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Carbon (C) contents of humic substances (HS) in soil aggregates are a sensitive indicator of changes in the edaphic quality caused by soil management systems and/or cover plant species. The aim of this study was to assess total contents of C and HS of organic matter in soil aggregates cultivated with onion under a no-till vegetable production system (NTVS) and conventional tillage (CT) compared to a secondary forest area. Treatments consisted of single and mixed cover crops and onion under NTVS: spontaneous vegetation, 100% black oat; 100% rye; 100% oilseed radish; consortium of oilseed radish (14%) + rye (86%); consortium of oilseed radish (14%) + black oat (86%). An area cultivated with onion under CT (± 37 years) and a forest area (secondary forest; ± 30 years) were also evaluated. Five years after implementation of NTVS, undisturbed soil specimens were collected from the 0.0-0.05, 0.05-0.10 and 0.10-0.20 m layers and aggregates were obtained (8.00 mm > Ø > 2.0 mm). In tríese aggregates, total organic carbon (TOC) and C of HS were determined, subdividided into a fulvic acid fraction (C-FAF), humic acid fraction (C-HAF) and humin (C-HUM). With the C values of the HS the following ratios were calculated: C-HAF/C-FAF and (C-HAF+C-FAF)/C-HUM. The highest content of TOC, C-FAF, C-HAF and C-HUM were found in the forest. In NTVS, the contents of TOC (at the 0.0-0.05 m depth) and C-HUM (0.0-0.05 and 0.05-0.10 m) were higher than those found under CT. The highest C-FAF contents were found under CT. NTVS compared to CT favors the humification process (higher C-HUM content and lower ratios of C-HAF+C-FAF/C-HUM (at the 0.0-0.05 and 0.05-0.10 m depths) and the protection of organic matter (higher TOC contents at the 0.0-0.05 m depth)). A linear relationship was observed between C-HUM and N of HS. Among the cover plant species, rye alone and rye combined with oilseed radish had the best results regarding humification of organic matter with predominance of C-HUM and C, RESUMEN Los contenidos de carbono (C) de las sustancias húmicas (SH) en los agregados del suelo son un indicador sensible de los cambios en la calidad edáfica causados por los sistemas de manejo del suelo y / o las especies vegetales de cobertura. El objetivo de este estudio fue evaluar el contenido total de C y SH de materia orgánica en agregados de suelo cultivado con cebolla bajo sistema de siembra directa de hortalizas (SSDH) y sistema de preparación convencional (SPC), comparando con un área de bosque. Los tratamientos consistieron en cultivos de cobertura solos y asociados con cebolla bajo SSDH: vegetación espontánea, 100% avena negra; 100% centeno; 100% nabo forrajero; consorcio de nabo (14%) + centeno (86%); consorcio de nabo (14%) + avena negra (86%). También se evaluó un área cultivada con cebolla bajo SPC (± 37 años) y un área de bosque (bosque secundario, ± 30 años). Cinco años después de la implementación de SSDH, se escogieron muestras de suelo de las capas 0,0-0,05, 0,05-0.10 y 0,10-0,20 my obtenidos los agregados (8.00 > Ø > 2,0 mm). En estos agregados, se determinaron el carbono orgánico total (COT) y C de SH, subdivididos en fracción ácido fúlvico (C-FAF), fracción ácido húmico (C-FAH) y humin (C-HUM). Con los valores de C de las SH, se calcularon las siguientes proporciones: C-FAH/C- FAF y (C-FAH + C-FAF)/C- HUM. El mayor contenido de COT, C-FAF, C-FAH y C-HUM se obtuvo en el bosque. En SSDH, los contenidos de COT (0,0-0,05 m) y C-HUM (0,0-0,05 y 0,05-0,10 m) fueron más altos que aquellos encontrados bajo SPC. Los contenidos más altos de C-FAF se encontraron bajo SPC. En SSDH en comparación con SPC favorece el proceso de humificación (mayor contenido de C-HUM y menores índices de C-FAH + C-FAF/C- HUM (en las profundidades de 0.0-0.05 y 0,05-0,10 m) y la protección de la materia orgánica (mayor contenido de COT a 0,0-0,05 m de profundidad)). Entre las especies de plantas de cobertura, el centeno solo y centeno asociado con nabo tuvieron los mejores