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In a greenhouse experiment, morpho-anatomical and micromorphometrical analyses of two soybean cultivars, MG/BR46 (Conquista) and BR16-tolerant and sensitive to drought, respectively-were used to study their water-deficit-tolerance strategies. Drought treatments were applied at reproductive stages from R2 to R7, where evaluations were conducted at 30 days and 45 days after stress started, respectively. The total length of Conquista plants (shoot + root) was greater than of BR16 plants. Pod dry weight was adversely affected due to the lack of moisture, decreasing productivity even of Conquista plants. Both the cultivars had normal development of root hairs; however, it was observed a decrease in the cortex:central cylinder ratio in BR16 stressed for 30 days, and they also showed similar leaflet thickness and stomata distribution. Differences in drought tolerance observed between the two cultivars seemed to be related to factors other than morphological traits since this species has a short lifecycle.Análises morfo-anatômicas e micromorfométricas de duas cultivares de soja, MG/BR46 (Conquista) e BR16—tolerante e sensível à seca, respectivamente, em experimento conduzido em casa de vegetação—foram feitas para estudar as diferentes estratégias de tolerância ao déficit hídrico. Tratamentos de seca foram aplicados no estádio reprodutivo R2 e R7, onde avaliações foram conduzidas em 30 dias e 45 dias após o inicio do estresse, respectivamente. O comprimento total das plantas da cultivar Conquista (parte aérea e raiz) foi maior do que das plantas da cultivar BR16. A massa seca da vagem foi adversamente afetada pelo déficit hídrico, diminuindo a produtividade das plantas da cultivar Conquista. Ambas as cultivares tiveram o desenvolvimento de pêlos radiciais normais e, uma diminuição da razão córtex:cilindro central foi observada em BR16 estressada por 30 dias, além de apresentar uma espessura do folíolo e distribuição dos estômatos normais. Diferenças na tolerância à seca observada entre as duas cultivares devem estar relacionadas também a outros fatores, alm das características morfológicas, já que esta espécie possui um ciclo de vida curto.