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7 results on '"Geigl, Eva-Maria"'

1. Service, expertise et archéométrie : état d’une réflexion collégiale

Author

Balasse, Marie, Bellot-Gurlet, Ludovic, Dillmann, Philippe, Geigl, Eva-Maria, Jacob, Jérémy, Lebon, Matthieu, Le Hô, Anne-Solenn, Lefèvre, Jean-Claude, Leroyer, chantal, Mathé, Vivien, Merle, Valérie, Mirabaud, Sigrid, Reiche, Ina, Archéozoologie, archéobotanique : sociétés, pratiques et environnements (AASPE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN), De la Molécule aux Nanos-objets : Réactivité, Interactions et Spectroscopies (MONARIS), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Archéomatériaux et Prévision de l'Altération (LAPA - UMR 3685), Nanosciences et Innovation pour les Matériaux, la Biomédecine et l'Energie (ex SIS2M) (NIMBE UMR 3685), Institut Rayonnement Matière de Saclay (IRAMIS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut Rayonnement Matière de Saclay (IRAMIS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Institut de Recherches sur les Archéomatériaux (IRAMAT), Université de Technologie de Belfort-Montbeliard (UTBM)-Université d'Orléans (UO)-Université Bordeaux Montaigne-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Jacques Monod (IJM (UMR_7592)), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP), Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement [Gif-sur-Yvette] (LSCE), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - 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Lyon 2 (UL2), Centre de Recherche en Archéologie, Archéosciences, Histoire (CReAAH), Université de Nantes - UFR Histoire, Histoire de l'Art et Archéologie (UFR HHAA), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ministère de la Culture (MC)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Le Mans Université (UM), LIttoral ENvironnement et Sociétés - UMRi 7266 (LIENSs), Université de La Rochelle (ULR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National d'Histoire de l'Art (INHA), INHA, New AGLAE - CNRS/Ministère de la Culture/ENSCP (new AGLAE), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), comité de pilotage du réseau CAI-RN, Compétences Archéométriques Interdisciplinaires - Réseau National, de la Mission pour les initiatives transverses et interdisciplinaires - 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Subjects
Service, [SHS.ARCHEO]Humanities and Social Sciences/Archaeology and Prehistory, [CHIM.ANAL]Chemical Sciences/Analytical chemistry, Archeometry, [CHIM.MATE]Chemical Sciences/Material chemistry, Expertise
Abstract

International audience; Following a thematic day on “Service and expertise through archaeological and conservation sciences” organised by the CAI-RN network (Competences Archéométriques Interdisciplinaires - Réseau National, MITI CNRS), the members of the Steering Committee of the CAI-RN network who took part in this workshop wished to bring together and clarify in this text a certain number of the points raised during the discussion. In particular, it gives a brief definition of the terms ‘service’ and ‘expertise’ and presents the different types of structures linked to the archaeometric community and carrying out these activities. This proposal for an initial analysis of the current situation also suggests a number of thought-provoking impulses.; Suite à une journée thématique « Service et expertise par les sciences archéologiques et de la conservation » organisée par le réseau CAI-RN (Compétences Archéométriques Interdisciplinaires – Réseau National, MITI CNRS) les membres du Comité de Pilotage du réseau CAI-RN ayant participé à cette journée ont souhaité rassembler et clarifier dans ce texte un certain nombre des points évoqués lors des discussions. Ceci en donnant notamment une brève définition des termes « service » et « expertise » et en présentant les différents types de structures liées à la communauté archéométrique et réalisant ces activités. Cette proposition d’une première analyse de la situation actuelle propose aussi quelques pistes de réflexion.

Published
2021
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2. The pre- and protohistory of Europe revealed by paleogenomics

Author

Geigl, Eva-Maria, Institut Jacques Monod (IJM (UMR_7592)), and Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
Âge du Bronze, [SDV.GEN.GPO]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Populations and Evolution [q-bio.PE], [SHS.ARCHEO]Humanities and Social Sciences/Archaeology and Prehistory, Néanderthaliens, Dénisoviens, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], [SHS.ANTHRO-BIO]Humanities and Social Sciences/Biological anthropology, Néolithique, métissage, paléogénomique, migration, ADN ancien, peuplement
Abstract

International audience; Paleogenomics makes possible to follow human migrations by DNA analysis of human tissues or teeth and thus the discovery of Denisovans, contemporaries of Neanderthals, mixed with homo sapiens.; La paléogénomie permet de suivre les migrations humaines par l’analyse ADN des tissus humains ou des dents et ainsi la découverte des Dénisoviens, contemporains des Néandertaliens, métissés avec l’homo sapiens.

Published
2021
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3. PCR and paleogenetics: for best and for worst

Author

Geigl, Eva-Maria, Institut Jacques Monod (IJM (UMR_7592)), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP)

Subjects
PCR, [SDV.GEN.GPO]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Populations and Evolution [q-bio.PE], [SHS.ARCHEO]Humanities and Social Sciences/Archaeology and Prehistory, [SHS.ANTHRO-BIO]Humanities and Social Sciences/Biological anthropology, paléogénomique, [SDV.BBM.BM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology, ADN ancien
Abstract

International audience; In the middle of the 1980s, extraction and analysis of DNA preserved in biologicalremains of the past yielded the first results, giving rise to a new scientific field, paleogenetics.Its first successes were obtained thanks to the advent of PCR. Yet, the degraded nature ofancient DNA and the power of PCR also led to numerous artefacts owing to contamination withmodern DNA that have almost killed this new field at the end of the 1990s. Strict experimentalprocedures and the development of methods of decontamination and contamination preventionallowed the revival of the field. Recently, genome-wide analyses; Au milieu des années 1980, l’extraction et l’analyse de l’ADN préservé dans des ves-tiges biologiques du passé ont donné des premiers résultats, entérinant la naissance du domainede la paléogénétique. C’est grâce à l’invention de la PCR que cette nouvelle discipline a puévoluer et récolter ses premiers succès. Néanmoins, la nature dégradée de l’ADN ancien et lapuissance de la méthode de la PCR ont aussi abouti à de nombreux artefacts dus à la conta-mination avec l’ADN moderne qui ont failli tuer ce nouveau domaine à la fin des années 1990.L’application de procédures expérimentales rigoureuses et le développement de méthodes dedécontamination et de prévention des contaminations ont ensuite permis la renaissance de lapaléogénétique avant que le séquenc¸age massivement parallèle n’ait rendu possible l’obtentiond’information génomique d’individus anciens et l’essor du domaine.

Published
2021
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4. Using palaeogenetics to unravel the impact of humans on animal populations in the past

Author

Geigl, Eva-Maria, Grange, Thierry, Institut Jacques Monod (IJM (UMR_7592)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), J. Peters, G. McGlynn & V. Goebel, and Geigl, Eva-Maria

Subjects
potential, wild versus domestic species, [SDV.BID.EVO]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Populations and Evolution [q-bio.PE], [SHS.ANTHRO-BIO]Humanities and Social Sciences/Biological anthropology, Wild-vs. Haustiere, [SDV.GEN.GA] Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics, genetic diversity, genetische Vielfalt, Paläogenetik, [SHS.ANTHRO-BIO] Humanities and Social Sciences/Biological anthropology, [SDV.GEN.GA]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics, [SDV.BID.EVO] Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Populations and Evolution [q-bio.PE], Genfluss, gene flow, limits, Palaeogenetics, Grenzen
Abstract

Mithilfe der Paläogenetik können potentiell sowohl die einstige genetische Vielfalt von Arten und/oder Populationen als auch evolutionäre Prozesse aufgedeckt werden, die andernfalls verborgen blieben, verließe man sich nur auf moderne genetische Daten. Nach einer generellen Darstellung von Grenzen und Potential der Paläogenetik präsentieren wir eine Reihe von Studien aus unserem Labor, die es erlauben, die Entwicklung der genetischen Vielfalt von diversen Tierarten seit dem Ende des Pleistozäns vergleichend zu betrachten - Spezies, die jeweils unterschiedliche Bindungen zum Menschen besaßen, entweder im Zuge der Domestikation oder durch die Vermeidung derselben. Wir zeigen auf, dass obwohl in den Domestizierungsprozess ursprünglich nur ein Teil einer größeren Wildtierpopulation einbezogen wurde, durch den regulären Genfluss von den Wild- zu den Haustieren letztgenannte eine höhere genetische Diversität innehaben als die Wildpopulationen. Denn viele davon haben während des Holozäns eine durch den Menschen verursachte Schrumpfung ihrer Bestände erfahren., Palaeogenetics has the potential to reconstruct past genetic diversity of species and/or populations and to reveal evolutionary processes that would otherwise remain hidden when relying only on modern genetic data. After a general presentation of the limits and potentials of palaeogenetics, we summarize a series of studies from our lab that allow us to compare the evolution of genetic diversity of various animal species since the end of the Pleistocene, that have had different relationships with humans with respect to their domestication or avoidance therefrom. We show that, even though domestication initially involved only a subset of a larger wild population, regular gene flow from wild to domestic animals allowed the latter to retain a higher genetic diversity than related wild populations many of which experienced a severe, human-driven population reduction during the Holocene.

Published
2019

5. Analysis of Ancient DNA in Microbial Ecology

Author

Gorgé , Olivier, Bennett , E Andrew, Massilani , Diyendo, Daligault , Julien, Pruvost , Melanie, Geigl , Eva-Maria, Grange , Thierry, Institut Jacques Monod ( IJM ), Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut Jacques Monod (IJM (UMR_7592)), and Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
DNA, Bacterial, Ancient DNA, Single-stranded library, Fossils, High-Throughput Nucleotide Sequencing, Paleontology, Genomics, Double-stranded library, humanities, Genome, Microbial, [SDV.GEN.GH]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Human genetics, Contamination, Illumina, NGS, Animals, Humans, IonTorrent, [ SDV.GEN.GH ] Life Sciences [q-bio]/Genetics/Human genetics, Soil Microbiology
Abstract

International audience; The development of next-generation sequencing has led to a breakthrough in the analysis of ancient genomes, and the subsequent genomic analyses of the skeletal remains of ancient humans have revolutionized the knowledge of the evolution of our species, including the discovery of a new hominin, and demonstrated admixtures with more distantly related archaic populations such as Neandertals and Denisovans. Moreover, it has also yielded novel insights into the evolution of ancient pathogens. The analysis of ancient microbial genomes allows the study of their recent evolution, presently over the last several millennia. These spectacular results have been attained despite the degradation of DNA after the death of the host, which results in very short DNA molecules that become increasingly damaged, only low quantities of which remain. The low quantity of ancient DNA molecules renders their analysis difficult and prone to contamination with modern DNA molecules, in particular via contamination from the reagents used in DNA purification and downstream analysis steps. Finally, the rare ancient molecules are diluted in environmental DNA originating from the soil microorganisms that colonize bones and teeth. Thus, ancient skeletal remains can share DNA profiles with environmental samples and identifying ancient microbial genomes among the more recent, presently poorly characterized, environmental microbiome is particularly challenging. Here, we describe the methods developed and/or in use in our laboratory to produce reliable and reproducible paleogenomic results from ancient skeletal remains that can be used to identify the presence of ancient microbiota.

Published
2015
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6. Multiplicité des symbioses : du parasitisme au mutualisme

Author

Achouak, Wafa, Bertin, Philippe, Capy, Pierre, Debroas, Didier, Dedeine, Franck, Deguilloux, Marie-France, Douady, Christophe Jean, Dubow, Michael, Faure, Denis, Geigl, Eva-Maria, Joly, Dominique, Jumas-Bilak, Estelle, Gall, Line Le, Miaud, Claude, Pelletier, Eric, Pommier, Thomas, Pompanon, François, Salamitou, Sylvie, Sime-Ngando, Télesphore, Simon, Jean-Christophe, Vandenkoornhuyse, Philippe, Troccaz, Olivier, Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Université de Rennes (UR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), and Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
[SDE.BE] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2015

7. The palaeogenetics of cat dispersal in the ancient world

Author

Laura Llorente, Ronny Decorte, Thierry Grange, Eva-Maria Geigl, Nikolai Spassov, Vedat Onar, Alison Crowther, Bea De Cupere, Olivier Putelat, Adrian Bălăşescu, Mary E. Prendergast, Hijlke Buitenhuis, Jacqueline Studer, Norbert Benecke, Hervé Monchot, Jwana Chahoud, Arturo Morales-Muñiz, Julien Daligault, Joris Peters, Silvia Guimaraes, Adina Boroneant, Eréndira M. Quintana Morales, Nicole Boivin, Wim Van Neer, Claudio Ottoni, Ursula Wierer, Nina Manaseryan, Cornelia Becker, Marta Osypińska, Geigl, Eva-Maria, and Archaeology of Northwestern Europe

Subjects
0301 basic medicine, EUROPE, Population genetics, Zoology, [SDV.GEN.GA] Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics, Biology, Settore BIO/08, 03 medical and health sciences, ancient DNA, domestication, cats, [SDV.BID.EVO] Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Populations and Evolution [q-bio.PE], Allele, Domestication, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, [SHS.ARCHEO] Humanities and Social Sciences/Archaeology and Prehistory, CONSTRUCTION, Ecology, Human evolutionary genetics, DNA, 030104 developmental biology, Ancient DNA, DOMESTICATION, EAST, Evolutionary biology, Biological dispersal, [SDV.BA.ZV] Life Sciences [q-bio]/Animal biology/Vertebrate Zoology, Gene pool
Abstract

The cat has long been important to human societies as a pest-control agent, object of symbolic value and companion animal, but little is known about its domestication process and early anthropogenic dispersal. Here we show, using ancient DNA analysis of geographically and temporally widespread archaeological cat remains, that both the Near Eastern and Egyptian populations of Felis silvestris lybica contributed to the gene pool of the domestic cat at different historical times. While the cat's worldwide conquest began during the Neolithic period in the Near East, its dispersal gained momentum during the Classical period, when the Egyptian cat successfully spread throughout the Old World. The expansion patterns and ranges suggest dispersal along human maritime and terrestrial routes of trade and connectivity. A coat-colour variant was found at high frequency only after the Middle Ages, suggesting that directed breeding of cats occurred later than with most other domesticated animals.

Published
2017

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