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National audience; The term “chromosome painting” widely implies painting of differential chromosome segments with sequence specific probes based on the technique of in situ molecular hybridization. Development of fluorescence in situ hybridization (FISH), further enhanced sensitivity and versatility of in situ hybridization procedures. Despite recent development and application of FISH in plant genome analysis, this technology remains unfamiliar to most coffee scientists. Here we report through of different examples, the potential of FISH technique as a tool for genome analysis in coffee. We investigated the presence of alien chromatin in interspecific hybrids between C. arabica x C. canephora as well as in one C. arabica line introgressed from C. liberica. Further, we demonstrated that it is possible to identify one specific chromosome on the whole genome, despite the morphological similarity between coffee chromosomes. Overall, our results illustrate how molecular cytogenetics approach would provide complementary information for genetic mapping studies based on molecular markers

International audience; A total of 26 strains, including 15 strains isolated from garlic plants with the typical symptoms of 'Café au lait' disease and 11 strains isolated from diseased or healthy rice seeds and sheaths infested by Pseudomonas fuscovaginae, were compared with 70 type or reference strains of oxidase-positive pathogenic or non-pathogenic fluorescent pseudomonads. The strains were characterized by using a polyphasic taxonomic approach. Numerical taxonomy of phenotypic characteristics showed that the garlic and rice strains were related to each other. However, they clustered into separate phenons, distinct from those of the other strains tested, and were different in several nutritional tests. On the basis of DNA-DNA hybridization, the garlic and rice strains constituted two distinct DNA hybridization groups, indicating that they belonged to separate species. The two groups of strains were also well differentiated by siderotyping. Garlic strains were pathogenic to garlic plants and either weakly pathogenic or non-pathogenic on rice; rice strains were either weakly pathogenic or non-pathogenic on rice and non-pathogenic on garlic. A phylogenetic analysis of 16S rRNA gene sequences confirmed that the two groups of strains belonged to the y-Proteobacteria and to the genus Pseudomonas. The names Pseudomonas salomonii sp. nov. and Pseudomonas palleroniana sp. nov. are respectively proposed for the garlic strains and the rice strains. The type strains are P. salomonii CFBP 2022(T) ( = ICMP 14252(T) = NCPPB 4277(T)) and P. palleroniana CFBP 4389(T) (= ICMP 14253(T) = NCPPB 4278(T))

Not available, Trois types de gènes codent pour les chaines lourdes(IGH) et les chaines légères kappa(IGK) et lambda(IGL) des immunoglobulines. Le réarrangement de ces gènes est obligatoire pour qu'ils puissent s'exprimer. La chronologie de ce réarrangement au cours de la différenciation des lymphocytes b implique d'abord les gènes IGH, et ensuite, selon la littérature, une séquence d'essais successifs dans l'ordre IGK-IGK-IGL-IGL. A la suite de l'observation d'une inversion de la ration des chaines kappa: lambda dans les lymphocytes associes aux tissus muqueux et dans les liquides sécrétoires chez l'homme, nous avons entrepris d'analyser le réarrangement des gènes des chaines légères humaines dans les leucémies, les lymphocytes b amygdaliens et les lymphocytes b du sang périphérique. Les résultats obtenus, présentés dans ce mémoire, nous conduisent à proposer un modèle alternatif pour la chronologie de réarrangement des gènes codant pour les chaines légères, selon lequel le réarrangement de ces gènes peut commencer soit par IGK soit par IGL. Le deuxième gène qui réarrangerait serait également au choix IGK ou IGL. Cette hypothèse diffère des modèles traditionnels en ce qu'une cellule b peut réarranger ce gène IGL sans avoir nécessairement réarrangé les deux allèles IGK. Nos résultats indiquent enfin que la prédominance de cellules produisant des chaines légères lambda dans le malt peut résulter de l'utilisation préférentielle de ce réarrangement alternatif

Not available, Trois types de gènes codent pour les chaines lourdes(IGH) et les chaines légères kappa(IGK) et lambda(IGL) des immunoglobulines. Le réarrangement de ces gènes est obligatoire pour qu'ils puissent s'exprimer. La chronologie de ce réarrangement au cours de la différenciation des lymphocytes b implique d'abord les gènes IGH, et ensuite, selon la littérature, une séquence d'essais successifs dans l'ordre IGK-IGK-IGL-IGL. A la suite de l'observation d'une inversion de la ration des chaines kappa: lambda dans les lymphocytes associes aux tissus muqueux et dans les liquides sécrétoires chez l'homme, nous avons entrepris d'analyser le réarrangement des gènes des chaines légères humaines dans les leucémies, les lymphocytes b amygdaliens et les lymphocytes b du sang périphérique. Les résultats obtenus, présentés dans ce mémoire, nous conduisent à proposer un modèle alternatif pour la chronologie de réarrangement des gènes codant pour les chaines légères, selon lequel le réarrangement de ces gènes peut commencer soit par IGK soit par IGL. Le deuxième gène qui réarrangerait serait également au choix IGK ou IGL. Cette hypothèse diffère des modèles traditionnels en ce qu'une cellule b peut réarranger ce gène IGL sans avoir nécessairement réarrangé les deux allèles IGK. Nos résultats indiquent enfin que la prédominance de cellules produisant des chaines légères lambda dans le malt peut résulter de l'utilisation préférentielle de ce réarrangement alternatif