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Resumen Existe una gran variedad de marcadores utiles tanto en el diagnostico como en el seguimiento de la enfermedad inflamatoria intestinal. Clasicamente se han utilizado los serologicos, ampliamente distribuidos y accesibles, pero en los ultimos anos han cobrado importancia los fecales, en especial la calprotectina fecal, por haber demostrado mayor precision a la hora tanto de establecer la sospecha de la enfermedad como de predecir la curacion mucosa o la persistencia de actividad inflamatoria. La calprotectina fecal muestra buena capacidad para predecir estudios endoscopicos patologicos, pero tiene una especificidad limitada ya que puede alterarse en otros cuadros digestivos con sintomas similares. La calprotectina fecal presenta mayor precision cuando se asocia a otros parametros, en especial a la proteina C reactiva, y a escalas clinicas de actividad inflamatoria. Finalmente, hay multiples marcadores de nueva generacion, serologicos y fecales, de los que hay escasa evidencia, aunque algunos han mostrado resultados prometedores en diferentes estudios.