13 results on '"microssatélites"'
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2. Mapeamento de QTL nos cromossomos 1, 2, 3, 12, 14, 15 e X em suínos: características de carcaça e qualidade de carne
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D.M. Paixão, P.L.S. Carneiro, S.R. Paiva, K.R.S. Sousa, L.L. Verardo, J. Braccini Neto, A.P.G. Pinto, A.M. Hidalgo, C. Souza do Nascimento, I.V. Périssé, P.S. Lopes, and S.E.F. Guimarães
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suínos ,raça Piau ,marcador molecular ,microssátelites ,Animal culture ,SF1-1100 - Abstract
A realização do presente estudo teve como objetivo mapear Quantitative Trait Loci (QTL) de carcaça e qualidade de carne em uma população F2 de suínos desenvolvida pelo cruzamento de dois reprodutores da raça brasileira Piau com 18 fêmeas comerciais (Landrace x Large White x Pietrain). O mapa de ligação para essa população foi construído após a genotipagem de 684 animais para 35 marcadores microssatélites. Os dados foram analisados pelo mapeamento por intervalo usando-se sexo, lote e genótipo halotano como efeitos fixos e peso de carcaça ao abate, peso da carcaça direita e idade ao abate como covariáveis. Um total de 18 QTLs foi encontrado; os QTLs para maior espessura de toucinho na região da copa, na linha dorsolombar, e a perda por cozimento foram significativos em nível de 5% genômico. A característica espessura de toucinho foi essencialmente associada aos alelos da raça Piau, conhecido como porco tipo banha. As informações dos QTLs significativos encontrados servem para futuros estudos de mapeamento fino para identificação de genes a serem usados em conjunto com os métodos tradicionais de seleção, para melhorar a eficiência dos programas de melhoramento, assim como prover informação acerca da fisiologia envolvida no desenvolvimento das características quantitativas dos suínos.
- Published
- 2012
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3. Is the Murciano-Granadina a single goat breed? A molecular genetics approach
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A.M. Martínez, J.L. Vega-Pla, J.M. León, M.E. Camacho, J.V. Delgado, and M.N. Ribeiro
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caprino leiteiro ,microssatélites ,diversidade genética ,conservação ,Animal culture ,SF1-1100 - Abstract
The population structure of the Murciano-Granadina breed was determined using 25 microsatellites from 266 goats of seven populations. The results of the genetic differentiation analysis showed that it is possible to differentiate the Murciana and Granadina populations even though a low F ST value (0.0432) had been obtained. Individuals could be assigned to their populations with a success rate of more than 80%. Bayesian-based clustering analysis of allele frequencies and multivariate analysis revealed that Murciana and Granadina populations were grouped in different clusters since K=3. The results demonstrate that Murciana and Granadina are still two different genetic groups included into Murciano-Granadina denomination. There is the opportunity to the genetically manage these populations, under a single herd-book but adding the necessary modifications to respect the conservation of the genetic diversity based on the use of multibreed models of genetic evaluation.
- Published
- 2010
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4. Mapeamento de locos de características quantitativas associados à composição de carcaça, no cromossomo seis de suíno Mapping of quantitative trait loci for carcass composition on swine chromosome six
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A.V. Pires, P.S. Lopes, S.E.F. Guimarães, C.T. Guimarães, and J.O. Peixoto
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suíno ,QTL ,cruzamento divergente ,composição de carcaça ,microssatélites ,swine ,outbred cross ,carcass composition ,microsatellite ,Animal culture ,SF1-1100 - Abstract
Uma população de suínos, composta de 550 animais F2, foi produzida a partir do intercruzamento da geração F1, obtida pelo cruzamento divergente de dois machos da raça nativa brasileira Piau com 18 fêmeas comerciais. O objetivo do trabalho foi mapear locos de características quantitativas (QTL) associados a cortes de carcaça. Os animais foram genotipados para 13 marcadores microssatélites, distribuídos no cromossomo 6 de suínos. As características avaliadas foram: peso total do pernil, peso do pernil sem pele e sem capa de gordura, peso total da copa, peso da copa sem pele e sem capa de gordura, peso total da paleta, peso da paleta sem pele e sem capa de gordura, peso total do carré, peso do lombo, peso total do bacon, peso das costelas, peso total da papada, peso do filezinho e peso da banha rama. Utilizou-se o método de regressão por intervalo de mapeamento por meio do programa QTL Express. Foram encontrados indicativos de QTL para peso de pernil limpo, peso de paleta, peso de lombo e peso de filezinho. A região genômica deve ser saturada com marcadores adicionais para confirmar a presença de QTL reais.A swine population of 550 F2 animals was produced by outbred cross using two sires of the native Brazilian breed Piau and 18 commercial dams. The animals were genotyped for 13 microsatellite markers. The evaluated composition traits of carcass were: ham weight, skinless and fatless ham weight, boston shoulder weight, skinless and fatless boston shoulder weight, picnic shoulder weight, skinless and fatless picnic shoulder weight, total loin (bone-in) weight, loin weight, bacon weight, rib weight, jowl weight, sirloin weight, and belly fat weight. Data were analyzed by multiple regression interval mapping, using the QTL Express software. Suggestive QTL were found for skinless and fatless ham weight, picnic shoulder weight, loin weight, and sirloin weight. However, the genomic region should be saturated with additional markers in order to confirm the presence of real QTL.
- Published
- 2008
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5. Desenvolvimento de novos marcadores microssatélites para estudos genéticos de bicudo verdadeiro e análise genética de espécies de bicudos em cativeiro em Minas Gerais utilizando marcador mitocondrial
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Grécia Mikhaela Nunes de Lima, Evanguedes Kalapothakis, Daniel Ambrózio da Rocha Vilela, and Mariana Pires de Campos Telles
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Repetições de microssatélites ,Bicudo (ave) ,mtDNA ,NGS ,DNA mitocondrial ,Genética ,Sporophila maximiliani ,Microssatélites - Abstract
CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior O bicudo verdadeiro (Sporophila maximiliani) é uma ave bastante admirada entre os apreciadores de aves canoras de gaiola, principalmente na região central do Brasil. A espécie é considerada criticamente ameaçada no Brasil, estando extinta nos estados do Rio de Janeiro e São Paulo. Em contraste, a população de bicudos legalmente em cativeiro é bastante significativa, com mais de 300 mil indivíduos. Conhecer a situação genética do bicudo é essencial para a tomada de decisões antes da soltura, uma vez que mesmo com as características físicas próximas de indivíduos de vida livre, sua diversidade genética ou a presença de híbridos pode prejudicar a sobrevivência da espécie na natureza a longo prazo. Por isso o desenvolvimento de marcadores moleculares que permitem avaliar a diversidade genética e a presença de possíveis híbridos, é essencial para a condução de programas de reintrodução de forma segura e bem sucedidas a longo prazo. Este trabalho teve por objetivo padronizar marcadores microssatélites compatíveis com a tecnologia NGS e analisar sequências de COI de espécimes em cativeiro de Minas Gerais. Foram desenhados 50 pares de primers e submetidos a PCRs em diferentes condições, dos quais 13 foram padronizados, sendo a maioria sensível a pequenas quantidades de DNA e pouco específicas; o que pode ser útil para futuros estudos com outras espécies do gênero. Foram analisadas 119 sequências do gene mitocondrial COI e três espécies: S. atrirostris, S. crassirostris e S. maximiliani. Não foi observado um agrupamento entre as espécies, podendo estar relacionada com a hibridização em cativeiro, devido à dificuldade de identificação das fêmeas de diferentes espécies, também não foi observada uma estruturação genética dentro dos criatórios, provavelmente devido ao fluxo gênico devido à transferência de animais entre esses locais. Com isso, novos estudos com diferentes marcadores precisam ser realizados a fim se conhecer melhor a situação genética da espécie em cativeiro.
- Published
- 2021
6. Aspects of the genetic heterogeneity of Leishmania (Leishmania) major-like isolated in Brazil
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Larissa Procopio Carvalho, Maria Norma Melo, Soraia de Oliveira Silva, Patrícia Flávia Quaresma, and Andrea Mara Macedo
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Caracterização molecular ,Heterogeneidade genética ,Dados de Sequência Molecular ,Leishmaniose Tegumentar Americana ,Leishmania (Leishmania) major-like ,Parasitologia ,Leishmaniose Cutânea ,Sequenciamento ,Leishmanioses ,Microssatélites ,Leishmania major - Abstract
CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico Segundo a Organização Mundial da Saúde as leishmanioses são consideradas importantes doenças negligenciadas, que estão amplamente distribuídas no Velho e no Novo Mundo. São endêmicas em cinco continentes, sendo registradas em 98 países e três territórios, abrangendo países subdesenvolvidos, em desenvolvimento ou mesmo desenvolvidos, com prevalência nas áreas de clima temperado a tropical. Estima-se que cerca de 14 milhões de pessoas estejam infectadas no mundo e que 350 milhões estejam em situações de risco de infecção. As espécies Leishmania (Leishmania) amazonensis, L. (L.) mexicana, L. (L.) venezuelensis, Leishmania (Viannia) braziliensis, L. (V.) panamensis, L. (V.) guyanensis, L. (V.) peruviana são as principais espécies que causam formas tegumentares de leishmanioses no Novo Mundo e L. (L.) major no Velho Mundo. No entanto, em alguns países do continente americano, como Brasil, Venezuela, Peru, Paraguai, Equador e México, já foram isolados parasitos semelhantes a L. major de pacientes que nunca estiveram fora destes países. Esses parasitos foram denominados Leishmania (L.) major-like. Vários estudos caracterizaram essas cepas usando técnicas bioquímicas, biológicas e moleculares, porém, a presença desse parasito no Novo Mundo ainda não está esclarecida. No Brasil, oito espécies do gênero Leishmania já foram caracterizadas como causadoras da leishmaniose tegumentar americana incluindo L. (L.) major-like. O presente estudo investigou a heterogeneidade genética de L. major-like isoladas no Brasil BH49, BH70, BH121, BH122, BH129 e BH135 utilizando tipagem por microssatélites (MLMT) e sequenciamento de fragmentos de DNA amplificados com três alvos moleculares (ITS-1, hsp70 e nagt), em comparação com L. major, a fim de verificar a ocorrência de diversidade genética inter e intraespecífica nesses parasitos. Os resultados deste estudo são relevantes para o estabelecimento de medidas de saúde pública e para a identificação das espécies de Leishmania antes do tratamento, em regiões geográficas distintas onde diferentes espécies podem estar circulando. Além disso, este estudo contribui para mostrar a complexidade de espécies de Leishmania, dentro de um país continental como o Brasil, com ampla diversidade de parasitos e vetores. The World Health Organization (WHO) considers Leishmaniasis one of the most important health problems. Cutaneous leishmaniasis is widely distributed in the Old and New World. They are endemic on five continents, being registered in 98 countries and three territories, covering underdeveloped, developing or even developed countries, with prevalence in areas of temperate to tropical climate. It is estimated that around 14 million people are infected worldwide and 350 million are at risk of infection. In the New World, the species Leishmania L. (Leishmania) amazonensis, (L.) mexicana, L. (L.) venezuelensis, Leishmania (Viannia) braziliensis, L. (V.) panamensis, L. (V.) guyanensis, L. (V.) peruviana and L. (L.) major in the Old World are the main species that cause cutaneous forms of leishmaniasis. However, in some countries of the American continent, such as Brazil, Venezuela, Peru, Paraguay, Ecuador and Mexico, parasites similar to L. major have already been isolated of patients who have never been outside these countries. These parasites were named Leishmania (L.) major-like. Several studies have characterized those strains using biochemical, biological and molecular techniques, however, the presence of this parasite in the New World is still unclear. In Brazil, eight of genus Leishmania species have already been characterized as causing American cutaneous leishmaniasis including L. (L.) major-like. The present study investigated the genetic heterogeneity of BH49, BH70, BH121, BH122, BH129 e BH135 L. major-like isolates in Brazil, using microsatellite typing (MLMT) and sequencing of amplified DNA fragments with three molecular targets (ITS-1, hsp70 and nagt), compared to L. major, in order to verify the occurrence of inter and intraspecific genetic diversity in these parasites. The results of this study are relevant for the establishment of public health measures for identification of Leishmania species before treatment in geographic regions where different species can be circulating. In addition, it contributes to show the complexity of Leishmania species within a continental country as Brazil with a high of parasite and vectors diversity.
- Published
- 2021
7. Biologia reprodutiva e estrutura populacional de Prochilodus lineatus em um remanescente lótico da Bacia do Rio Grande
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Violeta da Rocha Perini, Elizete Rizzo, Nilo Bazzoli, Renata Guimaraes Moreira, Daniel Cardoso de Carvalho, Hugo Pereira Godinho, and Fernanda Radicchi Campos Lobato de Almeida
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Usina de Porto Colômbia ,Prochilodus lineatus ,Peixe Desova ,Rio Pardo ,Fecundidade ,Microssatélites (Genética) ,Esteroides ,Desova ,Esteroides sexuais ,Rio Mogi Guaçu ,Biologia reprodutiva ,Genética de populações ,Microssatélites - Abstract
O rio Grande é conhecido pela alta capacidade de geração de energia elétrica, e ao longo do seu leito diversas grandes usinas foram implantadas, fragmentando seu curso, alterando o ecossistema e reduzindo a biodiversidade nativa. O presente trabalho avaliou a biologia reprodutiva e a genética populacional de Prochilodus lineatus no sistema de rios Grande, Pardo e Mogi-Guaçu, entre a usina de Porto Colômbia e Cachoeira de Emas. Espécimes foram capturados bimestralmente nos seguintes pontos de amostragem: (S1) localizado no rio Grande, imediatamente a jusante da represa de Porto Colômbia; (S1') no rio Grande, imediatamente a jusante da confluência com o rio Pardo; (S2) no rio Pardo, a 110 km de S1; (S3), no rio Mogi Guaçu, região de Cachoeira de Emas, cerca de 200 km de S2 e (S4) no rio Pardo, a montante da confluência com o rio Mogi Guaçu, cerca de 40 km de S2. Para avaliação da biologia reprodutiva, os seguintes parâmetros foram analisados: índice gonadossomático (GSI), estádios de maturação gonadal, diâmetro do folículo vitelogênico, atresia folicular, fecundidade e níveis plasmáticos de esteroides sexuais. Em S1, peixes em maturação apresentaram alterações nos parâmetros reprodutivos: menor GSI, diâmetro dos folículos vitelogênicos, fecundidade e índice de atresia folicular, quando comparados a S2 e S3. A frequência de peixes em maturação foi maior nos pontos S2 e S3 e, a desova foi registrada somente em S3. A fecundidade absoluta variou de 27,55 x 10³ a 440,47 x 10³, sendo maior no ponto S2. Nos pontos S2 e S3, as concentrações séricas de testosterona e 17-estradiol de fêmeas e testosterona nos machos apresentaram grandes variações durante a maturação gonadal, enquanto peixes de S1 mostraram variações pouco significativas. Os níveis de 17-hidroxiprogesterona mantiveram-se elevados em peixes maduros nos pontos S2 e S3, onde as fêmeas alcançaram a maturação final ovocitária. Os resultados indicaram que P. lineatus não se reproduz no rio Grande (S1), mas provavelmente usa o rio Pardo (S2), como rota migratória em direção ao rio Mogi Guaçu (S3), onde completa sua maturação gonadal e desova. Para análise da estrutura populacional, amostras da nadadeira adiposa de 30 exemplares de P. lineatus foram coletadas nos pontos S1, S1, S2, S3 e S4 durante a estação reprodutiva. As amostras foram submetidas à extração de DNA, amplificação por PCR e análise de microssatélites usando-se 10 primers descritos para o gênero Prochilodus. Todos os microssatélites usados foram polimórficos, com números alelos por locus variando de 5 a 32. Dos 179 alelos detectados, 32 eram privados para o seu ponto de coleta e estavam em baixa frequência ( 0,05), sendo os dois alelos privados mais frequentes detectadas no ponto S4. Peixes do ponto S1 apresentaram maior coeficiente de endogamia, o qual apresentou correlação com características abióticas dos pontos estudados. Os dados indicam que P. lineatus não constitui uma população genética panmítica na área de estudo, mas está subdividido em três agrupamentos que coexistem e mantém um nível de estruturação baixo, que poderia não estar relacionada ao isolamento geográfico, mas a um comportamento de homing. Além disso, as populações de P. lineatus poderiam constituir uma metapopulação influenciada por uma dinâmica de fonte-sumidouro, em que os pontos localizados nos tributários (S2, S3 e S4) atuariam como fonte de indivíduos e os pontos localizados no rio principal (S1 e S1) como sumidouro. Para avaliar histopatologia hepática, amostras de fígado de P. lineatus foram coletadas nos três rios de estudo e analisados os parâmetros: ocorrência de apoptose, índice hepatossomático (HSI) e índice de lesão tecidual (IL). O IL foi calculado levando em consideração a ocorrência e importância de seis alterações teciduais: necrose, deslocamento de núcleo, infiltrado inflamatório, vacuolização citoplasmática, hiperemia e granulação citoplasmática. Diferenças significativas relacionadas ao local de coleta dos espécimes foram observadas, com peixes do ponto S1 apresentando maiores IL e ocorrência de necrose do que peixes dos pontos S2 e S3. O HSI e a ocorrência de apoptose não apresentaram diferenças significativas entre os pontos de coleta. Em conjunto, os resultados do presente estudo contribuem para a compreensão do comportamento e biologia de P. lineatus em ambiente natural, bem como fornecem parâmetros importantes para a conservação e manejo de suas populações e para a piscicultura. The Grande River is known for its high capacity of power generation, and in its channel several large plants were established, fragmenting its course, changing the ecosystem and reducing native biodiversity. The present study evaluated the reproductive biology and population genetics of Prochilodus lineatus in the system composed by Grande River, Pardo River and Mogi Guaçu River, between Porto Colombia dam and Cachoeira de Emas. Specimens were collected bimonthly at the following sampling sites: (S1) located in the Grande River, immediately downstream from the Porto Colômbia dam, (S1') in the Grande River, immediately downstream from the confluence with the Pardo River; (S2) in the Pardo River, 110 km from S1, (S3) in the Mogi Guaçu River, region of Cachoeira de Emas, about 200 km from S2, and (S4) in the Pardo River, upstream from the confluence with the Mogi Guaçu River, about 40 km from S2. To evaluate the reproductive biology, the following parameters were analyzed: gonadosomatic index (GSI), gonadal maturation stages, vitellogenic follicle diameter (OD), follicular atresia (FA), fecundity (AF) and plasmatic levels of sex steroids. In S1, maturing fish showed changes in reproductive parameters: lower values of GSI, OD, FA and AF, compared to S2 and S3. The frequency of maturing fish was higher in sites S2 and S3, and spawning was recorded only in S3. Absolute fecundity ranged from 27.55 x 10³ to 440.47 x 10³, being greater at site S2. In sites S2 and S3, seric concentrations of testosterone and 17-estradiol in females and testosterone in males showed large variations during gonadal maturation, while fish from S1 showed minor variations. The 17-hydroxyprogesterone levels remained high in mature fish in sites S2 and S3, where females reached the final oocyte maturation. The results indicated that P. lineatus does not reproduce the Grande River (S1), but probably uses the Pardo River (S2) as migratory route towards the Mogi Guaçu River (S3), where it completes its gonadal maturation and spawning. For analysis of population structure, samples of adipose fin of 30 specimens of P. lineatus were collected at sites S1, S1', S2, S3 and S4 during the breeding season. Samples were subjected to DNA extraction, PCR amplification and microsatellite analysis using 10 primers described for the genus Prochilodus. All microsatellites used were polymorphic, with numbers of alleles per locus ranging from 5 to 32. From the 179 alleles detected, 32 were private for their sample site and were at low frequency ( 0.05), and the two most frequente private alleles were detected in site S4. Fish from site S1 presented higher inbreeding coefficient, which presented correlation with abiotic characteristics of the sites studied. The data indicate that P. lineatus does not constitute a panmitic genetic population in the study area, but it is divided into three clusters which coexist and maintain a low level of structuring, which could not be related to geographic isolation, but to homing behavior. Furthermore, P. lineatus populations could constitute a metapopulation influenced by a source-sink dynamics, in which the sites located in tributaries (S2, S3 and S4) would act as sources of individuals and the sites located in the main River (S1 and S1') as a sink area. To assess hepatic histopathology, liver fragments of P. lineatus were collected in the three rivers of the study and the following parameters were analyzed: occurrence of apoptosis, hepatosomatic index (HSI), and index of tecidual injury (IL). The IL was calculated considering the occurrence and the importance of six alterations: necrosis, nuclear changes, inflammatory infiltration, vacuolation, hyperemia and cytoplasmic granulation. Significant differences related to the sample site of the specimens were observed, with fish from S1 presenting higher IL and occurrence of necrosis than fish from sites S2 and S3. The HSI and the occurrence of apoptosis showed no significant differences between the sampling sites. Together, the results of this study contribute to the understanding of the behavior and biology of P. lineatus in its natural environment, as well as provide important parameters for the conservation and management of their populations and fish farming.
- Published
- 2013
8. Análise filogenética molecular e biossistemática do complexo Habenaria repens Nutt. (Orchidaceae) no Brasil
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Bruna Ladeira Lau, Eduardo Leite Borba, and Joao Aguiar Nogueira Batista
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Filogenia ,Microssatélites (Genética) ,Genética de populações ,Morfometria ,Habenaria ,Filogenia molecular ,Microssatélites ,Complexo de espécies - Abstract
Habenaria é um dos maiores gêneros de Orchidaceae, mesmo assim é muito pouco estudado. Poucas revisões e estudos taxonômicos foram feitos para o gênero e nenhuma abordagem morfométrica ou de genética de populações foi realizada até o momento. Um dos vários complexos existentes para o gênero é o formado por H. repens e morfotipos relacionados. Habenaria repens sensu lato tem distribuição do sul dos Estados Unidos ao norte da Argentina e, no Brasil, diversos variantes morfológicos semelhantes a ela podem ser encontrados. A fim de esclarecer a relação dos morfotipos existentes no Brasil com H. repens e entre eles, e de circunscrever essas entidades, foi feito um estudo com três diferentes abordagens: análise filogenética molecular, análise morfométrica multivariada e genética de populações. Ao todo, 31 populações, englobando duas espécies reconhecidas (H. repens e H. aranifera), seis morfotipos do Brasil, e uma população proveniente da localidade onde o tipo de H. repens foi coletado, nos Estados Unidos da América, foram amostrados. Dois marcadores nucleares (ITS e ETS) e dois plastidiais (matK e trnK), totalizando 3.250 caracteres, foram utilizados em análises filogenéticas. Nestas análises, foi evidenciada a existência de três clados não diretamente relacionados formados exclusivamente por entidades pertencentes ao complexo. Em um deles, mais distantemente relacionado a todos os demais, situa-se apenas o morfotipo H. aff. repens6, enquanto os outros morfotipos se dividem em dois clados maiores. Dezessete caracteres florais e três vegetativos foram utilizados em análises morfométricas com técnicas de estatística multivariada. Pouca distinção morfológica foi obtida entre os morfotipos, e nem todos os agrupamentos de populações formados coincidem com aqueles obtidos pela análise filogenética e pela genética de populações. Para esta última, cinco loci microssatélites foram amplificados para 295 indivíduos de 20 populações. Cinco agrupamentos genéticos foram identificados e estes coincidem, em grande parte, com alguns clados recuperados nas análises filogenéticas. Os padrões mais consistentes encontrados pelo conjunto dos marcadores foram: a união de três populações da forma típica de H. repens (Curitiba-PR, Anguera-BA e Areias-PB), o agrupamento dos morfotipos H. aff. repens3 e H. aff. repens4, e a discriminação de H. aranifera e das populações do morfotipo H. aff. repens7. Considerando-se todas as evidências e a congruência entre elas, é sugerido que cinco espécies sejam aceitas para o complexo no Brasil. Apesar dos morfotipos H. aff. repens3 e H. aff. repens4 serem recuperados como um único grupo pelos três marcadores empregados, estes apresentam grande variação em função de tamanho de todos os órgãos da planta (em grande parte caracteres não empregados nas análises), sendo facilmente distinguíveis, o que torna questionável a manutenção destes como um único táxon. Assim, outras análises serão realizadas para determinar se estes serão descritos como uma ou duas novas espécies. O morfotipo H. aff. repens7, que pertence ao mesmo clado dos morfotipos H. aff. repens3 e H. aff. repens4 na análise filogenética, foi possível de ser distinto tanto nesta análise quanto pelos marcadores microssatélites e pela morfometria, possuindo características diagnósticas que o sustentam como espécie distinta. O morfotipo H. aff. repens6 forma um clado muito isolado dos demais nas análises filogenéticas e, apesar de não se diferenciar nas análises morfométricas, nem mesmo foi possível de ser incluído na análise de genética de populações, pois falhou na amplificação com os primers desenhados para H. repens. Essas evidências indicam tratar-se de uma espécie distantemente relacionada e que se assemelha morfologicamente por convergência de caracteres florais. Logo, essa entidade será reconhecida como uma nova espécie sustentada por características de hábito e porte (não incluídas nas análises morfométricas). Dentro do outro clado obtido pelas análises filogenéticas, H. aranifera será mantida com o status de espécie, uma vez que foi recuperada como um grupo consistente por todos os marcadores utilizados. Os demais terminais pertencentes a esse clado, apesar de possuírem ampla variabilidade morfológica e terem sido separados por marcadores moleculares, não possuem características diagnósticas que sustentem a sua separação. Por esse motivo, todos serão aceitos como H. repens, uma espécie de ampla distribuição geográfica, com alto grau de polimorfismo e possuindo todas as características de uma ocloespécie, provavelmente constituindo um par progenitor-derivativo com H. aranifera. Habenaria is one of the largest genera of Orchidaceae, but even though, it is not well studied. Few taxonomic studies and revisions have been done so far, and none of them comprise morphometric or population genetics approaches. One of the many species complexes in the genus is the one formed by H. repens and related morphotypes. Habenaria repens sensu lato occurs from south United States of America to north Argentina and, in Brazil, many morphological variants can be found. In order to clarify the relationships between Brazilian morphotypes and H. repens, as well as the relationships among them, and circumscribe these entities, three different techniques were used: molecular phylogenetic analyses, multivariate morphometric analyses and population genetics. Thirty one populations, encompassing two known species (H. repens e H. aranifera), six Brazilian morphotypes, and one population from the locality where the species type was collected, in the United States of America, were sampled. Two nuclear markers (ITS and ETS) and two plastidial ones (matK and trnK) totalizing 3,250 characters were used in the phylogenetic analyses. In these, the existence of three clades, not directly related and formed exclusively by entities that belong to the complex, was detected. Morphotype H. aff. repens6 belongs to one of these clades, whereas the other morphotypes are separated in two bigger clades. Seventeen floral and three vegetative characters were used in morphometric analyses with multivariate statistic techniques. Little morphological distinction was found between the morphotypes, and not all the groups formed match those obtained with phylogenetic and population genetics approaches. For this last method, five microsatellite loci were amplified for 295 individuals belonging to 20 populations. Five genetic groups were identified and these match partially some of the clades recovered in the phylogenetic analyses. The most consistent patterns found by all three markers were: the reunion of three populations previously classified as the typical form of H. repens (Curitiba-PR, Anguera-BA and Areias-PB), a group with morphotypes H. aff. repens3 and H. aff. repens4, and the discrimination of H. aranifera and of the populations that form H. aff. repens7. Considering all the evidences and the congruence between them, it is suggested that at least five species be recognized in Brazil. Despite the fact that H. aff. repens3 and H. aff. repens4 form a group recovered by all markers employed, they present a large variation in the size of all plant organs (characters, in a great part, not included in the analyses), and are easily distinguishable, which makes it questionable whether they represent a single taxon or not. Therefore, other analyses must be carried out in order to determine if they should be described as one or two new species. Habenaria aff. repens7, which belongs to the same clade as H. aff. repens3 and H. aff. repens4, is distinguishable by morphological and molecular markers and possesses diagnostic features that support its recognition as a different species. Morphotype H. aff. repens6 forms a clade isolated from the others and, although it does not differentiate itself in the morphometric analyses, it was not even included in the population genetic analyses, because it failed to amplify with the primers developed for H. repens. These evidences suggest it represents a distantly related species that resembles morphologically the species that form the rest of the complex due to convergence of floral traits. Thus, this entity must be recognized as a new species supported by characters of habit and size (not included in the morphometric analyses). In regard to the other clade obtained in the phylogenetic analyses, H. aranifera will be maintained as a species, once it was recovered as a consistent group in all the analysis. The remaining terminals, in spite of having a broad morphological variability and some of them have been separated by molecular markers, do not have diagnostic characteristics that sustain more than one species. Hence, they will all be accepted under H. repens, a species with broad geographic distribution, high level of polymorphism as well as all the other attributes of an ochlospecies, probably constituting a progenitor-derivative pair with H. aranifera.
- Published
- 2013
9. Perfil da suscetibilidade a deltametrina em populações de Triatoma sordida (Hemiptera: Reduviidae) do estado de Minas Gerais procedentes de áreas com infestação persistente
- Author
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Grasielle Caldas D'avila Pessoa, Lileia Diotaiuti, Alvaro Eduardo Eiras, Denise Valle, Marcos Takashi Obara, Nelder de Figueiredo Gontijo, and Paulo Roberto de Oliveira
- Subjects
Deltametrina ,Piretróides ,Parasitologia ,Microssatélites (Genética) ,Resistência à inseticidas ,T sordida ,Triatominae ,Bioensaios ,Resistência a inseticida ,Enzimas detoxificativas ,Microssatélites - Abstract
Os relatos cada vez mais frequentes de populações triatomínicas com razões de resistência elevadas tem causado grande impacto, desafiando cientistas e sanitaristas na busca de novas alternativas para o controle vetorial. Considerando os casos de resistência de triatomíneos já reportados, é possível que o uso intensivo de inseticidas no Brasil por mais de 30 anos tenha favorecido o aparecimento de novos focos em regiões ainda mais amplas. Deste modo, justifica-se a importância de se investigar este fenômeno levando-se em consideração as condições ambientais nas quais ele se encontra inserido bem como variabilidade genética destes insetos e sua capacidade de alteração na linha do tempo na presença do ativo químico. O objetivo deste trabalho foi caracterizar o perfil de suscetibilidade/resistência de populações de T. sordida de áreas com infestação persistente da região do Triângulo Mineiro e do Norte de Minas Gerais ao piretróide deltametrina. A População utilizada como linhagem referência de suscetibilidade é proveniente de Uberaba. Os ensaios biológicos quali e quantitativos foram conduzidos de acordo com PESSOA (2008) e os bioquímicos de acordo com VALLE et al., (2006) com modificações. A caracterização da estrutura genética das populações foi desenvolvida por meio do estudo de microssatélites por técnica de transposição. As características ambientais e operacionais foram avaliadas por meio de questionário próprio. As variáveis climatológicas (umidade relativa, pluviosidade, temperatura e insolação) foram obtidas por meio de dados disponíveis no Banco de Dados Metereológicos para Ensino e Pesquisa - BDMEP. As análises dos bioensaios quantitativos revelaram RR50 que variaram de 0,44 a 6,5. De acordo com critério de categorização do status da suscetibilidade/resistência proposto pela OPAS (2005), apenas 1% das populações foi classificada como resistente a deltametrina (TsCJB; RR50: 6,50), enquanto que de acordo com critério de ZERBA & PICOLLO (2002), este valor sobe para 55,5%. Os bioensaios qualitativos revelaram um percentual de mortalidade à Dose Diagnóstica que variou de 43,3% a 100%, sendo 61,2% das populações classificadas como resistentes à deltametrina. Os resultados obtidos nos bioensaios qualitativos e quantitativos não se mostraram correspondentes, reforçando a necessidade de ensaios de campo. A padronização dos ensaios bioquímicos revelou que estes devem ser realizados com insetos de mesma geração e idade, com n amostral de 135 espécimes. A análise dos ensaios bioquímicos utilizando somente o percentil 99 se mostrou deficiente, justificando a necessidade de um teste estatístico em paralelo, a ser escolhido de acordo com o tipo de distribuição dos resultados obtidos. A análise das populações de interesse revelou alteração na maioria das populações para todas as enzimas (alfa-EST, beta-EST, pnpa-EST, OFM e ACHE), exceto de GST. Não foi observada correlação entre as RR encontradas e os resultados do testes bioquímicos. Não foi observada diferença no padrão das localidades com triatomíneos classificados como resistentes ou suscetíveis em relação a: constituição do intradomicílio, tipo de ecótopos peridomiciliares, a disponibilidade de esconderijos, e uso de inseticidas pelo próprio morador. Somente na localidade de Barriguda foi relatada utilização das matas no entorno para coleta de lenha. Verificaram-se diferenças nos parâmetros climatológicos insolação, temperatura e pluviosidade em todo o município (p< 0,05). O histórico de infestação das UD`s e carga de inseticida utilizada revelou-se mais elevado em Barriguda, Jataí II e Jataí I, sendo T. sordida (94,5%) a espécie de triatomíneo predominante capturada. O município de Coração de Jesus conta atualmente com três agentes de saúde, com pouco tempo de experiência profissional, não treinados para as atividades de borrifação que afirmam trabalharem em concordância com as preconizações do MS. Os estudos com microssatélites revelaram uma grande diversidade genética. A análise do FST possibilitou inferir sobre um fluxo de insetos entre as localidades de Jataí I, Jataí II, Boa Vista, com isolamento independente das populações de Barriguda e Bom Jesus. De forma geral, o uso de inseticidas para diversos fins, possíveis falhas operacionais principalmente devidas à falta de capacitação e supervisão dos agentes de saúde, somados a uma degradação irregular do inseticida determinada pelas condições ambientais, pode selecionar indivíduos resistentes justificando a persistência da infestação na região. A diversidade de RR observada dentro da mesma localidade, o fluxo genético observado nos ensaios moleculares, a abundância e diversidade de esconderijos e os diferentes perfis bioquímicos encontrados permitem inferir, inclusive, que a resistência pode estar sendo subestimada. High insecticide resistance ratios on triatominic populations have been frequently reported, causing impact on vector control strategies and challenging scientists and sanitarists on the quest for novel alternatives concerning vector control. Considering the already reported cases of triatomine resistance, it is possible that the intensive use of insecticides in Brazil for over 30 years caused the emergence of new foci in wider geographic areas. Thus, the investigation of the related phenomenon is justified by its importance. Moreover it is necessary to consider the environmental conditions on which the resistance is inserted, the insects genetic variability and the resistance timeline evolution after exposure to chemical assets. The aim of the present study was to characterize the pyrethroid deltamethrin susceptibility/resistance profile of Triatoma sordida (Stål, 1859) populations from areas with persistent infestation on the Triangulo Mineiro and on northern Minas Gerais. The qualitative and quantitative bioassays were conducted according to PESSOA (2008) and biochemical assays according to VALLE et al., 2006) with modifications. The genetic characterization of triatomine populations was developed through microsatellites transposition technique. The operational and environmental characteristics were assessed through questionnaires. The climatic variables (relative humidity, pluviosity, temperature and solar radiation) were obtained from BDMEP. The quantitative bioassay analyzes showed RR50 ranging from 0.44 to 6.5. According to the criterion of categorization status of susceptibility / resistance proposed by PAHO (2005), only 1% of the population was classified as resistant to deltamethrin (TsCJB; RR50: 6.50), whereas according to ZERBA & PICOLLO (2002) criterion, the value rises to 55.5%. Qualitative bioassays revealed a DD (diagnostic dose) mortality ranging from 43.3% to 100%, with 61.2% of the population classified as deltamethrin resistant. The results in qualitative and quantitative bioassays were not related, emphasizing the need of field trials. The standardization of biochemical assays showed that these must be performed with insects of the same generation and age, with a sample of 135 specimens. The analysis of biochemical assays using only the 99 percentile proved to be deficient, justifying the need of a parallel statistical test, to be chosen according to the statistical distribution of the results. The analysis of triatomine populations showed alterations in most of them for all the enzymes (alpha-EST, beta-EST, PNPA-EST, OFM and ACHE), except GST. No correlation was found between the RR values and the biochemical tests results. Localities with triatomines classified as resistant or susceptible presented similar patterns when considered: intradomiciliary constitution, types of peridomiciliary ecotopes, availability of hiding places, and use of insecticides by the resident. Only on the Barriguda locality was reported the collecting of firewood in surrounding vegetation by residents. Differences in the climatic variables (solar radiation, temperature and rainfall) were verified throughout the municipality (p
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- 2012
10. Filogeografia e estrutura populacional da Tartaruga de Couro, Dermochelys coriacea, em áreas de desova da Guiana Francesa, Martinica e Guadalupe
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Erica Molfetti Martins and Fabricio Rodrigues dos Santos
- Subjects
Tartarugas ,Genética da Conservação ,DNA mitocondrial ,Microssatélites (Genética) ,Tartaruga de Couro ,História Demográfica ,Genética ,Microssatélites - Abstract
A tartaruga de couro Dermochelys coriacea é a espécie de tartaruga marinha mais amplamente distribuída e é classificada como criticamente ameaçada pela World Conservation Union. Contudo, o grupo do Atlântico Noroeste é considerado com estando sob baixo risco e enfrentando poucas ameaças, e inclui algumas das maiores colônias de desova com mais de 10000 ninhos colocados a cada ano na Guiana Francesa. Analisamos duas populações de desova da Guiana Francesa e algumas populações menores das Índias Ocidentais Francesas (Guadalupe e Martinica), com o objetivo de investigar a diversidade e as histórias demográficas dessas populações. Utilizamos 12 locos microssatélites, dos quais quatro foram isolados pela primeira vez, e sequências de DNAmt da região controle e do citocromo b. Os três sítios de desova (Caiena, Awala e Guadalupe/Martinica) mostraram estrutura limitada embora significativa com DNA mitocondrial e com DNA nuclear, corroborando considerações prévias de uma única Unidade Regional de Manejo. Além disso, foram detectados gargalos de garrafa em todas as populações, datados de meados do Holoceno, o que pode ser explicado por flutuações climáticas ocorridas neste período. Sugerimos que estas populações devem ser manejadas como uma unidade evolutiva, mas os esforços de conservação locais são necessários, pois cada sítio de desova abriga parte da diversidade genética. The leatherback turtle Dermochelys coriacea is the most largely distributed sea turtle species and it is classified as critically endangered by the World Conservation Union. Nevertheless the Northwest Atlantic group is considered as under low risk and facing low threats, and includes some of the largest nesting rookeries with over 10,000 nests laid every year in the French Guiana. We analyzed two French Guiana nesting populations and some smaller populations from the French West Indies (Guadeloupe and Martinique), with the aim to investigate the diversity and demographic histories of these populations. We used 12 microsatellite loci, of which four were newly isolated, and mtDNA sequences of the control region and cytochrome b. The three rookeries (Cayenne, Awala and Guadeloupe/Martinique) showed limited although significant structuration with mitochondrial DNA and with nuclear DNA, corroborating the previous considerations as a single Regional Management Unit. Furthermore, bottlenecks were detected in all the populations, dating from the mid Holocene, which can be explained by the climate fluctuations of this period. We suggest that these populations should be managed as an evolutionary unit, but the local conservation efforts are necessary, since each nesting site hosts part of the genetic diversity.
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- 2012
11. Isolamento de miscrossatélites, taxonomiamolecular e diversidade genética de Planthymenia (Leguminosae)
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Mariana Vargas Cruz, Maria Bernadete Lovato, Gustavo Campos e Silva Kuhn, and Maíra Figueiredo Goulart
- Subjects
Plathymenia reticulata ,Hibridização ,Cerrados ,Mata Atlântica ,Microssatélites (Genética) ,Plathymenia ,Cerrado ,Ecótipos ,Genética ,Ecótones ,Microssatélites - Abstract
A taxonomia do gênero Plathymenia, leguminosa arbórea amplamente distribuída pela América do Sul, tem sido muito discutida desde sua descrição. Na mais recente revisão taxonômica do gênero, as duas espécies originalmente descritas foram consideradas uma só espécie. Alguns anos depois, estudos ecofisiológicos demonstraram a existência de diferenças adaptativas relacionadas às diferenças ambientais entre Mata Atlântica e Cerrado, o que levou os pesquisadores a considerar a existência de ecótipos relativos aos dois biomas. No presente estudo, marcadores microssatélites foram desenvolvidos especificamente para Plathymenia e caracterizados em 51 indivíduos presentes em duas populações amostradas em áreas de Cerrado. Os loci isolados demonstraram alto grau de polimorfismo e foram ainda utilizados a fim de investigar a ocorrência de fluxo gênico entre populaçõespresentes na Mata Atlântica e no Cerrado. Um total de 159 indivíduos foram amostrados em duas populações localizadas em áreas core de Cerrado, em duas populações de áreas core de Mata Atlântica, e em quatro outras populações, localizadas em regiões ecotonais, onde ocorre a transição de um bioma para o outro. Foi verificado que o habitat em que as populações se encontram está mais relacionado com a diferenciação genética do que a distância geográfica que existe entre as populações. Ao comparar as populações presentes nas áreas core da Mata Atlântica e do Cerrado, foram encontradas diferenças gênicas que estão de acordo com a classificação dos indivíduos em dois ecótipos adaptados a condições ambientais distintas encontradas em cada um dos biomas. Contudo, altos níveis de fluxo gênico foram observados nas populações presentes em áreas ecotonais indicando que não existem mecanismos de isolamento reprodutivo completo entreos ecótipos de Plathymenia. Nossos resultados corroboram, portanto, com a última revisão taxonômica que considera o gênero Plathymenia monoespecífico. The taxonomy of the genus Plathymenia, leguminous tree widely distributed in South America, has been much discussed since its description. In the most recent taxonomic revision of the genus, the two species originally described were considered a single species. Some years later, ecophysiological studies have demonstrated the existence of adaptive differences related to environmental differences between Atlantic Forest and Cerrado, which led researchers to consider the existence of different ecotypes between the two biomes. In the present study,microsatellite markers were developed specifically for Plathymenia and characterized in 51 individuals present in two populations sampled in areas of Cerrado. The isolated loci showed a high degree of polymorphism and were further used to investigate the occurrence of gene flow between populations present in the Atlantic Forest and Cerrado. A total of 159 individuals were sampled in two populationslocated in core areas of Cerrado, in two populations of core areas of Atlantic Forest, and in four other populations, located in ecotonal regions where the transition from one biome to another occurs. It was found that the habitat in which populations were sampled more is more related to the genetic differentiation found than the geographical distance between populations. When comparing the populations present in the core areas of Cerrado and Atlantic Forest we have found genetic differences that are consistent with the classification of individuals into two ecotypesadapted to different environmental conditions found in each of the biomes. However, high levels of gene flow were observed in the populations present in the ecotone areas, indicating that there are no mechanisms for complete reproductive isolation between the two ecotypes Plathymenia. Our results corroborate, therefore, with thelatest taxonomic revision that considers the genus Plathymenia monospecific.
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- 2012
12. Estudo da perda de heterozigosidade de genes supressores de tumor em tumores odontogênicos mistos
- Author
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Clarice Ferreira Galvão, Carolina Cavalieri Gomes, Vanessa de Fátima Bernardes, Adriano Mota Loyola, and Fabricio Rezende do Amaral
- Subjects
Ameloblastoma ,Repetições de microssatélites ,Fibrossarcoma Ameloblástico ,Fibroma Ameloblástico ,Odontoma ,Genes Supressores de Tumor ,Fibrossarcoma ,Tumores odontogênicos ,Perda de heterozigosidade ,Fibro-Odontoma Ameloblástico ,Microssatélites - Abstract
Os tumores odontogênicos representam um grupo de lesões derivadas de tecidos que formam os dentes e exibem características clínicas e patológicas variáveis. A avaliação da perda de heterozigosidade (Loss of Heterozygosity- LOH) pode permitir a identificação de alterações em tumores e lesões pré-cancerosas. Embora a LOH em regiões supressoras de tumor seja importante na compreensão do processo de formação das neoplasias, poucos estudos foram realizados com esta abordagem nos tumores odontogênicos. Neste trabalho, investigou-se a LOH através de um painel de nove marcadores para regiões microssatélites próximas a genes supressores de tumor nos cromossomos 3p, 9p, 11p, 11q e 17p em onze tumores odontogênicos mistos, incluindo cinco casos de fibroma ameloblástico (FA), três fibro-odontoma ameloblástico (FOA) e três de fibrossarcoma ameloblástico (FSA). Os loci mais frequentemente deletados foram dos genes TP53 (17p13, 62%) e CHRNB1 (17p13, 55%). LOH nas regiões cromossômicas 3p24.3, 9p21 e 9p22 foram observadas apenas nos FSA. Nenhuma amostra apresentou LOH nos loci cromossômicos 3p21.2 e 11q13.4. Para a região 9p22-p13, LOH ocorreu em apenas uma amostra de FOA. A média da frequência de perda alélica (fractional allelic loss) nas lesões benignas (FA e FOA) foi de 22%, enquanto nas lesões malignas (FSA) foi de 74,6%. Os resultados demostraram alta freqüência de perda alélica no fibrossarcoma ameloblástico comparado aos tumores benignos. Estes dados sugerem que a LOH pode ser útil no diagnóstico e na compreensão da patogênese dos tumores odontogênicos mistos. Odontogenic tumors represent a group of lesions with clinical and pathological variables, derived from tissues that form the teeth. The evaluation of the loss of heterozygosity (LOH Loss of heterozygosity-) allows identifying changes in tumors and precancerous lesions. Although loss of heterozygosity (LOH) in regions of tumor suppressor is important for understanding the process of formation of neoplasms, few studies have been performed with this approach in the odontogenic tumors. In this study, LOH in a panel of nine markers for tumor suppressor regions on chromosomes 3p, 9p, 11p, 11q and 17p were analyzed in five samples of ameloblastic fibroma, three samples of ameloblastic fibro-odontoma and three samples of ameloblastic fibrosarcoma. The most frequently lost genetic loci were p53 (17p13, 62%) and CHRNB1 (17p13, 55%). LOH at the chromosome regions 3p24.3, 9p21 and 9p22 was identified only in ameloblastic fibrosarcoma. No sample showed LOH at the chromosomal loci 3p21.2 and 11q13.4. For the region 9p22-p13, LOH occurred in one sample of ameloblastic fibro-odontoma. The fractional allelic loss was calculated for each sample. The mean fractional allelic loss of the benign lesions (i.e., ameloblastic fibroma and ameloblastic fibro-odontoma) was 22%, whereas the mean fractional allelic loss of the malignant lesions (i.e., ameloblastic fibrosarcoma) was 74.6%. In conclusion, our results show a higher fractional allelic loss of ameloblastic fibrosarcoma compared to its benign counterparts. These data suggest that LOH may be useful in the diagnosis and understanding of the pathogenesis of mixed odontogenic tumors.
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- 2012
13. Caracterização genética de invasões biológicas: o caso do Tucunaré (Cichla spp) em Minas Gerais
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Daniel Cardoso de Carvalho, Denise Aparecida Andrade de Oliveira, Paulo dos Santos Pompeu, Marcos Bryan Heinemann, Angela Maria Quintao Lana, and Maria Iracilda Sampaio
- Subjects
Peixe Controle biológico ,Tucunaré (peixe) Migração ,Tucunaré ,Tucunaré (Peixe) Genética ,Genética ,Microssatélites - Abstract
Este estudo buscou o entendimento do processo de colonização do peixe amazônico tucunaré no sudeste do Brasil por meio da caracterização genética de suas populações. Visto que essa é umaespécie invasora, a determinação inequívoca da população fonte e a rota de invasão são informações vitais na avaliação do seu sucesso adaptativo em áreas introduzidas e determinantes na elaboraçãode planos de manejo e controle. Foram propostas análises genéticas de populações introduzidas nas principais bacias hidrográficas do estado de Minas Gerais (São Francisco, Grande, Paranaíba e Doce). Sequências do DNA de duas regiões mitocondriais de indivíduos das populações introduzidas foram obtidas e comparadas com os estoques nativos da Amazônia para a identificação da origem dos estoques. Apenas haplótipos das espécies Cichla piquiti e C. kelberi, endêmicas da bacia do Araguaia-Tocantins, foram detectados nos sítios analisados. Posteriormente, dez (10) loci de microssatélites para a espécie invasora C. piquiti (testados com eficiência para C. kelberi) foram desenvolvidos para análise da estrutura e diversidade genética de suas populações. Os resultados indicam efeito fundador nas populações introduzidas, as quais apresentaram redução na riquezaalélica e heterozigose esperada quando comparada com a população nativa. A análise Bayesiana de atribuição detectou espécimes híbridos apenas na população nativa. Apesar de sua baixa diversidadegenética, o tucunaré mostrou sinais evidentes de que se estabeleceu com sucesso no ambiente receptor, sendo ele um ambiente impactado ou não, demonstrando que o efeito de propágulo não é importante para o processo de invasão do tucunaré. Padrões genéticos e de distribuição geográfica sugerem, ainda, que C. kelberi e C. piquiti apresentam processos introdutórios distintos nas principais bacias no Estado de Minas Gerais. This study aimed to understand the colonization process of the Amazonian fish introduced in southeast Brazil using molecular markers. In the invasive biology studies, the unequivocal characterization of the source population and the invasive route, are vital information not only in the evaluation on its adaptative success in invaded areas but also in its management and control. Genetic analyses were carried out on the introduced populations at the major river basis in the Minas Gerais State (São Francisco, Grande, Paranaíba and Doce). DNA sequences of twomitochondrial regions from specimens of the introduced species were obtained and compared with the natives stocks from the Amazon basin in order to detect the source population. Only mtDNA haplotypes from the species C. piquiti and C. kelberi, endemic from the Araguaia-Tocantins, the eastern limit of the Amazon basin, were recovered in the introduced populations. Furthermore, ten (10) microsatellites loci were developed for the invasive species C. piquiti (successfully tested for C. kelberi) in order to analyze the genetic structure and diversity of the introduced populations. The results have shown a founder effect in the introduced populations, with reduction in the allelic richness and expected heterozigosity, when they were compared with the native population. TheBayesian analysis of attribution detected possible hybrids specimens only in the native population. The tucunaré, apart from its low genetic diversity, is well established in the invasive areas showing that the propagule effect is not an important matter in its invasive process. Genetic and geographic distribution patterns suggest that C. kelberi and C. piquiti showed different introductory process in the major river basins in the Minas Gerais State.
- Published
- 2009
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