1. New approach for phylogenetic tree recovery based on genome-scale metabolic networks
- Author
-
Universitat Politècnica de València. Instituto Universitario de Matemática Pura y Aplicada - Institut Universitari de Matemàtica Pura i Aplicada, Universitat Politècnica de València. Departamento de Matemática Aplicada - Departament de Matemàtica Aplicada, Universitat Politècnica de València. Departamento de Física Aplicada - Departament de Física Aplicada, European Commission, Gamermann, Daniel, Montagud Aquino, Arnau, Conejero Casares, José Alberto, Urchueguía Schölzel, Javier Fermín, Fernández de Córdoba Castellá, Pedro José, Universitat Politècnica de València. Instituto Universitario de Matemática Pura y Aplicada - Institut Universitari de Matemàtica Pura i Aplicada, Universitat Politècnica de València. Departamento de Matemática Aplicada - Departament de Matemàtica Aplicada, Universitat Politècnica de València. Departamento de Física Aplicada - Departament de Física Aplicada, European Commission, Gamermann, Daniel, Montagud Aquino, Arnau, Conejero Casares, José Alberto, Urchueguía Schölzel, Javier Fermín, and Fernández de Córdoba Castellá, Pedro José
- Abstract
[EN] A wide range of applications and research has been done with genome-scale metabolic models. In this work, we describe an innovative methodology for comparing metabolic networks constructed from genome-scale metabolic models and how to apply this comparison in order to infer evolutionary distances between different organisms. Our methodology allows a quantification of the metabolic differences between different species from a broad range of families and even kingdoms. This quantification is then applied in order to reconstruct phylogenetic trees for sets of various organisms.
- Published
- 2014