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Submitted by Patrick Rômbola Ozanique (patrick.ozanique@unesp.br) on 2022-04-08T22:21:06Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - Patrick Rombola Ozanique.pdf: 2724947 bytes, checksum: a4746d2216c74a510c398659c800d445 (MD5) Rejected by Vivian Letícia Duarte Parisi (vivian.parisi@unesp.br), reason: Sua submissão será devolvida para que você possa fazer as correções. 1. Na capa, folha de rosto e folha de aprovação o nome do autor não devem ficar em caixa alta. 2. Sugerimos que você faça adequações no SUMÁRIO conforme a norma ABNT NBR 6027 e 6024. Observe os negritos. Na seção 2, deve ter tido um erro de digitação pois está assim: 2. Objetivo / 3. Cada lista deve estar em uma página diferente, tendo entre elas, uma quebra de página Lembramos que o arquivo depositado no repositório deve ser igual ao impresso, o rigor com o padrão da Universidade se deve ao fato de que o seu trabalho passará a ser visível mundialmente. Agradecemos a compreensão. Estamos à disposição caso necessite esclarecer alguma dúvida ou necessite algum auxílio para efetuar as correções. Atenciosamente, Repositório Institucional UNESP UNESP - Câmpus de São José do Rio Preto Rua Cristóvão Colombo, 2265 - Jd. Nazareth São José do Rio Preto – SP. on 2022-04-11T20:47:27Z (GMT) Submitted by Patrick Rômbola Ozanique (patrick.ozanique@unesp.br) on 2022-04-11T21:52:54Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - Patrick Rombola Ozanique.pdf: 2726501 bytes, checksum: 9c2efc34abc864b1adf1ebe5fa51054c (MD5) Approved for entry into archive by Vivian Letícia Duarte Parisi (vivian.parisi@unesp.br) on 2022-04-12T13:50:46Z (GMT) No. of bitstreams: 1 ozanique_pr_me_sjrp.pdf: 2726501 bytes, checksum: 9c2efc34abc864b1adf1ebe5fa51054c (MD5) Made available in DSpace on 2022-04-12T13:50:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ozanique_pr_me_sjrp.pdf: 2726501 bytes, checksum: 9c2efc34abc864b1adf1ebe5fa51054c (MD5) Previous issue date: 2022-04-08 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) O recrudescimento de bactérias e micobactérias fármaco-resistentes representam desafios à descoberta de novos agentes antibacterianos. Dessa forma, esforços são prementes para descobrir e desenvolver fármacos com padrões estruturais e mecanísticos inovadores. O presente trabalho teve como objetivo a síntese e avaliação de licochalcona C (LCC), uma chalcona C-prenilada com atividade antimicobacteriana inexplorada e atividade antibacteriana descrita como promissora. Também, serão sintetizadas duas séries de análogos chalcônicos de LCC, sendo as séries I e II com análogos modificados nos anéis A e B, respectivamente. A estratégia sintética incluiu reações de iodação e acoplamento de Suzuki, as quais permitiram regiosseletividade da C-prenilação na posição 3. A atividade antibacteriana e antimicobacteriana de LCC foi avaliada contra espécies Gram-positivas, Gram-negativas e micobactérias, exibindo valores de Concentração Inibitória Mínima de: Staphylococcus aureus MSSA (185 µM), Staphylococcus aureus MSRA (185 µM), Staphylococcus epidermidis (18 µM), Enterococcus faecalis (148 µM), Staphylococcus pneumoniae (148 µM), Streptococcus sanguinis (18 µM), Streptococcus sobrinus (37 µM), Streptococcus mutans (37 µM), Helicobacter pylori (74 µM), Pseudomonas aeruginosa (> 1.000 µM), Klebsiella pneumoniae (> 1.000 µM), Escherichia coli (> 1.000 µM), Mycobacterium tuberculosis H37Rv (92 µM), Mycobacterium kansasii (369 µM) e Mycobacterium avium (185 µM). The resurgence of drug-resistant bacteria and mycobacteria pose challenges to the discovery of new antibacterial agents. Thus, efforts are urgent to discover and develop drugs with innovative structural and mechanistic patterns. The present work aimed at the synthesis and evaluation of licochalcone C (LCC), a C-prenylated chalcone with unexplored antimycobacterial activity and antibacterial activity described as promising. Also, two series of chalconic analogues of LCC will be synthesized, with modified analogues in rings A and B. The synthetic strategy included iodination and Suzuki coupling reactions, which allowed regioselectivity of C-prenylation at position 3. The antibacterial and antimycobacterial activity of LCC was evaluated against Gram-positive, Gram-negative and mycobacterial species, exhibiting Minimal Inhibitory Concentration values of: Staphylococcus aureus MSSA (185 µM), Staphylococcus aureus MSRA (185 µM), Staphylococcus epidermidis (18 µM), Enterococcus faecalis (148 µM), Staphylococcus pneumoniae (148 µM), Streptococcus sanguinis (18 µM), Streptococcus sobrinus (37 µM), Streptococcus mutans (37 µM), Helicobacter pylori (74 µM), Pseudomonas aeruginosa (> 1,000 µM), Klebsiella pneumoniae (> 1,000 µM), Escherichia coli (> 1000 µM), Mycobacterium tuberculosis H37Rv (92 µM), Mycobacterium kansasii (369 µM) and Mycobacterium avium (185 µM). CAPES: 88887.612533/2021-00

Submitted by Alvaro Luiz Helena (alvaro.helena@unesp.br) on 2022-04-07T18:56:50Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - Última versão.docx: 2311011 bytes, checksum: f2b2b731f6665c2fa6541bff37eb8caa (MD5) Rejected by Vivian Letícia Duarte Parisi (vivian.parisi@unesp.br), reason: Sua submissão será devolvida para que você possa fazer as correções. Lembramos que o arquivo depositado no repositório deve ser igual ao impresso, o rigor com o padrão da Universidade se deve ao fato de que o seu trabalho passará a ser visível mundialmente. Agradecemos a compreensão. Estamos à disposição caso necessite esclarecer alguma dúvida ou necessite algum auxílio para efetuar as correções. Atenciosamente, Repositório Institucional UNESP UNESP - Câmpus de São José do Rio Preto Rua Cristóvão Colombo, 2265 - Jd. Nazareth São José do Rio Preto – SP. on 2022-04-07T20:23:21Z (GMT) Submitted by Alvaro Luiz Helena (alvaro.helena@unesp.br) on 2022-04-08T12:14:43Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - Última versão biblio.pdf: 2704747 bytes, checksum: df18ed455d1546c935b9256dbd54f59c (MD5) Approved for entry into archive by Vivian Letícia Duarte Parisi (vivian.parisi@unesp.br) on 2022-04-08T15:52:16Z (GMT) No. of bitstreams: 1 helena_al_me_sjrp.pdf: 2704747 bytes, checksum: df18ed455d1546c935b9256dbd54f59c (MD5) Made available in DSpace on 2022-04-08T15:52:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 helena_al_me_sjrp.pdf: 2704747 bytes, checksum: df18ed455d1546c935b9256dbd54f59c (MD5) Previous issue date: 2022-04-03 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Com o crescente desenvolvimento de resistência aos fármacos antibacterianos, as infecções microbianas mais comuns vêm se tornando um grande risco e desafio para saúde pública. A licochalcona H (LCH) foi selecionada como protótipo para o planejamento de três séries de análogos a serem sintetizados e avaliados contra bactérias e micobactérias patogênicas humanas. A LCH é uma retrochalcona C-isoprenilada, sendo um isômero constitucional da licochalcona A (LCA) e da licochalcona C (LCC), isoladas das raízes de Glycyrrhiza glabra (regaliz ou alcaçuz). A série I visa a avaliação de análogos modificados no anel A, permitindo avaliar a relevância da presença e posição da hidroxila e de substituintes eletrodoadores e eletroatratores. As modificações com relação ao substituinte isoprenila do anel B compõem a série II de análogos. A série III é composta pelas reduções parcial e total da cetona α, β-insaturada de LCH. Até o momento foram sintetizadas 35 substâncias, sendo 24 intermediários e 11 produtos finais, sendo eles a LCH, dois produtos naturais (equinatina e loureirina C) e os demais são inéditos na literatura. Para obtenção dos produtos finais desenvolveu-se uma rota sintética inédita que inclui reações de proteção com grupo metoximetila, O-metilação, iodação regiosseletiva, condensação aldólica de Claisen-Schmidt, acoplamento de Suzuki-Miyaura, desproteção e redução de carbonila α, β-insaturada. LCH, equinatina (ECH) e 7 se mostraram ativos contra bactérias Gram-positivas, micobactérias e inativas contra Gram-negativas, exceto contra Helicobacter pylori, com valores de Concentração Inibitória Mínima capaz de inibir pelo menos 90% dos micro-organismos (CIM90) variando de 9,2 – 1480 μM. 7, um regioisômero de LCH, apresentou uma potência aumentada, em comparação com o protótipo, em até 8 vezes contra bactérias Gram-positivas e em até 2 vezes contra micobactérias. Por outro lado 7, foi 3 vezes menos ativa que LCH contra H. pylori. Dos análogos avaliados biologicamente da série I, 7 foi o único que apresentou atividade significante comparado aos controles positivos (tetraciclina e clorexidina), o que indica que a hidroxila no anel A possui contribuição farmacofórica. Contra as micobactérias a ECH foi destaque, considerando sua simplicidade sintética, demonstrando valores de CIM90 variando de 115,6 – 231,2 μM. With the increasing development of resistance to antibacterial drugs, the most common microbial infections have become a major risk and challenge for public health. Licochalcone H (LCH) was selected as a prototype for the design of three series of analogues to be synthesized and evaluated against human pathogenic bacteria and mycobacteria. LCH is a C-isoprenylated retrochalcone, a constitutional isomer of licochalcone A (LCA) and licochalcone C (LCC), isolated from the roots of Glycyrrhiza gabra (regalis or licorice). The series I aims at the evaluation of modified analogues in the A ring, allowing to evaluate the relevance of the presence and position of the hydroxyl and electron donor-acceptor substituents. Modifications with respect to the isoprenyl substituent of B ring compose the series II of analogues. Series III is composed of partial and total reductions of the α, β unsaturated ketone of LCH. So far, 35 substances have been synthesized, 24 of which are intermediates and 11 are final products, being LCH, two natural products (echinatin and loureirin C) and the others are unpublished in the literature. To obtain the final products, an unprecedented synthetic route was developed that includes protection reactions with methoxymethyl group, O-methylation, regioselective iodination, Claisen-Schmidt aldol condensation, Suzuki-Miyaura coupling, deprotection and reduction of α, β unsaturated carbonyl. LCH, echinatin (ECH) and 7 were active against Gram-positive bacteria, mycobacteria and inactive against Gram-negative bacteria, except against Helicobacter pylori, with minimum inhibitory concentration values capable of inhibiting at least 90% of microorganisms (MIC90) ranging from 9,2 – 1480 μM. 7, a regioisomer of LCH, showed an increased potency compared to the prototype, up to 8 times against Gram-positive bacteria and up to 2 times against mycobacteria. On the other hand, 7 was 3 times less active than LCH against H. pylori. Of the biologically evaluated analogues of series I, 7 was the only one that showed significant activity compared to positive controls (tetracycline and chlorhexidine), which indicates that hydroxyl group in the A ring has a pharmacophoric contribution. Against mycobacteria, ECH was the highlight, considering its synthetic simplicity, showing MIC90 values ranging from 115,6 – 231,2 μM. 88887.499740/2020-00

Submitted by Thiago de Lima (thiago.lima@unesp.br) on 2021-02-10T14:10:53Z No. of bitstreams: 1 Versão tese final.pdf: 3444663 bytes, checksum: 7b86a0683ffb265907e31989972792ad (MD5) Approved for entry into archive by Ana Paula Santulo Custódio de Medeiros null (asantulo@rc.unesp.br) on 2021-02-11T12:22:32Z (GMT) No. of bitstreams: 1 lima_t_dr_rcla.pdf: 3128440 bytes, checksum: e5cfc070028c74a22c0e3fc9d7e4326d (MD5) Made available in DSpace on 2021-02-11T12:22:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 lima_t_dr_rcla.pdf: 3128440 bytes, checksum: e5cfc070028c74a22c0e3fc9d7e4326d (MD5) Previous issue date: 2021-01-27 Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) A escolha do local de oviposição em moscas-varejeiras é de suma importância para um desenvolvimento adequado das larvas e futuros adultos, essa escolha geralmente é feita analisando pistas químicas, voláteis ou não, e micro-organismos presentes no ambiente. E independentemente do substrato, as moscas-varejeiras sempre optam por colocar seus ovos agregados à ovos coespecíficos, pois isso garante vantagens à prole. Porém, o motivo pelo qual as fêmeas realizam esse comportamento ainda não é completamente compreendido. Uma das hipóteses é que os ovos e os ovários contêm semioquímicos e bactérias que auxiliam na regulação desse comportamento. Os objetivos desta pesquisa foram descobrir se extratos de ovos em diferentes estágios de desenvolvimento e ovários coespecíficos provocam atração em fêmeas de C. megacephala e C. albiceps e, em caso positivo, traçar o perfil químico dessas estruturas e, em seguida, descrever a comunidade bacteriana da superfície desses ovos e ovários para averiguar a presença de possíveis compostos e micro-organismos que possam afetar o comportamento reprodutivo de alguma maneira, especialmente o de oviposição. Os resultados mostraram que alguns extratos, principalmente em éter, provocam atração em fêmeas e que tanto os compostos químicos encontrados, uma mistura complexa de hidrocarbonetos e ácidos graxos, como as bactérias podem ter um papel na regulação de oviposição, desde a atração ao local até a agregação de adultos e ovos. The choice of oviposition site in blowflies is extremely important for an appropriate development of the larvae and future adults, this choice is usually made by analyzing chemical clues, volatile or not, and microorganisms present in the environment. Regardless the substrate, blowflies always choose to lay their eggs attached to co-specific eggs, since this behaviour guarantees advantages to their offspring. However, the reason why females carry out this behavior is not yet fully understood. One hypothesis is that eggs and ovaries contain semiochemicals and bacteria that help regulate this behavior. The objectives of this research were to find out if egg extracts at different stages of development and cospecific ovaries produce attraction in females of C. megacephala and C. albiceps and, if so, to describe the chemical profile of these structures and then describe the bacterial community on the surface of these eggs and ovaries to verify the presence of possible compounds and microorganisms that may affect reproductive behavior in some way, especially oviposition. The results showed that some extracts, mainly in ether, produce attraction in females and that the chemical compounds found, a complex mixture of hydrocarbons and fatty acids, as well as bacteria can play a role in the oviposition regulation, from attraction to the site to the aggregation of adults and eggs. CNPq: 153424/2016-8

Submitted by Felipe Ricardo Nunes de Moraes (moraes_fe@hotmail.com) on 2021-05-19T13:13:59Z No. of bitstreams: 1 dissertação.pdf: 1043882 bytes, checksum: cca2de93f68c498ccb459a85aafc8782 (MD5) Approved for entry into archive by Claudio Hideo Matsumoto null (claudio@foa.unesp.br) on 2021-05-19T13:53:23Z (GMT) No. of bitstreams: 1 moraes_frn_araca_int.pdf: 1043882 bytes, checksum: cca2de93f68c498ccb459a85aafc8782 (MD5) Made available in DSpace on 2021-05-19T13:53:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 moraes_frn_araca_int.pdf: 1043882 bytes, checksum: cca2de93f68c498ccb459a85aafc8782 (MD5) Previous issue date: 2020-10-28 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) As infecções endodônticas são causadas por uma comunidade multiespécie de bactérias. Com os métodos de identificação microbiológica e quantificação de endotoxinas, é difícil inferir a fisiologia, a função e a patogenicidade microbiana. Assim, a análise proteômica é uma técnica que pode revolucionar o estudo da patogênese das infecções endodônticas. O presente estudo tem por objetivo analisar o perfil proteômico de infecções endodônticas relacionadas a dentes com periodontite apical sintomática ou assintomática utilizando cromatografia líquida associada à espectrometria de Massas. A análise deste perfil proteômico visa a proporcionar a compreensão dos aspectos ecológicos e patogênicos do comportamento de comunidades bacterianas endodônticas através da identificação de proteínas expressas no referido ambiente no momento da coleta e a determinação da função dessas proteínas. Foram coletadas amostras de 18 pacientes encaminhados para tratamento de canal radicular ou tratamento de emergência na Faculdade de Odontologia de Araçatuba FOA – UNESP. Foram incluídos dentes com infecção endodôntica primária, sintomáticos ou assintomáticos. A identificação dos peptídeos foi feita num sistema nanoACQUITY UPLC-Xevo QTof MS system (Waters), a identificação das proteínas foi obtida utilizando o software Protein Lynx Global Server (PLGS) versão 3.0, utilizando o banco de dados de proteínas UniProtKB. A diferença de expressão entre os grupos foi obtida através do mesmo software, considerando-se p0,95 para as proteínas suprareguladas. Foram identificados um total de 2181 números de acessos entre fragmentos, isoformas e proteínas completas humana e 51 proteínas bacterianas e ambas foram classificadas quanto a sua função biológica, em relação às proteínas exclusivas de cada grupo, 347 proteínas foram identificadas no grupo sintomático. As funções biológicas mais prevalentes foram comunicação celular e transdução de sinais, seguidas pela resposta imune, observou-se diversas proteínas exclusivamente expressas no grupo sintomático, indicando a influência direta da periodontite sintomática na resposta do hospedeiro. Endodontic infections are caused by a multispecies community of bacteria. With microbiological identification methods and endotoxin quantification, it is difficult to infer physiology, function and microbial pathogenicity. Thus, proteomic analysis is a technique that can revolutionize the study of the pathogenesis of endodontic infections. The present study aims to analyze the proteomic profile of endodontic infections related to teeth with symptomatic or asymptomatic apical periodontitis using liquid chromatography associated with mass spectrometry. The analysis of this proteomic profile aims to provide an understanding of the ecological and pathogenic aspects of the behavior of endodontic bacterial communities by identifying proteins expressed in the said environment at the time of collection and determining the function of these proteins. Samples were collected from 18 patients referred for root canal treatment or emergency treatment at the School of Dentistry of Araçatuba FOA - UNESP. Teeth with primary endodontic infection, symptomatic or asymptomatic were included. The identification of peptides was made in a nanoACQUITY UPLC-Xevo QTof MS system (Waters) system, the identification of proteins was obtained using protein lynx global server (PLGS) software version 3.0, using the UniProtKB protein database. The difference in expression between the groups was obtained through the same software, considering p0.95 for the superregulated proteins. A total of 2,181 access numbers were identified between human fragments, isoforms and complete proteins and 51 bacterial proteins, and both were classified as their biological function, in relation to the exclusive proteins of each group, 347 proteins were identified in the symptomatic group. The most prevalent biological functions were cellular communication and signal transduction, followed by the immune response, and several proteins were observed exclusively expressed in the symptomatic group, indicating the direct influence of symptomatic periodontitis on the host response. CAPES: 001 FAPESP: 18/08282-9

Submitted by Sâmea Fernandes Joaquim (samea.joaquim@unesp.br) on 2020-03-02T12:28:32Z No. of bitstreams: 1 Defesa Samea - correção 27_02.docx: 774618 bytes, checksum: d1f6754fad53cc02174a016c83171c7a (MD5) Rejected by ROSANGELA APARECIDA LOBO null (rosangelalobo@btu.unesp.br), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo as orientações abaixo: Problema 1: arquivo em word O arquivo submetido deve, obrigatoriamente, estar em formato PDF. Seu arquivo está em Word. problema 2 : Ficha catalográfica No arquivo submetido não consta a ficha catalográfica, item obrigatório para submissão. A ficha deve ser inserida no arquivo PDF logo após a folha de rosto do seu trabalho. Assim que tiver efetuado as correções submeta o arquivo, em formato PDF, novamente. Agradecemos a compreensão. on 2020-03-03T17:31:47Z (GMT) Submitted by Sâmea Fernandes Joaquim (samea.joaquim@unesp.br) on 2020-03-03T19:04:25Z No. of bitstreams: 1 Tese Samea com ficha.pdf: 1000422 bytes, checksum: 04a8e7841ed68acd9fc97f34eee83e1e (MD5) Approved for entry into archive by ROSANGELA APARECIDA LOBO null (rosangelalobo@btu.unesp.br) on 2020-03-04T11:49:57Z (GMT) No. of bitstreams: 1 joaquim_sf_dr_bot_par.pdf: 494292 bytes, checksum: d90619b5a7c1357e79d13148b6727e8f (MD5) Made available in DSpace on 2020-03-04T11:49:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 joaquim_sf_dr_bot_par.pdf: 494292 bytes, checksum: d90619b5a7c1357e79d13148b6727e8f (MD5) Previous issue date: 2020-02-17 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) Os coliformes encontrados no leite podem ser de origem animal em casos de mastites ou provenientes de falhas na obtenção higiênica do leite. Estudos moleculares para identificação de estirpes de Escherichia coli em tanques de expansão são incipientes. Dessa maneira, o presente estudo indentificou os isolados de E. coli presentes em tanques de expansão de propriedades leiteiras, bem como genes associados a fatores de virulência, genes envolvidos na formação de biofilmes e pesquisa de genes de isolados produtores da enzima β-lactamase de espectro extendido (ESBL), além de estudos fenotípicos de multirresistência a antimicrobianos e formação de biofilmes em diferentes materiais. Foram isoladas 149 amostras de E. coli, dentre as quais, 24,2% obtiveram índice de resistência múltipla aos antimicrobianos (IRMA) >0,3. Quanto a formação de biofilmes, 42,28% dos isolados produziram em plástico de poliestireno, 21,48% em inox e 56,38% em silicone. Quanto à susceptibilidade dos produtores de biofilme ao iodo e digluconato de clorexidine, esses desinfetantes foram capazes de inibir a formação de biofilme, porém tiveram seu efeito diminuído em 25,40% das amostras após a formação do biofilme maduro. Foram detectados genes relacionados com a produção de biofilme, entretanto os genes de E. coli common pilus mostraram associação negativa com a produção fenotípica nos materiais analisados (p 0.3. As for the formation of biofilms, 42.28% of the isolates produced in polystyrene plastic, 21.48% in stainless steel and 56.38% in silicone. As for the susceptibility of biofilm producers to iodine and chlorhexidine digluconate, these disinfectants were able to inhibit the formation of biofilm, but their effect was reduced in 25.40% of the samples after the formation of the mature biofilm. Genes related to biofilm production were detected, however E. coli common pilus genes showed a negative association with phenotypic production in the analyzed materials (p

Submitted by Danila de Oliveira (danila.oliveira@unesp.br) on 2020-02-13T01:36:25Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_DANILA_DE_OLIVEIRA.pdf: 46112715 bytes, checksum: 8f12161e4e2048512f583ff12031bbc2 (MD5) Approved for entry into archive by Ana Paula Rimoli de Oliveira null (anapaula@foa.unesp.br) on 2020-02-14T14:56:58Z (GMT) No. of bitstreams: 1 oliveira_d_me_araca_par.pdf: 213641 bytes, checksum: 4d744384f356e5ba313088f44823d0ba (MD5) Made available in DSpace on 2020-02-14T14:56:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 oliveira_d_me_araca_par.pdf: 213641 bytes, checksum: 4d744384f356e5ba313088f44823d0ba (MD5) Previous issue date: 2020-02-10 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) Objetivo: quantificar bactérias colonizadoras do sulco gengival em paralelo à verificação do comportamento clínico periodontal e da adaptação marginal de laminados cerâmicos cimentados sobre dentes sem término cervical. Métodos: 73 laminados cerâmicos em dissilicato de lítio monolítico foram cimentados sobre dentes naturais sem término cervical e com a margem cervical posicionada cerca de 0,5mm no interior do sulco gengival. Para todos os dentes foi feita a coleta do fluido gengival crevicular (FGC) previamente à cimentação da restauração (baseline) e em 7, 180 e 365 dias após a cimentação para quantificação das bactérias S. mitis, P. intermedia e P. gingivalis através de PCR em tempo real. Clinicamente foram avaliados os parâmetros índice de placa visível (IPV), sangramento à sondagem (SS), profundidade de sondagem (PS), perda de inserção clínica (PIC), recessão gengival (RG) e a adaptação marginal da restauração em baseline, 7, 15, 30, 60, 180 e 365 dias. Foram obtidas réplicas da região cervical para análise da adaptação marginal por microscopia eletrônica de varredura (MEV). Resultados: Não houve diferença estatisticamente significante para o IPV, PS, SS em todos os períodos analisados (Anova, p>0,05). Não houve registro de PIC e RG. Houve diferença estatisticamente significante para S. mitis na comparação entre 180 e 365 dias (Dunn, p=0,03). Não foi detectado P. intermedia em nenhum dos sítios e não houve diferença estatisticamente significante para P. gingivalis em todos os tempos do estudo (Friedman, p>0,05). Todas as restaurações receberam o conceito alfa para a adaptação marginal nas análises clínica e microscópica. Conclusões: o sobrecontorno causado pelo laminado cerâmico não contribuiu para o acúmulo de placa na região cervical e para alterações no comportamento clínico periodontal, microbiológico e microscópico em relação aos mesmos dentes antes do tratamento restaurador. Purpose: quantify colonizing bacteria of the gingival sulcus, in parallel to the verify of the periodontal clinical behavior and the marginal adaptation of natural teeth restored with ceramic veneers without finish line. Methods: 73 ceramic veneers in monolithic lithium disilicate were cemented onto natural teeth without finish line and with the cervical margin positioned about 0.5mm inside the gingival sulcus. Gingival crevicular fluid (GCF) was collected for all teeth prior to cementation of the restoration (baseline) and 7, 180 and 365 days after cementation to quantify the bacteria S. mitis, P. intermedia and P. gingivalis through of real-time PCR. Clinically, visible plaque index (PIV), bleeding on probing (BOP), probing depth (PD), clinical attachment level (CAL), gingival recession (GR) and marginal adaptation were evaluated at baseline, 7, 15, 30, 60, 180 and 365 days. Replicas of the cervical region were obtained for analysis of marginal adaptation by scanning electron microscopy (SEM). Results: There was no statistically significant difference for PIV, PD, BOP in all periods analyzed (Anova, p>0.05). There were no records of CAL and RG. There was a statistically significant difference for S. mitis in the comparison between 180 and 365 days (Dunn, p=0.03). P. intermedia was not detected in any of the analyzed samples. There was no statistically significant difference for P. gingivalis at all study times (Friedman, p>0.05). All restorations had an alpha concept for marginal adaptation in clinical and SEM analysis. Conclusions: the overcontouring caused by ceramic veneers did not contribute to the accumulation of plaque in the cervical region and to changes in the clinical, microbiological and microscopic behavior in relation to the same teeth before the restorative treatment. CAPES: 001; FAPESP 2017/27188-0.

Submitted by Ana Claudia dos Santos (ana.c.santos@unesp.br) on 2022-04-18T19:00:42Z No. of bitstreams: 1 ilovepdf_merged_organized Ana Claudia.pdf: 1150389 bytes, checksum: 97ad975f65e53de3aea6b6be87f90036 (MD5) Approved for entry into archive by Laudicélia Martins Arantes (lm.arantes@unesp.br) on 2022-04-18T19:42:43Z (GMT) No. of bitstreams: 1 santos_ac_me_jabo.pdf: 1150389 bytes, checksum: 97ad975f65e53de3aea6b6be87f90036 (MD5) Made available in DSpace on 2022-04-18T19:42:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 santos_ac_me_jabo.pdf: 1150389 bytes, checksum: 97ad975f65e53de3aea6b6be87f90036 (MD5) Previous issue date: 2019-09-11 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Bactérias promotoras de crescimento de plantas podem ser uma alternativa para a produção vegetal em problemas como aumento dos índices de produtividade, e diminuição dos impactos ambientais. As bactérias probióticas possuem diversas habilidades, dentre elas facilitar a digestão e a absorção de nutrientes, e fortalecer o sistema imunológico de homens e animais. Nesse sentido, o objetivo desse estudo foi avaliar se os micro-organismos probióticos podem trazer benefícios também as plantas, como incremento de nutrientes. Para isso, utilizou-se as culturas de milho e soja, onde foi inoculado bactérias probióticas isoladas do rúmen: Bacillus cereus, Lactobacillus acidophilus e Succinovibrio dextrinosolvens. Os testes in vitro mostraram que as bactérias foram capazes de fixar nitrogênio, solubilizar o fósforo, sintetizar ácido indolacético e amilase. Depois dos testes in vitro, os experimentos foram conduzidos em casa de vegetação em blocos casualizados com cinco tratamentos e seis repetições, sendo eles T1= Controle; T2= Bacillus cereus, T3= Lactobacillus acidophilus, T4= Succinovibrio dextrinosolvens, T5= Bacillus cereus + Lactobacillus acidophilus + Succinovibrio dextrinosolvens. A inoculação com S. dextrinosolvens proporcionou o aumento da massa seca de raiz em milho, enquanto que a aplicação individual com L. acidophilus e em conjunto com as demais bactérias, proporcionaram o aumento do teor fósforo nas raízes de milho. Nas plantas de soja, a inoculação com L. acidophylus promoveu o aumento da massa seca da parte aérea e da concentração de fósforo e nitrogênio, em comparação ao tratamento não inoculado. Este é o primeiro relato mostrando que a bactéria L. acidophilus e S. dextrinosolvens possuem potencial para serem utilizadas como bactérias promotoras de crescimento de plantas. Plant growth-promoting bacteria may be an alternative to crop production in problems such as increased yields and reduced environmental impacts. Probiotic bacteria have many abilities, including facilitating digestion and absorption of nutrients, and strengthening the immune system of humans and animals. In this sense, the objective of this study was to evaluate if probiotic microorganisms can also bring benefits to plants, such as nutrient increment. For this, corn and soybean cultures were used, where probiotic bacteria isolated from the rumen were inoculated: Bacillus cereus, Lactobacillus acidophilus and Succinovibrio dextrinosolvens. In vitro tests showed that bacteria were able to fix nitrogen, solubilize phosphorus, synthesize indolacetic acid and amylase. After in vitro tests, the experiments were conducted in a greenhouse in randomized blocks with five treatments and six replications, T1 = Control; T2 = Bacillus cereus, T3 = Lactobacillus acidophilus, T4 = Succinovibrio dextrinosolvens, T5 = Bacillus cereus + Lactobacillus acidophilus + Succinovibrio dextrinosolvens. The inoculation with S. dextrinosolvens increased the root dry mass in maize, while the individual application with L. acidophilus and together with the other bacteria, increased the phosphorus content in the corn roots. In soybean plants, inoculation with L. acidophylus promoted the increase of shoot dry mass and phosphorus and nitrogen concentration, compared to uninoculated treatment. This is the first report showing that L. acidophilus and S. dextrinosolvens have the potential to be used as plant growth promoting bacteria. CAPES

Submitted by Felipe Morales Dalanezi (fm.dalanezi@unesp.br) on 2019-08-28T16:57:25Z No. of bitstreams: 1 Tese doutorado - Felipe Morales Dalanezi.pdf: 1350568 bytes, checksum: 2b36a7c1b28d82a3d0f179651daa1fae (MD5) Approved for entry into archive by ROSANGELA APARECIDA LOBO null (rosangelalobo@btu.unesp.br) on 2019-08-30T11:25:02Z (GMT) No. of bitstreams: 1 dalanezi_fm_dr_bot.pdf: 1350568 bytes, checksum: 2b36a7c1b28d82a3d0f179651daa1fae (MD5) Made available in DSpace on 2019-08-30T11:25:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dalanezi_fm_dr_bot.pdf: 1350568 bytes, checksum: 2b36a7c1b28d82a3d0f179651daa1fae (MD5) Previous issue date: 2019-08-22 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) A mastite bovina é responsável por grandes perdas econômicas na bovinocultura de leite, além de aspectos de saúde pública que devem também ser considerados. Animais com mastite clínica ou subclínica apresentam diversas alterações reprodutivas. No primeiro artigo da tese, os resultados obtidos demonstraram que a mastite causada por patógenos maiores (20,1%) ou por gram-negativos (15,4%) levaram a queda na taxa de prenhez na primeira inseminação comparado com o grupo controle (32,6%). Foi observado maior taxa de perda gestacional para os grupos de patógenos maiores (22,2%) e gram-negativos (30,1%) comparados com o controle (12,8%). Foi observado diferença entre todos os grupos para o número de dias em aberto. O grupo controle apresentou o menor intervalo (126,5 dias) seguido pelo grupo patógenos menores (162,0 dias) e pelo grupo de patógenos maiores (175,1 dias). Comportamento similar observado para patógenos gram-positivo (172,7 dias) e patógenos gram-negativos (191,1 dias). Portanto, é importante controlar a mastite em rebanhos leiteiros e, para tanto, o diagnóstico é uma etapa importante. Diferentes proteínas de fase aguda foram descritas como bons biomarcadores para o diagnóstico da mastite. No segundo artigo da tese, foi observado que diferentes patógenos podem alterar a liberação de proteínas de fase aguda no leite. Bactérias que causam inflamações mais graves (E. coli e Klebsiella pneumoniae) levaram maior concentração das APP. Patógenos que causam infecções crônica (Streptococcus ambientais Staphylococcus aureus, Mycoplasma spp.) levaram a concentrações intermediarias das APP Micro-organismos que causam mastite menos graves (Staphylococcus coagulase negativa e Enterococcus spp.) levaram a menores concentrações das APP. Hp, AGP e CRP apresentaram correlação forte, positiva e significativa. Bovine mastitis is responsible for major economic losses in dairy cattle farming, as well as public health aspects that should also be considered. Animals with clinical or subclinical mastitis present several reproductive alterations. In the first article of this thesis, the results showed that mastitis caused by major pathogens (20.1%) or gram-negative (15.4%) led to a decrease in pregnancy rate in the first insemination compared to the control group (32.6%). Higher gestational loss rates were observed for the major (22.2%) and gram-negative (30.1%) pathogen groups compared with the control (12.8%). The difference was observed between all groups for the number of days open. The control group had the shortest interval (126.5 days) followed by the minor pathogens group (162.0 days) and the major pathogens group (175.1 days). Similar behavior observed for gram-positive pathogens (172.7 days) and gram-negative pathogens (191.1 days). Therefore, it is important to control mastitis in dairy herds and, so, diagnosis is a critical step. Different acute phase proteins have been described as good biomarkers for the diagnosis of mastitis. In the second article of this thesis, it was observed that different pathogens may alter the release of acute phase proteins in milk. Bacteria that cause more severe inflammation (E. coli and K. pneumoniae) led to a higher concentration of APP. Pathogens causing chronic infections (Environmental Streptococcus, S. aureus, Mycoplasma spp.) led to intermediate concentrations of APP. Less severe mastitis causing microorganisms (Coagulase-negative Staphylococcus and Enterococcus spp.) led to lower concentrations of APP. Haptoglobin, AGP, and CRP showed strong, positive and significant correlations. FAPESP: 2015/21066-1 CAPES: 001

Submitted by Daniel Dalvan do Nascimento (dalvan.nascimento@unesp.br) on 2019-05-31T23:03:56Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Daniel Dalvan do Nascimento.pdf: 1126794 bytes, checksum: 35250b8407847725db4b0838dc17cc6c (MD5) Approved for entry into archive by Neli Silvia Pereira null (nelisps@fcav.unesp.br) on 2019-06-03T16:50:25Z (GMT) No. of bitstreams: 1 nascimento_dd_me_jabo.pdf: 1126794 bytes, checksum: 35250b8407847725db4b0838dc17cc6c (MD5) Made available in DSpace on 2019-06-03T16:50:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 nascimento_dd_me_jabo.pdf: 1126794 bytes, checksum: 35250b8407847725db4b0838dc17cc6c (MD5) Previous issue date: 2019-02-27 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) O Brasil, segundo maior produtor e também maior exportador de soja, tem grande parte da produção comprometida devido aos danos causados por nematoides. Para tanto, vários estudos têm relatado a eficiência de bactérias promotoras de crescimento no controle de nematoides nas mais diversas culturas. Diante do exposto, o objetivo desse trabalho foi selecionar isolados de três espécies de Bacillus eficientes no controle dos nematoides, Heterodera glycines, Meloidogyne incognita e M. javanica, e também, na promoção de crescimento da soja, sob diferentes formas de aplicação. Foram testados 19 isolados de Bacillus subtilis, B. velezensis (syn. B. amyloliquefaciens) e B. methylotrophicus, aplicados via Tratamento de sementes (TS) e Sulco de semeadura (SS), mais testemunhas (com e sem nematoides) e comercias [Bacillus subtilis UFPEDA 764 (TS); B. subtilis UFPEDA 764 (SS); Abamectina (TS); Cadusafós (SS)]. Avaliou-se a emergência das plântulas, altura da planta, massa fresca e seca das partes aéreas, massa fresca das raízes, número de vagens, índice de clorofila, nematoide total, nematoide por grama de raízes e fator de reprodução. Devido a existência de uma estrutura de dependência contida nas variáveis originais, realizou-se análise exploratória dos dados, via Análise de Componentes Principais (ACP), as variáveis independentes foram testadas via análise de Modelo Linear Geral (GLM). Os resultados mostraram que para as três espécies de nematoides, o método de aplicação via SS favoreceu a emergência das plântulas de soja, sendo mais eficiente que o método de aplicação via TS, ambos os métodos foram melhores que a testemunha não tratada com Bacillus spp.. Entretanto, o método de aplicação via TS foi superior comparado ao SS para as variáveis, altura da planta, massa fresca e seca das partes aéreas, massa fresca das raízes, número de vagens e índice de clorofila, bem como foi melhor para a supressão dos nematoides. Dos isolados de Bacillus spp. testados, ACB-01, ACB-08, ACB-22 e ACB-AP3 foram eficientes para promoção de crescimento da soja e supressão de H. glycines, M. incognita e M. javanica. Brazil, the second largest producer and also the largest exporter of soybeans, has a large part of the production compromised due to damage caused by nematodes. For this, several studies have reported the efficiency of growth-promoting bacteria in the control of nematodes in the most diverse cultures. In view of the above, the objective of this work was to select isolates of three species of Bacillus spp. efficient in the control of nematodes, Heterodera glycines, Meloidogyne incognita and M. javanica and also in the promotion of soybean growth under different forms of application. Nineteen isolates of Bacillus subtilis, B. velezensis (syn. B. amyloliquefaciens) and B. methylotrophicus were tested on application by seed treatment (ST) and sowing furrow (SF), plus controls (with and without nematodes) and commercial [Bacillus subtilis UFPEDA 764 (ST); B. subtilis UFPEDA 764 (SF); Abamectin (ST); Cadusafós (SF)]. Seed emergence, plant height, fresh and dry mass of aerial parts, fresh root mass, number of pods, total chlorophyll content, total nematode, nematode per gram of roots and reproductive factor were evaluated. Due to the existence of a dependency structure contained in the original variables, an exploratory analysis of the data was carried out, via Principal Component Analysis (PCA), the independent variables were tested through GLM analysis. The results showed that for the three nematode species, the SF application method favored the emergence of soybean seedlings, being more efficient than the ST application method, both methods were better than the control not treated with Bacillus spp. However, the ST application method was superior, compared to SF, for the variables, plant height, fresh and dry mass of the aerial parts, fresh root mass, number of pods and chlorophyll content, and was better for the suppression of nematodes. Among the isolates of Bacillus spp, tested, ACB-01, ACB-08, ACB-22 and ACB-AP3 were efficient for promoting soybean growth and suppression of H. glycines, M. incognita and M. javanica. 001

Submitted by CAMILA AMBROSIO DIAS (camila_6892@hotmail.com) on 2019-02-04T11:05:24Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Camila.pdf: 868128 bytes, checksum: 448f3de67d60045baeff644181e96034 (MD5) Approved for entry into archive by Ana Paula Rimoli de Oliveira null (anapaula@foa.unesp.br) on 2019-02-04T12:02:42Z (GMT) No. of bitstreams: 1 machado_cad_me_araca_int.pdf: 868128 bytes, checksum: 448f3de67d60045baeff644181e96034 (MD5) Made available in DSpace on 2019-02-04T12:02:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 machado_cad_me_araca_int.pdf: 868128 bytes, checksum: 448f3de67d60045baeff644181e96034 (MD5) Previous issue date: 2018-12-06 Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) O objetivo deste estudo clínico foi avaliar a eficácia de dois sistemas rotatórios: HyFlex CM e ProTaper Next na remoção de bactérias cultiváveis e endotoxinas de canais radiculares infectados. Vinte e quatro canais radiculares de molares e pré-molares com necrose pulpar e lesão periapical foram selecionados e divididos aleatoriamente em 2 grupos: HyFlex CM (n = 12); e ProTaper Next (n = 12). As amostras foram coletadas antes e após o preparo biomecânico e inoculadas em frascos específicos. A irrigação foi realizada com hipoclorito de sódio a 2,5%. Um teste turbidimétrico LAL (Pyrogent 5000 – Lonza, Walkersville, MD, EUA) foi utilizado para quantificar endotoxinas. Cultura microbiológica foi utilizada para determinar a contagem de unidades formadoras de colônias bacterianas (UFC/mL). Os dados coletados foram analisados estatisticamente usando SigmaPlot 12.0 para Windows (Systat Software Inc., San Jose, CA). Foi realizado o teste estatístico de Two-Way ANOVA e o nível de significância foi de 5%. Nas coletas antes do preparo biomecânico, bactérias cultiváveis e endotoxinas foram evidenciadas em 100% das amostras. A análise de cultura revelou que não houve uma diferença estatisticamente significativa na redução bacteriana entre os dois sistemas de instrumentação. As endotoxinas estavam presentes em 100% dos canais após a instrumentação e não houve diferença estatística entre os dois sistemas na redução de endotoxinas. Assim, concluímos que ambos os sistemas de instrumentação foram eficazes na redução de bactérias e endotoxinas de canais radiculares com infecção endodôntica primária e que não houve diferença estatística entre eles. Contudo, nenhum sistema foi capaz de eliminar 100% das bactérias e seus subprodutos. The aim of this clinical study was to compare the effectiveness of two rotary systems: HyFlex CM and ProTaper Next on the removal of cultivable bacteria and endotoxins from primarily infected root canals. Twenty-four root canals of molars and premolars with pulp necrosis were selected and randomly divided into 2 groups: HyFlex CM (n = 12); and ProTaper Next (n = 12). Samples were collected before and after the biomechanical preparation and inoculated in specific flasks. Irrigation was performed using 2.5% sodium hypochlorite. A kinetic turbidimetric lysate assay of limulus amoebocytes was used to quantify endotoxins. Microbiological culture was used to determine the count of bacterial colony forming units (CFU/mL). Data collected were statistically analyzed using SigmaPlot 12.0 for Windows (Systat Software Inc, San Jose, CA). The Two-Way ANOVA statistical test was performed and the level of significance was 5%. In the samples before the biomechanical preparation, cultivable bacteria and endotoxins were evidenced in 100% of the cases. The culture analysis revealed that there was no statistically significant difference in the bacterial reduction between the two instrumentation systems. Endotoxins were present in 100% of the canals after instrumentation, and there was no statistical difference between the two systems in endotoxin reduction. Thus, it was concluded that both instrumentation systems were effective in reducing root canal bacteria and endotoxins with primary endodontic infection and that there was no statistical difference between them. However, no system was able to eliminate 100% of the bacteria and their by-products. 16/08157-4

Submitted by Maria Sílvia Mauricio Rigolin (mariasilvia-ms@hotmail.com) on 2018-08-30T12:17:11Z No. of bitstreams: 1 TESE Doutorado Maria Sílvia.pdf: 2334416 bytes, checksum: ac49c8231d489e17deb4d48e1798f5d4 (MD5) Rejected by Marley Cristina Chiusoli Montagnoli (marley@foar.unesp.br), reason: Por favor, corrija o que segue: - No arquivo da tese enviado, a ficha catalográfica tem que estar logo após a página de rosto. No seu arquivo foi inserida após os dados curriculares. - O arquivo da tese não tem numeração de páginas. - Você agradeceu a Capes pela bolsa financiada na tese, mais não preencheu isso no campo de Financiamento no Metadados. on 2018-08-31T19:29:51Z (GMT) Submitted by Maria Sílvia Mauricio Rigolin (mariasilvia-ms@hotmail.com) on 2018-09-01T19:53:49Z No. of bitstreams: 2 TESE Doutorado Maria Sílvia.pdf: 2334416 bytes, checksum: ac49c8231d489e17deb4d48e1798f5d4 (MD5) TESE Doutorado Maria Sílvia.pdf: 2334893 bytes, checksum: ee55247bb3420e45898c885e5670dba8 (MD5) Rejected by Marley Cristina Chiusoli Montagnoli (marley@foar.unesp.br), reason: Fazer as seguintes correções: No sumário: - 4.3.1 Descongelamento das células é página 41, você escreveu 42 - 4.3.3 Adesão celular Nok-Si....... 42 (incluir esse item no Sumário, pois não consta) - 6 DISCUSSÃO é página 61, você escreveu página 61 Metadados: Quando você preencheu o campo Metadados, você não preencheu a agência de fomento. on 2018-09-04T19:03:04Z (GMT) Submitted by Maria Sílvia Mauricio Rigolin (mariasilvia-ms@hotmail.com) on 2018-09-05T02:11:56Z No. of bitstreams: 3 TESE Doutorado Maria Sílvia.pdf: 2334416 bytes, checksum: ac49c8231d489e17deb4d48e1798f5d4 (MD5) TESE Doutorado Maria Sílvia.pdf: 2334893 bytes, checksum: ee55247bb3420e45898c885e5670dba8 (MD5) TESE Doutorado Maria Sílvia.pdf: 2335009 bytes, checksum: 45ca6374871a27263f17b8560d7a0248 (MD5) Approved for entry into archive by Marley Cristina Chiusoli Montagnoli (marley@foar.unesp.br) on 2018-09-05T13:02:28Z (GMT) No. of bitstreams: 1 rigolin_msm_dr_arafor_par.pdf: 443418 bytes, checksum: 8e65241293ca0673b6ce23c12849dee9 (MD5) Made available in DSpace on 2018-09-05T13:02:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 rigolin_msm_dr_arafor_par.pdf: 443418 bytes, checksum: 8e65241293ca0673b6ce23c12849dee9 (MD5) Previous issue date: 2018-07-10 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) A longevidade dos implantes dentários depende da manutenção do tecido peri-implantar e da ausência de inflamação nessa área. Semelhante aos dentes, as bactérias patogênicas podem aderir nas superfícies dos abutments dos implantes e causar doença peri-implantar. As propriedades físico-químicas intrínsecas a cada material ao longo do tempo podem sofrer alterações e assim afetar a adesão devido a constante renovação celular e ao desenvolvimento do biofilme. Avaliar a influência do envelhecimento de materiais de abutment de titânio (Ti) e zircônia (ZrO2) na viabilidade, morfologia, adesão e proliferação de biofilmes de ceranócitos orais normais (Nok-si) e biofilme multiespécie Porphyromonas gingivalis, Streptococcus sanguinis e Fusobacterium nucleatum. Nos discos de ZrO2 e Ti foram analisados rugosidade superficial (Ra), ângulo de contato com a água e difração de raios X (DRX), antes e após o envelhecimento em autoclave. A viabilidade celular de Nok-si foi avaliada pelo ensaio de MTT e a morfologia foi analisada por microscopia eletrônica de varredura (MEV). A proliferação celular e a adesão foram analisadas usando microscópio confocal. Biofilme multiespécies foram analisados quantitativamente por Log (UFC/mL) e qualitativamente por MEV. Para Ti, diferença estatisticamente significante foram encontradas entre as medidas de rugosidade antes e depois do processo de envelhecimento, entretanto o processo de envelhecimento não afetou a rugosidade média dos discos de ZrO2. O processo de envelhecimento afetou a molhabilidade da superfície do Ti quando em contato com água e polietilenoglicol, para a superfície do ZrO2 quando em contato com etilenoglicol e polietilenoglicol (p

Submitted by ALVARO ITAUNA SCHALCHER PEREIRA (alvaro.pereira@ifma.edu.br) on 2017-05-25T17:16:41Z No. of bitstreams: 1 ALVARO ITAUNA SCHALCHER PEREIRA.pdf: 1602349 bytes, checksum: fb52c60e156f7be9b84bd7cf7e740220 (MD5) Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-05-30T16:22:02Z (GMT) No. of bitstreams: 1 pereira_ais_dr_sjrp_par.pdf: 547054 bytes, checksum: b4aa527fbd4791ac1577aa5e46fbcab5 (MD5) Made available in DSpace on 2017-05-30T16:22:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 pereira_ais_dr_sjrp_par.pdf: 547054 bytes, checksum: b4aa527fbd4791ac1577aa5e46fbcab5 (MD5) Previous issue date: 2017-04-28 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Os óleos essenciais obtidos de plantas medicinais vêm sendo ressaltados ao longo das décadas e sua eficácia tem sido evidenciada por pesquisadores de todo mundo, devido ao seu efeito antibacteriano. Objetivou-se avaliar a atividade antibacteriana de óleos essenciais extraídos por hidrodestilação e determinar a composição química por cromatografia gasosa acoplada à espectrometria de massas (CG/EM) de cinco plantas medicinais dentre elas alecrim (Rosmarinus officinalis L.), capim-limão (Cymbopogon citratus (D. C.) Stapf), cravo-da-índia (Caryophyllus aromaticus L.), eucalipto (Eucalyptus citriodora H.) e manjericão (Ocimum basilicum L.), selecionadas em mercados e/ou feiras livres de São Luís – MA. Para tanto, os testes microbiológicos foram utilizados seis cepas bacterianas da American (ATCC): Staphylococcus aureus (ATCC 25923), Bacillus cereus (ATCC 10876) e Enterococcus faecalis (ATCC 29212) Gram-positivas além de Escherichia coli (ATCC 25922), Salmonella enterica sorotipo Choleraesuis (ATCC 12011) e Pseudomonas aeruginosa (ATCC 9027) Gram-negativas e comparados com antimicrobiano padrão. As Concentrações Mínimas Inibidoras (MIC) utilizadas foram 25, 50, 75 e 100µɡ/mL. Os resultados da atividade antibacteriana in vitro com os halos de inibição das espécies bacterianas selecionadas, foram analisadas sobre teste de ANOVA, utilizando-se o Delineamento em Blocos ao Acaso, contendo cinco tratamentos, em dois blocos sendo possível constatar a não existência de diferença estatística em variáveis (p≤0,05). Para o óleo essencial do capim-limão, em especial para Staphylococcus aureus e Bacillus cereus com concentração de 75µɡ/mL. O óleo essencial do cravo-da-índia, atingiu um resultado frente à bactéria Staphylococcus aureus com uma concentração de 25µɡ/mL e as demais bactérias Bacillus cereus, Escherichia coli e Salmonella enterica sorotipo Choleraesuis com 50µɡ/mL, sendo Pseudomonas aeruginosa na concentração de 100µɡ/mL. O óleo essencial de Eucalipto conseguiu obter um resultado parcialmente ativo para as bactérias gram-negativas Escherichia coli e Salmonella enterica sorotipo Choleraesuis com concentração a partir de 50µɡ/mL e ativo para uma concentração de 75µɡ/mL para a bactéria gram-positiva Staphylococcus aureus. Por fim, o óleo essencial do manjericão na concentração de 25µɡ/mL sendo ativo perante a bactéria Staphylococcus aureus, aumentou-se a concentração para 50mg/mL na Gram-positiva Bacillus cereus e nas duas Gram-negativas Escherichia coli e Salmonella enterica sorotipo Choleraesuis, ambas sofreram a ação bactericida do óleo essencial. A bactéria Enterococcus faecalis apesar de ter sido classificada pelo halo de inibição ativa precisou de concentração mínima do estudo. Os óleos essenciais foram analisados por cromatografia de gases e espectrometria de massas – CG/EM e determinados os parâmetros físico-químicos: densidade, índice de refração, solubilidade em álcool (70%), odor, cor, aparência. Posteriormente, os picos cromatográficos (fingerprints) dos componentes minoritários e majoritários presentes nas diferentes frações dos cincos óleos essenciais foram identificados e quantificados. Para tanto, os compostos identificados pela análise química de CG/EM constataram a presença de monoterpenos e sesquiterpenos hidrocarbonados (não oxigenados) e oxigenados, além de três fenilopropanoides com diversidade de estruturas químicas de baixo peso molecular. Assim sendo, estudos futuros, visando à aplicabilidade destes óleos como aditivos naturais, devem ser realizados na tentativa de aumentar a vida de prateleira de alimentos, bem como melhorar as características físico-químicas e alcançar a segurança alimentar desejada. Essential oils obtained from medicinal plants have been highlighted over the decades and their efficacy has been evidenced by researchers around the world due to their antibacterial effect. The objective of this study was to evaluate the antibacterial activity of essential oils extracted by hydrodistillation and to determine the chemical composition by gas chromatography coupled to mass spectrometry (CG/MS) of five medicinal plants such as rosemary (Rosmarinus officinalis L.), lemon grass (Cymbopogon citratus (DC) Stapf), clove (Caryophyllus aromaticus L.), eucalyptus (Eucalyptus citriodora H.) and basil (Ocimum basilicum L.), Selected in markets and/or free fairs of São Luís - MA. For this purpose, six bacterial strains of Gram-positive American Type Culture Colletion (ATCC): Staphylococcus aureus (ATCC 25923), Bacillus cereus (ATCC 10876) and Enterococcus faecalis (ATCC 29212) were used in addition to Escherichia coli (ATCC 25922), Salmonella enterica serotype Choleraesuis (ATCC 12011) and Pseudomonas aeruginosa (ATCC 9027) Gram-negative and compared with standard antimicrobial. The Minimum Inhibitory Concentrations (MIC) used were 25, 50, 75 and 100μɡ/mL. The results of the in vitro antibacterial activity with the inhibition halos of the selected bacterial species were analyzed on the ANOVA test, using the randomized block design, containing five treatments, in two blocks and it was possible to verify the existence of statistical difference In variables (p≤0,05). For lemongrass essential oil, especially for Staphylococcus aureus and Bacillus cereus with a concentration of 75μɡ/mL. The essential oil of the clove reached a result against Staphylococcus aureus with a concentration of 25μɡ/mL and the other bacteria Bacillus cereus, Escherichia coli and Salmonella enterica serotype Choleraesuis with 50μɡ/mL, being Pseudomonas aeruginosa at the concentration of 100μɡ/mL. Finally, the essential oil of basil at a concentration of 25μɡ/mL being active against the bacterium Staphylococcus aureus, the concentration was increased to 50mg / mL in Gram-positive Bacillus cereus and in the two Gram-negative Escherichia coli and Salmonella enterica serotype Choleraesuis, Both underwent the bactericidal action of the essential oil. The bacterium Enterococcus faecalis, despite being classified by the active inhibition halo, required a minimum concentration of the study. The essential oils were analyzed by gas chromatography and GC/MS mass spectrometry and the physicochemical parameters were determined: density, refractive index, alcohol solubility (70%), odor, color, appearance. Subsequently, the fingerprints of the minority and major components present in the different fractions of the five essential oils were identified and quantified. For this, the compounds identified by the GC/MS chemical analysis showed the presence of monoterpenes and hydrocarbon (non-oxygenated) and oxygenated sesquiterpenes, in addition to three phenylpropanoids with a diversity of low molecular weight chemical structures. Therefore, future studies aiming at the applicability of these oils as natural additives should be carried out in an attempt to increase the shelf life of foods, as well as to improve the physico-chemical characteristics and achieve the desired food safety.

Submitted by Roberta Alves Merguizo Chinellato null (robmerguizo@yahoo.com.br) on 2017-02-13T20:05:29Z No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO ROBERTA CORREÇÃO.pdf: 2087375 bytes, checksum: 1e6e52c04ff2049723f222505199bc2f (MD5) Approved for entry into archive by LUIZA DE MENEZES ROMANETTO (luizamenezes@reitoria.unesp.br) on 2017-02-15T18:25:56Z (GMT) No. of bitstreams: 1 chinellato_ram_me_svic.pdf: 2087375 bytes, checksum: 1e6e52c04ff2049723f222505199bc2f (MD5) Made available in DSpace on 2017-02-15T18:25:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 chinellato_ram_me_svic.pdf: 2087375 bytes, checksum: 1e6e52c04ff2049723f222505199bc2f (MD5) Previous issue date: 2017-01-18 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Com o processo de expansão industrial, as regiões costeiras e estuarinas passaram a perceber a instalação de várias indústrias, devido à proximidade aos mercados consumidores e produtores, além da facilidade de escoamento de sua produção. Essas indústrias consomem uma grande quantidade de água, que é devolvida ao ambiente juntamente com uma série de substâncias tóxicas dissolvidas, incluindo hidrocarbonetos aromáticos, de biodegradabilidade intermediária e tendência à bioacumulação. Regiões estuarinas apresentam maior dificuldade de biorremediação, devido ao fato dos contaminantes ficarem aderidos ao sedimento. Além do descarte costeiro habitual, acidentes tendem a lançar uma quantidade maior e descontrolada de poluentes. A biorremediação é o processo de tratamento que utiliza os microrganismos encontrados tanto no ambiente terrestre como aquáticos contaminados para degradar substâncias toxicamente perigosas transformando-as em substâncias menos ou não tóxicas. As atividades para conter o incêndio no Terminal Químico Aratu S.A. (Ultracargo) lançou grande quantidade de hidrocarbonetos e líquido gerador de filme aquoso (AFFF) no estuário de Santos, modificando o perfil de contaminantes da região. As bactérias heterotróficas de ambientes marinhos apresentam grande potencial de biorremediação. O objetivo do presente trabalho foi avaliar, in vitro, a sucessão de espécies de bactérias heterotróficas em sedimentos do Estuário de Santos, afetados por hidrocarbonetos e AFFF e isolar espécies bacterianas com possível potencial uso em processos de biorremediação. Foram analisadas as densidades de bactérias heterotróficas e identificadas aquelas de maior relevância, por características morfológicas e identificação molecular. Após análise das amostras locais e Microcosmo, destacaram-se as bactérias do gênero Bacillus. A sucessão sugeriu três espécies como potenciais biorremediadoras, sendo elas Bacillus pumilus, Bacillus subtilis e Staphylococcus sp. With the industrial expansion, coastal and estuarine regions began to perceive installation of several industries, due to the proximity to the consumer markets and producers, besides the ease of transportation of their production. These industries consume a large amount of water, which is returned to the environment with a series of dissolved toxic substances, which includes aromatic hydrocarbons, which are slightly biodegradable and have the tendency to bioaccumulate. Estuarine regions present higher difficulty of bioremediation, since the contaminants are adhered to the sediment. In addition to the usual coastal discard, accidents tend to release a larger and uncontrolled amount of pollutants. Bioremediation is the treatment process that uses microorganisms found in both the terrestrial and aquatic environments to degrade toxic substances by transforming them into less toxic or non-toxic substances. The fire at the Terminal Químico Aratu S.A. (Ultracargo) launched a large amount of hydrocarbons and aqueous film-forming foam (AFFF) in the Santos estuary, modifying the profile of contaminants in the region. The heterotrophic bacteria of marine environments present great bioremediation potential. The objective of the present work was to evaluate in vitro the succession of heterotrophic bacteria species in Santos Estuary sediments affected by hydrocarbons and AFFF and to isolate bacterial species with potential use in bioremediation processes. The densities of heterotrophic bacteria were analyzed and the most relevant ones were identified, by morphological characteristics and molecular identification, where the Bacillus genus deserved attention. The succession suggested three species as potential bioremediators, being Bacillus pumilus, Bacillus subtilis and Staphylococcus sp.

Submitted by JEFFERSSON KRISHAN TRIGO GUTIERREZ null (jefftrigo347@hotmail.com) on 2016-11-10T19:05:26Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Final Jeffersson.pdf: 1700486 bytes, checksum: 9a952fb1627f458c0e0419e731a1c949 (MD5) Approved for entry into archive by LUIZA DE MENEZES ROMANETTO null (luizaromanetto@hotmail.com) on 2016-11-16T18:05:40Z (GMT) No. of bitstreams: 1 trigo gutierrez_jk_me_arafo_par.pdf: 472997 bytes, checksum: 875152f8da97666e5e25e7e7638903c3 (MD5) Made available in DSpace on 2016-11-16T18:05:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 trigo gutierrez_jk_me_arafo_par.pdf: 472997 bytes, checksum: 875152f8da97666e5e25e7e7638903c3 (MD5) Previous issue date: 2016-06-24 Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) O objetivo deste estudo foi formular e avaliar os efeitos fotodinâmicos da curcumina (CUR) encapsulada em nanopartículas poliméricas (NP) em culturas plactônicas de Candida albicans, Streptococcus mutans e Staphylococcus aureus resistente à meticilina e em biofilme misto formado por essas três espécies. NP de CUR aniônicas e catiônicas foram sintetizadas utilizando-se polímero poli-ácido lático (PLA) e sulfato de dextran (DEX). Para caracterização dessa solução, foram determinadas as propriedades fisicoquímicas (tamanho, polidispersão e potencial zeta) e realizados testes de eficiência de encapsulamento, espectro de absorção, fotoestabilidade (fotodegradação da CUR) e atividade fotodinâmica (fotodegração de reagente e scavenger de oxigênio singleto). Em seguida, os efeitos da Terapia Fotodinâmica antimicrobiana (aPDT) mediada pela CUR-NP contra culturas planctônicas e biofilme misto cultivado in vitro por 48 horas, foram avaliados por meio de quantificação de colônias (UFC/mL). Cada avaliação foi realizada em triplicata em três ocasiões distintas e comparada com CUR livre. Os dados obtidos foram submetidos à análise estatística descritiva e inferencial (α=0,05). Após a síntese as CUR-NP apresentaram propriedades nanomêtricas farmacotécnicas adequadas , com valores médios de tamanho, polidispersão e potencial zeta 237,9; 0,08 e -35,2 mV; 239; 0,20 e +32 mV respectivamente para as CUR-NP aniônica e catiônica. Foi observada uma eficiência de encapsulamento de 67 e 64,6 % para as CUR-NP aniônicas e catiônicas. Os sinais de máxima absorção de luz para as CUR-NP e CUR foram pr[oximos da faixa UVvisível, também foi observada a degradação das formulações em diferentes períodos de iluminação. A liberação de CUR das NP aniônicas e catiônicas foi de 96% após 48 horas de estudo. Também foi observada maior atividade fotodinâmica após 5 minutos de irradiação tanto para as CUR-NP quanto para a CUR livre. aPDT mediada por CUR livre demostrou melhoor eficácia antimicrobiana contra os três micro-organismos tanto em culturas planctônicas quanto em biofilme misto de três espécies comparada com a CUR-NP aniônica mediadora de aPDT uma vez que a CUR livre erradicou os três micro-organismos em cultura planctônica(p< 0,001) e promoveu diminuição da viabilidade do biofilme misto, observou-se maior efetividade sobre C. albicans (p≤0,026). Enquanto a CUR-NP aniônica associada a luz azul promoveu a diminuição da viabilidade dos três micro-organismos em cultura planctônicas tendo maior efeito sobre S. mutans (p< 0,001), além disso, não foi observada diminuição da viabilidade do biofilme misto(p≥0,129). A CUR-NP catiônica apresentou efeito antimicrobiano mesmo na ausência de luz em culturas planctônicas dos três micro-organismos (p< 0,001) e biofilme misto, sendo a bactéria S. mutans o mais suscetível à formulação (p< 0,001). A formulação sintetizada foi solúvel em água e homogênea e a eficácia fotodinâmica antimicrobiana em culturas planctônicas foi inferior comparada com a CUR livre. The aim of this study was to formulate and evaluate the photodynamic effect of curcumin (CUR) encapsulated in polymeric nanoparticles (NP) on planktonic cultures of Candida albicans, Streptococcus mutans and methicillin-resistant Staphylococcus aureus and on multispecies biofilm formed by these microorganisms. Anionic and cationic CUR-NP were synthesized using poly-lactic acid (PLA), and dextran sulfate (DEX). To characterize this solution, the physicochemical properties (size, polydispersity and zeta potential) were determined and tests of encapsulation efficiency, absorption spectrum, photostability (photodegradation of CUR) and photodynamic activity (photobleaching of singlet oxygen reagent and scavenger) were also performed. Next, antimicrobial effects of CUR-NP-mediated Photodynamic Therapy (PDT) against planktonic cultures and mixed biofilms grown in vitro for 48 hours were assessed by quantification of colonies (CFU/mL), Each evaluation were carried out in triplicate on three separate occasions and compared to free CUR. Data were submited to descritve and inferential statistical analize (α = 0.05). After synthesis CUR-NP had appropriate pharmacotechnical nanometric properties, mean values of size, polydispersity, and zeta potential were 237.9; 0.08 and -35.2 mV; 239; 0.20 and +32 mV, respectively for anionic and cationic CUR-NP. Encapsulation efficiency of 67 and 64.6% for anionic and cationic CURNP were observed. Peaks absorption for CUR-NP and CUR were close to UV-visible range, was also observed degradation of the formulations at different times of lighting. The release of CUR from anionic and cationic NP was 96% after 48 hours of study. It was also observed greater photodynamic activity after 5 minutes of irradiation for both CUR-NP and for the free CUR. Free CUR mediated aPDT demonstrated better antimicrobial effects against the three microorganisms both planktonic cultures as for mixed biofilms of three species compared with aPDT mediated by anionic CUR-NP, because aPDT mediated by free CUR erradicated the three microorganisms in the planktonic culture ( p

Submitted by LEILEANE COHN TORRES null (leilecohn@gmail.com) on 2016-04-19T01:44:33Z No. of bitstreams: 1 Leileane final abril 2016 14-04-2016.pdf: 838394 bytes, checksum: cfdc81cc4befc572657094761466052a (MD5) Approved for entry into archive by Juliano Benedito Ferreira (julianoferreira@reitoria.unesp.br) on 2016-04-20T20:27:44Z (GMT) No. of bitstreams: 1 torres_lc_me_sjc_par.pdf: 387667 bytes, checksum: 237db73b9ba30c6eb4677c9a4511a560 (MD5) Made available in DSpace on 2016-04-20T20:27:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 torres_lc_me_sjc_par.pdf: 387667 bytes, checksum: 237db73b9ba30c6eb4677c9a4511a560 (MD5) Previous issue date: 2016-02-24 Interações entre micro-organismos ocorrem na natureza. O conhecimento das modificações estruturais, metabólicas e comportamentais de Candida albicans em interações com outros micro-organismos nos biofilmes, podem esclarecer os eventos que ocorrem quando estes micro-organismos interagem na natureza ou nos tecidos do hospedeiro e podem beneficiar as estratégias de controle da candidose. O objetivo do presente trabalho foi avaliar interações microbianas de C. albicans em biofilmes multiespécies e avaliar a patogenicidade dessas interações. Foram realizadas interações entre cepas padrão de C. albicans, com Acinetobacter baumanni e Klebsiella pneumoniae em biofilmes, avaliando-se a contagem de unidades formadoras de colônias por mililitro (UFC/mL). Foram também avaliadas interações com cepas padrão de Candida albicans com dois isolados clínicos de cada um dos micro-organismos (A. baumannii e K. pneumoniae). A patogenicidade dos micro-organismos isolados e em interações com C. albicans foram avaliadas no modelo experimental Galleria mellonella. Houve aumento no crescimento de C. albicans em biofilme in vitro quando em interação com as cepas clínicas testadas. A interação in vitro de C. albicans com A. baumannii favoreceu o crescimento de C. albicans de forma significativa e não afetou A. baumannii, com maior aumento na interação com as cepas clínicas. Exceto para a cepa clínica 1, a interação com K. pneumoniae também estimulou o crescimento de C. albicans, mas em menor intensidade quando comparado à interação entre C. albicans e A. baumannii. Conclusão: a interação de C. albicans in vitro com A. baumannii ou K. pneumoniae foi favorável para C. albicans exceto em interação com cepa clínica 1 de K. pneumoniae, onde houve redução no crescimento de C. albicans. Houve redução na porcentagem de morte de G. mellonella quando inoculada com C. albicans e cepa clínica 2 de K. pneumoniae ou quando G. mellonella foi inoculada com C. albicans e cepa clínica 2 de A. baumannii. Interactions among microorganisms occur in nature. The knowledge of structural, metabolic and behavioral modifications of Candida albicans in interactions with other microorganisms in biofilms can clarify the events that occur when those microorganisms interact in nature or in host tissue and can benefit in strategies to control candidiasis. The aim of this study was to evaluate the microbial interactions of C. albicans in multispecies biofilms and evaluate the pathogenicity of these interactions. Were performed interactions between standards strains of C. albicans with standards strains of Acinetobacter baumannii and Klebsiella pneumoniae in biofilms, evaluating the counts of colony forming units per milliliter (CFU / mL). Were also performed interactions between standard strain of C. albicans with two clinical isolates of each one of the microorganisms (A. baumannii and K. pneumoniae). The pathogenicity of the isolated micro-organisms and in interaction with C. albicans was evaluated in Galleria mellonella experimental model. There was an increase in the growth of C. albicans in in vitro biofilm when interacting with the clinical strains tested. The interaction in vitro between C. albicans and A. baumannii favored the growth of C. albicans significantly and did not affect A. baumannii, with the biggest increase in interaction with the clinical strains. Except for clinical strain 1, the interaction with K. pneumoniae also promoted the growth of C. albicans, but at a lower intensity compared to the interaction between C. albicans and A. baumannii. Conclusion: The interaction in vitro between C. albicans with Acinetobacter baumannii or K. pneumoniae was favorable for C. albicans except in the interaction K. pneumonia clinical strain 1, in which there was a reduction in the growth of C. albicans. There was a reduction in the percentage of G. mellonella death when inoculated with C. albicans and K. pneumoniae clinical strain 2 or when G. mellonella was inoculated with C. albicans and A. baumannii clinical strain 2.

Submitted by LETÍCIA GRILO DE SOUZA null (leti_gs17@hotmail.com) on 2016-02-18T17:57:05Z No. of bitstreams: 1 tese com ficha FINAL.pdf: 2457777 bytes, checksum: d2ec3867571ca27b81a1241f1d041c5e (MD5) Approved for entry into archive by Sandra Manzano de Almeida (smanzano@marilia.unesp.br) on 2016-02-18T18:39:42Z (GMT) No. of bitstreams: 1 souza_lg_me_sjc.pdf: 2457777 bytes, checksum: d2ec3867571ca27b81a1241f1d041c5e (MD5) Made available in DSpace on 2016-02-18T18:39:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 souza_lg_me_sjc.pdf: 2457777 bytes, checksum: d2ec3867571ca27b81a1241f1d041c5e (MD5) Previous issue date: 2016-01-19 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) A cárie é uma doença infectocontagiosa multifatorial. Em cavidades profundas, as lesões cariosas geralmente estão associadas a quadros de sintomatologia pulpar dolorosa. O objetivo deste estudo foi determinar a diversidade bacteriana e a quantidade de endotoxinas e casos de cáries sintomáticas e assintomáticas. Para este estudo foram selecionados 20 pacientes com lesões cariosas profundas com sensibilidade dolorosa compatível com pulpite reversível (n=10) e sem sintomatologia dolorosa (n=10). As amostras de dentina cariada foram obtidas com o auxílio de colheres de dentina estéreis e apirogénicas e foram coletadas em dois momentos: antes e após a remoção convencional do tecido cariado. Estas amostras foram divididas em duas alíquotas, que foram em seguida submetidas ao teste Checkerboard (alíquotas contendo 150 ul de TE e 100 uL de NaOH a 0,5 M) e teste cinético cromogénico LAL (Alíquotas com 1 ml de soro apirogênico) para determinação do perfil microbiano e quantificação de endotoxina, respectivamente. O teste estatístico Mann Whitney não mostrou diferença entre a camada de dentina superficial e profunda para as bactérias estudadas. Em relação ao fator sensibilidade as bactérias Capnocytophaga sputigena, Leptotrichia buccalis e Lactobacillus species foram as que apresentaram diferenças estatisticas significantes, sendo mais presente em pacientes com sintomatologia. Para as endotoxinas, os dentes sintomáticos resultaram em maiores quantidades de endotoxinas (p = 0,047). Dentes sintomáticos apresentaram 4,13 log 10 EU / mg dentina, enquanto o nível de endotoxinas para os dentes dentes assintomáticos foi de 3,45 log 10 EU / mg dentina. Dentinas coletadas em diferentes áreas apresentaram quantidades similares de endotoxinas (p = 0,139). A quantidade de bactérias não parece estar relacionada com a sintomatologia de lesões cariosas profunda, enquanto a quantidade de endotoxinas é maior em cáries sintomáticas. Caries is a multifactorial infectious disease. In deep cavities, carious lesions are usually associated with scenarios of pulp painful symptoms. The objective is to determine bacterial diversity and endotoxin levels in cases of sintomatic and assintomatic caries. Twenty patients with deep carious lesions with soreness compatible with reversible pulpitis (n = 10) and without pain symptoms (n = 10). Carious dentine samples were obtained with the aid of sterile dentine and apyrogenic spoons and harvested in two steps: before and after conventional caries removal. These samples were divided into two aliquots, which were then subjected to the checkerboard(aliquots contained in 150µl of TE and 100µl of 0.5 M NaOH) and kinetic chromogenic LAL test(aliquots with 1 ml of apirogenic serum) for determination of microbial profile and quantitation of endotoxin, respectively. By Mann Whitney test showed no difference between the superficial and deep dentin layer for the studied bacteria. In relation to factor sensitivity bacteria Capnocytophaga sputigena, Leptotrichia buccalis e Lactobacillus species were the ones that showed statistically significant differences, being more present in patients with symptoms. For the endotoxins, symptomatic teeth resulted in greater quantity of endotoxins (p=0.047). Symptomatic teeth presented 4.13 log10 EU/mg dentin, while endotoxin level for no symptomatic teeth was 3.45 log10 EU/mg dentin. Dentin collected in different areas presented similar amount of endotoxins (p=0.139). The amount of bacteria does not seem to be related to symptomatology of deep carious lesions, while endotoxins quantity is greater in symptomatic scenarios.

Made available in DSpace on 2018-07-27T18:26:19Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-12-07. Added 1 bitstream(s) on 2018-07-27T18:30:47Z : No. of bitstreams: 1 000881020.pdf: 1039348 bytes, checksum: e095eb7a42a200efaa99e98fc3fb9a8c (MD5) A utilização de probióticos surge como uma alternativa, para o uso de antibióticos em peixes, evitando que os mesmos adoeçam. O escopo deste trabalho foi avaliar os efeitos da alimentação adicionada de probiótico contendo Bacillus amyloliquefaciens na inflamação aguda contra A.hydrophila em tilápias-do-Nilo (Oreochromis niloticus). Para tanto foram utilizados 936 exemplares de tilápias-do-Nilo (30g), distribuídas uniformemente em 12 tanques-rede sendo 78 peixes em cada. Os peixes foram alimentados durante 60 dias com ração adicionada com a bactéria probiótica em diferentes concentrações, sendo constituídos os seguintes grupos; Grupo 1 (controle) alimentado com ração basal sem adição de probiótico: Grupo 2 (T1) suplementados com 0,75 gramas de probiótico/kg de ração; Grupo 3 (T2) suplementados com 1,5 gramas de probiótico/kg de ração; Grupo 4 (T3) suplementados com 3 gramas de probiótico/kg de ração. Para o estímulo inflamatório inoculou-se na bexiga natatória dos peixes 0,5 ml de solução salina 0,65% no grupo controle e 0,5 ml x106 de uma solução, contendo A. hydrophila inativada nos demais grupos. As coletas de sangue e exsudato inflamatório foram realizadas nos tempos de 12, 24 e 48 horas após estímulo inflamatório (HPE), para as seguintes análises: variáveis hematológicas, índices de glicose basal, atividade respiratória dos leucócitos sanguíneos (burst oxidativo), características qualitativas e quantitativas do exsudato, atividade lítica das proteases do soro e atividade de aglutinação bacteriana. Os resultados foram comparados por meio de análise de variância (ANOVA) ao nível de 5% de probabilidade e a diferença entre as médias foi comparada pelo teste de Tukey. Não foram observadas variações hematológicas significativas entre os grupos de tilápias-do-Nilo tratadas e estimuladas e o grupo controle, o mesmo pode ser observados... The use of probiotics arises as an alternative to the use of antibiotics in fishes, preventing them from becoming sick. The scope of this study was to evaluate the effects of food with added probiotic containing Bacillus amyloliquefaciens in acute inflammation against A.hydrophila in the Nile-tilapia (Oreochromis niloticus). To that end, there were used 936 copies of the Nile-tilapia (30g), evenly distributed in 12 net tanks with 78 fish in each. The fishes were fed for 60 days with food added with the probiotic bacteria in different concentrations, with the following groups being formed; Group 1 (control) fed with basal food without added probiotic: Group 2 (T1) supplemented with 0.75 grams of probiotic / kg food; Group 3 (T2) supplemented with 1.5 grams of the probiotic / kg food; Group 4 (T3) supplemented with 3 grams of probiotic / kg food. For the inflammatory stimulus it was inoculated in the swimming bladder of fish 0.5 ml of saline solution 0.65% in the control group and 0.5 ml x106 of a solution containing inactivated A. hydrophila in the other groups. Blood collections and inflammatory exudate were held in the periods of 12, 24 and 48 hours after the inflammatory stimulus (HPE), for the following analysis: haematological variables, basal glucose levels, respiratory activity of sanguine leukocytes (oxidative burst), qualitative and quantitative characteristics of the exudate, lytic activity of serum proteases and agglutination bacterial activity. The results were compared using analysis of variance (ANOVA) at 5% probability and the difference between the means was compared by Tukey test. There were no significant hematological changes between the groups of Nile-tilapia treated and stimulated and the control group, the same thing can be observed in glycemic indeces and respiratory activity of blood leucocytes. The inflammatory exudate was characterized by the predominant accumulation ...

Made available in DSpace on 2016-08-12T18:48:52Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-12-03. Added 1 bitstream(s) on 2016-08-12T18:51:10Z : No. of bitstreams: 1 000864610.pdf: 3089089 bytes, checksum: e31156d3741c67e09c6b97faabdaf165 (MD5) Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Photobacterium damselae subsp. piscicida (Phdp) é importante agente causal de septicemia e pseudotuberculose, respectivamente nas fases aguda e crônica em peixes marinhos. O método de imunização e tratamento das infecções bacterianas em peixes é limitado à imunização ativa, com demanda bioenergética celular para gerar a resposta imune humoral. O uso de antibióticos na água, como forma terapêutica, resulta em resíduos na carne do peixe e no consumidor final humano, favorecendo o desenvolvimento da resistência microbiana. Este estudo teve como objetivos a produção e purificação de anticorpos IgY policlonais, extraídos da gema do ovo de galinha e específicos para as proteínas citoplasmáticas e de membrana bacteriana de Phdp e seus efeitos no controle da sepse aguda em Rachycentron canadum infectados experimentalmente. Os resultados demonstram redução do acúmulo de células na inflamação aguda induzida, pela inoculação da bactéria homóloga na cavidade celomática e na atividade respiratória de leucócitos sanguíneos nos grupos que receberam anticorpos IgY 48 horas e 15 dias antes do desafio. Verificou-se ainda redução da disseminação bacteriana em fígado, rim, baço e coração que foi correlacionada com a diminuição das lesões renais e hepáticas e demonstrada no perfil bioquímico e histopatológico. Os resultados são promissores no que tange ao uso da imunoglobulina Y como método profilático e na imunoterapia de infecções bacterianas em organismos aquáticos The Photobacterium damselae ssp. piscicida is an important causative agent of septicemia and pseudotuberculosis in the acute and chronic phases in marine fish, respectively. The method for immunization and treatment of bacterial infections in fish is limited to the active immunization, which demands cellular bioenergy to generate humoral immune response. The use of antibiotics in the water as a form of therapy results in residues in the meat that will be consumed by humans, favoring the development of microbial resistance. Thus, the aim of the study was to produce and purify polyclonal IgY, specific for membrane proteins of P. damselae ssp. piscicida (PMBphdp), extracted from the yolk of laying hens, and to observe its effects on the control of acute sepsis in experimentally infected Rachycentron canadus. The results showed reduction of cell accumulation in acute inflammation induced by inoculation of the homologous bacteria in the coelomic cavity and decrease in the respiratory activity of blood leukocytes in groups receiving IgY antibodies at 48 hours and 15 days before the challenge. It was also observed the reduction of bacterial dissemination to the liver, kidney and heart which was correlated with the decrease in liver and kidney damage, which was demonstrated by the biochemical and histopathological profile. The results are promising regarding the use of immunoglobulin Y as prophylactic method and for immunotherapy of microbial infections in aquatic organisms

Made available in DSpace on 2016-08-12T18:48:52Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-12-02. Added 1 bitstream(s) on 2016-08-12T18:51:10Z : No. of bitstreams: 1 000865027.pdf: 896212 bytes, checksum: 13e6100871354f5ee6c6af746cd371b8 (MD5) A vinhaça é um subproduto resultante da fabricação do etanol e do açúcar. Existe uma enorme preocupação para os profissionais da área ambiental com relação ao seu destino final, pelo elevado grau impactante quando descartada no meio ambiente. As usinas do setor sucroenergético ultimamente vêm utilizando a adubação com vinhaça nas lavouras, graças às grandes concentrações de nutrientes presentes neste efluente. Estudo sobre a composição e a fisiologia da microbiota de solos submetidos à irrigação de vinhaça pode ter grande importância na descoberta de produtos de interesse biotecnológico, uma vez que este resíduo aumenta a atividade microbiana nos ambientes onde é aplicado. O objetivo do referido trabalho foi realizar a caracterização molecular, através do sequenciamento do gene 16S rRNA, a fim de identificar a filogenia de quatro isolados bacterianos obtidos de solos agrícolas de cana-de-açúcar com manejo de vinhaça, assim como avaliar a capacidade de solubilização de fosfato desses isolados em meio NBRIP e relacionar os dados obtidos com boas práticas na agricultura. O isolado LGA01-EV05 mostrou alta similaridade de sequência com Curtobacterium albidum, o isolado LGA02-EV08 denota similaridade com Brevibacillus nitrificans, os isolados LGA03-V20B e LGA04-V20G evidenciam elevado grau de similaridade entre si e com Sinomonas soli. Os táxons dos isolados são pertencentes aos filos Actinobactéria e Firmicutes. Com relação à avaliação do potencial bacteriano para solubilização de fosfato, os quatro isolados demonstraram eficiência em solubilizar fosfato em meio NBRIP. Entretanto, observou-se que não houve diferença estatística entre os grupos LGA02-EV08 e LGA04-V20G, sendo as melhores bactérias solubilizadoras de fosfato. Elas apresentaram um rendimento cerca de quatro vezes superior ao grupo LGA03-V20B, o pior entre os analisados The stillage is a by-product of the production of ethanol and sugar. There is a huge concern for professionals in the environmental area in relation to its final destination, the high degree impactful when discarded into the environment. The plants the sugarcane industry lately have been using the fertilization with vinasse in crops thanks to large concentrations of nutrients present in this effluent. Study on the composition of the microbiota and physiology of soils subjected to irrigation vinasse can be of great importance in finding products of biotechnological interest since this residue enhances the microbial activity in environments where it is applied. The purpose of that study was the molecular characterization, by sequencing the 16S rRNA gene in order to identify the phylogeny of four bacterial isolates obtained from sugarcane cropland with vinasse management, and assess the capacity of phosphate solubilization of these isolated amid NBRIP and relate the data with best practices in agriculture. Isolated LGA01-EV05 showed high sequence similarity to Curtobacterium albidum, isolated LGA02-EV08 denotes similarity to Brevibacillus nitrificans, the LGA03-V20B isolated and LGA04-V20G show high degree of similarity between themselves and with Sinomonas soli. Taxa of isolates are belonging to the phyla Firmicutes and Actinobacteria. As to the evaluation of the bacterial potential for phosphate solubilization, the four isolates were efficient in solubilizing phosphate amid NBRIP. However, it was observed that there was no statistical difference between the LGA02-EV08 and LGA04-V20G groups, with the best phosphate solubilizing bacteria. They had an income about four times the LGA03-V20B group, the worst among the analyzed

Made available in DSpace on 2016-03-07T19:20:55Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-11-27. Added 1 bitstream(s) on 2016-03-07T19:24:44Z : No. of bitstreams: 1 000858751.pdf: 1279197 bytes, checksum: a6b7adec5b4fbf5c0cbc62f17a606107 (MD5) A podridão negra, incitada por Xanthomonas campestris pv. campestris (Xcc), é considerada a doença bacteriana mais destrutiva das brássicas em muitos países, podendo promover consideráveis reduções na produtividade. O estudo dos nichos ecológicos de sobrevivência de bactérias fitopatogênicas possui grande importância no manejo de fitobacterioses, uma vez que uma pequena quantidade de inóculo sobrevivente entre os ciclos de cultivo pode ser suficiente para iniciar uma nova epidemia no campo. Baseado nisso, o presente trabalho avaliou a sobrevivência de Xcc em diferentes ensaios, através da utilização do isolado 3098C de Xcc resistente a 100 μg/mL de rifampicina. A sobrevivência de Xcc na forma de células livres no solo foi avaliada em cinco experimentos, desenvolvidos em condições de campo, entre maio e agosto de 2014. Em condições controladas¸ foram utilizados seis tipos de solo, amostrados de diferentes áreas com cultivo ou não de brássicas. A colonização do filoplano e rizosfera de 26 espécies de plantas daninhas por Xcc também foi avaliada em experimentos de campo, entre agosto de 2014 a outubro de 2015. Nos experimentos de campo, Xcc sobreviveu entre 4 e 7 dias no solo, sendo influenciada diretamente pela temperatura e umidade, ocorridas durante os experimentos. Em condições controladas, a bactéria sobreviveu de 10 a 24 dias, sendo esses períodos influenciados pela textura, pH e teor de matéria orgânica em cada tipo de ... Black rot, incited by Xanthomonas campestris pv. campestris (Xcc), is the most destructive bacterial disease of brassicas in many countries, and can promote substantial reductions in productivity. The study of survival ecological niches of phytopathogenic bacteria has great importance in the management of plant bacteriosis, since a small amount of inoculum surviving among the cultivation cycle may be sufficient to initiate a new outbreak in the field. Based on this, this study evaluated the survival of Xcc in different experiments using Xcc strain 3098C, resistant to 100 μg/mL of rifampicin. The survival of Xcc as free cells in the soil was evaluated in five experiments, carried out in field conditions, between May and August, 2014. Under controlled conditions, six types of soil were used, sampled from different areas, with or without brassicas cultivation. The colonization of phylloplane and rhizosphere of 26 weed species by Xcc was also evaluated in field experiments, between August, 2014 and October, 2015. In field experiments, Xcc survived between 4 and 7 days in the soil, being directly influenced by temperature and humidity that occurred during the experiments. Under controlled conditions, the bacteria survived for 10 to 24 days, and these periods were influenced by texture, pH and organic matter content in each soil type. In weeds rhizosphere, Xcc had low capacity to survive, at most 28 days on Raphanus raphanistrum. In phylloplane, Xcc survived more than 42 days in Lepidium virginicum, and up to 70 days in Raphanus raphanistrum. Weeds from Amaranthaceae and Poaceae families did not show potential for the epiphytic survival of Xcc.

Made available in DSpace on 2016-09-27T13:40:07Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-08-21. Added 1 bitstream(s) on 2016-09-27T13:45:19Z : No. of bitstreams: 1 000870467.pdf: 1126912 bytes, checksum: 0d220e03b71df656b478827a129bd6d7 (MD5) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) effluent to assess studies on cell mass production, yield, productivity, Chemical Oxygen Demand (COD) and economic viability of a project to produce bacterial biomass on an industrial scale. Initially, different concentrations of the substrate were performed with the purpose of increasing the productivity and the biomass recovery (¼, ½ and ¾ the initial volume) using microfiltration. Cultivations was accomplished in bioreactors (50 L), at 1,500 ± 200 lux, 32 ± 2°C during 5 days. The biomass was recovery by microfiltration then freeze-dried. Later, the biomass samples were analyzed regarding to proximate composition. Thus, an analysis was developed to assess the resources necessary to estimate costs and revenue that might occur during the project operating (10 years). The main viability indicators used were the Net Present Value (NPV), the Internal Rate of Return (IRR) and the payback. The results showed greater recovery and biomass productivity in bioreactor with higher organic matter (28.61 ± 0.71 g and 0.1144 g biomass L-1 day-1). The greater COD reduction was 69.23%. Except for the lipids and proteins, whose concentrations were higher in the biomass produced in the most concentrated substrates, the other components remained the same. Regarding the economic viability, the results showed that, with a productivity of 0.085 g biomass L-1 day-1, 9.58 tons of biomass could be produced during one year. The total investment for the project was estimated in R$ 6,361,456.51, with an annual costs of R$ 2,366,131.38 and incomes of R$ 3,870,913.15. Considering these results and the viability indicators of 23.70% for the IRR and R$ 4,466,192.26 for the NPV, per annum, the project was considered feasible, providing the recovery of the invested capital within 3.98 years of activity. FAPESP: 2011/50274

Made available in DSpace on 2016-02-05T18:30:15Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-07-16. Added 1 bitstream(s) on 2016-02-05T18:34:25Z : No. of bitstreams: 1 000858031_20170806.pdf: 108222 bytes, checksum: d30d53d86f7661757a061670f3b2cb98 (MD5) Bitstreams deleted on 2017-08-07T14:09:13Z: 000858031_20170806.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2017-08-07T14:10:16Z : No. of bitstreams: 1 000858031.pdf: 980973 bytes, checksum: b395a844998ca8066d04420b0f82824a (MD5) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) A cárie precoce da infância (CPI) é ainda um grave problema de saúde pública no mundo, principalmente em países em desenvolvimento. Estudos têm sugerido a associação da ingestão frequente de carboidratos fermentáveis como a sacarose, altas contagens de microrganismos cariogênicos e maior vulnerabilidade imunológica da criança na etiologia da CPI. O objetivo deste estudo foi avaliar os aspectos microbiológicos e imunológicos associados ao desenvolvimento da cárie precoce da infância. Crianças com idade entre 36 e 60 meses foram selecionadas e divididas em três grupos: LC - livres de cárie, CPI e CPI-S (CPI-severa). Questionário sobre os aspectos socioeconômico-culturais, hábitos de higiene bucal e diários de dieta foram respondidos pelos responsáveis. Foram coletadas amostras de saliva e biofilme dental das crianças e processadas para subsequentes avaliações laboratoriais. Em seguida, os níveis de IgA salivar total e contra GbpB de S. mutans foram determinados por ELISA e Western blot, respectivamente, as concentrações salivares dos peptídeos catiônicos antimicrobianos (PCAM): defensinas hBD-2 e hBD-3, catelicidina LL-37 e histatina 5 (HTN-5) por ELISA e a presença e os níveis salivares de Streptococcus mutans, Streptococcus sobrinus, Lactobacillus spp., Bifidobacterium spp. e Scardovia wiggsiae por qRT-PCR, sendo que estes dados foram correlacionados com os níveis salivares e no biofilme dental de estreptococos mutans (SM) e Lactobacillus spp. por meio de cultivo em meios específicos. Os resultados mostraram que as crianças com CPI-S apresentaram menor renda familiar quando comparadas às crianças LC ou CPI. Contudo, a ingestão de açúcar não diferiu entre os grupos. O grupo CPI-S apresentou maior contagem de SM na saliva/biofilme em relação aos grupos LC e CPI. Houve uma correlação positiva... Early childhood caries (ECC) is still a serious public health problem worldwide, especially in developing countries. Studies have been suggested the association among frequent intake of fermentable carbohydrates such as sucrose, high cariogenic microorganism's counts and child's immune vulnerability in the etiology of ECC. The objective of this study was to evaluate the microbiological and immunological factors for the development of early childhood caries. 36 to 60 monthold children were selected and distributed into three groups: caries free (CF), ECC and S-ECC (severe-ECC). Questionnaires about socio-economic-cultural data, oral hygiene habits and food-frequency diary were completed by the parents. Saliva and dental biofilm were collected from children and processed for subsequent laboratorial tests. The following analyses were determined: total IgA and IgA response against S. mutans GbpB by ELISA and Western blot, respectively; salivary concentrations of antimicrobial peptides (AMPs): defensins hBD-2 and hBD-3, cathelicidin LL-37 and histatin 5 (HTN-5) by ELISA; salivary detection and quantification of Streptococcus mutans, Streptococcus sobrinus, Lactobacillus spp., Bifidobacterium spp. and Scardovia wiggsiae by qRT-PCR, and these data were correlated with mutans streptococci (MS) and Lactobacillus spp. levels by culture in specific medium. Results showed that S-ECC children had reduced family income compared to ECC and CF. However, sugar intake did not differ among the groups. S-ECC group had higher MS count than CF/ECC groups. Positive correlations between salivary IgA response against GbpB and MS counts were found when the entire population was evaluated. When children with high mutans streptococci counts were compared, S-ECC group showed a significant decrease in IgA antibody levels against GbpB compared... FAPESP: 12/19235-5

Made available in DSpace on 2015-10-06T13:03:06Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-07-13. Added 1 bitstream(s) on 2015-10-06T13:18:57Z : No. of bitstreams: 1 000848691.pdf: 292702 bytes, checksum: c164b1940d843e7e3969defa025270fa (MD5) Spodoptera albula é uma praga polifaga e cosmopolita sendo que no Brasil não existem produtos registrados para o seu controle embora recentemente alguns agricultores tenham relatados surtos desta espécie em lavouras de soja no estado do Mato Grosso. Desta forma, é de extrema importância o desenvolvimento de táticas de controle eficientes para esta praga e que ao mesmo tempo sejam pouco agressivas ao meio ambiente e à sociedade. Bacillus thuringiensis (Bt) é uma bactéria entomopatogênica altamente eficiente no controle de lepidópteros praga e apresenta toxicidade para várias espécies do gênero Spodoptera. A atividade tóxica de isolados e bioinseticidas à base de Bt foi avaliada utilizando lagartas de segundo instar de S. albula em bioensaios de mortalidade e virulência, bem com os efeitos subletais do Bt nas lagartas sobreviventes aos tratamentos. Os bioinseticidas Agree, Xentari e Dipel SC foram selecionados para os bioensaios de virulência, sendo que o primeiro foi o mais virulento e, portanto o mais promissor para o manejo desta praga. Também foi observada diferença na toxicidade entre as formulações do Dipel. Entre os isolados nenhum se destacou no controle desta praga e o isolado Bt05 afetou o desenvolvimento das lagartas resultando em menor peso de pré-pupa e pupa em relação a testemunha Spodoptera albula is a polyphagous and cosmopolitan pest and in Brazil there are no products registered for their control although some farmers have recently been reported outbreaks of this specie in soybean in the Mato Grosso state. Thus, it is extremely important to developing effective tactics to control this pest that are less harmful to the environment and society. Bacillus thuringiensis (Bt) is a highly efficient entomopathogenic bacterium in lepidopterous pest control and it is toxic to several species of Spodoptera genus. The toxic activity of Bt isolates and Bt biopesticides was evaluated using S. albula second instar larvae in mortality and virulence bioassays, and evaluating the sublethal Bt effects on larvae surviving to treatment. The biopesticides Agree, Xentari and Dipel SC were selected for bioassay virulence. Agree was the most virulent and therefore the most promising for the S. albula management. It was also observed differences in toxicity between Dipel formulations. All Bt isolates tested were not good for the control of this pest and the isolate BT05 affected the development of larvae resulting in lower weight of pre-pupa and pupa compared to control

Made available in DSpace on 2015-10-06T13:02:51Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-06-19. Added 1 bitstream(s) on 2015-10-06T13:19:26Z : No. of bitstreams: 1 000849134_20170101.pdf: 429152 bytes, checksum: abd1abadcca0b3fa8264300bc2c7ad0a (MD5) Bitstreams deleted on 2017-01-02T15:03:47Z: 000849134_20170101.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2017-01-02T15:05:06Z : No. of bitstreams: 1 000849134.pdf: 2667968 bytes, checksum: 472c913350f7049ae593ecc260ae5639 (MD5) A bactéria Xanthomonas citri subsp. citri (Xcc) é o agente causal do cancro cítrico, uma doença que afeta quase todos os tipos de culturas de citros. A produção de determinados fatores de patogenicidade em Xcc é regulado por um grupo de genes chamados rpf, que codificam elementos de um sistema de comunicação célulaFcélula chamada de quórum sensing (QS), mediado por moléculas da família do fator difusível de sinal (DSF). A interferência com a sinalização célulaFcélula, também denominado quórum quenching, seja por degradação do sinal ou excesso de produção tem sido sugerido como estratégia para controlar doenças bacterianas. Nesse estudo, foram isoladas três cepas provenientes de folhas de citros que apresentaram alta capacidade de perturbar a sinalização QS em Xcc. Ensaios de patogenicidade em laranja doce (Citrus sinensis (L.) Osbeck) mostraram que as bactérias pertencentes ao gênero Pseudomonas e Bacillus têm forte capacidade de reduzir a severidade da doença. Estes efeitos foram associados a alteração na aderência bacteriana e a formação de biofilme, fatores que são conhecidos por contribuir para a virulência de Xcc. Essas bactérias quórumFquenching podem ser um instrumento extremamente útil para o processo de controle biológico e oferecer uma alternativa para o tratamento tradicional de cobre, atualmente utilizado para o tratamento do cancro cítrico The bacterium Xanthomonas citri subsp. citri (Xcc) is the causal agent of citrus canker, a disease that affects almost all types of citrus crops. The production of particular pathogenicity factors in Xcc is controlled by a cluster of genes named rpf, which encode elements of cellFcell communication system called Quorum Sensing (QS), mediated by molecules of the Diffusible Signal Factor (DSF) family. Interference with cellFcell signaling, also termed quorum quenching, either by signal degradation or overFproduction has been suggested as strategy to control bacterial disease. In this study, we isolated three bacterial strains from citrus leaves that displayed a high ability to disrupt QS signaling in Xcc. Pathogenicity assays in sweet orange (Citrus sinensis (L.) Osbeck) showed that bacteria belonging to the genera Pseudomonas and Bacillus also have a strong ability to reduce the severity of citrus canker disease. These effects were associated with alteration in bacterial attachment and biofilm formation, factors that are known to contribute to Xcc virulence. These quorumFquenching bacteria may represent a highly valuable tool in the process of biological control and offer an alternative to the traditional copper treatment currently used for the treatment of citrus canker disease

Made available in DSpace on 2016-02-05T18:29:50Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-03-19. Added 1 bitstream(s) on 2016-02-05T18:33:55Z : No. of bitstreams: 1 000856531_20180401.pdf: 178192 bytes, checksum: 5fe4091ff282788eb99786be5db51eb4 (MD5) Bitstreams deleted on 2018-04-02T12:47:07Z: 000856531_20180401.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2018-04-02T12:47:58Z : No. of bitstreams: 1 000856531.pdf: 1016357 bytes, checksum: 391d3a986bfc56d254337889ab8e974e (MD5) Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) É sabido que grande parte da produção primária global ocorre nos oceanos, e que um problema fundamental é entender como os organismos usam este carbono e quais são os padrões das variações espaço-temporais do carbono e do fluxo de energia. Deste modo, o interesse no ciclo do carbono vem aumentando nos últimos anos devido ao aumento recente de problemas mundiais, tais como mudanças climáticas e antropização de zonas costeiras. A alça microbiana conduz energia e carbono por meio das bactérias, para os níveis tróficos superiores, além de promover a assimilação de elementos inorgânicos biologicamente importantes, como nitrogênio e fósforo, em matéria orgânica na coluna d'água, elementos estes que são de extrema importância biológica. O presente estudo teve por objetivo estudar a estrutura e o funcionamento da alça microbiana nos sedimentos da Baía do Araça, quantificar seus elementos, verificar as flutuações nas densidades e correlacionar com outros fatores analisados, tais como contaminantes metálicos, matéria orgânica e hidrocarbonetos. Foram coletadas amostras de sedimento em 37 pontos, divididos em duas regiões (entremarés e sublitoral), durante o período de um ano. As amostras foram analisadas quanto a granulometria, conteúdo de matéria orgânica, carbonos orgânicos totais, hidrocarbonetos, além da análise dos componentes microbiológicos. Foi observado que as maiores densidades de microrganismos foram observadas na região do sublitoral. Houve uma correlação negativa entre as densidades de bactérias heterotróficas e nano flagelados, podendo indicar bacterivoria. As variações de matéria orgânica ao longo do estudo afetaram diretamente as populações de bactérias heterotróficas It is known that great part of the global primary occurs in the oceans, and a problem is to understand how the organisms use this carbon, what are the patterns of the spatial-temporal variations of carbon and of the energy flow. Thus, the interest in the carbon cycle is increasig in recent years due to the increase of global problems, such as climate change and the increase of population in coastal areas. The microbial loop leads energy and carbon, by bacteria, to the other trophic levels, and it also promotes the assimilation of inorganic elements biologically relevants, such as nitrogen and phosphorus, in organic matter in the water column, which are extremely biologically importants. This study aims to analyze the structure and the functioning of the microbial loop, quantifying its elements, check the densities variations and correlate with other analyzed factors, such as metal contaminants, organic matter and hydrocarbons. Sediment samples were collected at 37 points, divided into two regions (intertidal and subcoastal), during the period of one year. The samples were processed for granulometric analyzis, organic matter, total organic carbons, hydrocarbons, and microbiological components. It was observed that the highest densities of microrganisms were at the subcoastal region. There was a negative correlation between the densities of heterotrophic bacteria and nanoflagellates, which may indicate bacterivory. Variations of organic matter throughout the study directly affected the heterotrophic bacteria populations

Made available in DSpace on 2015-08-20T17:09:46Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-24. Added 1 bitstream(s) on 2015-08-20T17:26:26Z : No. of bitstreams: 1 000843763.pdf: 3771507 bytes, checksum: 95075b8d207831c0a64fbf7c2f3c81e0 (MD5) No Brasil e no mundo, a cultura do milho é uma das mais importantes, por ser a base da alimentação animal e utilizado também na alimentação humana. Técnicas sustentáveis de manejo na cultura do milho são necessárias, visando aumento de produtividade, minimizando custos e impactos ambientais. O objetivo deste trabalho foi avaliar diferentes coberturas vegetais (milheto, crotalária, guandu, milheto + crotalária, milheto + guandu e pousio), doses de N (0, 40, 80 e 120 kg ha -1 ) com e sem a inoculação de sementes com Azospirillum brasilense na cultura do milho, cultivado em sistema plantio direto no crescimento e produtividade na região do Cerrado. Foi utilizado delineamento experimental em blocos casualizados em esquema fatorial 6x4x2, constituindo 48 tratamentos, com 4 repetições. O estudo foi realizado na Fazenda Experimental pertencente à Faculdade de Engenharia - UNESP - Campus de Ilha Solteira, localizada no município de Selvíria - MS. O solo do local é do tipo LATOSSOLO VERMELHO Distrófico típico argiloso. A precipitação média anual é de 1.330 mm, a temperatura média anual é de 25 oC e a umidade relativa do ar entre 70 e 80%. Durante a condução do experimento, foram realizadas as seguintes avaliações: massa seca, teores e quantidades acumuladas de N, P e K nas plantas de cobertura; no milho: população inicial e final de plantas, produção de massa seca da parte aérea das plantas, teor de N foliar, índice de clorofila foliar, teores e valores acumulados de N, P e K na planta, altura de plantas e de inserção de espiga, diâmetro de colmo, comprimento de espiga, diâmetro de espiga, massa de mil grãos e produtividade de grãos. As coberturas vegetais, exceto o guandu no primeiro ano e pousio no segundo, produziram quantidade adequada de resíduo para manter o sistema plantio direto na região de Cerrado de baixa altitude. O consórcio milheto + crotalária possibilita quantidades acumuladas de N e K.. In Brazil and in the world, maize crop is one of the most important because it is the basis of animal feed and also used in human feed. Sustainable techniques of management in maize crop are needed, aiming at increasing yield, reducing costs and environmental impacts. The objective of this study was to evaluate different cover crops (millet, sunn hemp, pigeonpea, millet + sunn hemp, millet + pigeonpea and fallow), N rates (0, 40, 80 and 120 kg ha -1 ) with and without inoculation of seeds with Azospirillum brasilense in maize crop, cultivated in no- tillage system on growth and yield in the Cerrado region. The experimental design was complete randomized blocks in a factorial scheme 6x4x2, constituting 48 treatments, with 4 replications. The study was conducted at the Experimental Farm belonging to the Faculty of Engineering - UNESP (Ilha Solteira), located in Selviria - MS. The soil of the place is a Typical Dystrophic Red Latosol clayey texture. The average annual rainfall is 1.330 mm, the average annual temperature is 25°C and the relative humidity between 70 and 80%. During the experiment, the following evaluations were performed: dry matter, content and accumulated values of N, P and K in cover crops; in maize: initial and final population of plants, production of dry matter of the shoots, leaf nitrogen content, leaf chlorophyll index, content and accumulated values of N, P and K in the whole plant, plant height and of ear insertion, stem diameter, ear length, ear diameter, thousand grain weight and grain yield. The cover crops except the pigeonpea in 2012/13 and fallow in 2013/14 produced adequate amount of residue to keep the no-tillage system in the Cerrado region. The consortium of millet + sunn hemp provided the greater accumulated amount of N and K for both years of cultivation. The great yield of maize grains under pigeonpea residue was due to increase in ear diameter and thousand-grain weight. Thus, the great maize yield ...

Made available in DSpace on 2015-06-17T19:33:40Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-11. Added 1 bitstream(s) on 2015-06-18T12:48:13Z : No. of bitstreams: 1 000832294.pdf: 448454 bytes, checksum: 9a4a8ff98b4856e69ab8351e22414449 (MD5) Este trabalho teve como objetivo avaliar os efeitos da alimentação com diferentes fontes de forragem em dietas com 10% glicerina bruta incluída na MS sobre o consumo, digestibilidade, fermentação ruminal, desempenho, características de carcaça, qualidade da carne e emissão de metano entérico de bovinos Nelore terminados em confinamento. Os tratamentos consistiam em diferentes fontes de forragem (FDN da forragem fixado em 15%): Silagem de milho (SM), Cana de açúcar (CA) e Bagaço de cana (BC) em dietas com glicerina bruta (10% MS). Para tal estudo foram conduzidos dois experimentos: Experimento 1: Nove novilhos Nelore canulados no rúmen (300 ± 30 kg e 18 ± 2 meses de idade) foram utilizados em delineamento de quadrado latino (3x3), três tratamentos e três períodos em três repetições simultâneas para avaliar o consumo, digestibilidade, fermentação e microbiota ruminal. Não houve efeitos das diferentes fontes de forragem em dietas com glicerina bruta no consumo de matéria seca (MS), matéria orgânica (MO) e proteína bruta (PB) (P>0.05). O consumo de fibra em detergente neutro (FDN) foi maior em animais alimentados com SM que não diferiu de animais alimentados com BC (P0.05) among diets. On the other hand, the population of Selenomonas ruminantium, was higher (P

Made available in DSpace on 2015-06-17T19:34:28Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-06. Added 1 bitstream(s) on 2015-06-18T12:48:48Z : No. of bitstreams: 1 000833296.pdf: 990996 bytes, checksum: 5d24814a408c5eef27398042c2980dfe (MD5) O objetivo do estudo foi avaliar a difusão de tecnologia para a atividade leiteira de agricultores familiares visando à melhoria da qualidade do leite através de diagnósticos, treinamentos e acompanhamento dos extensionistas treinados divulgando para os produtores rurais. O estudo foi realizado com 550 propriedades para identificação do perfil dos produtores totais em relação aos produtores familiares da região de Ribeirão Preto, junto com cooperativas leiteiras e o programa da CATI LEITE/SAA/SP. Desse total foram selecionados 143 produtores, dos quais 50 receberam assistência técnica treinada com foco em qualidade do leite através de cursos teórico-práticos e 93 foram apenas monitorados através de análise do leite. Os produtores foram selecionados e divididos em 2 tratamentos: os que receberam o treinamento e os que não receberam. Foram realizadas amostragens do leite mensal para verificar a eficácia do treinamento na melhoria da qualidade do leite. Foi constatada melhoria significativa da qualidade do leite em função do apoio da assistência técnica e que, a qualidade do leite produzido pelos produtores familiares não diferiu da qualidade do leite de produtores patronais The objective of the study was to evaluate the diffusion of technology for dairy farming family farmers aimed at improving the quality of milk through diagnostics, training and monitoring of trained extension workers disclose to farmers. The study was conducted with 550 properties to identify the profile of the total producers in relation to family farmers in the Ribeirão Preto region, along with dairy cooperative and CATI program MILK / SAA / SP. Of this total was conducted sampling of 143 producers in 50 received technical assistance trained with a focus on milk quality through theoretical and practical courses according to your needs and only 93 were monitored through the milk analysis. All 50 producers were monitored and evaluated monthly for 12 months through technical visits of trained technical assistants. Visits were carried techniques for data collection and milk samples for monitoring the quality of milk and the use of the techniques covered in the courses. It was found significant improvement of milk quality due to the support of technical assistance and that the quality of milk produced by family farmers did not differ in the quality of the milk producers employers

Made available in DSpace on 2015-06-17T19:34:31Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-06. Added 1 bitstream(s) on 2015-06-18T12:48:41Z : No. of bitstreams: 1 000831916_20160206.pdf: 112802 bytes, checksum: ab469a2967fddd117429a39b27723454 (MD5) Bitstreams deleted on 2016-02-10T15:55:07Z: 000831916_20160206.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-02-10T15:55:45Z : No. of bitstreams: 1 000831916.pdf: 3397060 bytes, checksum: 8fdf8471abaa6fa3e7d5431cd8932cbb (MD5) Com a intensificação da piscicultura brasileira, caracterizada por densidade de estocagem cada vez maior, especialmente em tanques-rede, tem-se observado um número crescente de enfermidades, principalmente de origem bacteriana, ocasionando alta mortalidade e prejuízos econômicos expressivos em todas as fases da criação. Um dos problemas relacionados ao controle de enfermidades na piscicultura é o uso constante e equivocado de antimicrobianos e quimioterápicos nas criações, que provocam problemas de resistência bacteriana e impactos ambientais que comprometem a qualidade do produto final. Assim, a busca por alternativas rápidas e eficazes de diagnóstico são cada vez mais necessárias, uma vez que contribuem para o controle de enfermidades antes que estas provoquem sinais clínicos irreversíveis e taxas de mortalidade elevada. Em vista disso, o diagnóstico molecular, representado pelas técnicas da Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) e suas variações, tais como sequenciamento e PCR em tempo real, constituem alternativas a serem exploradas. Desse modo, os objetivos deste trabalho foram: a) adaptar a metodologia de PCR de colônia aliada ao sequenciamento do gene 16S rRNA para bactérias que causam doenças em peixes, b) determinar a sensibilidade aos antimicrobianos florfenicol e oxitetraciclina dos gêneros bacterianos de maior frequencia, c) validar testes de PCR em tempo real para detecção e quantificação de Aeromonas hydrophila e Streptococcus agalactiae e avaliar sua especificidade e sensibilidade analítica d) aplicar a metologia validada no diagnóstico de infecções por esses patógenos em grupos de tilapias infectadas experimentalmente. Nas metodologias desenvolvidas, buscou-se redução de custos e tempo para diagnóstico. Os resultados encontrados demonstraram que a PCR de colônia apresentou redução de custos e tempo quando comparada às técnicas tradicionais de isolamento, identificação bioquímica ... With the intensification of the Brazilian fish farming, characterized by increasing density storage, especially in cages, it has been observed a growing number of diseases, mainly bacterial, causing high mortality and significant economic losses in all phases of breedin. One of the problems related to the control of diseases in fish farming is the constant misuse of antibiotics and chemotherapeutics that cause problems of bacterial resistance and environmental impacts which affect the quality of the final product. Thus, the search for rapid and effective diagnostic alternative is increasingly necessary, since they contribute to control of diseases before they cause irreversible clinical signs and high mortality rates. In view of this, the molecular diagnostic techniques represented by the Polymerase Chain Reaction (PCR) and its variations, such as sequencing and real time PCR, constitute alternatives to be explored. Thus, the objectives of this work were: a) adapting the methodology of colony PCR coupled with sequencing of the 16S rRNA gene for bacteria that cause disease in fish, b) determine the sensitivity to antimicrobial florfenicol and oxytetracycline bacterial genera of higher frequency, c) validate real-time PCR assay for detection and quantification of Aeromonas hydrophila and Streptococcus agalactiae and to evaluate its sensitivity and analytical specificity d) applying the validated Methodology for the diagnosis of infections caused by these pathogens in infected experimentally tilapias groups. In the developed methodologies, we attempted to reduce costs and time to diagnosis. The results showed that: colony PCR showed a reduction of costs and time compared to traditional isolation techniques, biochemical identification, DNA extraction and conventional PCR; the alliance of colony PCR and 16S rRNA gene sequencing allowed identification of all tested bacterial pathogens, not being necessary the design of specific ...

Made available in DSpace on 2015-09-17T15:25:03Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-05. Added 1 bitstream(s) on 2015-09-17T15:49:25Z : No. of bitstreams: 1 000845518_20160402.pdf: 83963 bytes, checksum: b27fb8e88a318385605bd8bd1405bf1a (MD5) Bitstreams deleted on 2016-04-04T12:10:26Z: 000845518_20160402.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-04-04T12:11:06Z : No. of bitstreams: 1 000845518.pdf: 674514 bytes, checksum: 62da913b8ef513635c243ef06495c521 (MD5) Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Cimentos endodônticos associados à amoxicilina têm sido pesquisados como uma alternativa para obturação do canal radicular. Os objetivos do presente estudo foram: Avaliar a citocompatibilidade do AH Plus e do Sealapex associados com amoxicilina em quantidade de 10% do peso total dos cimentos (Capítulo 1) e avaliar o escoamento e o tempo de presa dos cimentos AH Plus e Sealapex associados à amoxicilina em diferentes concentrações e a atividade antibiofilme dos cimentos associados a uma maior concentração de amoxicilina que não altera as propriedades físicas de ambos os cimentos (Capítulo 2). No Capítulo 1 a citocompatibilidade dos materiais foi avaliada utilizando fibroblastos L929 expostos por 24 horas a diferentes diluições dos extratos dos cimentos puros e associados à amoxicilina. Os ensaios de brometo de 3-(4,5-dimetil-2-tiazolil )-2,5-difenil-2Htetrazólio (MTT) e vermelho neutro foram utilizados para avaliação da viabilidade celular e a fluorescência para actina e α-tubulina foram utilizadas para análise do citoesqueleto. Os dados foram analisados empregando a análise de variância a dois critérios e pós teste de Bonferroni, com nível de significância de 5%. Os resultados mostraram que a incorporação de amoxicilina na concentração de 10% do peso total dos cimentos não diminuiu a viabilidade dos fibroblastos e não causou alterações estruturais nos componentes do citoesqueleto estudados. Conclui-se que à amoxicilina poderia ser um agente antimicrobiano promissor para ser incorporada aos cimentos endodônticos. No Capítulo 2 o escoamento a o tempo de presa dos cimentos puros ou associados à amoxicilina em concentrações de 0,25 a 10% foram estudadas de acordo com a especificação no6876 da Organização Internacional de Padronização (ISO 2012). A avaliação antibiofilme dos cimentos puros e associados à amoxicilina 1% foi realizada por teste de contato...(Resumo completo clicar acesso eletrônico) Sealers associatedwith amoxicillinhave been developed as an alternative to root canal filling. The objectives of this study were to evaluate the cytocompatibility of AH Plus and Sealapex associated with amoxicillin in concentration of 10% of the total weight of sealer (Chapter 1) and evaluate the flow and the setting time of AH Plus sealer and Sealapex associated with amoxicillin at different concentrations and the activity of sealers antibiofilm associated with higher concentrations of amoxicillin which does not alter the physical properties of both sealers (Chapter 2). In Chapter 1 cytocompatibility of the materials was assessed using the L929 fibroblasts exposed for 24 hours with different dilutions of the extracts of pure sealer and associated with amoxicillin. The testing of 3- (4,5-dimethyl-2-thiazolyl) -2,5-diphenyl-2H-tetrazolium (MTT), and neutral red were used for evaluation of cell viability and fluorescence actin and α-tubulin were used for analysis of the cytoskeleton. Data were analyzed using analysis of variance and two criteria Bonferroni post test at 5% significance level. The results showed that incorporation of amoxicillin at a concentration of 10% by weight of the sealer did not decrease the viability of fibroblasts and did not cause structural changes in the cytoskeletal components studied. It is concluded that amoxicillin could be a promising antimicrobial agent to be incorporated in sealers. In chapter 2 the flow and setting time of the sealer pure or associated with amoxicillin from 0.25 to 10% concentrations were evaluated according to no 6876 specification of the International Organization for Standardization (ISO 2012). The antibiofilm evaluation of pure sealer and 1% associated with amoxicillin was performed by direct contact test with Enterococcus faecalis biofilm previously induced in bovine dentin for 14 days. Fresh sealer were in contact with the biofilm... (Complete abstract electronic access below)

Made available in DSpace on 2015-09-17T15:24:45Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-12-12. Added 1 bitstream(s) on 2015-09-17T15:47:21Z : No. of bitstreams: 1 000846941_20170112.pdf: 163516 bytes, checksum: 4ce30a0fdeac06cfebbb8131e5403824 (MD5) Bitstreams deleted on 2017-01-13T11:40:16Z: 000846941_20170112.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2017-01-13T11:40:54Z : No. of bitstreams: 1 000846941.pdf: 1511151 bytes, checksum: 290ab0e91f305496c3e95ec8ec96174e (MD5) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) Bioprospectar microrganismos a partir de ambiente impactado por xenobiótico e expô- los a um contaminante alvo, sob condições controladas, proporciona um estudo detalhado da capacidade microbiana local em se adaptar, sobreviver e remediar o ambiente. A proposta do presente trabalho foi isolar bactérias com potencial em degradar o herbicida diuron de solo com histórico de cinco anos de aplicação desse herbicida, sendo o meio de isolamento composto por glicose (controle) e diuron (meio indutor), separadamente, como fonte de carbono. Foram isoladas 400 bactérias, sendo 68% gram-positivas e 32% gram-negativas. A maioria dos isolados mostrou potencial em degradar entre 10 a 30% do herbicida em cinco dias de cultivo em meio líquido, entretanto bactérias dos gêneros Stenotrophomonas e Bacillus foram capazes de degradar 87% e 68%, respectivamente. Variações no meio de cultivo mostraram a importância da presença de fonte de carbono mais facilmente assimilável para o desenvolvimento da habilidade bacteriana em degradar o diuron. Células bacterianas imobilizadas em alginato-Ca não apresentaram aumento relevante na taxa de degradação de diuron. Entretanto, técnicas de microcosmos (solo) mostraram-se eficientes no aumento do potencial de degradação do herbicida. Condições de consórcio microbiano na presença de bactérias e fungos foram os ensaios que apresentaram as maiores porcentagens de degradação do herbicida diuron, tanto no cultivo de células em meio líquido, imobilizadas e microcosmo. A degradação do herbicida diuron pelas bactérias isoladas permitiu o estudo da via de degradação da molécula original no ambiente, destacando a formação dos metabólitos DCPMU, DCPU, 3,4-DCA, 3,4- CAC, 4-CA, 4-CAC e Anilina. O conjunto de dados obtidos neste trabalho sugere fortemente que as bactérias presentes em solos impactados com diuron possuem o potencial em degradar o herbicida, entretan Bioprospection of microorganisms from impacted environment by xenobiotic and expose them to a target contaminant, under controlled conditions, provides a detailed study of the local microbial ability to adapt, survive and remediate the environment. The purpose of this study was to isolate bacteria with potential to degrade the diuron herbicide from soil with a diuron historical application of five years. The isolation media were composed by glucose (control) and diuron (inductor means) separately as a carbon source. A number of 400 bacteria were isolated, and they were classified as 68% gram-positive and 32% gram-negative. Most isolates showed potential to degrade diuron from 10 to 30%, into five days ofcultivation in liquid medium, however bacteria of the genera Stenotrophomonas and Bacillus were able to degrade 87% and 68%, respectively. Variations in the culture medium showed the importance of the presence of a carbon source easily assimilated to improve the bacteria development and ability to degrade diuron. Bacterial cells immobilized in Ca-alginate showed no significant increase in the rate ofdiuron degradation. However, microcosms techniques (soil) were effective in increasing the herbicidal degradation potential. Microbial consortium conditions in the presence of bacteria and fungi presented the highest herbicide diuron degradation percentages in liquid cultivation, cell immobilized and microcosm. The degradation of the herbicide diuron by bacteria allowed the degradation pathway of the parent molecule in the environment, highlighting the formation ofmetabolites DCPMU, DCPU, 3,4-DCA, 3,4-CAC, 4-CA, 4-CAC and aniline. The results obtained from this study strongly suggests that the bacteria present in soil impacted with diuron have the potential to degrade the herbicide, however completely mineralization is provided by the action of local microbial population.

Made available in DSpace on 2015-04-09T12:28:11Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-12-12Bitstream added on 2015-04-09T12:48:02Z : No. of bitstreams: 1 000817273.pdf: 298948 bytes, checksum: 762ca1d6e7651d637723020aefd757ff (MD5) O uso de bactérias solubilizadores de fósforo pode ser uma alternativa para reduzir a quantidade de fertilizantes fosfatados. O presente trabalho examinou quatro diferentes áreas que recebem tratamentos distintos, sendo: soja como cultura de rotação, vinhaça e torta de filtro, como fertilizantes, comparando com o controle; relacionando o número total de bactérias solubilizadores de fósforo, bactérias totais e alguns parâmetros microbiológicos do solo para cada tratamento. Mesmo a matéria orgânica sendo maior (19,8%) para área de torta de filtro, a umidade apresentando maior valor (18,9%) para a área de vinhaça e as bactérias totais variando de 7,1 log10 de até 7,4 unidades formadoras de colônias, não houve diferença significativa entre as áreas. A desidrogenase (TFF 593.5μg / 24h.g) e o carbono da biomassa microbiana (916.7μg C / g) foram maiores para a área de torta de filtro. A atividade respiratória foi menor (5,23 mg / 100g de CO2) para a área de soja e a concentração de fósforo foi maior (1011,3 g P g-1) para a área da torta de filtro. Em contrapartida, o número total de bactérias solubilizadores de fósforo foi maior (6,03 log10 UFC) para a área de soja e não para a área da torta de filtro ou vinhaça. Estes resultados sugerem que o uso da vinhaça e torta de filtro não melhora as condições para colonização e estabelecimento de bactérias solubilizadores de fósforo e que a utilização de bactérias solubilizadoras de fósforo em torta de filtro melhora a disponibilidade desse nutriente, tratando-se de uma possível alternativa de baixo custo The use of phosphate solubilizing bacteria can be an alternative to reduce the amount of phosphate fertilizers. The present work examined four different areas that receive different treatments, as follows: soybeans as crop rotation, vinasse and filter cake as fertilizer, compared with control; relating the total number of phosphorus solubilizing bacteria, total bacteria and some soil microbiological parameters for each treatment. Even the organic matter was higher (19.8%) to filter cake area, moisture having greater value (18.9%) to the area of vinasse and total bacteria ranging from 7.1 to 7.4 log10 colony forming units, there was no significant difference between the areas. Dehydrogenase (TFF 593.5μg / 24h.g) and microbial biomass carbon (C 916.7μg / g) were higher in the area of filter cake. The respiratory activity was lower (5.23 mg / 100g of CO2) for soybean area and the concentration of phosphorus was higher (1011.3 g P g-1) to the area of the filter cake. However, the total number of phosphorus solubilizing bacteria was higher (6.03 log10 CFU) in the area of soy and not to the area of the filter cake and vinasse. These results suggest that the use of vinasse and filter cake does not improve the conditions for colonization and establishment of phosphorus solubilizing bacteria and the use of phosphorus solubilizing microorganisms in the filter cake improving the availability of this nutrient , in the case of a possible low-cost alternative

Made available in DSpace on 2015-05-14T16:52:58Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-08-29Bitstream added on 2015-05-14T16:59:38Z : No. of bitstreams: 1 000827367.pdf: 649488 bytes, checksum: 15aceb684d9b0e92b84316491ef60b36 (MD5) Objetivou-se avaliar doses de nitrogênio em cobertura, com e sem a inoculação das sementes com a bactéria promotora de crescimento de plantas Azospirillum brasilense nas safras de primavera/verão de 2011/12 e 2012/13 em cultivo do milho solteiro, e no milho outonal nas safras 2012 e 2013, consorciado com Urochloa brizantha cv. Xaraés. O delineamento experimental utilizado para as quatro safras foi o de blocos casualizados, com quatro repetições, em esquema fatorial 5 X 2, ou seja, cinco doses de N em cobertura (0; 30; 60; 90 e 120 kg ha -1 ), com e sem a inoculação das sementes do milho com A. brasilense, na dose de 100 mL para 25 kg de sementes, sendo consorciado com Urochloa brizantha cv. Xaraés nas duas safras outonais. Foram avaliados no florescimento do milho, os teores de nutrientes foliares e o índice de clorofila foliar, e na colheita os componentes da produção e a produtividade de grãos do milho, bem como a produtividade de matéria seca e o teor de proteína bruta da forrageira após o consórcio. A adubação em cobertura, com a dose de N de até 120 kg ha -1 , incrementou linearmente os teores nutricionais foliares e a produtividade de grãos do milho irrigado cultivado na primavera/verão no Cerrado, e os teores de proteína bruta do capim-Xaraés em consórcio com o milho outonal. A inoculação das sementes de milho com A. brasilense, em cultivo consorciado com capim-Xaraés na época outonal incrementou a nutrição, a altura das plantas e os componentes da produção do milho, entretanto, sem efeito na produtividade de grãos. Plantas de milho advindas de sementes inoculadas com A. brasilense, pelo seu maior crescimento vegetativo, proporcionaram menor produção de matéria seca do capim-Xaraés semeado em consórcio com o milho outonal This study aimed to evaluate doses of nitrogen, with and without seed inoculation with bacteria Azospirillum brasilense cropped in spring/summer of 2011/12 and 2012/13 in single corn crop, and corn in autumn cropped in 2012 and 2013, intercropped with Urochloa brizantha cv. Xaraés. The experimental design for the four cropped was a randomized complete block design with four replications in a factorial 5 X 2, or five N topdressing (0, 30, 60, 90 and 120 kg ha -1 ) with and without the inoculation of corn seeds with A. brasilense at a dose of 100 mL per 25 kg of seed being intercropped by Urochloa brizantha cv. Xaraés the two autumnal cropped. Were evaluated at corn flowering, the levels of foliar nutrients and chlorophyll index, and crop yield components and grain yield of corn as well as the productivity of dry matter and crude protein content of the forage after the consortium. The topdressing, with N rates up to 120 kg ha -1 , increased linearly foliar nutrient levels and grain yield of irrigated corn grown in the spring/summer in the Cerrado soil, and crude protein of grass Xaraés in consortium with the autumnal corn. Inoculation of corn seeds with A. brasilense, in intercropping with Xaraés grass in autumnal time increased the nutrition, growth in plant height and yield components of corn, however, without effect on grain yield. Corn plants resulting from seeds inoculated with A. brasilense, by their greater vegetative growth, providing lower dry matter production of grass seed into Xaraés consortium with autumnal corn

Made available in DSpace on 2015-03-03T11:52:37Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-07-29Bitstream added on 2015-03-03T12:06:20Z : No. of bitstreams: 1 000811960.pdf: 431584 bytes, checksum: 29bbfbd40fb6da9a126f4a3cccfb92ff (MD5) O milho é um dos principais cereais cultivados em todo território mundial, é utilizado como fonte para alimentação humana, animal e como matéria prima para a indústria. Trata-se de uma cultura bastante influenciada pelo nitrogênio, o qual é considerado fundamental para o aumento de produtividade de grãos. Há a necessidade de incorporar tecnologias para a racionalização e conscientização do uso dos fertilizantes nitrogenados. Uma das alternativas é a utilização de bactérias diazotróficas capazes de disponibilizar o nitrogênio para a planta de milho, possibilitando o incremento na produtividade de grãos. O objetivo desse trabalho foi avaliar a ocorrência de interação da inoculação com a bactéria do gênero Azospirillum brasilense em diferentes genótipos de milho, na ausência e na presença de nitrogênio em cobertura, para diferentes caracteres agronômicos. O experimento foi realizado no delineamento de blocos ao acaso, utilizando diferentes genótipos de milho, formas de inoculação com Azospirillum brasilense e doses de nitrogênio em cobertura. Avaliou-se a produtividade de grãos, os componentes da produção e os caracteres da planta. Observou-se efeito da inoculação para a produtividade de grãos na ausência de nitrogênio, enquanto que para os outros caracteres este efeito variou de acordo com a dose de nitrogênio utilizada em cobertura. Os caracteres produtividade de grãos e teor de nitrogênio apresentaram interação genótipo vs formas de inoculação significativa na ausência de nitrogênio em cobertura e os caracteres altura da planta, diâmetro do colmo, índice relativo de clorofila e posição relativa da espiga na presença de nitrogênio em cobertura. Como a resposta à inoculação varia em função dos genótipos, é interessante delinear programas de melhoramento para o desenvolvimento de genótipos mais responsivos Maize is one of the most important cereals grown worldwide and it is used as a source for human and animal food and as feedstock for industry. It is a culture heavily influenced by nitrogen, wich one is considered essential for increasing the grain yield. It is necessary to incorporate technologies to rationalize and to become aware of the use of nitrogen fertilizers. One alternative is the use of diazotrophic bacteria, wich one is able to provide nitrogen for the maize plant enabling the increasing in grain yield. The objective of this study was to evaluate the occurrence of interaction of the inoculation with bacteria of the genus Azospirillum brasilense in different maize genotypes in the absence and presence of topdressing nitrogen for different agronomic traits. The experiment was conducted in completely randomized block designed. It was used different maize genotypes under different doses of topdressing nitrogen and inoculation forms of Azospirillum brasilense. The grain yield, yield components and plant traits were evaluated. In the absence of topdressing nitrogen, it was observed effect of the inoculation for the grain yield. However, for the other agronomic traits, the effect of the inoculation varied according to the doses of topdressing nitrogen. The grain yield and nitrogen content showed significance of the interaction genotype vs forms of inoculation in the absence of topdressing nitrogen and plant height, culm diameter, relative chlorophyll index and relative position of the ear, showed the interaction in the presence of nitrogen topdressing. The inoculation varies in function of the genotypes, so it is interesting to delineate breeding programs for the development of more responsive genotypes

Made available in DSpace on 2015-04-09T12:28:29Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-07-24Bitstream added on 2015-04-09T12:47:20Z : No. of bitstreams: 1 000817158.pdf: 763287 bytes, checksum: 5fbb2889f17a91f70839a5d61580be7f (MD5) Mananoligossacarídeo na alimentação pode melhorar a imunidade, crescimento e saúde de peixes cultivados. Assim, o objetivo deste trabalho foi avaliar a influência de níveis de MOS (0,0 g Kg-1; 2,0 g kg-1; 4,0 g kg-1; 8,0 g kg-1; 10,0 g kg-1; 15,0 g kg-1) na dieta de tilápia-do-Nilo sobre os parâmetros hematológicos e imunológicos, desempenho produtivo, digestibilidade de proteína e resistência à bactéria L. garvieae, após 45 dias. 576 tilápias (127,3±4,79 g e 18,7±0,27 cm), distribuídas em 24 caixas (310 L) com aeração e renovação constante de água (6 tratamentos e 4 repetições) foram alimentadas com as dietas-teste extrusadas. Aos 0, 7, 15, 30 e 45 dias após a alimentação, foi coletado sangue, destinado à realização de análises hematológicas e imunológicas. O consumo das dietas foi registrado semanalmente e aos 45 dias, os peixes foram pesados e medidos para obtenção de parâmetros de desempenho. Após 45 dias, as mesmas dietas, acrescidas de marcador e peletizadas foram oferecidas aos peixes e as fezes coletadas para determinar o coeficiente de digestibilidade de proteína. Nas mesmas condições, com 168 tilápias (125,3±5,09 g e 17,6±0,33 cm) e após 7, 15, 30 e 45 dias de alimentação realizaram-se desafios por co-habitação com L. garvieae, avaliando-se a taxa de mortalidade, durante 15 dias. Os grupos alimentados com o prebiótico não apresentaram melhora significativa em relação ao grupo controle nas variáveis imunológicas, hematológicas e digestibilidade de proteína. O mesmo ocorreu com o desafio bacteriano. Entretanto, a inclusão de 2,0, 4,0 e 8,0 g Kg-1 de MOS na dieta melhorou os valores de ganho de pesos dos animais. Como conclusão, a inclusão de MOS não afetou a hematologia, imunidade, digestibilidade de proteína e resistência bacteriana. Mas, a inclusão de 2,0, 4,0 e 8,0 g Kg-1 do prebiótico na dieta melhorou o ganho de peso da tilápia-do-Nilo Manann oligosaccharide in feed can improve immunity, growth and health of farmed fish. Thus, the objective of this study was evaluate the influence of MOS levels (0.0 g Kg-1; 2.0 g kg-1; 4.0 g kg-1; 8.0 g kg-1; 10.0 g kg-1; 15.0 g kg-1) in the diet of Nile Tilapia in hematological and immunological parameters, production performance, digestibility of protein and resisting bacteria L. garvieae, after 45 days. 576 tilapias (127.3 ± 4.79 g and 18.7 ± 0.27 cm), distributed in 24 fiberglass tank (310 L) with aeration and constant renewal of water (6 treatments and 4 replications) it was fed with diets-extruded test. In time 0, 7, 15, 30 and 45 days after feeding, it was collected blood for hematological and immunological analyses. The consumption of diets was registered weekly and in the period 45 days the fish was weighed and measured to obtain performance parameters. After 45 days, the same diets, added marker and pelletized, were offered to fish and the faeces was collected to determine protein digestibility coefficient. Under the same conditions, with 168 Nile tilapia (125.3 ± 5.09 g and 0.33 ± 17.6 cm) and after 7, 15, 30 and 45 days it was made challenges by cohabitation with L. garvieae, evaluating the mortality rate during 15 days. The groups fed with prebiotic didn't show significant improvement as compared to the control group on variables, immunological, hematological and protein digestibility. The same occurred with the bacterial challenge. However, the inclusion of 2.0, 4.0 and 8.0 g Kg-1 of MOS in the diet improved the gain of weight of animals. As a conclusion, the inclusion of MOS not affected the hematology, immunity, protein digestibility and bacterial resistance. But, the inclusion of 2.0, 4.0 and 8.0 g Kg-1 of the prebiotic on diet improved weight gain of Nile tilapia

Made available in DSpace on 2015-03-03T11:52:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-07-22Bitstream added on 2015-03-03T12:07:10Z : No. of bitstreams: 1 000807109.pdf: 457835 bytes, checksum: c8b102f16b86a5f3ecea8c8ee3c9df40 (MD5) A pesquisa objetivou analisar a suscetibilidade de duas populações distintas de Helicoverpa armigera a produtos comerciais à base de Bacillus thuringiensis (Bt) e isolados de Beauveria bassiana, Metarhizium anisopliae e Metarhizium rileyi. As populações foram coletadas em lavouras de soja nos municípios de Rio Verde (GO) e Luís Eduardo Magalhães (BA) e criadas em laboratório até a décima geração antes do início dos bioensaios. Os formulados utilizados foram Dipel® PM (B. thuringiensis var kurstaki), Xentari® WG (B. thuringiensis var. aizawai) e Agree® WG (B. thuringiensis var. aizawai GC91 transconjugado com B. thuringiensis var. kurstaki), com a aplicação de 50 ?L da suspensão do produto biológico, na concentração de 107 esporos viáveis/mL, sobre a superfície da dieta acondicionada em recipientes esféricos de plástico (2 cm de diâmetro x 3 cm de altura). Em cada recipiente foi inserida uma lagarta, de cada instar larval, em um total de 100 lagartas por tratamento distribuídas em 10 repetições. As avaliações referentes à mortalidade foram efetuadas a cada 24 horas, até o sétimo dia após a aplicação dos tratamentos. Os fungos B. bassiana e M. anisopliae foram obtidos a partir dos produtos comerciais biológicos Boveril® PM e Metarril® PM, respectivamente, enquanto que M. rileyi foi isolado de cadáveres de H. armigera, sendo padronizados na concentração de 108 conídios viáveis/mL. Como unidade experimental foram utilizados recipientes de plástico (2 cm de diâmetro x 3 cm de altura), com dieta artificial na qual uma alíquota de 50 ?L do fungo foi misturada ou aplicada na superfície. Em cada recipiente foi inserida uma lagarta de primeiro instar, com menos de 24 h de vida, totalizando 100 lagartas por tratamento distribuídas em 10 repetições. A mortalidade foi avaliada a cada 24 h, até o décimo dia após a aplicação dos tratamentos. Lagartas de primeiro instar de H. armigera, de ambas ... The research aimed to assess the suscetibility of two distinct Brazilian populations of Helicoverpa armigera to commercial Bacillus thuringiensis insecticides and isolates of Beauveria bassiana, Metarhizium anisopliae and Metarhizium rileyi.The pest populations were collected in soybean fields located in Rio Verde (GO) and Luís Eduardo Magalhães (BA), taken to laboratory and reared until the tenth generation on artificial diet, to be used in the experiment.The bioassays were performed using spherical plastic receptacles (2-cm diameter x 3- cm height) containing artificial diet until complete the half volume. The formulated products used were Dipel® WP (B. thuringiensis var kurstaki), Xentari® WG (B. thuringiensis var. aizawai) and Agree® WG (B. thuringiensis var. aizawai GC91 with B. thuringiensis var. kurstaki), spraying 50 ?L of biological product solution at 107 viable spores/mL, on the surface of the diet. One caterpillar was inserted in each receptacle, related with larval instar, totaling 100 caterpillars per treatment and each group containing 10 caterpillars were considered a replication. Mortality were assessed each 24h, until the seventh day after the beginning of the bioassay. To perform the bioassays with entomopathogenic fungi, B. bassiana and M. anisopliae were obtained from the bio-insecticides Boveril® WP and Metarril® WP, respectively and M. rileyi was isolated from H. armigera cadavers at concentration of 108 viable conidia/mL. The bioassays were performed using spherical plastic receptacles (2-cmdiameter x 3-cm height) containing artificial diet until complete the half volume. After this step, a solution of 50 ?L containing the entomopathogenic fungi was sprayed on the diet surface. One caterpillar was inserted in each receptacle, with less than 24 h after hatch, totaling 100 caterpillars per treatment. Each group containing 10 caterpillars were considered a replication. Mortality were assessed each 24h, until ...

Made available in DSpace on 2015-03-03T11:52:26Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-07-18Bitstream added on 2015-03-03T12:07:12Z : No. of bitstreams: 1 000811933_20151218.pdf: 96939 bytes, checksum: 04a99a8168a4d1d45d4874efe4f2b497 (MD5) Bitstreams deleted on 2015-12-18T13:57:58Z: 000811933_20151218.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2015-12-18T13:58:36Z : No. of bitstreams: 1 000811933.pdf: 896821 bytes, checksum: d95843628c2f7f0cc36797c46e5efaf7 (MD5) Bacillus thuringiensis é uma bactéria que pode conferir patogenicidade a uma ampla variedade de insetos, e que possui fatores associados à mortalidade de insetos por B. thuringiensis, que foram identificados e são utilizados no controle de insetos-praga como, por exemplo, as toxinas Cry, Vip e Cyt. Novos genes de B. thuringiensis que possam estar envolvidos no processo de patogenicidade a insetos têm sido identificados, entre estes, as quitinases. Enzimas capazes de hidrolisar as ligações glicosídicas entre as unidades de N-acetil-glicosamina da quitina, e aparecem como uma interessante opção por também mostrarem potencial para serem utilizadas no controle de pragas. No presente trabalho, realizou-se o isolamento e a caracterização de um gene de quitinase do isolado de B. thuringiensis I_555 (chi_I555) e a produção e caracterização parcial da quitinase (Chi_I555). A análise de chi_I555 indicou uma fase de leitura aberta de 2025 pares de bases que codificam uma proteína com 674 aminoácidos e peso molecular de 74,24 kDa. Análises bioinformáticas indicaram a presença de um sítio ativo de quitinase, de um domínio de fribronectina e de um domínio ligante de quitina na proteína Chi_I555. A expressão heteróloga de Chi_I555 resultou na produção de uma quitinase ativa sobre o substrato “Chitin Azure” em uma faixa ótima de pH próxima do neutro. A proteína Chi_I555 utilizada neste estudo é altamente promissora para o uso em construções de plantas geneticamente modificadas Bacillus thuringiensis is a bacterium that can confer pathogenicity to a wide variety of insects, and has associated with mortality of insects by B. thuringiensis factors that have been identified and are used to control insect pests such as the Cry toxins, Vip and Cyt. New genes of B. thuringiensis that may be involved in the pathogenic process of insects have been identified among these chitinases. Enzymes capable of hydrolyzing glycosidic linkages between the units of N-acetyl-glucosamine from chitin, and appear as an interesting option to also show potential for use in pest control. In this study, we carried out the isolation and characterization of a chitinase gene from B. thuringiensis isolate I_555 (chi_I555) and the production and partial characterization of a chitinase (Chi_I555). Chi_I555 analysis indicated an open reading frame of 2025 base pairs encoding a protein of 674 amino acids and a molecular weight of 74.24 kDa. Bioinformatics analysis indicated the presence of an active site of chitinase, a fribronectin domain and a chitin binding domain of the protein Chi_I555. Heterologous expression of Chi_I555 resulted in the production of an active chitinase on the substrate Chitin Azure in a great range of pH close to neutral. The Chi_I555 protein used in this study is highly promising for use in construction of genetically modified plants

Made available in DSpace on 2015-01-26T13:21:12Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-07-07Bitstream added on 2015-01-26T13:31:00Z : No. of bitstreams: 1 000800504.pdf: 2832230 bytes, checksum: b906fd797b3c0c0ad9250568ba7fe3ff (MD5) A crescente demanda mundial por combustíveis menos poluentes tem dado destaque ao Brasil. O governo brasileiro lançou programas que estimulam uma agricultura sustentável, os quais contemplam a fixação biológica de nitrogênio, que pode substituir total ou parcialmente a adubação nitrogenada. Além disso, visando maior eficiência, têm surgido pesquisas sugerindo novos sistemas de plantio, como o de mudas pré-brotadas (MPB). Nesse sentido, o estudo teve como objetivo avaliar: (i) os efeitos da inoculação de bactérias diazotróficas sobre a formação de MPB de cana-de-açúcar, oriundas de gemas individualizadas; e (ii) o crescimento inicial destas mudas, associadas à aplicação de nitrogênio, cultivadas em solo de baixa fertilidade. Foram conduzidos dois experimentos, um em casa de vegetação, com duração de 50 dias e outro em vasos a campo, com duração de 180 dias. Em ambos os experimentos, o delineamento foi em blocos casualizados, sendo o primeiro com tratamentos arranjados em esquema fatorial 2 x 3 (com e sem inoculante e três quantidades de reserva das gemas) e o segundo em fatorial 2 x 2 x 4 (com e sem inoculante, com e sem nitrogênio, avaliados em quatro épocas: aos 45, 90, 135 e 180 dias). O inoculante teve efeito sobre a fase inicial e pode reduzir o tempo de viveiro para produção de mudas pré-brotadas. Em solo de baixa fertilidade, o inoculante promoveu ganhos na parte aérea quando associado a doses de N. No sistema radicular não trouxe ganhos na produção de matéria seca, mas promoveu alterações na arquitetura radicular, proporcionando maior comprimento das raízes. A inoculação favoreceu incrementos na eficiência da utilização do fertilizante nitrogenado na parte aérea da planta, possivelmente pelas alterações na arquitetura radicular. O inoculante apresentou efeito promotor de crescimento em plantas The growing global demand for cleaner fuels has given prominence to Brazil. The Brazilian government has launched programs that encourage sustainable agriculture, which include biological nitrogen fixation, which may totally or partially replace nitrogen fertilization. Moreover, aiming at greater efficiency, have emerged suggesting new research tillage systems, such as presprouted seedlings (MPB). This study is aimed at evaluating: i) the effects of diazotrophic bacteria inoculation on the formation of sugarcane pre-sprouted seedlings (MPB), originating from individual buds; and (ii) the association of nitrogen application with the initial growth of these seedlings in low fertility soils. The first experiment was conducted in a greenhouse for a duration of 50 days. The second included pots in the field for a duration of 180 days. In both experiments, the design utilized randomized blocks; the first with treatments arranged in a 2 x 3 factorial design (with and without inoculation and three quantities of bud reserve) and the second in 2 x 2 x 4 factorial (with and without inoculation, with and without nitrogen evaluated in four seasons: at 45, 90, 135 and 180 days). The inoculant had an effect on the initial phase and reduced the time to produce pre-sprouted seedlings in the greenhouse. In low fertility soil, the inoculant promoted gains in shoot when associated with N doses. There were no gains in root dry matter production in inoculated soils, however, changes were noted in root architecture, with greater growth in root length. The inoculant revealed a positive effect on plant growth

Made available in DSpace on 2015-05-14T16:53:19Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-07-02Bitstream added on 2015-05-14T16:59:02Z : No. of bitstreams: 1 000823250.pdf: 982861 bytes, checksum: 6ede8cb030f6896d2228dd44f3ab391c (MD5) Pacientes críticos internados em Unidade de Terapia Intensiva (UTI), em sua maioria, requerem auxílio da Ventilacão Mecânica Invasiva (VMI). A análise da diversidade microbiana é fundamental para identificação de espécies, ainda desconhecidas, responsáveis pela Pneumonia Associada a Ventilação Mecânica (PAVM). Os objetivos deste estudo foram: a) Estudar a diversidade microbiana presente na cavidade oral e no BAL (mini-BAL) de pacientes internados em UTI sob VMI, através da técnica Checkerboard DNA-DNA Hybridization; b) Avaliar se o perfil microbiano presente na cavidade oral está presente no Lavado Bronco Alveolar (mini-BAL), em diferentes períodos de tempo da VMI (12 h, 48 h, 96 h) e na extubação; c) Detectar a presença de espécies bacterianas circulantes na corrente sanguínea de pacientes internados em UTI sob VMI através dos resultados de hemocultura. Participaram do estudo 10 pacientes críticos internados em UTI sob VMI. As amostras foram coletadas no dorso da língua, espaço subgengival, no BAL, no aspirado endotraqueal e cânula de intubação orotraqueal. Foi possível identificar a presença de espécies bacterianas no BAL/aspirado endotraqueal, inclusive com aumento da carga bacteriana com o tempo prolongado de Intubação orotraqueal (IOT), 48 h e 96 h; e em relação à mucosa oral e espaço subgengival também foi possível observar já nas primeiras 12 h a presença de espécies bacterianas no BAL, estes achados apresentaram associação com PAVM e com resultados de hemocultura positiva. As bactérias isoladas na hemocultura foram S auerus, S epidermides, P aeruginosa. Houve associação de febre com PAVM e hemocultura positiva. Concluiu-se que durante a IOT, espécies bacterianas migram rapidamente para as vias aéreas inferiores, podendo contribuir para a fisiopatogenia da PAVM, houve associação de PAVM com Enterococcus faecalis, Fusobacterium periodo Critical patients admitted to intensive care unit (ICU), in their majority, require Invasive Mechanical Ventilation assistance (MV). The analysis of microbial diversity is fundamental to identifying species, as yet unknown, responsible for Pneumonia associated with mechanical ventilation (VAP). The objectives of this study were: to Study microbial diversity) present in the oral cavity and in the BAL (mini-BAL) of patients hospitalized in ICU under VM by Checkerboard DNA-DNA Hybridization technique; b) assess whether the microbial profile present in the oral cavity is present in Broncho Alveolar (mini-BAL), in different time periods of the MV (12 h, 48 ‘h, 96 h) and on extubation; c) detect the presence of bacterial species circulating in the bloodstream of patients hospitalized in ICU under VM through the results of blood cultures. Participated in this study 10 critical patients admitted to ICU under MV. The samples were collected on the dorsum of the tongue, subgingival space, in BAL, endotracheal aspirate and orotracheal intubation cannula. It was possible to identify the presence of bacterial species in the BAL/endotracheal aspirate, including with increased bacterial load with the extended time of orotraqueall Intubation (OTI), 48 h and 96 h; and in relation to the oral mucosa and subgingival space has also been possible to observe in the first 12 h the presence of bacterial species in the BAL, these findings showed association with VAP and with positive blood culture results. The isolated bacteria in blood culture were S auerus, S epidermides, P aeruginosa. There was association with fever and blood culture positive PAVM. It was concluded that during the OTI, bacterial species migrate quickly to the lower airways and may contribute to the pathophysiology of VAP. There were associations between VAP and Enterococcus faecalis, Fusobacterium periodonticum, Gemella morbillorum, Neisseria...

Made available in DSpace on 2015-03-03T11:52:22Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-07-01Bitstream added on 2015-03-03T12:07:26Z : No. of bitstreams: 1 000811366.pdf: 358045 bytes, checksum: 9cd1f999c10e551e3f1a2870a24607d9 (MD5) O rúmen é um ecossistema aberto, no qual o alimento consumido pelos ruminantes é fermentado a ácidos graxos de cadeia curta e proteína microbiana, os quais servem respectivamente como fonte de energia e de proteína para o animal. Espécies de micro-organismos têm desenvolvido no rúmen uma série de interações complexas, o qual é um dos melhores exemplos de simbiose entre micro-organismos na natureza. Os métodos convencionais para a taxonomia baseada em técnicas de cultivo vêm sendo substituídas por técnicas moleculares, que são rápidas e mais precisas. O fundamento das técnicas moleculares está na sequência do 16S rRNA que fornece a classificação filogenética usadas na identificação e quantificação da comunidade bacteriana. Para avaliar a diversidade bacteriana ruminal neste estudo, foram utilizados 3 bovinos da raça Nelore, canulados no rúmen. As frações líquida e sólida do conteúdo ruminal foram processadas para extração de DNA metagenômico, após a extração foi verificado a quantidade e integridade das amostras. Em seguida, foi feita a PCR baseada nas regiões hipervariáveis V1 e V2 do 16S rRNA, e em sequência procedeu-se a construção da biblioteca e sequenciamento utilizando a plataforma Illumina. Os dados foram analisados pelos softwares MG-RAST e MOTHUR para filiações bacterianas. Aproximadamente 11.407.000 reads foram geradas com qualidade e 812 e 752 UTOs foram encontrados no nível de espécie e gênero respectivamente. Foram identificados 27 filos no conteúdo ruminal de bovinos Nelore através do sequenciamento do gene 16S rRNA pela plataforma Illumina. Os conhecimentos gerados a partir do presente estudo são informações primárias e primordiais para o entendimento da composição bacteriana ruminal. Assim, nos proporciona vislumbrar futuro promissor no desenvolvimento de novos métodos e tecnologias aplicáveis na nutrição animal The rumen is an open ecosystem in which the food consumed by ruminant is fermented to yield short-chain fatty acids and microbial protein, that in turn serve as a source of energy and protein for the animal, respectively. Species of microorganisms into rumen have developed a series of complex interactions that become one of the best examples of symbiosis between microorganisms in nature. Conventional methods for microbial taxonomy based on culture techniques have been replaced by molecular techniques which are quickly and more accurate. The majority of phylogenetic molecular tools for bacteria classification are based on ribosomal 16S rRNA gene that provides resources for identification and also quantification of bacterial communities. In order to evaluate the ruminal bacterial diversity present in three Nelore cannulated cattle, the rumen content was fractionated in liquid and solid samples after its collect. Both parts were processed for metagenomic DNA extraction which in turn was evaluated according quantity and integrity parameters. Next stage consisted in PCR technique based on V1 and V2 hypervariable 16S rRNA regions to generate amplicons used for DNA sequencing performed at Illumina platform. Data were processed by MG-RAST and MOTHUR softwares to deduce bacterial affiliations. Approximately 11,407,000 reads were generated showing quality for indication of 812 and 752 OTUs at the level of species and genus, respectively. Twenty-seven phyla were successfully identified in Nellore ruminal contents by 16S rRNA sequencing in the powerful Illumina platform. The knowledge generated from this study are primary and essential for the wide understanding of rumen bacterial composition information. Thus, it provides us resources to be explored in a promising future focusing the development of new methods and technologies applied to animal nutrition

Made available in DSpace on 2014-11-10T11:09:55Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-06-27Bitstream added on 2014-11-10T11:57:42Z : No. of bitstreams: 1 000792129.pdf: 1387453 bytes, checksum: a23091891fb1b1c568aaa3170eeee7cf (MD5) O entomopatógeno Bacillus thuringiensis têm se destacado no controle biológico de insetos-praga como alternativa viável em substituição aos inseticidas químicos. A bactéria é caracterizada pela produção de cristais protéicos em concomitância com o processo de esporulação. Esses cristais são formados por polipeptídeos que apresentam propriedade entomopatogênica frente a diversas ordens de insetos, porém são inócuos ao meio ambiente. Dessa forma, o conhecimento da diversidade de genes de B. thuringiensis presente no solo é de extrema importância para compreender sua distribuição ecológica e seus efeitos em habitats diferentes. Em paralelo, o uso de técnicas de análise envolvendo metagenômica são propostas para estudar comunidades microbianas presentes no meio ambiente, permitindo inclusive o acesso a microrganismos incultiváveis. A partir desta proposta o presente trabalho analisou a diversidade de genes codificadores das proteínas entomopatogênicas de B.thuringiensis em seqüências metagenômicas de DNA extraído de solo com cultivo de cana-de-açúcar e solo de floresta nativa em estações climáticas distintas. Foi possível identificar linhagens que possivelmente deram origem ao material genético via plataforma MG-RAST e os genes codificadores das proteínas entomopatogênicas foram identificados utilizando o software BLAST. Os resultados evidenciam uma provável influência das estações climáticas sobre a diversidade dos genes obtidos por este tipo de análise The entomopathogen Bacillus thuringiensis is the most used alternative to control pests as opposed to the use of chemical products. This bacterium is able to produce crystals protein with entomopathogenic properties coded by the cry genes during its sporulation phase. The knowledge of the diversity of cry genes found in B. thuringiensis that is considered a soil bacterium is of extreme importance to allow us to understand the ecological distribution and its potential effects on the environment. Aside from this, the use of metagenomics techniques are being proposed to study microbial communities, as a way to overcame uncultivable microorganism. Based on such proposition this work aimed to evaluate the presence of B. thuringiensis entomopathogenic protein coding genes from metagenomic DNA extracted from soil samples on which sugar-cane has been cultivated as well as native forest soil samples obtained during different seasons of the year. It was possible to identify some strains of B. thuringiensis using the platform MG-RAST and their respective cry genes using the software BLAST. The obtained results allowed us to consider the influence of the climate on the diversity of cry genes that could be recognized by this type of analysis

Made available in DSpace on 2015-04-09T12:28:05Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-06-09Bitstream added on 2015-04-09T12:48:25Z : No. of bitstreams: 1 000817293.pdf: 1011948 bytes, checksum: 6854d3b9376a3b4692a20f1cc23048bc (MD5) As estruturas e alguns compostos produzidos pelos microrganismos apresentam elevada quantidade de cargas como, por exemplo, parede celular e biopolímeros. Os exopolissacarídeos (EPSs) de bactérias pertencentes à ordem Rhizobiales apresentam biopolímeros que têm sido muito estudados. Os EPSs são moléculas que apresentam grupos polares, esta característica é capaz de reduzir a tensão interfacial de mistura água/óleo e óleo/água. A formação de emulsões é um fator importante para a biodegradação de óleos e hidrocarbonetos. As cargas presentes na parede celular das células bacterianas são de natureza predominantemente aniônica. Estas estruturas são capazes de interagir fortemente com cátions metálicos e desempenham um papel importante no sequestro ou imobilização de íons no ambiente. A aplicação dos isolados de rizóbios são interessantes ferramentas biotecnológicas no processo de biorremediação, por estes microrganismos não apresentarem toxicidade à saúde e ao meio ambiente. Dos isolados de rizóbios pertencentes ao Laboratório de Bioquímica de Microrganismos e Plantas, da FCAV/UNESP, foram selecionados quatro, que demonstraram elevada produção de goma ‘in vitro’. Este trabalho teve como objetivo investigar o potencial biotecnológico, de isolados de Rhizobium spp. (SEMIA 4064 e JAB6) e dois isolados de Mesorhizobium spp. (LMG 6125 e LMG 11892), como bioemulsificantes e biossorventes. Para a identificação dos isolados foi sequenciada a região 16S rRNA (1500pb). Foram estudados a produção de EPS e aplicação desses biopolímeros como bioemulsificantes de óleos e hidrocarbonetos. Investigando a Reologia e a ... The structures and some compounds produced by microorganisms have a high amount of charges such as, for example, cell wall and biopolymers. The exopolysaccharides (EPSs) of bacteria belonging to the order Rhizobiales have biopolymers that have been widely studied. The EPSs are molecules that have polar groups, this feature they are can to reduce the interfacial tension of water/oil and oil/water. The formation of emulsions is important factor for the biodegradation of oils and hydrocarbons. The charges present in the cell wall on the bacterial cells are predominantly of anionic in nature. These structures are capable of interacting strongly with metal ions and play an important role in sequestering or immobilization of ions in the environment. The application of the populations of rhizobia are interesting biotechnological tools in bioremediation process, these organisms do not present toxicity to health and the environment. Rhizobial isolates belonging to the Laboratory of Biochemistry of Plants and Microorganisms, FCAV / UNESP, four were chosen that demonstrated high gum production in vitro. This work aimed to investigate the potential of biotechnology of the isolates of Rhizobium spp. (SEMIA 4064 and JAB6) and two strains of Mesorhizobium spp. (LMG 6125 and LMG 11892), as biosorbents and bioemulsifiers. For the identification of the isolates were done sequencing of the gene 16S rRNA (1500pb). The production and application of these EPSs were studied as bioemulsifiers of oils and hydrocarbons. Investigating the monosaccharides composition and rheology of the EPSs. These isolates were explored for sensitivity of live cells and the process of removal of dead cells by copper ions (Cu2+) and chromium (Cr6+). The sequencing showed that the isolates LMG 6125 and LMG 11892 were not consistent with the genus and species previously described

Made available in DSpace on 2014-11-10T11:09:58Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-06-06Bitstream added on 2014-11-10T11:57:26Z : No. of bitstreams: 1 000779449_20150106.pdf: 956149 bytes, checksum: c893e21c17da578d54f227f0f3a50bb4 (MD5) Apesar de não ser um elemento biológico essencial, a prata metálica e seus derivados (ex. AgNO3 e complexos) têm apresentado várias aplicações medicinais como na purificação da água, tratamento de ferimentos, recobrimentos anti-infecção de instrumentos médicos, no tratamento de queimaduras pois possuem propriedades anti-microbianas potentes com baixa toxicidade em seres humanos. Sua utilização como agente antimicrobiano nos remete ao inicio da história humana, sendo muito utilizada na preservação de água potável durante anos, recurso primordial em conflitos militares. Neste trabalho foram sintetizados e caracterizados novos complexos de prata(I) do tipo Ag(NN)(tu)X, onde NN = 2,2'-bipiridina (bpy), 1,10-fenantrolina (phen), dipirido[3,2-a:2',3'-c]fenazina (dppz) e 1,10-fenantrolina-5,6-diona (phd); tu = tiouréia e X = NO3 -, CF3SO3 -, BF4 - e SO4 2-. Os complexos foram caracterizados pelas técnicas de espectroscopia na região do IV, ressonância magnética nuclear (1H), análise elementar e espectrometria de massas. As estruturas moleculares dos complexos [{Ag(bpy)(μ-tu)}2](NO3)2 (A1) e [{Ag(phd)(μ-tu)(tu)}2](CF3SO3)2 (D2) foram determinadas por difração de raios-X de monocristal, indicando um sistema binuclear com os centros de prata(I) conectados em ponte pelo atomo de enxofre da molécula de tiouréia. A atividade biológica in vitro dos compostos [Ag2(bpy)2(tu)2](NO3)2 (A1), [Ag2(phen)2(tu)2](NO3)2 (B1) e [Ag2(phen)2(tu)2](CF3SO3)2 (B2) foram estudadas frente a fungos (C. albicans, C. tropicalis e C. krusei), bactérias (S. aureus, E. coli e P. aureginosa), M. tuberculosis e formas amastigota e promastigota da L. amazonensis. Mesmo sendo um estudo bastante reduzido, tendo em vista a quantidade de microorganismos e de compostos estudados, foi possível averiguar algumas varições no comportamente biológico com a alteração tanto do ligante quelante NN quanto do contra-íon. Com resultados promissores, os estudos de... Even Ag0, and its derivates, being not an essential element, they have presented medicinal applications such as water purification, injuries treatment, antiinfection recovery of medical instruments, burn treatment as they have powerful antimicrobial properties and low human toxicity. Silver compounds have been used as antimicrobial agent since the beginning of human history when it was added to potable water for preservation as a primary resource in military conflicts. In the present work novel silver complexes (I) of Ag(NN)(tu)X type in which X = 2,2-bipiridine (bpy), 1,10-phenantroline (phen), dipirido[3,2-a:2’,3’-c]phenazine (dppz) and 1,10- phenantroline-5,6-dione (phd); tu= thiourea and X=NO3 -, CF3SO3 -, BF4 - and SO4 2- have been synthesized and characterized. The complexes had been characterised by infrared spectroscopy, 1H nuclear magnetic resonance, elementary analysis and mass spectroscopy techniques. The crystal structures of [{Ag(bpy)(μ- tu)}2](NO3)2 (A1) and [{Ag(phd)(μ-tu)(tu)}2](CF3SO3)2 (D2) were determined by single crystal X-ray diffraction indicating a binuclear system with silver(I) centers bridgebonded by sulphur atoms of thiourea molecule. The in vitro biological activity of [Ag2(bpy)2(tu)2](NO3)2 (A1), [Ag2(phen)2(tu)2](NO3)2 (B1) e [Ag2(phen)2(tu)2](CF3SO3)2 (B2) compounds had been studied for fungi (C. albicans, C. tropicalis e C. krusei), bacteria (S. aureus, E. coli e P. aureginosa), M. tuberculosis and amastigote and promastigote forms of L. amazonensis. Although a reduced study has been performed in view of the microorganisms and compounds quantities it was possible to evaluate some changes on biological behavior by both chelant ligand NN and counterion modification. Promising results were obtained on the antileishmanial activity for B2 compound which have showed a selectivity index (SI) of 13,8-15,5 values much higher than the observed for AmpB, the standard drug (5,5-5,83).

Made available in DSpace on 2014-12-02T11:16:52Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-05-25Bitstream added on 2014-12-02T11:21:18Z : No. of bitstreams: 1 000792203.pdf: 666866 bytes, checksum: 2777008a28025b2358c1aa9fc11307d9 (MD5) Plutella xylostella (Linnaeus, 1758) (Lepidoptera: Plutellidae), a traça-das-crucíferas, é um dos principais insetos-praga de crucíferas (Brassicaceae) no Brasil e em todo o mundo. Embora possa ser controlada tanto com inseticidas sintéticos como biológicos, populações de P. xylostella podem ser selecionadas rapidamente para a resistência a vários inseticidas químicos ou biológicos. Além disso, diferentes populações de P. xylostella podem surgir devido ao isolamento geográfico, resultando em isolamento reprodutivo e em populações fisiologicamente distintas, com diferentes sensibilidades a várias táticas de controle. Tal variação requer sistemas de gestão adaptados às populações em particular. Os bioinseticidas mais comuns utilizados para controlar P. xylostella baseiam-se na bactéria entomopatogênica Bacillus thuringiensis (Bacillaceae) (Bt). Apesar de muitos estudos focarem a ação do Bt em diversas pragas agrícolas, como P. xylostella, por exemplo, muitas dúvidas ainda persistem particularmente quanto aos seus efeitos subletais, mecanismo de ação e toxicidade das proteínas Bt. Assim, o objetivo desta pesquisa foi analisar a virulência e os efeitos subletais de proteínas Cry, bem como investigar fatores que afetam a suscetibilidade de insetos ao Bt (níveis de proteína, bactérias do intestino médio e mutações no gene ABCC2) em cinco populações brasileiras e uma da Inglaterra de P. xylostella. Foram realizados bioensaios de suscetibilidade com 5 populações brasileiras (PC, PA, Px, SBT e Bt) e uma da Inglaterra (UK) de P.xylostella e as proteínas Cry1Ac, Cry2Aa e Cry1IE de B. thuringiensis, estimando-se a virulência e avaliando os efeitos subletais das toxinas. Como as toxinas Cry2Aa e Cry1IE não causaram mortalidade nas lagartas de todas as populações, os testes foram realizados apenas com Cry1AC. Também foram conduzidos experimentos enzimáticos e ... Plutella xylostella (Linnaeus , 1758) (Lepidoptera: Plutellidae), diamonback moth, is a major insect pest of crucifers (Brassicaceae) in Brazil and worldwide. Although it can be controlled with synthetic insecticides such as biological products, populations of P. xylostella can be quickly selected for resistance to several chemical or biological insecticides. In addition, different populations of P. xylostella may arise due to geographic isolation, resulting in reproductive isolation and physiologically distinct populations with different sensitivities to various control tactics. This variation requires management systems tailored to particular populations. The most common insecticides used to control P. xylostella based on entomopathogenic bacterium Bacillus thuringiensis (Bacillaceae) (Bt). Although many studies focus on the action way of Bt to several agricultural pests such as P. xylostella, for example, many doubts still persist particularly regarding their sublethal effects, mechanism of action and toxicity of Bt proteins. The objective of this research was to analyze the virulence and sublethal effects of Cry proteins, as well investigate factors affecting the susceptibility of Diamondback to Bt (protein level, the midgut bacteria and mutations in the ABCC2 gene) in five Brazilian populations and one population from England. Susceptibility bioassays with 5 Brazilian populations (PC, PA, PX, SBT and Bt) and one from England (UK) of P. xylostella and Cry1Ac, Cry2Aa, and Cry1IE Bt toxins were performed by estimating its virulence and sublethal effects. How Cry2Aa Cry1IE toxins did not cause larvae mortality for all populations, tests were performed just with Cry1Ac. Enzymatic and molecular experiments with the larvae guts were also performed to investigate the factors that affecting the susceptibility of insects to toxins produced by Bt. In those bioassays were analyzed total protein, the ...

Made available in DSpace on 2014-11-10T11:09:56Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-04-25Bitstream added on 2014-11-10T11:57:42Z : No. of bitstreams: 1 000792126.pdf: 1460032 bytes, checksum: 893375b9efeacd9cd350165c560a9ac5 (MD5) O trabalho objetiva avaliar o papel da comunidade bacteriana na dinâmica dos sedimentos. No presente trabalho, compararam-se as comunidades bacterianas presentes em sedimentos de dois viveiros de piscicultura, um reservatório de água (V1) e o outro com condições de elevada carga orgânica (V4), os quais estão inseridos em um sistema sequencial com fluxo contínuo de água. As coletas de sedimentos foram realizadas em dois períodos distintos, um sendo na seca (Julho e Agosto/2012) e outro na chuva (Janeiro e Fevereiro/2012). A comunidade bacteriana foi avaliada através do sequenciamento do gene 16S rRNA. Os filos bacterianos permaneceram praticamente inalterados nas amostras V1 comparadas nas duas épocas estudadas. Nas amostras do V4 observou-se variação na frequência dos organismos encontrados em relação às diferentes coletas. A predominância em V1 foi dos filos Firmicutes seguido do Proteobacteria, Acidobacteria e Actinobacteria. No V4, o maior número de sequências encontradas pertencia ao filo Proteobacteria, seguido de Acidobacteria, Firmicutes, Actinobacteria, Chloroflexi, Nitrospira, Gemmatimonadetes e TM7. A comparação da população bacteriana dos dois viveiros estudados em diferentes épocas mostrou que as bactérias variam de acordo com as condições climáticas e estão intimamente interligadas com a concentração de nutrientes do local. Estas diferenças são importantes na elucidação do papel desenvolvido pelos procariotos na dinâmica dos sedimentos The aim of this study was identify the bacterial communities in dynamic of the sediment. In this study, we compared the bacterial communities present in sediment of two fish farm pond a used as water reservoir (V1) and the other with conditions of high nutrient load (V4), which are inserted in a sequential system with continous water flow (six ponds). The sediment sampling were conducted in two distinct periods one in dry season (July and August/2012) and another in the rain (January and February/2012). The bacterial community was assessed by sequencing the 16S rRNA. Through this data we observed in V1 regardless of time of year the bacterials phyla remained virtually unchanged.In V4 samples, was observed a variation in the frequency of organisms found in relation to different collections. In V1 was the predominance of the Phylum Firmicutes followed Proteobacteria, Acidobacteria and Actinobacteria. The largest number of sequences found at V4 belonged to the Proteobacteria phylum followed Acidobacteria, Firmicutes, Actinobacteria, Chloroflexi, Nitrospira, Gemmatimonadetes and TM7. A comparison of the bacterial population of the two ponds studied at different times showed that the bacteria at these sites varies according to the climatic conditions and are closely linked with nutrient concentration local. These differences are important in elucidating the role played by prokaryotes in the sediment dynamics

Made available in DSpace on 2015-06-17T19:34:48Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-03-14. Added 1 bitstream(s) on 2015-06-18T12:47:03Z : No. of bitstreams: 1 000830081_20160101.pdf: 121876 bytes, checksum: 342f21a15b1d2e738af168b1e2467da5 (MD5) Bitstreams deleted on 2016-01-04T10:26:29Z: 000830081_20160101.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-01-04T10:28:25Z : No. of bitstreams: 1 000830081.pdf: 809941 bytes, checksum: ea53cd5ef0cec7fb993a2745e82dad53 (MD5) The antimicrobial peptides LL-37, hBD-1, hBD-2 and hBD-3 are considered an endogenous antibiotic, with important role in the prevention of periodontal diseases due to their ability to regulate the immune response. However those peptides could be degraded by periodontal pathogens. Therefore, therapies able to up regulate the secretion of those peptides by human cells, and the association of antimicrobial peptides with natural compounds, which may act in synergism to modulate the immune response, may be a novel approach for effectively controlling periodontal diseases. The aim of this in vitro study were: i) investigate the ability of green tea extract and EGCG to induce hBD-1 and hBD-2 secretion and gene expression by gingival epithelial cells (B11) and to protect hBDs from degradation by P. gingivalis, ii) A 3D co-culture model of gingival epithelial cells and fibroblasts stimulated with A. actinomycetemcomitans LPS (1 μg/ml) were used to investigated the anti-inflammatory properties of the hBD-3, LL-37, ACPACs and EGCG and to determine whether LL-37 acts in synergy with AC-PACs, EGCG and hBD-3. Gingival epithelial cells were stimulated with green tea extract or EGCG in the presence and absence of specific inhibitors. The secretion and gene expression of hBD-1 and hBD-2 was respectively measured by ELISA and qPCR. The ability of green tea extract and EGCG to prevent hBDs degradation by P. gingivalis present in a bacterial culture supernatant was evaluated by ELISA. A 3D co-culture model composed of gingival fibroblasts embedded in a collagen matrix overlaid with gingival epithelial cells had a synergistic effect with respect to the secretion of IL-6 and IL-8 in response to A. actinomycetemcomitans LPS stimulation compared to fibroblasts and epithelial cells individually. The 3D co-culture model was stimulated with noncytotoxic concentrations of: i) hBD-3 (10 and 20 μM) ...(Complete abstract electronic access below)

Made available in DSpace on 2015-06-17T19:34:47Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-02-28. Added 1 bitstream(s) on 2015-06-18T12:47:05Z : No. of bitstreams: 1 000830788.pdf: 822528 bytes, checksum: a180e8a4717cf27205b84b2017a24f10 (MD5) De maneira geral, resíduos industriais como vinhaça e torta de filtro, causam preocupação devido ao risco de impactos ambientais que podem ser causados quando utilizados na reposição de nutrientes em solos com cultivo de cana-de-açúcar (Saccharum spp.). Devido à falta de estudos que busquem desvendar os impactos destes resíduos na estrutura e composição de comunidades bacterianas, este trabalho teve como proposta utilizar o gene 16S rRNA para avaliar a diversidade bacteriana presente em 5 biomas com diferentes manejo de cana-de-açúcar e os resíduos vinhaça e torta de filtro. Foram analisados um total de 1.090 sequencias do 16S rRNA de bactérias, recuperadas de: i) solo com fertirrigação de vinhaça e plantio de cana-de-açúcar (SV), ii) solo depositado sobre o canal mestre da vinhaça (MC), iii) solo de mata nativa localizada próxima a áreas de plantio de cana-de-açúcar (MT), iv) solo com plantio de cana-de-açúcar sem a aplicação de vinhaça (CH) e v) semicomposto de torta de torta de filtro (CP). Com base na curva de rarefação e índice Richness, SV foi considerado o ambiente mais diverso, MT foi considerado como portador de diversidade intermediária e, com base nos outros índices, MC foi considerado o ambiente menos diverso. O filo Actinobacteria, relacionado com a degradação da biomassa vegetal e produção de antimicrobianos, dominou a população do ambiente CP, fato possivelmente relacionado a elevada quantidade de material lignocelulósico disponível na torta de filtro. CP também apresentou os filos Firmicutes e Proteobacteria, ambos presentes em diferentes estágios do processo de compostagem. Os ambientes de solos foram considerados como portadores de poucos táxons relacionados a gêneros bacterianos cultivados, além de apresentarem elevado número de clones afiliados a bactérias não classificadas. Os testes de variância molecular Unifrac e Libshuff demonstram que os cinco biomas ... Generally, industrial wastes as vinasse and filter cake cause public apprehension due to the risk of environmental impacts caused by their use as nutrients replenishment in soils with cultivation of sugarcane (Saccharum spp.). Due to lack of studies that seek to unravel the impacts of these residues in the structure and composition of bacterial communities, this work aimed to apply the 16S rRNA gene to assess the bacterial diversity present in five biomes with different sugarcane crop management besides waste vinasse and filter cake. A total of 1,090 sequences of bacterial 16S rRNA were recovered and analyzed: i) soil under sugarcane crop fertilized by vinasse (SV); ii) soil from the master channel for vinasse distribution (MC), iii) soil under native forest located next to areas of sugarcane planting (MT), iv) soil under sugarcane crop without vinasse irrigation (CH), and v) filter cake semi-composting compound (CP). Based on Richness index and rarefaction curve, the SV is considered the most diverse, followed by MT as the intermediary, and MC as the least diverse environment. The Actinobacteria phylum related to the degradation of plant biomass and production of antimicrobials has dominated the population of the CP environment, that was possibly related to high amount of lignocellulosic material available on the filter cake. CP also presented the Firmicutes and Proteobacteria phyla, both present at different stages of the composting process. Soil environments showed few taxa related to cultured bacterial genera unlike the high number of clones affiliated to bacteria not classified. Unifrac and Libshuff tests for molecular variance show that the five biomass present variation in the structure of bacterial communities. In addition, SV and MC does not share species each other. These results demonstrate that the environments containing vinasse and filter cake are different from other biomes with management of sugarcane. These ...

Made available in DSpace on 2015-07-13T12:10:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-02-28. Added 1 bitstream(s) on 2015-07-13T12:25:31Z : No. of bitstreams: 1 000834957.pdf: 3564767 bytes, checksum: 0131b920f37cf2c928de7c95af5a707c (MD5) Devido ao elevado custo da adubação nitrogenada e a pouca utilização da inoculação de bactérias fixadoras de nitrogênio na cultura do feijão, considerada ineficiente quando comparada à outras leguminosas, tecnologias que otimizem a utilização do Rhizobium nessa cultura é fundamental para a busca de uma produção sustentável. A utilização de bactérias do gênero Azospirillum em conjunto com o Rhizobium potencializa a nodulação no feijoeiro, e consequentemente a resposta da cultura à fixação biológica. A necessidade da utilização e a dose da adubação nitrogenada concomitantemente à inoculação de sementes, e o desempenho desses fatores em sistema plantio direto também é incerto. Com base nisso, o trabalho foi desenvolvido em área experimental da UNESP - Ilha Solteira, localizada no município de Selvíria (MS) e no Campus de Agronomia da UNESP - Ilha Solteira, com o objetivo de verificar o desenvolvimento e a produtividade do feijoeiro com inoculação de sementes (T1 - inoculação ausente, T2 - Azospirillum brasilense, T3 - Rhizobium tropici, T4 - Azospirillum brasilense + Rhizobium tropici) e doses de nitrogênio em cobertura (0, 30, 60, 90 e 120 kg ha - 1 ) Utilizou-se o delineamento experimental em blocos casualizados dispostos em um esquema fatorial 4x5, com 4 repetições no experimento em campo e 3 repetições no experimento em laboratório. Concluiu-se que: a coinoculação com A. brasilense + R. tropici proporcionou às plantas de feijão maior massa de sistema radicular e aumentou o número de vagens; a massa da parte aérea aumentou até a dose de 86 kg ha -1 de N em 2012; as maiores doses de nitrogênio mineral em cobertura diminuiu o número e a massa de nódulos; a produtividade em 2012 foi influenciada linearmente pelas doses de N, e em 2013 a inoculação com A. brasilense proporcionou a maior produtividade de grãos de feijão Due to the high cost of nitrogen fertilization and the limited use of inoculation with nitrogen- fixing bacteria in commun bean, considered inefficient compared to other legumes, technologies that optimize the use of Rhizobium in this culture are fundamental to the pursuit of sustainable production. The use of bacteria of the genus Azospirillum together with Rhizobium may potentiate the nodulation in bean and consequently the crop response to the biological fixation of atmospheric nitrogen. Based on this, the study was conducted in the experimental area, UNESP - Ilha Solteira, located in Selvíria ( MS ) and the Campus of Agronomy UNESP - Ilha Solteira, aiming to verify the development and productivity of bean inoculated with seeds ( T1 - no inoculation, T2 - Azospirillum brasilense, T3 - Rhizobium tropici, T4 - Azospirillum brasilense + Rhizobium tropici ) and doses of nitrogen ( 0, 30, 60, 90 and 120 kg ha -1 ) was used to experimental design was randomized blocks arranged in a 4x5 factorial scheme with four replications in a field experiment and 3 replications in laboratory experiment. It was concluded that: a coinoculação with A. brasilense + R. tropici bean plants greater mass of roots and increased the number of pods and the mass of shoots increased up to a dose of 86 kg ha -1 N in 2012, the highest doses of mineral nitrogen topdressing reduced the number and nodule mass ; productivity in 2012 was influenced linearly by N, and in 2013 the inoculation with A. brasilense provided the highest yield of commun beans

Made available in DSpace on 2015-01-26T13:21:11Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-02-26Bitstream added on 2015-01-26T13:31:04Z : No. of bitstreams: 1 000803371.pdf: 600837 bytes, checksum: 850c380a2ac98e37fd93bb85fc37039a (MD5) Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) O glicerol combinado com óleos vegetais poderia limitar a intensa biohidrogenação dos ácidos graxos de cadeia longa e a produção de metano sem causar efeitos deletérios sobre a população microbiana e digestibilidade. Três incubações in vitro foram conduzidas para avaliar o efeito do glicerol (0 or 150 g/kg MS) combinado com três diferentes dietas: Feno de Tifton 85 sem a inclusão de óleo (FSO), Feno de Tifton 85 + 80g de óleo de soja/kg MS (FOS) e Feno de Tifton 85 + 80 g de óleo de linhaça/kg MS (FOL) incubados por 0, 6, 12 e 24 h sobre a composição de ácidos graxos e os parâmetros de fermentação ruminal. A PCR em tempo-real (qPCR) foi utilizado para quantificação de microorganismos às 24 h. As arquéias metanogênicas ,bactérias celulolíticas e lipolíticas foram expressas em função das bactérias totais. Separadamente, a cinética de produção de gases foi avaliada nos tempos 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 18, 22, 24, 36, 42 e 48 h. A digestibilidade verdadeira in vitro (DVIV) e a produção CH4 (%/g DMS) foram avaliadas às 48 h. Os valores de pH e as concentrações de amônia (NH3-N) foram menores nas dietas FSO comparado com FOS e FOL, independente da adição de glicerol (P0,05). As bactérias Fibrobacter succinogenes foram mais sensíveis a adição de óleos vegetais entre todas as bactérias celulolíticas (P0.05). Among all cellulolytic bacteria, Fibrobacter succinogenes was the most sensitive to the addition of vegetable oil in the diet (P

Made available in DSpace on 2014-12-02T11:16:52Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-02-24Bitstream added on 2014-12-02T11:21:18Z : No. of bitstreams: 1 000792755.pdf: 750838 bytes, checksum: 83fdb291a29e45f08d982392852e5724 (MD5) O algodão Gossypium hirsutum (L.) é uma Malvaceae cultivada em várias regiões do Brasil e do mundo, devido à versatilidade da sua produção, sendo a principal matéria-prima para a indústria têxtil, devido às características e utilidades de sua fibra, sendo utilizado também para a produção de óleo e outros subprodutos. A importância econômica do algodão atrela-se à questão do controle de insetos-praga como sendo um dos fatores que traz a maior parcela de custos na produção dessa cultura. A lagarta falsa-medideira, Chrysodeixis includens (Walker, 1857) (Lepidoptera: Noctuidae), de maior ocorrência na cultura da soja até a década passada, vem causando sérios danos nas regiões produtoras de algodão. Entre os principias avanços para o controle de pragas, pode-se citar a disponibilidade de cultivares de algodoeiro geneticamente modificadas com genes oriundos da bactéria Bacillus thuringiensis, onde essas plantas transgênicas expressam cristais proteicos com efeito inseticida, com a finalidade de controlar lepidópteros pragas que possam vir a ser prejudiciais à cultura. Os eventos de algodão Bt que expressam as proteínas Cry1Ac (Bollgard I®) e Cry1Ac mais Cry1F (WideStrike®) são ferramentas atuais e disponíveis para o manejo desse inseto-praga, afim de subsidiar o Manejo Integrado de Pragas. Dessa forma, o objetivo deste trabalho foi avaliar os efeitos de cultivares transgênicas de algodoeiro que expressam a proteína Cry1Ac e que expressam as proteínas Cry1Ac mais Cry1F, nos parâmetros biológicos de C. includens e visando determinar a sobrevivência da espécie. O estudo foi realizado em laboratório, sob condições controladas, utilizando lagartas neonatas que foram alimentadas durante toda a fase larval com folhas das cultivares transgênicas NuOPAL (Bollgard I®) e FM 975 (WideStrike®) e suas respectivas isolinhas convencionais, DeltaOPAL e FM 993. Em cada ... The cotton Gossypium hirsutum (L.) is a Malvaceae cultivated in various regions of Brazil and the world, due to the versatility of its production. The cotton is the main raw material for the textile industry, due to the characteristics and utility of its fiber; it is being also used for the production of oil and other sub products. The socioeconomic importance of cotton is located in the control of insect pests as a factor that brings the greatest costs in the production of this crop. The soybean looper, Chrysodeixis includens (Walker, 1857) (Lepidoptera: Noctuidae) of greater occurrence in the soybean crop until the last decade, is causing serious damages in the cotton regions. Among the main advances, in control of pests, could cite the availability of genetically modified cotton cultivars with gens coming of the bacteria Bacillus thuringiensis, where this transgenic plants express protein crystals with insecticide effects to control Lepidoptera pests that can become prejudicial to cotton. The events of cotton expressing Cry1Ac and, Cry1Ac and Cry1F proteins which are current and available tools to the management of this insect pest, in order to subsidize the integrated pest management. In this way, the objective of this study was to evaluate the effects of transgenic cotton cultivars expressing the Cry1Ac and, Cry1Ac and Cry1F proteins, in the biological parameters of C. includens and aiming at to determine the survivor of the species. This study was developed in the laboratory, in controlled conditions, it was used neonate larvae that were fed over the entirely larval phase with leaves of the transgenic cultivars, NuOPAL (Bollgard I®) and FM 975 (WideStrike®), and their respective conventional isolines, DeltaOPAL and FM 993. In each cultivar, the biological parameters observed were average duration and viability of larval phase, average duration and viability of the pupal phase, average ...