marker ASGR–BBML p779/p780 is efficient in discriminating sexual and apomictic Urochloaspp.Cytogenetic data is applied to Urochloabreeding and taxonomic and phylogenetic studies.Karyotype analyses suggest allopolyploid origin in U. arrectaand U. brizantha5x.This is the first study involving karyotype description for U. arrecta.
- Published
- 2021
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21. Performance of transgenic and conventional soybean plants subjected to bioassay for detection of glyphosate tolerant seeds
- Author
-
Pereira, Welison Andrade, primary, Silva, Alisson Santos Lopes da, additional, Nobre, Danúbia Aparecida Costa, additional, Paula, Guilherme de Sousa, additional, and Silva, Felipe Lopes da, additional
- Published
- 2018
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22. Dynamics of reserves of soybean seeds during the development of seedlings of different commercial cultivars
- Author
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Pereira, Welison Andrade, Pereira, Sara Maria Andrade, and Dias, Denise Cunha Fernandes dos Santos
- Subjects
germination ,mobilização de reservas ,seedlings ,germinação ,Glycine max (L.) Merrill ,plântulas ,reserves mobilization - Abstract
Physiological quality and vigor of the seeds comprise properties that determine a high level of activity and performance during germination and seedling emergence, having a direct relation with the establishment of the stand of a crop. In this context, the assessment of seedling development, including the analysis of the seed reserves mobilization are a reliable method to investigate the physiological potential of seed lots. In this preliminary study, the aim was to investigate the dynamics of seed reserves mobilization of a sample of soybean commercial cultivars. By means of the seedling length bioassay and weight of dry matter of seeds, cotyledons, hypocotyls and radicles, information on the reserves mobilization during the germination process was obtained. Data were subjected to analysis of variance and Scott and Knott test, and afterwards, phenotypic correlations between traits were obtained. The results have shown that the dry matter of seeds, reserves reduction of seeds and dry matter of seedlings are positively correlated, and thus, seeds containing more reserves may be more effective during the early development of seedlings. In contrast, reserve reduction of seeds and conversion efficiency of the seeds reserves in the dry matter of seedlings are negatively correlated. Qualidade fisiológica e vigor compreendem propriedades das sementes que determinam alto nível de atividade e desempenho durante a germinação e emergência das plântulas, tendo relação direta com o estabelecimento do estande de uma lavoura. Neste contexto, a avaliação do desenvolvimento das plântulas, incluindo análise da mobilização de reservas das sementes pode se constituir em um método confiável para investigação do potencial fisiológico de lotes. Neste estudo preliminar, objetivou-se investigar a dinâmica de reservas em sementes de cultivares comerciais de soja. Por meio do teste de comprimento de plântulas e peso de massa seca de sementes, cotilédones, hipocótilos e radículas foram obtidas informações sobre a mobilização de reservas durante o processo de germinação. A massa seca de sementes, redução de reservas de sementes e massa seca de plântulas estão positivamente correlacionados entre si, e, logo, sementes contendo mais reservas podem apresentar maior vigor durante o desenvolvimento inicial de plântulas. Em contrapartida, redução de reserva de sementes e eficiência na conversão de reservas das sementes em massa seca de plântulas são negativamente correlacionadas.
- Published
- 2015
23. Location of low copy genes in chromosomes of <italic>Brachiaria</italic> spp.
- Author
-
Nani, Thaís Furtado, Schnable, James C., Washburn, Jacob D., Albert, Patrice, Pereira, Welison Andrade, Sobrinho, Fausto Souza, Birchler, James A., and Techio, Vânia Helena
- Abstract
Repetitive DNA sequences have been widely used in cytogenetic analyses. The use of gene sequences with a low-copy-number, however, is little explored especially in plants. To date, the karyotype details in
Brachiaria spp. are limited to the location of rDNA sites. The challenge lies in developing new probes based on incomplete sequencing data for the genus or complete sequencing of related species, since there are no model species with a sequenced genome inBrachiaria spp. The present study aimed at the physical location of conserved genes in chromosomes ofBrachiaria ruziziensis, Brachiaria brizantha , andBrachiaria decumbens using RNAseq data, as well as sequences ofSetaria italica andSorghum bicolor through the fluorescent in situ hybridization technique. Five out of approximately 90 selected sequences generated clusters in the chromosomes of the species ofBrachiaria studied. We identified genes in synteny with 5S and 45S rDNA sites, which contributed to the identification of chromosome pairs carrying these genes. In some cases, the species ofBrachiaria evaluated had syntenic segments conserved across the chromosomes. The use of genomic sequencing data is essential for the enhancement of cytogenetic analyses. [ABSTRACT FROM AUTHOR]- Published
- 2018
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24. Dynamics of reserves of soybean seeds during the development of seedlings of different commercial cultivars
- Author
-
Pereira, Welison Andrade, primary, Pereira, Sara Maria Andrade, additional, and Dias, Denise Cunha Fernandes dos Santos, additional
- Published
- 2015
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25. Reciprocal gene flow among soybean cultivars on that populations genetics theorical
- Author
-
Pereira, Welison Andrade, Dias, Denise Cunha Fernandes dos Santos, Cruz, Cosme Damião, Oliveira, Aluízio Borém de, Sediyama, Tuneo, and Caixeta, Eveline Teixeira
- Subjects
CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA::FITOTECNIA::MELHORAMENTO VEGETAL [CNPQ] ,Populations genetics ,Organismos transgênicos ,Genetic ,Soja ,Melhoramento genético ,Transgenic organisms ,Genética de populações ,Soybean - Abstract
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico According to the literature, it isn't common that the natural hybridization rate in Glycine max exceeds the value 1%. With the arrival of transgenic cultivars, new researches has been done in order to investigate the allogamy of these cultivars. For seed producers for marketing is important to know this aspect of the cultivars, because genetic purity is the assurance of your product. Researches show that the fact of growing genetically modified to not change the existing expectation of cross-fertilization. In the knowledge that genetic purity is required for any variety, the objetctive was to assess the rate of reciprocal cross-fertilization involving two soybean cultivars, one conventional and one GM. Previously, we attempted to adjust methods of bioassay for the detection of soybean seeds of GM crops, and reflect the gene flow of soybean from the perspective of population genetics. From the adjustment of the methods of bioassays: i) seed germination in a substrate containing glyphosate, and ii) presoaking of seeds with the herbicide, followed by germination test, we obtained efficient protocols for detecting and quantification of GM soybean seeds of the soybean seeds. The method of wetting the substrate with germination herbicide solution, 0.03% of its acid equivalent at a ratio of 3 times the weight of dry paper was selected for the testing of natural hybridization. Faced with the prospect of population genetics, it was concluded that the chance of fixation of an allele in the gene pool of a population after gene flow is, among other factors, because of its relevance to the fitness of their bearers. In addition, the selection against a dominant allele needs only one generation to eliminate it from the gene pool of the population and that the dilution effect should be used for the dissemination of natural hybridization rates found in studies of this type. In the study of reciprocal cross-fertilization, different methods for the verification of natural hybridization, examining the color of the flower field, examining the color of the hypocotyls in a greenhouse, the spraying of seedlings with the herbicide in greenhouses, and the germination of seeds in contact with the herbicide in the laboratory seed analysis showed that the rates of outcrossing population were 0.05, 0.10, 0.39 and 0.22% respectively. Based on these results, it was found that the rate of natural hybridization reverse is not the same in both directions and that the application of the dilution effect is indispensable to present the results of studies on gene flow, since the population values are lower than those found in the rows studied. Conforme a literatura, não é comum que a taxa de hibridação natural em Glycine max ultrapasse o valor de 1%. Com a chegada das cultivares transgênicas, novas pesquisas foram realizadas no intuito de investigar a alogamia dessas cultivares. Para os produtores de sementes para comercialização é importante conhecer este aspecto das cultivares, pois pureza genética é a garantia de qualidade do seu produto. Pesquisas demonstram que o fato da cultivar ser modificada geneticamente não altera a expectativa existente de fecundação cruzada. Na consciência de que pureza genética é requerida para qualquer variedade, o objetivo deste trabalho foi avaliar a taxa de fecundação cruzada recíproca envolvendo duas cultivares de soja, uma convencional e outra GM. Anteriormente, buscou-se ajustar metodologias de bioensaios para a detecção de sementes de soja de cultivar GM, e refletir o fluxo gênico em soja sob a perspectiva de genética de populações. A partir do ajuste das metodologias dos bioensaios: i) germinação de sementes em substrato umedecido com o glifosato, e, ii) pré-embebição de sementes em solução do herbicida, seguida de teste de germinação, obteve-se protocolos eficientes para a detecção e quantificação de sementes de soja GM entre sementes de soja convencional. O método do umedecimento do substrato de germinação com solução do herbicida, a 0,03% do seu equivalente ácido, na proporção de 3 vezes o peso do papel seco foi escolhida para os testes de detecção de hibridação natural. Diante às perspectivas de genética de populações, concluiu-se que a chance de fixação de um alelo no pool gênico de uma população após o fluxo gênico é, entre outros fatores, função de sua relevância para a aptidão de seus portadores. Além disso, que a seleção contra um alelo dominante precisa de apenas uma geração para eliminá-lo do pool gênico da população e que o efeito diluição deve ser utilizado para a divulgação das taxas de hibridação natural encontradas em estudos desta natureza. No estudo de fecundação cruzada recíproca, os diferentes métodos para a verificação da hibridação natural, na verificação da cor da flor em campo, na verificação da cor do hipocótilo em casa de vegetação, na pulverização de plântulas com solução do herbicida em casas de vegetação, e, na germinação de sementes em contato com o herbicida em laboratório de análise de sementes, demonstraram que as taxas de fecundação cruzada populacionais foram 0,05, 0,10, 0,39 e 0,22 %, respectivamente. Com base nestes resultados, verificou-se que a taxa de hibridação natural recíproca não é a mesma em ambos os sentidos e que a aplicação do efeito diluição é indispensável para apresentar os resultados de estudos sobre o fluxo gênico, já que os valores populacionais são inferiores àqueles encontrados para as fileiras estudadas.
- Published
- 2010
26. Ajuste de metodologias para a identificação de cultivares de soja quanto à tolerância ao glifosato
- Author
-
Pereira, Welison Andrade, Lisboa, Suzana Patrícia, Dias, Denise Cunha Fernandes dos Santos, Alvarenga, Eveline Mantovani, and Borém, Aluízio
- Subjects
Glycine max ,pureza genética ,modified genetically organism ,genetic purity ,organismo geneticamente modificado - Abstract
Os bioensaios constituem numa alternativa prática e eficiente para detecção de sementes de soja geneticamente modificada (GM), tolerante ao glifosato. Contudo, deve ser verificada sua utilização na identificação das sementes quando o lote é de soja GM, ou seja, quando sementes de soja convencional são a minoria. Objetivou-se com este trabalho ajustar a metodologia de dois bioensaios de detecção de sementes de soja GM e testar os melhores protocolos, um de cada bioensaio, na detecção e quantificação de misturas simuladas, contendo genótipos contrastantes quanto à tolerância ao herbicida. Nos bioensaios, foram testadas três umidades do substrato (2,0; 2,5 e 3,0 vezes o seu peso seco), cinco soluções do herbicida (0; 0,01; 0,03; 0,06 e 0,12 %) no método papel umedecido com glifosato e quatro soluções (0; 0,3; 0,6 e 1,2 %) no método pré - embebição de sementes. A umidade 3,0 e solução 0,03 % constituíram o protocolo mais eficiente para detecção no método do papel umedecido. A umidade 2,0 e solução 0,3 % se destacaram no método da pré-embebição das sementes. Foi mais prático e rápido detectar plântulas tolerantes do que plântulas sensíveis em ambos os testes. Em amostras com maior taxa de contaminação, foi mais fácil detectar e mais difícil quantificar misturas com exatidão. Os erros foram relativamente raros considerando os acertos. Bioassays constitute a practical and efficient alternative for detection of genetically modified soybean seeds (GM) tolerant to gliphosate. However, their use should be analyzed in the identification of seeds when the lot is of GM soybean, in other words, when seeds of conventional soybean are the minority. The objectives of this study were to adjust the methodology of two bioassays to detect GM soybean seeds and to test the best protocols, one of each bioassay, in the detection and quantification of simulated mixtures, containing contrasting genotypes for tolerance to the herbicide. In the bioassays, the following were tested: three moistures of the substratum paper (2.0; 2.5 and 3.0 times the dry weight), five solutions (0; 0.01; 0.03; 0.06 and 0.12%) in the method moistened paper with herbicide and four solutions (0; 0.3; 0.6 and 1.2 %) in the pre-soak seed method. The moisture 3.0 and solution 0.03 % constituted the most efficient protocol for detection in the moistened paper method. The moisture 2.0 and solution 0.3 % stood out in the pre-soak seed method. It was more practical and quicker to detect tolerant seedlings than sensitive seedlings in both tests. In samples with higher contamination rates, it was easier to detect and more difficult to precisely quantify the mixtures. The mistakes were relatively rare considering the successes.
- Published
- 2009
27. Gene flow analisys in RR soybean and methodology for its deteccion
- Author
-
Pereira, Welison Andrade, Oliveira, Aluízio Borém de, Carneiro, José Eustáquio de Souza, Giudice, Marcos Paiva Del, Dias, Denise Cunha Fernandes dos Santos, and Sediyama, Tuneo
- Subjects
Plant genetics ,Genética vegetal ,Soja ,CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA::GENETICA VEGETAL [CNPQ] ,Biossegurança ,Fluxo gênico ,Biosafety ,Soybean ,Gene flow - Abstract
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico The objective of this work was to investigate the gene flow from the Roundup Ready soybean to a conventional in two sites of Minas Gerais: Viçosa and Florestal. Cross-pollination rate was observed between CD219RR® and CD211, both of property of COODETEC (Central Cooperative of Agricultural Research). It was also objective of this research to study five methodologies to identify tolerant soybean seeds to the herbicide, and one of them was chosen for the detection of the occurrence of gene flow in this work. The first experiment was installed in the field in an outline of concentric squares delineated especially for the objectives of this study. The first five squares, from the center to the border, formed the pollen source, where seeds were sowed of gliphosate tolerant cultivar. The remaing squares were sowed susceptible cultivar seeds. In the maturation stage, stage R8, were harvested in the four directions starting from the center, rows corresponding to the sides of the squares, in varied distances of the pollen source: 0,5; 1,0; 2,0; 4,0 and 8,0 meters. Of the harvested rows, samples of 900 seeds per row were evaluated through the bioassay of germination in substrate moistened with 0,06% glifosato solution. In this analysis, seedling endowed with indicative trace of tolerance to the gliphosate indicated occurrence of cross-pollination. The obtained data were analyzed statistically through linear regression with plateau. Results indicated cross-pollination rates different for the two locations showing that this trait can vary in function of the environment. The largest natural hybridization rates (1,27% in Florestal and 0,25% in Viçosa) happened at the smallest distances. The cross-pollination rates approached zero at the distances of 2,26 and 1,16m from the source, for Florestal and Viçosa, respectively. O objetivo deste trabalho foi investigar o fluxo gênico da soja Roundup Ready para uma convencional em duas localidades no Estado de Minas Gerais: Viçosa e Florestal. Foi observada a taxa de fecundação cruzada entre CD219RR® e CD211, ambas de propriedade da COODETEC (Cooperativa Central de Pesquisa Agrícola). Foi também objetivo dessa pesquisa estudar cinco metodologias para identificar sementes de soja tolerante ao herbicida. Uma delas foi escolhida para detecção do fluxo gênico neste trabalho. O primeiro experimento foi instalado em campo num esquema constituído de quadrados concêntricos, delineado especialmente para os objetivos deste estudo. Os cinco primeiros quadrados, do centro para borda, formaram a fonte de pólen, onde sementes do cultivar tolerante ao glifosato foram semeadas. À sua volta, foi semeado o cultivar sensível. Na fase de maturação, estágio R8, foram colhidas nas quatro direções a partir do centro, fileiras correspondentes aos lados dos quadrados, em distâncias variadas da fonte de pólen: 0,5; 1,0; 2,0; 4,0 e 8,0 metros. Das fileiras colhidas, amostras de 900 sementes por fileira foram avaliadas por meio do bioensaio de germinação de sementes em substrato umedecido com solução 0,06% de glifosato, metodologia adotada a partir dos estudos realizados sobre os bioensaios. Nesta análise, plântulas dotadas de traços indicativos de tolerância ao glifosato indicaram ocorrência de fecundação cruzada. Os dados obtidos foram analisados estatisticamente por meio de regressão linear com platô. Os resultados indicaram taxas de fecundação cruzada diferentes para as duas localidades mostrando que esta característica varia em função do ambiente. As maiores taxas de hibridação natural (1,27% em Florestal e 0,25% em Viçosa) ocorreram às menores distâncias. As taxas de fecundação cruzada aproximaram-se de zero às distâncias de 2,26 e 1,16m da fonte, para Florestal e Viçosa, respectivamente.
- Published
- 2006
28. Influence of seed size and water restriction on germination of soybean seeds and on early development of seedlings
- Author
-
Pereira, Welison Andrade, primary, Pereira, Sara Maria Andrade, additional, and Dias, Denise Cunha Fernandes dos Santos, additional
- Published
- 2013
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29. Fluxo gênico recíproco entre cultivares de soja convencional e geneticamente modificada
- Author
-
Pereira, Welison Andrade, primary, Sávio, Filipe Luis, additional, Dias, Denise Cunha Fernandes dos Santos, additional, Cruz, Cosme Damião, additional, and Borém, Aluízio, additional
- Published
- 2012
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30. Ajuste de metodologias para a identificação de cultivares de soja quanto à tolerância ao glifosato
- Author
-
Pereira, Welison Andrade, primary, Lisboa, Suzana Patrícia, additional, Dias, Denise Cunha Fernandes dos Santos, additional, Alvarenga, Eveline Mantovani, additional, and Borém, Aluízio, additional
- Published
- 2009
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31. Influência da disposição, número e tamanho das sementes no teste de comprimento de plântulas de soja
- Author
-
Pereira, Welison Andrade, primary, Sávio, Filipe Luis, additional, Borém, Aluízio, additional, and Dias, Denise Cunha Fernandes dos Santos, additional
- Published
- 2009
- Full Text
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32. Fluxo gênico em soja geneticamente modificada e método para sua detecção
- Author
-
Pereira, Welison Andrade, primary, Giúdice, Marcos Paiva Del, additional, Carneiro, José Eustáquio de Souza, additional, Dias, Denise Cunha Fernandes dos Santos, additional, and Borém, Aluízio, additional
- Published
- 2007
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33. AJUSTE DE METODOLOGIAS PARA A IDENTIFICAçÃO DE CULTIVARES DE SOJA QUANTO À TOLERÂNCIAAO GLIFOSATO.
- Author
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PEREIRA, WELISON ANDRADE, LISBOA, SUZANA PATRÍCIA, DOS SANTOS DIAS, DENISE CUNHA FERNANDES, ALVARENGA, EVELINE MANTOVANI, and BORÉM, ALUÍZIO
- Subjects
- *
SOYBEAN , *CULTIVATORS , *AGRICULTURAL implements , *GLYPHOSATE , *ISOPROPYLAMINE , *BIOLOGICAL assay , *SEEDS , *SOIL moisture - Abstract
Bioassays constitute a practical and efficient alternative for detection of genetically modified soybean seeds (GM) tolerant to gliphosate. However, their use should be analyzed in the identification of seeds when the lot is of GM soybean, in other words, when seeds of conventional soybean are the minority. The objectives of this study were to adjust the methodology of two bioassays to detect GM soybean seeds and to test the best protocols, one of each bioassay, in the detection and quantification of simulated mixtures, containing contrasting genotypes for tolerance to the herbicide. In the bioassays, the following were tested: three moistures of the substratum paper (2.0; 2.5 and 3.0 times the dry weight), five solutions (0; 0.01; 0.03; 0.06 and 0.12%) in the method moistened paper with herbicide and four solutions (0; 0.3; 0.6 and 1.2 %) in the pre-soak seed method. The moisture 3.0 and solution 0.03 % constituted the most efficient protocol for detection in the moistened paper method. The moisture 2.0 and solution 0.3 % stood out in the pre-soak seed method. It was more practical and quicker to detect tolerant seedlings than sensitive seedlings in both tests. In samples with higher contamination rates, it was easier to detect and more difficult to precisely quantify the mixtures. The mistakes were relatively rare considering the successes. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2009
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34. Recurrent selection and PvPGIP family gene expression for resistance to white mold in common bean
- Author
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Vasconcellos, Renato Coelho de Castro, Santos, João Bosco dos, Pereira, Welison Andrade, Pereira, Helton Santos, Torga, Paula Pereira, and Bruzi, Adriano Teodoro
- Subjects
Feijão – Doenças e pragas ,Mofo branco ,Feijão – Melhoramento genético ,White mold ,Sclerotinia sclerotiorum ,Beans – Disseases and pests ,Genética Vegetal ,Beans – Breeding ,Phaseolus vulgaris - Abstract
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) O mofo branco, causado pelo fungo Sclerotinia sclerotiorum (Lib.) de Bary, é uma doença de grande impacto sobre a cultura do feijoeiro, pois limita o potencial de produção e reduz a qualidade das sementes e vagens. Os mecanismos de resistência das plantas são devidos a resistência fisiológica e a mecanismos de escape, que incluem a morfologia, arquitetura ereta, porosidade do dossel e precocidade da planta. Os objetivos deste trabalho foram obter progênies de feijoeiro com maiores níveis de resistência fisiológica ao mofo branco, grãos do tipo carioca e porte ereto, por meio da seleção recorrente; verificar a eficiência na seleção destes caracteres; e validar a expressão de genes da família PvPGIP para a resistência ao mofo branco. Na seleção recorrente a recombinação foi realizada pelo esquema dialélico parcial ou cônico, a seleção foi massal em S0 e as progênies foram avaliadas e selecionadas até às gerações S0:3 (ciclo X) e S0:2 (ciclo XI), juntamente com as mais resistentes do ciclo IX para se estimar o ganho com a seleção. Os caracteres avaliados foram resistência ao mofo branco pelo método do Straw test, porte e tipo de grãos. A seleção recorrente possibilitou ganho na resistência ao mofo branco de aproximadamente 6% por ciclo de seleção e foi eficiente para obtenção de progênies com alto nível de resistência ao mofo branco, grãos do tipo carioca e porte ereto adaptadas às condições de cultivo do Sul de Minas Gerais. Para a análise de expressão dos quatro genes da família PvPGIP foram avaliados 4 linhagens de feijão, sendo 2 linhagens do programa de seleção recorrente para mofo branco (50/5 e 84/6), 1 linhagem resistente e não adaptada às condições brasileiras (Cornell 605) e uma linhagem suscetível (Corujinha). Foram utilizados dois isolados de mofo branco, sendo a expressão destes genes avaliada em 0, 1, 2, 3 e 5 dias após a inoculação. Plantas inoculadas com o isolado menos agressivo (UFLA 03) não apresentaram diferença significativa da expressão relativa de nenhum dos genes analisados, sendo considerado pouco eficiente na discriminação dos genótipos. Já com o isolado mais agressivo (UFLA 116) todos os genes da família foram diferencialmente expressos, mostrando relação com a resistência ao mofo branco e apresentaram um incremento até o terceiro dia após a inoculação. As duas progênies selecionadas apresentaram nível de resistência semelhante à Cornell 605. Portanto, a incorporação desses genes pode contribuir para melhorar ainda mais os níveis de resistência das linhagens derivadas da seleção recorrente e podem ser utilizados para o desenvolvimento de marcadores moleculares visando a seleção assistida para resistência do feijoeiro ao mofo branco. The white mold, caused by the fungus Sclerotinia sclerotiorum (Lib.) de Bary, is a disease with a great impact on the common bean crop, because it limits the production potential and reduces the quality of the seeds and pods. Plant resistance mechanisms are due to physiological resistance and escape mechanisms, which include morphology, upright architecture, canopy porosity and plant precocity. The objectives of this work were to obtain bean progenies with higher levels of physiological resistance to white mold, carioca grain type and upright habit, through recurrent selection; verify the efficiency in the selection of these characters and validate the gene expression of the PvPGIP family for white mold resistance. In the recurrent selection the recombination was performed by the partial or conical diallel scheme, the massal selection was in S0 and the progenies were evaluated and selected until the generations S0: 3 (cycle X) and S0: 2 (cycle XI), together with the most resistants of the IX cycle to estimate the gain with selection. The evaluated characters were resistance to white mold by the straw test method, plant habit and grain type. Recurrent selection allowed gains in the resistance to white mold of approximately 6% per cycle and was efficient to obtain progenies with high resistance to white mold, grains of the carioca type and upright habit, adapted to the conditions of South of Minas Gerais. For the expression analysis of the PvPGIP gene family, 4 lines of common bean were evaluated, 2 lines from the recurrent selection program for white mold (50/5 and 84/6), 1 resistant line not adapted to the Brazilian conditions (Cornell 605) and a susceptible line (Corujinha). Two white mold isolates were used and the expression of these genes being evaluated at 0, 1, 2, 3 and 5 days after inoculation. The less aggressive isolate (UFLA 03) did not present significant difference in the relative expression of any of the analyzed genes, being considered inefficient in discriminating the genotypes. With the most aggressive isolate (UFLA 116) all the genes of the family were differentially expressed, they are related to resistance to white mold and showed an increase up to the third day after inoculation. The two progenies selected presented resistance level similar to the Cornell 605. Therefore, the incorporation of these genes can contribute to further improve the resistance levels of the lines derived from recurrent selection and can be used for the development of molecular markers aiming the assisted selection for common bean resistance to white mold.
- Published
- 2017
35. Analysis of the PAM2-like protein family in soybean: functional divergence in the ERD15-like subfamily
- Author
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Silva, Lucas Araújo Castro e, Pereira, Welison Andrade, Bevitori, Rosângela, Fontes, Elizabeth Pacheco Batista, and Deguchi, Michihito
- Subjects
Plantas - Estresse hídrico ,ERD15 ,Proteins - analysis ,Arroz ,Soja ,PAM2 ,Proteínas - Análises ,Soybeans ,Rice ,Plants - Water stress ,CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOQUIMICA::BIOLOGIA MOLECULAR [CNPQ] - Abstract
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico The PAM2 motif is largely distributed in eukaryotic proteins and was initially identified as a binding site for poly (A) binding proteins (PABP), which play a role in RNA metabolism. Despite the PAM2 motif relevance, a comprehensive analysis of its occurrence in proteins of the plant kingdom is still absent. In the present study, the PAM2-like protein family was phylogenetically characterized in Arabidopsis, soybean and rice. Totally, 19 PAM2-like sequences were identified in the Arabidopsis genome, while 31 members of the family were found in soybean and 22 members in rice. The PAM2-like family was subdivided in 7 subfamilies (A-G) based on the conservation of the sequences and in the structure of the motifs. Among them, the ERD15-like subfamily, whose name derives from the ERD15 (Early Responsive to Dehydration 15) Arabidopsis protein, originally identified by its rapid induction in response to dehydration, was characterized extensively, concerning its phylogeny, dehydration responsiveness and cellular function. Microarray data from stressed plants shows that both members of the ERD15-like subfamily in Arabidopsis, AtERD15 (AT2G41430) e AtERL15 (AT4G14270), are responsive to drought. The drought response profile of 4 of the 6 soybean ERD15-like subfamily members was also investigated. It was observed that the pair Glyma14g05980 and Glyma02g42860 is continuously induced as the stress progress, whereas the pair Glyma11g20940 and Glyma04g28560 is initially induced, but has a reduction on its expression level when the stress becomes more severe, indicating a possible functional divergence in the ERD15-like subfamily. The superexpression and the suppression of the AtERD15 gene were evaluated regarding to sensibility to ABA and tolerance to drought. A correlation between AtERD15 (AT2G41430) expression level and the germination rate of seeds in the presence of the phytohormone ABA was observed. Opposingly, a negative correlation was observed for the level of AtERD15 transcript and the root growth in plants stressed by PEG, as well as for the drought stress tolerance. The soybean, GmERD15-like (Glyma02g42860), and rice, OsERD15-like (Os07g46670), homologs shown partial phenotype complementation for ABA susceptibility during germination, as presented by AtERD15, but, on the contrary, promoted increased drought tolerance on stressed plants. Collectively, these results imply that the members of the ERD15-like family diverge in function. Under normal conditions, the proteins AtERD15, GmERD15-like and OsERD15-like are localized in the cytoplasm. Nonetheless, under osmotic stress, the subcellular localization profile of these proteins is modified, as they increase their concentration around the nucleus. The OsERD15-like protein (Os07g46670) was translocated to the nucleus under osmotic stress conditions. Under transient expression in tobacco leaves, the three proteins exhibited the same localization pattern, being present in the cytoplasm as well as in the nucleus, except in the nucleolus. Finally, it was demonstrated that the protein GmERD15-like (Glyma02g42860) is capable of binding to the promoters of the genes CDC2 (Glyma06g17640) and F-Box (Glyma13g43730) and that the superexpression of GmERD15-like in soybean protoplasts led the induction of both genes, in addition to DNAJ (Glyma14g31810). CDC2, DNAJ and F-Box are all induced by drought. These results indicate that GmERD15-like controls a selected group of genes induced by hydric stress. O motivo PAM2 está largamente distribuído em proteínas eucarióticas e foi incialmente identificado como um sítio de ligação a proteínas que se ligam à cauda poli (A) (PABP), que participam do metabolismo de RNA. Apesar da relevância do motivo PAM2, uma análise compreensiva de sua ocorrência em proteínas do reino vegetal ainda não foi conduzida. Nesta investigação, a família das proteínas PAM2-like foi caracterizada filogeneticamente em Arabidopsis, soja e arroz. Um total de 19 sequências PAM2-like foi identificado no genoma de Arabidopsis, enquanto que em soja foram encontrados 31 membros e em arroz 22 membros da família. A família PAM2-like foi subdividida em 7 subfamílias (A-G) baseado na conservação de sequências e na estrutura de motivos característicos. Entre elas, a subfamília ERD15-like, cujo nome foi derivado da proteína ERD15 (Early Responsive to Dehydration 15) de Arabidopsis, identificada originalmente por sua rápida indução em resposta à desidratação, foi caracterizada extensivamente, em relação à sua filogenia, responsividade à seca e função celular. Foi observado em dados de micro arranjo de plantas estressadas que os dois membros da subfamília ERD15-like de Arabidopsis, AtERD15 (AT2G41430) e AtERL15 (AT4G14270), são responsivos à seca. O perfil de resposta ao estresse causado pela seca de 4 dos 6 membros da subfamília de soja também foi avaliado, sendo que o par Glyma14g05980 e Glyma02g42860 progressão do estresse, ao é continuamente induzido com a passo que o par Glyma11g20940 e Glyma04g28560 é inicialmente induzido, mas tem seu nível de expressão reduzido no estresse mais severo, indicando uma possível divergência funcional na subfamília ERD15-like. A superexpressão e supressão do gene AtERD15 foram avaliadas quanto à sensibilidade à ABA e tolerância à seca. Foi observada uma correlação entre o nível de expressão de AtERD15 (AT2G41430) e a capacidade de germinação de sementes na presença do fito hormônio ABA. Contrariamente, uma correlação negativa foi observada entre o nível de transcrito de AtERD15 e o crescimento de raiz em plantas estressadas por PEG, assim como a tolerância a estresse causado pela seca. Os homólogos da soja, GmERD15-like (Glyma02g42860), e de arroz, OsERD15- like (Os07g46670) complementaram parcialmente o fenótipo de suscetibilidade à ABA durante a germinação apresentado por AtERD15, mas ao contrário de AtERD15, promoveram um aumento da tolerância à seca em plantas estressadas. Coletivamente, estes resultados implicam que os membros da família ERD15 divergem funcionalmente. As proteínas AtERD15, GmERD15- like e OsERD15-like são localizadas no citoplasma em condições normais. Entretanto, em resposta a estresse osmótico o perfil de localização das proteínas é modificado, sendo concentradas ao redor do núcleo. A proteína OsERD15-like (Os07g46670) foi translocada para o núcleo em condições de estresse osmótico. Em expressão transiente em folhas de tabaco, todas três proteínas exibiram o mesmo padrão de localização, estando presentes tanto no citoplasma, como no núcleo, com exclusão do nucléolo. Por fim, foi demonstrado que a proteína GmERD15-like (Glyma02g42860) tem a capacidade de ligação aos promotores dos genes CDC2 (Glyma06g17460) e F- Box (Glyma13g43730) e que sua superexpressão de GmERD15-like em protoplastos de soja levou a indução da expressão de ambos, além do gene DNAJ (Glyma14g31810). Tanto CDC2, como DNAJ e F-Box são induzidos por seca. Estes resultados indicam que GmERD15-like controla um conjunto seleto de genes induzidos por estresse hídrico.
- Published
- 2014
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