Multidisciplinary research in public health is approached using methods from many scientific disciplines. One of the main characteristics of this type of research is dealing with large data sets. Classic statistical variable selection methods, known as “screen and clean”, and used in a single-step, select the variables with greater explanatory weight in the model. These methods, commonly used in public health research, may induce masking and multicollinearity, excluding relevant variables for the experts in each discipline and skewing the result. Some specific techniques are used to solve this problem, such as penalized regressions and Bayesian statistics, they offer more balanced results among subsets of variables, but with less restrictive selection thresholds. Using a combination of classical methods, a three-step procedure is proposed in this manuscript, capturing the relevant variables of each scientific discipline, minimizing the selection of variables in each of them and obtaining a balanced distribution that explains most of the variability. This procedure was applied on a dataset from a public health research. Comparing the results with the single-step methods, the proposed method shows a greater reduction in the number of variables, as well as a balanced distribution among the scientific disciplines associated with the response variable. We propose an innovative procedure for variable selection and apply it to our dataset. Furthermore, we compare the new method with the classic single-step procedures. La investigación multidisciplinaria en salud pública se enfoca usando métodos de muchas disciplinas científicas. Una de las principales características de este tipo de investigación es lidiar con conjuntos voluminosos de datos. Los métodos clásicos estadísticos de selección de variables, conocidos como “screen and clean”, y utilizados en un solo paso, seleccionan las variables con mayor peso explicativo en su modelo. Estos métodos, comúnmente usados en investigación pública en salud, pueden inducir a enmascarar la multicolinealidad, excluyendo variables relevantes para los expertos en cada disciplina y sesgando el resultado. Se usan algunas técnicas específicas para resolver este problema, como las regresiones penalizadas y estadísticas bayesianas, que ofrecen resultados más equilibrados entre subconjuntos de variables, pero con umbrales menos restrictivos de selección. Usando la combinación de métodos clásicos, se propone en este trabajo un tercer paso en el procedimiento, recogiendo variables relevantes de cada disciplina científica, minimizando la selección de variables en cada una de ellas y obteniendo una distribución equilibrada que explica la mayor parte de la variabilidad. Este procedimiento fue aplicado en un conjunto de datos de una investigación en salud pública. Comparando los resultados con los métodos de un solo paso, el método propuesto expone una gran reducción en el número de variables, así como la distribución equilibrada entre las disciplinas científicas asociadas con la variable de respuesta. Proponemos un procedimiento innovador para la selección de variables y aplicarlo a nuestro conjunto de datos. Asimismo, comparamos el nuevo método con los procedimientos clásicos de un solo paso. A pesquisa multidisciplinar em saúde pública emprega métodos provenientes de diversas disciplinas científicas. Uma das principais características desse tipo de pesquisa é o fato de lidar com conjuntos de dados grandes. Os métodos clássicos de seleção de variáveis estatísticas, conhecidos como “screen and clean” (filtrar e limpar), e aplicados a partir de um passo único, selecionam as variáveis com o maior peso explanatório no modelo. Esses métodos, amplamente disseminados na pesquisa em saúde pública, podem induzir ao mascaramento e à multi-colinearidade, excluindo variáveis que seriam relevantes para os especialistas em cada disciplina e enviesando os resultados. Algumas técnicas específicas usadas para resolver esse problema, como regressões penalizadas e estatísticas Bayesianas, oferecem resultados mais equilibrados entre subconjuntos de variáveis, porém com limiares de seleção menos restritivos. O artigo propõe um procedimento com três passos, usando uma combinação de métodos clássicos, captando as variáveis relevantes de cada disciplina científica, minimizando a seleção de variáveis em cada disciplina e obtendo uma distribuição equilibrada que explica a maior parte da variabilidade. O procedimento foi aplicado a um conjunto de dados de uma pesquisa em saúde pública. Ao comparar os resultados com os métodos que utilizam um único passo, o método proposto demonstra maior redução no número de variáveis, assim como, uma distribuição equilibrada entre as disciplinas científicas relacionadas à variável dependente. Propomos um procedimento inovador para a seleção de variáveis, que aplicamos depois ao nosso conjunto de dados. Além disso, comparamos o método novo com os procedimentos clássicos de apenas um estágio.