Patrier, Juliette, Villageois-Tran, Khanh, Szychowiak, Piotr, Ruckly, Stéphane, Gschwind, Rémi, Wicky, Paul-Henri, Gueye, Signara, Armand-Lefevre, Laurence, Marzouk, Mehdi, Sonneville, Romain, Bouadma, Lila, Petitjean, Marie, Lamara, Fariza, de Montmollin, Etienne, Timsit, Jean-Francois, Ruppé, Etienne, Abel, Laurent, Abrous, Amal, Andrejak, Claire, Angoulvant, François, Bachelet, Delphine, Bartoli, Marie, Behilill, Sylvie, Beluze, Marine, Bhavsar, Krishna, Cervantes-Gonzalez, Minerva, Chair, Anissa, Charpentier, Charlotte, Chenard, Léo, Chirouze, Catherine, Couffin-Cadiergues, Sandrine, Couffignal, Camille, Debray, Marie-Pierre, Deplanque, Dominique, Descamps, Diane, Diallo, Alpha, da Silva, Fernanda Dias, Dorival, Céline, Duval, Xavier, Eloy, Philippine, Enouf, Vincent, Esperou, Hélène, Esposito-Farese, Marina, Etienne, Manuel, Florence, Aline-Marie, Gaymard, Alexandre, Ghosn, Jade, Gigante, Tristan, Gilg, Morgane, Goehringer, François, Guedj, Jérémie, Houas, Ikram, Hoffmann, Isabelle, Hulot, Jean-Sébastien, Jaafoura, Salma, Kafif, Ouifiya, Khalil, Antoine, Lafhej, Nadhem, Laouénan, Cédric, Laribi, Samira, Le, Minh, Le Hingrat, Quentin, Le Mestre, Soizic, Letrou, Sophie, Levy, Yves, Lina, Bruno, Lingas, Guillaume, Malvy, Denis, Mentré, France, Mouquet, Hugo, Neant, Nadège, Paul, Christelle, Papadopoulos, Aurélie, Petrov-Sanchez, Ventzislava, Peytavin, Gilles, Piquard, Valentine, Picone, Olivier, Rosa-Calatrava, Manuel, Rossignol, Bénédicte, Rossignol, Patrick, Roy, Carine, Schneider, Marion, Su, Richa, Tardivon, Coralie, Timsit, Jean-François, Tubiana, Sarah, van der Werf, Sylvie, Visseaux, Benoit, Wiedemann, Aurélie, AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), CHU Trousseau [Tours], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Université Sorbonne Paris Nord, Physiopathologie et pharmacotoxicologie placentaire humaine : Microbiote pré & post natal (3PHM - UMR-S 1139), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU) (Imagine - U1163), Centre de Recherche des Cordeliers (CRC (UMR_S_1138 / U1138)), École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Cité (UPCité), Health data- and model- driven Knowledge Acquisition (HeKA), Inria de Paris, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre de Recherche des Cordeliers (CRC (UMR_S_1138 / U1138)), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Cité (UPCité)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Génétique Moléculaire des Virus à ARN - Molecular Genetics of RNA Viruses (GMV-ARN (UMR_3569 / U-Pasteur_2)), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Centre National de Référence des virus des infections respiratoires (dont la grippe) - National Reference Center Virus Influenzae [Paris] (CNR - laboratoire coordonnateur), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Université Paris Cité (UPCité), This work was partially supported by the Direction Générale des Armées (project FastGeneII), and French COVID Cohort Study Group Laurent Abel, Amal Abrous, Claire Andrejak, François Angoulvant, Delphine Bachelet, Marie Bartoli, Sylvie Behilill, Marine Beluze, Krishna Bhavsar, Lila Bouadma, Minerva Cervantes-Gonzalez, Anissa Chair, Charlotte Charpentier, Léo Chenard, Catherine Chirouze, Sandrine Couffin-Cadiergues, Camille Couffignal, Marie-Pierre Debray, Dominique Deplanque, Diane Descamps, Alpha Diallo, Fernanda Dias da Silva, Céline Dorival, Xavier Duval, Philippine Eloy, Vincent Enouf, Hélène Esperou, Marina Esposito-Farese, Manuel Etienne, Aline-Marie Florence, Alexandre Gaymard, Jade Ghosn, Tristan Gigante, Morgane Gilg, François Goehringer, Jérémie Guedj, Ikram Houas, Isabelle Hoffmann, Jean-Sébastien Hulot, Salma Jaafoura, Ouifiya Kafif, Antoine Khalil, Nadhem Lafhej, Cédric Laouénan, Samira Laribi, Minh Le, Quentin Le Hingrat, Soizic Le Mestre, Sophie Letrou, Yves Levy, Bruno Lina, Guillaume Lingas, Denis Malvy, France Mentré, Hugo Mouquet, Nadège Neant, Christelle Paul, Aurélie Papadopoulos, Christelle Paul, Ventzislava Petrov-Sanchez, Gilles Peytavin, Valentine Piquard, Olivier Picone, Manuel Rosa-Calatrava, Bénédicte Rossignol, Patrick Rossignol, Carine Roy, Marion Schneider, Richa Su, Coralie Tardivon, Jean-François Timsit, Sarah Tubiana, Sylvie Van Der Werf, Benoit Visseaux, Aurélie Wiedemann.