1. Article
- Author
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Guillaume Pavlovic, Bernard Decaris, Frédéric Choulet, Gérard Guédon, Alexandre Toulmay, and Vincent Burrus
- Subjects
0303 health sciences ,03 medical and health sciences ,Streptococcus thermophilus ,biology ,030306 microbiology ,Streptococcus salivarius subsp thermophilus ,Dairy industry ,biology.organism_classification ,Molecular biology ,Modular evolution ,030304 developmental biology ,Food Science ,Microbiology - Abstract
Structure et evolution d'une famille d'elements integratifs potentiellement conjugatifs ou mobilisables de Streptococcus thermophilus. Les elements integratifs conjugatifs (ICEs) s'excisent par recombinaison site-specifique sous forme circulaire, se transferent par conjugaison puis s'integrent dans la bacterie receptrice. L'element ICESt1 de Streptococcus thermophilus CNRZ368 (34,7 kb) s'integre et s'excise par recombinaison site-specifique. Par ailleurs, il code un systeme de conjugaison putatif apparente de facon lointaine a eelui de Tn916 d'Enterococcus faecalis et constitue donc un ICE putatif. Quatre elements apparentes a ICESt1 sont integres au meme site que lui chez sept souches de S. thermophilus. L'un des elements, ICESt3 est probablement un ICE. Les trois autres (CIMEs) deriveraient d'un ICE par deletion des modules de conjugaison et de recombinaison. Ces elements codent des fonctions non impliquees dans le transfert comme des systemes de restriction-modification. Chacun d'entre eux presente une structure chimerique resultant de l'acquisition de modules d'origines differentes. L'analyse de leur sequence indique qu'ils sont impliques dans des transferts horizontaux entre S. thermophilus et diverses especes de bacteries lactiques alimentaires ou pathogenes. ACIME308 a echange des modules de restriction-modification et de resistance aux ions Cd ++ avec des plasmides. CIME19258 a acquis un module de resistance aux ions Cd ++ par integration d'un ICE apparente a Tn916 dans un CIME. La recombinaison site-specifique entre un site interne d'ICESt1 de type attL et le site attR provoque l'excision de la partie droite d'ICESt1 qui constituerait elle-meme un ICE, ICESt2. ICESt1 serait ainsi apparu par accretion d'un CIME et d'ICESt2. CIME302, ICESt2 et ICESt3 seraient egalement apparus par accretion site-specifique d'ICEs et de CIMEs et/ou mobilisation de CIMEs par des ICEs. Un ICE s'integrerait par recombinaison site-specifique dans le site attR d'un CIME formant ainsi un element composite (CIME-ICE) par accretion. Celui-ci s'exciserait par recombinaison site-specifique puis se transfererait par conjugaison.
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- 2003
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