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[EN] The selection of a variety involves characterizing identifying physiological aspects of the fruit for its characterization and for its recognition by the consumer. To do this, it is necessary that in seed production crops or plants with the characteristics desired by the producer are selected to obtain a production that behaves sufficiently homogeneously. If there are no established criteria and different producers select the plants to obtain seeds, it may happen that the characteristics of the fruit differ in their identification. In addition, cultural care must be considered so that, in the event of possible pathologies during cultivation, they are not transmitted by seed. To prevent this from happening, it is advisable to disinfect the seeds to ensure that they are free of inoculum.

[ES] Las especies del género Cucurbita (calabazas y calabacines) se encuentran entre los 10 principales cultivos de hortalizas en todo el mundo. La gran diversidad morfológica que presenta este género, lo hace interesante para el desarrollo de nuevas variedades. Sin embargo, a pesar del potencial de mejora y económico que presenta este género, los programas desarrollados para estos cultivos han sido menos numerosos en comparación con los llevados a cabo para otras hortalizas. Las tecnologías NGS junto con la bioinformática han resultado dos potentes herramientas para el estudio de la genética vegetal y el desarrollo de los programas de mejora. Los avances en las tecnologías NGS han ayudado al descubrimiento de millones de polimorfismos, que son un recurso invaluable para la mejora asistida por marcadores. Así mismo, la identificación y el seguimiento de la variación genética son ahora tan eficaces y precisos que se pueden genotipar miles de SNPs dentro de grandes poblaciones. El análisis de la diversidad genética existente en las poblaciones vegetales, incluyendo tanto especies domesticadas como silvestres, es un paso esencial para el descubrimiento de nuevos genes de interés con el fin de introducirlos en futuros planes de mejora. En el presente trabajo se ha descrito la diversidad existente dentro de una población de 96 individuos de diferentes especies del género Cucurbita. A partir de la secuenciación de RNA de hoja joven se obtuvo un total de 702.735 SNPs de alta calidad los cuales se anotaron utilizando SnpEff, un programa de predicción de efectos capaz de predecir el impacto que puede ocasionar cada SNPs. La distribución de los SNPs a lo largo de los cromosomas no fue homogénea, pudiendo distinguir regiones ricas y pobres en polimorfismos. El porcentaje de heterocigosidad observado fue muy bajo, cera del 1%. Se identificaron polimorfismos en unos 24.674 genes (78% de los genes), siendo 32 el promedio de variantes encontradas por gen. Del total de polimorfismo

[ES] Uno de los objetivos más importantes de la mejora del siglo XXI es el desarrollo de cultivares que permitan mantener los rendimientos actuales en un escenario climático variable. En este contexto, las variedades tradicionales españolas presentan un gran potencial como fuente de caracteres adaptativos debido a la diversidad agroclimática presente en España. La colección más numerosa y antigua de variedades tradicionales españolas de trigo se conserva en el Centro Nacional de Recursos Fitogenéticos (CRF) del INIA. La colección activa está formada por 3.722 accesiones, de las que 1.551 son variedades españolas. De éstas, 767 son variedades tradicionales españolas de trigo blando (Triticum aestivum (L.) ssp. aestivum). Estas accesiones presentan una amplia variabilidad genética y resultan de gran interés en investigación y mejora. El manejo y utilización de una colección con un alto número de accesiones, en la que además existen algunos duplicados, es difícil debido al volumen de material que se debe analizar y el espacio y recursos que consume. Como forma de facilitar el acceso a la variabilidad existente e incentivar su uso en mejora, se crean colecciones nucleares, que deben incluir la mayor diversidad posible evitando redundancias, y, por lo general, tener un tamaño inferior al 20% de la colección original. A partir de la colección completa de variedades locales de trigo blando, en el CRF-INIA se realizó un cribado seleccionando 522 accesiones donde se excluyeron duplicados. Posteriormente, dentro de este grupo se seleccionaron 189 accesiones con objeto de cubrir la variabilidad morfológica existente. Este subconjunto de variedades se ha caracterizado a nivel fenotípico y molecular. Incluyendo caracteres agromorfológicos (cuantitativos y cualitativos), marcadores bioquímicos y genotipado a nivel genómico empleando la tecnología DArTseq. Este conjunto de datos constituye el punto de partida del presente trabajo donde se ha abordado la creación de la colección nu

[ES] Las especies del género Cucurbita (calabazas y calabacines) se encuentran entre los 10 principales cultivos de hortalizas en todo el mundo. La gran diversidad morfológica que presenta este género, lo hace interesante para el desarrollo de nuevas variedades. Sin embargo, a pesar del potencial de mejora y económico que presenta este género, los programas desarrollados para estos cultivos han sido menos numerosos en comparación con los llevados a cabo para otras hortalizas. Las tecnologías NGS junto con la bioinformática han resultado dos potentes herramientas para el estudio de la genética vegetal y el desarrollo de los programas de mejora. Los avances en las tecnologías NGS han ayudado al descubrimiento de millones de polimorfismos, que son un recurso invaluable para la mejora asistida por marcadores. Así mismo, la identificación y el seguimiento de la variación genética son ahora tan eficaces y precisos que se pueden genotipar miles de SNPs dentro de grandes poblaciones. El análisis de la diversidad genética existente en las poblaciones vegetales, incluyendo tanto especies domesticadas como silvestres, es un paso esencial para el descubrimiento de nuevos genes de interés con el fin de introducirlos en futuros planes de mejora. En el presente trabajo se ha descrito la diversidad existente dentro de una población de 96 individuos de diferentes especies del género Cucurbita. A partir de la secuenciación de RNA de hoja joven se obtuvo un total de 702.735 SNPs de alta calidad los cuales se anotaron utilizando SnpEff, un programa de predicción de efectos capaz de predecir el impacto que puede ocasionar cada SNPs. La distribución de los SNPs a lo largo de los cromosomas no fue homogénea, pudiendo distinguir regiones ricas y pobres en polimorfismos. El porcentaje de heterocigosidad observado fue muy bajo, cera del 1%. Se identificaron polimorfismos en unos 24.674 genes (78% de los genes), siendo 32 el promedio de variantes encontradas por gen. Del total de polimorfismo

[ES] Uno de los objetivos más importantes de la mejora del siglo XXI es el desarrollo de cultivares que permitan mantener los rendimientos actuales en un escenario climático variable. En este contexto, las variedades tradicionales españolas presentan un gran potencial como fuente de caracteres adaptativos debido a la diversidad agroclimática presente en España. La colección más numerosa y antigua de variedades tradicionales españolas de trigo se conserva en el Centro Nacional de Recursos Fitogenéticos (CRF) del INIA. La colección activa está formada por 3.722 accesiones, de las que 1.551 son variedades españolas. De éstas, 767 son variedades tradicionales españolas de trigo blando (Triticum aestivum (L.) ssp. aestivum). Estas accesiones presentan una amplia variabilidad genética y resultan de gran interés en investigación y mejora. El manejo y utilización de una colección con un alto número de accesiones, en la que además existen algunos duplicados, es difícil debido al volumen de material que se debe analizar y el espacio y recursos que consume. Como forma de facilitar el acceso a la variabilidad existente e incentivar su uso en mejora, se crean colecciones nucleares, que deben incluir la mayor diversidad posible evitando redundancias, y, por lo general, tener un tamaño inferior al 20% de la colección original. A partir de la colección completa de variedades locales de trigo blando, en el CRF-INIA se realizó un cribado seleccionando 522 accesiones donde se excluyeron duplicados. Posteriormente, dentro de este grupo se seleccionaron 189 accesiones con objeto de cubrir la variabilidad morfológica existente. Este subconjunto de variedades se ha caracterizado a nivel fenotípico y molecular. Incluyendo caracteres agromorfológicos (cuantitativos y cualitativos), marcadores bioquímicos y genotipado a nivel genómico empleando la tecnología DArTseq. Este conjunto de datos constituye el punto de partida del presente trabajo donde se ha abordado la creación de la colección nu

[ES] Uno de los objetivos más importantes de la mejora del siglo XXI es el desarrollo de cultivares que permitan mantener los rendimientos actuales en un escenario climático variable. En este contexto, las variedades tradicionales españolas presentan un gran potencial como fuente de caracteres adaptativos debido a la diversidad agroclimática presente en España. La colección más numerosa y antigua de variedades tradicionales españolas de trigo se conserva en el Centro Nacional de Recursos Fitogenéticos (CRF) del INIA. La colección activa está formada por 3.722 accesiones, de las que 1.551 son variedades españolas. De éstas, 767 son variedades tradicionales españolas de trigo blando (Triticum aestivum (L.) ssp. aestivum). Estas accesiones presentan una amplia variabilidad genética y resultan de gran interés en investigación y mejora. El manejo y utilización de una colección con un alto número de accesiones, en la que además existen algunos duplicados, es difícil debido al volumen de material que se debe analizar y el espacio y recursos que consume. Como forma de facilitar el acceso a la variabilidad existente e incentivar su uso en mejora, se crean colecciones nucleares, que deben incluir la mayor diversidad posible evitando redundancias, y, por lo general, tener un tamaño inferior al 20% de la colección original. A partir de la colección completa de variedades locales de trigo blando, en el CRF-INIA se realizó un cribado seleccionando 522 accesiones donde se excluyeron duplicados. Posteriormente, dentro de este grupo se seleccionaron 189 accesiones con objeto de cubrir la variabilidad morfológica existente. Este subconjunto de variedades se ha caracterizado a nivel fenotípico y molecular. Incluyendo caracteres agromorfológicos (cuantitativos y cualitativos), marcadores bioquímicos y genotipado a nivel genómico empleando la tecnología DArTseq. Este conjunto de datos constituye el punto de partida del presente trabajo donde se ha abordado la creación de la colección nu

Tesis por compendio, Xanthomonas arboricola pv. pruni is the causal agent of the bacterial spot disease of stone fruits, almond and ornamental species of Prunus. This pathogen constitutes one of the major threats to this group of species due to the economic losses it generates, and it is therefore considered as a quarantine organism in the European Union (EU). Recently, several outbreaks of the disease have been described in EU countries including Spain, where this pathogen has been detected in seven regions. Given the importance of this emerging disease and the lack of information about it, several aspects related to its diagnosis and epidemiology have been addressed in this work. Additionally, taxonomic characterization of three atypical Xanthomonas strains isolated from nectarines, causing similar symptoms to those produced by X. arboricola pv. pruni, have also been performed. First, a prototype of lateral flow immunoassay has been designed for the diagnosis of bacterial spot disease. It was developed by producing two polyclonal antibodies which were then combined with carbon nanoparticles and assembled on nitrocellulose strips. The specificity of the immunoassay was tested, obtaining a positive result with all the strains of X. arboricola pv. pruni analyzed. The limit of detection observed was 104 CFU/ml, which is sufficient for the detection of this pathogen in symptomatic samples. To demonstrate the accuracy and the reliability of the immunoassay, the prototype developed was used in the analysis of naturally infected field samples and healthy samples. Results were compared to those obtained by plate isolation and real time PCR, and a high correlation among techniques was observed. In a second step, as X. arboricola pv. pruni was first detected in Spain in 2002, and in subsequent years several outbreaks have occurred in 11 provinces, it was considered of interest to study the relationships between a collection of 239 Spanish strains of this pathogen originated from nurseries, orcha, Xanthomonas arboricola pv. pruni es el agente causal de la mancha bacteriana de los frutales de hueso, el almendro y especies ornamentales del género Prunus. Este patógeno constituye una de las mayores amenazas para estas especies debido a las pérdidas económicas que genera, por lo que está considerado como un organismo de cuarentena en la Unión Europea (UE). Se han descrito numerosos brotes en países miembros de la UE en los últimos años y entre ellos en España, donde ha sido detectada la bacteria en siete Comunidades Autónomas. Ante la importancia de esta enfermedad emergente y la carencia de información sobre la misma, en este trabajo se han abordado aspectos relacionados con su diagnóstico y epidemiología que permitirán ampliar nuestro conocimiento sobre ella. Además, también se ha realizado la caracterización taxonómica de tres cepas atípicas de Xanthomonas aisladas de nectarino, que causan síntomas similares a los producidos por X. arboricola pv. pruni. En primer lugar, se ha desarrollado un prototipo de tiras inmunológicas de flujo lateral para el diagnóstico de la mancha bacteriana. Para su diseño, se partió de dos anticuerpos policlonales que se combinaron con nanopartículas de carbono y se ensamblaron en membranas de nitrocelulosa. Se analizó la especificidad de las tiras, obteniendo resultado positivo con todas las cepas de X. arboricola pv. pruni ensayadas. El límite de detección obtenido con las tiras de flujo lateral fue de 104 UFC/ml, que es suficiente para la detección de esta bacteria en muestras sintomáticas. Para comprobar su fiabilidad y precisión, el prototipo desarrollado se utilizó en el análisis de muestras de campo naturalmente infectadas y muestras sanas, y los resultados se compararon con los obtenidos en el aislamiento en medio de cultivo y los de PCR en tiempo real, observándose una elevada correlación entre las tres técnicas. En segundo lugar, como X. arboricola pv. pruni se detectó por primera vez en España en 2002, y desde entonces se, Xanthomonas arboricola pv. pruni és l'agent causal de la taca bacteriana dels fruiters d'os, l'ametler i espècies ornamentals del gènere Prunus. Aquest patogen constitueix una de les majors amenaces per a aquestes espècies a causa de les pèrdues econòmiques que genera, per la qual cosa està considerat com un organisme de quarantena en la Unió Europea (UE). S'han descrit nombrosos brots en països membres de la UE en els últims anys i entre ells a Espanya, on ha sigut detectat el bacteri en set Comunitats Autònomes. Davant la importància d'aquesta malaltia emergent i la manca d'informació sobre aquest tema, en aquest treball s¿han abordat aspectos relacionats amb el seu diagnòstic i epidemiologia que permetran ampliar el nostre coneixement sobre ella. A més, també s'ha realitzat la caracterització taxonòmica de tres ceps atípics de Xanthomonas aïllats de nectariner, que causen símptomes similars als produïts per X. arboricola pv. pruni. En primer lloc, s'ha desenvolupat un prototip de tires immunològiques de flux lateral per al diagnòstic de la taca bacteriana. Per al seu disseny, es va partir de dos anticossos policlonals que es van combinar amb nanopartícules de carboni i es van assemblar en membranes de nitrocel¿lulosa. Es va analitzar l'especificitat de les tires obtenint resultat positiu amb tots els ceps de X. arboricola pv. pruni assajats. El límit de detecció obtingut amb les tires de flux lateral va ser de 104 UFC/ml, que és suficient per a la detecció d'aquest bacteri en mostres amb símptomes de la malaltia. Per a comprovar la seua fiabilitat i precisió, el prototip desenvolupat es va utilitzar en l'anàlisi de mostres de camp naturalment infectades i mostres sanes, i els resultats es van comparar amb els obtinguts en l'aïllament en medi de cultiu i els de PCR en temps real, observant-se una elevada correlació entre les tres tècniques. En segon lloc, com que X. arboricola pv. pruni es va detectar per primera vegada a Espanya en 2002, i des de llavors s¿han pr

Tesis por compendio, Xanthomonas arboricola pv. pruni is the causal agent of the bacterial spot disease of stone fruits, almond and ornamental species of Prunus. This pathogen constitutes one of the major threats to this group of species due to the economic losses it generates, and it is therefore considered as a quarantine organism in the European Union (EU). Recently, several outbreaks of the disease have been described in EU countries including Spain, where this pathogen has been detected in seven regions. Given the importance of this emerging disease and the lack of information about it, several aspects related to its diagnosis and epidemiology have been addressed in this work. Additionally, taxonomic characterization of three atypical Xanthomonas strains isolated from nectarines, causing similar symptoms to those produced by X. arboricola pv. pruni, have also been performed. First, a prototype of lateral flow immunoassay has been designed for the diagnosis of bacterial spot disease. It was developed by producing two polyclonal antibodies which were then combined with carbon nanoparticles and assembled on nitrocellulose strips. The specificity of the immunoassay was tested, obtaining a positive result with all the strains of X. arboricola pv. pruni analyzed. The limit of detection observed was 104 CFU/ml, which is sufficient for the detection of this pathogen in symptomatic samples. To demonstrate the accuracy and the reliability of the immunoassay, the prototype developed was used in the analysis of naturally infected field samples and healthy samples. Results were compared to those obtained by plate isolation and real time PCR, and a high correlation among techniques was observed. In a second step, as X. arboricola pv. pruni was first detected in Spain in 2002, and in subsequent years several outbreaks have occurred in 11 provinces, it was considered of interest to study the relationships between a collection of 239 Spanish strains of this pathogen originated from nurseries, orcha, Xanthomonas arboricola pv. pruni es el agente causal de la mancha bacteriana de los frutales de hueso, el almendro y especies ornamentales del género Prunus. Este patógeno constituye una de las mayores amenazas para estas especies debido a las pérdidas económicas que genera, por lo que está considerado como un organismo de cuarentena en la Unión Europea (UE). Se han descrito numerosos brotes en países miembros de la UE en los últimos años y entre ellos en España, donde ha sido detectada la bacteria en siete Comunidades Autónomas. Ante la importancia de esta enfermedad emergente y la carencia de información sobre la misma, en este trabajo se han abordado aspectos relacionados con su diagnóstico y epidemiología que permitirán ampliar nuestro conocimiento sobre ella. Además, también se ha realizado la caracterización taxonómica de tres cepas atípicas de Xanthomonas aisladas de nectarino, que causan síntomas similares a los producidos por X. arboricola pv. pruni. En primer lugar, se ha desarrollado un prototipo de tiras inmunológicas de flujo lateral para el diagnóstico de la mancha bacteriana. Para su diseño, se partió de dos anticuerpos policlonales que se combinaron con nanopartículas de carbono y se ensamblaron en membranas de nitrocelulosa. Se analizó la especificidad de las tiras, obteniendo resultado positivo con todas las cepas de X. arboricola pv. pruni ensayadas. El límite de detección obtenido con las tiras de flujo lateral fue de 104 UFC/ml, que es suficiente para la detección de esta bacteria en muestras sintomáticas. Para comprobar su fiabilidad y precisión, el prototipo desarrollado se utilizó en el análisis de muestras de campo naturalmente infectadas y muestras sanas, y los resultados se compararon con los obtenidos en el aislamiento en medio de cultivo y los de PCR en tiempo real, observándose una elevada correlación entre las tres técnicas. En segundo lugar, como X. arboricola pv. pruni se detectó por primera vez en España en 2002, y desde entonces se, Xanthomonas arboricola pv. pruni és l'agent causal de la taca bacteriana dels fruiters d'os, l'ametler i espècies ornamentals del gènere Prunus. Aquest patogen constitueix una de les majors amenaces per a aquestes espècies a causa de les pèrdues econòmiques que genera, per la qual cosa està considerat com un organisme de quarantena en la Unió Europea (UE). S'han descrit nombrosos brots en països membres de la UE en els últims anys i entre ells a Espanya, on ha sigut detectat el bacteri en set Comunitats Autònomes. Davant la importància d'aquesta malaltia emergent i la manca d'informació sobre aquest tema, en aquest treball s¿han abordat aspectos relacionats amb el seu diagnòstic i epidemiologia que permetran ampliar el nostre coneixement sobre ella. A més, també s'ha realitzat la caracterització taxonòmica de tres ceps atípics de Xanthomonas aïllats de nectariner, que causen símptomes similars als produïts per X. arboricola pv. pruni. En primer lloc, s'ha desenvolupat un prototip de tires immunològiques de flux lateral per al diagnòstic de la taca bacteriana. Per al seu disseny, es va partir de dos anticossos policlonals que es van combinar amb nanopartícules de carboni i es van assemblar en membranes de nitrocel¿lulosa. Es va analitzar l'especificitat de les tires obtenint resultat positiu amb tots els ceps de X. arboricola pv. pruni assajats. El límit de detecció obtingut amb les tires de flux lateral va ser de 104 UFC/ml, que és suficient per a la detecció d'aquest bacteri en mostres amb símptomes de la malaltia. Per a comprovar la seua fiabilitat i precisió, el prototip desenvolupat es va utilitzar en l'anàlisi de mostres de camp naturalment infectades i mostres sanes, i els resultats es van comparar amb els obtinguts en l'aïllament en medi de cultiu i els de PCR en temps real, observant-se una elevada correlació entre les tres tècniques. En segon lloc, com que X. arboricola pv. pruni es va detectar per primera vegada a Espanya en 2002, i des de llavors s¿han pr

[EN] Peppers and chillies are one of the most important horticultural products, with an annual production of twenty nine million tons of fresh peppers. Peppers are used as a spice and / or vegetable in a lot of dishes, recipes and sauces because of their characteristic flavor and aroma. The best known and studied factor of the pepper flavor is the pungency produced by capsaicinoids, which are exclusive of the Capsicum genus. However, the aroma and volatile fraction are less studied. In this sense, modern Capsicum varieties available in markets cover a low diversity, but traditional varieties provide an extraordinary gene pool for the selection and improvement of many characters, especially those related to fruit quality. Moreover, molecular markers have emerged in recent years as a useful tool to identify and differentiate plant genetic resources. Especially useful are the microsatellite markers (SSRs), which allow rapid and accurate genotyping, because they are multiallelic, highly polymorphic , co-dominant, stable, easy to use and have a high sensitivity. A preliminary genotyping of pepper landraces could give information about the differences in the genetic profile between accessions as well as information about the fixation level of each of them. The objectives of this work where on the one hand genotype eleven accessions of Capsicum with fourteen SSR to estimate differences in the genetic profiles among accessions and between individual plants, and on the other hand compare the volatile fraction of five accessions (selected from the initial eleven) characterizing their aromatic profile by GC-MS. This work is a preliminary study from one more ambitious aimed at associate genetic markers with volatile profiles of sensory importance to the aroma of Capsicum fruits. From the fourteen SSR used, six were discarded for not obtaining good amplifications. The remaining eight SSRs showed polymorphism between accessions, with a total of twenty two different alleles. Fourt, [ES] Pimientos y chiles son uno de los productos hortícolas más importantes, con una producción anual de veintinueve mill. toneladas de pimiento fresco. El pimiento se emplea como especia y/o hortaliza en una gran cantidad de platos, recetas y salsas contribuyendo con su sabor y aroma característicos. La pungencia, producida por los capsaicinoides, única del género Capsicum, es el factor más conocido y estudiado en los pimientos, mientras que los estudios sobre el aroma y la fracción volátil son mucho más escasos. En este sentido, las variedades modernas de Capsicum disponibles en los mercados abarcan una baja diversidad, mientras que las variedades tradicionales proporcionan un extraordinario pool genético para la selección y mejora de muchos caracteres, en especial los relacionados con la calidad del fruto. Por otra parte, los marcadores moleculares se han erigido en los últimos años como un método muy útil para identificar y diferenciar los recursos fitogenéticos, especialmente marcadores como los microsatélites (SSRs), los cuales permiten buenos genotipados, debido a que son multialélicos, muy polimórficos, codominantes, estables, fáciles de usar y poseen una alta sensibilidad en la diferenciación entre especies y genotipos. Un genotipado inicial con SSR de materiales tradicionales de pimiento permite establecer el perfil genético entre accesiones y estimar el nivel de fijación genética que posee cada accesión. Este trabajo consistió por un lado en genotipar con catorce SSRs once entradas Capsicum para estimar diferencias de perfiles genéticos entre accesiones y entre plantas individuales y por otro, realizar un análisis comparativo de la fracción volátil de cinco de las accesiones mencionadas, caracterizadas por un perfil aromático diverso, mediante GC-MS, estableciendo las reglas de herencia comunes para los compuestos volátiles en los pimientos. Todo ello enfocado como primer paso hacia genotipados más ambiciosos con vistas a asociar perfiles genéticos y marc

Las variedades tradicionales de tomate son apreciadas por los consumidores, que están dispuestos a pagar mayores precios por recuperar el sabor del tomate. Este interés ha propiciado que los estudios referentes a estos materiales se hayan multiplicado durante los últimos años, aunque normalmente se ciñen a pocas variedades, pocas poblaciones por variedad, o a aspectos muy concretos de sus características. El presente trabajo aborda una caracterización de variedades tradicionales del levante español que permita reunir e integrar los resultados de caracterización morfo-agronómica, organoléptica, funcional y molecular, en un intento de poner en valor estos importantes recursos fitogenéticos. Dentro de las poblaciones de las variedades tradicionales evaluadas se han observado niveles elevados de variación en características morfo-agronómicas y funcionales. Dicha variación puede deberse a factores micro-ambientales o diferencias genotípicas, puesto que se trata de variedades población. No obstante, las diferencias observadas en los niveles de variación respecto a híbridos F1 empleados como control, sugiere que las diferencias genotípicas entre individuos no serían tan importantes como cabría pensar. La variación detectada entre poblaciones de la misma variedad es, en general, mayor en todos los niveles (morfo-agronómico, organoléptico, funcional y molecular). Aunque parece existir una cierta tendencia en el perfil organoléptico, funcional y morfológico para cada variedad, lo cierto es que los rangos de variación de estos perfiles entre distintas variedades se solapan. La selección diferencial realizada por cada agricultor dentro de variedad podría ser una de las principales causas de la elevada variabilidad detectada. A ésta se añade los efectos de la mezcla de semillas y los cruzamientos espontáneos que se han evidenciado en la evaluación de los materiales (tanto por segregación morfo-agronómica como por los niveles de heterocigosidad observada en algunas poblaciones).

[ES] Se estudió una colección de 51 accesiones de variedades tradicionales de melón de Murcia. Mediante la tecnología de genotipado masivo Sequenom Mass assay se genotiparon SNPs repartidos por todo el genoma del melón. Los resultados se compararon con los resultados de una colección nuclear de germoplasma de melón analizada previamente por el grupo de Mejora Genética de Cucurbitáceas del COMAVUPV. Esta colección nuclear incluía entradas de todas las variedades botánicas de melón. A través del análisis de componentes principales se evaluó la diversidad de la colección y sus relaciones genéticas con germoplasma variado de la especie. La mayoría de las entradas de la colección murciana se agruparon en dos grupos muy definidos: Piel de sapo y Tendral, pertenecientes a C.melo subsp melo var inodorus. El resto de entradas fueron muy variables, algunas presentaron similitud con genotipos de referencia y otras no, representando nuevos genotipos. La realización de genotipos gráficos de varias entradas permitió visualizar la variación a nivel genómico. Se identificó variabilidad en algunos grupos de ligamiento, mientras que otros se mantenían uniformes. Es de particular interés que en algunas de las regiones variables de las entradas de la colección murciana se han descrito QTLs relacionados con la calidad del fruto, [ES] A collection of 51 accessions of melon landraces from Murcia was studied. SNPs evenly distributed throughout the melon genome were genotyped by the Sequenom genotyping technology. Results were compared to those obtained from a germplasm core collection previously analyzed by the COMAV-UPV Cucurbits Breeding Group. This core collection includes most of the melon botanical varieties. A Principal component analysis was conducted to study the collection's diversity and to evaluate the genetic relationships of the Murcian collection with the core collection. Most accessions from the Murcian collection fell into two main groups: Piel de sapo and Tendral, both belonging to C.melo subsp. melo var inodorus. The rest of the accessions were considerably variable. Certain accessions were fairly similar to reference genotypes while others were not. Genome-wide variability was assessed through graphical genotypes of various accessions. Variability in certain linkage groups was observed, while others were genetically uniform. It is particularly interesting that amongst some of the variable regions found within the accessions of the Murcian collection, QTLs related to fruit quality traits have been identified.

[CA] L’albergínia (Solanum melongena) ha sigut cultivada durant segles a tot arreu del món i actualment és un dels cultius amb més importància econòmica. La relació entre la versió salvatge, semi-domèstica i cultivada de Solanum melongena ha sigut sempre motiu de controvèrsia. És versemblant que l’albergínia que es consumeix en l’actualitat siga conseqüència de la domesticació de l’espècie silvestre Solanum incanum. Per una altra part, la existència d’una successió continua de formes fa que els límits entre taxons moltes vegades no siga massa clar entre albergínia i les seues espècies relacionades. La domesticació de les espècies cultivades ha provocat un empobriment genètic fins al punt en que l’albergínia d’avui dia és susceptible a nombroses malalties i plagues. És en aquest context on les espècies silvestres relacionades tenen un paper interessant, i és que aquestes han mostrat ser una reserva important de variabilitat genètica i variació al·lèlica per a caràcters d’interès agronòmic i característiques qualitatives tant de la planta com del fruit. La caracterització molecular detallada de col·leccions de germoplasma ens permetrà estudiar la diversitat a més de permetre’ns identificar accessions potencialment interessants per a la selecció i millora a banda de l’elaboració d’estratègies per a la conservació i maneig del germoplasma. En aquest treball s’han caracteritzat 48 accessions pertanyents a les espècies S. aethiopicum, S. anguivi, S. macrocarpon, S. dasyphyllum i S. incanum mitjançant l’ús de 39 marcadors SNPs. Els anàlisis de PCoA i clúster diferencien les espècies entre elles a més de mostrar la variabilitat genética existent dins d’elles. D’altra banda, els resultats obtinguts en aquest treball també confirmen que els SNPs seleccionats a partir dels transcriptomes de S. incanum i S. aethiopicum efectivament són reals, el que ens permetrà en un futur utilitzar-los en plataformes de genotipat massiu com pot ser SNPplex., [ES] La berenjena (Solanum melongena) ha sido cultivada durante siglos en todo el mundo y actualmente es uno de los cultivos más importantes economicamente hablando. La relación entre la versión salvaje, semi domestica y cultivada de Solanum melongena ha sido siempre motivo de controvèrsia. Es plausible que la berenjena que se consume hoy en día sea la consecuencia de la domesticación de la especie silvestre Solanum incanum. Por otra parte, la exististencia de una sucesión continua de formes hace que los límites entre taxones muchas veces no sea demasiado claro entre la berenjena y sus especies relacionades. La domesticación de las especies cultivades ha provocado un empobrecimiento genético hasta tal punto en que la berenjena de hoy en día sea susceptible a diferentes enfermedades y plagas. Es en este contexto donde las especies silvestres relacionades tienen un papel interesante, y es que estas han mostrado er una reserva importante de variavilidad genètica y variación alélica para catacteres de interès agronómicos y características cualitativas tanto de la planta como del fruto. La caracterización molecular detallada de col·lecciones de germoplasma nos permitirá estudiar la diversidad además de permitirnos identificar accesiones potencialmente interessantes para la selección y mejora además de la elaboración de estrategias para la conservación y manejo de germoplasma. En este Trabajo se han caracterizado 48 accesiones pertenecientes a S. aethiopicum, S. anguivi, S. macrocarpon, S. dasyphyllum y S. incanum mediante el uso de 39 marcadores SNPs. El anàlisis de PCoA y de clúster diferencia las especies entre ellas y muestra también la variabilidad genética existente entre elles. Por otra parte, los resultados obtenidos en este Trabajo también confirman que los SNPs seleccionados a partir de los transcriptomes de S. incanum y S. aethiopicum efectivamente son reales, lo cual nos permitirá en un futuro utilizarlos en plataformas de genotipado masivo como puede ser SNPp, [EN] The eggplant (Solanum melongena) has been cultivated for centuries all over the world and nowadays is one of the most economical important cultivars. The relationship between the wild and the cultivated version of Solanum melongena has been controversial. It is likely that the consumed eggplant today is the result of the domestication of wild species Solanum incanum. On the other hand the existence of a flux of forms makes unclear the limits between Solanum melongena and its wild relative taxons. The domestication of the cultivated species has ended with a genetic impoverishment and therefore making the eggplant susceptible to many diseases. In this context the wild related species have an interesting role as they are a source of genetic and allelic variation for different important traits. The detailed molecular characterization of germplasm collections will allow us to study the diversity and even identifying potentially interesting accessions for breeding and also to improve the conservation and handle germplasm strategies design. Here we have characterized 48 accessions belonging to the species S. aethiopicum, S. anguivi, S. macrocarpon, S.dasyphyllum and S. incanum by the use of 39 SNPs markers. The PCoA and cluster analysis are able to distinguish the species between and within them. Moreover, the obtained results also confirm that the SNPs selected from the transcriptomes of S. incanum and S. aethiopicum are indeed real, which in the future will allow us to use them in massive genotyping platforms such SNPplex.

Las variedades tradicionales de tomate son apreciadas por los consumidores, que están dispuestos a pagar mayores precios por recuperar el sabor del tomate. Este interés ha propiciado que los estudios referentes a estos materiales se hayan multiplicado durante los últimos años, aunque normalmente se ciñen a pocas variedades, pocas poblaciones por variedad, o a aspectos muy concretos de sus características. El presente trabajo aborda una caracterización de variedades tradicionales del levante español que permita reunir e integrar los resultados de caracterización morfo-agronómica, organoléptica, funcional y molecular, en un intento de poner en valor estos importantes recursos fitogenéticos. Dentro de las poblaciones de las variedades tradicionales evaluadas se han observado niveles elevados de variación en características morfo-agronómicas y funcionales. Dicha variación puede deberse a factores micro-ambientales o diferencias genotípicas, puesto que se trata de variedades población. No obstante, las diferencias observadas en los niveles de variación respecto a híbridos F1 empleados como control, sugiere que las diferencias genotípicas entre individuos no serían tan importantes como cabría pensar. La variación detectada entre poblaciones de la misma variedad es, en general, mayor en todos los niveles (morfo-agronómico, organoléptico, funcional y molecular). Aunque parece existir una cierta tendencia en el perfil organoléptico, funcional y morfológico para cada variedad, lo cierto es que los rangos de variación de estos perfiles entre distintas variedades se solapan. La selección diferencial realizada por cada agricultor dentro de variedad podría ser una de las principales causas de la elevada variabilidad detectada. A ésta se añade los efectos de la mezcla de semillas y los cruzamientos espontáneos que se han evidenciado en la evaluación de los materiales (tanto por segregación morfo-agronómica como por los niveles de heterocigosidad observada en algunas poblaciones).

[ES] Se estudió una colección de 51 accesiones de variedades tradicionales de melón de Murcia. Mediante la tecnología de genotipado masivo Sequenom Mass assay se genotiparon SNPs repartidos por todo el genoma del melón. Los resultados se compararon con los resultados de una colección nuclear de germoplasma de melón analizada previamente por el grupo de Mejora Genética de Cucurbitáceas del COMAVUPV. Esta colección nuclear incluía entradas de todas las variedades botánicas de melón. A través del análisis de componentes principales se evaluó la diversidad de la colección y sus relaciones genéticas con germoplasma variado de la especie. La mayoría de las entradas de la colección murciana se agruparon en dos grupos muy definidos: Piel de sapo y Tendral, pertenecientes a C.melo subsp melo var inodorus. El resto de entradas fueron muy variables, algunas presentaron similitud con genotipos de referencia y otras no, representando nuevos genotipos. La realización de genotipos gráficos de varias entradas permitió visualizar la variación a nivel genómico. Se identificó variabilidad en algunos grupos de ligamiento, mientras que otros se mantenían uniformes. Es de particular interés que en algunas de las regiones variables de las entradas de la colección murciana se han descrito QTLs relacionados con la calidad del fruto, [ES] A collection of 51 accessions of melon landraces from Murcia was studied. SNPs evenly distributed throughout the melon genome were genotyped by the Sequenom genotyping technology. Results were compared to those obtained from a germplasm core collection previously analyzed by the COMAV-UPV Cucurbits Breeding Group. This core collection includes most of the melon botanical varieties. A Principal component analysis was conducted to study the collection's diversity and to evaluate the genetic relationships of the Murcian collection with the core collection. Most accessions from the Murcian collection fell into two main groups: Piel de sapo and Tendral, both belonging to C.melo subsp. melo var inodorus. The rest of the accessions were considerably variable. Certain accessions were fairly similar to reference genotypes while others were not. Genome-wide variability was assessed through graphical genotypes of various accessions. Variability in certain linkage groups was observed, while others were genetically uniform. It is particularly interesting that amongst some of the variable regions found within the accessions of the Murcian collection, QTLs related to fruit quality traits have been identified.

[EN] Peppers and chillies are one of the most important horticultural products, with an annual production of twenty nine million tons of fresh peppers. Peppers are used as a spice and / or vegetable in a lot of dishes, recipes and sauces because of their characteristic flavor and aroma. The best known and studied factor of the pepper flavor is the pungency produced by capsaicinoids, which are exclusive of the Capsicum genus. However, the aroma and volatile fraction are less studied. In this sense, modern Capsicum varieties available in markets cover a low diversity, but traditional varieties provide an extraordinary gene pool for the selection and improvement of many characters, especially those related to fruit quality. Moreover, molecular markers have emerged in recent years as a useful tool to identify and differentiate plant genetic resources. Especially useful are the microsatellite markers (SSRs), which allow rapid and accurate genotyping, because they are multiallelic, highly polymorphic , co-dominant, stable, easy to use and have a high sensitivity. A preliminary genotyping of pepper landraces could give information about the differences in the genetic profile between accessions as well as information about the fixation level of each of them. The objectives of this work where on the one hand genotype eleven accessions of Capsicum with fourteen SSR to estimate differences in the genetic profiles among accessions and between individual plants, and on the other hand compare the volatile fraction of five accessions (selected from the initial eleven) characterizing their aromatic profile by GC-MS. This work is a preliminary study from one more ambitious aimed at associate genetic markers with volatile profiles of sensory importance to the aroma of Capsicum fruits. From the fourteen SSR used, six were discarded for not obtaining good amplifications. The remaining eight SSRs showed polymorphism between accessions, with a total of twenty two different alleles. Fourt, [ES] Pimientos y chiles son uno de los productos hortícolas más importantes, con una producción anual de veintinueve mill. toneladas de pimiento fresco. El pimiento se emplea como especia y/o hortaliza en una gran cantidad de platos, recetas y salsas contribuyendo con su sabor y aroma característicos. La pungencia, producida por los capsaicinoides, única del género Capsicum, es el factor más conocido y estudiado en los pimientos, mientras que los estudios sobre el aroma y la fracción volátil son mucho más escasos. En este sentido, las variedades modernas de Capsicum disponibles en los mercados abarcan una baja diversidad, mientras que las variedades tradicionales proporcionan un extraordinario pool genético para la selección y mejora de muchos caracteres, en especial los relacionados con la calidad del fruto. Por otra parte, los marcadores moleculares se han erigido en los últimos años como un método muy útil para identificar y diferenciar los recursos fitogenéticos, especialmente marcadores como los microsatélites (SSRs), los cuales permiten buenos genotipados, debido a que son multialélicos, muy polimórficos, codominantes, estables, fáciles de usar y poseen una alta sensibilidad en la diferenciación entre especies y genotipos. Un genotipado inicial con SSR de materiales tradicionales de pimiento permite establecer el perfil genético entre accesiones y estimar el nivel de fijación genética que posee cada accesión. Este trabajo consistió por un lado en genotipar con catorce SSRs once entradas Capsicum para estimar diferencias de perfiles genéticos entre accesiones y entre plantas individuales y por otro, realizar un análisis comparativo de la fracción volátil de cinco de las accesiones mencionadas, caracterizadas por un perfil aromático diverso, mediante GC-MS, estableciendo las reglas de herencia comunes para los compuestos volátiles en los pimientos. Todo ello enfocado como primer paso hacia genotipados más ambiciosos con vistas a asociar perfiles genéticos y marc

[ES] Se estudió una colección de 51 accesiones de variedades tradicionales de melón de Murcia. Mediante la tecnología de genotipado masivo Sequenom Mass assay se genotiparon SNPs repartidos por todo el genoma del melón. Los resultados se compararon con los resultados de una colección nuclear de germoplasma de melón analizada previamente por el grupo de Mejora Genética de Cucurbitáceas del COMAVUPV. Esta colección nuclear incluía entradas de todas las variedades botánicas de melón. A través del análisis de componentes principales se evaluó la diversidad de la colección y sus relaciones genéticas con germoplasma variado de la especie. La mayoría de las entradas de la colección murciana se agruparon en dos grupos muy definidos: Piel de sapo y Tendral, pertenecientes a C.melo subsp melo var inodorus. El resto de entradas fueron muy variables, algunas presentaron similitud con genotipos de referencia y otras no, representando nuevos genotipos. La realización de genotipos gráficos de varias entradas permitió visualizar la variación a nivel genómico. Se identificó variabilidad en algunos grupos de ligamiento, mientras que otros se mantenían uniformes. Es de particular interés que en algunas de las regiones variables de las entradas de la colección murciana se han descrito QTLs relacionados con la calidad del fruto, [ES] A collection of 51 accessions of melon landraces from Murcia was studied. SNPs evenly distributed throughout the melon genome were genotyped by the Sequenom genotyping technology. Results were compared to those obtained from a germplasm core collection previously analyzed by the COMAV-UPV Cucurbits Breeding Group. This core collection includes most of the melon botanical varieties. A Principal component analysis was conducted to study the collection's diversity and to evaluate the genetic relationships of the Murcian collection with the core collection. Most accessions from the Murcian collection fell into two main groups: Piel de sapo and Tendral, both belonging to C.melo subsp. melo var inodorus. The rest of the accessions were considerably variable. Certain accessions were fairly similar to reference genotypes while others were not. Genome-wide variability was assessed through graphical genotypes of various accessions. Variability in certain linkage groups was observed, while others were genetically uniform. It is particularly interesting that amongst some of the variable regions found within the accessions of the Murcian collection, QTLs related to fruit quality traits have been identified.

[CA] L’albergínia (Solanum melongena) ha sigut cultivada durant segles a tot arreu del món i actualment és un dels cultius amb més importància econòmica. La relació entre la versió salvatge, semi-domèstica i cultivada de Solanum melongena ha sigut sempre motiu de controvèrsia. És versemblant que l’albergínia que es consumeix en l’actualitat siga conseqüència de la domesticació de l’espècie silvestre Solanum incanum. Per una altra part, la existència d’una successió continua de formes fa que els límits entre taxons moltes vegades no siga massa clar entre albergínia i les seues espècies relacionades. La domesticació de les espècies cultivades ha provocat un empobriment genètic fins al punt en que l’albergínia d’avui dia és susceptible a nombroses malalties i plagues. És en aquest context on les espècies silvestres relacionades tenen un paper interessant, i és que aquestes han mostrat ser una reserva important de variabilitat genètica i variació al·lèlica per a caràcters d’interès agronòmic i característiques qualitatives tant de la planta com del fruit. La caracterització molecular detallada de col·leccions de germoplasma ens permetrà estudiar la diversitat a més de permetre’ns identificar accessions potencialment interessants per a la selecció i millora a banda de l’elaboració d’estratègies per a la conservació i maneig del germoplasma. En aquest treball s’han caracteritzat 48 accessions pertanyents a les espècies S. aethiopicum, S. anguivi, S. macrocarpon, S. dasyphyllum i S. incanum mitjançant l’ús de 39 marcadors SNPs. Els anàlisis de PCoA i clúster diferencien les espècies entre elles a més de mostrar la variabilitat genética existent dins d’elles. D’altra banda, els resultats obtinguts en aquest treball també confirmen que els SNPs seleccionats a partir dels transcriptomes de S. incanum i S. aethiopicum efectivament són reals, el que ens permetrà en un futur utilitzar-los en plataformes de genotipat massiu com pot ser SNPplex., [ES] La berenjena (Solanum melongena) ha sido cultivada durante siglos en todo el mundo y actualmente es uno de los cultivos más importantes economicamente hablando. La relación entre la versión salvaje, semi domestica y cultivada de Solanum melongena ha sido siempre motivo de controvèrsia. Es plausible que la berenjena que se consume hoy en día sea la consecuencia de la domesticación de la especie silvestre Solanum incanum. Por otra parte, la exististencia de una sucesión continua de formes hace que los límites entre taxones muchas veces no sea demasiado claro entre la berenjena y sus especies relacionades. La domesticación de las especies cultivades ha provocado un empobrecimiento genético hasta tal punto en que la berenjena de hoy en día sea susceptible a diferentes enfermedades y plagas. Es en este contexto donde las especies silvestres relacionades tienen un papel interesante, y es que estas han mostrado er una reserva importante de variavilidad genètica y variación alélica para catacteres de interès agronómicos y características cualitativas tanto de la planta como del fruto. La caracterización molecular detallada de col·lecciones de germoplasma nos permitirá estudiar la diversidad además de permitirnos identificar accesiones potencialmente interessantes para la selección y mejora además de la elaboración de estrategias para la conservación y manejo de germoplasma. En este Trabajo se han caracterizado 48 accesiones pertenecientes a S. aethiopicum, S. anguivi, S. macrocarpon, S. dasyphyllum y S. incanum mediante el uso de 39 marcadores SNPs. El anàlisis de PCoA y de clúster diferencia las especies entre ellas y muestra también la variabilidad genética existente entre elles. Por otra parte, los resultados obtenidos en este Trabajo también confirman que los SNPs seleccionados a partir de los transcriptomes de S. incanum y S. aethiopicum efectivamente son reales, lo cual nos permitirá en un futuro utilizarlos en plataformas de genotipado masivo como puede ser SNPp, [EN] The eggplant (Solanum melongena) has been cultivated for centuries all over the world and nowadays is one of the most economical important cultivars. The relationship between the wild and the cultivated version of Solanum melongena has been controversial. It is likely that the consumed eggplant today is the result of the domestication of wild species Solanum incanum. On the other hand the existence of a flux of forms makes unclear the limits between Solanum melongena and its wild relative taxons. The domestication of the cultivated species has ended with a genetic impoverishment and therefore making the eggplant susceptible to many diseases. In this context the wild related species have an interesting role as they are a source of genetic and allelic variation for different important traits. The detailed molecular characterization of germplasm collections will allow us to study the diversity and even identifying potentially interesting accessions for breeding and also to improve the conservation and handle germplasm strategies design. Here we have characterized 48 accessions belonging to the species S. aethiopicum, S. anguivi, S. macrocarpon, S.dasyphyllum and S. incanum by the use of 39 SNPs markers. The PCoA and cluster analysis are able to distinguish the species between and within them. Moreover, the obtained results also confirm that the SNPs selected from the transcriptomes of S. incanum and S. aethiopicum are indeed real, which in the future will allow us to use them in massive genotyping platforms such SNPplex.

[CA] L’albergínia (Solanum melongena) ha sigut cultivada durant segles a tot arreu del món i actualment és un dels cultius amb més importància econòmica. La relació entre la versió salvatge, semi-domèstica i cultivada de Solanum melongena ha sigut sempre motiu de controvèrsia. És versemblant que l’albergínia que es consumeix en l’actualitat siga conseqüència de la domesticació de l’espècie silvestre Solanum incanum. Per una altra part, la existència d’una successió continua de formes fa que els límits entre taxons moltes vegades no siga massa clar entre albergínia i les seues espècies relacionades. La domesticació de les espècies cultivades ha provocat un empobriment genètic fins al punt en que l’albergínia d’avui dia és susceptible a nombroses malalties i plagues. És en aquest context on les espècies silvestres relacionades tenen un paper interessant, i és que aquestes han mostrat ser una reserva important de variabilitat genètica i variació al·lèlica per a caràcters d’interès agronòmic i característiques qualitatives tant de la planta com del fruit. La caracterització molecular detallada de col·leccions de germoplasma ens permetrà estudiar la diversitat a més de permetre’ns identificar accessions potencialment interessants per a la selecció i millora a banda de l’elaboració d’estratègies per a la conservació i maneig del germoplasma. En aquest treball s’han caracteritzat 48 accessions pertanyents a les espècies S. aethiopicum, S. anguivi, S. macrocarpon, S. dasyphyllum i S. incanum mitjançant l’ús de 39 marcadors SNPs. Els anàlisis de PCoA i clúster diferencien les espècies entre elles a més de mostrar la variabilitat genética existent dins d’elles. D’altra banda, els resultats obtinguts en aquest treball també confirmen que els SNPs seleccionats a partir dels transcriptomes de S. incanum i S. aethiopicum efectivament són reals, el que ens permetrà en un futur utilitzar-los en plataformes de genotipat massiu com pot ser SNPplex., [ES] La berenjena (Solanum melongena) ha sido cultivada durante siglos en todo el mundo y actualmente es uno de los cultivos más importantes economicamente hablando. La relación entre la versión salvaje, semi domestica y cultivada de Solanum melongena ha sido siempre motivo de controvèrsia. Es plausible que la berenjena que se consume hoy en día sea la consecuencia de la domesticación de la especie silvestre Solanum incanum. Por otra parte, la exististencia de una sucesión continua de formes hace que los límites entre taxones muchas veces no sea demasiado claro entre la berenjena y sus especies relacionades. La domesticación de las especies cultivades ha provocado un empobrecimiento genético hasta tal punto en que la berenjena de hoy en día sea susceptible a diferentes enfermedades y plagas. Es en este contexto donde las especies silvestres relacionades tienen un papel interesante, y es que estas han mostrado er una reserva importante de variavilidad genètica y variación alélica para catacteres de interès agronómicos y características cualitativas tanto de la planta como del fruto. La caracterización molecular detallada de col·lecciones de germoplasma nos permitirá estudiar la diversidad además de permitirnos identificar accesiones potencialmente interessantes para la selección y mejora además de la elaboración de estrategias para la conservación y manejo de germoplasma. En este Trabajo se han caracterizado 48 accesiones pertenecientes a S. aethiopicum, S. anguivi, S. macrocarpon, S. dasyphyllum y S. incanum mediante el uso de 39 marcadores SNPs. El anàlisis de PCoA y de clúster diferencia las especies entre ellas y muestra también la variabilidad genética existente entre elles. Por otra parte, los resultados obtenidos en este Trabajo también confirman que los SNPs seleccionados a partir de los transcriptomes de S. incanum y S. aethiopicum efectivamente son reales, lo cual nos permitirá en un futuro utilizarlos en plataformas de genotipado masivo como puede ser SNPp, [EN] The eggplant (Solanum melongena) has been cultivated for centuries all over the world and nowadays is one of the most economical important cultivars. The relationship between the wild and the cultivated version of Solanum melongena has been controversial. It is likely that the consumed eggplant today is the result of the domestication of wild species Solanum incanum. On the other hand the existence of a flux of forms makes unclear the limits between Solanum melongena and its wild relative taxons. The domestication of the cultivated species has ended with a genetic impoverishment and therefore making the eggplant susceptible to many diseases. In this context the wild related species have an interesting role as they are a source of genetic and allelic variation for different important traits. The detailed molecular characterization of germplasm collections will allow us to study the diversity and even identifying potentially interesting accessions for breeding and also to improve the conservation and handle germplasm strategies design. Here we have characterized 48 accessions belonging to the species S. aethiopicum, S. anguivi, S. macrocarpon, S.dasyphyllum and S. incanum by the use of 39 SNPs markers. The PCoA and cluster analysis are able to distinguish the species between and within them. Moreover, the obtained results also confirm that the SNPs selected from the transcriptomes of S. incanum and S. aethiopicum are indeed real, which in the future will allow us to use them in massive genotyping platforms such SNPplex.

[ES] El sistema radicular y en concreto su arquitectura, ha demostrado ser una de las características más determinantes en el desarrollo y la productividad vegetal. Gracias a la habilidad plástica de las raíces, la planta puede modificar su configuración espacial adaptando la arquitectura radicular a la distribución heterogénea de los recursos edáficos (agua y nutrientes, principalmente). En este contexto, el aumento de la eficiencia de los cultivos está condicionado por la disponibilidad de sistemas radiculares sanos y estructuralmente bien adaptados al ambiente en el que se desarrollan. Por lo tanto, es necesario determinar qué ideotipo radicular (combinación ideal de características radiculares) es el más adecuado para un ambiente concreto. El conocimiento sobre la variabilidad y las relaciones filogenéticas entre las diferentes entradas disponibles, es un prerrequisito para el futuro uso de los recursos fitogenéticos en programas de mejora. Sin embargo, dentro del género Capsicum sp., es destacable la inexistencia de estudios de diversidad radicular dentro de dicho género. Los objetivos del trabajo fueron describir parte de la variación inter e intraespecífica de la arquitectura radicular dentro 18 genotipos del género Capsicum (C. annuum, C. baccatum, C. frutescens y C. pubescens) procedentes de España y América, en dos estadios diferentes de desarrollo, a los 15 y 70 dsf (días de seguimiento fenológico), así como la puesta a punto de una batería de 25 SSR para la caracterización molecular. Se han encontrado una importante variabilidad fenotípica entre los distintos genotipos para todos los caracteres de raíz analizados (***P < 0.001) en estado de plántula. Estas diferencias no se mantienen con la misma intensidad en estado adulto (70 dsf). En ambos casos, la longitud radicular ha demostrado ser un parámetro significativo, y con variabilidad constante en este género. Sin embargo, no se han obtenido correlaciones entre los parámetros de ambos fenotipados, posibl, [EN] Root systems, particulary its root architecture, has shown to play an important role in plant development and productivity. Due to root plastic ability, plants can ensure the adquisition of soil resources (mainly water and nutrients) changing their spatial configuration through changes in root architecture, adapting to the heterogeneous distribution of these resources within the soil. Because of increasingly extreme adverse abiotic factors as drought, salinity or suboptimal levels of nutrients, crops efficiency is restricted by the availability of healthy root systems that fit to environment in which they operate. Therefore it is necessary to define the root ideotype (radicular ideal combination of characteristics) best suited for a particular environment. Knowledge about variability and phylogenetic relationships between different available accessions, is a prerequisite for the future use of plant genetic resources in breeding programs. However, despite the economic and cultural importance of Capsicum sp., the absence of root diversity studies within this genus is a remarkable issue. In this context, this study describes part of the inter and intraspecific variation of root architecture in 18 genotypes of the genus Capsicum (C. annuum, C. baccatum, C. frutescens, and C. pubescens) from Spain and America, in two different stages of development, at 15 and 70 dsf (phenological monitoring days), and the set up of 25 SSR markers for molecular characterization. We found significant phenotypic variability among genotypes for all root traits analyzed (*** P <0.001) in seedling stage. These differences are not maintained with the same intensity in the adult stage (70 dsf). In both cases, root length was shown to be a significant parameter, and with constant variability in this genus. However, no correlations were obtained between parameters from both phenotyped stages. Polymorphism using SSR, allowed the separation of the different used species (C. annuum, C. baccatum

[ES] El sistema radicular y en concreto su arquitectura, ha demostrado ser una de las características más determinantes en el desarrollo y la productividad vegetal. Gracias a la habilidad plástica de las raíces, la planta puede modificar su configuración espacial adaptando la arquitectura radicular a la distribución heterogénea de los recursos edáficos (agua y nutrientes, principalmente). En este contexto, el aumento de la eficiencia de los cultivos está condicionado por la disponibilidad de sistemas radiculares sanos y estructuralmente bien adaptados al ambiente en el que se desarrollan. Por lo tanto, es necesario determinar qué ideotipo radicular (combinación ideal de características radiculares) es el más adecuado para un ambiente concreto. El conocimiento sobre la variabilidad y las relaciones filogenéticas entre las diferentes entradas disponibles, es un prerrequisito para el futuro uso de los recursos fitogenéticos en programas de mejora. Sin embargo, dentro del género Capsicum sp., es destacable la inexistencia de estudios de diversidad radicular dentro de dicho género. Los objetivos del trabajo fueron describir parte de la variación inter e intraespecífica de la arquitectura radicular dentro 18 genotipos del género Capsicum (C. annuum, C. baccatum, C. frutescens y C. pubescens) procedentes de España y América, en dos estadios diferentes de desarrollo, a los 15 y 70 dsf (días de seguimiento fenológico), así como la puesta a punto de una batería de 25 SSR para la caracterización molecular. Se han encontrado una importante variabilidad fenotípica entre los distintos genotipos para todos los caracteres de raíz analizados (***P < 0.001) en estado de plántula. Estas diferencias no se mantienen con la misma intensidad en estado adulto (70 dsf). En ambos casos, la longitud radicular ha demostrado ser un parámetro significativo, y con variabilidad constante en este género. Sin embargo, no se han obtenido correlaciones entre los parámetros de ambos fenotipados, posibl, [EN] Root systems, particulary its root architecture, has shown to play an important role in plant development and productivity. Due to root plastic ability, plants can ensure the adquisition of soil resources (mainly water and nutrients) changing their spatial configuration through changes in root architecture, adapting to the heterogeneous distribution of these resources within the soil. Because of increasingly extreme adverse abiotic factors as drought, salinity or suboptimal levels of nutrients, crops efficiency is restricted by the availability of healthy root systems that fit to environment in which they operate. Therefore it is necessary to define the root ideotype (radicular ideal combination of characteristics) best suited for a particular environment. Knowledge about variability and phylogenetic relationships between different available accessions, is a prerequisite for the future use of plant genetic resources in breeding programs. However, despite the economic and cultural importance of Capsicum sp., the absence of root diversity studies within this genus is a remarkable issue. In this context, this study describes part of the inter and intraspecific variation of root architecture in 18 genotypes of the genus Capsicum (C. annuum, C. baccatum, C. frutescens, and C. pubescens) from Spain and America, in two different stages of development, at 15 and 70 dsf (phenological monitoring days), and the set up of 25 SSR markers for molecular characterization. We found significant phenotypic variability among genotypes for all root traits analyzed (*** P <0.001) in seedling stage. These differences are not maintained with the same intensity in the adult stage (70 dsf). In both cases, root length was shown to be a significant parameter, and with constant variability in this genus. However, no correlations were obtained between parameters from both phenotyped stages. Polymorphism using SSR, allowed the separation of the different used species (C. annuum, C. baccatum

SE DESCRIBE EL FUNDAMENTO, LA METODOLOGIA Y LAS APLICACIONES DE LOS MARCADORES MOLECULARES BASADOS EN PCR DE TIPO MICROSATÉLITE.

Los marcadores RAPD se han utilizado con éxito en diversas especies con fines de mejora animal o vegetal y para el análisis de poblaciones de microorganismos. En este artículo se incluye una breve revisión teórica y una explicación práctica detallada del procedimiento. Con la explicación planteada se pretende facilitar el aprendizaje de este sistema de marcadores al alumno de Ciencias de la vida (Agronomía, Biología, Veterinaria, Medio ambiente, Biotecnología..), tanto a nivel teórico como práctico.

SE DESCRIBE EL FUNDAMENTO, LA METODOLOGIA Y LAS APLICACIONES DE LOS MACADORES MOLECULARES BASADOS EN PCR DE TIPO RAPD

SE DESCRIBE EL FUNDAMENTO, LA METODOLOGIA Y LAS APLICACIONES DE LOS MARCADORES MOLECULARES BASADOS EN PCR DE TIPO MICROSATÉLITE.

SE DESCRIBE EL FUNDAMENTO, LA METODOLOGIA Y LAS APLICACIONES DE LOS MARCADORES MOLECULARES BASADOS EN PCR DE TIPO MICROSATÉLITE.

SE DESCRIBE EL FUNDAMENTO, LA METODOLOGIA Y LAS APLICACIONES DE LOS MACADORES MOLECULARES BASADOS EN PCR DE TIPO RAPD

Los marcadores RAPD se han utilizado con éxito en diversas especies con fines de mejora animal o vegetal y para el análisis de poblaciones de microorganismos. En este artículo se incluye una breve revisión teórica y una explicación práctica detallada del procedimiento. Con la explicación planteada se pretende facilitar el aprendizaje de este sistema de marcadores al alumno de Ciencias de la vida (Agronomía, Biología, Veterinaria, Medio ambiente, Biotecnología..), tanto a nivel teórico como práctico.

SE DESCRIBE EL FUNDAMENTO, LA METODOLOGIA Y LAS APLICACIONES DE LOS MACADORES MOLECULARES BASADOS EN PCR DE TIPO RAPD

Los marcadores RAPD se han utilizado con éxito en diversas especies con fines de mejora animal o vegetal y para el análisis de poblaciones de microorganismos. En este artículo se incluye una breve revisión teórica y una explicación práctica detallada del procedimiento. Con la explicación planteada se pretende facilitar el aprendizaje de este sistema de marcadores al alumno de Ciencias de la vida (Agronomía, Biología, Veterinaria, Medio ambiente, Biotecnología..), tanto a nivel teórico como práctico.

SE DESCRIBE EL FUNDAMENTO, LA METODOLOGIA Y LAS APLICACIONES DE LOS MACADORES MOLECULARES BASADOS EN PCR DE TIPO RAPD

SE DESCRIBE EL FUNDAMENTO, LA METODOLOGIA Y LAS APLICACIONES DE LOS MARCADORES MOLECULARES BASADOS EN PCR DE TIPO MICROSATÉLITE.

Se describe la utilización del paquete informa'tico PHYLIP para el desarrollo de análisis de agrupamientos en el contexto de estudios de variabilidad. En concreto, se desarrolla un ejemplo a partir de marcadores RAPDs.

Los recientes avances en Genética y Genómica están proporcionando una gran cantidad de información sobre la secuencia y la función de los genes, lo que supone la base para el desarrollo de nuevas estrategias de estudio de la diversidad. En este artículo se describe una nueva metodología de uso creciente, utilizada para la detección de polimorfismos genéticos en poblaciones naturales: EcoTILLING. Esta herramienta se ha empleado con éxito en diversas especies, no sólo para estudiar la variabilidad existente, sino con fines de mejora vegetal o animal. En este artículo se incluye una breve revisión teórica y una explicación práctica detallada. Con la explicación planteada se pretende facilitar el aprendizaje de esta nueva estrategia de análisis de la diversidad al alumno de Ciencias de la vida (Agronomía, Biología, Veterinaria, Medio ambiente, Biotecnología..), tanto a nivel teórico como práctico.

Los recientes avances en Genética y Genómica están proporcionando una gran cantidad de información sobre la secuencia y la función de los genes, lo que supone la base para el desarrollo de nuevas estrategias de estudio de la diversidad. En este artículo se describe una nueva metodología de uso creciente, utilizada para la detección de polimorfismos genéticos en poblaciones naturales: EcoTILLING. Esta herramienta se ha empleado con éxito en diversas especies, no sólo para estudiar la variabilidad existente, sino con fines de mejora vegetal o animal. En este artículo se incluye una breve revisión teórica y una explicación práctica detallada. Con la explicación planteada se pretende facilitar el aprendizaje de esta nueva estrategia de análisis de la diversidad al alumno de Ciencias de la vida (Agronomía, Biología, Veterinaria, Medio ambiente, Biotecnología..), tanto a nivel teórico como práctico.

Los recientes avances en Genética y Genómica están proporcionando una gran cantidad de información sobre la secuencia y la función de los genes, lo que supone la base para el desarrollo de nuevas estrategias de estudio de la diversidad. En este artículo se describe una nueva metodología de uso creciente, utilizada para la detección de polimorfismos genéticos en poblaciones naturales: EcoTILLING. Esta herramienta se ha empleado con éxito en diversas especies, no sólo para estudiar la variabilidad existente, sino con fines de mejora vegetal o animal. En este artículo se incluye una breve revisión teórica y una explicación práctica detallada. Con la explicación planteada se pretende facilitar el aprendizaje de esta nueva estrategia de análisis de la diversidad al alumno de Ciencias de la vida (Agronomía, Biología, Veterinaria, Medio ambiente, Biotecnología..), tanto a nivel teórico como práctico.

Se describe la utilización del paquete informa'tico PHYLIP para el desarrollo de análisis de agrupamientos en el contexto de estudios de variabilidad. En concreto, se desarrolla un ejemplo a partir de marcadores RAPDs.

Los recientes avances en Genética y Genómica están proporcionando una gran cantidad de información sobre la secuencia y la función de los genes, lo que supone la base para el desarrollo de nuevas estrategias de estudio de la diversidad. En este artículo se describe una nueva metodología de uso creciente, utilizada para la detección de polimorfismos genéticos en poblaciones naturales: EcoTILLING. Esta herramienta se ha empleado con éxito en diversas especies, no sólo para estudiar la variabilidad existente, sino con fines de mejora vegetal o animal. En este artículo se incluye una breve revisión teórica y una explicación práctica detallada. Con la explicación planteada se pretende facilitar el aprendizaje de esta nueva estrategia de análisis de la diversidad al alumno de Ciencias de la vida (Agronomía, Biología, Veterinaria, Medio ambiente, Biotecnología..), tanto a nivel teórico como práctico.

Se describe la utilización del paquete informa'tico PHYLIP para el desarrollo de análisis de agrupamientos en el contexto de estudios de variabilidad. En concreto, se desarrolla un ejemplo a partir de marcadores RAPDs.